人外周血白细胞DNA提取标准操作规程(SOP)
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人外周血白细胞DNA提取标准操作规程(SOP) (血液/组织/细胞基因组提取试剂盒(DP304))
1实验原理
本法采用血液/组织/细胞基因组提取试剂盒(DP304),从全血中分离白膜层,去除其中的红细胞及蛋白质,裂解白细胞释放DNA,再通过去除DNA中的杂质使其纯化,得到高纯度的DNA原液,最后使用微量紫外可见分光光度计对DNA 的浓度及纯度进行定量检测。
2实验仪器
2.1 1.5ml EP管
2.2微量移液器,10μL、50μL、200μL、1000μL
2.3涡旋振荡器
2.4数显恒温搅拌循环水箱
2.5吸附柱CB3
2.6收集管
2.7离心机
2.8涡旋振荡器
2.9微量紫外可见分光光度计(Thermo NanoDrop1000)
3实验试剂
3.1正常人混合血液,应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。
3.2红细胞裂解液(裂解红细胞)
3.3缓冲液GA(轻微裂解作用,为蛋白激酶K提供反应环境),若溶液产生沉淀,使用前应在37℃水浴中预热10min,以溶解沉淀。
3.4蛋白激酶K(裂解蛋白质)
3.5缓冲液GB(裂解白细胞,释放DNA),若溶液产生沉淀,使用前应在37℃水浴中预热10min,以溶解沉淀。
3.6无水乙醇(沉淀DNA,去除杂质)
3.7缓冲液GD(去除蛋白质),使用前应按照试剂瓶标签的说明加入无水乙醇。
3.8缓冲液PW(去除盐),使用前应按照试剂瓶标签的说明加入无水乙醇。
3.9洗脱缓冲液TE(保存DNA)
4实验步骤
4.1样品的采集与保存:用装有EDTA的塑料管采集2mL静脉血,2000rpm离心5min,可见分层,分别为血浆层、白膜层、红细胞,将血浆吸出弃去,再通过点吸的方式将白膜层全部吸出,置于干净的1.5mL EP管备用。
如无法及时提取DNA,则应置于-80℃进行保存。
4.2样品预处理:
4.2.1裂解红细胞:通过低速涡旋15s混匀样品,取150μL样品置于干净的1.5mL EP管,加入750μL红细胞裂解液,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀
5min,然后10000rpm离心2min,吸去上清,留下白细胞沉淀。
4.2.2重悬白细胞:加入200μL缓冲液GA,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀3~5min,使白细胞沉淀重悬。
4.2.3裂解蛋白质:加入20μL蛋白激酶K,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀1min。
4.2.4裂解白细胞,释放DNA:加入200μL缓冲液GB,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀10min,70℃水浴10min。
4.2.5沉淀DNA,去除杂质:加入200μL无水乙醇,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀15s,简短离心使样品进一步混匀并去除管盖内壁的水珠。
将管内所有溶液都加入吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
4.2.6去除蛋白质:向吸附柱CB3中加入500μL缓冲液GD,12000rpm离心
1min,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
4.2.7去除盐类:向吸附柱CB3中加入600μL缓冲液PW,12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
4.2.8去除盐类:重复步骤(7)。
向吸附柱CB3中加入600μL缓冲液PW,12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
4.2.9去除残存漂洗液:将吸附柱CB3放回收集管中,12000rpm离心2min,倒掉废液。
将吸附柱CB3打开盖子置于室温放置10min。
4.2.10洗脱DNA:将吸附柱CB3转入一个干净的1.5mL EP中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50μL洗脱缓冲液TE,室温放置5min,12000rpm离心2min,将溶液收集到1.5mL EP管中,如无法及时测定,应置于-80℃进行保存。
4.2.11测定DNA浓度及纯度:使用微量紫外可见分光光度计进行测定,测定前通过手弹EP管底部3~5次的方式来使DNA溶液混匀。
5实验结果分析
5.1A230nm:碳水化合物和盐类最高吸收峰吸收波长。
5.2A280nm:蛋白质及酚类物质最高吸收峰吸收波长。
5.3A260nm:DNA/RNA最高吸收峰吸收波长。
5.4260/280:比值应在1.7~2.0之间,低于1.7表示有蛋白质及酚类物质污染,高于2.0表示有RNA污染。
5.5260/230:比值应大于1,低于1表示有碳水化合物和盐类污染。
5.6ng/μL:样品浓度单位,是通过样品在260nm处的吸光值以及选择的分析常数来计算的。
采用本法提取的DNA溶液浓度应大于100ng/μL。