上海交通大学普通生物学课件 第2章:生命的化学基础
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素--非共价键
C=O C-N H-O H
氢 键
C-O O —
H3 N- +
盐 键
非共价键的键强度很小,所以
A、需要多个非共价键才足以维持高 级结构的稳定;
B、高级结构不很稳定。生物大分子变
性就是因为高级结构破坏,大分子 性质改变,生物活性丧失。但是, 一级结构尚未破坏。
一条肽链的两端有不同结构和性质: 一端的氨基酸残基带有游离氨 基,称氨基端; 另一端的氨基酸残基带有游离 羧基,称羧基端。
2)、单糖通过糖苷键联成多糖链
(1) 贰糖 对贰糖结构的了解包括弄清楚: 单糖基成份 α-还是β-糖苷键 取代位置
麦芽糖
一条多糖链的两端有不同结构和性质: 一端的糖基有游离的半缩醛羟基,称还原端; 另一端的糖基没有游离的半缩醛羟基, 称非还原端。
水、无机盐、单糖、 氨基酸、核苷酸 蛋白质、核酸、多糖、 脂质
组成细胞分子中的四种功能团:
O 羟基:—OH; 羧基:—COOH; 羰基:—C— 氨基:—NH2
生物小分子和生物大分子的关系
小分子 大分子 复合大分子
单糖
氨基酸 核苷酸 (脂类)
多糖
蛋白质 核酸
糖蛋白
糖脂 脂蛋白
(由小分子到大分子)
合成大分子 (聚 合)
DNA双螺旋结构
(2)RNA为单链盘绕,局部形成碱基配对。
例如:转运RNA(tRNA)的三叶 草结构
转 的 运 三 叶 草 ( 结 构 ) RNA tRNA
4 )、多糖链的高级结构 不同高级结构带来不同的生物学性能
淀粉形成螺旋状 纤维素呈长纤维状 能源贮存 结构支架
5)脂质
脂质是指生物体内不溶于水而溶于 有机溶剂的各种小分子。
吡喃型
(葡萄糖结构式)
单糖的生物功能: A、作为多糖的组成元件
B、作为燃料
C、组成寡糖参与细胞信号传递
4)氨基酸
氨基酸是同时具有α-氨基和α-羧基的小分子
(氨基酸通式)
参与蛋白合成的共有20种天然氨基酸的α碳原子上均 连接这 4 种基团,即: α羧基、 α氨基,一个 H 原子 和一个 R 基 ( 除甘氨酸中为 H 原子外) R 基代表任意基团。
ATP参与能量代谢
二、组成生物的大分子
生物大分子主要有三大类: 蛋白质、 核酸、多糖、 (脂 质)
它们都是由生物小分子单体通过特有的共价 键联结而成。
(2) (1)
(1) 碱基—糖之间是β—糖苷键 (2) 糖—磷酸之间是磷酸酯键
1)、氨基酸通过肽键联成肽链
氨基酸种的α羧基和另一个氨基酸种的α氨基发生脱水缩合, 生成的化学键称为肽键,并生成二肽化合物,多个氨基酸 以肽键顺序相连形成多肽; 每一条肽链都有特定的氨基酸序列,并在蛋白质中具有特
参加大分子核酸组成的共有8种核苷酸
DNA水解液中 RNA水解液中
腺脱氧核苷酸(dAMP)
鸟脱氧核苷酸(dGMP) 胞脱氧核苷酸(dCMP) 胸腺脱氧核苷酸(dTMP)
腺苷酸(AMP)
鸟苷酸(GMP) 胞苷酸(CMP) 尿苷酸(UMP)
另外还有一些重要的具有生物活性的核苷酸 具有生物活性的核苷酸
(cAMP), cGMP 参与细胞信号传递
一端的核苷酸,其5
- C 没有进 入磷酸 二 酯键,称 5 ’ 末端; 另一端的核苷酸, 其3-C没有进入磷酸 二酯键,称 3 ’ 末端。
4、生物大分子的高级结构
1)、蛋白质的高级结构
蛋白质的一级结构是指肽链中氨基
酸的排列顺序
蛋白质的二级结构是指邻近几个氨 基酸形成的一定的结构形状。
3)、 核酸的高级结构
(1) DNA双螺旋
A、两条反向平行的核苷酸链共同盘绕
形成双螺旋,糖-磷酸-糖构成螺旋
主链 B、两条链的碱基都位于中间,碱基平 面与螺旋轴垂直
C、两条链对应碱基呈配对关系
A=T
G≡C
D、螺旋直径 20A,螺距 34A,
每一螺距中含 10 bp
DNA 双螺旋可以看作是 DNA 的二级结构 ,DNA 的三级结构的形成需要蛋白质帮助。
(3) 胆固醇是细胞的必要成份
(4) 血清中的胆固醇太多会促使形 成动脉硬化 和心脑血管疾病
哇!
终 于 结 束 了 。 。 。
葡萄糖---水溶性的
油 脂---脂溶性的
脂质种类很多,分子结构相差较大 A、油脂:甘油三脂 B、磷 脂 C、固 醇
甘 油 三 酯 分 子 结 构
磷 脂 分 子 结 构
磷脂分子可以 看成是一个极性 头,两条非极性 尾巴。
(1) 固醇类的内核由 4 个环组成 (2) 一些人体重要维生素和激素是固醇
(1) 游离态,调节细胞的渗透压、PH值;
(2) 合成有机体的原料; (3) 与有机物质结合,组成具有特殊性质的蛋 白质或作为酶的辅助因子,参与代谢活动。
3)单糖
多羟基醛或多羟基酮及其缩合物和某些衍生物称为糖。
(葡萄糖结构式)
天然单糖 大多数是 D-型糖
C1上羟基位置不同 时出现α-,β-两 种构型
如:α-螺旋和β-折叠
蛋白质的三级结构是指整条肽链盘绕
折叠形成一定的空间结构形状。如纤 维蛋白和球状蛋白。 蛋白质的四级结构是指各条肽链之间
的位置和结构。所以,四级结构只存
在于由两条肽链以上组成的蛋白质。
一级结构
二级结构
α-螺旋
β-折叠 三级结构
四级结构
血红蛋白质的三级结构和四级结构
2)、 维持生物大分子高级结构的重要因
麦 芽 糖 的 结 构
(2)淀粉和纤维素都由葡萄糖组成,它们 之间主要区别在于α-糖苷键和β- 糖苷键的区别 (3)注意:多糖链也有方向性,有还原
端和非还原端
糖原
淀粉
纤维素
3)、核苷酸通过磷酸二酯键联成核酸
(1) 核酸链也有方向性 (2) DNA 和 RNA 在组成成份上有差别 DNA 脱氧核糖 有胸腺嘧啶, 无尿嘧啶 RNA 核糖 有尿嘧啶, 无胸腺嘧啶
第二章:生命的化学基础
一、原子和分子
1. 组成生命的化学元素
在自然界的130种元素中, 以O、Si、Al、Fe为最多, 而生物体中仅有25—26种是必须的, O、H、C、N普遍存 在, P、S、Na、K、Mg、Ca、Cl等为主要元素。
由上述元素构成化合物,形成小分子和大分子物质
细胞的化学组成
生物小分子: 生物大分子:
大分子分解 (水 解)
2、构成生物的小分子
1)水 游离水和结合水
60% —90%的重量
水占生物体的
地球上生命起源于水中,陆生生物
体内细胞也生活在水环境中
水的性质影响生命活动,如:水分子的极性,
水分子之间的氢键,内聚力、溶解性质,电
离性,pH
2)无机盐:
存在方式:一般都以离子状态存在
作 用:
氨基酸的α碳原子为手性碳原子,根据旋光性的不 同,左旋和右旋氨基酸分别命名为L- α-氨基酸(左旋) 和D- α-氨基酸(右旋),两者之间互为镜像体。 生物界种的各种蛋白质(除一些细菌的细胞壁中的短
肽和个别抗生素外)几乎都是由L- α-氨基酸所构成;
含D- α-氨基酸的极少。
氨基酸的功能:
(1)作为组建蛋白质的元件 (2)有的氨基酸或其衍生物具 有生物活性(代谢调节、信号传递等)
5)核苷酸(组成核酸的结构单位)
核苷酸分子由三个部分组成:
碱基:嘌呤(双环分子)、 嘧啶(单环分子) 戊糖:RNA为核糖、DNA为脱氧核糖 磷酸:
DNA的碱基是: A、T、G、C RNA的碱基是: A、U、G、C
脱氧核糖或核糖 上第1’位碳原子 与嘌呤或嘧啶结 合,就成为脱氧 核苷或核苷;第5’ 位碳原子在与磷 酸结合,就成为 脱氧核糖核苷酸 或核糖核苷酸。
定的三维空间构象。
寡肽:含有 10 左右氨基酸残基
(如二肽、五肽、八肽)
多肽:含 10-20 个氨基酸残基
蛋白质:含几十个氨基酸残基
注意:肽链分子的两端有自由的α氨基或α羧基,
有方向性,分别成为氨基末端( N-末端)和 羧基
末端( C-末wk.baidu.com);
肽链的顺序方向定义为从氨基端到羧基端的方向
一个氨基酸的羧基和另一个 氨基酸的氨基脱水缩合形成肽键
C=O C-N H-O H
氢 键
C-O O —
H3 N- +
盐 键
非共价键的键强度很小,所以
A、需要多个非共价键才足以维持高 级结构的稳定;
B、高级结构不很稳定。生物大分子变
性就是因为高级结构破坏,大分子 性质改变,生物活性丧失。但是, 一级结构尚未破坏。
一条肽链的两端有不同结构和性质: 一端的氨基酸残基带有游离氨 基,称氨基端; 另一端的氨基酸残基带有游离 羧基,称羧基端。
2)、单糖通过糖苷键联成多糖链
(1) 贰糖 对贰糖结构的了解包括弄清楚: 单糖基成份 α-还是β-糖苷键 取代位置
麦芽糖
一条多糖链的两端有不同结构和性质: 一端的糖基有游离的半缩醛羟基,称还原端; 另一端的糖基没有游离的半缩醛羟基, 称非还原端。
水、无机盐、单糖、 氨基酸、核苷酸 蛋白质、核酸、多糖、 脂质
组成细胞分子中的四种功能团:
O 羟基:—OH; 羧基:—COOH; 羰基:—C— 氨基:—NH2
生物小分子和生物大分子的关系
小分子 大分子 复合大分子
单糖
氨基酸 核苷酸 (脂类)
多糖
蛋白质 核酸
糖蛋白
糖脂 脂蛋白
(由小分子到大分子)
合成大分子 (聚 合)
DNA双螺旋结构
(2)RNA为单链盘绕,局部形成碱基配对。
例如:转运RNA(tRNA)的三叶 草结构
转 的 运 三 叶 草 ( 结 构 ) RNA tRNA
4 )、多糖链的高级结构 不同高级结构带来不同的生物学性能
淀粉形成螺旋状 纤维素呈长纤维状 能源贮存 结构支架
5)脂质
脂质是指生物体内不溶于水而溶于 有机溶剂的各种小分子。
吡喃型
(葡萄糖结构式)
单糖的生物功能: A、作为多糖的组成元件
B、作为燃料
C、组成寡糖参与细胞信号传递
4)氨基酸
氨基酸是同时具有α-氨基和α-羧基的小分子
(氨基酸通式)
参与蛋白合成的共有20种天然氨基酸的α碳原子上均 连接这 4 种基团,即: α羧基、 α氨基,一个 H 原子 和一个 R 基 ( 除甘氨酸中为 H 原子外) R 基代表任意基团。
ATP参与能量代谢
二、组成生物的大分子
生物大分子主要有三大类: 蛋白质、 核酸、多糖、 (脂 质)
它们都是由生物小分子单体通过特有的共价 键联结而成。
(2) (1)
(1) 碱基—糖之间是β—糖苷键 (2) 糖—磷酸之间是磷酸酯键
1)、氨基酸通过肽键联成肽链
氨基酸种的α羧基和另一个氨基酸种的α氨基发生脱水缩合, 生成的化学键称为肽键,并生成二肽化合物,多个氨基酸 以肽键顺序相连形成多肽; 每一条肽链都有特定的氨基酸序列,并在蛋白质中具有特
参加大分子核酸组成的共有8种核苷酸
DNA水解液中 RNA水解液中
腺脱氧核苷酸(dAMP)
鸟脱氧核苷酸(dGMP) 胞脱氧核苷酸(dCMP) 胸腺脱氧核苷酸(dTMP)
腺苷酸(AMP)
鸟苷酸(GMP) 胞苷酸(CMP) 尿苷酸(UMP)
另外还有一些重要的具有生物活性的核苷酸 具有生物活性的核苷酸
(cAMP), cGMP 参与细胞信号传递
一端的核苷酸,其5
- C 没有进 入磷酸 二 酯键,称 5 ’ 末端; 另一端的核苷酸, 其3-C没有进入磷酸 二酯键,称 3 ’ 末端。
4、生物大分子的高级结构
1)、蛋白质的高级结构
蛋白质的一级结构是指肽链中氨基
酸的排列顺序
蛋白质的二级结构是指邻近几个氨 基酸形成的一定的结构形状。
3)、 核酸的高级结构
(1) DNA双螺旋
A、两条反向平行的核苷酸链共同盘绕
形成双螺旋,糖-磷酸-糖构成螺旋
主链 B、两条链的碱基都位于中间,碱基平 面与螺旋轴垂直
C、两条链对应碱基呈配对关系
A=T
G≡C
D、螺旋直径 20A,螺距 34A,
每一螺距中含 10 bp
DNA 双螺旋可以看作是 DNA 的二级结构 ,DNA 的三级结构的形成需要蛋白质帮助。
(3) 胆固醇是细胞的必要成份
(4) 血清中的胆固醇太多会促使形 成动脉硬化 和心脑血管疾病
哇!
终 于 结 束 了 。 。 。
葡萄糖---水溶性的
油 脂---脂溶性的
脂质种类很多,分子结构相差较大 A、油脂:甘油三脂 B、磷 脂 C、固 醇
甘 油 三 酯 分 子 结 构
磷 脂 分 子 结 构
磷脂分子可以 看成是一个极性 头,两条非极性 尾巴。
(1) 固醇类的内核由 4 个环组成 (2) 一些人体重要维生素和激素是固醇
(1) 游离态,调节细胞的渗透压、PH值;
(2) 合成有机体的原料; (3) 与有机物质结合,组成具有特殊性质的蛋 白质或作为酶的辅助因子,参与代谢活动。
3)单糖
多羟基醛或多羟基酮及其缩合物和某些衍生物称为糖。
(葡萄糖结构式)
天然单糖 大多数是 D-型糖
C1上羟基位置不同 时出现α-,β-两 种构型
如:α-螺旋和β-折叠
蛋白质的三级结构是指整条肽链盘绕
折叠形成一定的空间结构形状。如纤 维蛋白和球状蛋白。 蛋白质的四级结构是指各条肽链之间
的位置和结构。所以,四级结构只存
在于由两条肽链以上组成的蛋白质。
一级结构
二级结构
α-螺旋
β-折叠 三级结构
四级结构
血红蛋白质的三级结构和四级结构
2)、 维持生物大分子高级结构的重要因
麦 芽 糖 的 结 构
(2)淀粉和纤维素都由葡萄糖组成,它们 之间主要区别在于α-糖苷键和β- 糖苷键的区别 (3)注意:多糖链也有方向性,有还原
端和非还原端
糖原
淀粉
纤维素
3)、核苷酸通过磷酸二酯键联成核酸
(1) 核酸链也有方向性 (2) DNA 和 RNA 在组成成份上有差别 DNA 脱氧核糖 有胸腺嘧啶, 无尿嘧啶 RNA 核糖 有尿嘧啶, 无胸腺嘧啶
第二章:生命的化学基础
一、原子和分子
1. 组成生命的化学元素
在自然界的130种元素中, 以O、Si、Al、Fe为最多, 而生物体中仅有25—26种是必须的, O、H、C、N普遍存 在, P、S、Na、K、Mg、Ca、Cl等为主要元素。
由上述元素构成化合物,形成小分子和大分子物质
细胞的化学组成
生物小分子: 生物大分子:
大分子分解 (水 解)
2、构成生物的小分子
1)水 游离水和结合水
60% —90%的重量
水占生物体的
地球上生命起源于水中,陆生生物
体内细胞也生活在水环境中
水的性质影响生命活动,如:水分子的极性,
水分子之间的氢键,内聚力、溶解性质,电
离性,pH
2)无机盐:
存在方式:一般都以离子状态存在
作 用:
氨基酸的α碳原子为手性碳原子,根据旋光性的不 同,左旋和右旋氨基酸分别命名为L- α-氨基酸(左旋) 和D- α-氨基酸(右旋),两者之间互为镜像体。 生物界种的各种蛋白质(除一些细菌的细胞壁中的短
肽和个别抗生素外)几乎都是由L- α-氨基酸所构成;
含D- α-氨基酸的极少。
氨基酸的功能:
(1)作为组建蛋白质的元件 (2)有的氨基酸或其衍生物具 有生物活性(代谢调节、信号传递等)
5)核苷酸(组成核酸的结构单位)
核苷酸分子由三个部分组成:
碱基:嘌呤(双环分子)、 嘧啶(单环分子) 戊糖:RNA为核糖、DNA为脱氧核糖 磷酸:
DNA的碱基是: A、T、G、C RNA的碱基是: A、U、G、C
脱氧核糖或核糖 上第1’位碳原子 与嘌呤或嘧啶结 合,就成为脱氧 核苷或核苷;第5’ 位碳原子在与磷 酸结合,就成为 脱氧核糖核苷酸 或核糖核苷酸。
定的三维空间构象。
寡肽:含有 10 左右氨基酸残基
(如二肽、五肽、八肽)
多肽:含 10-20 个氨基酸残基
蛋白质:含几十个氨基酸残基
注意:肽链分子的两端有自由的α氨基或α羧基,
有方向性,分别成为氨基末端( N-末端)和 羧基
末端( C-末wk.baidu.com);
肽链的顺序方向定义为从氨基端到羧基端的方向
一个氨基酸的羧基和另一个 氨基酸的氨基脱水缩合形成肽键