全国细菌耐药监测网上传数据标准(试用版)

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此字段要求 100%必填字段,最长 3 个字符。 (1)不带任何后缀的 1~3 位整数或者 2 位数字+"y"后缀,代表年龄是按岁计算。 (2)2 位数字 + "d" 即代表年龄按天计算。 (3)2 位数字 + "w" 即代表年龄按周计算。 (4)2 位数字 + "m" 即代表年龄按月计算。 (5)空值或其它字符,系统会认为是非法值,需补充修改后才能上报。 9、年龄类别 PAT_TYPE 非必填字段,系统会根据年龄 AGE 自动生成该字段,即使是数据中已经填写了该 值系统也会强制替换,若要填写,则该字段长度必须为 3 位字符,具体的计算规则如 下: 1) 当 AGE 后缀为“d”代表“天”时: A. <=28,生成“new”代表“新生儿”; B. >28,生成“ped”代表“儿童”; 2) 当 AGE 后缀为“w”代表“周”时: A. <=4,生成“new”代表“新生儿”; B. >4,生成“ped”代表“儿童”; 3) 当 AGE 后缀为“m”代表“月”时: A. 0,生成“new”代表“新生儿”; B. >=1,生成“ped”代表“儿童”; 4) 当 AGE 为纯数字,代表“岁”时: A. 0,生成“unk”代表“不明”,需修正后才能上报; B. >=1 并且<=14,生成“ped”代表“儿童”; C. >=15 并且<=65,生成“adu”代表“成人”; D. >65,生成“ger”代表“老年”。 10、科室(送检科室)WARD 为非必填项,最大长度为 15 字,中英文不限。 11、科室类别 WARD_TYPE 为 100%必填项,最大长度为 3 个字,必须与 WHONET 内置的代码要求一致,见附 表(1)。 12、专业类别 DEPARTMENT 为 100%必填项,最大长度为 6 个字,中英文不限(WHONET 默认长度为 3),此字 段所填写的值,必须在用户系统设置的本院科室代码字典库中(科室代码设置见第一 条)。未在字典库中的科室代码为非法值,无法通过系统校验,当数据上传成功后, 系统会自动将此字段中的本院科室代码替换为系统内置的标准科室分类代码,系统内 置的标准科室分类代码见附表(2)。 13、标本类型数字代码 SPEC_TYPE 和英文代码 SPEC_CODE 不要求两者都完整,只要有其中一项即可,系统会根据其中一项自动补齐另一项。 英文代码必须是 2 字符,数字代码最大 3 字符,两个字段都分别有自己的标准代码库 (同样源自 WHONET 数据库,见附表 3)。如果两者都有,但不匹配的例如痰标本的英 文代码为“sp”,数字代码应该为“3”,如果填写了其它数字代码,系统会给出提示, 要求修正不匹配的数据后再次上传。超出附表内的标本类型系统视为非法值,需修正 后才能上报数据。另外,当标本类型为质控标本(即 SPEC_TYPE 为 qc 或者 ex,并且 SPEC_CODE 为 75 或 99)时,系统会给出提示并自动忽略该条数据。 14、标本编号 SPEC_NUM 字段
SPEC_CODE 数 字代码 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54
全国细菌耐药监测网信息系统
数据上报标准(试用)
全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统”收集所
有成员单位的耐药监测数据,系统具备完善的数据筛选和容错处理功能。
一、科室代码设置 监测网成员单位首次登录时须先在本院科室维护栏内登记注册医院临床科室并 将其映射至系统所要求的标准科室分类上,科室代码为上报数据中 DEPARTMENT 字段 中保存的代码,也可以设置成系统内置的标准科室代码,此代码可为数字代码、英文 代码或中文名,最多允许 15 个字符(不区分中英文),设置后可随时增加和修改。上 传的数据文件格式为 Whonet 5.6 的通用文件格式,后缀必需为“.dbf”(系统未来可 能会支持 Excel 表格与 Csv 平面文本文件)。 二、数据文件各字段要求 1、来源 ORIGIN 非必填字段,最长 1 个字符。若填写,则其必须为“h”,若不填写,数据上传后 系统会自动补充,若填写值不为“h”,系统将自动替换成“h”。 2、国家 COUNTRY_A 非必填字段,最长 3 个字符。若填写,则其必须为“CHN”,若未填写,数据上传 后系统会自动补充。 3、医院 INSTITUT 非必填字段,为卫生部统一分配的标准代码,标准 6 字符,前两位为国家标准省 级代码(如北京为 11,云南为 53 等),后 4 位为各省编码(从 0001 开始),如昆明 医科大学第一附属医院可能为(530001),若未填写,数据上传后系统自动补充已注 册的医院标准代码,若填写则必须与本院的代码一致,否则系统会自动替换为正确代 码,在数据上传时此字段不建议填值。 4、实验室 LABORATORY 非必填字段,最长 3 个字符。系统不再将此作为医院标识,无具体格式要求,在 数据上传时此字段不建议填值。 5、病历号 PATIENT_ID 必填字段,要求至少填写总数据量的 90%(住院病人要求全部填写,其余 10%对 应门诊无病历号的数据),最长 16 字符。 6、姓氏 LAST_NAME 和名字 FIRST_NAME 以上两项只需有一项且必需有其中一项正确填写,最长 12 各个字符(即 6 个中 文字符),此两项任意一项须 100%填写。 7、性别 SEX 此字段要求 100%必填,最长 1 个字,WHONET 要求只能填写“f”或者“m”,系统 提供了相关的容错处理机制,允许填写“男”和“女”,系统会自动将“男”替换成 “m”,将“女”替换成“f”。 8、年龄字段 AGE
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100%必填字段,最大长度 12 字。 15、检验结果(细菌)ORGANISM 100%必填字段,标准 3 位英文字符代码,此代码为 WHONET 5.6 标准细菌代码; 系统仅接受附表(4)所列出的细菌,不接受真菌,支原体,厌氧菌和分枝杆菌等。 附表(4)所规定的标准代码外的数据,系统会给出提示并自动忽略该条数据。 16、细菌类别 ORG_TYPE 系统仅接受革兰阳性菌“+”和革兰阴性菌代码“-”,最大允许 1 字符,此字段 可不填写。当系统发现未填写时会自动根据 ORGANISM 字段的值推导出来,当系统发 现本字段中填写的值与系统所推导的合法值不匹配的时候,会自动将其替换成合法 值。 17、β-内酰胺酶 BETA_LACT 非必填字段,1 字符,且值仅能为“+”或“-”,若填写为“n”、“ne”、“neg”、 “negative”或者中文全角“+”,系统会自动将其修正为半角英文“+”,若填写为 “p”、“po”、“pos”、“positive”或者中文全角“-”,系统会自动将其修正为半角 英文“-”。 18、超广谱β-内酰胺酶 ESBL 规则同上。 19、耐甲氧西林葡萄球菌检测试验 MRSA_SCRN 规则同上。 20、诱导型克林霉素耐药试验 INDUC_CLI 规则同上。 21、霍奇试验 HODGE 非必需字段,规则同上。 22、碳青酶烯酶 CARBAPENEM 规则同上。 23、送检日期(标本日期)SPEC_DATE 为 100%必填字段,格式为 2013/10/13 或者 2013-10-13,必须为 10 字符,若为 其它格式,系统自动修正为 yyyy-mm-dd 格式。 24、报告日期(数据录入日期)DATE_DATA 为非必填字段,规则同上。 25、抗生素 所有抗生素代码采用 Whonet 5.6 标准代码。抗生素代码见附表(5)。 1) 纸片法(K-b 法):代码须包含抗生素含量,如填写结果只能为 6 至 80 之间的
SPEC_NUM 英 文代码 no th sp br ea ey mo sk jt uc ur bl sf lu ab ga dr fl bi wd sw as ps am tr si sb at fn og cx um va bx ti bn he hv li st re mu ha ar ax co em eo fi gn gm gf pl
far Farm(农场)
fie Field(野外)
sto Store/Market(商店/超市)
res Restaurant(饭店)
zoo Zoo(动物园)
mix 混合
unk 未知(不明来源)
oth 其他(来源明确但不属于上述任何一种情况)
wenku.baidu.com
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附表 2. 系统内置标准科室代码表
(待定)
附表 3. SPEC_TYPE 与 SPEC_CODE 对照表
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附表 1. WARD_TYPE 代码表 代码 out 门诊病人
含义
in 住院病人
inx 住院病人(非-ICD)
icu 重症监护病房
int 过度监护病房
eme 急诊
nur 家庭护理
com 社区
hos 其它医院
lab 实验室
aba Abattoir(屠宰场)
vet Veterinary clinic(兽医诊所)
整数,不能是小数,也不能带任何符号,否则视为填写错误,系统会将该值 忽略,这会影响该列的通过率。 2) MIC 法:如果填写,则长度不能超出 6 个字符,否则视为填写错误,系统会将 该值忽略,这会影响该列的通过率。填写规则: A. 不接受 S、I、R,若填写 S、I、R 视为填写错误,系统会将该值忽略,这会 影响该列的通过率。 B. 数字为半角纯数字,可为小数,不允许出现全角数字,否则视为填写错误, 系统会将该值忽略,这会影响该列的通过率。 C. 允许带>、>=、<、<=的数字,例如:<=1、>=4 等。 D. 允许带“/”分隔符的格式,例如:64/4,上传后系统自将“/”后面的字符 含“/”一起删除掉,仅保留“/”前面的字符。
名称
鼻腔拭子 咽拭子 痰 支气管分泌物 耳部标本 眼分泌物 口腔拭子 皮肤拭子 关节拭子 导尿管尿 尿液 血液 脑脊液 肺穿刺液 腹水 胃液 排泄物 液体 胆汁 伤口拭子 外科手术伤口拭子 脓肿 脓液 羊水 气管插管 窦道拭子 棉签 吸气管 无菌体液 器官 宫颈拭子 脐带标本 阴道拭子 活检组织 组织 脑部组织 心脏标本 心脏瓣膜 肝脏穿刺液 粪便 直肠拭子 肌肉标本 手部拭子 手臂拭子 腋窝拭子 结膜拭子 中耳拭子 外耳拭子 瘘管 生殖器拭子 男性外生殖器拭子 女性外生殖器拭子 胎盘组织
的数据,不予保存。 4) 本系统目前抗菌药物敏感性执行标准为 CLSI M100-S23,上传数据如果有未达
到该折点标准的数据,系统会将该组数据中的未达到 CLSI M100-S23 标准的 抗生素结果忽略。如某一抗生素,CLSI M100-S23 折点为 S:<=2,I:4-8,R:>=16, 测定结果为<=8,这样的数据系统无法判断是敏感还是中介,系统会自动将该 组数据中的这个抗生素结果忽略掉,不予保存,不影响通过率。 2014 新版细菌耐药监测信息系统具备了强大的数据容错处理功能,能将上传 的不合格数据自动修正或删除,处理为合格的数据文件,同时具备一定的学习功 能,用户可以下载经容错处理后的数据发现并纠正错误,不断改进,提高数据质 量,同时可将修正后数据用于本机构细菌耐药监测统计分析。
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E. 允许结果“SYN-S”、“SYN-R”,上传后系统自动将 GEH_NM 结果为 SYN-S 替换 为<=500,SYN-R 替换为>=1000;将 STH_NM 结果为 SYN-S 替换为<=1000,SYN-R 替换为>=2000。 F. 关于复方新诺明(SXT_NM)结果,上传后系统自动将数据为 320 的字符替换 为 16,160 替换为 8,80 替换 4,40 替换为 2,20 替换为 1,10 替换为 0.5,其 余字符保持原始数据。 G. 系统会将数据中出现的一些特殊字符替换为合法字符,具体如下: a) 全角“≧”或“≥” 将替换为半角“>=” b) 全角“≦”、“≤” 将替换为半角“<=” c) 全角“>”将替换为半角“>” d) 全角“<”将替换为半角“<” e) 全角“=”将替换为半角“=” f) 全角“.”与“。”将替换为半角“.” 3) 在数据中若出现未在附表(5)中的其它抗生素字段,系统会自动忽略该字段
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