限制性内切酶
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EcoRⅠ的识别序列
5‘ … G C T G A A T T C G A G … 3’ 3‘ … C G A C T T A A G C T C … 5’
切口:粘性切口和平端切口
EcoRⅠ —GAATTC— —CTTAAG— —G + AATTC— —CTTAA G— 粘端切口 HpaⅡ —GTTAAC— —CAATTG— —GTT + AAC— —CAA TTG— 平端切口
(二)基因工程的基本定义
(三)克隆的定义
(一)重组DNA技术
(recombinant DNA technology)
是指在体外按人们的意愿将不同的 DNA分子重组的技术。
(二)基因工程
(Genetic engineering)
是指利用重组DNA技术将目的基因 和载体重组,再导入受体细胞内进行扩
增和表达的过程。
(三)克隆 (clone)
是指通过无性繁殖过程所产生的 与亲代完全相同的子代群体。 基因工程相当于目的基因的无性 繁殖过程,也称其为基因克隆 (gene cloning)。
二、基因工程操作中常用的工具
(一)工具酶来自百度文库
(二) 载 体
(一)工具酶
1 限制性内切酶
2 T4 DNA连接酶
3 大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ
三 、基因工程的操作过程
(一)目的基因的获得
(二)目的基因与载体的连接
(三)重组体导入受体细胞
(四)基因工程菌的筛选
(五)外源基因的表达
(一) 目的基因的获得
1.构建基因组DNA文库 基因组DNA文库(genomic DNA library) 2.构建cDNA文库 cDNA文库(cDNA library) 3.人工合成法 要求已知目的基因的核苷酸序列或其产物 的氨基酸序列 4.聚合酶链反应 (polymerase chain reaction ,PCR)
2.λ 噬菌体(bacteriophage, phage)
蛋白衣壳
头部
尾
尾部纤维
3. 粘粒 (cosmid) :
由λ噬菌体的cos区与pBR322质粒 组合的杂种载体。粘粒可克隆29-
45kb的大片段,常用作建立真核基
因组文库的载体。
4.病毒(virus)
病毒载体更多用于真核表达 系统,如腺病毒,腺病毒相关病 毒、痘病毒,逆转录病毒,猴空 泡病毒等。
4 逆转录酶 5 T4多核苷酸激酶 6 碱性磷酸酶 7 末端脱氧核苷酸转移酶
1.限制性内切酶(restriction endonuclease)
定义: 一类能识别和切割双链DNA 分子中特定碱基序列的核酸水解酶。 分类:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ 作用:与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰 系统,限制外源DNA,保护自身DNA。
1.质粒(plasmid)
定义: 是染色体外能自我复制的 双链环状小分子DNA。
特点:
能在宿主细胞内独立复制, 带有某些遗传信息,会赋予宿主 细胞一些遗传性状。
pUC19质粒的物理图谱
pBR322质粒
基因工程中使用的质粒具备的特点
质粒的复制型 分为松弛型和严谨型两类。 质粒的不相容性 作为载体的质粒一般是不相容的。 质粒的接合性 用作载体的质粒都是非接合性质粒。 多克隆位点 即多种限制性内切酶的单一识别序列。 筛选标记 常用双抗生素抗性插入失活筛选标记和 蓝白菌落筛选标记。
转移到DNA或RNA的5‘端羟基上。
碱性磷酸酶简称AKP,此酶能特异的切除 DNA或RNA5‘端的磷酸产生5’端羟基以 防止载体的自身连接。 末端脱氧核苷酸转移酶能催化单核苷酸转
移到DNA的3‘端的羟基上。
(二) 载体
是携带目的DNA片段进入受体 细胞进行扩增和表达的工具。 常用载体: 质粒 噬菌体 粘粒 病毒
(三)重组体导入受体细胞
1. 受体菌的条件:安全宿主菌 限制酶和重组酶缺陷 处于感受态 2. 导入方式: 转化(transformation) 转染(transfection) 转导(transduction)
(四)基因工程菌的筛选
1. 抗药性标记选择 2. 标志补救 : α互补
3. 分子杂交法:原位杂交
基因技术
哈尔滨医科大学生物化学与分子生物学教研室 高旭 刘兴汉
基因操作技术
1 基因工程
2 分子杂交
3 聚合酶链反应
4 DNA序列测定
5 转基因动物
6 基因剔除技术
7 克隆动物
8 基因诊断和基因治疗
第一节
基因工程
( Genetic engineering)
一、基因工程的基本概念
(一)重组DNA技术的基本定义
Southern印迹
4. 免疫学方法:如免疫化学方法
酶免检测法
1. 抗药性标记选择
pBR322质粒—双抗生素抗性
2. 标志补救 : α互补
bla=氨苄青霉素抗性基因 Ori=复制起始点 lacZ’=β-半乳糖苷酶N端编码序列
2. 其他相关酶类
T4 DNA连接酶用于互补粘性末端和
平端DNA分子之间的连接。
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ具有5‘→3’的聚合
作用,5‘→3’外切作用和3ˊ→5ˊ的外切作用。
逆转录酶是以mRNA为模板合成互补DNA即 cDNA,用于组建cDNA基因文库。
T4多核苷酸激酶能催化ATP的γ-磷酸
基因组DNA文库(genomic DNA library)
将某种生物的基因组DNA切割成一定大小的片段, 分别与适合的载体重组后导入宿主细胞,这些重组 分子中插入片段的总和可代表该生物全部基因组序列。 这种通过重组、克隆方法保存在宿主细胞中的各种 DNA重组分子的集合体称为基因组DNA文库。
构建基因组DNA文库的过程
命
名:
第一个字母代表细菌的属名,用大写; 第二、三个字母是该细菌种名,用小写; 第四个字母代表株; 用罗马数字表示发现的先后次序。 EcoRⅠ E=Eschrichia属
co=coli种
R=RY13菌株
Ⅰ =发现的第一个限制酶
限制性内切核酸酶
Ⅱ型限制酶识别序列特点 ———回文结构
EcoRⅠ的切割位点
(二)目的基因与载体的连接
1.同源粘性末端连接 2.平端连接
3.定向连接
1. 同源粘性末端连接
方式:同一限制酶切割位点连接配伍末 端连接
2. 平端连接
适用于:限制性内切酶产生的平端切割 粘性未端或切平形成的平端
3. 定向连接
适用于:两种不同的粘性末端 一个粘端,一个平端
目的基因与载体的连接