DNAman序列拼接
序列分析软件DNAMAN 的使用方法简介
序列分析软件DNAMAN 的使用方法简介DNAMAN 是一种常用的核酸序列分析软件。
由于它功能强大，使用方便，已成为一种普遍使用的DNA 序列分析工具。
本文以DNAMAN 5.2.9 Demo version 为例，简单介绍其使用方法。
打开DNAMAN，可以看到如下界面：第一栏为主菜单栏。
除了帮助菜单外，有十个常用主菜单，第二栏为工具栏：第三栏为浏览器栏：在浏览器栏下方的工作区左侧，可见Channel 工具条，DNAMAN 提供20 个Channel，(如左所示：)点击Channel 工具条上相应的数字，即可击活相应的Channel。
每个Channel 可以装入一个序列。
将要分析的序列（DNA 序列或氨基酸序列）放入Channel 中可以节约存取序列时间，加快分析速度。
此版本DNAMAN 提供自动载入功能，用户只需激活某个Channel，然后打开一个序列文件，则打开的序列自动载入被激活的Channel 中。
本文以具体使用DNAMAN 的过程为例来说明如何使用DNAMAN 分析序列。
1．将待分析序列装入Channel（１）通过File Open 命令打开待分析序列文件，则打开的序列自动装入默认Channel。
（初始为channel1）可以通过激活不同的channel (例如：channel5)来改变序列装入的Channel。
（２）通过Sequence/Load Sequence 菜单的子菜单打开文件或将选定的部分序列装入Channel 。
通过Sequence/Current Sequence/Analysis Defination 命令打开一个对话框，通过此对话框可以设定序列的性质（DNA 或蛋白质），名称，要分析的片段等参数。
2．以不同形式显示序列通过Sequence//Display Sequence 命令打开对话框，如下图所示：根据不同的需要，可以选择显示不同的序列转换形式。
对话框选项说明如下：Sequence &Composition 显示序列和成分Reverse Complement Sequence 显示待分析序列的反向互补序列Reverse Sequence 显示待分析序列的反向序列Complement Sequence 显示待分析序列的互补序列Double Stranded Sequence 显示待分析序列的双链序列RNA Sequence 显示待分析序列的对应RNA 序列3．DNA 序列的限制性酶切位点分析将待分析的序列装入Channel，点击要分析的Channel，然后通过Restriction/Analysis 命令打开对话框，如下所示：参数说明如下：Results 分析结果显示其中包括：Show summary（显示概要） Show sites on sequence（在结果中显示酶切位点）Draw restriction map（显示限制性酶切图）Draw restriction pattern（显示限制性酶切模式图）Ignore enzymes with more than（忽略大于某设定值的酶切位点）Ignore enzymes with less than（忽略小于某设定值的酶切位点）Target DNA （目标DNA 特性）circular（环型DNA），dam/dcm methylation（dam/dcm 甲基化）all DNA in Sequence Channel（选择此项，在Sequence Channel 中的所有序列将被分析，如果选择了Draw restriction pattern，那么当所有的channel 中共有两条DNA 时，则只能选择两个酶分析，如果共有三个以上DNA 时，则只能用一个酶分析。
dnaman使用方法
dnaman使用方法使用DNAMAN的方法DNAMAN是一款功能强大的生物信息学软件，广泛应用于DNA 和蛋白质序列分析、比对、编辑和可视化等领域。
本文将介绍DNAMAN的使用方法，帮助读者快速上手并熟练运用该软件。
一、安装和启动DNAMAN1. 下载软件安装包：在DNAMAN官方网站上下载适用于您的操作系统的安装包，并保存到本地。
2. 安装软件：双击安装包，按照提示完成软件的安装过程。
3. 启动软件：安装完成后，双击桌面上的DNAMAN图标，即可启动软件。
二、导入和编辑序列1. 导入序列：在DNAMAN的主界面，点击"文件"菜单，选择"导入序列"，然后选择您要导入的序列文件（支持FASTA、GenBank 等格式）。
2. 编辑序列：在序列编辑界面，您可以对序列进行添加、删除、替换等操作。
点击"编辑"菜单，选择相应的编辑功能，然后在弹出的对话框中进行操作。
三、序列比对和分析1. 序列比对：点击"工具"菜单，选择"序列比对"，然后选择比对算法和参数设置，点击"开始比对"按钮即可进行序列比对。
2. 序列分析：DNAMAN提供了丰富的序列分析工具，如ORF预测、限制酶切位点分析、引物设计等。
点击"工具"菜单，选择相应的分析工具，按照提示进行操作。
四、序列可视化和输出1. 序列可视化：DNAMAN提供了多种序列可视化方式，如线性图、环形图、比对图等。
点击"视图"菜单，选择相应的可视化方式，即可查看序列的结构和特征。
2. 输出结果：完成序列分析后，您可以将结果导出为文本文件或图像文件。
点击"文件"菜单，选择"导出结果"，然后选择输出格式和保存路径，点击"保存"按钮即可导出结果。
五、保存和管理项目1. 保存项目：在使用DNAMAN进行序列分析时，建议您保存项目以便后续操作。
生物信息学软件的使用
多序列比对实例
输入文件的格式(fasta)： >KCC2_YEAST NYIFGRTLGAGSFGVVRQARKLSTN…… >DMK_HUMAN DFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNK……. >KPRO_MAIZE TRKFKVELGRGESGTVYKGVLEDDRHVAVKKLEN…… >DAF1_CAEEL QIRLTGRVGSGRFGNVSRGDYRGEAVAVKVFNALD…… >1CSN HYKVGRRIGEGSFGVIFEGTNLLNN……
Clustal简介
CLUSTAL是一种渐进的比对方法，先将多个 序列两两比对构建距离矩阵，反应序列之间两 两关系；然后根据距离矩阵计算产生系统进化 指导树，对关系密切的序列进行加权；然后从 最紧密的两条序列开始，逐步引入临近的序列 并不断重新构建比对，直到所有序列都被加入 为止。ClustalW是现在用的最广和最经典的多 序列比对软件
多序列比对工具－clustalX
Clustalx是一个单机版的基于渐进比对的多序列比对 工具，由Higgins D.G. 等开发。和网络版的Clustalw 有异曲同工之效. 有应用于多种操作系统平台的版本，包括linux版， DOS版的clustlw，windows版本的clustalx等。
输入控 制命令 输入文 件名称
输出控 制命令
程序 名称
结果保存 uscle进行比对过程演示
Genedoc与BioEdit的简单介绍
GeneDoc是一个特别的排列程序，有很好的 蛋白质排列注释和分析、描影和结构定义功能 部件，就像一个反映排列的内在的进化树。 BioEdit也是一个生物序列编辑器，它的基本 功能是提供蛋白质、核酸序列的编辑、处理和 分析
序列分析软件DNAMAN的使用方法
出现两个默认选项，restrict.enz 和dnamane.enz， 如果添加过自制的酶列表，则附加显示自制酶列表文
件名。 其中restrict.enz 数据文件包含180 种限制酶，
dnamane.enz 数据文件包含2524 种限制酶。 选择其中一个数据文件，相应的酶在左边的显示框中
序列分析软件DNAMAN的使用方法
4．DNA 序列比对分析 （Dot Matrix Comparision）
要比较两个序列，可以使用DNAMAN 提供的序列比对工具Dot Matrix Comparision （点矩阵比较）通过 Sequense/Dot matrix comparision 命令打开比对界面，
对话框选项说明如下： Sequence &Composition 显示序列和
成分
序列分析软件DNAMAN的使用方法
2． 以不同形式显示序列
Reverse Complement Sequence 显示待分 析序列的反向互补序列
Reverse Sequence 显示待分析序列的反向 序列
Complement Sequence 显示待分析序列的 互补序列
参数说明如下： File 从文件中选择参加比对的序列 Folder 从文件夹中选择参加比对的序列 Channel 从channel 中选择参加比对的序列 Dbase 从数据库中选择参加比对的序列 Remove 清除选择的序列（鼠标点击左边显示框中的
序列名选择） Clear 清除全部序列
序列分析软件DNAMAN的使用方法
Annotations 是否显示注释 Comparision 比对参数， 其中Window 代表Window size（单位比对长度）， Mismatch 代表Mismatch size（单位比对长度中许
DNAMAN的使用方法
文件菜单中选择“打开”或通过快捷键Ctrl+O，打开存储在计算机中的DNA序列文件。
保存文件
文件菜单中选择“保存”或通过快捷键Ctrl+S，将更改后的DNA序列存储到硬盘或其他存储设 备中。
文件格式要求
只支持常见的序列文件格式如FASTA、GenBank等，可以选择单个文件或批量导入。
D N A 序列的导入和编辑
分析序列统计学
序列长度分布
序列特征统计图
DNAMAN可以为所有序列生成序 列长度分布图，从而确定序列长 度最常见的地方，并且甚至可以 根据自己的喜好来更改分布参数。
这是用于比较DNA序列中各类特 征的常用工具。统计图通常是以 直方图的形式出现，幸运的是 DNAMAN可以自动生成这种统计 图并轻松进行定位和分析。
D N A 序列编辑
D N A 序列导入
D N A 序列统计信息
DNAMAN提供多种序列编辑工具， 例如添加碱基、删除碱基、反转 序列和互补序列等。
DNAMAN支持多种序列格式导入， 例如FASTA、GenBank等。
在编辑界面右侧的信息面板中， DNAMAN会自动生成序列的碱基 组成、止旋镇性能力等信息。
多样性分析
发现多样性和图形化分组模型对 于了解疾病的分布和传播至关重 要，DNAMAN通过比对分析大量 的DNA序列，可以进行多样性分 析并演示图形化分组模型。
D N A M A N 在植物和动物遗传学中的应用
BA C分析
通过资料库查询和选择BAC、 BIBAC、Cosmid等载体中的 DNA，进行序列分析和匹配 以获得目标DNA序列。
常见问题解答
1 D N A M A N 支持哪些文件格式？
便携式数据格式（PDF）、HTML网页、Microsoft Word和图像文件（PNG、JPEG、GIF）等。
序列分析软件DNAMAN的使用方法
件的酶。最后，点击按钮执行操作。
点击对比界面左上角的按钮，出现下列 对话框：
序列分析软件DNAMAN的使用方法
参数说明如下：
Sequence type 序列类型 Sequence 1 参加比对的第一序列选择框，框内选项
说明如下： 如果要比对的序列在Channel 中，点击下拉箭头，选
择相应的Channel，则被选中的Channel 中的序列作 为参加比对的第一序列； 也可以从文件夹中选择参加比对的序列，在File 选择 框上点击即可。通过Length 选择参加比对的序列片 段。 Sequence 2 参加比对的第二序列选择框；选项说明 同上 Show Sequence 选择此项，当同源性大于设定值时， 将显示同源性；
序列分析软件DNAMAN的使用方法
如何使用DNAMAN 分析序列
1．将待分析序列装入Channel 通过 命令打开待分析序列文件，则打开的序列
自动装入默认Channel。 通过Sequence/Load Sequence 菜单的子菜
单打开文件或将选定的部分序列装入Channel 。 通过Sequence/Current
参数说明如下： Results 分析结果显示 其中包括： Show summary（显示概要） Show sites on sequence（在结果中显示酶切位点） Draw restriction map（显示限制性酶切图） Draw restriction pattern（显示限制性酶切模式图）
DNAMAN使用方法(图文教程)：多重序列比对
序列比对的理论基础是进化学说：如果两个序列之间具有足够的相似性，就推测二者可能有共同的进化祖先，经过序列内残基的替换、残基或序列片段的缺失、以及序列重组等遗传变异过程分别演化而来。
序列相似和序列同源是不同的概念，序列之间的相似程度是可以量化的参数，而序列是否同源需要有进化事实的验证。
物以类聚人以群分，就像你要了解一个人可以通过了解他的朋友一样，序列比对是从已知获得未知的一个十分有用的方法。
另外，物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。
序列比对按照数目、范围和对象来分，可以分为：o两序列比对和多序列比对o全局比对和局部比对o核酸序列比对和氨基酸序列比对。
限于篇幅，今天只给大家介绍如何使用DNAMAN 8作核酸多序列比对。
多序列比对就是把两条以上可能有系统进化关系的序列进行比对的方法。
其意义在于它能够把不同种属的相关序列的比对结果按照特定的格式输出，并且在一定程度上反映它们之间的相似性。
首先，在解螺旋回复0628下载DNAMAN 8软件。
打开后可以看到以下界面：第一栏为主菜单栏，除了帮助菜单外，有十个常用主菜单；第二栏为工具栏；第三栏为浏览器栏。
打开File-New，将序列粘贴到弹出的窗口中，点击File-save,保存到指定的文件夹。
将所需比对的序列保存好以后，选中Sequence—Aligment—Multiple aligment sequence 进行多序列比较。
在弹出的窗口Sequence&Files中加载序列，File、Fold、channel、Database分别表示从文件、文件夹、channel和数据库中获取序列。
勾选窗口中的“DNA”，点击“下一步”。
在弹出的窗口Method中，“optimalaligment”最佳比对方式中有四个高大上的选项：Full Alignment（完全比对）、Prosile Aligment（轮廓比对）、New Swquence on Profile （轮廓上的新序列）、Fast Alignment（快速比对），本文选择了Fast Alignment，并且勾选了Try both strands(尝试使用双链)。
序列分析软件DNAMAN_的使用方法中文
饶志明
博士/教授／ 博士生导师
江南大学生物工程学院工业微生物中心 江南大学工业生物技术教育部重点实验室
E-mail: raozhm@
DNAMAN 是一种常用的核酸序列分析 软件。由于它功能强大，使用方便，已 成为一种普遍使用的DNA 序列分析工具。
oligoprimerprimergeneratordnaman如何使用primerpremier50引物设计多重pcr引物设计探针设计引物评析引物同源性分析用blastn软件进行同源性比较选择两个引物3端与同一非目的基因不同源的序列作为引物设计题目一xx微生物xx酶基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达目的基因编码如耐高温淀粉酶生淀粉酶普鲁兰酶植酸酶碱性甘露聚糖酶脂肪酶碱性蛋白酶谷氨酰胺转移酶木聚糖酶纤维素降解酶甘油脱氢酶甘油脱水酶荧光素酶葡萄糖苷酶过氧化物酶过氧化氢酶已糖激酶葡萄6磷酸脱氢酶乳酸脱氢酶苹果酸脱氢酶尿酸酶胆红素氧化酶吡喃葡萄糖激酶单宁酶表达载体
（2）多序列同源性分析
通过打开Sequence/Multiple Sequence Alignment 命令打开对话框， 参数说明如下： File 从文件中选择参加比对的序列 Folder 从文件夹中选择参加比对的序列 Channel 从channel 中选择参加比对的序列 Dbase 从数据库中选择参加比对的序列 Remove 清除选择的序列（鼠标点击左边显示框中的 序列名选择） Clear 清除全部序列
2． 以不同形式显示序列
通过Sequence//Display Sequence 命令打开对话框， 根据不同的需要，可以选择显示不同的 序列转换形式。 对话框选项说明如下： Sequence &Composition 显示序列和 成分
dnaman比对序列结果解读
dnaman比对序列结果解读（原创实用版）目录1.Dnaman 比对序列结果2.结果解读3.结论正文在生物信息学领域，Dnaman 是一款广泛使用的 DNA 比对工具，能够帮助研究人员快速准确地比较两个或多个 DNA 序列。
本文将基于 Dnaman 比对序列结果，对其进行解读。
首先，我们来看 Dnaman 比对序列结果。
Dnaman 将输入的 DNA 序列进行比对，并生成比对结果文件。
该文件包含了比对过程中各碱基之间的匹配程度、插入和删除情况等详细信息。
通过对比结果文件，研究人员可以直观地了解序列之间的相似性和差异性。
接下来，我们来解读比对结果。
在 Dnaman 的比对结果中，颜色代表了不同类型的信息。
例如，红色表示不匹配的碱基，蓝色表示匹配的碱基，绿色表示插入的碱基，橙色表示删除的碱基。
通过观察这些颜色，我们可以了解序列之间的相似性。
如果两个序列之间的匹配程度较高，那么它们之间的颜色将以蓝色为主。
反之，如果序列之间的差异较大，那么将会看到大量的红色、绿色和橙色。
此外，我们还可以通过比对结果文件中的数字信息来了解插入和删除的具体情况。
在解读比对结果时，我们需要注意以下几点。
首先，比对结果可能会受到序列长度、质量等因素的影响，因此在分析结果时需要综合考虑这些因素。
其次，对于某些特定的序列，可能需要采用其他的比对方法和参数设置，以获得更准确的结果。
最后，在解读结果时，我们需要将比对结果与生物学背景相结合，从而得出更有意义的结论。
综上所述，Dnaman 比对序列结果的解读对于研究 DNA 序列的相似性和差异性具有重要意义。
通过对比结果文件的观察和分析，我们可以了解序列之间的匹配程度、插入和删除情况等信息。
然而，在解读结果时，我们需要注意比对方法的局限性，并结合生物学背景进行综合分析。
系统发育树构建
Blast 获得参照序列（/）
Clustal 比对
Bioedit 编辑
Mega建树
系统发育树的构建
• Blast 获得参照序列
Basic Local Alignment Search Tool，是一套在蛋白质数 据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具，能迅速 与公开数据库进行相似性序列比较，其结果中的得分是对 一种对相似性程度的统计说明。
• Clustal 比对 • Bioedit 编辑 • Mega 建树
序列拼接 序列提交 系统发育树构建
非克隆测序结果拼接
A B
5’
3’
C
3’
反向互补序列
5’Βιβλιοθήκη A CDNAMAN软件实现序列拼接
• 双向测序结果中一条链反向互补序列的获 得 • 拼接
反向互补序列的获得
序列导入
反向互补序列的获得
序列拼接
序列拼接
序列拼接
序列提交（以BankIt为例） /
实验2 引物设计与测序结果分析
学院：______ 班级:_______ 学号:_________ 姓名:__________ 成绩：______ 实验二引物设计及测序结果分析目的：1、掌握常规引物设计的原则及操作流程。
2、熟悉简并引物设计的原理及操作方法。
3、熟悉引物设计软件及在线引物设计工具的操作方法。
4、掌握使用相关软件及在线工具分析测序结果的方法。
内容：1、使用Primer Premier、Oligo、BLAST等软件及在线工具进行常规引物设计，并对引物扩增效率、特异性进行评价。
2、使用DNAMAN软件进行常规引物快速设计。
3、使用NCBI中的在线引物设计工具Primer-BLAST快速设计引物。
4、使用在线工具CODEHOP设计简并引物。
5、使用Chromas、BioEdit软件查阅测序结果峰图文件。
6、使用DNAMAN软件对测序序列进行编辑，进行序列拼接。
软硬件要求：联网计算机，预装Windows 7操作系统，预装IE或Chrome浏览器、英汉电子词典（有道词典或金山词霸），预装DNAMAN7、Primer Premier5、Oligo7、Chromas、BioEdit等生物信息学分析软件。
操作及问题：一、Primer Premier5、Oligo7、BLAST常规引物设计本部分操作将使用Primer Premier5、Oligo7、BLAST等软件及工具设计拟南芥AtBADH基因编码区全长特异引物。
（参考“第四章引物设计及测序结果分析”课件）（一）使用Primer Premier5搜索引物1、在NCBI数据中查找登录号为NM_001198470的序列记录，查阅相关信息，并下载序列将其保存为fasta格式文件。
问题1：该序列是什么类型的序列？该序列编码区在什么位置？2、打开Primer premier5软件，点击键ctrl+V将上一步中下载的序列粘贴入弹出的GeneTank窗口中（或者点击。
3、点击GeneTank窗口中左上角的Primer premier窗口中点击Search Criteria窗口中根据要求选择合适选项及参数，选定后，点击Search Progress窗口中有Search Results窗口；如没有出现数重新搜索引物。
(生物类研究生必学)DNAMAN、DNAstar、primer5.0、Endnote常用功能介绍
Primer
Primer是由加拿大的Premier公司开发的专业用于 PCR或测序引物以及杂交探针的设计，评估的软件。
其主要界面同样也是分为序列编辑窗口 （Genetank），引物设计窗口（Primer Design）， 酶切分析窗口（Restriction Sites）和纹基分析窗 口（Motif）。
点击OK,出现搜索结果，选择其中一条
发夹结构 引物二聚体 错误引发
一对理想的引物应当不存在任何一种上述结构， 但是，实际操作中我们常常遇到：
选择要修改的引物，点击Edit Primers，对引物进 行修改，修改完成后点击OK。
引物设计完之后我们再来看一下引物内部的稳定性： 主菜单栏⇒Report ⇒Internal Stability
我们双击一篇文献，可 以看见其信息比较完整
选中所有文件，右键，Find Full Text，下载文献
再讲如何导入中文文献。
一般我们下载中文文献都是从一下3个网站下载： 中国期刊网、万方、维普，下面就讲讲如何用 endnote导入这三个网站上的文献。
点击存盘，选择Endnote格式输出
运行EndNote后，出现的第一个界面如下：
我们可以新建一个数据库：
如何将文献导入数据库
1. 电脑里的本地文献 选择Import File出现以下界面：
选择一个文件导入
双击该文献的标题
由于导入本地文献要编辑文件信息比较繁琐，
所以一般选择通过网络导入。这里，英文和中文 文献又有所区别，首先讲一下如何通过网络导入 英文文献：
点击输出到本地文件并保存。打开Endnote,选择Import File出现以下界面：
点击输入，则将该文献信息导入到了Endnote里
dnaman比对序列结果解读
dnaman比对序列结果解读摘要：一、简介：Dnaman比对序列的基本概念二、比对结果的解读方法1.匹配度分析2.一致性分析3.变异分析4.基因型分析三、比对结果的实用意义1.在遗传病筛查中的应用2.在基因突变检测中的应用3.在遗传多样性研究中的应用四、结论：Dnaman比对序列在生物技术领域的重要性正文：随着生物信息学的发展，Dnaman比对序列已成为生物学研究中不可或缺的工具。
它通过将目标序列与参考序列进行比对，从而揭示两者之间的相似性和差异性。
比对结果的解读在生物学研究中具有重要意义，可以帮助我们深入了解基因、变异和遗传等方面的问题。
在Dnaman比对序列中，匹配度是指两条序列之间相同或相似的碱基数量。
通过分析匹配度，我们可以了解目标序列与参考序列之间的相似性。
高匹配度表示两条序列具有较高的相似性，可能来源于同一个祖先序列；低匹配度则表示两条序列之间差异较大，可能存在不同的功能或表达方式。
一致性分析是评估比对结果中碱基替换、插入和删除等变异情况的指标。
一致性越高，说明目标序列与参考序列在相应区域越稳定；一致性越低，说明该区域变异较多，可能影响基因功能或表达。
通过对一致性进行分析，我们可以了解目标序列在进化过程中的变异情况，为遗传变异研究提供数据支持。
变异分析是比对结果解读中的重要环节。
通过分析比对序列间的变异，我们可以发现致病基因、种间差异等信息。
在遗传病筛查中，通过比对患者样本与正常人群的序列，可以发现患者序列中的致病性变异；在遗传多样性研究中，对比不同个体或种群的序列，可以揭示遗传变异在不同群体中的分布规律。
基因型分析是比对序列在生物技术领域的重要应用之一。
通过比对不同个体或品种的序列，我们可以确定各品种的基因型，进而分析基因型与表型之间的关系。
这对于分子育种、遗传病诊断等领域具有重要意义。
总之，Dnaman比对序列在生物技术领域具有广泛的应用前景。
通过对比对结果的解读，我们可以深入了解基因、变异和遗传等方面的问题，为生物科学研究和应用提供有力支持。
pcr序列拼接软件contigexpress使用简介
PCR序列拼接软件Contig Express使用简介1 - Contig Express的基本情况大家做分子生物学实验最多的步骤可能就是PCR了。
PCR之后一般要进行测序以保证扩增序列的正确性。
由于测序能力的限制，目前最好的公司也只能保证一个反应800bp测准。
如果大家的克隆片断大于1k，那么势必要同时测两个反应，然后将两个反应得到的序列利用其相互重叠的部分进行拼接，这样才能得到完整的PCR产物序列。
怎样拼接呢？有的公司还比较厚道，会帮助您拼好；可使大多数公司碰到这种情况只会将几个片断丢给您自己让您DIY。
Contig Express是著名的软件Vector NTI的组件之一。
经过一些简单的处理该组件可以被剥离出来独立运行，经我们试用效果良好。
Contig Express将每个PCR测序片断视为一个Contig，当您输入多个Contig后，它会自动寻找其中的公共序列，然后将他们拼接好后的结果已图形方式呈现给您。
完全免除您手工逐个片断Blast，然后肉眼找共同序列的苦恼。
Contig Express 9.1可以从论坛中下载。
2 - 向Contig Express中加入需要拼接的序列目前PCR测序的结果多以ABI和Fasta两种格式提供。
一般来说ABI结果是原始结果最为可信，因此我们最好向Contig Express中直接倒入ABI格式的原始数据。
倒入的方法是"Project---Add Fragments---From ABI file..."。
在接下来弹出的"Import Sequence From"对话框中选择测序公司发给您的ABI文件。
需要注意的是目前公司发给您的原始ABI文件多是"AB1"文件名。
Contig Express无法直接识别，因此有必要在文件类型中选择“All Files(*.*)"。
由于要拼接多个序列这时您可以配合Ctrl键进行多选。