pMD18-T Vector
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内容Page
●制品说明1
●制品内容1
●保存1
●纯度1
●用途1
●pMD18-T Vector的结构 1
●实验操作 2
■Control DNA片段的克隆实验2
■一般DNA片段的克隆实验2
●使用注意 3
●Q&A 3
●制品说明
pMD18-T Vector是一种高效克隆PCR产物(TA Cloning)的专用载体。它是TaKaRa公司经过长年的研究开发,由pUC18载体改建而成的。在pUC18载体的多克隆位点处的Xba I和Sal I识别位点之间插入了Eco R V识别位点,用Eco R V进行酶切反应后,再在两侧的3'端添加“T”而成。因大部分
耐热性DNA聚合酶反应时都有在PCR 产物的3'末端添加一个“A”的特性,所以使用本制品可大大提高PCR产物的连接、克隆效率。
本制品是以最为常用的pUC18载体为基础研制而成,所以它具有同pUC18载体完全相同的功能。此外,本制品中的高效连接液Ligation Solution I可以在极短的时间内(30分钟~1小时)完成连接反应,大大地方便了实验操作。另外,本制品中还含有Control Insert(500 bp),可用于Control反应。
●制品内容
pMD18-T Vector(50 ng/μl)20 μl×1支
Control Insert(50 ng/μl)10 μl×1支
Ligation Solution I 30 μl×5支*
* 使用时请于冰中融解。
●保存:-20℃
●纯度
■Control Insert经克隆后的白色菌落中,有90%以上含有Insert DNA片段。
■Control Insert经克隆后,用双脱氧测序法确认多克隆酶切位点及T碱基的存在。
●用途
■进行TA克隆,克隆PCR产物。
■对克隆后的PCR产物须用M13 Primers进行DNA测序。
●pMD18-T Vector的结构
-1-
●实验操作
■Control DNA片段的克隆实验
A)操作方法
1)在微型离心管中配制下列DNA溶液,全量为5μl。
pMD18-T Vector*1 1 μl
Control Insert DNA*2 1 μl
dH2O 3 μl
2)加入5 μl(等量)的Ligation Solution I。
3)16℃反应30分钟(过夜反应也不影响效率)。
4)全量(10 μl)转化至JM109等感受态细胞(100μl)中。
5)在含有X-Gal、IPTG、Amp的L-琼脂平板培养基上培养,形成单菌落。计数白色、蓝色菌落。
6)挑选白色菌落,使用PCR法确认T载体中插入片段的长度大小。
B)结果
使用Control Insert时的连接/转化结果如下,使用的感受态细胞的转化效率为:1.5×108 cfu/μg pUC118 DNA。
* 效率是指白色菌落中的目的DNA I nsert片段的连入效率。
■一般DNA片段的克隆实验
1)在微型离心管中配制下列DNA溶液,全量为5μl。
pMD18-T Vector*1 1 μl
Insert DNA*3 0.1 pmol~0.3 pmol
dH2O up to 5 μl
2)加入5 μl(等量)的Ligation Solution I。
3)16℃反应30分钟(过夜反应也不影响效率)。
4)全量(10μl)转化至JM109等感受态细胞(100 μl)中。
5)在含有X-Gal、IPTG、Amp的L-琼脂平板培养基上培养,形成单菌落。
6)挑选白色菌落,使用PCR法确认T载体中插入片段的长度大小。
*1 pMD18-T Vector的使用量
取0.5 μl实验也可得到满意的结果。实际操作时,可按实验需要使用T载体的量。pMD18-T Vector
1 μl(50 ng)的摩尔数约为0.03 pmo l。
*2 Control I nsert DNA
Control I nsert DNA为500 bp的3′末端带有A碱基的PCR产物,Control I nsert DNA 1 μl(50 ng)的摩尔数约为0.15 pmo l。
*3 I nsert DNA的使用量
在进行克隆时,Vector DNA和I nsert DNA的摩尔比一般为:1 :2~10。
-2-
●使用注意
1)Ligation Solution I请于冰中融解。
2)克隆时使用的Insert DNA片段(PCR产物)尽量进行切胶回收纯化,PCR产物中的短片段DNA
(甚至是电泳也无法确认的非特异性小片段)、残存引物等杂质都会影响TA克隆的效率。
3)按照本实验操作进行连接后,直接进行转化时的连接液不要超过20 μl。
4)连接反应请在16℃下进行,温度升高(>26℃)较难形成环状DNA。
5)连接效率偏低时,可适当延长连接时间至数小时。
6)当要转化的DNA量较大或准备进行电转化时,需对连接液进行乙醇沉淀纯化DNA后再进行转化。
●Q&A
Q-1 pMD18-T Vector转化时须使用何种感受态细胞?
A-1 本制品的载体来源于pUC18载体,因此,适合pUC18载体的感受态细胞都可使用,如:JM109等。
Q-2 怎样提高pMD18-T Vector的克隆效率?
A-2 1. 纯化PCR产物。切胶回收的PCR片段最好。此时可使用TaKaRa Code No. D301或DV805A 制品。
2. DNA片段的立体结构、DNA片段的长短都会影响克隆效率。一般情况下,大片段DNA的克隆
效率(连接效率与转化效率)小于短片段DNA,在使用大片段DNA的连接液进行转化时,建
议采用电转化方法。
Q-3 PCR产物难以插入载体,为什么?
A-3 1. 确认PCR反应使用的DNA聚合酶在PCR产物的3′端是否附加了A。有些DNA聚合酶扩增的PCR产物是平端,如使用本公司的Pyrobest DNA聚合酶(TaKaRa Code No. DR005)等
扩增得到的PCR产物不能直接用于TA克隆;PCR产物保存时间不要过长,长时间保存的PCR
产物会脱去末端的“A”碱基。
2.PCR产物中短片段杂质DNA太多,这时应切胶回收纯化DNA片段,回收时PCR产物不要在紫外线下暴露时间过长。
3.确认感受态细胞的转化效率,使用的感受态细胞的转化效率最好大于108cfu/μg pUC118 DNA。
4.确认Ligation Solution I的连接效率是否降低,多次反复冻融会降低Ligation Solution I的
连接效率。
5. 确认抗生素的浓度是否过大。
6. 最好使用新配制的平板培养基。
Q-4 转化后的菌落全为蓝色(或淡蓝色),为什么?
A-4 插入的PCR片段较短(小于500 bp),且插入片段没有影响lacZ基因的读框时,平板培养基上出现的菌落有可能呈现蓝色。
Q-5 欲对TA克隆产物进行测序时,可使用何种引物?
A-5 本制品的载体来源于pUC18载体。因此,用于pUC18载体测序的引物都可以使用。