实验操作注意事项

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第二天 2)用接种环挑取一个DH5α单菌落 接种于5mL LB液体培养基中,37℃, 190rpm振荡培养过夜。(12h即可) 第三天 (打冰) 3)将1mL菌液全部转接 到一个含有40mL LB液体培养基锥形瓶中, 37℃,210-250r/min振荡培养2小时。 4)将菌液转移到40mL离心管中,冰上放 置10min以抑制菌生长。(此时打开离心机 预冷,将0.1mol/L CaCl2、80%甘油放在冰 上预冷) 4℃,4000 r/min离心10min,回 收细胞。倒出培养液,将管倒置在灭菌滤 纸上1min,以便使培养液流尽

9.在吸附柱中加入500 μl去蛋白液Buffer DW1,9,000 × g离心30 sec。倒掉收集管 中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。 10.向吸附柱中加入500 μl Wash Solution, 9,000 × g离心30 sec。倒掉收集管中的液 体,将吸附柱放入同一个收集管中。 11.重复步骤10一次 12.将空吸附柱和收集管放入离心机,9,000 × g离心1 min。(此步绝不可省略,否则 残余的乙醇会严重影响得率和后续实验。)

5)向上述溶液中加入120ul氯仿,盖紧离 心管盖,用手剧烈震荡15s,室温静置5min。 (再次抽滤,保证蛋白质的去除) 6)12,000g4℃离心15min,取上清液(约 450ul)移入另一新的离心管中。 7)向上清中加入等体积的异丙醇,上下颠 倒充分混匀后,于15~30℃下静置10min。 8)12,000g4℃离心10min。离心结束后, 试管底部会出现RNA沉淀。

感受态细胞的制备(氯化钙法)
准备工作:灭菌:0.1mol/L CaCl2、80%甘 油、2个40mlLB液体培养基(250ml锥形瓶, 方便摇菌 )、2个5ml液体培养基、一个不 含青霉素的LB固体平板、2个40ml离心管、 滤纸、5ml枪头 第一天 1)将大肠杆菌DH5α菌株接种于LB 固体培养基中,倒置37℃过夜培养(1216h)。(活化细胞制感受态时,培养基不 加抗生素。没有抗生素,细菌长得比较快, 可适当缩短培养时间)
谢谢!

注意:Buffer P3和Buffer DW1中含有刺激 性的化合物,操作过程中要小心。Buffer P2在碱法抽提方法中起非常关键的作用, 其中所含的NaOH很容易因为被空气中的 CO2中和而失效,因此每次使用后一定要密 封保存。 1.挑取单菌落接种于含有2.5ul青霉素的液 体培养基中,37℃ 190rpm振荡培养12-16 小时。 2.保种,915ul菌液+210ul80%甘油 163ul菌液+37ul80%甘油 3.于室温,8,000 × g离心2 min收集剩余 菌体,倒尽或吸干培养基。

4.在菌体沉淀中加入250 μl Buffer P1,吸 打或振荡至彻底悬浮菌体。(一定要彻底 悬浮菌体,否则影响得率和质量。) 5.加入250 μl Buffer P2,立即温和颠倒离 心管5-10次混匀,室温静置2-4 min。(如 果同时操作多个样品,每加入一管混匀一 管,不要采用全部加入一起混匀的方法, 计时从第一管样品加入开始。裂解时间不 宜过长。加入Buffer P2后应温和混匀,如 果剧烈振荡,可能把基因组DNA打断从而 混杂在质粒中。)

PCR产物回收


准备:75℃水浴;检查Buffer DE-B是否出现沉淀, 若出现沉淀,应于70℃温浴加热溶解并冷却至室 温后再使用。 1)在紫外灯下切下含有相应DNA片段的琼脂糖 凝胶,吸尽凝胶表面液体并切碎。计算凝胶重量 (提前记录1.5mL离心管重量),该重量作为一 个凝胶体积(100mg=100uL体积)。经验值是小 孔是4个孔约为200mg,中孔是3个孔约为200mg, 大孔是2个孔约为200mg。 2)加入三个凝胶体积的Buffer DE-A(一般是 600ul),混合均匀后于75℃加热,每2-3min混合 一次,直至凝胶块完全熔化(熔化不完全会造成 阻塞回收柱,DNA片段的回收率低,甚至会收不 到目的片段。切胶时尽量切碎)。
转化
1. 取200μL感受态细胞DH5α ,加入10μL 连接产物混匀,冰上放置30min。 2. 42℃热激90s,冰上放置2min。 3. 每管加800μL LB液体培养基恢复培养, 轻轻混匀,37℃,转速为140r /min下温育 1h。 (使菌恢复,青霉素抗性表达)

4. 在含Amp(100μg/mL)的LB固体培养基 表面均匀涂上X-gal(20mg/mL)40μL 和 IPTG(40mg/mL)40μL,静置一会,使平板 充分吸收。 5. 将200μL已转化的菌液均匀涂在培养基平 板表面,放置30min。 6. 倒置平板,37℃培养12~16h。

9)弃上清液,缓慢沿管壁加入75%乙醇1ml (用DEPC处理水配制,切勿触及沉淀), 轻轻上下颠倒洗涤离心管管壁。 10)12,000g4℃离心5min后小心弃去乙醇。 (为避免影响后续操作,应尽量除去乙醇) 11)室温干燥沉淀2~5min(切勿离心或加热 干燥,否则RNA将会很难溶解),加入适 量的RNase-free水溶解沉淀,待RNA沉淀 完全溶解后于-80℃保存。RNA溶解时,很 容易降解。最后一步溶解很关键,溶解后 需分装

6.加入350 μl Buffer P3,立即温和颠倒离 心管5-10次充分混匀。(如果起始菌液较 多,混匀后室温静置2分钟以彻底去除 RNA。) 7.于离心机最大转速(≥ 12,000 × g)离心 5-10 min 8.将上清全部小心移入吸附柱,9000 × g 离心30 sec。倒掉收集管中的液体,将吸 附柱放入同一个收集管中。(吸附柱的最 大有效容积为750 μl,如果裂解液较多,可 以重复该步骤直到至所有裂解液流过吸附 柱。)

转化菌质粒的提取
准备工作: 检查Buffer P1中是否已经加入RNase A。 加入RNase A后,Buffer P1请存放于2-8℃ 检查Wash Solution中是否已经加入乙醇。 每次使用前要检查Buffer P2和Buffer P3是 否出现沉淀,如有沉淀,要用37℃溶解沉 淀,待冷却至室温后使用(温度较低,会 出现浑浊,会影响质粒得率)。

3)向上述裂解液中加入200ul氯仿,盖紧离 心管盖,用手剧烈震荡15s,待溶液充分乳 化(无分相现象)后,室温静置5min。 (氯仿沸点低,易挥发,振荡时应小心离心 管盖突然弹开) 4)12,000g4℃离心15min(此时溶液分为 三层,即:上层为透明的水层,RNA溶解在 此层中;半固体状的中间层,此层中包含 DNA;另外有黄色的有机溶剂下层,蛋白质、 多糖等物质溶解在此层),取上清液(约 600ul)移入另一新的离心管中(谨慎操作, 防止吸入白色中间层)。

7)同6,重复一次。 8)将制备管置回2mL离心管中,8000g离 心1min(必须有,否则乙醇残留会影响后 续操作)。 9)将制备管置回1.5mL离心管中,在准备 膜中央加入加热到65℃(能提高洗脱效率) 的25-30uL Eluent 或去离子水,室温静置 10min。12000g离心1min洗脱DNA。 10)将洗脱的含目的片断的Eluent重新置于 膜中央,重复一次洗脱过程。
3)加入0.5个Buffer DE-A体积的Buffer DEB(300ul),混合均匀形成黄色溶液,静 置10min。(如果片段小于400bp要加入一 个凝胶体积的异丙醇) 4)将3中的混合液转移到DNA制备管中, 5000g离心1min。弃滤液。(如果液体过多 可离心两次) 5)将制备管置回2mL离心管,加入500uL Buffer W1 5000g离心1min。弃滤液。 6)将制备管置回2mL离心管,加入700uL Buffer W2 5000g离心1min。弃滤液。 (确 保Buffer W2中已加入无水乙醇 )
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13.在吸附膜中央加入40 μl Elution Buffer (将Elution Buffer预热至60℃可以进一步 提高得率。洗脱液应加在硅胶膜中心部位 以确保洗脱液会完全覆盖硅胶膜的表面达 到最大洗脱效率。),室温静置1-2 min, 9,000 × g离心1 min。将所得到的质粒 DNA溶液置于-20℃保存或用于后续试验。

5)加入预冷的0.1mol/L CaCl2 10mL悬浮 沉淀(轻轻吹打,使菌液均匀),立即放 在冰上保温30min,使其低渗。4℃ 4 000r/min离心10min,回收细胞。 6)用冰冷的0.1mol/L CaCl2 2mL悬浮细胞 (务必放冰上)。 7)分装细胞,每200μL感受态细胞一份, 并分别加入终浓度10-15%甘油,-80℃贮存。

连接
10uL的反应体系: pMD18-T Vector(取出放置冰上)1uL 回收的PCR产物 4uL SolutionΙ 5uL 16℃反应过夜(常为16h)。


pMD 18-T Vector和pMD simple18-T Vector由pUC18载体改建而成,它消除了 pUC18载体上的多克隆酶切位点,再在 pUC18载体的多克隆酶切位点处导入了 EcoR V酶切位点,使用EcoR V进行酶切反 应后,再在两侧的3′端添加 “T” 而成。因 大部分耐热性DNA聚合酶进行PCR反应时 都有在PCR 产物的3′末端添加一个“A” 的 特性,所以使用本制品可以大大提高PCR 产物的连接、克隆效率。
实验操作注意事项
RNA提取 PCR产物回收 感受态细胞的制备(氯化钙法) 连接 转化 转化菌质粒的提取

RNA提取
提取RNA所用的耗材如枪头、离心管等要 用DEPC水浸泡过夜,灭菌时要30min 1)取20ml左右对数生长期的盐藻细胞液 (107数量级细胞,太多,细胞裂解不完全, 会有DNA,太少,RNA量不足),8000g 离心2min(温度不宜太低,否则会产生盐 沉淀),弃上清,收集细胞; 2)加入1mlRNATM plus,用移液器吹打重 悬,重复混匀至无明显沉底,转入1.5ml离 心管中,室温静置5min。注:RNATM plus 具有腐蚀作用,并且吸入有害,小心使用。
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