生物化学第十一章核酸降解与核苷酸生物合成
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1. 嘌呤核苷酸的合成特点是首先直接形成次黄嘌 呤核苷酸,然后才能转变成为其他的嘌呤核苷 酸,而不是先形成游离的嘌呤,再生成核苷酸; 2. PRPP是核苷酸中磷酸核糖部分的供体; 3. 嘌呤的各原子是在PRPP的C-1位置上逐个加上 去的,关键步骤是PRPP和谷氨酰胺形成5-磷酸 核糖胺; 4. 由不同的化合物提供不同的原子,最终形成次 黄嘌呤核苷酸。
核酸酶的种类
• 核酸是由核苷酸组成的,而核酸酶的作用就是打 开核酸的磷酸二酯键,水解核酸成为核苷酸或者 寡核苷酸片断。 • 核酸酶的分类是根据对核酸作用的主要特性进行 分类的,分别是: 1. 对底物的专一性:作用于DNA还是RNA,分为核 糖核酸酶、脱氧核糖核酸酶和非特异性核酸酶 2. 作用方式:是作用于核酸内部还是核酸的两端, 分为核酸内切酶、核酸外切酶和限制性内切酶等 等。 3. 磷酸二酯键的打开方式分:水解3’-OH或者5’-OH。
脱氧核糖核苷酸的生物合成
2. 脱氧胸腺嘧啶核苷酸的形成有2个途径: ① 以dUMP为原料形成dTMP,同时伴随着 叶酸的生成。
② 由胸腺嘧啶通过胸苷磷酸化酶生成胸苷, 再生成dTMP。
单核苷酸与多磷酸核苷酸的转化
• UMP+ATP→→UDP+ADP • AMP+ATP →→2ADP • 以上的反应都是在酶的作用下进行的,在 生物的能量供给和转移的过程中起到重要 的作用。
嘧啶的补救合成途径
• • • • 尿嘧啶 + PRPP←→尿苷-5’-磷酸 + PPi 尿苷 + ATP+Mg2+→尿苷-5’-磷酸 + ADP 胞嘧啶核苷+ATP→胞嘧啶核苷酸+ADP 以上是嘧啶的补救合成途径。
脱氧核糖核苷酸的生物合成
1. 主要是由核糖核苷酸的还原生成的,腺嘌 呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶都可以还原 成相应的脱氧核糖核苷酸;当然需要其中 的酶系参与,下图显示了整个过程。
限制性内切酶
• 存在于细菌中,特异性非常高,主要的生 物学功能是降解从外面侵入细胞的DNA, 但不降解自身的DNA。 • 限制性内切酶有自己特异的酶切位点。 • 限制性内切酶有自己的命名方式,很特殊。 • 部分限制性内切酶的酶切位点
部分限制性内切酶的酶切位点
酶名称 EcoRⅠ BamHⅠ HindⅡ HindⅢ HapⅡ 来 源 识别位点 -N-C-T-T-A-A↓G-N-5′5′NG↑A-A-T-T-C-N-N-C-C-T-A-G↓G-N-5′5′NG↑G-A-T-C-C-N-C-A-Pu↓Py-T-G-5′5′G-TPy↑Pu-A-C-T-T-C-G-A↓A-5′5′A↑A-GC-T-TN-G-G-C↓C-N-5′5′N-C↑CG-G-NEcoRⅠ Bacillus Hemophilus Hemophilus Hemophilus
第四节
小
结
1. 降解核酸的不同酶 2. 核苷酸的从头合成过程的要点(包括嘌呤 和嘧啶) 3. 嘌呤和嘧啶环中的原子来源 4. 补救途径的意义
பைடு நூலகம்
嘌呤的降解
• 不同生物内的嘌呤碱的降解酶系不同,所 以代谢产物不同,代谢途径也不尽相同。 1. 腺嘌呤→次黄嘌呤→(鸟嘌呤→ )黄嘌 呤→尿酸→尿囊素→尿囊酸→尿素 →NH3+CO2 不同的生物代谢产物不同。 2. 嘌呤的降解过程还可以在核酸或者核苷酸 水平上进行。 3. 图解
图
解
嘧啶的降解
• 不同生物的嘧啶分解过程不尽相同,降解 过程如下:
第三节
核苷酸的生物合成
一.核苷酸的生物合成途径 二.核糖核苷酸的生物合成 三.脱氧核糖核苷酸的生物合成 四.单核苷酸与多磷酸核苷酸的转化
核苷酸的生物合成途径
1. 核苷酸的从头合成:由氨基酸、磷酸戊糖、 二氧化碳和氨等小分子化合物合成核苷酸。 2. 补救合成途径:由核苷和碱基直接合成核 苷酸。 3. 通常情况下,核苷酸的合成都是启用第一 途径,如果受阻,就启动第二途径。
嘧啶核苷酸的形成
嘧啶的从头合成途径 嘧啶的补救合成途径
嘧啶的从头合成途径
1. 嘧啶环中原子的来源 2. 嘧啶从头合成的图示 3. 嘧啶从头合成的要点
嘧啶环中原子的来源
嘧啶从头合成的图示
嘧啶从头合成的要点
1. 嘧啶核苷酸的合成先组装嘧啶环,然后与 磷酸核糖结合,与嘌呤核苷酸生成恰好相 反; 2. 天冬氨酸和氨甲酰磷酸反应,脱水成环, 脱氢成乳清酸; 3. PRPP依旧提供磷酸核糖,与乳清酸形成 尿苷酸; 4. 胞嘧啶核苷酸在尿嘧啶三磷酸基础上形成 的。
核糖核苷酸的生物合成
1. 嘌呤核苷酸的形成 2. 嘧啶核苷酸的形成
嘌呤核苷酸的形成
· · a. b. · · 嘌呤核苷酸中元素的来源 从头合成过程: IMP的合成 AMP、GMP的合成 补救合成途径 嘌呤核苷酸合成的要点
IMP的合成
AMP、GMP的合成
嘌呤核苷酸中元素的来源
补救合成途径
嘌呤核苷酸合成的要点
第十章 核酸降解与核苷酸生物合 成
第一节 第二节 第三节 第四节 核酸的降解 核苷酸的降解 核苷酸的生物合成 小 结
第一节
一.概述 二.核酸酶的种类
核酸的降解
概
•
1. 2. 3. 4. 5. 6.
述
核酸酶促降解产物核苷酸及其衍生物,在代谢 上非常重要: 核苷酸是核酸生物合成的前体; 某些核苷酸及其衍生物是很多生物合成过程中 的重要中间物,比如UDPG等等; 腺苷酸是生物体中重要的辅因子,比如NAD+、 FAD等等; 某些核苷酸是重要的中间代谢调节物质,如 cAMP 等等; 肌苷酸和鸟苷酸是强力的助鲜剂; ATP是生物能量代谢中通用的高能化合物。
第二节
一.核苷酸的降解 二.嘌呤的降解 三.嘧啶的降解
核苷酸的降解
核苷酸的降解
• 核苷酸水解掉磷酸基就就会变成核苷,生 物体内广泛存在的磷酸单酯酶和核苷酸酶 可以催化这个反应。 • 核苷酸+水+核苷酸酶→ → →核苷+磷酸 • 核苷在核苷酶的作用下继续分解: 1. 核苷+磷酸(核苷磷酸化酶)←→碱基+戊 糖-1-磷酸; 2. 核苷+水*(核苷水解酶)→ → →碱基+戊 糖
核酸酶的种类
• 核酸是由核苷酸组成的,而核酸酶的作用就是打 开核酸的磷酸二酯键,水解核酸成为核苷酸或者 寡核苷酸片断。 • 核酸酶的分类是根据对核酸作用的主要特性进行 分类的,分别是: 1. 对底物的专一性:作用于DNA还是RNA,分为核 糖核酸酶、脱氧核糖核酸酶和非特异性核酸酶 2. 作用方式:是作用于核酸内部还是核酸的两端, 分为核酸内切酶、核酸外切酶和限制性内切酶等 等。 3. 磷酸二酯键的打开方式分:水解3’-OH或者5’-OH。
脱氧核糖核苷酸的生物合成
2. 脱氧胸腺嘧啶核苷酸的形成有2个途径: ① 以dUMP为原料形成dTMP,同时伴随着 叶酸的生成。
② 由胸腺嘧啶通过胸苷磷酸化酶生成胸苷, 再生成dTMP。
单核苷酸与多磷酸核苷酸的转化
• UMP+ATP→→UDP+ADP • AMP+ATP →→2ADP • 以上的反应都是在酶的作用下进行的,在 生物的能量供给和转移的过程中起到重要 的作用。
嘧啶的补救合成途径
• • • • 尿嘧啶 + PRPP←→尿苷-5’-磷酸 + PPi 尿苷 + ATP+Mg2+→尿苷-5’-磷酸 + ADP 胞嘧啶核苷+ATP→胞嘧啶核苷酸+ADP 以上是嘧啶的补救合成途径。
脱氧核糖核苷酸的生物合成
1. 主要是由核糖核苷酸的还原生成的,腺嘌 呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶都可以还原 成相应的脱氧核糖核苷酸;当然需要其中 的酶系参与,下图显示了整个过程。
限制性内切酶
• 存在于细菌中,特异性非常高,主要的生 物学功能是降解从外面侵入细胞的DNA, 但不降解自身的DNA。 • 限制性内切酶有自己特异的酶切位点。 • 限制性内切酶有自己的命名方式,很特殊。 • 部分限制性内切酶的酶切位点
部分限制性内切酶的酶切位点
酶名称 EcoRⅠ BamHⅠ HindⅡ HindⅢ HapⅡ 来 源 识别位点 -N-C-T-T-A-A↓G-N-5′5′NG↑A-A-T-T-C-N-N-C-C-T-A-G↓G-N-5′5′NG↑G-A-T-C-C-N-C-A-Pu↓Py-T-G-5′5′G-TPy↑Pu-A-C-T-T-C-G-A↓A-5′5′A↑A-GC-T-TN-G-G-C↓C-N-5′5′N-C↑CG-G-NEcoRⅠ Bacillus Hemophilus Hemophilus Hemophilus
第四节
小
结
1. 降解核酸的不同酶 2. 核苷酸的从头合成过程的要点(包括嘌呤 和嘧啶) 3. 嘌呤和嘧啶环中的原子来源 4. 补救途径的意义
பைடு நூலகம்
嘌呤的降解
• 不同生物内的嘌呤碱的降解酶系不同,所 以代谢产物不同,代谢途径也不尽相同。 1. 腺嘌呤→次黄嘌呤→(鸟嘌呤→ )黄嘌 呤→尿酸→尿囊素→尿囊酸→尿素 →NH3+CO2 不同的生物代谢产物不同。 2. 嘌呤的降解过程还可以在核酸或者核苷酸 水平上进行。 3. 图解
图
解
嘧啶的降解
• 不同生物的嘧啶分解过程不尽相同,降解 过程如下:
第三节
核苷酸的生物合成
一.核苷酸的生物合成途径 二.核糖核苷酸的生物合成 三.脱氧核糖核苷酸的生物合成 四.单核苷酸与多磷酸核苷酸的转化
核苷酸的生物合成途径
1. 核苷酸的从头合成:由氨基酸、磷酸戊糖、 二氧化碳和氨等小分子化合物合成核苷酸。 2. 补救合成途径:由核苷和碱基直接合成核 苷酸。 3. 通常情况下,核苷酸的合成都是启用第一 途径,如果受阻,就启动第二途径。
嘧啶核苷酸的形成
嘧啶的从头合成途径 嘧啶的补救合成途径
嘧啶的从头合成途径
1. 嘧啶环中原子的来源 2. 嘧啶从头合成的图示 3. 嘧啶从头合成的要点
嘧啶环中原子的来源
嘧啶从头合成的图示
嘧啶从头合成的要点
1. 嘧啶核苷酸的合成先组装嘧啶环,然后与 磷酸核糖结合,与嘌呤核苷酸生成恰好相 反; 2. 天冬氨酸和氨甲酰磷酸反应,脱水成环, 脱氢成乳清酸; 3. PRPP依旧提供磷酸核糖,与乳清酸形成 尿苷酸; 4. 胞嘧啶核苷酸在尿嘧啶三磷酸基础上形成 的。
核糖核苷酸的生物合成
1. 嘌呤核苷酸的形成 2. 嘧啶核苷酸的形成
嘌呤核苷酸的形成
· · a. b. · · 嘌呤核苷酸中元素的来源 从头合成过程: IMP的合成 AMP、GMP的合成 补救合成途径 嘌呤核苷酸合成的要点
IMP的合成
AMP、GMP的合成
嘌呤核苷酸中元素的来源
补救合成途径
嘌呤核苷酸合成的要点
第十章 核酸降解与核苷酸生物合 成
第一节 第二节 第三节 第四节 核酸的降解 核苷酸的降解 核苷酸的生物合成 小 结
第一节
一.概述 二.核酸酶的种类
核酸的降解
概
•
1. 2. 3. 4. 5. 6.
述
核酸酶促降解产物核苷酸及其衍生物,在代谢 上非常重要: 核苷酸是核酸生物合成的前体; 某些核苷酸及其衍生物是很多生物合成过程中 的重要中间物,比如UDPG等等; 腺苷酸是生物体中重要的辅因子,比如NAD+、 FAD等等; 某些核苷酸是重要的中间代谢调节物质,如 cAMP 等等; 肌苷酸和鸟苷酸是强力的助鲜剂; ATP是生物能量代谢中通用的高能化合物。
第二节
一.核苷酸的降解 二.嘌呤的降解 三.嘧啶的降解
核苷酸的降解
核苷酸的降解
• 核苷酸水解掉磷酸基就就会变成核苷,生 物体内广泛存在的磷酸单酯酶和核苷酸酶 可以催化这个反应。 • 核苷酸+水+核苷酸酶→ → →核苷+磷酸 • 核苷在核苷酶的作用下继续分解: 1. 核苷+磷酸(核苷磷酸化酶)←→碱基+戊 糖-1-磷酸; 2. 核苷+水*(核苷水解酶)→ → →碱基+戊 糖