高斯03教程PPT版本

数据查找
二.查找数据
D. 查找关键词Mol, 区分大小写，如图17所 示，取cm**3/mol为单位的数值，类似查找10， 取平均值，即为V.
Cp计算
一.输入文件制作
将高斯计算得到的输出文件(如12.out) opt freq至freq之间的内容删除后保存即可。
Cp计算
二. C P计算
把C P计算程序Thermo3.exe放在与刚才保存的文件
计 算 法 讲 义
内 容 提 要 绘制构型 高斯计算 数据查找 Cp计算 建模
绘制构型
一、平面坐标 采用chemoffice2004 中的chemdraw 程序 绘制化合物分子的平面构型，见图1 。保存 上述文件格式为*.cdx（系列化合物按异构 体取代位置命名，以1，2，9-PCPT为例）, 如129.cdx.
四.高斯输入文件的制作 用图3中的相应坐标替换图4中的相应 坐标,保存为*.txt, 如129.txt,即为高斯 计算
输入文件。
高斯计算
采用Gaussian 98程序打开高斯计算输
入文件129.txt,可得到高斯计算输出文件
129.out.
数据查找
一.查错 以1，2-PCPT为例，用GaussView程 序打开高斯输出文件12.out,查看有无异常，
谢ຫໍສະໝຸດ Baidu！
数据查找
二.查找数据
C. 查找关键词zero, 如图14所示，即为ZPE值。 如图15， Sum of electronic and thermal Enthalpies后 为H值，Sum of electronic and thermal Free Energies后为G值。 如图16所示，tot行对应着Eth、Cv、S值。
同一目录下，而后打开所有程序—附件—命令提示符， 输入DOS指令CD 来更改目录至C P计算程序
Thermo3.exe所在目录下 ，输入：thermo3 12.out, 确认
后出现“scale factor for frequency=?”,输入0.95，确认
后得到C P计算输出文件THERMO.OUT ，更改文件名
绘制构型
二.空间坐标
采用chemoffice2004 中的chem3D 程序 打开129.cdx文件，得到化合物分子的立 体构型，见图2 。保存上述文件格式为 *.gjc, 如129.gjc.
绘制构型
三.空间坐标的获取 用记事本方式打开文件129.gjc,得到化 合物的空间坐标，见图3 。
绘制构型
如图5。
数据查找
二.查找数据 A. 用记事本打开12.out,查找，关键词 exact,看图6所示数据是否大于零，否则需
重新优化计算。
数据查找
二.查找数据 B. 查找关键词freq三次后,查找关键词 scf,得到E值，如图7，复制数据填入表格
相应位置，见图8。
数据查找
二.查找数据
往下拖动页面，应次得到： Ehomo: 位于Alpha occ行最后一个数据，见图9。 Elumo：位于Alpha virt行第一个数据，见图10. 在Total atomic charges下面，找取最负电荷，即q-,和氢电荷中最正的， 即qH+,见图11 u:Dipole moment行，选tot值，如图12 α:Exact polarizability行选第1、第3和第6个数据，取平均值,如图13
为12THERMO.OUT即可。
建模
用SPSS 12.0 for windows打开前面数据查 找所得的Excel表格，得到如图18所示界面 。在工具栏中选择Analyze—Regression— linear,如图19，选择相应的自变量和因变量 ，采用Stepwise方法即可得到相关方程，如 图20和图21。