遗传多样性分子检测38页PPT
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遗传多样性PPT课件
日本人 , 蒙古人 高加索人 ,非洲黑人 印第安人
IO的频率为50-60% IO的频率为65-80% IO的频率为100%
47
(二 ) 自然种群的空间遗传结构
1 小尺度遗传变异 (1)小种群和隔离种群 自然种群的遗传结构主要受随机遗传漂变、
基因流限制和分化选择压力等综合因素的影响。 这些作用导致小种群和隔离种群的种群内各隔 离种群的遗传变异降低，种群间遗传变异升高。
例2： 许多多年生草本植物，以及一年生草本植 物和木本植物，可能在初期的种子种群中具有很高的 遗传变异，但随着稀疏过程这种变异会不断减少。
60
2、突变发生的时间不同，遗传变异作用不同 突变发生的时间可能包括： （1）减数分裂配子形成阶段 （2）胚胎阶段 （3）个体营养生长阶段
61
小结: 1 什么是遗传多样性(两个方面) 2 遗传多样性的表现形式(四个方面) 3 遗传多样性的种群尺度(四个种群尺度) 4 影响遗传多样性的因素 5 遗传多样性的时间与空间格局及其影响因素
58
4 人类对环境干扰形成遗传格局
人为形成遗传格局
人为影响造成热带雨林生境的破碎化 59
(四). 遗传多样性的时间结构
1。种群结构和选择压力的季节变异，导致种群遗 传组成的周期变化。
例1 ：对于植物来说，遗传变异的短期变化经常 与侵移（colonization）、定居（establishment）、 林分成熟（stand maturity）有着必然的联系。
48
49
问题10:物种保护实践中 如何解决小种群和隔离种
群的遗传问题呢?
50
1 小尺度遗传变异
(2)大种群和非孤立种群 对于一个大种群和非孤立种群来说，如果
漂变和基因流是唯一影响基因频率的重要因子， 那么大多数的遗传变异应该发生在种群之内。
遗传多样性研究的理论 PPT课件
3、哈代-温伯格平衡
►定义： ►重要意义： ►该定律是群体遗传学(种群遗传学)许多理论
理论模型建立的基础。它是群体遗传学的核 心。分子进化的中心理论，以及有关分子遗 传多样性试验数据的分析均是建立在该定律 基础上。
第四节 评价种群遗传多样性的指标
1、杂合度和基因多样度 杂合度 基因多样度 遗传杂合性指标的应用 2、遗传距离 3、核苷酸多样性 4、固定指数 5、共享带率
第七节 遗传多样性的保护与管理
1、野生生物的遗传多样性研究 2、作物和家养动物遗传资源的鉴定和管理 3、圈养种群的遗传管理
本章主要参考资料
► 陈晓峰等，2019.遗传多样性研究的理论、方法及应用，见 陈灵芝，马克平主编：生物多样性科学：原理与实践.上海： 上海科学技术出版社，93～ 125
► 法兰克汉著(黄俊文等译),2019.保育遗传学导论.北京：科学 出版社
3、遗传多样性的层次
遗传多样性的表现形式是多层次的。在分子水平，可表 现为核酸、蛋白质、多糖等生物大分子的多样性；在 细胞水平可体现在染色体结构的多样性以及细胞结构 与功能的多样性；在个体水平，可表现为生理代谢差 异、形态发育差异以及行为习性的差异。遗传多样性 通过对上述各层次的生物性状的影响，导致生物体的 不同适应性，进而影响生物的分布和演化。此外，人 们也发现，许多遗传变异并不导致任何可观测到的表 型上的差异。
遗传多样性研究的理论 方法及应用
第一节 遗传多样性概述
►1、遗传多样性的基本概念 ►2、遗传多样性的本质 ►3、遗传多样性的层次
► 分子水平、细胞水平、个体水平、种群水平 ► 4、遗传多样性在进化上的意义 ► 5、遗传多样性的应用价值 ► 6、遗传多样性的现状及展望
1、遗传多样性的基本概念
多基因遗传病ppt课件
5 第5页，共73页。
质量性状
Qualitative trait: genetic traits which are present or absent. One has the trait or not.
6
第6页，共73页。
数量性状
Qualitative trait. Quantitative trait: genetic traits which are measurable characteristics.
问题：什么是紧密连锁？强连锁？不连锁？
38
第38页，共73页。
39
第39页，共73页。
Linkage Disequilibrium (LD)
The preferential occurrence of a disease gene is associated with specific alleles of linked markers.
26
第26页，共73页。
域值
有性别差异域值的分布图
27
第27页，共73页。
4.亲缘关系与发病风险
多基因遗传病有家族聚集倾向，患者 亲属发病率高于群体发病率，但亲属发病 率随着与先证者的亲缘关系级数递增而剧 减，向着群体发病率靠扰。
28 第28页，共73页。
亲缘关系与精神分裂症患病风险
29
第29页，共73页。
人类的许多常见病、先天畸形、恶性肿瘤等是由许 多对基因控制的。这些基因协同作用，即通过所谓的累 加效应（additive effect），再受一定的环境因素作用, 遗传 因素和环境因素相互作用，最终形成明显的表现型(即产 生某些性状、疾病或畸形)。这类疾病也称为复杂性状疾病 （complex disease）。
质量性状
Qualitative trait: genetic traits which are present or absent. One has the trait or not.
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第6页，共73页。
数量性状
Qualitative trait. Quantitative trait: genetic traits which are measurable characteristics.
问题：什么是紧密连锁？强连锁？不连锁？
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第38页，共73页。
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第39页，共73页。
Linkage Disequilibrium (LD)
The preferential occurrence of a disease gene is associated with specific alleles of linked markers.
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第26页，共73页。
域值
有性别差异域值的分布图
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第27页，共73页。
4.亲缘关系与发病风险
多基因遗传病有家族聚集倾向，患者 亲属发病率高于群体发病率，但亲属发病 率随着与先证者的亲缘关系级数递增而剧 减，向着群体发病率靠扰。
28 第28页，共73页。
亲缘关系与精神分裂症患病风险
29
第29页，共73页。
人类的许多常见病、先天畸形、恶性肿瘤等是由许 多对基因控制的。这些基因协同作用，即通过所谓的累 加效应（additive effect），再受一定的环境因素作用, 遗传 因素和环境因素相互作用，最终形成明显的表现型(即产 生某些性状、疾病或畸形)。这类疾病也称为复杂性状疾病 （complex disease）。
遗传多样性ppt课件
4
8 遗传变异 (1)、基因突变（Genetic or point mutation） (2)、染色体变异(Chromosomal variations)
9 遗传漂变（Genetic drift） 10 基因流 （Gene flow）
5
遗传多样性主要内容
遗传多样性的概念和含义 遗传多样性的影响因素 遗传多样性的时空格局
10
2 遗传多样性有多种表现形式
11
实例: 猕猴桃属植物概况
? 全世界共有 66个种， 110个以上分类单位
? 62个种分布在中国 ? 大多数物种具有食用
价值 ? 目前经济栽培的主要
两种: 美味猕猴桃 (A. deliciosa) 和中华猕 猴桃 (A. chinensis)
12
果皮颜色、果面毛被
基因A
突变
基因B
基因型
或者
表现型
3
4 基因频率 5 基因型频率 6 表现型频率 7 基因频率、基因型频率和表现型频率关系
Hardy-Weinberg定律 在随机交配的大群体中，若没有选择、突变、和迁
移（基因流）等因素存在，对于特定的等位基因的基因 频率和基因型频率与基因型频率在世代间保持不变。而 且基因型频率与基因型频率存在着简单的关系。符合上 述条件的种群称之为平衡种群。
A. melanadra, A. kolomikta, A.
callosa, A. rubricaulis, A. polygama, A. chinensis: 2x, 4x
2X
4X
A. valvata：4x, 6x
6X
8X16
－紫红
14
营养成分、风味
? Vitamin C 含量： 10 mg - > 1000 mg
8 遗传变异 (1)、基因突变（Genetic or point mutation） (2)、染色体变异(Chromosomal variations)
9 遗传漂变（Genetic drift） 10 基因流 （Gene flow）
5
遗传多样性主要内容
遗传多样性的概念和含义 遗传多样性的影响因素 遗传多样性的时空格局
10
2 遗传多样性有多种表现形式
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实例: 猕猴桃属植物概况
? 全世界共有 66个种， 110个以上分类单位
? 62个种分布在中国 ? 大多数物种具有食用
价值 ? 目前经济栽培的主要
两种: 美味猕猴桃 (A. deliciosa) 和中华猕 猴桃 (A. chinensis)
12
果皮颜色、果面毛被
基因A
突变
基因B
基因型
或者
表现型
3
4 基因频率 5 基因型频率 6 表现型频率 7 基因频率、基因型频率和表现型频率关系
Hardy-Weinberg定律 在随机交配的大群体中，若没有选择、突变、和迁
移（基因流）等因素存在，对于特定的等位基因的基因 频率和基因型频率与基因型频率在世代间保持不变。而 且基因型频率与基因型频率存在着简单的关系。符合上 述条件的种群称之为平衡种群。
A. melanadra, A. kolomikta, A.
callosa, A. rubricaulis, A. polygama, A. chinensis: 2x, 4x
2X
4X
A. valvata：4x, 6x
6X
8X16
－紫红
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营养成分、风味
? Vitamin C 含量： 10 mg - > 1000 mg
分子遗传学-遗传多态性ppt课件
3ˊ-GACGT↑C-5ˊ HaeⅢ 5ˊ-GG↓CC-3ˊ
3ˊ-CC↑GG-5ˊ
完整编辑ppt
19
完整编辑ppt
20
分型法：
RFLP标记是发展最早的DNA标记技术。
RFLP技术主要包括以下基本步骤：
DNA提取
用限制性内切酶酶切DNA 、
用
凝胶电泳分开DNA片段
把DNA片段转移到滤
膜上 利用放射性标记的探针杂交显示特定的
卫星DNA: 序列重复单位的长度最常见的是100~300bp,有时可 达几千bp,这些基元的拷贝数是1000~100000,形成很长的成 串的重复结构.通常存在于异染色质，主要分布在着丝粒区 域。
小卫星DNA:是一些重复单位在10~60bp,总长度由几百到几千 个bp串联重复序列,它主要存在于近端粒处,在不同的个体间 存在着串联数目的差异,表现出高度的个体特异性,且以孟德 尔方式稳定地遗传和分离,通常又被称为DNA指纹.该类可通 过RFLP的方法加以鉴别.完整编辑ppt来自7DNA标记的分类
依据多态性的检测手段,DNA标记可分为四大类: (1)基于DNA-DNA杂交的DNA标记.
该标记技术是利用限制性内切酶及凝胶电 泳分离不同生物体的DNA分子,然后用经标记 的DNA探针,通过放射自显影或非同位素显色 技术来揭示DNA的多态性.其中最具代表性的 是发现最早和应用广泛的RFLP标记.
EsD分型示意图 完整编辑ppt
15
遗传标记中的第一代标记
RFLP( restriction fragment length polymorphism) 标记技术
RFLP即限制性片段长度多态性.是指用某 一种限制性内切酶来切割来自不同个体的DNA 分子上，内切酶的识别序列有差异，即是由限 制性酶切位点上碱基的插入、缺失、重排或点 突变所引起的。这种差异反映在酶切片段的长 度和数目上。
3ˊ-CC↑GG-5ˊ
完整编辑ppt
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分型法：
RFLP标记是发展最早的DNA标记技术。
RFLP技术主要包括以下基本步骤：
DNA提取
用限制性内切酶酶切DNA 、
用
凝胶电泳分开DNA片段
把DNA片段转移到滤
膜上 利用放射性标记的探针杂交显示特定的
卫星DNA: 序列重复单位的长度最常见的是100~300bp,有时可 达几千bp,这些基元的拷贝数是1000~100000,形成很长的成 串的重复结构.通常存在于异染色质，主要分布在着丝粒区 域。
小卫星DNA:是一些重复单位在10~60bp,总长度由几百到几千 个bp串联重复序列,它主要存在于近端粒处,在不同的个体间 存在着串联数目的差异,表现出高度的个体特异性,且以孟德 尔方式稳定地遗传和分离,通常又被称为DNA指纹.该类可通 过RFLP的方法加以鉴别.完整编辑ppt来自7DNA标记的分类
依据多态性的检测手段,DNA标记可分为四大类: (1)基于DNA-DNA杂交的DNA标记.
该标记技术是利用限制性内切酶及凝胶电 泳分离不同生物体的DNA分子,然后用经标记 的DNA探针,通过放射自显影或非同位素显色 技术来揭示DNA的多态性.其中最具代表性的 是发现最早和应用广泛的RFLP标记.
EsD分型示意图 完整编辑ppt
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遗传标记中的第一代标记
RFLP( restriction fragment length polymorphism) 标记技术
RFLP即限制性片段长度多态性.是指用某 一种限制性内切酶来切割来自不同个体的DNA 分子上，内切酶的识别序列有差异，即是由限 制性酶切位点上碱基的插入、缺失、重排或点 突变所引起的。这种差异反映在酶切片段的长 度和数目上。
遗传多样性的分子检测共40页
不会再掉进坑里。——黑格尔 32、希望的灯一旦熄灭，生活刹那间变成了一片黑暗。——普列姆昌德 33、希望是人生的乳母。——科策布 34、形成天才的决定因素应该是勤奋。——郭沫若 35、学到很多东西的诀窍，就是一下子不要学很多。——洛克
遗传多样性的分子检测
11、获得的成功越大，就越令人高兴 。野心 是使人 勤奋的 原因， 节制使 人枯萎 。 12、不问收获，只问耕耘。如同种树 ，先有 根茎， 再有枝 叶，尔 后花实 ，好好 劳动， 不要想 太多， 那样只 会使人 胆孝懒 惰，因 为不实 践，甚 至不接 触社会 ，难道 你是野 人。(名 言网) 13、不怕，不悔(虽然只有四个字，但 常看常 新。 14、我在心里默默地为每一个人祝福 。我爱 自己， 我用清 洁与节 制来珍 惜我的 身体， 我用智 慧和知 识充实 我的头 脑。 15、这世上的一切都借希望而完成。 农夫不 会播下 一粒玉 米，如 果他不 曾希望 它长成 种籽； 单身汉 不会娶 妻，如 果他不 曾希望 有小孩 ；商人 或手艺 人不会 工作， 如果他 不曾希 望因此 而有收 益。-- 马钉路 德。
遗传多样性的分子检测
11、获得的成功越大，就越令人高兴 。野心 是使人 勤奋的 原因， 节制使 人枯萎 。 12、不问收获，只问耕耘。如同种树 ，先有 根茎， 再有枝 叶，尔 后花实 ，好好 劳动， 不要想 太多， 那样只 会使人 胆孝懒 惰，因 为不实 践，甚 至不接 触社会 ，难道 你是野 人。(名 言网) 13、不怕，不悔(虽然只有四个字，但 常看常 新。 14、我在心里默默地为每一个人祝福 。我爱 自己， 我用清 洁与节 制来珍 惜我的 身体， 我用智 慧和知 识充实 我的头 脑。 15、这世上的一切都借希望而完成。 农夫不 会播下 一粒玉 米，如 果他不 曾希望 它长成 种籽； 单身汉 不会娶 妻，如 果他不 曾希望 有小孩 ；商人 或手艺 人不会 工作， 如果他 不曾希 望因此 而有收 益。-- 马钉路 德。
遗传多样性的分子检测共40页
遗传多样性的分子检测
56、极端的法规，就是极端的不公。 ——西 塞罗 57、法律一旦成为人们的需要，人们 就不再 配享受 自由了 。—— 毕达哥 拉斯 58、法律规定的惩罚不是为了私人的 利益， 而是为 了公共 的利益 ；一部 分靠有 害的强 制，一 部分靠 榜样的 效力。 ——格 老秀斯 59、假如没有法律他们会更快乐的话 ，那么 法律作 为一件 无用之 物自己 就会消 灭。— —洛克
60、人民的幸福是背脊。——非洲 2、最困难的事情就是认识自己。——希腊 3、有勇气承担命运这才是英雄好汉。——黑塞 4、与肝胆人共事，无字句处读书。——周恩来 5、阅读使人充实，会谈使人敏捷，写作使人精确。——培根
56、极端的法规，就是极端的不公。 ——西 塞罗 57、法律一旦成为人们的需要，人们 就不再 配享受 自由了 。—— 毕达哥 拉斯 58、法律规定的惩罚不是为了私人的 利益， 而是为 了公共 的利益 ；一部 分靠有 害的强 制，一 部分靠 榜样的 效力。 ——格 老秀斯 59、假如没有法律他们会更快乐的话 ，那么 法律作 为一件 无用之 物自己 就会消 灭。— —洛克
60、人民的幸福是背脊。——非洲 2、最困难的事情就是认识自己。——希腊 3、有勇气承担命运这才是英雄好汉。——黑塞 4、与肝胆人共事，无字句处读书。——周恩来 5、阅读使人充实，会谈使人敏捷，写作使人精确。——培根