常用生物学软件

分子生物学相关软件： 1. Vector NTI Advance 11，分子生物学的综合软件，什么功能几乎都全了。 2. Primer premier 5，引物设计软件，Primer Premier 6 用的 Java 界面，易用性差了很多。 3. Oligo 7，引物设计软件，设计 Fusion PCR 和 In-Fusion 连接的引物的时候，比 Primer premier 直观一
2. Foxmail 7，上网这多年，注册了很多邮箱，一点 F4，全收，相当方便，加上离线管理等，从 Foxmail 4 一直用到今天。
3. e-Mule，电驴，veryCD 上的东西相当丰富，但可惜学校里面不让下。 4. 卡巴斯基安全部队 2012，杀毒很好，而且关键是更新的很快，占资源也相对较小。
不建议安装的同类软件：瑞星、360、金山，特别是诺顿。
文献管理： 1. EndNote X5，文献管理软件，平时方便论文管理，写文章的时候插入文献也是相当的方便，从 Endnote
5 时代到 X5，越来越强大、越来越好用。 不建议安装的同类软件：Noteexpress。 2. RefViz 2.1，文献分析软件，与 EndNote 结合使用，分析文献，可以省掉一些自己归纳的时间，不过 很久没有更新了，所以建议大家还是 Web of Science 上先分析好了，再分门别类导进 Endnote 里面。
7. 分子量计算器 6.4，一个小软件，输结构式就有分子量，省的现用现查。
不能打印。
图片处理： 1. Adobe Photoshop CS5 Extended，修改图片。 2. Adobe Illustrator CS5，画各种复杂的矢量图，改 PDF、改各种其他软件导出的矢量图(ai、EPS、PDF
等)。 不建议安装的同类软件：Visio、SmartDraw、ConceptDraw。 3. Image-Pro Plus 6.0，对图象进行加工处理并得到数据的软件，相当专业。有 7.01，但好像没有破解。 4. Adobe Dreamweaver CS5，原来是做网页的，但现在大部分时候是用来拆网页得到网页中的各种元件， 或者复制在浏览器中无法复制网页内容时用。 不建议安装的同类软件：Frontpage。 5. ChemSketch 12，画化合物分子结构式的。 6. ACDSee 3.1，反应最快的看图软件了，后面的版本虽然多了很多功能，可是打开速度太慢了，都快赶 上 Photoshop 了，而 ACDSee 即使再怎么增加功能，在可预见的未来，也赶不上 Photoshop。
些。 4. BioEdit 7，杂七杂八的功能凑在一起的一个分子生物学软件，有些罕见的 Vector NTI Advance 没有的
功能。 5. DNAMAN 6，与 Vector NTI 类似的一个软件，但是图型化上做I 差的不是一点点，罕用，但有时候有些序列的格式非得要用它的样子排，没有办法。 6. SimVector 4.2，画质粒的一个软件，效果还行，与 Vector NTI 画出来的风格不一样，有的杂志喜欢； 7. PyMol 1.4.1，蛋白质三维结构查看软件，可以做一些简单的分析。 8. Discovery Studio 2.5，有 3.1 的，但还没有找到破解，有可以下的告诉我一下，非常强大的蛋白质结
构分析软件。 9. ICM Pro：做蛋白质结构和对接的一个软件。 10. RNADraw 1.1，RNA 和 DNA 二级结构的分析软件，可以分析 PCR 和基于小 RNA 代谢工程时的引物二
聚体，比较直观，可惜的是已经 1997 年后就没有再更新了。 11. QuantityOne 4.62，BioRad 凝胶电泳自带的一个软件，但是功能有限制，网上有破解的，可以分析跑
常用软件清单
周景文
日常上网：
2011.12.4
1. Maxthon 2，最好用一个浏览器了，这些年了，一直用的很好，中间换过搜狗、Chrome、QQ 浏览器， 很多浏览器已经都消失了，最后还是一直在用 Mathon 2，Maxthon 3 有点失败。自带的下载模块很好 用，在迅雷、电驴、快车都被屏蔽的今天，这个还是挺好用的。
14. CytoScape 2.8，用来做系统生物学分析的，有很多小插件，可以做各种与网络分析相关的工作，也支 持 SBML。
办公软件： 1. Office 2010 (Word、Excel、PowerPoint)，都得用的非常非常熟。 2. Adobe Acrobat Professional X，阅读、批改、转换、合并、分割 PDF 文件。 3. Adult PDF Password Recovery 3.1，看名字就知道干什么的了，相当强大，加密的 PDF 往往不能取词、
数学软件： 1. OriginPro 8.5，画各种各样的数据图，兼做简单的数据处理。 2. SigmaPlot 12，与 OriginPro 类似，画出来的图风格不大一样，两个学一个就可以了。但是建议还是
学 OriginPro，更新的较快，对于汉字支持更好一点。 3. MatLab 2011b，数学里面的，几乎什么都可以，有很多软件是基于 MatLab 平台的，比如 COBRA、
CellNetAnalyzer 等。
4. SAS 9.3，如果说有什么数据分析是 Excel 所无法完成的，那么推荐用 MatLab；如果觉得 MatLab 分
析出来的结果还不够细，那么，我建议用 SAS。
其它： 1. Adobe Audition 3.0，专业的音频软件，主要用来录音，剪辑、消除特定声音等。 2. Deamon Tools 4.45，打开虚拟光驱文件的软件。
的胶、杂交结果和菌落分析，很好用。 12. GelPro Analyzer 4.5，跑胶和杂交以及菌落的分析软件，好像很久没有更新了，功能和 QuantityOne
有点像，但现在用的越来越少了。以前类似的还有一个 BandScanner，都没有什么特色。这几个软件， 实际上现在连 Photoshop 都可以做这些简单的量化分析，更复杂的建议用 ImagePro。 13. PathwayStudio 10 ， 蛋 白 质 相 互 作 用 、 细 胞 信 号 转 导 和 代 谢 分 析 的 软 件 ， 可 惜 没 有 破 解 ， 从 PathwayStudio 4 的时代就很好用了。
3. Lingoes 2.8，目前为止用的最好的一个翻译软件，美中不足仍然是划线取词和有些软件有冲突，强烈
建议大家把湘雅医学词典装上，如果有可能，把所有的英语词典都装上。 不建议安装的同类软件：金山词霸，医学大词典。 4. Python 2.4，较简单的编程语言编译软件，API 接口多，可以操作 PyMol、Excel、文本文件等，取代 很多需要手工机械操作的活。 5. UltraEdit 17.3，取代记事本的一个强大软件，很多时候会用到，比如把 CNKI 的数据导到 EndNote， 有些软件的 16 进制下的 P-J。 6. UltroISO 9.5，做 ISO 和打开 ISO 的软件，通常用它来做 ISO 或是修改，WinRAR 可以打开 ISO，但 是没有办法改动。