分子生物学-转录因子
分子生物学名词解释
分子生物学：从广义来讲，分子生物学是从分子水平阐明生命现象和生物学规律的一门新兴的边缘学科。
它主要对蛋白质及核酸等生物大分子结构和功能以及遗传信息的传递过程进行研究。
DNA重组技术:DNA重组技术（又称基因工程）是将DNA片段或基因在体外经人工剪接后，按照人们的设计与克隆用载体定向连接起来，转入特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达，产生影响受体细胞的新的遗传性状。
信号转导:是指外部信号通过细胞膜上的受体蛋白传到细胞内部，并激发诸如离子通透性、细胞形状或其它细胞功能方面的应答过程。
转录因子:是指一群能与基因5′端上游特定序列专一结合，从而保证目的基因以特定强度在特定时间和空间表达的蛋白质分子。
功能基因组：又称后基因组，是在基因组计划的基础上建立起来的，它主要研究基因及其所编码蛋白质的结构和功能，指导人们充分准确地利用这些基因的产物。
结构分子生物学:就是研究生物大分子特定空间结构及结构的运动变化与其生物学功能关系的科学。
生物信息学：是生物科学和信息科学重大交叉的前沿学科，它依靠计算机对所获得数据进行快速高效计算、统计分类以及生物大分子结构功能的预测。
染色体：是指存在于细胞核中的棒状可染色结构，由染色质构成。
染色质是由DNA、RNA和蛋白质形成的复合体。
染色体是一种动态结构，在细胞周期的不同阶段明显不同。
C-值（C-value）:一种生物单位体基因组DNA的总量。
C-值矛盾（C-value paradox）：基因组大小与机体的遗传复杂性缺乏相关性。
核心DNA（core DNA）：结合在核心颗粒而不被降解的DNA。
连接DNA（linker DNA）：重复单位中除核心DNA以外的其它DNA。
DNA多态性：指DNA序列中发生变异而导致的个体间核苷酸序列的差异，主要包括单核苷酸多态性和串联重复序列多态性两类。
DNA的一级结构：是指4种核苷酸的排列顺序，表示了该DNA分子的化学组成。
又由于4种核苷酸的差异仅仅是碱基的不同，因此又是指碱基的排列顺序。
《现代分子生物学》第五章 1 转录
表 12-1 E.coli RNA Pol 的结构和功能 亚基 基因 分子量 数目 组分 可能的功能 （KDa） α rpoA 40 2 核心酶 酶 组 装 及 与 调 节 蛋白作用 β rpoB 155 1 核心酶 和底物（核苷酸） 结合 β ’ rpoC 160 1 核心酶 模板结合 ω 10 1 核心酶 σ rpoD 70 1 σ 因子 和启动子结合， 识 别模板链 参照 B. Lewin:《GENES》Ⅴ.1994, Table 14.1 14.2
转录过程中，DNA双链中的一条链为模板链 （template/antisense strand ），而另一条链为 编码链（coding/sense strand）。
转录起始于RNA聚合酶和启动子(promoter) 结合之后，转录起始的第一个碱基称为转录 起始点(start point) 。在RNA聚合酶的作用下 合成RNA，至终止子(terminator)终止。 由启动子到终止子之间的序列称为转录单位 (transcription unit)。转录起始点前面的序列 称为上游(upstream)，后面的序列称为下游 (downstream)。
亚基可能参与全酶的组装及全酶识别启 动子。另外， 亚基还参与RNA聚合酶与 一些转录调控因子间的作用。 亚基具有与底物（NTP及新生的RNA链） 结合的能力。利福霉素可以阻断转录的起 始，链霉溶菌素可抑制延伸反应，二者均 是通过与亚基的结合而发挥作用的。
’亚基可能与模板结合。 肝素可与’亚基结合而抑制转录，并且可 以和’亚基竞争DNA的结合位点。 亚基和’亚基提供了RNA聚合酶的活性 中心，其一级结构与真核生物RNA聚合酶 大亚基有同源性。 亚基的功能是帮助全酶识别启动子并与之 结合。 亚基也可被看作一种辅助因子，因 此又可称为因子（ Sigma factor）。
名词解释-分子生物学
1、转录（Transcription）：以某一DNA链为模板，按照碱基互补原则形成一条新的RNA链的过程，是基因表达的第一步。
2、编码链：与mRNA 有相同序列的DNA 链3、下游：沿着表达方向的序列。
例如，编码区是在起始区的下游。
4、上游：转录起点之前的序列，例如，细菌启动子在转录单位的上游，起始密码在编码区上游。
5、启动子：结合RNA 聚合酶并起始转录的DNA 区域。
6、RNA聚合酶：使用DNA作为模板合成RNA的酶(正式应为DNA-依赖性RNA 聚合酶)7、终止子：是给予RNA聚合酶转录终止信号的DNA序列。
DNA分子中终止转录的核苷酸序列。
8、转录单位：指RNA聚合酶起始位点和终止位点间的距离，可能包括不止一个基因。
9、初级转录本：与一个转录单位相对应的未修饰的RNA 产物。
10、组成型表达constitutive expression：个体发育的任一阶段，在所有细胞中都持续进行的表达。
一般是生命过程必需的基因。
11、负调控：在没有任何调节蛋白或其失活的情况下，基因表达；存在repressor的时候基因表达受阻。
12、正调控：在没有任何调节蛋白或其失活的情况下，基因关闭；存在activator的时候基因表达开启。
一般原核生物偏向负调控，原核生物的DNA裸露无保护，很容易启动转录，并翻译。
因此其细胞内的基因可以说是基本全部默认开启，因此在正常情况下原核细胞内存在大量不同的reressor阻遏着大量基因的转录。
细胞必须根据不同的条件，对一些被阻遏的基因进行去阻遏的调控，或对一些基因的表达进行阻止。
13、顺式作用元件cis-acting element DNA分子上的一些与基因转录调控相关的特定序列。
14、反式作用因子trans-acting factor一些与基因表达调控有关的蛋白因子。
15、顺式调控cis-acting regulation 一段非编码DNA序列对基因转录的调控作用，顺式正调控（启动子、增强子）；顺式负调控（沉默子）16、反式调控trans-acting regulation 转录因子作用于顺式作用元件对基因转录的调控。
分子生物学转录知识点总结
分子生物学转录知识点总结一、转录的过程在转录过程中，DNA的一部分被复制成RNA。
转录包括几个步骤：启动、延伸和终止。
启动是指RNA聚合酶结合到DNA的启动子上，并开始合成RNA的过程。
在这个过程中，RNA聚合酶将DNA模板上的核苷酸与互补的核苷酸配对，合成RNA链。
在延伸阶段，RNA聚合酶依次进行核苷酸配对合成RNA链，直到到达终止密码子位置。
在终止步骤中，RNA聚合酶到达终止密码子后停止合成RNA链，然后与DNA分子分离。
二、转录的调控在细胞内，转录是由一系列转录因子和启动子共同调控的。
转录因子是一类可以结合到DNA并调控基因转录的蛋白质。
它们可以促进或抑制RNA聚合酶的结合，从而控制基因的表达。
通过这种方式，细胞可以根据需要来调节基因的转录，进而调控蛋白质的合成。
三、转录因子转录因子是一类可以结合到DNA并调控基因转录的蛋白质。
它们可以通过不同的方式调控转录过程，包括直接结合到DNA上、与RNA聚合酶结合、调控染色质结构等。
转录因子的功能非常复杂，它们可以与DNA的启动子、增强子和沉默子结合，从而促进或抑制基因的转录。
四、转录启动转录启动是转录的第一步，也是调控转录的重要环节。
在启动阶段，RNA聚合酶首先与转录因子结合到DNA上，形成转录复合物。
然后，RNA聚合酶在转录因子的辅助下开始合成RNA链，直到达到终止密码子位置。
结语通过本文的介绍，我们了解了分子生物学转录的基本知识点，包括转录的过程、调控、转录因子和转录启动。
转录是生物体内的一种基本生物学过程，它在细胞中起着至关重要的作用。
通过对这些知识点的了解，我们可以更好地理解生物体内的基因表达调控机制，从而为生物学研究和生物技术应用提供理论依据。
转录因子在植物抗逆性中的调控机制
转录因子在植物抗逆性中的调控机制转录因子在植物抗逆性中的调控机制是一个复杂而精细的生物学过程。
以下是根据您提供的文档结构，撰写的关于该主题的文章。
一、转录因子概述转录因子是一类能够结合到DNA上的蛋白质，调控基因的转录过程。
在植物中，转录因子对抗逆性基因的表达起着至关重要的作用。
植物在面临逆境如干旱、盐碱、低温、高温、病原菌侵染等环境压力时，转录因子能够通过调节下游基因的表达，增强植物的适应性和生存能力。
1.1 转录因子的功能转录因子通过识别特定的DNA序列，与基因的启动子区域结合，从而激活或抑制基因的转录。
它们可以是激活因子，促进基因表达；也可以是抑制因子，抑制基因表达。
转录因子的活性受到多种信号通路的调控，包括植物激素信号、环境信号和内部代谢信号等。
1.2 转录因子的分类转录因子可以根据其结构域和功能进行分类。
常见的转录因子家族包括AP2/ERF家族、bZIP家族、WRKY家族、MYB 家族等。
每个家族的转录因子都有其特定的DNA结合模式和调控特性。
二、转录因子在植物抗逆性中的调控机制植物在逆境条件下，转录因子通过多种机制调控基因表达，以应对不同的环境压力。
2.1 逆境信号的识别与响应植物首先需要识别逆境信号，如干旱、盐分、低温等。
这些信号通过植物的感知系统被识别后，会激活一系列的信号传导途径，最终导致转录因子的激活或抑制。
2.2 转录因子的激活与功能逆境信号激活的转录因子会进入细胞核，结合到特定基因的启动子区域，调控这些基因的表达。
这些基因通常编码与抗逆性相关的蛋白质，如渗透调节蛋白、抗氧化酶、抗冻蛋白等。
2.3 转录因子的相互作用转录因子之间也存在相互作用，它们可以通过形成同源或异源二聚体，或者通过相互竞争DNA结合位点，来协同调控基因表达。
这种相互作用增加了调控网络的复杂性，使得植物能够精细调控其抗逆性反应。
2.4 转录因子的后转录调控除了直接调控基因的转录，转录因子还可以通过影响mRNA的加工、稳定性和翻译等后转录过程，进一步调节基因表达。
分子生物学-转录
10个核苷酸的合成中，RNA聚合酶易从模板链上脱落，合成效率较低, 此阶段称为
流产转录(abortive trancription)；一旦合成的RNA链长度>10nt, 聚合酶可以与DNA、 RNA形成稳定的三维复合结构，进入转录延伸阶段，这一转变过程称为启动子逃
离（promoter escape）.
2)当RNA聚合酶成功脱离启动子后，进入转录延伸阶段（transcription elongation） 未转录的DNA双链从两蟹爪交接处进入聚合酶, 并分别进入酶分子中各自通道, 在
离开聚合酶后又重新恢复双链结构. 转录延伸中的RNA分子只有8～9nt与模板DNA
互补,其余的RNA链则从模板链上剥离, 并通过RNA通道离开RNA聚合酶. 在延伸过 程中, RNA聚合酶具有两种校正功能:
的平台。体外实验结果显示，其它GTFs与RNA聚合酶Ⅱ按照一定的顺序在启动子
上完成组装。
前起始复合物形成后在特定条件下，在TFⅡH解旋酶活性的催化下引起启动子区
域解链，并同时对RNA聚合酶Ⅱ大亚基羧基端(C-terminal domain,CTD)七肽重复序 列中（Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser）的Ser进行磷酸化修饰，使RNA聚合酶Ⅱ起始
PolⅡ core promoter
二、转录前复合物的形成
普通转录因子可以协助RNA聚合酶Ⅱ结合到启动子并协助实现从闭合复合物向 开放复合物的转化；同时还协助聚合酶脱离启动子顺利进入延伸阶段。把结合在
启动子上准备起始转录的一整套GTFs及RNA聚合酶Ⅱ称为前起始复合物（preinitiation complex）. 前起始复合物的形成位点是核心启动子的TATA元素。GTFs中的TFⅡD首先通过 TBP亚基结合到TATA序列上而形成一个其它GTFs与RNA聚合酶Ⅱ对启动子结合
转录因子的结构和功能研究进展
转录因子的结构和功能研究进展转录因子是一类在基因转录调控中起重要作用的蛋白质，它通过结合到DNA 序列上来调节RNA合成和转录速率，因此对于生命活动的正常进行至关重要。
近年来，对于转录因子的组成、结构和功能的研究不断深入，为人们深入理解生命活动的本质提供了重要的手段。
一、转录因子的结构和分类转录因子通常是由一系列氨基酸组成的多聚体蛋白质，它们通常具有DNA结合结构域、转录激活或抑制结构域和介导蛋白-蛋白相互作用的结构域等多个结构域。
按照其DNA结合结构域的不同，转录因子可以分为以下几类：1.锌指蛋白：锌指蛋白是最早被发现的转录因子之一，它通常由一个或多个锌指结构域组成，每一个锌指结构域通常由30个氨基酸组成，并在其中包含一个锌离子。
锌指蛋白可以通过与DNA双链特定序列的连接来实现调控功能。
2.基础亲和性/柔性序列特异性蛋白：这类蛋白质通常没有明显的结构域，其DNA结合的特点是它们与DNA的结合生物序列比较模糊，因此也被称为柔性序列特异性蛋白。
3.碱性螺旋-环-螺旋转录因子：碱性螺旋-环-螺旋转录因子具有富含碱性氨基酸的一段结构域和一个螺旋-环-螺旋结构的结构域。
多数查找到的碱性螺旋-环-螺旋转录因子DNA结合区域由一个基序寻找和一个可控或柔性的侧验证基结构组成。
4.类似于缺陷DNA ：类似于缺陷DNA 转录因子是一种基于识别和有序的DNA序列识别机理的侧验证因子结构，并且在它们达到DNA结构时可以形成负卷感区，这通常与它们的功能相关。
二、转录因子的作用机制转录因子可以在调节DNA结构方面发挥多种不同的作用。
它们可以通过识别并结合某个特定的基序序列，来直接影响DNA结构。
此外，它们还可以通过修饰某个介导结构域的氨基酸残基，来进一步调节相应的转录因子活性。
通过继承复合体的安排和规范，转录因子可以形成，对DNA序列特定区域的弯曲或斜切进一步积极调节功能。
此外，转录因子还可以和其他蛋白质打交道，发挥协同作用，共同完成基因转录的调控。
分子生物学中的RNA转录
分子生物学中的RNA转录近年来，越来越多的研究表明，RNA转录在分子生物学领域中起着至关重要的作用。
RNA转录是指将DNA中的信息转录成RNA分子的过程。
这个过程涉及到多种分子机制，包括转录因子、RNA聚合酶、RNA辅因子等。
RNA转录的机制非常复杂，需要不同的分子机制协同作用才能顺利完成。
首先，转录因子会在DNA上识别特定的序列，并结合到这个序列上。
然后，它们会招募RNA聚合酶，促使它开始在这个区域上合成RNA。
在这个过程中，RNA聚合酶会沿着DNA链向前移动，并将RNA合成在一起。
在这个过程中，RNA聚合酶需要依赖RNA辅因子的协助，才能完成RNA分子的准确合成。
RNA转录是非常精密的过程。
它涉及到多种调控机制，例如转录因子的表达调控、表观遗传修饰等等。
这些调控机制可以影响RNA转录的速度和准确性，从而控制基因的表达水平。
此外，RNA也可以在合成后经历剪切、异构、修饰等一系列后续修饰，从而影响RNA的表达水平和功能。
因此，RNA转录及其后续修饰过程在分子生物学中具有极其重要的地位。
RNA转录的研究近年来也取得了重大突破。
例如，在染色质结构方面的研究中，发现了某些结构可以调节RNA的转录速度和准确性。
此外，许多新型的RNA修饰也被发现，并被证明可以在转录后修饰RNA，从而影响其表达和功能。
这些发现有助于我们更全面地了解RNA转录及其后续修饰的机制和生物学意义。
总之，RNA转录作为分子生物学中重要的机制之一，涉及到复杂的分子机制和调控路径。
对其进行深入研究，有助于我们更全面地了解基因表达和生物学机制，可以为人类疾病治疗和新药开发提供一定的启示。
分子生物学——转录
转录起始复合物
RNApol (α2ββ′σ - DNA - pppGpN- OH 3′ α ββ′σ) ′
（二）转录延长
1. σ亚基脱落，RNA–pol聚合酶核心酶变 亚基脱落， 聚合酶核心酶变 构，与模板结合松弛，沿着DNA模板前 与模板结合松弛，沿着 模板前 移； 2. 在核心酶作用下，NTP不断聚合， 核心酶作用下 作用下， 不断聚合， 不断聚合 RNA链不断延长。 链不断延长。 链不断延长 (NMP) n + NTP → (NMP) n+1 + PPi
• 在DNA分子双链上某一区段，一股链 分子双链上某一区段， 分子双链上某一区段 可转录，另一股链不转录； 可转录，另一股链不转录； • 模板链并非永远在同一单链上。 模板链并非永远在同一单链上。
聚合酶（ 二、RNA聚合酶（DDRP） 聚合酶 ）
1. 原核生物的 原核生物的RNA聚合酶 聚合酶 E.coli的RNA聚合酶是由四种亚基 的 聚合酶是由四种亚基 组成的六聚体（ ωσ） 组成的六聚体（ α2 β β′ ωσ）
TF II B
TF II H
DNA
转录 前 起 始 复 合 物
4. 拼板理论 拼板理论(piecing theory)
一个真核生物基因的转录需要3至 个 一个真核生物基因的转录需要 至5个 转录因子。转录因子之间互相结合，生成 转录因子。转录因子之间互相结合， 有活性和专一性的复合物，再与 有活性和专一性的复合物，再与RNA聚合 聚合 酶搭配而有针对性地结合、 酶搭配而有针对性地结合、转录相应的基 因。
一、原核生物的转录过程
南师大 分子生物学第五章 转录因子
Molecular Biology
第一节 转录因子的结构
一、转录因子常见的基本结构 二、转录因子的种类
Molecular Biology
一、转录因子常见的基本结构
转录因子有一个共同的特性，即由不同的功能结 构域组成可调变的蛋白质结构，而这些功能结构 域从蛋白总体分离出来后，无论是单独作用还是 与其它来源的蛋白连接后，仍保持原有的功能。
乙烯应答元件结合因子（ERF），最先是从烟草中，作为 GCC-box结合蛋白分离出来的。 ERF蛋白具有一个高度保守的含58或59个氨基酸的DNA 结合域。 在拟南芥基因组中，有124个ERF 基因，参与对低温、干 旱、病原体及其诱发因子的反应，构成一个转录因子基因 家族。 这类基因家族在植物的生长、发育、抗病、抗胁迫以及次 生代谢等方面起着非常重要的作用。 该家族现只在高等植物中被发现。
Molecular Biology
转录因子的DNA芯片技术研究
Molecular Biology
Molecular Biology
Molecular Biology
第三节 一些常见的植物转录因子
一、植物中常用的特异性转录因子 二、植物中特有的转录因子——Dof
Molecular Biology
Molecular Biology
二、转录因子的研究方法
与传统的“单基因” 技术比较，微阵列具有无可 比拟的优势。 该技术能在同一时间内对数千个基因表达谱的差 异进行平行分析，从而可以对基因进行大量、快 速、平行研究，实现高通量筛选； 而且，还可得出其所筛选出的特异性配基的相对 亲和力信息。
Molecular Biology
转录因子名词解释分子生物学
转录因子名词解释分子生物学
转录因子是一类在分子生物学中起关键作用的蛋白质，它们能
够调控基因的转录过程。
转录因子通过结合到DNA上的特定序列区域，即转录因子结合位点，来影响基因的表达。
它们可以促进或抑
制基因的转录，并且在细胞内起着调控基因表达的重要角色。
转录因子通常包含一个或多个结构域，包括DNA结合结构域和
转录激活或抑制结构域。
DNA结合结构域使转录因子能够与DNA上
的特定序列结合，而转录激活或抑制结构域则调控着转录的活性。
通过与其他调控蛋白、共转录因子和RNA聚合酶等分子相互作用，
转录因子能够在基因表达调控网络中发挥重要作用。
转录因子的作用可以是正向的，即促进基因的转录，也可以是
负向的，即抑制基因的转录。
它们的作用可以受到多种信号的调节，包括细胞外信号、激素、细胞周期和环境条件等。
通过调控基因的
转录，转录因子参与了细胞分化、发育、应激反应和疾病发生等生
物学过程。
在研究中，科学家们通过多种实验技术来研究转录因子，包括
染色质免疫沉淀、电泳迁移实验、转录因子结合位点鉴定等。
这些
技术可以帮助科学家们了解转录因子的结构、功能和调控机制。
总结起来，转录因子是一类能够调控基因转录的蛋白质，通过与DNA特定序列结合来影响基因的表达。
它们在细胞内起着重要的调控作用，参与了多种生物学过程，是分子生物学研究中的重要研究对象。
分子生物学部分名词解释
名词解释1、基因：是合成一种功能蛋白质或RNA分子所必需的全部DNA序列。
2、基因组：某一特定生物体的整套（单倍体）遗传物质的总和。
3、转录因子：一群能与基因5’端上游特定序列专一性结合，从而保证目的基因一特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。
4、C值：指一种生物单倍体基因组DNA的总量。
5、复制子：DNA复制从起点开始双向进行直到终点为止，每一个这样的DNA单位称为复制子或复制单元。
6、半保留复制：DNA复制过程中，每个子代DNA的一条链来自亲代的DNA，另一条链则是新合成的，这种复制方式称为半保留复制。
7、冈崎片段：DNA合成过程中，随从链的合成是不连续进行的，先合成许多片段，最后各段再连接成为一条长链。
这些小的片段叫做冈崎片段。
8、单顺反子：只编码一个蛋白质的mRNA称为单顺反子mRNA。
9、多顺反子：有些mRNA的编码区可生成多个不同的蛋白质，称为多顺反子mRNA。
10、重叠基因：同一段DNA携带两种（包含两种）以上不同蛋白质信息。
也可解释为“调控具有独立性但部分使用共同基因序列的遗传信息”。
11、嵌套基因：指那些通过调节蛋白质合成终点而产生两种或更多嵌套蛋白产物的基因。
12、假基因：基因家族中有些成员不产生有功能的基因产物，这种基因称为假基因。
13、转座子：通过DNA复制而转移的转座元件。
14、增强子：DNA上能强化转录起始的序列，能够在启动子任何方向以及任何位置（上游或下游）作用。
15、断裂基因：真核基因由于含有大量的非蛋白编码序列将外显子隔开，因而呈现一种断裂结构，因此，真核基因也称为断裂基因。
16、内含子：大多数真核基因都是由蛋白质编码序列和非编码序列两部分组成。
非编码序列被称为内含子，又称插入序列（IVS）。
内含子只转录，在前mRNA时被剪切掉。
如果一个基因有几个内含子，一般总是把基因的外显子分隔成n+1部分。
内含子的核苷酸数量可比外显子多许多倍。
17、外显子：大多数真核基因都是由蛋白质编码序列和非编码序列两部分组成。
分子生物学知识：转录因子的结构和调控机制
分子生物学知识：转录因子的结构和调控机制转录因子是调控基因表达的重要分子，可以通过结合DNA调节基因的转录过程。
其结构和调控机制的研究有助于深入理解基因调控的分子机制。
本文将介绍转录因子的结构特点以及调控机制。
一、转录因子的结构特点转录因子是一类质量较小的蛋白质，通常由数百个氨基酸组成。
它们的结构通常包括DNA结合域和调控域两个部分，DNA结合域可以介导转录因子与DNA结合，并且根据其结构可以分为四类：脱氧核糖核酸激酶（histone kinase）结构域、环状结构域、锚定结构域和交叉型锚定-散板结构域。
除了DNA结合域外，转录因子还含有一些调控域，其可以与其它蛋白质发生相互作用，从而进一步影响基因表达。
例如，某些转录因子可能含有酶促活性域，在结合到DNA时可以将某些辅助蛋白质或小分子酶转运到适当的基因片段上，从而影响相关基因的表达。
不同的转录因子结构域在不同的生物过程中发挥不同的作用。
例如，锚定结构域可以将转录因子锚定在DNA上，限制其与其它转录因子相互作用，而核糖核酸激酶结构域则可以通过直接与DNA结合，调控某些基因的表达。
在某些病理生理状态下，转录因子结构域的突变可能导致基因表达异常，从而引发一系列地病理反应。
二、转录因子的调控机制转录因子的结构域决定了其与DNA结合的方式和程度，从而影响基因表达调控的结果。
除了结构域之外，转录因子还可以通过一些调控机制影响基因表达。
常见的转录因子调控机制包括：1.翻译后修饰翻译后修饰是指在蛋白质翻译后，通过酶反应等方式对蛋白质结构进行调整的过程。
例如，利用乙酰化、甲基化等化学修饰方式对转录因子进行调节，可以有效地改变转录因子结构，从而影响其与DNA 结合的能力以及对基因表达调控的效果。
2.miRNA调控miRNA是一种小RNA分子，可以通过结合靶基因mRNA调节基因表达。
某些miRNA可以直接结合转录因子，从而调节转录因子的表达和活性。
例如，在胰岛素受体信号通路中，转录因子FOXP3可能被miR-125b调节，从而影响胰岛素对膜蛋白的响应，并进一步影响胰岛素的作用。
转录因子研究套路
转录因子研究套路
转录因子研究是分子生物学研究领域中重要的一部分,它用于研究基因表达调控在生命过程中的作用。
转录因子研究包括两个主要步骤:转录因子的鉴定和活性的分子分析。
接下来从细胞的角度对转录因子研究的套路进行阐述。
首先,应该选择一种模式生物,以进行转录因子研究,例如小鼠、酵母或者细胞cultures。
通常,应首先获取目标转录因子基因序列,并采用抗体进行识别。
抗体用于鉴定转录因子位置,例如核酸和蛋白质结合位点,在不同的细胞器的定点以及转录因子在不同的细胞内主要的定位。
此外,抗体可分析蛋白质-蛋白质相互作用和转录因子调控体系,以深入了解蛋白的分子功能。
其次,应使用方法如定量聚合酶链反应(PCR)来进行定量分析,并应用测序技术来检测转录因子的基因结构和表达水平。
使用RT-PCR,可以定量检测转录因子表达水平和蛋白质水平。
此外,系统生物学方法可以获得转录因子在不同生物样本中的组合和表达,以解析转录因子在各种生理过程中的作用。
最后,可以使用转录组数据技术来比较不同样本的转录因子基因表达量,进而分析基因表达水平的变化。
并可以进一步检测哪些基因由转录因子调控和调节表达,从而更全面地了解转录因子在不同细胞分化、发育和人身体发病过程中的作用机制。
因此,转录因子研究的套路主要包括以上四步:获取转录因子基因序列,识别转录因子,定量分析转录因子,比较转录因子基因表达量。
每一步都紧密相连,使用这些方法,可以深入地解析转录因子在不同生理过程中发挥的作用。
转录因子的控制和功能
转录因子的控制和功能转录因子是一类非常重要的蛋白质，它们可以连接到DNA上，激活或抑制基因的转录，从而对细胞的功能和特性进行调控。
转录因子的控制和功能在生物学研究中扮演着重要的角色，因此本文将介绍转录因子的控制和功能，并且探讨一些现有的研究成果。
转录因子的控制可以分为多个方面，包括基因表达和修饰、信号转导、蛋白质相互作用等。
其中，转录因子的基因表达和修饰是很重要的调控因素。
在细胞分化和发育过程中，一些转录因子的表达量和活性会发生变化，从而影响基因表达的水平。
此外，一些表观遗传因素，比如DNA甲基化和组蛋白修饰也可以影响转录因子的调控效力。
有些转录因子也可以通过互作，形成蛋白质复合体，在转录方面产生协同作用。
另一个影响转录因子控制的重要因素是信号转导。
在细胞内存在许多复杂的信号通路，当某些信号引起转录因子的活性变化时，就会影响细胞的基因表达。
比如，激素可以影响转录因子的活性，从而导致基因表达的变化。
一些外部因素，比如环境因素和化学物质也可以通过激活或抑制转录因子而对生物体的生理功能产生影响。
转录因子的功能也十分广泛，并且很多功能还需要进一步的研究。
其中一个重要的功能是影响细胞生命的决策，比如分化和增殖。
这些过程都需要转录因子的参与，在细胞内分化的过程中，一些皮肤细胞转录因子的表达会减少，而一些神经细胞的转录因子则会增加，从而导致细胞结构和功能上的差异。
此外，转录因子也在细胞周期中发挥着重要的作用，它可以在不同的细胞阶段影响细胞增殖和细胞周期的调控。
除了影响细胞本身之外，转录因子对整个有机体也有很大的影响。
比如转录因子可以影响生物体的免疫系统，促进或抑制抗体的产生，并且影响炎症反应的强度和时长等。
它们还可以促进或抑制细胞凋亡，从而影响组织和器官的发育和维持。
综上所述，转录因子在细胞生物学和分子生物学中的作用是十分重要的。
虽然我们已经深入了解了许多关于转录因子的控制和功能的信息，但它们的研究仍然有很多待解决的问题，比如差异性基因表达的机制以及转录因子如何与其靶基因相互作用的机制等等。
fnr转录因子
在生物学和分子生物学领域，FNR（Fumarate and Nitrate Reduction）是一种转录因子。
FNR 是一种负责调控细菌中响应氧气水平的蛋白质，特别是在缺氧条件下。
FNR 在革兰氏阴性细菌中普遍存在，最为典型的研究对象是大肠杆菌（Escherichia coli）。
在缺氧条件下，FNR蛋白可以结合到DNA上，影响与其结合的基因的转录，从而调节这些基因的表达。
FNR 能够感知环境中的氧气水平，因此在缺氧条件下，它可以激活一些与厌氧代谢有关的基因，例如与韦尔氏氧化（fermentation）有关的基因。
FNR 蛋白通常具有铁硫簇（iron-sulfur cluster）作为其感知氧气的结构域。
当氧气水平较低时，这个铁硫簇被保持在还原状态，FNR蛋白就能够结合到目标基因的调控区域上，从而发挥其转录因子的作用。
FNR 蛋白在细菌中是一个重要的适应性因子，它帮助细菌在不同的氧气条件下进行生存和代谢调节。
由于其在细菌中的关键作用，FNR 蛋白的研究对于理解微生物生理学和生态学以及相关的基因调控网络具有重要意义。
转录因子研究
转录因子研究转录因子是一类调控基因表达的蛋白质，通过与DNA序列特定的结合位点结合来调控基因的转录过程。
转录因子在细胞发育、生长、分化、应激应答等过程中发挥重要的调控作用，对于维持生命的正常状态至关重要。
研究转录因子的一种方法是通过克隆、纯化和鉴定转录因子蛋白。
首先，研究人员需要从细胞中提取转录因子蛋白或者通过转录因子基因的克隆获得转录因子蛋白。
然后，研究人员可以使用蛋白质纯化技术，如亲和层析、离子交换层析和凝胶过滤等方法，纯化目标转录因子蛋白。
最后，通过质谱分析等技术对纯化的蛋白进行鉴定，确定其分子量和氨基酸序列。
除了研究转录因子蛋白本身，还可以研究转录因子的结合位点和作用机制。
研究人员可以使用DNA比对和足迹分析等方法，确定转录因子的结合位点，并进一步验证这些位点的功能。
同时，也可以通过转录组学技术，如RNA序列和ChIP-seq等，全面了解转录因子对基因的调控网络。
此外，还可以通过研究转录因子与其他调控因子的相互作用，揭示其在复杂的细胞调控网络中的作用机制。
例如，可以通过蛋白质相互作用实验，酵母双杂交等技术，鉴定转录因子与其他蛋白质的相互作用。
同时，研究人员也可以利用生物信息学分析工具，预测转录因子与其他调控因子在调控网络中的相互作用。
最后，研究转录因子的功能也可以通过生成转录因子基因敲除或过表达的转基因模型来进行。
这些模型可以用来研究转录因子在发育过程中的作用，以及转录因子突变对细胞功能的影响。
总之，研究转录因子需要采用多种方法，包括基础的分子生物学和生物化学实验，以及计算生物学和生物信息学分析。
这些研究可以帮助我们更好地理解转录因子在基因调控网络中的作用，从而揭示生命的复杂性。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
Independence of
DNA-binding domain and
transcription-activation domain
UASG
GAL4 protein :
a yeast activator
• a set of genes responsible for metabolism of galactose
(TBP); needed for RNApol I, II, III
TFIIA;
Binds to TFII D Enhances TFII D binding to TATA box Stabilizing the DNA-TFII D complex
TFII A TBP of D
Wilds minor groove
bridging factor
TFIIH; Large complex made up of > 5 subunits Helicase activity (ATPase, ) kinase activity Phosphorylation of CTD of RNApol IIO DNA repair
+ Cis-factor
4.3.3.2. RNA polymerase in Eukaryotes
RNApol. I, II, III
Including L, L’ subunit & 7-12 small subunits
L’ with 78%±homologous
between 3 RNApol. I, II, III
stimulate only a basal level of transcription.
4.3.3. 与基本转录相关的T.F.
General transcription factors (GTF)
真核生物中RNApol的作用必须有其他相关转 录蛋白在启动子处的先期结合才能启动转录
4.3.3.1 General T.F. for basic transcription
The general T.F. are capable
of sponsoring only a basal level transcription.
To provide the needed extra boost in
transcription, eukaryotic cells
have additional, gene-specific transcription factors (activators e.g GAL4).
DNA
DNA
DNA binding domain of activator
DNA
HTH
DNA
Zinc finger
consist of Helix-turn-Helix and encoded by zipper Leucine HLH
the homeobox of 60 aa in large activator family consist of Zinc finger (basic ZIP bZIP) or basic domain of Helix-loop-Helix (bHLH) DNA
DNA
DNA
HTH
DNA
Zinc finger
Myb, MADS, WRKY, Leucine zipper HLH AP2/EREBP（APETALA2 / Ethylene－responsive element binding protein） NAC (NAM, ATAF, CUC2) ARF ( Anaerobic Response Factor)
l
l l l
TF (I, II, III) Transcriptional Factor
TBP (TATA box Binding Protein) TAF (TBP Associate Factor) RAP (RNApol. Associate protein) TIC (Transcriptional Initiate Complex)
TFIIF;
Binding and recruiting RNApol II to assemble TIC Promoting RNA elongation by its helicase (ATPase)
helicase
(ATPase)
TFII F RNApol II TFII B
Basic TIC
The general T.F. are capable
of sponsoring only a basal level transcription.
To provide the needed extra boost in
transcription, eukaryotic cells
have additional, gene-specific transcription factors (activators e.g GAL4).
(or/and N Export Signal, NES)
dimerization domain of activator
(in some transcription factor of dimer / tetremer factor) DNA
Homodimers
or DNA Heterodimers held together by dimerization domains Including Leu zipper or Helix-loop-Helix
• each of GAL4-responsive genes
进
化
L’~ β’of prokaryote RNApol. & L ~ β
(功能相似)
渊
源
RNApol II (B);
--- For pre-mRNA transcription
--- L’ maximum subunit 240 kd & have specific COOH-end
named CTD
4.3.3. 与基本转录相关的T.F. General transcription factors 真核生物中RNApol的作用必须 有其他相关转录蛋白在启动子 处的先期结合才能启动转录
Eukaryotic RNA polymerases are
incapable of binding by themselves to their respective promoters. Instead, they rely on proteins called transcription factors to show them the way. Such factors are grouped into Two classes: general transcription factors（GTF） gene-specific transcription factors（STF）
DNA
DNA binding domain
成为转录因子分类 DNA 的重要标志
•
Transcription activation domain
(most activator have one or more than one of these domain)
Group 1: acidic domain Yeast GAL4 typifies this group , 49 aa domain with 11 acidic aa Group 2: Glutamine-rich domain Sp1 have two this domain, 25% Gln, 39 Gln in a span of 143 aa Group 3: Proline-rich domain CTF has a domain of 84 aa, 19 of which are Pro
蛋白酶水解
Non-physiological form
使RNApol易于离开Promoter
转录延伸
提高转录效率10X IIA
---RNApol II + >20TFIIs
逐级组装
TIC → 转录启动
TFIID;
(Transcriptional Initiation Complex) A sort of protein complex (TBP & > 8 TAF) Very high conserved C-end domain of 180 aa Binds with DNA in minor groove & wilds it Determination initiation starting site Control UPE effect for basic transcription
( Carboxyl Terminal Domain ) only in RNApol II
--- CTD-end; 7aa repeats & high frequency phosphorylation
Tyr—SerP—Pro—ThrP—SerP—Pro—SerP
Yeast 26X Drosophila 44X Rat & Human 52X
TATA
+1
pre-TIC
TFII F RNApol II TFII B
Basic TIC
E H complete TIC
Promoter clearance
E
H
B
D
A
mRNA
Transcription starting
GTF + TATA box → basal level transcription