棉花精氨酸脱羧酶基因GhADC1克隆与表达分析
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h i r s u t u m
L I Y a — d o n g , MO H u i - j u a n , WANG X i n g — f e n , S U N Ya n — x i a n g , , MA Z h i - y i n g
( 1 . Ag r i c u l t u r a l Un i v e r s i t yo fHe b e i , Ke yL a b o r a t o r yo fC r o p Ge r mp l a s m Re s o u r c e s o f He b e i , Ba o d i n g0 7 1 0 01 , C h i n a ; 2 . I n s t i — t u t e o f Ge n e t i c s a n dBr e e d i n g , La n g &n gNo r ma l U n i v e r s i y, t L a n g f a n g0 6 5 0 0 0 , Ch / n a )
a n a r gi ni ne de c a r b ox yl a s e g e ne wa s c l o ne d f r om upl a nd c o Ron us i ng bi o i nf o r ma t i c s a n d RT- PCR t e c h no l o gi e s . The f ul l — l e ng t h
异, 推 测 在 抗 病 品种 中 G b ADC 1可 能参 与根 部 对 黄 萎病 菌 胁 迫 的早 期 应 答 。 关键词 : 棉花 ; 精 氨 酸脱 羧 酶 基 因 ; 多胺 ; 黄萎病菌 ; 基 因表 达
中 图分 类号 : ¥ 5 6 2 . 0 3 5 . 3 文献 标 志码 : A
文章编号 : 1 0 0 2 . 7 8 0 7 ( 2 0 1 3 ) 0 4 — 0 2 9 1 — 0 9
Cl o n i n g a n d E x p r e s s i o n An a l y s i s o f a n Ar g i n i n e De c a r b o x y l a s e Ge n e f r O m Go s s y p i u m
摘要: 以抑 制 性 消 减 杂 交 ( S S H) 文库序列为基 础, 采用 生物信息学和 R T . P C R 方 法从 陆 地 棉 中 克 隆 出精 氨 酸 脱羧酶基 因, 命名为 G h ADC 1 , Ge n B a n k登 录 号 为 K C8 5 1 8 5 6 。 该 基 因全 长 2 9 5 4 b p , 其中5 ’ 非翻译 区4 7 7 b p ,
Ab s t r a c t : Ba s e d o n a s e q u e n c e i n a s u p p r e s s i o n s u b t r a c t i v e h y b r i d i z a t i o n l i b r a r y , Gh ADC1 , Ge n Ba n k a c c e s s i o n n o . KC8 5 1 8 5 6 ,
棉 花 学 报 C o R o n S c i e n c e 2 0 1 3 , 2 5 ( 4 ) : 2 9 1 - 2 9 9
棉花精氨 酸脱羧酶基 因 G h A DC 1 克 隆与表达分析
李 亚栋 , 默 辉娟 , 王省芬 , 孙 艳香 , 马 峙英
( 1 . 河北农业大学 / 河 北 省作 物种 质 资 源 重 点 实验 室 , 河 北 保定 0 7 1 0 0 1 ; 2 . 廊 坊 师 范学 院 遗 传 与 育 种 研 究 所 , 河北 廊 坊 0 6 5 0 0 0 )
wk.baidu.com
e DNA o f Gh AD C1 wa s 2 9 5 4 一 b p l o n g . T h e 5 ’ UT R wa s 4 7 7 一 b p a n d c o n t a i n e d s e v e r a l c 妇- a c t i n g e l e me n t s i n v o l v e d i n s t r e s s r e — s p o n s e s a n d a u ORF e n c o d i n g a n 8 - a mi n o a c i d s e q u e n c e . Th e ma i n ORF wa s 2 1 8 1 - b p l o n g , a n d e n c o d e d 7 2 6 a mi n o a c i d s wi t h a p u t a t i v e N— t e r mi n a l c h l o r o p l a s t — t a r g e t i n g s i g n a l p e p t i d e . Co n s e r v e d d o ma i n a n a l y s i s s h o we d t h a t Gh ADC1 c o n fi n e d a P L P b i n d i n g s i t e a n d a n Or n / Da p / Ar g d e c a r b o x y l a s e s i g n a l s i t e . T h e s e c h a r a c t e i r s t i c s i n d i c a t e d t h a t i t b e l o n g s t o t h e t y p e I I I P LP — d e -
具 有 多 个 参 与胁 迫 响 应 的顺 式作 用 元 件 和 一 个 编 码 8个 氧 基 酸 的微 型 编 码 序 列 ( u O RF ) ; 主编 码 区 ( mO RF )
2 1 8 1 b D, 共编 码 7 2 6个 氨 基 酸 , 其 中 N 端 具 有 叶绿 体 定 位 信 号 肽 。推 测 的 Gh AD C1蛋 白具 有 P L P结合 位 点及 O m/ Da p / A r g脱 羧 酶 的信 号 位 点 , 属 于典 型 的 I I I 型P L P依 赖 型 精 氨 酸脱 羧 酶 家 族 成 员 。 荧 光 定 量 R T . P C R 结 果表 明, 正常条件下 , G h ADC 1在 叶片 中表 达 量 高 于 茎和 根 部 组 织 , 且 在 抗 黄 萎病 品 种 冀 棉 2 0 中 的表 达 水 平 高 于 耐 病 品种 中 5 2 1 ; 黄 萎病 菌胁 迫 能 够 快 速 诱 导 抗 病 品 种 根 部 G h ADC 1表 达 , 而 在 耐 病 品种 中 未 见 明显 差
L I Y a — d o n g , MO H u i - j u a n , WANG X i n g — f e n , S U N Ya n — x i a n g , , MA Z h i - y i n g
( 1 . Ag r i c u l t u r a l Un i v e r s i t yo fHe b e i , Ke yL a b o r a t o r yo fC r o p Ge r mp l a s m Re s o u r c e s o f He b e i , Ba o d i n g0 7 1 0 01 , C h i n a ; 2 . I n s t i — t u t e o f Ge n e t i c s a n dBr e e d i n g , La n g &n gNo r ma l U n i v e r s i y, t L a n g f a n g0 6 5 0 0 0 , Ch / n a )
a n a r gi ni ne de c a r b ox yl a s e g e ne wa s c l o ne d f r om upl a nd c o Ron us i ng bi o i nf o r ma t i c s a n d RT- PCR t e c h no l o gi e s . The f ul l — l e ng t h
异, 推 测 在 抗 病 品种 中 G b ADC 1可 能参 与根 部 对 黄 萎病 菌 胁 迫 的早 期 应 答 。 关键词 : 棉花 ; 精 氨 酸脱 羧 酶 基 因 ; 多胺 ; 黄萎病菌 ; 基 因表 达
中 图分 类号 : ¥ 5 6 2 . 0 3 5 . 3 文献 标 志码 : A
文章编号 : 1 0 0 2 . 7 8 0 7 ( 2 0 1 3 ) 0 4 — 0 2 9 1 — 0 9
Cl o n i n g a n d E x p r e s s i o n An a l y s i s o f a n Ar g i n i n e De c a r b o x y l a s e Ge n e f r O m Go s s y p i u m
摘要: 以抑 制 性 消 减 杂 交 ( S S H) 文库序列为基 础, 采用 生物信息学和 R T . P C R 方 法从 陆 地 棉 中 克 隆 出精 氨 酸 脱羧酶基 因, 命名为 G h ADC 1 , Ge n B a n k登 录 号 为 K C8 5 1 8 5 6 。 该 基 因全 长 2 9 5 4 b p , 其中5 ’ 非翻译 区4 7 7 b p ,
Ab s t r a c t : Ba s e d o n a s e q u e n c e i n a s u p p r e s s i o n s u b t r a c t i v e h y b r i d i z a t i o n l i b r a r y , Gh ADC1 , Ge n Ba n k a c c e s s i o n n o . KC8 5 1 8 5 6 ,
棉 花 学 报 C o R o n S c i e n c e 2 0 1 3 , 2 5 ( 4 ) : 2 9 1 - 2 9 9
棉花精氨 酸脱羧酶基 因 G h A DC 1 克 隆与表达分析
李 亚栋 , 默 辉娟 , 王省芬 , 孙 艳香 , 马 峙英
( 1 . 河北农业大学 / 河 北 省作 物种 质 资 源 重 点 实验 室 , 河 北 保定 0 7 1 0 0 1 ; 2 . 廊 坊 师 范学 院 遗 传 与 育 种 研 究 所 , 河北 廊 坊 0 6 5 0 0 0 )
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e DNA o f Gh AD C1 wa s 2 9 5 4 一 b p l o n g . T h e 5 ’ UT R wa s 4 7 7 一 b p a n d c o n t a i n e d s e v e r a l c 妇- a c t i n g e l e me n t s i n v o l v e d i n s t r e s s r e — s p o n s e s a n d a u ORF e n c o d i n g a n 8 - a mi n o a c i d s e q u e n c e . Th e ma i n ORF wa s 2 1 8 1 - b p l o n g , a n d e n c o d e d 7 2 6 a mi n o a c i d s wi t h a p u t a t i v e N— t e r mi n a l c h l o r o p l a s t — t a r g e t i n g s i g n a l p e p t i d e . Co n s e r v e d d o ma i n a n a l y s i s s h o we d t h a t Gh ADC1 c o n fi n e d a P L P b i n d i n g s i t e a n d a n Or n / Da p / Ar g d e c a r b o x y l a s e s i g n a l s i t e . T h e s e c h a r a c t e i r s t i c s i n d i c a t e d t h a t i t b e l o n g s t o t h e t y p e I I I P LP — d e -
具 有 多 个 参 与胁 迫 响 应 的顺 式作 用 元 件 和 一 个 编 码 8个 氧 基 酸 的微 型 编 码 序 列 ( u O RF ) ; 主编 码 区 ( mO RF )
2 1 8 1 b D, 共编 码 7 2 6个 氨 基 酸 , 其 中 N 端 具 有 叶绿 体 定 位 信 号 肽 。推 测 的 Gh AD C1蛋 白具 有 P L P结合 位 点及 O m/ Da p / A r g脱 羧 酶 的信 号 位 点 , 属 于典 型 的 I I I 型P L P依 赖 型 精 氨 酸脱 羧 酶 家 族 成 员 。 荧 光 定 量 R T . P C R 结 果表 明, 正常条件下 , G h ADC 1在 叶片 中表 达 量 高 于 茎和 根 部 组 织 , 且 在 抗 黄 萎病 品 种 冀 棉 2 0 中 的表 达 水 平 高 于 耐 病 品种 中 5 2 1 ; 黄 萎病 菌胁 迫 能 够 快 速 诱 导 抗 病 品 种 根 部 G h ADC 1表 达 , 而 在 耐 病 品种 中 未 见 明显 差