疫沉淀(Immunoprecipitation)实验操作方法
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免疫沉淀(Immunoprecipitation)实验操作方法
实验原理:
免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质如protein A/G特异性地结合到免疫球蛋白(抗体)FC片段的现象而开发出来的特异分离富集抗原的方法。目前多用预先结合固化在Agarose beads上的protein A/G
(Agrose-proteinA/G),使之与抗体结合,再通过抗体特异性结合抗原而形成
Agrose-proteinA/G 、抗体、抗原复合物,利用Agarose beads的重量,通过离心即可特异分离富集目的抗原。
实验步骤:
1.处理细胞:依据实验目的,设计实验,处理好细胞模型。一般3×106细胞/处理(即六
孔板一个孔,约200ug总蛋白)。
2.配IP 裂解液:200ul/孔(6孔板),并加入蛋白酶抑制剂,如果蛋白磷酸化水平影响实
验结果则应加入磷酸酶抑制剂。注意抑制剂的要现加现用。
3.收集细胞:冰上操作,裂解细胞前用1×PBS(4度)洗1遍,每孔加入200ul IP裂解
液,冰上静置5分钟后刮下细胞并收集至EP管中。
4.超声:强度37%,5秒×4次(程序07)。目的是使细胞裂解更完全并打断基因组DNA,
但可能会影响蛋白质之间的相互作用,进行共免疫沉淀实验时要注意这一点。
5.离心细胞裂解液:4度10000rpm 10 分钟。
6.Agrose-proteinA/G清洗:一般1ug抗体对应15ul Agrose-proteinA/G(不同公司产品
可能不同,注意结合说明书及实验结果考虑),预清洗细胞裂解液的Agrose-proteinA/G 用量与结合抗体的用量一致。取相应量的Agrose-proteinA/G到EP管中(剪枪头)并用500ul1×PBS(4度)洗两遍,5000rpm× 2分钟,吸掉上清备用。
7.细胞裂解液预清洗:为去除非特异作用,细胞裂解液先用Agrose-proteinA/G预清洗。
转移步骤5离心好的细胞裂解液上清至步骤6洗好的Agrose-proteinA/G中,4度翻转1小时。
8.抗体和Agrose-proteinA/G预孵育:为减少游离抗体消耗抗原造成IP效率下降,将抗
体和Agrose-proteinA/G进行预孵育。在步骤6洗好的Agrose-proteinA/G中加入200ul 含0.1%BSA 的IP 裂解液及相应量的抗体,4度翻转1小时。不同抗体时间可能有不同。
9.抗原抗体孵育:步骤7和8后进行离心(5000rpm 2分钟),将预清洗好的细胞裂解液
转移到含预孵育好的抗体和Agrose-proteinA/G 的EP管中,4度孵育过夜。
10.洗IP复合物:步骤9后离心(5000rpm 2分钟),吸掉上清,加入IP裂解液(一般不
用加抑制剂)500 ul,弹匀后4度摇转5分钟,重复6次。最后一次离心后加入3×SDS 60ul。
11.WB检测。
附注:
IP lysis buffer
Tris 50 m M PH 7.4
NaCl: 150m M
EGTA 2m M
EDTA 1 m M
Triton X-100 1%
磷酸酶抑制剂:Pyrophosphate 2.5m M
Glycerol phosphate 1m M
Na3VO4 1m M
蛋白酶抑制剂:PMSF 1m M
Leupeptin 1ug/ml
Aprotinin 5ug/ml
IP lysis buffer
NaF(FW:42g/mol) 50mM*50 0.105g/ml
焦磷酸钠(265.9g/mol) 2.5mM *100 0.067g/ml