转录组测序
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在 Illumina 分析软件下将转化为序列文件。即所说的raw data 。目前各公共数据 库接受fastq 文件，所以我们提供的raw data 都是fastq 文件。
wenku.baidu.com
4. 平行样品是否需要安排在同一机器同一flowcell 上机？ 答：不需要。平行样品是指建库的时候尽量保证平行，信息分析的时候平行分
析。
5. Raw data 如何读取？为什么不提供原始图像数据和中间过程文件？
答：数据文件以txt 文本格式为主。对于 Windows 用户，推荐使用Editplus 或
UltraEdit 作为浏览程序，否则会因文件过大造成死机。Unix 或Linux 系统比较适 于浏览较大的文本文件。由于Illumina 更新了pipeline，测序过程中生成的图像文 件将实时转化为中间过程文件，这一步完成后图像文件将自动删除，得到中间过
程文件（此文件为二进制文件，只有在Illumina 机器上才能读取，通常不保留），
2. 原核生物都可以做转录组测序分析吗？ 答：都可以。真核生物是利用磁珠调离法将带有 poly(A) 的mRNA 分离出，而原 核生物则是去核糖体RNA 。
3. 测序失败的原因有哪些？测序成功的标准是什么？
答：测序失败的原因是多方面的，设备、耗材、操作等方面都会对测序的结果
造 成影响。我们的设备和耗材质量稳定，工作人员均接受过专业的培训。测序 成功标准：reads 数达标，错误率低，Q20 高等指标。
转录组测序常见问题
摘自华大科技官网
http://www.bgitechsolutions.cn/
1. 提取人、植物、动物、酵母等来源的RNA ，是否有指导性方法?推荐用何种方
法进行？
答：RNA 提取质量的好坏主要取决于样品本身的质量即新鲜程度。除此之外，针 对大多数的动植物组织样品，Invitrogen 公司的Trizol 试剂都能获得较好的提取效 果，请客户参照其说明书进行；对于多糖含量特别丰富的植物组织，如棉花，铁 树，兰花等，可采用杭州博日产的pBIOZOL 试剂或CTAB‐ PVP 结合LiCl 沉淀进行提 取；对于脂肪组织，可采用QIAGEN 公司的RNeasy lipid mini kit进行提取。
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4. 平行样品是否需要安排在同一机器同一flowcell 上机？ 答：不需要。平行样品是指建库的时候尽量保证平行，信息分析的时候平行分
析。
5. Raw data 如何读取？为什么不提供原始图像数据和中间过程文件？
答：数据文件以txt 文本格式为主。对于 Windows 用户，推荐使用Editplus 或
UltraEdit 作为浏览程序，否则会因文件过大造成死机。Unix 或Linux 系统比较适 于浏览较大的文本文件。由于Illumina 更新了pipeline，测序过程中生成的图像文 件将实时转化为中间过程文件，这一步完成后图像文件将自动删除，得到中间过
程文件（此文件为二进制文件，只有在Illumina 机器上才能读取，通常不保留），
2. 原核生物都可以做转录组测序分析吗？ 答：都可以。真核生物是利用磁珠调离法将带有 poly(A) 的mRNA 分离出，而原 核生物则是去核糖体RNA 。
3. 测序失败的原因有哪些？测序成功的标准是什么？
答：测序失败的原因是多方面的，设备、耗材、操作等方面都会对测序的结果
造 成影响。我们的设备和耗材质量稳定，工作人员均接受过专业的培训。测序 成功标准：reads 数达标，错误率低，Q20 高等指标。
转录组测序常见问题
摘自华大科技官网
http://www.bgitechsolutions.cn/
1. 提取人、植物、动物、酵母等来源的RNA ，是否有指导性方法?推荐用何种方
法进行？
答：RNA 提取质量的好坏主要取决于样品本身的质量即新鲜程度。除此之外，针 对大多数的动植物组织样品，Invitrogen 公司的Trizol 试剂都能获得较好的提取效 果，请客户参照其说明书进行；对于多糖含量特别丰富的植物组织，如棉花，铁 树，兰花等，可采用杭州博日产的pBIOZOL 试剂或CTAB‐ PVP 结合LiCl 沉淀进行提 取；对于脂肪组织，可采用QIAGEN 公司的RNeasy lipid mini kit进行提取。