第5章基因表达调控
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(三)原核操纵子受到阻遏蛋白的负性调节
原核基因调控普遍涉及特异阻遏蛋白参 与的开、关调节机制。 当阻遏蛋白与操纵序列结合或解聚时, 就会发生特异基因的阻遏或去阻遏。
二、操纵子调控模式 1、乳糖操纵子调控的机制
⑴乳糖操纵子的结构:Z、Y、A三个结构基因, 逆流而上依次为:操纵基因(O)、启动子(P)、
2、色氨酸操纵子的调控机制
⑴色氨酸操纵子的结构
⑵色氨酸操纵子的调控机制
①阻遏蛋白的调控作用
调节区
I P O
结构基因
前导肽 衰减子 mRNA
trp 低时
trp 高时
trp
色氨酸 操纵子
②衰减子的调控作用
L基因的3′端有一个衰减子序列。前导序列转
录的mRNA具有如下特性及功能:
1)内含4段特殊的短序列
①阻遏蛋白与操纵基因解离
②CAP与CAP结合位点结合
阻遏蛋白的负性调节
阻遏基因 DNA mRNA 阻遏蛋白
I
pol P
O
Z
Y
A
没有乳糖存在时
DNA mRNA
IHale Waihona Puke Baidu
pol
P
O
Z
Y
A
mRNA
启动转录
阻遏蛋白
β-半乳糖苷酶 半乳糖 乳糖
有乳糖存在时
CAP的正性调节
+ + + + 转录
DNA
CAP
P
O
Z
Y
基因表达的调节与基因的结构、性质, 生物个体或细胞所处的内、外环境,以及细
胞内所存在的转录调节蛋白有关。
(一)特异DNA序列决定基因的转录活性
(二)转录调节蛋白可以增强或抑制转录活性
原核生物
—— 操纵子(operon) 机制
启动序列 (promoter) 其他调节序列 编码序列
操纵序列 (operator) 特异DNA序列
启动序列 操纵序列 阻遏蛋白 编码序列 pol
⑵乳糖操纵子的转录调控机制
通过负调控因子和正调控因子所进行的复合 调控。阻遏蛋白与操纵基因结合,防碍RNApol与 P结合形成开放性启动子复合物,阻止基因转录; CAP与CAP结合位点结合促进RNApol与P结合, 引起有效转录。 乳糖操纵子结构基因转录需具备两个条件:
第五章基因表达调控
Regulation of Gene Expression
第一节 基因表达调控的基本概念
Basic Conceptions of Gene Expression Regulation
一、基因表达
基因组(genome) 来自一个生物体的一整套遗传物质。 基因表达(gene expression) 是基因转录及翻译的过程,即:生成具 有生物学功能产物的过程。 基因表达是受调控的。
二、基因表达具有时间特异性和空间特异性
(一)时间特异性
按功能需要,某一特定基因的表达严格按特
定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间
特异性(temporal specificity)。
多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶段
特异性(stage specificity)。
(二)空间特异性
在个体生长全过程,某种基因产物在个体按 不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的
合能力。
2、操纵序列 ——阻遏蛋白(repressor)的结合位点 当操纵序列结合有阻遏蛋白时,会阻碍 RNA聚合酶与启动序列的结合,或是RNA聚合 酶不能沿DNA向前移动 ,阻碍转录。
pol 启动序列 操纵序列 阻遏蛋白 编码序列
3、其他调节序列、调节蛋白
例如:
激活蛋白(activator)可结合启动序列邻近的
CAP结合位点和调节基因,O与P有一定程度重
叠。
乳糖操纵子的结构
调控区 DNA 结构基因
P
O
操纵序列
Z
Y
A
Z: β-半乳糖苷酶
Y: 透酶 A:乙酰基转移酶
启动序列
CAP结合位点
操纵序列 ——阻遏蛋白的结合位点
当操纵序列结合有阻遏蛋白时,会阻碍 RNA 聚合酶与启动序列的结合,或是 RNA 聚合 酶不能沿DNA向前移动 ,阻碍转录。
前导序列:在trp mRNA5′端trpE基因的起始密码 前一个长162bp的mRNA片段。 Trp操纵子的前导肽:由前导序列翻译产生的一个 含有14个AA的多肽。其中有两个相邻的色氨酸。
转录衰减机制:
新生肽链 核糖体
5’ 1 2
衰减子结构 (attenuator)
3
4
mRNA
UUUU 3’
DNA
生物体所处的内、外环境是在不断变化 的。通过一定的程序调控基因的表达,可使 生物体表达出合适的蛋白质分子,以便更好 地适应环境,维持其生长和增殖。
(二)以维持细胞分化与个体发育
在多细胞个体生长、发育的不同阶段,
或同一生长发育阶段,不同组织器官内蛋白
质分子分布、种类和含量存在很大差异,这
些差异是调节细胞表型的关键。
mRNA
DNA A mRNA
图13-2 顺式作用元件
转录起始点
RNA聚合酶Ⅱ
B
不同真核生物的顺式作用元件中也会发
现一些共有序列,如TATA盒、CAAT盒
等,这些共有序列是 RNA聚合酶或特异
转录因子的结合位点。
2、真核基因的调节蛋白 反式作用因子(trans-acting factor)
由某一基因表达产生的蛋白质因子,通 过与另一基因的特异的顺式作用元件相 互作用,调节其表达。这种调节作用称 为反式作用。 还有蛋白质因子可特异识别、结合自身 基因的调节序列 , 调节自身基因的表达, 称顺式作用。
DNA
a A
反式调节
b
mRNA 蛋白质A
A c
DNA mRNA
C
顺式调节
C
图13-3 反式与顺式作用蛋白
蛋白质C
(三)转录调节蛋白通过与DNA或与蛋白质 相互作用对转录起始进行调节
指的是反式作用因子与顺式作用元件之间
的特异识别及结合。通常是非共价结合,
被识别的DNA结合位点通常呈对称、或不
完全对称结构。
绝大多数调节蛋白质结合DNA前,需通过 蛋白质-蛋白质相互作用,形成二聚体 (dimer)或多聚体(polymer)。
(四)RNA聚合酶与基因的启动序列/ 启动子相结合
1、原核启动序列/真核启动子与RNA聚合酶活性 RNA聚合酶与其的亲和力,影响转录。 2、调节蛋白与RNA聚合酶活性 一些特异调节蛋白在适当环境信号刺激
DNA序列,促进RNA聚合酶与启动序列的
结合,增强RNA聚合酶活性。 有些基因在没有激活蛋白存在时, RNA 聚 合酶很少或完全不能结合启动序列。
真核生物
1、顺式作用元件(cis-acting element) ——可影响自身基因表达活性的DNA序列
转录起始点
DNA B A
RNA聚合酶Ⅱ
编码序列
蛋白质因子
1、启动序列
是RNA聚合酶结合并启动转录 的特异DNA序列。
-10区
N17 N16 N17 N16 TTAACT TATGAT TATGTT TATAAT N7 N7 N6 N7 RNA转录起始 A A A A
-35区 trp
tRNATyr TTGACA TTTACA TTTACA TTGATA
下表达,然后通过 DNA- 蛋白质、蛋白质 - 蛋
白质相互作用影响RNA聚合酶活性。
第三节 原核基因表达调节
Regulation of Gene Expression in Prokaryote
一、原核基因转录调节特点
——调节的主要环节在转录起始。
(一)σ因子决定RNA聚合酶识别特异性
在转录起始阶段,σ因子识别特异启动序 列;不同的σ因子决定特异基因的转录激活, 决定mRNA、rRNA和tRNA基因的转录。
trp 密码子
1、当色氨酸浓度高时
核糖体
5’
1
2
3 4
2、当色氨酸浓度低时
细菌通过衰减作用弥补阻遏作用的不足,因为
阻遏作用只能使转录不起始,对于已经起始的
转录,只能通过弱化作用使之中途停下来。
阻遏作用的信号是细胞内色氨酸的多少;弱化
作用的信号则是细胞内载有色氨酸的tRNA的多
少。
在细菌细胞内这两种作用相辅相成,体现着生物 体内周密的调控作用。
空间特异性(spatial specificity)。
基因表达伴随时间顺序所表现出的这种分布 差异,实际上是由细胞在器官的分布决定的, 所以空间特异性又称细胞或组织特异性 (cell or tissue specificity)。
三、基因表达的方式及调节存在很大差异
按对刺激的反应性,基因表达的方式分为: 基本(或组成性)表达 诱导或阻遏表达
(二)有些基因的表达受到环境 变化的诱导和阻遏
在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活, 基因表达产物增加,这种基因称为可诱导基 因(inducible gene)。 可诱导基因在特定环境中表达增强的过程, 称为诱导(induction)。 如果基因对环境信号应答是被抑制,这种基 因是可阻遏基因 (repressible gene) 。可阻遏 基因表达产物水平降低的过程称为阻遏 (repression)。
A
CAP CAP CAP CAP
无葡萄糖,cAMP浓度高时
CAP
有葡萄糖,cAMP浓度低时
※当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能
发挥作用;
※ 如无CAP存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序 列结合,操纵子仍无转录活性。 单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源;若有 葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时 , 细菌首先利用葡 萄糖。 葡萄糖对 lac 操纵子的阻遏作用称分解代谢阻遏 (catabolic repression)。
lac recA
Ara BAD
CTGACG
TTGACA
N16
TACTGT
TATAAT
N6
A
共有序列
图13-1 五种E.coli启动序列的共有序列
共有序列(consensus sequence) 决定启动序 列的转录活性大小。 某些特异因子(蛋白质)决定RNA聚合酶 对一个或一套启动序列的特异性识别和结
(一)基本(或组成性)表达
某些基因在一个个体的几乎所有细胞 中持续表达,通常被称为管家基因 (housekeeping gene)。 无论表达水平高低,管家基因较少受环 境因素影响,而是在个体各个生长阶段 的大多数或几乎全部组织中持续表达, 或变化很小。区别于其他基因,这类基 因表达被视为组成性基因表达 (constitutive gene expression)。
在一定机制控制下,功能上相关的一组基 因,无论其为何种表达方式,均需协调一
致、共同表达,即为协调表达 (coordinate
expression) , 这 种 调 节 称 为 协 调 调 节 (coordinate regulation)。
四、基因表达调控为生物体生长、
发育所必需
(一)以适应环境、维持生长和增殖
2)序列①是一个开放阅读框:转录后立即翻译成
14氨基酸的短肽称作前导肽,前导肽第10,11位是
两个连续的色氨酸。
衰减子与前导肽
现象: 在色氨酸高浓度和低浓度时观察到 trp 操纵子的表达水平相差约600倍,而阻 遏作用仅使转录降低70倍。 阻遏物(阻遏蛋白)失活突变并不能完 消除色氨酸对trp操纵子表达的影响。 发现:仔细研究发现这种调控现象与色氨 酸操纵子特殊的结构有关。可能存在其 它调控机制。 (1)阻遏作用只是一个一级开关,主管 转录是否启动。 (2)另一个系统进行细调控并决定已经 启动的转录是否继续下去(衰减作用)。
三、原核生物的转录终止调节机制
(一)不依赖Rho因子的转录终止
终止子结构特点: 两段富含GC的反向重复序列,中间间隔 若干核苷酸; 下游含一系列T序列。
(二)依赖Rho因子的转录终止
常见于噬菌体中,结构特点不清楚。
四、转录后水平上的调控
1、翻译起始的调控 RBS(核糖体结合位点): mRNA链上起始密码子AUG上游的一段 非翻译区。在RBS中有SD序列,该序列 与核糖体16SrRNA的3’端互补配对,促 使核糖体结合到mRNA上,有利于翻译的 起始。
(二)操纵子模型的普遍性
原核生物绝大多数基因按功能相关性成簇
地串联、密集于染色体上,共同组成一个转录
单位──操纵子(operon)。一个操纵子只含一 个启动序列( promoter )及数个可转录的编码 基因。通常,这些编码基因可转录出多顺反子 mRNA 。原核基因的协调表达就是通过调控单
个启动基因的活性来完成的。
第二节
基因表达调控的基本原理
Basic Principles of Gene Expression Regulation
一、基因表达调控呈现多层次和复杂性
基因表达的多级调控 基因激活 拷贝数 重排 甲基化程度
转录起始 转录后加工 mRNA降解
蛋白质翻译 翻译后加工修饰 蛋白质降解等
二、基因转录激活受到转录调节蛋白 与启动子相互作用的调节