PubMed检索基础
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策略:根据实际需求选择,最好的是使用主题词与关键词相结合 (1)已有对应主题词先进行MESH检索,确定该检索词的主题词, 进而通过Entry Terms确定同义词,拓展检索词,再以主题词 结合同义词查找 (2)没有对应主题词时可以想到检索词相关的上位词是否有对应 的主题词或者直接用关键词(最好用专业词典进行翻译)
GoPubMed+FMJS
GoPubMed+FMJS==更直观、更细仔的分析内容
医学统计平台
思考题
对比GoPubMed与SCI分析功能的异同及各自的 优势
检索之上的分析利器----GoPubMed
由德国Transinsight公司和德累斯顿大学合作研 发的,基于PubMed的文献资源的文本挖掘与分析 /web/gopubmed/ /web/gopubmed/
PUBMED中医药内容的检索技巧
1、中医词汇首选对应的Mesh词,注重Mesh词与自由词结合,并配合自由 词的不同拼写方法。(推拿、气功) 2、中药名称首选药材拉丁名配合英文名与汉语拼音,同时需要注意中药的 上位概念如Drug,Chinese Herbal 、Plant Roots 3、方剂检索一般用方名的汉语拼音,但必需注意使用拉丁字母拼写的方名 (日韩),其中甚至有些拉丁字母拼写的方名已为Mesh词。 4、疾病的中医疗法:采用疾病主题词与对应的中医药疗法的主题词如 Drug,Chinese Herbal 、Plant Roots、Medicine,Chinese Traditional、 chinese herbal;实验研究与临床研究分别应用中药与药理作用、治疗应用 结合进行检索。
传统医疗与制药的数据库, 英文版
医科大学的汉方医学中心
参考文献:
[1]宋一伦, 杨学智, 吕晓燕, 等. PubMed-MEDLINE数据库英 文中医药信息检索方法的探讨[J]. 中国中西医结合杂志, 2006,26(7):651-654. [2] 林丹红. 利用 M edline 检索中医药论文的方法与局限性分 析 术[J]. 医学信息学杂志, 2009,30(7). [3]林丹红著.中西医学文献信息获取与利用[M].北京市:中国 中医药出版社.2010.
Science Links Japan--日本科技门户类网站:将 日本各类科学技术在线信息源收集后予以分类, 并用英语向日本国外进行介绍的综合性网页。主 要目的是向日本国外的科研人员,科技政策研究 人员等提供便利的日本科技信息。
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Bread PPT
学科领域的总体概况
GoPubMed
初步了解学科领域研究热点 涉及的主要研究方向 主要作者、机构、合作网络 学科领域主要期刊资源 ………..
案例分析
分析痛风研究的研究进展
从出版年限、国家、城市、期刊、主题、作者、发文趋势、作者网 络等方面实现检索结果的可视化。 高频词统计了解研究热点 找寻最新文献,了解研究进展
非小细胞肺癌/放射疗法
脑癌/放射疗法
非小细胞肺癌/化学疗法 非小细胞肺癌/遗传学
获取全文的途径
1、全文数据库
2、文献传递:FMJS、读秀、FULINK、万方医学网 3、论坛、向作者索取
主题词与关键词的有效运用
不是每个词都有对应的主题词 没有主题标引的文献不可以用主题词检索 ----如何识别主题标引的文献
表示限定查找文件类型 例: filetype: pdf
常用的文件类型:DOC、XLS、PPT、PDF、RTF 5、双引号“” 表示精确搜索
例:搜索糖尿病饮食治疗,如果不加双引号,搜索结果被拆分,效果不 是很好,但加上双引号后,“糖尿病饮食治疗”,获得的结果就全是 符合要求的了。
部分功能可以通过搜索引擎的高级搜索来实现
了解研究区域分 布,参考投稿方 向
主题与作者分析: 发现热点、重要 作者---寻求合作 或锁定跟踪对象
课题发展态势
主要研究人员研究关 系网络:线条越多, 线形越多,地位越重 要
高频词
研究领域子类
GoPubMed 对高频的GO 和MeSH 词进行统计分析,反映出该领域的 研究热点。
新近展
Pubmed5、 检索PUBMED中有关四逆汤的文献,请写出你所用的检索词
。
PUBMED中医药文献检索的注意事项 方剂检索一般用方名的汉语拼音,但需注意一些翻译问题及拼写不同 中医药的概念部分在增补概念[Supplementary Concept]中,也有类似主题 词的聚类功能,检索中应有效运用
1
主题词与关键词的有效运用 PUBMED中医药内容的检索技巧 检索之上的分析利器GoPubMed
提高
2 3
特征词 特征词的内涵及在检索的作用 由于临床医学、医学教育与科研人员经常需要并感 兴趣而设置的具有特殊意义的词组,形成族性限定。 人类和动物 年龄组 性别 时代特征词 妊娠 出版类型特征词 具体动物名称特征词
PUBMED2、请查找近3年发表的有关幼儿(6~12岁)哮喘的随机对照 试验的文献,要求哮喘出现在题名中,下载两篇以文摘格式保存。
字段限定的功能:高级检索或字段限定[TI] PUBMED过滤器的功能: 年龄:6-12、出版时间:近3年、文献类型:随机对照试验 文摘下载方式
Mesh在检索中的重要作用
准确性----准确揭示文献内容的主题
更进一步选择主要主题词(MAJR)即以其为核心内容,进一步缩小检索范 围,提高查准率
专指性----主题词与副主题组配检索,使检索结果更专指。
副主题:对主题词起限定作用,两者组配,缩小检索范围。 Mesh 83个副主题词 副主题词中英文对照参见FMJS,见教材附录一P212
数据与PubMed同步 语义检索、深度应用 无高级检索需在PubMed构建完检索策略再进行分析
GoPubMed
生物医学概念与语义关系 GO 基因本体
PubMed
Mesh医学主题词表 PRO蛋白质本体
多维度分析与挖掘 可视化
可视化+4W
4W
what when
who
where
可视化:从出版年限、国家、城市、期刊、主题、作者、发文趋势、 作者网络等方:空格 逻辑非:用“-”表示,“-”号前必须有空格 逻辑或:用大写“OR” ,OR的前面必须有空格 -------- Goo局限于某个具体网站或 一类网站 注:冒号后不能有空格,域名不能有http
1.检索词的提取 2.采用主题词/副主题词组配的方式 比较: "Carcinoma, Non-Small-Cell Lung/radiotherapy"[Mesh] Carcinoma, Non-Small-Cell Lung AND radiotherapy 2.PUBMED过滤器的功能: 文献类型--综述性文献、免费全文
PUBMED反馈与加强
主要问题
没有应用到PUBMED的筛选的功能,也就是特征词 对于副主题词的作用不了解 未从detail转化情况来反思检索结果 未能理解主题标引的概念 欠缺思考、太敷衍
PUBMED基础与提高
1
过滤器(限定检索)----特征词
基础
2
MESH检索----主题词与副主题词
主题词选择策略
Mesh试查----查看转化情况 应用FMJS与万方医学网辅助翻译 选用专业的医学词典 甚至是查看文献中的专业术语的翻译 Mesh的树状结构如针灸的选词
PUBMED 3、请查找放射疗法对非小细胞肺癌生活质量影响的相关文献, 选择2篇下载文摘, 并尝试获取一篇免费综述性全文以截图的方式呈现。
"sini tang"[Supplementary Concept] OR "sini tang"[All Fields]
sini tang OR sini decoction 检索式:("sini tang"[Supplementary Concept] OR "sini tang"[All Fields] OR "sini decoction"[All Fields]) OR ("sini taபைடு நூலகம்g"[Supplementary Concept] OR "sini tang"[All Fields])
用途:搜索国家、政府、组织、学校的信息 搜索死链接网站 替代站内搜索 搜索受限的网站 例: site: site: site:jp site:org site:gov
3、intile: 表示把搜索范围限定在网页标题中 例: intile: 肝炎 4、filetype:
"si ni tang"
sinitang
日韩的汉方研究,复方常以拉丁字母拼写, 并且进入PUBMED的时间都较早,研究方 法值得借鉴
实例—分析检索词与检索技巧
1、有一位老师已查了外文数据库中有关国外研 究四逆汤的文献,但由于没有日本的医学数据库 ,想查找一些日本国内研究四逆汤的信息做研究 内容的补充,请问应该如何检索? 2、在此基础上想要尝试能不能有一些PDF的文 献做为参考支撑,如何实现?