gfp基因的克隆与表达
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基因工程实验设计
题目:绿色荧光蛋白基因(gfp)的克隆及表达
专业:生工1001 姓名:刘会淼
2013年3月13
实验目的:研究绿色荧光蛋白(Greed Fluorescent Protein,GFP)基因的基因克隆及在大肠杆菌中的表达。
实验方法; 通过分别将DH-5α (pEGFP-N3)和DH-5α(pET-28a)提取质粒、酶切并连接形成重组质粒pET-28a-GFP,将重组质粒导入 DH-5α感受态细胞中进行转化,通过限制性核酸内切酶Not I与Bam H1和PCR对所建质粒进行分析鉴定后, 通过转化的方法把含绿色荧光蛋白(GFP)外源基因转入大肠杆菌体BL-21内进行表达,再用IPTG诱导GFP基因表达,如果可以看到显现绿色,判断GFP基因在大肠杆菌中成功表达。
1.材料与方法:
1.1.1 实验材料
(
克隆菌 DH-5a、表达菌BL-21为本实验室收藏菌种,质粒 pET-28a 和 pEGFP-N3,引物,限制性内切酶 Bam H1、Not Ⅰ
1.1.2 仪器设备
Eppendof离心机、电泳仪、电子天平、台式离心机、控温磁力搅拌器、调温电热套pH计、冰箱、台式冷冻恒温振荡器、紫外灯、生物洁净工作台、电热恒温水温箱、琼脂糖凝胶电泳电泳装置、凝胶成像分析系统、酒精灯、培养皿、、移液枪、枪头、接种环、酒精棉球、灭菌枪头、平板封口膜、离心管
1.1.3 试剂及溶液
分装后于121 ℃ 高压灭菌20 min。(LB固体培养基是在液体LB中加琼脂粉至1 %);
溶液Ⅰ 50 mL
葡萄糖50 mmol/L
Tris-Cl (pH !
25 mmol/L
EDTA (pH 10 mmol/L
121℃高压灭菌 15 min后置于0~4℃贮存;
溶液Ⅱ 100 mL
NaOH mol/L
SDS 1% (W/V)
用时由母液2 mol/L NaOH、10%(W/V) SDS稀释现配;
(
溶液Ⅲ 100 mL
KOAc (5 mol/L) 60 mL
冰乙酸 mL
H2O mL
121 ℃高压灭菌 15 min后置于0~4 ℃贮存;
氯仿;琼脂糖;灭菌的去离子水;10×酶切缓冲液;TaqDNA聚合酶;TaqDNA聚合酶缓冲。灭菌的 mol/L CaCl2,标准相对分子质量的DNA;溴乙锭(EB)储存液µg/mL;LB/Kan(50 µg/mL)固体培养基;IPTG配成浓度为400 mM水溶液,-20 ℃保存备用;卡那霉素(Kan)配成浓度为100 ug/mL水溶液,-20 ℃保存备用;70%乙醇:用新开装的乙醇和灭菌无离子水配成,放在0~4 ℃;无水乙醇:放在0~4 ℃;RNase 母液:将RNase 溶于10 mmol/L Tris·Cl(pH 、15 mmol/L NaCl 配成的试剂中,配成10 mg/mL的溶液,在100 ℃加热15 min,使可能溶有的DNase失活,然后缓慢冷却至室温,分装成小份保存于-20 ℃;
方法:
《
1.2.1 大肠杆菌DH-5α (pEGFP-N3)染色体DNA的提取
1.2.2、实验目的:掌握酚氯仿法提取DNA的原理和操作。
1.2.3,器材:⑴,微量移液器、高速离心机、EP管、吸头、烘箱、水浴锅、管架、胶头滴管、冰箱
⑵,消化缓冲液: CTAB/NaCl溶液:NaCl溶解于80ml H2 O,缓慢加入
10g CTAB,加水至100ml;其它试剂:氯仿:异戊醇(24:1),酚:氯仿:
异戊醇(25:24:1),异丙醇,70% 乙醇,TE,10% SDS,蛋白
酶K (20mg/ml或粉剂),5mol/L NaCl。
1.2.4实验原理
生物的大部分或几乎全部DNA都集中在细胞核或类核中。DNA在体内通常都与蛋白质结合,蛋白质对DNA制品的污染常影响到以后的DNA操作过程,因此需把蛋白质除去,一般采用酚氯仿抽提法。苯酚、氯仿对蛋白质有极强的变性作用,而对DNA无影响。经苯酚、氯仿抽提后,蛋白质变性而被离心沉降到酚相与水相的界面,DNA则留在水相,少量的或与DNA 紧密结合的蛋白质可用蛋白酶予以去除。DNA制品中少量的RNA无影响,必要时可加入不含DNase的RNase去除RNA污染。
1.2.5、实验步骤1. 100ml 细菌过夜培养液, 5000rpm离心10分钟, 去上清液。
2. 加TE悬浮沉淀, 并加10% SDS, 50μl 20mg/ml(或1mg干粉)蛋白
酶K, 混匀, 37℃保温1小时。
3. 加5mol/L NaCl, 混匀。
4. 加CTAB/NaCl溶液, 混匀, 65℃保温20分钟。
5. 用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提, 5000rpm离心10分钟, 将上清液移至干净离心管。
6. 用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提, 取上清液移至干净管中。
7、加1/10 体积3mol/L NaAc,及2.5倍体积预冷(-20℃)无水乙醇,混匀。-20℃沉淀30min。12000rpm15min,弃上清
8、加70%乙醇1ml,轻轻混匀,12000rpm15min,弃上清。
9、EP管放置于烘箱中烘干。
?
10、加30ul TE或ddH2O溶解DNA。
11、琼脂糖凝胶电泳检测
注意,实验室中一般用的的EP管,可根据自己需要按比例调节加样量。
DH-5α(pET-28a)的载体质粒也可根据同样方法提取。
1.3.1PCR扩增
1.3.2实验目的
1、学习PCR扩增的基本原理。
2、掌握PCR技术的常规操作。
3、了解PCR扩增的参数设计。
1.3.3实验原理
《
1、聚合酶链反应 (Polymerase chain reaction,PCR):利用核酸变、复性的性质,以待扩增的DNA为模板,在体外由引物介导的酶促合成特异DNA片段的过程。
2、PCR反应体系
引物、dNTP、 Mg2+、模板、 Taq DNA聚合酶, Buffer。
3、PCR循环参数
① 95℃ 5min
② 95℃ 30s
③ 52℃ 30s
④ 72℃ 30s
⑤ goto②29times
⑥ 72℃ 10min
1.3.4器材
…
1,微量移液取样器,移液器吸头, PCR微量离心管,PCR仪,台式离心机,琼脂糖凝胶电泳系统,紫外凝胶成像系统
2,Taq DNA聚合酶,PCR缓冲液, MgCl2,dNTP,引物,模板,ddH2O,TBE电泳缓冲液,EB,加样缓冲液
3,引物:
1.3.5实验步骤
1、在 PCR 微量离心管中配制30ul反应体系。