1遗传标记在核桃属植物遗传多样性研究中的应用

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不同核桃品种的ISSR标记分析

不同核桃品种的ISSR标记分析
I S S R分子标记对来 自于 中国辽 宁、 新疆、 陕西 、 河北 、 山
桃 的繁殖方式 为嫁接 繁殖 , 在 自然 条件 下 , 其遗 传后 代 均为遗传 基础复 杂 的杂合 体 , 所 以, 仅从 形 态特 征很 难
区分不同品种 。因此 , 核桃 品种的分子 鉴定工作就 显得
尤 为 重要 。
核桃又名 胡桃 , 为油料 干果树 种 , 是世 界 上著 名 的 四大坚果 ( 核桃 、 扁桃、 板栗 、 腰果 ) 之一n ] 。我 国有 核桃 属植物 1 3 种, 而全 世界 约 有 2 3 个 种l _ 2 ] 。因其果 实 、 树 皮、 枝、 干、 花 粉 等 有较 好 的 营养 价值 和极 高 的经 济 价 值l 2 _ 3 _ , 核桃在全 国 2 4个省( 区) 都有分布和栽培 , 其产量 和面积均居世 界第 一位 。核桃 属植 物为 雌雄 同株 异 熟 的单性花植 物 , 在长期 进化 中, 由于在实 际 生产 中核
编号做标记 , 及时带 回实验室 , 储存于一8 O ℃冰箱 中待用 , 样 品来源详见 表 1 。试剂 D N A Ma r k e r 1 0 0 b p L a d d e r 和
P C R反应 所需 的 试剂 T a q酶、 d N T P s 、 1 0 ×P C R B u f f e r 、
北方 园艺2 0 1 3 ( 0 4 ) : 1 0 3 ~1 0 7
・ 生物技术 ・
不 同核桃 品种 的 I S S R 标 记 分 析
肖 志 娟 ,翟 梅 枝 ,许 静 ,杨 惠,李 丽
( 西北 农 林科 技大 学 林 学 院 , 陕西 杨凌 7 1 2 1 0 0 )

要: 以西北农林科技 大学资源苗圃的 1 8个核桃 品种嫩叶为试材 , 利用R分子 标记对 我 国核桃 组进行 了

遗传标记在动物遗传育种上的作用

遗传标记在动物遗传育种上的作用

遗传标记在动物遗传育种的应用摘要:遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。

其功能不一定研究得很清楚但因突变性状是明确的,所以容易测定。

对于微生物虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因。

也有用着丝粒作为遗传标记的。

但在动物遗传育种的应用广泛,并随着科学技术的发展一直不断进步,使得遗传育种的效率和精确性不断增强,也使遗传育种的性状监测更加详细。

主要总结概述遗传标记在动物遗传育种的应用。

关键词:遗传标记动物遗传育种遗传标记是指在遗传分析上用作标记的基因,也称为标记基因。

在重组实验中多用于测定重组型和双亲型。

作为标记基因,其功能不一定研究得很清楚但因突变性状是明确的,所以容易测定。

对于微生物虽多用与生化性状有关的基因,但对高等生物则多用与形态性状有关的基因。

也有用着丝粒作为遗传标记的。

在微生物遗传学中遗传标记还区分为选择性标记(或称选择性基因)和非选择性标记或称选择性基因)二类。

遗传标记指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。

它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。

遗传标记包括形态学标记(morphological marker)、细胞学标记(cytological marker)、生物化学标记(biochemical marker)、免疫学标记(Immune Genetic Markers)和分子标记(molecular marker)五种类型。

利用标记来选择和培育动物具有悠久的历史。

自从19世纪中期,奥地利学者孟德尔首创了将形态学性状作为遗传标记的应用先例以来,遗传标记得到发展和丰富。

形态学标记、细胞学标记、生化标记、免疫学标记等一直被广泛应用,然而这些标记都无法直接反映遗传物质的特征,仅是遗传物质的间接反映,且易受环境的影响,因此具有很大的局限性。

分子标记技术在果树种质资源及遗传育种研究中的应用

分子标记技术在果树种质资源及遗传育种研究中的应用
o ee i re ig,be dn e t ct n,eouina dca s c t no e ei rlt n hp e ei oy rhs a ayi-p d— fh rdt be dn y re igi ni ai d i f o vlt n lsi ai f n t eai s i ,gn t p lmop im n lss e i o i f o g c o c ge n ee i fc aatr t sa ay i.tecn t cin o e ei p iga dg n o aiain e elcl ain。g n ln - r ea dh rdt o h rce si n lss h o sr t f n tcma pn n e elc l t -gn o ai t y i c u o g z o z o e eco e
记辅助选择育种等方面关于分子标记技术的应用进行了综述:
关键 词 分子标记分子 ; 果树 ; 种质资源 ; 传育种 遗 文献标识码 : A 中圈分类号 :6 0 2 ¥ 6 .
Th p c to fM oe u e M a k Te h o o y i h t d e Ap l a in o lc l i r c n l g n t e S u y
Ab ta t T eat l t d cstep n il a dc aa tr tc f o sr c h ri ei r u e h r cpe n h rcei iso mmo sd DN moe uemak t ut re c no i s e  ̄yu e A lc l r Of ite .Moev r t lo r ro e s ia smma z stea piain o lc l r ng r ls rs uc so ut re teg r pam eo re rsrain i h td u i r e h p l t f c o moeu emak i empam eo re ff i te s h em ls rsuc sp eevt ntesu y r t o

分子标记在园艺植物研究上的应用

分子标记在园艺植物研究上的应用

对其应 用前景进 行分析。
关 键 词 : 分 子标 记 ; 园艺植 物 ;应 用现 状 ; 前景
随 着生 命科 学的发 展 ,各项生 物技术 纷纷被应 用于 园
记技术 可以构 建高 质量的 D NA指纹 图谱 ,尤其是 AF P L 技 术。祝军利用AF P L 技术建立 了苹果清晰的DNA指纹 图谱旧 , 张潞生也利用AF P L 技术建立猕猴 桃的D NA指 纹图谱恻 ,宋 婉建 立 了枣优 良品种 的DNA指 纹图谱 [。在蔬 菜 作物 中 , 1 q 拟南芥 、白菜 、青花 、辣椒 、黄瓜 、番茄 、马铃 薯和莴 苣
梅和 杏亲缘关系最短 ,桃次 之 ,李最远 。中科 院邹喻萍 等
利 用R D对 传统 “ ii AP Ta ”荷花 ( t s和现 代中 国荷花 作 x 1 u) o 种质分析【 5 】 ,根据遗传距离估计它们的祖先。 彭建营等利 用RA D技术对 枣的6 个 品种 ,进行DN P 4 A
利用近 等基 因系( a— sgnc Ln ,NI ) 分离群 体分 Ner i e i ie o L或
艺植物 ,如蔷 薇属 、菊 属 、莲 属、绿绒 蒿属 、百合 属和悬 钩子属等 ,利 用R D AP 技术进 行 了系统分 类【 j 】 着观赏 园 。随 艺植 物产业的不 断升温 ,对其分类 工作提 出了越来越 高的
基础 ,各种分 子标记技 术的 出现使各种 植物 的遗 传 图谱越 来越 完整 。 目前 ,已经建立或 初步建立 了遗 传图谱的植物
有 苹 果 、 桃 、樱 桃 、 扁 桃 、核 桃 、草 莓 、 蓝 莓 、 葡 萄 、柑
Байду номын сангаас
2 系谱分析和分类
由于 分子标记所检测 的是DN A水平 的差异 ,因而标记

野核桃杂种后代遗传性状分析

野核桃杂种后代遗传性状分析

野核桃杂种后代遗传性状分析
徐颖;张美勇
【期刊名称】《山东农业科学》
【年(卷),期】2005(000)004
【摘要】对野核桃自然杂交后代F1株系和F2株系进行了遗传性状的调查分析,结果发现其在抗果实细菌性黑斑病、炭疽病和叶片白粉病、生长速度、坚果大小等性状上均表现了超亲的变异,为早实核桃抗性育种增加了遗传资源,为材用型、抗病性、砧木和绿化新品系的选育提供了物质基础,是一批具有筛选价值的远缘杂交后代株系.
【总页数】2页(P21-22)
【作者】徐颖;张美勇
【作者单位】山东省果树研究所,山东,泰安,271000;山东省果树研究所,山东,泰
安,271000
【正文语种】中文
【中图分类】S664.103.2
【相关文献】
1.大豆杂种后代蛋白质含量的遗传研究:Ⅱ.杂种后代的遗传分析 [J], 王丕武;张晓玲
2.黑麦草×苇状羊茅杂种后代非整倍体频率和植侏性状分析 [J], 陈才夫;王槐三
3.新疆野核桃自然保护区不同坡向野核桃种群生命表与波动周期 [J], 张维;焦子伟;任艳利;杨允菲;李建东
4.基于AFLP标记的山东省5个野核桃群体的遗传多样性分析 [J], 王东升;辛红;邢世岩;刘晓静;吴岐奎
5.转Bt基因水稻杂种后代的农艺性状分析 [J], 陈业坚;吴其褒;舒庆尧;张增勤;刘守平;何方印
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RAPD技术在甘肃桃遗传多样性与种质资源分析中的应用

RAPD技术在甘肃桃遗传多样性与种质资源分析中的应用

RAPD技术在甘肃桃遗传多样性与种质资源分析中的应用近年来,随着生物技术的迅猛进步,RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)技术作为一种快速、简便且经济有效的分子标记技术被广泛应用于植物遗传多样性与种质资源分析中。

甘肃是我国重要的桃产区之一,具有丰富的桃种质资源,RAPD技术在甘肃桃的遗传多样性和种质资源分析中发挥了重要作用。

RAPD技术是一种PCR(Polymerase Chain Reaction)扩增方法,利用随机引物扩增植物DNA样本的可变区域,得到一系列随机分布的DNA片段。

相比于其他分子标记技术,RAPD 技术具有操作简易、需要的DNA量少、扩增效率高等优点。

在甘肃桃的遗传多样性分析中,RAPD技术使用多样的随机引物对不同种质的桃进行PCR扩增,得到了一系列具有多态性的DNA片段。

通过聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,可以将扩增得到的DNA片段分离出来,形成可以观察的DNA条带图谱。

通过分析DNA条带图谱的差异,可以探究不同桃种质间的遗传干系和遗传多样性水平。

探究发现,甘肃桃种质资源中存在着丰富的遗传多样性。

通过RAPD技术分析,发现不同品种的桃在DNA条带图谱上有着明显的差异,表明不同品种具有不同的遗传特征。

同时,RAPD技术还能够检测到种质资源中的基因突变和基因重组事件,为选择育种和种质鉴定提供了重要依据。

在甘肃桃的种质资源分析中,RAPD技术也发挥了重要作用。

RAPD技术不仅可以鉴定品种间的遗传干系,还可以评估不同品种的遗传相似性和遗传距离。

通过建立遗传相似性矩阵和遗传距离矩阵,可以使用聚类分析和主成分分析等统计方法对不同品种进行分类和划分。

这些探究结果对于桃种质资源的保卫、利用和育种具有重要的指导意义。

另外,RAPD技术还可以用于甘肃桃的品种鉴定和纯度检测。

通过RAPD技术可以建立桃品种的DNA指纹图谱,利用DNA指纹图谱可以准确鉴定不同桃品种,并对品种的纯度进行检测。

核桃种质资源遗传多样性研究中的AFLP技术优化及引物筛选

核桃种质资源遗传多样性研究中的AFLP技术优化及引物筛选

B oig 7 0 1 C i ; .oet B ra f i n Qa n 0 4 0 , h a adn 10 , h a4 F r y ueuo Qa a , i a 6 40 C i ) 0 n s n n n
Ab ta tAF Pf grr t gss m w so t zd b mpo igo v ut a fw lu( u ln e a L. ,o sr c : L n ep ni yt a pi e y e lyn ff ec lv r o an t J ga sr i ) fr i i n e mi i is j
g n t ie i n y i fwan tg r ls . e ei dv r t a a ss o l u emp a m Twe t ar f ifm ltv rme r d niid a d r c mme d d fr c s y l ny p iso n o aie p i r wee ie tf n e o s e n e o AF P a ay i o e ei iest fwan t L n lss fg n t dv ri o lu . c y Ke r s: an t Gemp a m ; L Prme s Ge e i ie i y wo d W l u ; r ls AF P; i r ; n tc d v r t s y
2. le e o i ce c He e rc lu a ie i B o i g 0 1 01 C n Colg fLf S in e, b iAg iutr Un v r t a dn 7 0 , hia; e l s y, 3. e De at n fM o e ce c n e hn lg He e rc l rlUnv ri Th p rme to d r S in e a d T c oo y, b iAgiut a ie t n u s y,

光核桃种质资源的遗传多样性分析开题报告

光核桃种质资源的遗传多样性分析开题报告

光核桃种质资源的遗传多样性分析开题报告
一、研究背景
核桃是一种重要的果树作物,因其果实风味独特、营养丰富,受到广泛的青睐。

光核桃是核桃的主要品种之一,生长在我国北方地区。

种质资源的遗传多样性分析是研究物种起源与进化、种质资源利用与开发的重要途径。

因此,对光核桃种质资源的遗传多样性进行分析具有重要的意义。

二、研究目的
本研究旨在通过对光核桃种质资源的遗传多样性分析,研究光核桃的地理遗传结构、品种间遗传关系、基因型多样性等,为光核桃的遗传改良和保护提供理论依据。

三、研究内容和方法
1. 样品收集
从光核桃主要栽培区域收集不同品种的叶片样品,共计100份。

2. DNA提取
采用改良的CTAB法从叶片样品中提取总DNA,纯化后存储于低温环境中。

3. SSR扩增
利用SSR引物对样品中DNA进行PCR扩增,将扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,并测定带型图谱。

4. 遗传分析
使用POPGENE软件计算种群遗传多样性参数,包括群体遗传多样性指数、基因分化指数和群体分子方差等。

使用STRUCTURE软件进行基因型聚类分析和遗传群体结构分析,建立系统发育树。

四、研究意义
通过对光核桃种质资源的遗传多样性分析,可以揭示光核桃的遗传
多样性状况和遗传组成,为保护和利用光核桃的种质资源提供科学依据。

同时,对光核桃的地理遗传结构和品种间遗传关系进行深入研究,有助
于推广和应用光核桃资源,提高光核桃的种质利用价值。

分子标记及其在核桃种质资源研究中的应用

分子标记及其在核桃种质资源研究中的应用

分子标记及其在核桃种质资源研究中的应用摘要介绍了分子标记技术的类型,以及目前常用的几种分子标记技术(rflp、aflp、rapd、ssr、issr等)的基本原理、特点,综述了分子标记技术在核桃种质资源研究中的应用情况,并对目前分子标记研究存在的问题及前景作了分析。

关键词分子标记;核桃;种质资源;应用中图分类号q819文献标识码a文章编号1007-5739(2009)14-0347-04分子标记也称为dna分子遗传标记,或dna标记,是继形态学标记、细胞学标记及生化标记之后,近年来被广泛应用的一种新的遗传标记。

分子标记从分子水平反映生物个体间或种群间具有差异特征的dna片段,直接反映基因组dna间的差异,从而为解释各物种间的亲缘关系奠定了技术理论基础[1]。

dna标记能对各个发育时期的个体、组织、器官进行检测,不受发育阶段及环境的影响,且遗传稳定、数量丰富。

dna分子标记对生物的影响表现为中性,有些标记为共显性,且对选择隐性基因控制的性状十分有利。

至dna标记诞生到现在,发展迅猛,日臻成熟。

目前,dna标记被广泛地应用于植物遗传育种、基因定位、基因克隆以及分子辅助选择等研究领域。

我国是核桃属(juglans)植物分布中心之一,原产于我国的有5个种,其中核桃(j. regia l.)和铁核桃(j. siggillata l.)具有极大的商业坚果栽培价值[2-5]。

随着核桃属作物大规模商业化的快速发展,以及品种选育、鉴定、推广及种质资源收集和保护工作的深入开展,形态描述、地理来源以及同工酶等方法由于自身存在局限性而难以满足核桃属植物研究和开发的需要,分子标记技术将成为上述工作的有效工具。

1分子标记的类型dna分子标记大多以电泳谱带的形式体现,大致可分为两大类[1]。

第1类是非pcr依赖的分子标记(基于southern杂交的分子标记),包括限制性片段长度多态性标记(restriction fragment length polymorphism dna,rflp)、原位杂交(in situ hybridization)等;第2类dna标记基于pcr技术,主要包括随机扩增多态性dna标记(random amplification polym-orphismdna,rapd)、dna扩增指纹印迹(dna amplifi-cation fingerprinting,dna)、简单序列重复标记(simple seq-uence repeat,ssr)、随机引物聚合酶链反应(arbitrarily primedpcr,ap-pcr)以及扩增片段长度多态性标记(amplified fragment length polymorphism,aflp)等。

用AFLP技术分析四川核桃资源的遗传多样性_陈良华

用AFLP技术分析四川核桃资源的遗传多样性_陈良华

植物生态学报 2008, 32 (6) 1362~1372 Journal of Plant Ecology (Chinese V ersion )——————————————————收稿日期: 2007-02-08 接受日期: 2007-06-09基金项目: 四川省作物育种攻关重点项目林竹新品种选育课题(2006YZGG-10)和四川省林业厅科技先导计划(2005-5) 在实验过程中得到了万雪琴博士的支持, 吴元奇老师对数据分析给予了帮助,在此表示感谢 * 通讯作者 Author for correspondence E-mail: hutx001@ E-mail of the first author: chlhua2001@用AFLP 技术分析四川核桃资源的遗传多样性陈良华 胡庭兴* 张 帆 李国和(四川农业大学林学园艺学院, 四川雅安 625014)摘 要 利用AFLP 分子标记技术, 运用EcoR /ⅠMse Ⅰ双酶切组合, 选用多态性高、分辨力强的4对选择性扩增引物组合E32/M48、E33/M61、E35/M61、E33/M62分别对四川省3个野生核桃(Juglans regia )种群和1个野生铁核桃(J. sigillata )种群共46个样品进行遗传多样性分析、居群遗传结构分析及种属关系探讨。

结果表明: 1)共扩增出244个遗传位点, 其中146个多态位点, 多态率为59.84%; 核桃群体组和铁核桃群体的多态性百分率分别为55.33%和52.05%, 两个物种遗传多态性水平相当; 核桃群体组所检出的位点平均有效等位基因数A e 、Nei’s 基因多样度H 、平均Shannon 信息指数I 分别为1.322 9、0.190 8和0.286 3, 而铁核桃群体分别为1.339 9、0.196 1和0.289 8, 铁核桃群体遗传多样性水平略高于核桃群体。

2)群体间特异带及群体间共有带占总扩增带数的15.16%, 其中铁核桃群体特异谱带最多, 群体特异谱带揭示了群体间的遗传差异及相似性。

四川西部核桃属植物遗传多样性研究的开题报告

四川西部核桃属植物遗传多样性研究的开题报告

四川西部核桃属植物遗传多样性研究的开题报告一、研究背景核桃属(Juglans)是包括核桃、胡桃、榛子在内的一类植物。

核桃属植物广泛分布于北半球温带地区,具有较高的经济价值。

其中,四川西部作为中国重要的核桃生产区之一,是世界著名的核桃产地,其核桃种植量和产量均居全国前列。

然而,随着环境污染和人类活动的加剧,核桃属植物的遗传多样性逐渐降低。

同时,由于人们对核桃的需求不断增加,为了满足市场需求,人工选择和种植已经成为了现实。

但是,这种做法却无法保证核桃属植物品种的遗传多样性和基因稳定性,导致了品种的质量和产量下降。

因此,对四川西部核桃属植物的遗传多样性进行研究,可以帮助人们更好地保护和利用这些重要资源。

同时,这也对基因保护,核桃品种选育以及相关遗传研究都具有重要意义。

二、研究目的本研究主要旨在:1.通过对四川西部核桃属植物的遗传多样性进行研究,了解该地区核桃属植物的遗传特征和多样性情况。

2.分析核桃属植物遗传多样性的成因,特别是环境和人类活动对遗传多样性的影响程度,为进一步保护和利用核桃属植物资源提供科学依据。

3.为核桃属植物品种的选育以及相关遗传研究提供基础数据。

三、研究内容1.样本采集本研究拟在四川西部地区(包括成都、雅安、广安等地)采集核桃属植物的样品,并对其进行分类、编号、描述和记录相关生态环境和生长情况。

2.基因分析对采集到的样品进行遗传学分析,主要包括核酸提取、扩增、测序、数据处理和分析等步骤。

通过DNA条形码技术,对核桃属植物进行种类分类,并对不同物种内部的基因多样性和遗传结构进行分析。

3.环境分析通过采集地、海拔、环境温度、湿度等多种环境因素的测量和分析,研究环境因素对核桃属植物遗传多样性的影响。

同时,分析人类活动对于核桃属植物遗传多样性的影响。

四、研究意义1.对核桃属植物的遗传多样性进行研究,可以为基因保护、种质资源和品种选育等提供科学依据和支持。

2.了解环境因素和人类活动对核桃属植物遗传多样性的影响,可以提供更好的管理和保护策略。

基于分子标记的植物种群遗传多样性研究

基于分子标记的植物种群遗传多样性研究

基于分子标记的植物种群遗传多样性研究植物种群遗传多样性是种群进化和生态发展的基础,它反映出种群内遗传差异的程度和分布状况。

作为植物保育的重要指标之一,研究植物遗传多样性可以为种群保护和生态修复提供科学依据。

目前,随着生物信息学和分子生物学的发展,种群遗传多样性的研究方法也得到了大幅度提升。

分子标记是遗传学领域中的一种研究工具,通过对某一特定DNA序列进行研究,可以快速揭示出物种间遗传多样性的程度。

在植物学的研究中,常用的分子标记包括核酸序列和蛋白质序列。

其中,核酸序列分子标记的研究主要包括限制性片段长度多态性 (RFLP)、序列标记间隔法 (SSR)、随机扩增多态性DNA (RAPD)、DNA指纹图谱 (AFLP)、单倍型分析 (HAPLOTYPE)、SNP等等。

这些分子标记方法有不同的优缺点,可以根据实际需要选择适合的方法来深入研究植物物种间的遗传多样性。

限制性片段长度多态性(RFLP)法是一种可以对DNA特定部位进行定性、定量分析的方法。

它通过限制性内切酶的作用将DNA片段分割成若干不同长度的碎片,然后利用电泳法分离这些碎片,得到有相对特异性的DNA带谱图。

该方法优点在于能够研究复杂的基因多态性,可以避免PCR扩增过程中对GC含量和DNA质量的要求,缺点在于步骤繁琐、时间长、成本高。

序列标记间隔法 (SSR)是基于微卫星分子进化的一种分子标记方法。

这种方法依托细胞质基因组中的微卫星序列来构建一个高分辨率的多态性标记。

高度多态性的核酸片段不仅在植株自交系动态变化过程中具有稳定的遗传学特征,同时该标记还可以锁定一段DNA特定区域,避免了较复杂酶切和PCR扩增过程中的非特异性DNA等因素的干扰,因此使用范围广泛。

随机扩增多态性DNA (RAPD)是利用PCR扩增DNA片段,然后在EA界面上用电泳分离并可视化DNA片段,再把不同的PCR产物的可视化图谱进行比较,确定不同个体的分子特征。

由于RAPD标记在PCR反应扩增中对操作者、PCR反应条件、反应系统组成及质量等方面的要求较高,同时仅能分析0.5~10kb左右大小的DNA片断,因此被SSR和AFLP方法所替代。

核桃属材用核桃SSR标记的遗传多样性分析

核桃属材用核桃SSR标记的遗传多样性分析

核桃属材用核桃SSR标记的遗传多样性分析高玉娜;赵登超;孙永泉;刘清华;侯立群【期刊名称】《西北农业学报》【年(卷),期】2011(020)009【摘要】以美国黑核桃、核桃楸、青林核桃实生子代及部分普通品种共86份种质资源为试验材料,利用8对SSR引物进行遗传多样性分析及聚类分析.结果表明,8对黑核桃引物共扩增出48条带,其中多态性带44条,占总扩增带的91.67%;遗传多样性指数为0.197 2~0.473 4,Shannon指数为0.304 3~0.666 3.说明黑核桃微卫星在核桃近缘种中能得到有效扩增,可以用于近缘种遗传多样性分析和核桃属种间关系研究.聚类结果表明,青林实生子代具有丰富的遗传多样性,与核桃楸及黑核桃具有明显差异,但与其他普通品种界限不明显.【总页数】6页(P129-134)【作者】高玉娜;赵登超;孙永泉;刘清华;侯立群【作者单位】山东师范大学生命科学院,济南250014;山东省林业科学研究院,济南250014;山东省林木遗传改良重点实验室,济南250014;山东师范大学生命科学院,济南250014;山东师范大学生命科学院,济南250014;山东省林业科学研究院,济南250014;山东省林木遗传改良重点实验室,济南250014【正文语种】中文【中图分类】S664.1【相关文献】1.四川核桃良种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析 [J], 周于波;朱鹏;龚伟;王景燕;闫思宇;吴开志2.怒江州深纹核桃种质资源SSR遗传多样性分析 [J], 吴涛;陈少瑜;宁德鲁;肖良俊;贺娜;唐春云;和玉德3.基于SSR分子标记的78份核桃种质资源遗传多样性分析 [J], 敬丹;骆翔;陈利娜;李好先;唐丽颖;曹尚银4.基于ISSR标记的16个核桃品种遗传多样性分析及分子身份构建 [J], 李国田;张美勇;相昆;徐颖;沈广宁;薛培生;杨军5.应用ITS序列及SSR标记分析核桃与铁核桃亲缘关系 [J], 王滑;阎亚波;张俊佩;裴东因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

核桃谱系地理学和转录组学遗传标记开发研究

核桃谱系地理学和转录组学遗传标记开发研究

核桃谱系地理学和转录组学遗传标记开发研究核桃Uuglans regia)为胡桃属植物中的模式种,分布范围广泛,栽培历史悠久且具有很高的食用和药用价值。

长期以来核桃复杂的遗传背景与重要的价值是学者关注的焦点。

目前,对核桃植物进行研究的报道主要集中在形态学、解剖学、胚胎学、细胞学和孢粉学等方面。

应用分子标记技术对胡桃属植物进行研究的报道也仅限于个别种的少数群体或个体,采用的分子遗传标记也大多是通用引物,其多态性及所含的遗传信息都比较有限。

因而通过分子标记手段对核桃全国不同地理群体的遗传多样性进行研究以及开发出更多遗传信息丰富的标记的研究是有必要的。

本研究一方面通过DNA测序技术,利用单亲遗传细胞质分子标记及双亲遗传的核DNA片段进行核桃谱系地理学探讨;另一方面基于Illumina HiSeqTM高通量测序平台,对核桃的叶片、花芽、雌花及雄花四种器官进行转录组测序,获得4.98 G数据,随后利用生物信息学方法对数据进行了重头组装、拼接、注释及相关生物信息学分析,并利用核桃不同Unigene中微卫星序列开发易扩增、多态性好的EST-SSR引物。

通过上述两方面的研究分析,为核桃群体进化历史、遗传标记及其种质资源的开发利用和保护提供理论基础和依据。

主要研究结论如下:(1)利用3-9线粒体基因片段和TrnL-F叶绿体基因片段对核桃以及外类群野核桃(J.cathayensis)、核桃楸(J.mandshurica)和麻核桃(J.hopeiensis)进行遗传多样性与系统发育关系研究。

结果显示,胡桃属5个物种中,核桃的遗传多样性最高,其它几个种的遗传变异很少。

野核桃(J.cathayensis)、核桃楸(J.mandshurica)和麻核桃(J.hopeiensis)三个种的亲缘关系较近分为一组,称为胡桃楸组,该组与核桃、铁核桃之间存在显著差异。

同时,研究发现核桃与美国白核桃亲缘关系近,存在生物地理间断分布现象。

微卫星DNA在分析核桃遗传多样性上的应用

微卫星DNA在分析核桃遗传多样性上的应用
T he PCR o p t i mum s y s t e m wa s s e t u p;1 2 p r i me r s wi t h g o o d r e p e a t a b i l i t y nd a s  ̄o n g p o l y mo r p hi s m we r e s c r e e n e d o u t f r o m 2 7 p r i me r s ; 1 7 4 b a n d s we r e a mpl i ie f d o u t t o t a l l y , i n wh i c h 1 1 8 we r e p ol l y mo r p h i s m ba n ds , a c c o u n t i n g or f 6 7 . 8 2 % o f t h e t o t a l , t h e a v e r a ge d n u mbe r
Ab s t r ac t :I n o r de r t o s ud t y g e n e t i c d i v e r s i t y o f d i f f e r e n t wa l n u t v a r i e t i e s nd a t o p r o vi d e t h e o r e t i c a l b a s i s f o r b r e e d i n g n e w v a r i e t i e s nd a
Appl i c a t i o n o f mi c r o s a t e l l i t e DNA o n a na l y z i ng g e ne t i c d i ve r s i t y o f
Ju gl a ns r e gi a
XI AO Z h i - j u a n , Z HAI Me i — z h i , WANG Z h e n — y u a n , X U J i n g , L I L i , Y ANG H u i

核桃实生居群遗传多样性ISSR分析

核桃实生居群遗传多样性ISSR分析
植物遗传资源学报 2011,12(4):640-645
JournalofPlantGeneticResources
核桃实生居群遗传多样性 ISSR分析
李国田,艾呈祥,张力思,魏海蓉,刘庆忠
(山东省果树研究所/山东省果树生物技术育种重点实验室,泰安 271000)
摘要:利用 ISSR技术对新疆核桃元丰、云新核桃、泰山野核桃和陕西核桃 4 个核桃实生居群共 61 份种质进行了遗传多样 性分析。 结果表明:从 36 条 ISSR引物中筛选 9 条引物,共检测出 101 个位点,多态性位点 89 个,占检测位点总数的 88.12%, 有效等位基因数、Nei′s基因多样性指数和 Shannon 信息指数分别为 1.5207、0.3125 和 0.4759。 UPGMA聚类结果表明,61 份核 桃种质聚为 5 组,元丰核桃居群和陕西核桃首先聚在一起,然后与云新核桃聚在一起,最后与泰山野核桃相聚,其中陕西核桃 居群的遗传多样性最高,分为 2 组,其多态位点百分率、H值和 I值分别为 66.29%、0.2111 和 0.3239。 居群间遗传一致度在 0.6727 ~0.7970 之间,基因流为 0.4220,表明不同居群间基因交流程度很低,基因分化明显,在遗传组成上存在显著差异。
主要手段,国内外已对核桃属植物的遗传关系、品种 鉴别等方面进行了多方面的研究[2-5] , 等 Bayazit [6] 利用 AFLP方法对土耳其低需冷量核桃的多样性进 行了分析,用于确定核桃在地中海地区分布的范围; 国内利用 等 RAPD、SSR 技术对核桃属不同种之间
收稿日期 修回日期 :2010-05-20
关键词:核桃;实生居群;遗传分析;ISSR
ISSRAnalysisofGeneticDiversity among Seedling Walnut ( Juglansspp.) Populations

基于分子标记的植物品种鉴定和遗传多样性研究

基于分子标记的植物品种鉴定和遗传多样性研究

基于分子标记的植物品种鉴定和遗传多样性研究植物是地球上最重要的生物资源之一,它们可以提供食物、药品、材料以及保持生态平衡。

而植物品种鉴定和遗传多样性研究则是保护植物资源、促进植物遗传改良等领域非常重要的一环。

基于分子标记的技术已经成为当今最具前景和实用的辨认和分类植物品种以及研究遗传多样性的方法之一。

一、基于分子标记的植物品种鉴定方法植物品种是通过对植物形态、生物学、化学性状以及遗传特征的综合研究,确定其不同的品种和种属。

而传统的植物鉴定方法通常是基于形态学、生理和生化特征等进行的。

但这种方法存在很多局限性,如同种植物因地理环境等原因会产生一定的变异性,有时不利于明确鉴别。

而基于分子标记的植物品种鉴定方法,主要是利用分子生物学技术,运用多样的分子标记鉴定不同的植物品种。

现代分子标记技术为鉴定植物提供了一个新的角度,常用的分子标记主要包括核酸序列标记、蛋白质标记和DNA指纹图谱。

其中,核酸序列标记是现代分子生物学技术中最常用的技术之一。

它通过分析DNA序列的变异性和多样性,鉴定出不同品种之间的区别。

DNA指纹图谱则是对核酸序列基本特征与区别进行简化分析,建立一个可见的标记图谱,帮助准确辨认不同的品种和种属。

目前,基于分子标记的植物品种鉴定方法已经成功推广应用于许多植物学研究领域。

二、基于分子标记的植物遗传多样性研究植物遗传多样性研究是指通过对植物的遗传多样性进行系统、全面的观测、调查、分析和评价,以了解不同植物品种的基因组成、遗传变异特征等信息,评估植物资源的遗传多样性和遗传结构变化,以及制定有效的保护和利用策略等。

基于分子标记的植物遗传多样性研究是通过对植物基因组中的某些特定基因序列的变异聚类进行分析,来研究物种分化、育种和遗传演化等问题。

在分子标记方面,最常用的是RAPD、AFLP、SSR和SNP等技术。

这些分子标记通过对植物DNA序列特定的保守区域进行密集的扫描分析,从而揭示出其中存在的多态性位点和变异性系列。

基于ISSR标记的贵州山核桃遗传多样性分析

基于ISSR标记的贵州山核桃遗传多样性分析
67% (见 表 3)。 运 用
Popgene32 软 件 分 析 24 份 贵 州 山 核
桃的 遗 传 多 样 性 (表 4)。 引 物 UBC
845、UBC856 的 贵 州 山 核 桃 扩 增 电

SEED

第 41 卷
(
Se
ed)
Vo
l.
41
第 01 期 2022 年 1 月
No.
01
J
an. 2022
基于I
SSR 标记的贵州山核桃遗传多样性分析
敏, 苗贵东, 夏可灿, 张
郭计华, 程

培, 张万芹, 蔺维成, 王颖娟
(兴义民族师范学院, 贵州 兴义 562400)
要:以贵州省黔西南州安龙县栖凤镇 24 份贵州山核桃种质为供试群体,采用I
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山核桃(
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rg),又 名 小 胡 桃
核桃果肉中富含多种 氨 基 酸,含 有 7 种 人 体 必 需 氨 基
桃属于胡桃科山核桃属,与 核 桃(
关键词: 贵州山核桃;I
SSR 分子标记;遗传多样性
DOI: 10.
16590/
cnk
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大巴山区核桃实生居群的坚果表型和遗传多样性

大巴山区核桃实生居群的坚果表型和遗传多样性

大巴山区核桃实生居群的坚果表型和遗传多样性徐永杰;韩华柏;王滑;陈凌娜;马庆国;裴东【摘要】[Objective]Daba mountains is one of the most abundant areas of biodiversity and walnut ( Juglans regia) resources because of its unique geography and climate. In recent years,walnut resources lose dramaticallyin this area due to human intervention. In view of the serioussituation,investigations were carried out on the nut phenotypic diversity and genetic diversity of walnut populations originated from seedlings in Daba mountains to know its nut phenotypic variation, germplasm characteristics and genetic structure. [Method]Variation of 12 nut phenotypic traits ( 30 representative nuts per sample) and 16 gene loci (1 seedling per sample and 16 SSR primers were used) of 386 samples from12 seedling populations in Daba mountains were analyzed.[Result]1) The variation coefficient of nut phenotypic traits of 12 seedling populations in Daba mountains was between 26 . 75% – 34 . 36%,with an average of 30 . 60%. And the germplasm resource of small nut ( less than 6 g ) accounted for a certain proportion. The Shannon index of the populations was between 1 . 112 –1 . 546 ,with an average of 1 . 324 ,and the expected heterozygosity ranged from 0 . 612 to 0 . 718 ,with an average of 0.688,suggesting abundant variations in nut phenotypic and genetic diversity in this area. 2) The phenotypic and genetic differentiation among populations in this area was small,with differentiation coefficients of 8. 15% and 6. 32%respectively. 3) Cluster analysis showed that the Manhattandistance of nut phenotypic traits and the genetic similarity coefficient were positively related to the geographic distance. [Conclusion]There were large nut phenotypic diversity and genetic diversity in walnut trees in Daba mountains because of long-term regenerations from seedlings and adaptation to diverse site conditions. The Daba mountains is an important area of genetic diversity of walnuts in China. This study would provide an important basis for the walnut breeding and conservation in the region.%【目的】大巴山区因其地理和气候原因是我国生物多样性也是核桃资源分布最为重要的地区之一。

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中 圊蓉 学c 丕 攉 2 0 1 4 , 3 0 ( 1 3 ) : 1 - 5
Chi n e s e Ag r i c ul t u r a l S c i e nc e Bul l e t i n
遗传标记在核桃属植物遗传 多样性研 究 中的应 用
徐 永杰 , 裴 东 , 马庆 国林业所/ 国家 林业 局林 木培育重点实验室, 北京 1 0 0 0 9 1 ; 湖北省林业科学研究 院, 武汉 4 3 0 0 7 5 ;
湖北省兴 山县林科所 , 湖 北宜昌 4 4 3 7 0 0 )
摘 要: 为 了更好 地评 价利 用好 中国核 桃 种植 资 源 , 加 强核桃 育种 的基 础 性研 究 5 - - 作, 本 研 究 总结 归纳 了
( J u g l a n s r e g i a L . ) 、 核桃楸( ma n s h . r i c a Ma x i m) 、 野 核 桃( c a t h a y e n s i s Do d e ) 、 泡 核 桃 s l " g i l l a t a Do d e ) 和 麻 核桃 h o p e i e n s i s Hu ) , 全 国广 泛 栽 培 的是核 桃 和泡 核
种质 资源 , 但 由于细 胞学 标记 存在 耗 时费 力 、 非染 色体 变异 性 状难 以检 测 、 基 因的精 细定 位 困难 等缺 点 , 所 以
到目 前 为止 , 可 以供广泛核桃种质资源评价利用的细 胞 学标 记仍 然很 少 。
3 生化 标记
2 0 世纪6 0年 代 产 生 的 蛋 白质 电 泳 技 术 促 进 了
w a l n u t r e s o u r c e s t o s t r e n g t h e n w ln a u t b a s i c r e s e rc a h wo r k . On t h e b a s i s o f s u mma r y , t h e p r o s p e c t o f t h e s e ma rk e r s w a s r e v i e we d . I n o r d e r t o e x p l o r e g e n e t i c ma r k e s r l o c i a n d ll a e l i c v a ia r t i o n a s s o c i a t e d w i t h b r e e d i n g i n c u l t i v a t i o n a n d wi l d wa ln u t p o p u l a t i o n i n C h i n a , i t s u g g e s t e d t h a t a s s o c i a t i n g mu l t i p l e g e n e t i c ma rk e r s s h o u l d b e u s e d i n f u t u r e s t u d y f o r f a s t b r e e d i n g . Ke y wo r d s : g e n e t i c ma r k e r s ; w a l n u t ; g e n e t i c d i v e r s i t y
物原产地之一n ~ 。据统计 , 中国现有实生核桃树 2 亿
多株 , 每 株 树均 为异 花授 粉 所 产 生 的一 个 独特 的基 因 型, 也是 自然杂 交 的杂种 后代 , 这 个庞 大 的实 生种 群 是
自然 留给 人 们 的财 富 , 为 选 择 育 种 提 供 了丰 富 的 资
源 。 早期 的核 桃 良种 选 育 主 要 是 利 用 集 团选 择 法 【 5 】 ,
形 态学标记 、 细胞 学标记、 生化标记和近年来广泛应 用的分子标记在核桃种质 资源评价 中的应用情况 ,
并 在 此基础 上 评述 了这 些标记 的应 用前 景 , 指 出在 以后 的研 究 中应 开展 多种 水 平遗 传标 记 的 关联 分析
研究 , 发掘 中国栽培、 野生群体 中与主要育种相关联的遗传标记位点及其等位 变异, 获取载体材料 , 以便
生 化 标 记 的产 生 和 发 展 。 生 化标 记 是 以基 因 表达 的 蛋 白质 产物 为主 的能够 明确 显示遗 传 多样 性 的一类 遗 传 标记 , 与 形态 学标 记相 比, 它具 有取 样少 、 经济、 可直
ma r k e r s ) 、 生化标 记( b i o c h e mi c a l ma r k e r s ) 和 分 子 标 记
方式之一。 遗传 标记 是 指可 以稳 定遗传 的、 容 易识 别 的、 特殊 的遗 传 多态性表 现 形式 , 主 要 包 括 形 态 学 标 记 ( mo r p h o l o g i c a l ma r k e r s ) 、细 胞 学 标 记 ( c y t o l o g i c a l
O 引 言
桃 】 。近 年 来 , 国 内外 学 者 通 过 对 胡 桃 科 植 物 的地 理 分布 、 相 关 文献 考 证 、 地 质 化 石 分析 、 考 古 出土文 物 鉴 定及孢 粉分 析等 多方 面 确切证 明 中国是世 界 胡桃科 植
核 桃属 植 物 隶 属 胡 桃 科( J u g l a n d a c e a e ) , 是 多 年 生 落 叶果 树 , 在 中国又 名 胡桃 、 羌桃 、 万寿 子 、 长 寿 果等 。 全 世 界 胡 桃 科 植 物 共 有 9属 7 1 种, 在 中 国有 7 属2 7 种 。 原 产 于 中 国 的 核 桃 属 植 物 有 5个 种 , 即 核 桃
・2 ・
中 国农 学通报
h t t p : / / ww w. c a s b . o r g . c n
2 0 世纪 7 0 年代 随着 北 方地 区核 桃 繁殖 技 术 的推广 , 核 桃 育 种 进 入 了无 性 系选 择 育种 阶段 。 众 所 周 知 , 种 质 资源 评 价 是 无性 系育 种 基 础 , 而 利 用 遗 传 标 记 ( g e n e t i c ma r k e r s ) 对 种 质 资源 评 价 是 快 速 有 效 的评 价
S t a t e F o r e s t r y A d m i n i s t r a t i o n , B e i j i n g 1 0 0 0 9 1 ;
2 H u b e i A c a em d y fF o o r e s t r y , Wu h a n 4 3 0 0 7 5 ; 3 X i n g s h a n C o u n t y F o r e s t r y I st n i t  ̄e i n Y i c h a n g C i t y i n H u b e i P r o v i n c e , Y i c h a n g Hu b e i 4 4 3 7 0 0 )
( m o l e c u l r a ma r k e r s ) 4 种类 型[ 7 】 。笔者就这 4 类标记在
核桃 种质 资源 评 价 中的应 用进 展情 况 作述评 。
1形 态 学标记
接反应基因产物差异且受环境影响小等优点。生化标 记 主 要 有 储 藏 蛋 白、 同工 酶 和 等 位 酶 标 记 p 。核 桃 属
实现快速 育 种 的 目的 。
关 键词 : 遗传 标记 ; 核桃 ; 遗 传 多样性
中图分 类号 : ¥ 6 6 4 1 , O 2 1 2
文献标 志码 : A
论 文编 号 : 2 0 1 3 — 2 5 3 3
Th e Ap p l i c a t i o n o f Ge n e i t c Ma r k e r s i n t h e S t u d y o f W a l n u t Ge n e i t c Di v e r s i t y
植 物 中应 用报 道 的 多为 同工 酶 标记 。近 2 O 年来 , 学者 们 已经 筛选 出的用 于亲 缘关 系和 品种 鉴 定 的叶片 同工 酶 有过 氧化 氢 酶( P x) 、 6 一 磷酸 葡糖 糖 酸脱 氢酶 ( 6 P G D) 、 硫辛酰胺脱氢酶( DI A) 、 葡 萄糖 磷 酸 变位 酶( P G M) 、 琥 珀 酸 脱 氢 酶( S DH) 、 苹 果酸 酶( MDH ) 和 甘 露 糖 磷 酸 酶 ( MP I ) 、 淀粉 酶 ( AMY) 、 超 氧 化物 歧 化 酶 ( S OD ) 、 过氧 化 物酶( P 0D ) 2 3 - 2 6 】 , 其 中苹 果 酸 酶 ( MD H) 较有争议 , 有 学 者 认 为 其在 品种 鉴 定方 面 没 有 可用 的变 异[ 2 3 - 2 4 。筛选 出 的花 粉 同工 酶有 苹 果酸 酶 ( MDH) , 6 一 磷 酸葡 糖 糖 酸 脱 氢 酶( 6 P G D) , 且 发 现 同一 品种 花 粉 同工 酶 活 性 高于 叶片口 。除进 行亲 缘关 系 鉴定 外 , 同工酶 还 可 以对核
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