高通量测序服务简介.pptx
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菌基因组的精细图（基因组覆盖度大于95％，基因区覆盖度达到98％以上，单碱 基错误率低于十万分之一）。 3. 全基因组重测序：全基因组重测序是对已知基因组序列的物种的个体进行 测序， 并在个体或群体水平进行差异分析的方法。基于全基因组重测序的分子育种，能 够快速的进行种质资源普查筛选，寻找到大量基因差异，实现遗传进化分析及重 要性状候选基因的预测。在全基因组水平上扫描并检测与动植物重要性状相关的 突变位点，具有重大的科研价值和产业价值。
我们提供的数据分析服务（细致展开）
基本数据分析：
序列前处理工作，包括成对测序数据的序列匹配，裁减低质量部分，数据格式转换等 序列拼接，Scaffolding，对454数据的homopolymer进行修正等。 用多种主流基因预测软件预测基因并挑选最合适的代表基因结构。 tRNA/rRNA识别和分类。 基因组GC含量分析，并识别特异区域。 基因功能注释（包括同源注释和蛋白结构域识别）。 基因功能分类，参照Gene Ontology或COG标准（由用户指定标准）。
高通量测序服务适用范围
mRNA或miRNA的表达组研究
进行高水准研究的医院、科研机构，涉及疾病样本、动物样本、 农业样本、微百度文库物样本的表达组研究。
新物种测序或已测序物种的重测序
开展基因组学研究的科研机构，或对特殊物种（农业经济作物， 如烟草、葡萄等；有价值的微生物，如致病菌、垃圾处理菌、农 业土壤改良菌、工业工程菌株等）进行基因组研究的机构，包括 一些发酵相关企业。
其它企业：
1、美季生物。 -小型企业，偏重于454测序。
2、晶能科技。 -依托研究院所建立的高通量测序服务企业。有一定业务量，但不稳 定。
3、其他类企业： -还有一些小型企业，这些企业主要通过代理或只能承担小量样本测 序，其服务流动性较大而且服务质量无法保证。
欣景生物科技则拥有成熟的测序与分析流程、经验丰富的分析人员，可 以提供高质量的二代测序相关服务。
我们的优势
1、服务水准高。团队中有关高通量测序实验已经大量大型课题的锻炼，
包括大量基因组测序、转录组测序等等，并已有Nature、Science等高端杂志 文章数据分析经验，有一整套严格的实验质量标准和操作流程，且不断跟踪 国际最新的进展，可以在高起点为客户提供服务。
2、服务周到。技术团队中有专职的高通量数据信息分析人员，在测序完
疾病相关或表型相关的人类基因组重测序
如华大之前做的炎黄计划，以及最近国际在进行的肿瘤基因组计 划等，一般是有较大科研经费实力的机构。
高通量测序数据分析服务适用范围
已进行高通量测序实验的机构，后续需要对所获
得的数据展开各种不同应用的研究。如基因组数据挖 掘、表达组的cSNP寻找、基因组的拼接与补洞、 miRNA的不同样本的表达差异分析等等。
高通量测序服务与数据分析服务简介
高通量测序简介
高通量测序技术（第二代或下一代测序技术，next generation sequencing) 是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万 到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在研究 中又被称为深度测序(deep sequencing) 。
基于illumina的solexa与罗氏454的高通量测序平台， 欣景生物可提供不同物种样本的各种类型的二代 测序服务。根据样本RNA或者DNA的不同应用可分 为表达组测序、microRNA测序、基因组测序等。
生物信息高级分析：
提供图型化界面由用户人工确认基因结构和基因功能注释。 重复序列识别和分类。 基因家族识别和聚类。 基因功能聚类，参照FunCatDB标准。 代谢调控途径识别和重建。 转录因子（Transcription Factor）识别和分类分析。 分泌蛋白识别和分析。 蛋白激酶识别和分析。 转运蛋白(Transporter)识别和分析。 假基因（pseudogene）识别和分析。 SSR标记模式识别和预测。
有完善的质控标准。
4、服务灵活。针对客户不同的需求在可行的前提下可以制定不同
的实验操作与数据分析方案。
一般的二代测序服务公司没有相应深度分析的能力， 而实验室很难独立展开深度分析的工作，可以采用合 作科研或纯服务委托形式。
我们提供的测序服务内容（细致展开）
表达组测序:
特定组织或者细胞中的mRNA经分离后制备成片段化的cDNA文库，通过solexa测 序仪对cDNA文库高通量测序，从而获得一个细胞或生物个体的全转录组信息。
更多相关内容不再展开
应用举例
应用举例
应用举例
高通量测序服务市场情况分析
大型知名品牌企业：
-华大基因。
-这类企业有完整的产业链，有着巨大规模的传统测序与二代 测序服务经验与市场拓展经验；但同时存在对具体客户服务不够 细致的缺点。
-2011年华大基因全球测序营业额1000000000元（人民币）
成后可以为客户提供完整的生物信息学分析，直至可以进行文章投稿或结题 等，这点在各个高通量测序服务企业中是非常有优势的，因为很多客户测序 完成后，如果缺乏此环节，其成果水平下降，甚至出现数据烂在手中的情况， 并不是而事实上是因为缺乏分析环节的保障。
3、服务稳定。实验操作阶段的每个实验环节都有专门的人员负责，
miRNA测序 :
可对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。用于作 用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学 应用。
基因组测序:
1. 细菌基因组测序:对全新或不同菌株细菌基因组进行全测序研究。 2. 真菌全基因组测序(全新或不同菌株):对于真菌全基因组而言，可以得到到一个真
高通量测序数据分析简介
随着第二代测序技术的广泛应用，海量数据不 断产生，包括大量的各类测序结果，需要凭借 专业的人员和方法对数据进行各种分析和统计， 才能得到有效的所需信息。
基于超级计算机、雄厚的生物信息学分析 经验与实力，欣景生物建立了成熟的高通量
测序数据的分析流程，有着经验丰富的生物信
息学分析人员，可提供针对各类二代测序数 据的深层数据分析服务。
我们提供的数据分析服务（细致展开）
基本数据分析：
序列前处理工作，包括成对测序数据的序列匹配，裁减低质量部分，数据格式转换等 序列拼接，Scaffolding，对454数据的homopolymer进行修正等。 用多种主流基因预测软件预测基因并挑选最合适的代表基因结构。 tRNA/rRNA识别和分类。 基因组GC含量分析，并识别特异区域。 基因功能注释（包括同源注释和蛋白结构域识别）。 基因功能分类，参照Gene Ontology或COG标准（由用户指定标准）。
高通量测序服务适用范围
mRNA或miRNA的表达组研究
进行高水准研究的医院、科研机构，涉及疾病样本、动物样本、 农业样本、微百度文库物样本的表达组研究。
新物种测序或已测序物种的重测序
开展基因组学研究的科研机构，或对特殊物种（农业经济作物， 如烟草、葡萄等；有价值的微生物，如致病菌、垃圾处理菌、农 业土壤改良菌、工业工程菌株等）进行基因组研究的机构，包括 一些发酵相关企业。
其它企业：
1、美季生物。 -小型企业，偏重于454测序。
2、晶能科技。 -依托研究院所建立的高通量测序服务企业。有一定业务量，但不稳 定。
3、其他类企业： -还有一些小型企业，这些企业主要通过代理或只能承担小量样本测 序，其服务流动性较大而且服务质量无法保证。
欣景生物科技则拥有成熟的测序与分析流程、经验丰富的分析人员，可 以提供高质量的二代测序相关服务。
我们的优势
1、服务水准高。团队中有关高通量测序实验已经大量大型课题的锻炼，
包括大量基因组测序、转录组测序等等，并已有Nature、Science等高端杂志 文章数据分析经验，有一整套严格的实验质量标准和操作流程，且不断跟踪 国际最新的进展，可以在高起点为客户提供服务。
2、服务周到。技术团队中有专职的高通量数据信息分析人员，在测序完
疾病相关或表型相关的人类基因组重测序
如华大之前做的炎黄计划，以及最近国际在进行的肿瘤基因组计 划等，一般是有较大科研经费实力的机构。
高通量测序数据分析服务适用范围
已进行高通量测序实验的机构，后续需要对所获
得的数据展开各种不同应用的研究。如基因组数据挖 掘、表达组的cSNP寻找、基因组的拼接与补洞、 miRNA的不同样本的表达差异分析等等。
高通量测序服务与数据分析服务简介
高通量测序简介
高通量测序技术（第二代或下一代测序技术，next generation sequencing) 是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万 到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在研究 中又被称为深度测序(deep sequencing) 。
基于illumina的solexa与罗氏454的高通量测序平台， 欣景生物可提供不同物种样本的各种类型的二代 测序服务。根据样本RNA或者DNA的不同应用可分 为表达组测序、microRNA测序、基因组测序等。
生物信息高级分析：
提供图型化界面由用户人工确认基因结构和基因功能注释。 重复序列识别和分类。 基因家族识别和聚类。 基因功能聚类，参照FunCatDB标准。 代谢调控途径识别和重建。 转录因子（Transcription Factor）识别和分类分析。 分泌蛋白识别和分析。 蛋白激酶识别和分析。 转运蛋白(Transporter)识别和分析。 假基因（pseudogene）识别和分析。 SSR标记模式识别和预测。
有完善的质控标准。
4、服务灵活。针对客户不同的需求在可行的前提下可以制定不同
的实验操作与数据分析方案。
一般的二代测序服务公司没有相应深度分析的能力， 而实验室很难独立展开深度分析的工作，可以采用合 作科研或纯服务委托形式。
我们提供的测序服务内容（细致展开）
表达组测序:
特定组织或者细胞中的mRNA经分离后制备成片段化的cDNA文库，通过solexa测 序仪对cDNA文库高通量测序，从而获得一个细胞或生物个体的全转录组信息。
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应用举例
应用举例
应用举例
高通量测序服务市场情况分析
大型知名品牌企业：
-华大基因。
-这类企业有完整的产业链，有着巨大规模的传统测序与二代 测序服务经验与市场拓展经验；但同时存在对具体客户服务不够 细致的缺点。
-2011年华大基因全球测序营业额1000000000元（人民币）
成后可以为客户提供完整的生物信息学分析，直至可以进行文章投稿或结题 等，这点在各个高通量测序服务企业中是非常有优势的，因为很多客户测序 完成后，如果缺乏此环节，其成果水平下降，甚至出现数据烂在手中的情况， 并不是而事实上是因为缺乏分析环节的保障。
3、服务稳定。实验操作阶段的每个实验环节都有专门的人员负责，
miRNA测序 :
可对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。用于作 用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学 应用。
基因组测序:
1. 细菌基因组测序:对全新或不同菌株细菌基因组进行全测序研究。 2. 真菌全基因组测序(全新或不同菌株):对于真菌全基因组而言，可以得到到一个真
高通量测序数据分析简介
随着第二代测序技术的广泛应用，海量数据不 断产生，包括大量的各类测序结果，需要凭借 专业的人员和方法对数据进行各种分析和统计， 才能得到有效的所需信息。
基于超级计算机、雄厚的生物信息学分析 经验与实力，欣景生物建立了成熟的高通量
测序数据的分析流程，有着经验丰富的生物信
息学分析人员，可提供针对各类二代测序数 据的深层数据分析服务。