8 抗体酶、核酶和极端酶

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模拟酶核酶极端酶PPT课件

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对任何化学反应,反应物在 变为产物之前,必须获得一
定的能量,成为活化态或 称过渡态。过渡态处于最
高能阶上。
过渡态与反应物的能阶之差
称为活化能。
获得活化能的多少与反应的 速度成正比。
过渡态理论
过渡态理论认为,酶与底物的结合经历了一个 易于形成产物的过渡态,实际上是降低了反应 所需的活化能。
2. 冠醚化合物的模拟酶 冠醚水解酶模拟物
胶束模拟酶
单 分 子 胶 束 酶 模 型
胶束酶模型
目前模拟酶的研究主要有以下几方面:
1.模拟酶的金属辅基:
有一类复合酶,除蛋白质外,还有含金属的有机小分 子物质或简单的金属,叫做辅酶或辅基。辅基在催 化反应中起着重要的作用。有一些研究工作就是模 拟酶分子中的金属辅基。
例如,用分子量为40000~60000的聚亚乙基亚胺 作为模型化合物的骨架,引入10%摩尔的十二烷 基和15%摩尔的咪唑基,合成一个硫酸酯酶模型. 用这个模型聚合物催化苯酚硫酸酯类化合物的水 解,其活性比天然的Ⅱ型芳基硫酸酯酶高100倍。
11.2 抗体酶(Abzyme)
抗体酶概念 抗体酶产生的理论基础 抗体酶的制备方法 抗体酶的应用
酶是生物催化剂
酶是一类具有催化功能的生物分子 酶反应有两个主要的特征:
高催化效率、高选择性
1946年,Pauling用过渡态理论阐明酶催 化的实质
酶之所以具有催化活力是因为它能特异性结合 并稳定化学反应的过渡态(底物激态),从而降 低反应能级。
过渡态理论
过渡态理论是解释酶催化原理的经典理论。
• 模拟酶的酶学基础
–酶的作用机制:过渡态理论 –对简化的人工体系中识别、结合和催化的研究
• 超分子化学
– 主-客体化学:主体和客体在结合部位的空间及 电子排列的互补

分子酶学名词解释简答

分子酶学名词解释简答

分子酶学复习重点1 剪接型核酶:定义:指RNA分子被磷酸二酯酶切割后,伴随着形成新的磷酸二酯键,即磷酸二酯键的转移反应或称转酯反应。

2 剪切型核酶: 这类核酶的作用是只剪不接,催化自身RNA或不同的RNA分子,切下特异行核苷酸序列。

3 探针酶:既保持高度的反应性,又能在DNA中任意选定的区域内进行切割的酶。

实质是核酸内切酶,由两部分组成,第一部分叫做切割系统,为核酸切割试剂或酶,第二部分叫做识别系统,可以识别核酸底物的特定核苷酸序列。

4 人工酶:人工合成的具有催化活性的蛋白质或多肽。

5 模拟酶:利用有机化学合成的一些比酶结构简单得多但具有催化功能的非蛋白质分子。

6 抗体酶:又称催化抗体,是一类具有催化能力的免疫球蛋白,即通过一系列化学与生物技术方法制备出的具有催化活性的抗体,它既具有相应的免疫活性,又能像酶那样催化化学反应。

7 克隆酶:基因工程将某种酶基因导入宿主细胞中大量表达其产物为克隆酶,即用基因工程技术生产的酶。

8 突变酶:用基因定位突变技术修饰天然酶基因,然后用基因工程技术生产该突变基因的酶,被称为突变酶。

9 酶活力(enzyme activity)也称为酶活性,是指酶催化一定化学反应的能力。

10 酶的比活力:单位质量样品中的酶活力;1mg蛋白质中所含的U数;1Kg蛋白质中所含的Kat数。

11 酶的转换数(K cat):当酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子所转换底物分子数,又叫转换数(简称TN), Kcat可以用来衡量酶的催化效率,越大效率越高。

12 亲和标记:利用酶对S的特殊亲和力,将酶加以修饰标记,故称之为亲和标记。

13差别修饰法(差别标记):这种方法是非特异性试剂标记法的一个发展。

它利用竞争性抑制剂或底物预先占据活性中心,使非特异性试剂只修饰活性中心以外的基团,然后透析除去保护剂(即竞争性抑制剂或底物),再用同位素标记的非特异性试剂修饰活性中心的基团。

经氨基酸分析可知哪些基团位于活性中心。

核酶的名词解释

核酶的名词解释

核酶的名词解释核酶是一类具有生物催化活性的蛋白质分子,它们在细胞内起着关键的生物催化作用。

核酶以其特异性的催化活性,参与了细胞内许多重要的生物化学反应。

一、核酶的功能和作用核酶是生物体内基因表达和蛋白质合成等过程中的重要催化剂。

它们通过特异性地识别和切割核酸链,参与了DNA复制、转录和剪接等核酸代谢过程。

核酶还可以识别并修复DNA中的损伤,维护基因组的稳定性。

此外,核酶还参与细胞内RNA的降解和转运,调控RNA的稳定性和水平。

二、核酶的分类核酶的分类可以根据其催化活性的不同而划分。

根据催化反应所涉及的底物类型,核酶可以分为DNA酶和RNA酶。

DNA酶特异地识别DNA链,促使其切割或连接,从而实现DNA修复、复制和重组等生物学过程。

RNA酶则专门作用于RNA分子,具有剪断、修饰和修复RNA的功能。

根据核酶催化所涉及的反应类型,核酶又可以分为内切酶和外切酶。

内切酶可让底物链在催化反应中切断,并促使DNA或RNA链的连接。

外切酶则在催化反应中将底物链截断,形成较小的核酸片段。

这两类酶都起着不可或缺的生物催化作用。

三、核酶的结构和活性中心核酶的催化活性主要集中在其活性中心。

核酶的活性中心通常由氨基酸残基组成,包括天冬酰胺、酪氨酸和组氨酸等残基。

这些氨基酸残基的侧链在催化过程中起到非常关键的作用,帮助核酶识别底物并促使催化反应的进行。

核酶的结构可以是单个蛋白质分子或由多个蛋白质亚基组成的复合物。

不同的核酶结构决定了它们特异性催化的能力。

一些核酶具有特定的结构域,如核心结构域和识别结构域,这些结构域能够与底物发生特异性的相互作用,从而实现催化反应。

四、核酶的研究与应用核酶的研究一直是生命科学领域的热点。

科学家们通过对核酶的研究,揭示了DNA和RNA代谢过程中的许多重要细节,为我们深入理解生命的本质提供了重要的线索。

核酶的研究还带来了许多潜在的应用。

例如,目前已经开发出一些具有特定生物催化活性的核酶,可以在实验室中用于特定的基因治疗或基因工程应用。

抗体酶

抗体酶

1986年Schultz以对硝基苯酚磷酸胆碱酯(PNPPC) 作为相应的羧酸二酯的过渡态类似物。 诱导产生的抗体酶使水解反应速度加快12000倍。
抗体酶
抗体酶(Abzyme)或催化抗体(Catalytic antibody)是抗体的高度选择性和酶的高效 催化能力巧妙结合的产物。
本质上是一类具有催化活力的免疫球蛋
过渡态理论

过渡态理论认为,酶与底物的结合经历了一个 易于形成产物的过渡态,实际上是降低了反应 所需的活化能。
与反应过渡状态结合作用
在酶催化的反应中,与酶的活性中心形 成复合物的实际上是底物形成的过渡状 态, 酶与过渡状态的亲和力要大于酶与底物 或产物的亲和力。
抗体酶设想
1969年Jencks根据抗体结合抗原的高度 特异性,与天然酶结合底物的高度专一 性相类似的特性,在过渡态理论的基础 上首先提出设想:
10.1 模拟酶
11.1.1 模拟酶的概念
模拟酶又称人工酶或酶模型,是在分子 水平上模拟酶活性部位的形状、大小及其微 环境等结构特征,以及酶的作用机制和立体 化学的一门学科,是从分子水平上模拟生物 功能的一门边缘学科。
模拟酶是20世纪60年代发展起来的一个新的研 究领域,是仿生高分子的一个重要的内容。
–酶的作用机制:过渡态理论
–对简化的人工体系中识别、结合和催化的研究
• 超分子化学
– 主-客体化学:主体和客体在结合部位的空间及 电子排列的互补
– 超分子:该分子形成源于底物和受体的结合, 这种结合基于非共价键相互作用,当接受体与 络合离子或分子结合形成稳定的,具有稳定结 构和性质的实体,形成超分子 – 功能:分子识别、催化、选择性输出
白,在
其可变区赋予了酶的属性。 它是利用现代生物学与化学的理论与技术交叉研 究的成果,是抗体的高度选择性和酶的高效催化 能力巧妙结合的产物。

抗体酶核酶和极端酶

抗体酶核酶和极端酶
抗体酶核酶和极端酶
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抗体酶核酶和极端酶
抗体酶 abzyme
生物工程酶 核酸类:
Ribozyme
Deoxyribozyme
其它:模拟酶
抗体酶核酶和极端酶
克隆酶 遗传修饰酶 蛋白质工程新酶 、
二、核酶的分类
I型内含子 剪接型核酶
II型内含子
锤头核酶
剪切型核酶 发夹核酶
自体催化
丁型肝炎病毒(HDV)核酶
RNaseP
异体催化
抗体酶核酶和极端酶
抗体酶核酶和极端酶
第二节 核 酶(Ribozyme)
一、核酶的概念 二、核酶的种类 三、核酶的应用 四、核酶面临的问题 五、影响核酶活性的因素
抗体酶核酶和极端酶
一、核酶的概念
具有生物催化功能的RNA。
生物催化剂 (Biocatalyst)
蛋白质类:天然酶 enzyme
极端酶 extremozyme
抗体酶核酶和极端酶
抗体与酶的异同:
相同点:都是蛋白质,都有特异性。 不同点: 1)抗体无催化活力,酶有催化活力。 2)本质差别:酶是能与反应过渡态选择结合的 催化物质,抗体是和基态紧密结合的物质。 3)酶的活性和合成受到代谢调节,种类有限。 抗体只有在抗原存在时才产生,种类无限。
抗体酶核酶和极端酶
抗体酶核酶和极端酶
第三节 极端酶(extremozyme)
一、极端微生物和极端酶
1.极端微生物:
又称嗜极菌(extremophiles),是在超 常生态环境条件下生存的微生物。
抗体酶核酶和极端酶

8 核酶

8 核酶
T.Cech和S.Altman 分子内(incis)的ribozyme (自我剪接型和自我剪切型) 分子间 (in trans)的ribozyme
Ribozyme的种类
Ribozyme研究进展与展望
第二节 脱氧核酶
一 概念:具有酶活性的DNA分子称为脱氧核酶
二 关键:设计思路与RNA酶类似,不同的是不需要
•2’ –氧对3’ –磷酸进行亲核进攻,形成2’ , 3’ –环磷酸二酯 键(正向过程) •5’-氧作为亲核试剂对2’ , 3’ –环磷酸二酯键发生亲核进攻, 形成磷酸二酯键(逆向过程)
发夹型核酶
•与底物结合后,形成两个结构域(螺旋-环-螺旋) •催化过程不需要金属离子的直接参与,主要Байду номын сангаас稳定 的作用。
锤头结构和发夹结构,其中尖头指出自我剪 切的部位。 • 自我剪接ribozyme:包含剪切与连接两个 步骤。相当于核酸内切酶。
1几种能进行自我剪切的RNA结构
锤头型核酶
•第一个确定的具有催 化活性的RNA
•三个碱基对组成的臂 以及11个保守碱基核 心所组成
•核心中保守碱基是核 酶活性所必需的
锤头型核酶作用机制
四.酶促反应动力学特征
1.PH值和温度对酶反应速率的影响
2.激活剂 3.酶浓度对酶反应速率的影响
1.PH值和温度对酶反应速率的 影响
• pH4-8范围内呈钟形,在pH6.2左右达最大 值。最适温度在40℃左右。
2.激活剂
• K+、 Na+、 Mg2+、 Mn2+、 Pb2+等;阴离 子如组氨酸,还有H+等。表明酶的折叠活 性形式中可能有G-四联体存在。
• Ⅱ型IVS :结构与四膜虫的不同,而与细胞核

核酶和抗体酶

核酶和抗体酶
ination library)
将不同的重链和轻链基因随机组合,克隆 到合适的表达载体中,在原核细胞表达不 同的抗体,形成一个抗体库,从这个抗体 库中,用抗原可以筛选到相应的抗体基因。
引入法
随着噬菌体抗体库技术的完善,可根据需 要构建适当序列的基因片断,绕过免疫学 方法,构建全新的抗体酶。 噬菌体展示技术将组建亿万种不同特异性 抗体可变区基因库和抗体在大肠杆菌中功 能性表达,与高效快速的筛选手段结合起 来,彻底改变了抗体酶生产的传统途径。
A. 酯酶的底 物–酯
B.酯的羧基碳原子 受到亲核攻击形成 四面体过渡态
C.设计的磷酸酯 类似物,作为抗原 去免疫实验动物
O –C –
磷酸酯类似物 免
(半抗原)

对酯水解反应有 催化作用的单克
隆抗体
抗体酶用于有机酯的水解,过渡态类似 物磷酸盐和磷酸酯作为免疫原诱导产生 的单克隆抗体催化水解反应比未催化反 应快104倍。
L-19IVS
G- P
- OH +
15nt
P399nt
图 13- 四膜虫 35S RNA 内含子剪接 的转酯反应模型
L-19具有酶的主要特 征:专一性强,加快 反应速度,反应前后 酶分子保持不变
L-19 IVS所催化的水解反应和连接反应
异议
引入法
用基因工程方法改造和制备全新的抗体酶 是一种很有前途和发展潜力的抗体酶制备 方法。
将催化基因引入到特异抗体的抗原结合 位点上,使其获得催化功能。 也可以针对性地改变抗体结合区的某些 氨基酸序列,以获得高效的抗体酶。
引入法
对于已产生的单抗,分析抗体结合部位 的氨基酸顺序或对应的碱基顺序。 通过对抗体酶结合部位氨基酸对应的基 因序列进行定点突变,希望能在抗体结 合部位换上有催化作用的氨基酸。 改变抗体酶的催化效率。

核酶的名词解释是什么

核酶的名词解释是什么

核酶的名词解释是什么核酶是一类在生物体内起着关键作用的酶。

它们负责催化生物化学反应,从而使细胞正常运作。

核酶是由特定的核酸分子组成的,这些分子包括DNA(脱氧核酸)和RNA(核糖核酸)。

在生物体内,核酶通过识别和结合特定的核酸序列,并对其进行分解或合成,从而控制细胞的生理活动。

作为生物体内的催化剂,核酶在细胞的基因表达和蛋白质合成等重要过程中起着至关重要的作用。

在蛋白质合成过程中,核酶通过解读DNA上的基因编码信息,将其转录成RNA,然后通过翻译过程将RNA翻译成具有特定功能的蛋白质。

核酶还参与到DNA复制和修复、RNA剪接和RNA降解等其他重要的细胞过程中。

核酶的命名通常根据它们在生物体内的功能和特定的反应类型来命名。

核酶可以分为多个不同的类别,包括内切酶、连接酶、多聚酶、脱氧核糖核酸酶(RNase)和核糖核酸酶(DNase)等。

内切酶是一类能够将DNA或RNA分子切割成特定片段的酶。

它能够识别和结合特定的DNA或RNA序列,并在该序列内部切割链。

内切酶在基因工程和分子生物学研究中起着重要的作用,例如用于构建基因工程载体和进行DNA测序等。

连接酶则具有将两个DNA或RNA分子连接成一个新分子的能力。

它能够将两个分子中的特定位置连接在一起,从而形成一个新的分子。

连接酶在DNA修复和重组、病毒复制以及细胞分裂等过程中起到重要作用。

多聚酶是一类具有合成DNA或RNA链的能力的酶。

它能够从已存在的单链DNA或RNA模板合成新的链。

多聚酶在DNA复制和RNA合成中起到至关重要的作用,确保基因信息的传递和细胞正常功能的实现。

脱氧核糖核酸酶(RNase)和核糖核酸酶(DNase)是一类负责分解RNA和DNA分子的酶。

它们能够将RNA或DNA分子中的化学键切断,从而使它们被分解成更小的片段。

RNase和DNase在生物体内维持核酸水平的平衡以及参与到细胞凋亡和免疫响应等过程中发挥重要作用。

除了上述核酶类别外,还存在其他酶能够催化和调控其他生物化学反应。

模拟酶核酶极端酶

模拟酶核酶极端酶

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适应环境的比较
极端酶在极端环境下具有稳定的结 构和活性,而核酶则通常在温和的 生理条件下发挥催化作用。
催化机制的差异
核酶的催化机制涉及RNA特定结构 的形成和变化,而极端酶的催化机 制则是通过蛋白质的特定结构和功 能来实现的。
三种酶的未来发展前景
模拟酶的发展前景
核酶的发展前景
极端酶的发展前景
随着生物技术的不断进步,模拟酶有 望在药物研发、生物检测和生物工程 等领域发挥更大的作用。通过改进合 成方法和优化结构,可以提高模拟酶 的稳定性和催化活性,进一步拓展其 应用范围。
模拟酶核酶极端酶
• 模拟酶 • 核酶 • 极端酶 • 比较与展望
01
模拟酶
模拟酶的定义
模拟酶是一种人工合成的酶类似物, 通过模拟天然酶的活性中心结构和催 化机制,实现与天然酶相似的催化功 能。
模拟酶通常由有机小分子、聚合物、 无机材料或复合物等组成,与天然酶 相比具有更高的稳定性和可调控性。
模拟酶的分类
根据催化机制
模拟酶可分为模拟氧化还原酶、模拟水解酶、模拟裂合酶等。
根据组成
模拟酶可分为有机模拟酶和无机模拟酶,其中有机模拟酶又可分为 小分子模拟酶和聚合物模拟酶。
根据结构
模拟酶可分为球状模拟酶、纤维状模拟酶和管状模拟酶等。
模拟酶的应用
药物设计与开发
模拟酶可用于设计具有特定催 化功能的药物,提高药物的疗
核酶是一种具有催化功能的RNA分子,通过自身折 叠成特定的三维结构来发挥催化作用。
02
核酶具有高度的特异性,能够识别并切割特定的 RNA序列,从而调控基因的表达。
03
核酶的发现对于理解生命本质和探索生命起源具有 重要意义。

分子酶学名词解释简答

分子酶学名词解释简答

分子酶学复习重点1 剪接型核酶:定义:指RNA分子被磷酸二酯酶切割后,伴随着形成新的磷酸二酯键,即磷酸二酯键的转移反应或称转酯反应。

2 剪切型核酶: 这类核酶的作用是只剪不接,催化自身RNA或不同的RNA分子,切下特异行核苷酸序列。

3 探针酶:既保持高度的反应性,又能在DNA中任意选定的区域内进行切割的酶。

实质是核酸内切酶,由两部分组成,第一部分叫做切割系统,为核酸切割试剂或酶,第二部分叫做识别系统,可以识别核酸底物的特定核苷酸序列。

4 人工酶:人工合成的具有催化活性的蛋白质或多肽。

5 模拟酶:利用有机化学合成的一些比酶结构简单得多但具有催化功能的非蛋白质分子。

6 抗体酶:又称催化抗体,是一类具有催化能力的免疫球蛋白,即通过一系列化学与生物技术方法制备出的具有催化活性的抗体,它既具有相应的免疫活性,又能像酶那样催化化学反应。

7 克隆酶:基因工程将某种酶基因导入宿主细胞中大量表达其产物为克隆酶,即用基因工程技术生产的酶。

8 突变酶:用基因定位突变技术修饰天然酶基因,然后用基因工程技术生产该突变基因的酶,被称为突变酶。

9 酶活力(enzyme activity)也称为酶活性,是指酶催化一定化学反应的能力。

10 酶的比活力:单位质量样品中的酶活力;1mg蛋白质中所含的U数;1Kg蛋白质中所含的Kat数。

11 酶的转换数(K cat):当酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子所转换底物分子数,又叫转换数(简称TN), Kcat可以用来衡量酶的催化效率,越大效率越高。

12 亲和标记:利用酶对S的特殊亲和力,将酶加以修饰标记,故称之为亲和标记。

13差别修饰法(差别标记):这种方法是非特异性试剂标记法的一个发展。

它利用竞争性抑制剂或底物预先占据活性中心,使非特异性试剂只修饰活性中心以外的基团,然后透析除去保护剂(即竞争性抑制剂或底物),再用同位素标记的非特异性试剂修饰活性中心的基团。

经氨基酸分析可知哪些基团位于活性中心。

14酶工程抗体酶核酶极端

14酶工程抗体酶核酶极端

抗体
由抗原诱导产生的,在结构上与抗原高度 互补并与抗原具有特异结合功能的免疫球 蛋白。 抗体的最显著的特征是多样性和专一性
抗体中的每条链中有恒定区和可变区。
抗体与酶的异同:
相同点:
都是蛋白质,都有特异性。
1)酶是能与反应过渡态选择结合的催化性物
质,抗体是和基态分子结合的物质。它们识别
底物的机理是相同的。
过渡态理论

过渡态理论认为,酶与底物的结合经历了一个 易于形成产物的过渡态,实际上是降低了反应 所需的活化能。
抗体酶设想
1969年Jencks根据抗体结合抗原的高度特异性, 在过渡态理论的基础上首先提出设想:

与天然酶结合底物的高度专一性相类似的特性,
能与化学反应中过渡态结合的抗体,可能具有酶 的活性,催化反应的进行。
抗体,即抗体酶。
1986年Schultz以对硝基苯酚磷酸胆碱酯(PNPPC) 作为相应的羧酸二酯的过渡态类似物。 诱导产生的抗体酶使水解反应速度加快12000倍。
抗体酶
抗体酶(Abzyme)或催化抗体 (Catalytic antibody)本质上是一类具 有催化活力的免疫球蛋白,在其可变区赋予 了酶的属性。
2.剪切型核酶
这类RNA进行自身催化的反应是只切不接。 1)自体催化剪切型 剪切机制
锤头型核酶的二级结构 和空间立体结构示意图
•三个双螺旋区。
•13个核苷酸残基 保守序列。 •剪切反应在右上 方GUX序列的3‘端 自动发生。
发夹(hairpin )结构
1989年汉普(Hample)研究烟草环斑病毒 (sTRSV)的负链RNA的自我剪切反应,提 出发夹结构(hairpin structure)模型。
它是利用现代生物学与化学的理论与技术交

核酶

核酶

+GpN
L-19IVS

自我剪接反应释放出来的IVS还可以通过转磷酸酯反应而 自身环化。IVS经过两次环化和开环,最后得到共失去19 个核苷酸的线状IVS。L-19IVS本身缺少环化点,不再能 催化分子内反应,但它能催化其他RNA分子发生化学反 应,具有5种酶的活力。
建议的L19 RNA催化机理
锤头二级结构编号
17位( X )的核苷酸残
基多数是C,不能是U,G. 7位核苷酸残基的置换 不会对酶活性产生很大 影响
17位核苷酸
7位核苷酸
发夹(hairpin )结构

发夹核酶发现于三种不同植物RNA病毒,即烟草环点 病毒,菊苣黄色斑点病毒型和筷子芥花叶病毒。三种发夹 核酶分别是这些RNA病毒卫星RNA的负链,英文缩写分 别是sTRSV,sCYMVT,sARMV,均为单链RNA。 发夹核酶结构模型 发夹核酶催化机制 金属离子在催化反应 中起结构 作用,其剪切活性比锤头结构核酶高。
体外: 体内:
2.1 剪切机制
Mg 2+
2.2 结构与功能的关系 活性是必需的。
M1RNA 5‘端完整结构对维持催化
RNaseP可剪切前
剪切位点
体5‘端41nt, 5’端成熟。
不同tRNA的 5’ 端没有 顺序共同性,剪切的准
确性与剪切部位周围的
核苷酸顺序无关,表明 在RNaseP的组分内没 有引导序列, RNaseP 所识别的是底物的高级 结构。

T.Cech的重要发现开始于1981年。 研究目的:细胞中DNA转录成rRNA后,rRNA中一些无意 义的序列,或“内含子”(intron),如何从RNA分子中 剪切下来的。根据过去传统的概念,这一过程必须要有 蛋白质酶来完成。

核酶名词解释

核酶名词解释

核酶名词解释核酶(RNA酶)是一类能够催化核酸分子的降解、合成以及修复等生物学反应的酶类。

核酶可以将核酸分子加水分解为较小的核苷酸单元,也可以通过连接核苷酸单元形成新的核酸链。

核酶在细胞内起到重要的调控作用,参与基因表达、RNA修饰、病毒拟拟的以及其他生物过程。

核酶按其功能可分为多个亚类,其中一些重要的亚类包括:1.核外酶(exoribonucleases):核外酶能够将多核苷酸链的末端加水分解,从而将核酸降解为较短的片段。

这些酶在细胞碎裂或凋亡等过程中起到关键作用,并参与RNA质己检测和降解等关键生物过程。

2.核内酶(endoribonucleases):核内酶参与核酸修复、RNA间断修复以及基因表达调控等生物过程。

这些酶能够识别和催化单链核酸或双链核酸的切割,从而产生特定的RNA片段或修复RNA分子。

3.转录酶(transcriptases):转录酶是一类能够合成RNA链的核酶。

在转录过程中,转录酶能够识别DNA模板链的碱基序列,并通过与适应性互补的核苷酸单元进行配对和连接,合成与DNA模板链相互互补的RNA链。

4.修饰酶(Modifier enzymes):修饰酶是一类催化RNA修饰反应的核酶。

RNA修饰包括核碱基的化学修饰、RNA链的修饰以及RNA结构的调节等。

修饰酶可以对RNA分子上的特定碱基进行化学修饰,从而调节RNA的功能、稳定性以及相互作用等。

核酶不仅在生物体内起到重要的生理调控作用,还被广泛应用于分子生物学、生物技术以及医学等领域。

通过研究和应用核酶,科学家们可以更好地理解细胞内的基因调控机制、RNA 修饰以及疾病的发生机制,并开发出针对核酸分子的药物和诊断方法。

酶工程 核酶和抗体酶(6.3)--抗体酶与核酶

酶工程 核酶和抗体酶(6.3)--抗体酶与核酶
• 并将这类具催化能力的免疫球蛋白称为催 化抗体,即抗体酶。
1986 年 Schultz 以对硝基苯酚磷酸胆碱酯( PNPP C )作为相应的羧酸二酯的过渡态类似物。
诱导产生的抗体酶使水解反应速度加快 12000 倍。
抗体酶
• 抗体酶( Abzyme )或催化抗体( Cata lytic antibody)
–能与化学反应中过渡态结合的抗体,可 能具有酶的活性,催化反应的进行。
• 1986 年 Lerner 和 Schultz 证实了这一设想 。
抗体酶的发现
• Lerner 和 Schultz 分别领导各自的研究小 组首次观察到了抗体具有选择性的催化活 性。
• 1986 年美国 Lerner 和 Schultz 两个实验室 同时在 Science 上发表论文,报道他们成 功地得到了具有催化活性的抗体。
抗体酶的催化反应类型
• 1 、转酰基反应 • 2 、水解反应 • 3 、 Claisen 重排反应 • 4 、酰胺合成反应 • 5 Diels-Alder 反应 • 6 、转酯反应 • 7 、光诱导反应 • 8 、氧化还原反应 • 9 、脱羧反应 • 10 、顺反异构化反应
抗体酶的特性
• 2 、有更强的专一性和稳定性 – 抗体的精细识别使其能结合几乎任何 天然的或合成的分子 – 抗体酶催化反应的介质效应 • 酯解反应中介质效应 • 脱羧反应中介质效应 • 酰基转移反应中介质效应
诱导法
“ 制备”抗原: 设计过渡态类似物
合成半抗原 半抗原-载体
筛选抗体酶: 筛选具有催化 性能的单抗
杂交瘤细胞制备: 免疫小鼠
与骨髓瘤细胞结合 限制性稀释
筛选与半抗原具有 高亲和力的克隆
制备单克隆抗体: 将细胞培养于腹水液或 培养介质中生产单抗

第八章 核酶和抗体酶 PPT课件

第八章 核酶和抗体酶 PPT课件

一、 抗体酶概述
概念
• 是一种具有催化功能的免疫球蛋白(抗体分子), 在其可变区赋予了酶的属性,属于化学人工酶
酶与抗体的差别
酶是能与反应过渡态选择结合的催化性物质,抗 体是和基态分子结合的非催化性物质
二、 抗体酶的催化反应
1、酰基转移反应
二、 抗体酶的催化反应
2、重排反应
二、 抗体酶的催化反应
Thomas Cech University of Colorado at Boulder, USA
一、核酶的发现
1983年美国S.Altman等研究RNaseP(由20%蛋 白质和80%的RNA组成),发现RNaseP中的RNA可 催化E. coli tRNA的前体加工
Sidney Altman Yale University New
这类RNA进行自 身催化的反应是只切 不接。
特点:在 Mg 2+ 或其 他二价金属离子存在 下,在特定的位点, 自我剪切,产生5’OH 和2’,3’-环磷酸 二酯末端。
核酶自身剪切反应
锤头型核酶的二级结构 和空间立体结构示意图
三个双螺旋区 13个核苷酸残基保 守序列
剪切反应在右上方 GUX序列的3’端自 动发生
3、氧化还原反应
二、 抗体酶的催化反应
4、金属螯和合反应
二、 抗体酶的催化反应
5、磷酸酯水解反应
二、 抗体酶的催化反应
6、磷酸酯闭环反应
二、 抗体酶的催化反应
7、光诱导反应
a. 光聚合反应(二聚作用)
二、 抗体酶的催化反应
7、光诱导反应
b. 光裂解反应
三、 抗体酶的制备方法
1、拷贝法 2、引入法
I型内含子
根 剪接型核酶

第八章 核酶和抗体酶

第八章 核酶和抗体酶

DNA是双股核酸,而且其分子量非常巨大, 因此无法自由卷绕成特定构象,都只是形成 长长的双螺旋结构。
1982年,切赫(Cech)发 现四膜虫前体rRNA的自我剪接

1983年,阿尔特曼(Altman)发现核 糖核酸酶P的RNA部分具有催化能力。
1989年,二者获得诺贝尔化学奖
一.切赫:四膜虫rRNA前体的自我剪接实验
微生物名称 酶名称 识别顺序 同裂酶 同尾酶
Bacillus amyloliquefaciens H 解淀粉芽孢杆菌
Bacillius globigil 球芽孢杆菌 Escherichia coli RY13 大肠杆菌 Haemophilus influenzae 流感嗜血菌 Providencia stuartii 164 普罗威登细菌 Streptomyces albus Subspecies pathocidicus 白色链球菌
DNA聚合酶
逆转录酶 碱性磷酸酶 T4多聚核苷酸激酶
末端脱氧核苷酸转移酶
例题:
1. 20世纪80年代初,Cech 和Altman分别发现了具有催化功能的核酶, 打破了酶只是蛋白质的传统观念,为此双双获得了1989年的诺贝尔 化学奖。“核酶”是指某些( )。 A.DNA B.RNA C.染色体 D.ATP 2. 人体内的酶都是蛋白质吗?下列关于人体内蛋白质的叙述中,正确的 是 A.蛋白质具有多样性,是由于氨基酸的种类、数目、排列顺序和空 间结构不同 B.指导蛋白质合成的基因中的碱基有C、G、A、T、U C.人体内的酶都是蛋白质,激素不一定是蛋白质 D.蛋白酶也是蛋白质,能够把蛋白质分解为氨基酸 答案是C。
二.奥尔特曼:
RNaseP(核糖核酸酶P)中的RNA亚基的催化功 能的研究

week-6-抗体酶 核酶 极端酶

week-6-抗体酶 核酶 极端酶

能与过渡态结合的抗体也具有酶的性质
根据Pauling理论,William Jencks于1969年预言:若能找 理论, 年预言: 根据 理论 于1969年预言 到对应某反应过渡态的抗体,将其加入该反应体系中, 到对应某反应过渡态的抗体,将其加入该反应体系中,就可 观测到这个抗体对该反应的催化效应。 观测到这个抗体对该反应的催化效应。 也即:抗体若能与某化学反应的过渡态结合, 也即:抗体若能与某化学反应的过渡态结合,则这样的抗 体必也能像酶一样,使其活化能降低, 体必也能像酶一样,使其活化能降低,从而帮助大量反应物 分子跨越能障,达到加速反应的目的。 分子跨越能障,达到加速反应的目的。 抗体一旦能与过渡态相结合, 这就意味着 ,抗体一旦能与过渡态相结合,它就具有酶的 性质,即在温和条件下高效专属地催化学反应。 性质,即在温和条件下高效专属地催化学反应。
抗体酶的作用机制
如果以激发态的分子为半抗原激发免疫系统产生抗体 ,那 么这种抗体就可能像酶一样催化经过此过渡态的化学反应。 么这种抗体就可能像酶一样催化经过此过渡态的化学反应。 由于在实践中很难获得反应的过渡态, 由于在实践中很难获得反应的过渡态,激发态的过渡态分 子不可能作为抗原来产生抗体, 子不可能作为抗原来产生抗体,所以对某一特定的酶催化的 化学反应, 可以合成一种稳定态分子,它在带电性能, 化学反应, 可以合成一种稳定态分子,它在带电性能,几何形 状与反应过渡态分子结构类似。 状与反应过渡态分子结构类似。这种稳定态分子即为过渡态 类似物。 类似物。 设计和制备稳定的过渡态类似物, 设计和制备稳定的过渡态类似物,以此代替反应的过渡态 作为半抗原诱导产生抗体, 作为半抗原诱导产生抗体,这样产生的抗体就能识别反应过 程的真正过渡态,该抗体具有酶催化反应的基本特征, 程的真正过渡态,该抗体具有酶催化反应的基本特征,可能 成为一种具有酶活性的抗体。这就是我们所称的抗体酶。 成为一种具有酶活性的抗体。这就是我们所称的抗体酶。

核酶与抗体酶

核酶与抗体酶
主讲
陈 惠
核 酶(Ribozyme) 酶(Ribozyme)
一、概述 二、剪接型核酶 三、剪切型核酶 四、核酶的应用 五、核酶技术面临的问题 六、脱氧核酶(deoxyribozyme)
一、概 述
1、对酶及生物催化剂的认识的发展 对酶及生物催化剂的认识的发展
蛋白质类: 蛋白质类:天然酶 enzyme 极端酶 extremozyme 抗体酶 abzyme 生物催化剂 (Biocatalyst) ) 生物工程酶 核酸类: 核酸类 Ribozyme Deoxyribozyme 其它: 其它:模拟酶
四、核酶的应用
一、在医学领域中的应用:
1. 通过识别特定位点而抑制目标基因的表达,抑制效率高, 专一性强。 2. 免疫源性低,很少引起免疫反应。 3. 针对锤头核酶而言,催化结构域小,既可作为转基因表达产 物,也可以直接以人工合成的寡核苷酸形式在体内转运。
二、在其他领域的应用
防治动、植物 病毒侵害:马铃薯纺锤形块茎类病毒负链 的多价核酶构建,马铃薯卷叶病毒复制酶基因负链的突变 核酶的克隆等
5 ’ 3’
Ⅱ类内含子二级结构模式
发夹二级结构模型
剪切位点 3 ‘ 5 ‘
5个环和4个螺旋形成两个 结构域 剪切反应发生在底物识别 序列GUC的5‘端 两个内部环中的碱基及在 螺旋区Ⅱ的G11和底物中 的G+1都是酶发挥作用所 必需的。
HDV RNA斧头结构模式
剪切部位 三个碱基对的茎 需要二价阳离子, 需要二价阳离子, 产生5‘ 产生 ‘-OH和 2’,3’-环 和 ’ ’环 磷酸
7位核苷酸 位核苷酸
发夹(hairpin 发夹(hairpin )结构
发夹核酶发现于三种不同植物RNA病毒,即 烟草环点病毒,菊苣黄色斑点病毒型和筷子芥 花叶病毒。三种发夹核酶分别是这些RNA病毒 卫星RNA的负链,英文缩写分别是 sTRSV,sCYMVT,sARMV,均为单链RNA。 发夹核酶结构模型 发夹核酶催化机制 金属离子在催化反应 中起结构作用,其剪切活性比锤头结构核酶高。
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+GpN
2)Ⅱ类内含子的自我剪接
Ⅱ型IVS是与细胞核mRNA前体的IVS结构
相似的间隔序列。通过转磷酸酯反应, 生成成熟的RNA及套环状的IVS。催化的 剪接反应不需要鸟苷或鸟苷酸参加,但 仍需要镁离子(Mg2+)。 剪接机制
2‘
p 5‘
HO-A

p
3‘
套环的形成
Mg 2+
3’
OH
p-A
p
外显子连接 p
7. 光诱导反应
a.光聚合反应(二聚作用)
b.光裂解反应
研究展望
1. 研究酶作用机理,获得蛋白质结构与功
能间关系的一般规律。 2. 获得一类新型的蛋白酶。 3. 催化天然酶不能催化的反应。
第二节 核 酶(Ribozyme)
一、核酶的概念 二、核酶的种类 三、核酶的应用 四、核酶面临的问题 五、影响核酶活性的因素
•三个双螺旋区。 •13个核苷酸残基 保守序列。
•剪切反应在右上 方GUX序列的3‘端 自动发生。
发夹(hairpin )结构
1989年汉普(Hample)研究烟草环斑病毒 (sTRSV)的负链RNA的自我剪切反应,提 出发夹结构(hairpin structure)模型。
发夹核酶结构模型
发夹二级结构模型
剪切位点
•四个螺旋区、三
个连接区和两个环。 •剪切反应发生在 底物识别序列GUC 的5‘端。
3‘ 5‘
2) 异体催化剪切型
核糖核酸酶P(RNaseP)是内切核酸酶, 是核糖核蛋白体复合物,能剪切所有tRNA前 体的5‘端,除去多余的序列,形成3’-OH 和 5’-磷酸末端。

RNaseP由M1RNA和蛋白质亚基组成。
抗体介导前药治疗技术:将能水解前药释放出 肿瘤细胞毒剂的酶和肿瘤专一性抗体相偶联,则酶 通过和肿瘤结合的抗体存在于细胞的表面。静脉给 药后,当药物扩散至肿瘤细胞的表面或附近,抗体
酶将前药迅速水解释放出抗肿瘤药物。
抗体酶的催化反应
1.酰基转移反应
2.重排反应
3.氧化还原反应
5.磷酸酯水解反应
6.磷酸酯闭环反应
都是蛋白质,都有特异性。
不同点:
1)抗体无催化活力,酶有催化活力。
2)本质差别:酶是能与反应过渡态选择
结合的催化物质,抗体是和基态紧密结合 的物质。
3)酶的活性和合成受到代谢调节, 种类有限。 抗体只有在抗原存在时才产生,种 类无限。
2.酶与底物形成过渡态理论
酶的催化在于能结合底物产生过渡 态,降低能障(反应的活化能)。 以过渡态类似物作为半抗原,诱导 与其互补构象的抗体,使其具有催化活 性,可观察到抗体催化相应底物发生化 学反应。
ribozyme的发现
80年代初期,美国科罗拉多大学博尔德分校的
Thomas Cech和美国耶鲁大学的Sidnery
Altman各自独立地发现RNA具有生物催化功
能.从而改变了生物催比剂的传统概念。
为此,T.Cech和S.Altman共同获得了1989
年度诺贝尔化学奖。
一、核酶的概念
具有生物催化功能的RNA。
3‘
GOH 3’ G-IVS
5’GAAA 19nt L-19IVS
1、转核苷酸作用
2CpCpCpCpC
2、水解作用 CpCpCpCpC 3、转磷酸作用
CpCpCpCpCpC
+CpCpCpC CpCpCpC + pC
CpCpCpCpCpCp+UpCpU CpCpCpCpCpC + UpCpUp 4、去磷酸作用 CpCpCpCpCp CpUpCpUpN CpCpCpCpC +Pi +G CpUpCpU 5、限制性内切酶作用
蛋白质类:天然酶
极端酶 抗体酶 生物催化剂 (Biocatalyst)
enzyme
extremozyme abzyme
生物工程酶 核酸类:
Ribozyme Deoxyribozyme
克隆酶
其它:模拟酶
遗传修饰酶 蛋白质工程新酶 、
二、核酶的分类
I型内含子
剪接型核酶
II型内含子
锤头核酶 剪切型核酶 发夹核酶 自体催化 丁型肝炎病毒(HDV)核酶 RNaseP 异体催化
自然界存在催化分子内反应(in cis)的
ribozyme(自我剪接型和自我剪切型)和催化 分子间反应(in trans)的ribozyme。
自我剪接ribozyme分类
自我剪接ribozyme可分为两类:
Ⅰ型IVS:均与四膜虫大核rRNA前体的IVS结构相似、催化 自我剪接需鸟苷(或5′鸟苷酸)和Mg2+参与。 Ⅱ型IVS :结构与四膜虫的不同,而与细胞核mRNA前体中
类 内 含 子 的 剪 接 机 制
P-A
HO 3’
2.剪切型核酶
这类RNA进行自身催化的反应是只切不接。 1)自体催化剪切型 剪切机制
剪 切 机 制
转酯化过程:
由靠近切割 位点3‘端的2’OH或 氧原子对切割位
点的磷原子实施
亲核攻击,产生
5‘-OH 和2’,3‘环磷酸二酯。
核酶自身剪切反应
锤头型核酶的二级结构 和空间立体结构示意图
如:L-19IVS具有5种酶活性,可催化多 种分子间反应。
1.剪接型核酶
剪接型核酶的作用机制是通过既剪
又接的方式除去内含子(Intron)。
1)I类内含子的自我剪接(Self-splicing)
I型IVS是与四膜虫26srRNA前体的IVS结构 相似的间隔序列,具有环状结构。通过转 磷酸酯反应,生成成熟的26srRNA及G-IVS, G-IVS经两次环化生成L-19IVS。催化过程 需要鸟苷酸或鸟苷以及镁离子参与。 剪接机制 L-19IVS在体外的多种酶活性
3 引入法
将催化基团或辅助因子引入到抗体的抗原结
合部位,可采用选择性化学修饰方法,亦可 利用蛋白质工程和基因工程技术
引入法举例
四、抗体酶的应用
1.戒毒:
用可卡因水解的过渡态类似物-磷酸单酯为半 抗原,产生的单克隆抗体能催化可卡因的分解, 水解后的可卡因片断失去可卡因刺激功能。
2. 肿瘤治疗
嗜压菌(barophiles)
抗辐射的微生物
2. 极端酶的制备
1)天然极端酶的筛选和生产 2)蛋白质工程生产极端酶
思考题:
对动物进行免疫,取免疫动物的脾细胞与
骨髓瘤细胞杂交,杂交细胞则分泌单克隆
抗体,经筛选和纯化,得抗体酶。
2. 拷贝法
用酶作为抗原免疫动物得到抗酶的抗 体,再将此抗体免疫动物并进行单克隆化, 获得单克隆的抗抗体。对抗抗体进行筛选, 获得具有原来酶活性的抗体酶。
缺点:具有一定的盲目性和偶然性,并且不能产 生新酶.
为底物的ribozyme
第三节 极端酶(extremozyme)
一、极端微生物和极端酶
1.极端微生物:
又称嗜极菌(extremophiles),是在
超常生态环境条件下生存的微生物。
根据所耐受的环境条件不同,分为:
嗜热菌(thermophiles) 超嗜热菌(hyperthermophiles) 嗜冷菌(psychrophiles) 嗜盐菌(halophiles) 嗜酸菌(acidophiles) 嗜碱菌(alkaliphiles)
的IVS相似。它催化自我剪接反应不需要鸟苷或鸟苷酸参与,
但仍需Mg2+
2.自我剪切ribozyme的分类
自我剪切ribozyme, 自我剪切的RNA结构有
锤头结构和发夹结构,其中尖头指出自我剪 切的部位。 自我剪接ribozyme:包含剪切与连接两个步 骤。
几种能进行自我剪切的RNA结构
催化分子间反应的ribozyme的分 类
3’ HO-G
GMP,GDP,GTP

p 5‘
P-G 3’ OH
p Mg
2+或Mn 2+
p
类 内 含 子 的 剪 接 机 制
3‘ HO
p
P-G
外显子
内含子或居间序列 (Intervening sequence,IVS)
内含子
5'
5'外显子
3'外显子 U pA G pU 3'
第一次转酯反应
pG-OH
二、抗体酶的定义
抗体酶又称催化抗体(catalytic antibody),是抗体的高度选择性和酶 的高效催化能力巧妙结合的产物,本 质上是一类具有催化活力的免疫球蛋 白,在其可变区赋予了酶的属性。
三、抗体酶的制备 1. 诱导法
用设计好的半抗原,通过与载体蛋白
(如牛血清白蛋白)偶联制成抗原。然后
可找出其结构功能域和必需基团,据此可进 行分子改造,以获得分子更小的、高效的 ribozyme
研究热点:
从催化分子内反应的自我剪切ribozyme设计
出催化分子间反应的ribozyme.
Ribozyme的固定化
Ribozyme的固定化已成功,将在医学、工业上获得应用。
意义: 对各种RNA-蛋白质复合物酶的分离鉴定,对许多具有特别 重要生物功能的RNA和蛋白质构成的颗粒体。在自然界将会 发现更多的具有自我剪接或自我剪切的RNA分子和以非RNA
抗体酶 核酶 极端酶
Abzyme Ribozyme extremozyme
第一节 抗体酶(Abzyme)
一、抗体酶的理论基础
1. 抗体蛋白的特性:
抗体(antibody):
抗原(antigen): 半抗原(hapten):
IgG的三级结构
IgG与抗原形成 的交联晶格
抗体与酶的异同:
相同点:
三、核酶的应用
1. 基础理论:生命起源的探索 2. 医药: 1)通过识别特定位点而抑制目标基因的表达, 抑制效率高,专一性强。如抗肝炎病毒、抗人类免 疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV- Ⅰ)、抗肿瘤。 2)免疫原性低,很少引起免疫反应。 3. 植物抗病毒
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