转录因子
转录因子数据集
矿产资源开发利用方案编写内容要求及审查大纲
矿产资源开发利用方案编写内容要求及《矿产资源开发利用方案》审查大纲一、概述
㈠矿区位置、隶属关系和企业性质。
如为改扩建矿山, 应说明矿山现状、
特点及存在的主要问题。
㈡编制依据
(1简述项目前期工作进展情况及与有关方面对项目的意向性协议情况。
(2 列出开发利用方案编制所依据的主要基础性资料的名称。
如经储量管理部门认定的矿区地质勘探报告、选矿试验报告、加工利用试验报告、工程地质初评资料、矿区水文资料和供水资料等。
对改、扩建矿山应有生产实际资料, 如矿山总平面现状图、矿床开拓系统图、采场现状图和主要采选设备清单等。
二、矿产品需求现状和预测
㈠该矿产在国内需求情况和市场供应情况
1、矿产品现状及加工利用趋向。
2、国内近、远期的需求量及主要销向预测。
㈡产品价格分析
1、国内矿产品价格现状。
2、矿产品价格稳定性及变化趋势。
三、矿产资源概况
㈠矿区总体概况
1、矿区总体规划情况。
2、矿区矿产资源概况。
3、该设计与矿区总体开发的关系。
㈡该设计项目的资源概况
1、矿床地质及构造特征。
2、矿床开采技术条件及水文地质条件。
转录因子
转录因子基因转录有正调控和负调控之分。
如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时，基因不表达；而从靶基因上去除阻遏蛋白后，RNA聚合酶识别受调控基因的启动子，使基因得以表达，这是正调控。
这种阻遏蛋白是反式作用因子。
而顺式作用因子则指的是基因上与反式作用因子结合的对基因表达起调控作用的基因序列。
转录因子(transcription factor)是起正调控作用的反式作用因子。
转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。
真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态，RNA聚合酶自身无法启动基因转录，只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后，基因才开始表达。
转录因子的结合位点（transcription factor binding site，TFBS）是转录因子调节基因表达时，与mRNA结合的区域。
按照常识，转录因子（transcription factor，TF）的结合位点一般应该分布在基因的前端，但是，新的研究发现，人21和22号染色体上，只有22％的转录因子结合位点分布在蛋白编码基因的5'端。
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。
一种蛋白质是不是转录机构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所必须的。
一般可将这些转录所需的蛋白质分为三大类：(1)RNA聚合酶的亚基，它们是转录必须的，但并不对某一启动子有特异性。
(2)某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复合物，但不组成游离聚合酶的成分。
这些因子可能是所有启动子起始转录所必须的。
但亦可能仅是譬如说转录终止所必须的。
但是，在这一类因子中，要严格区分开哪些是R NA聚合酶的亚基，哪些仅是辅助因子，是很困难的。
(3)某些转录因子仅与其靶启动子中的特异顺序结合。
如果这些顺序存在于启动子中，则这些顺序因子是一般转录机构的一部分。
如果这些顺序仅存在于某些种类的启动子中，则识别这些顺序的因子也只是在这些特异启动子上起始转录必须的。
转录因子的名词解释
转录因子的名词解释
转录因子 (Transcription factor) 是一种蛋白质，能够与 DNA 模板上特定的序列结合，并调节基因表达。
在细胞内，转录因子通常是通过识别并结合到基因的启动子上来实现这一功能的。
转录因子可以分为多种类型，每种类型都针对特定的基因序列或调控区域。
例如，有些转录因子可以结合到基因的启动子上，促进基因的表达;而有些转录因子则可以结合到基因的终止子上，抑制基因的表达。
转录因子在基因调控中扮演着重要的角色，可以影响基因的表达水平、表达时间和表达模式。
转录因子的异常表达可能会导致细胞恶性转化和肿瘤的发生。
因此，转录因子已成为医学研究的热点之一。
在细胞生物学和分子生物学的研究中，转录因子是一个非常重要的概念。
对于理解基因调控机制、细胞信号传导途径以及细胞生物学过程都有着重要的意义。
转录因子的结构特点
转录因子的结构特点
转录因子是一类特殊的蛋白质分子，它具有以下结构特点：
1. DNA结合结构：转录因子通常含有DNA结合结构域，使其能够与
DNA分子特定的序列结合。
这种结构域通常是通过螺旋形成的α-螺旋，能够与基因组DNA上的特定序列相互作用。
2. 转录激活结构域：许多转录因子含有转录激活结构域，能够与其他
蛋白质结合，并促进基因的转录过程。
这些结构域通常包括活化功能
区域，如酶活性区域、蛋白激酶结构域等。
3. 蛋白交互结构域：转录因子也包含与其他蛋白质相互作用的结构域，这些结构域能够使转录因子与其他调控蛋白质相结合，形成蛋白质复
合物，从而影响基因的表达。
4. 转录因子亚基：有些转录因子是由多个亚基组成的。
亚基之间通过
相互作用结合形成功能完整的蛋白质，这些亚基在传递信号、增强蛋
白稳定性、提高DNA结合能力等方面发挥重要作用。
总的来说，转录因子具有特定的DNA结合结构域、转录激活结构域、
蛋白交互结构域以及可能的多亚基组成等特点，这些特点使其能够参
与基因的转录调控，从而影响生物体的发育和适应性。
转录因子研究方法
转录因子研究方法转录因子（transcription factor）是一类能够结合到特定DNA序列上，调控基因转录的蛋白质。
研究转录因子可以帮助我们理解基因表达调控的机制以及其在生物学中的重要作用。
下面将介绍一些研究转录因子的常用方法。
1. DNA 亲和层析法（DNA affinity chromatography）DNA亲和层析法是一种常用的转录因子鉴定方法。
首先，需要合成一段包含感兴趣DNA序列的亲和标签。
然后将这些亲和标签与细胞核提取物混合，在水合胶柱中进行层析分离。
之后，通过洗脱和免疫印迹等方法可以鉴定特定转录因子与该DNA序列的结合。
2. 电泳迁移移位分析（Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA）EMSA是一种在体外研究转录因子结合DNA的常用方法。
该方法可以检测转录因子与DNA结合形成复合物后形成的新的电泳迁移带。
首先，需要纯化转录因子或使用细胞核提取物。
然后，将DNA序列与荧光标记等进行标记，并将其与转录因子混合。
之后，通过电泳迁移实验，观察复合物的电泳迁移带的变化，以判断转录因子是否与DNA结合。
3. 转录激活试验（Luciferase reporter assay）转录激活试验常用于研究转录因子对基因转录的调控作用。
该方法利用目标基因启动子区域的增强子或顺式作用元件（cis-acting elements），将其与荧光素酶（luciferase）等标记基因连在一起构建报告基因检测系统。
然后将转录因子与转染载体一起转染到细胞中，并测量荧光素酶的活性。
通过荧光素酶活性的变化，可以判断转录因子对基因转录的调控作用。
4. 冷凝点及位点测序（ChIP-seq）冷凝点及位点测序（chromatin immunoprecipitation followed by sequencing，ChIP-seq）是一种高通量测序方法，用于研究转录因子结合DNA 上的特定位点。
转录因子研究
转录因子研究转录因子是一类调控基因表达的蛋白质，通过与DNA序列特定的结合位点结合来调控基因的转录过程。
转录因子在细胞发育、生长、分化、应激应答等过程中发挥重要的调控作用，对于维持生命的正常状态至关重要。
研究转录因子的一种方法是通过克隆、纯化和鉴定转录因子蛋白。
首先，研究人员需要从细胞中提取转录因子蛋白或者通过转录因子基因的克隆获得转录因子蛋白。
然后，研究人员可以使用蛋白质纯化技术，如亲和层析、离子交换层析和凝胶过滤等方法，纯化目标转录因子蛋白。
最后，通过质谱分析等技术对纯化的蛋白进行鉴定，确定其分子量和氨基酸序列。
除了研究转录因子蛋白本身，还可以研究转录因子的结合位点和作用机制。
研究人员可以使用DNA比对和足迹分析等方法，确定转录因子的结合位点，并进一步验证这些位点的功能。
同时，也可以通过转录组学技术，如RNA序列和ChIP-seq等，全面了解转录因子对基因的调控网络。
此外，还可以通过研究转录因子与其他调控因子的相互作用，揭示其在复杂的细胞调控网络中的作用机制。
例如，可以通过蛋白质相互作用实验，酵母双杂交等技术，鉴定转录因子与其他蛋白质的相互作用。
同时，研究人员也可以利用生物信息学分析工具，预测转录因子与其他调控因子在调控网络中的相互作用。
最后，研究转录因子的功能也可以通过生成转录因子基因敲除或过表达的转基因模型来进行。
这些模型可以用来研究转录因子在发育过程中的作用，以及转录因子突变对细胞功能的影响。
总之，研究转录因子需要采用多种方法，包括基础的分子生物学和生物化学实验，以及计算生物学和生物信息学分析。
这些研究可以帮助我们更好地理解转录因子在基因调控网络中的作用，从而揭示生命的复杂性。
转录因子
反式作用因子
[英文] transacting factors
[解释] 指参与真核生物转录调控的蛋白质因子，有激活蛋白和阻遏蛋白两类。可与DNA、转录酶、通用转录因子或其它反式作用因子相互作用，以促进或阻遏转录。
转录因子
[英文] transcription factor
抑癌基因
[英文] t基因。抑制肿瘤发生的基因，它们的丢失、突变或失去功能，使激活的癌基因发挥作用而致癌。抑癌基因的产物是抑制细胞增殖，促进细胞分化，和抑制细胞迁移，因此起负调控作用，抑癌基因的突变是隐性的。主要包括（表14-2）：①转录调节因子，如Rb、p53，②负调控转录因子，如WT，③周期蛋白依赖性激酶抑制因子（CKI），如p15、p16、p21，④信号通路的抑制因子，如ras GTP酶活化蛋白（NF-1），磷脂酶（PTEN）；⑤ DNA修复因子，如BRCA1、BRCA2，
原癌基因
[英文] proto-oncogene
[解释] 是细胞内与细胞增殖相关的基因，是维持机体正常生命活动所必须的，在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异，基因产物增多或活性增强时，使细胞过度增殖，从而形成肿瘤。原癌基因的产物主要包括：①生长因子，如sis，②生长因子受体，如fms、erbB，③蛋白激酶及其它信号转导组分，如src、ras、raf，④细胞周期蛋白，如bcl-1，⑤细胞凋亡调控因子，如bcl-2，⑥转录因子，如myc、fos、jun。
[解释] 以反式作用影响转录的因子可统称为转录因子。参见：transacting factors
人类视网膜细胞瘤基因
[英文] Rb
[解释] 是第一个被克隆的抑癌基因。Rb的突变导致视网膜瘤。在G1期Rb与E2F结合，抑制E2F的活性，在G1/S期Rb被CDK2磷酸化失活而释放出转录因子E2F，促进蛋白质的合成。
转录因子转录激活原理
转录因子转录激活原理转录因子是一类可以调控基因表达的蛋白质，它们在细胞内起着关键的作用。
转录因子通过与DNA结合，调控基因的转录过程，从而影响细胞的功能和特性。
转录因子转录激活的原理包括多种机制，如招募共激活因子、改变染色质结构和调节转录机器的组装等。
转录因子的转录激活主要通过招募共激活因子来实现。
共激活因子是一类与转录因子相互作用的蛋白质，它们通过与转录因子结合，增强转录因子的转录活性。
共激活因子可以通过多种方式增强转录因子的活性，例如改变染色质结构、促进转录机器的组装等。
转录因子和共激活因子的相互作用可以形成一个复合物，该复合物能够结合到基因的启动子区域，从而激活基因的转录。
除了招募共激活因子，转录因子还可以通过改变染色质结构来实现转录激活。
染色质是细胞核内DNA和蛋白质的复合物，它的结构可以影响基因的表达。
转录因子可以通过与染色质结合，改变染色质的结构，使基因的启动子区域更加容易被转录机器访问，从而增强基因的转录活性。
转录因子还可以调节转录机器的组装，进一步影响基因的转录。
转录机器是由多个蛋白质组成的复合物，它们协同工作，完成基因的转录过程。
转录因子可以与转录机器中的蛋白质相互作用，促进转录机器的组装，从而增强基因的转录活性。
总的来说，转录因子转录激活的原理涉及多个层面的调控机制。
转录因子通过招募共激活因子、改变染色质结构和调节转录机器的组装等方式，调控基因的转录过程，从而实现基因的转录激活。
这些机制相互作用，共同调控基因的表达，对于细胞的功能和特性具有重要的影响。
转录因子转录激活的原理不仅在基础研究中起着重要作用，也对于人类疾病的研究有着重要意义。
许多疾病的发生和发展与基因的异常表达密切相关，而转录因子的异常调控往往是导致基因异常表达的重要原因之一。
因此，深入理解转录因子转录激活的原理，有助于揭示疾病的发生机制，为疾病的诊断和治疗提供新的思路和方法。
转录因子通过招募共激活因子、改变染色质结构和调节转录机器的组装等机制，实现基因的转录激活。
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转录因子
转录因子是细胞的蛋白质哨兵，它决定DNA 中众多基因中的某些特定基因在给定的时间内转录为mRNA 。
细菌里面含有200~300种转录因子，而动物细胞包约含1000种。
通过使DNA 和基本转录装置联系起来，转录因子决定了细胞的蛋白质结构。
作为初级控制者，它们在细胞内浓度很低。
其浓度很大程度上取决于具体的蛋白质、细胞类型和环境因素，根据经验法则，它的在浓度在n 摩尔(nM)浓度范围，细菌的每个细胞有1~1000个转录因子，在哺乳动物细胞中约有3610~10个。
通常，低浓度转录因子只控制少数基因，高浓度的则相反。
转录因子激活DNA 转录 拓展：在分子生物学中，转录因子（Transcription factor ）是指能够结合在某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质，这些蛋白质能调控其基因的转录。
转录因子可以调控核糖核酸聚合酶（RNA 聚合酶，或叫RNA 合成酶）与DNA 模板的结合。
转录因子一般有不同的功能区域，如DNA 结合结构域与效应结构域。
转录因子不单与基因上游的启动子区域结合，也可以和其它转录因子形成转录因子复合体来影响基因的转录。
转录因子的调节是一个十分复杂的过程, 因为它取决于很多因素，其中最明显的是其他的DNA 结合蛋白(包括转录因RNA 聚合酶
转因录
子
子等)以及局部的染色体结构. 早期的体外实验认为DNA序列决定转录因子的装配顺序，但愈来愈多的证据显示转录的激活取决于大量的转录因子的相互作用。
目前表观遗传学似乎对转录激活也扮演重要角色。
通常每个细胞只含大约10个四聚体，大多数转录因子有相似或者更高的浓度为每nM几十个或上百个。
有趣的是，DNA非特定的吸引力使90%的乳糖抑制体被吸附在DNA周围，只有少数的溶解在细胞质内。
这引发了一个重要的问题：与如此少量的随机波动是如何被生物细胞控制的？例如，如果这些转录因子是完全随机的，在细胞分裂时，如此少量的的转录因子可能使某些子细胞完全不含转录因子。
更多的的努力被投向了一直以来研究最多的蛋白质，如p53 ——一种出现在近50%的癌症中的转录因子。
正如其他许多蛋白质一样，它的名字起源于它的最初表征凝胶，p53蛋白的分子量为53kDa。
现在我们已经知道它的质量为43.7kDa，它缓慢的移动速度是笨重的脯氨酸残基造成的，但它的名字p53还是保留了下来。
这些转录因子促使细胞程序性死亡来防止其继续增殖，抑制肿瘤的生长。
它有自己的特征浓度约100 nM。
转录因子通过与来自受体信号相互作用，来改变它们与DNA的结合属性，从而调整转录信息。
癌细胞中DNA的变异改变p53与它控制的下游基因的结合属性，从而阻止细胞死亡，导致细胞不可控增殖。
肿瘤蛋白p53——P53与DNA结合
（扩展：p53为肿瘤抑制蛋白（也称为p53蛋白或p53肿瘤蛋白），属于最早发现的肿瘤抑制基因（或抑癌基因）之一。
p53蛋白能调节细胞周期和避免细胞癌变发生。
因此，p53蛋白被称为基因组守护者。
p53蛋白借由许多不同的压力形式而激发其活性，其中包括但不仅仅局限于DNA损伤(包括UV, IR或化学物质如过氧化氢(hydrogen peroxide)所造成的损伤)，氧化压力(oxidative stress)，渗透压力(osmotic stress)，核糖核苷酸缺乏(nucleotide depletion) 和丧失调节癌基因表现能力。
这些活性激发可由两个主要的事件得出。
首先，在受到压力的细胞中，p53蛋白的半衰期(half-life) 会突然的增加，造成p53蛋白在细胞中的累积。
再来则是构型变化(conformational change) 使得p53蛋白被激发成为转录调节因子(transcription regulator)。
）
转录因子的数目和浓度能告诉我们什么呢？它对于我们分析转录因子分离的趋势、分析与DNA非特定连接和估计触发转录程序的响应时间有重要意义。