名词解释
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固定相和流动相:
级联放大作用:
由于酶的共价修饰反应是酶促反应,只要有少量的信号分子(如激素)存在,即可通过加速这种酶促反应,而使大量的另一种酶发生化学修饰,从而获得放大效应,这种调节方式快速,效率极高。
蛋白质超二级结构:
在蛋白质分子中,特别是球状蛋白质中,由若干相邻的二级结构单元(即α-螺旋,β-折叠片和β-转角等)彼此相互作用组合在一起,形成有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体,充当三级结构的构件单元,称超二级结构。
肽平面:
组成肽键的四个原子及与之相连的两个α-碳原子都处在同一个平面内,这个刚性平面称为肽平面。
酶的国际单位:
1个酶活力单位是指在特定条件下,在1min内能转化1u mol底物的酶量。
测定条件为250C和其他最适条件,该单位为国际单位。
RAPD:
随机扩增多态性。
其方法是用一个随机核苷酸序列为引物对基因组DNA进行PCR扩增,产生不连续的DNA产物,再通过凝胶电泳来观察扩增片段的多态性,获得特异分子标记。
c DNA文库:
将细胞全部mRNA反转录成cDNA并被克隆的总和成为c DNA文库。
DNA拓扑异构体:
天然DNA均呈超螺旋结构,其环数是超螺旋的一个参数,除环数不同外,其他性质(如大小、一级结构等)完全相同的DNA分子成为拓扑异构体。
Na+ .K+—ATPase:
钠钾ATP酶,动物细胞存在于质膜上的一种酶,该酶利用ATP水解把Na+迸出,而把K+泵入细胞。
它是维持细胞膜电位的重要装置。
钙调蛋白:
CaM是一种特殊的钙结合蛋白质,广泛存在于各种细胞中,它是由148个氨基酸残基组成的一条多肽链,以单体形式存在。
CaM有4个Ca+结合位点,当没有结合Ca+时,以无活性的形式存在。
当CaM与Ca+结合后,构象发生变化,变成有活性的Ca+—CaM复合物。
此复合物可以以两种形式调节生理活动:1、直接与靶酶起作用;2、通过激活依赖Ca+—CaM的PK起作用。
蛋白质组学:
研究某一物种、个体、器官、组织及细胞中全部蛋白质,获得整个体系内所有蛋白质组分的生物学和理化参数,揭示生命活动规律的一门学科。
限制性内切酶:
原核生物中存在着一类能识别外源DNA双螺旋中4-8个碱基对所组成的特异的具有二重螺旋对称性的回文序列,并在此序列的某位点水解DNA链,产生粘性
末端或平末端,这类酶称为限制性内切酶。
同工酶:
从不同种属或同一种属、同一个体的不同组织或同一组织的同一细胞中获得的具有不同分子形式却催化相同化学反映的一组酶叫做同工酶。
又可分为原级同工酶和次级同工酶,由酶蛋白编码基因不同而产生的同工酶叫做原级同工酶,由基因转录产物mRNA或者翻译产物经过不同的加工过程产生的同工酶叫做次级同工酶。
AFLP:
扩增片段长度多态性。
是RFLP和PCR技术相结合产生的一项新技术,用限制性内切酶消化基因组DNA,由于不同材料的DNA的酶切片段存在差异,用特定引物选择性的扩增基因组限制性酶切片段,再用凝胶电泳分离就可以观察基因组DNA的多态性。
G-蛋白:
一般是指一类与膜受体偶联的异三聚体结合蛋白质,其具有和GTP结合并催化GTP水解成GDP的能力,由α、β、γ三个亚基组成,可充当细胞膜上受体和靶酶之间的信号传递体。
DNA双螺旋多态性:
在多核苷酸链中,脱氧核糖的五元环能折叠成多种构象,此外,分子还可以绕C-N糖苷键以及3’,5’–磷酸二脂键旋转一定的角度,这就使具有同样碱基配对的DNA双螺旋可以采取另一些构象,DNA构象上的这种差异成为多态性。
PAGE
sanger反应:
在弱碱性溶液中,氨基酸的α-氨基易与2,4-二硝基氟苯(DNFB)反应,生成黄色的二硝基苯氨基酸(DNP-AA),此反应最初被sanger用于测定N-末端氨基酸,又被称为sanger反应。
Ribozyme:
对RNA有催化活性的RNA
顺反子:
遗传学上将编译一个多肽的遗传单位称为顺反子。
引发体:
引物酶与相关蛋白质结合成的一个有活性的复合体叫做引发体。
分子病:
由于基因突变导致蛋白质一级结构发生变异,使蛋白质的生物学功能减退或丧失,甚至造成生理功能的变化而引起的疾病,称为分子病。
增色效应与减色效应:
当DNA的双螺旋结构发生解体时,两条链分开,形成无规则线团,一系列理化性质也随之发生改变,260nm紫外吸收值升高,此效应称之为增色效应。
反之,
由于DNA有规则的双螺旋结构中的碱基紧密的堆积在一起而造成的260nm紫外吸收值降低,此效应称之为减色效应。
固定化酶:
将酶从微生物细胞中提取出,将其用固定支持物(称为载体)固定,使其成为不溶于水或不易散失和可多次使用的生物催化剂,这种固定的酶称为固定化酶。
解偶联作用:
在完整线粒体内,电子传递与磷酸化是紧密偶联的,当使用某些试剂而导致的电子传递与ATP形成这两个过程分开,只进行电子传递而不能形成ATP的作用,称为解偶联作用
亲和层析:
利用共价连接有特异配体的层析介质,分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白质或其他分子的层析技术。
信号肽/导肽:
二者都是新生肽链N-端的一段核苷酸序列。
信号肽含10到20个疏水氨基酸,合成后即可特异被SRP识别,并将核糖体引导到内质网停泊蛋白上继续翻译。
肽链前端进入内质网腔后,信号肽即被切除。
边合成边转运!
导肽富含碱性和疏水氨基酸,这导致它既亲水又疏水,利于穿越脂双层。
同时带正电的头更利于顺跨膜电势穿膜。
跨膜后被切除。
先合成后转运!
Km/Tm
Km为米氏常数,是酶的特征物理常数,Km值是反应速度为最大速度一半时的底物浓度,单位mol/L或m mol/L
Tm是热变性过程中光吸收达到最大吸收(完全变性)一半(双螺旋结构失去一半)时的温度,单位为0C
DNA文库/c DNA文库
整套由基因组DNA片段插入克隆载体获得的分子克隆之总和叫做基因文库。
将细胞全部mRNA反转录成cDNA并被克隆的总和成为c DNA文库
超二级结构/结构域
超二级结构是指多态链上若干相邻的构象单元(如α-螺旋,β-折叠,β-转角等)彼此作用,进一步组合成有规则的结构组合体。
结构域指存在于球状蛋白质分子中的两个或多个相对独立的,在空间上能辨认的三维实体,每个有二级结构组合而成,充当三级结构的构件,其间由单肽链连接。
主动运输/被动运输
凡是物质逆浓度梯度的运送称为主动运输,这一过程的进行需要能量。
凡是物质顺浓度梯度的运送叫做被动运输,这一过程是自发的,无需能量。
PCR/RAPD
PCR,聚合酶链式反应,又称体外基因扩增。
该法模拟体内DNA的复制过程,首先使DNA变性,两条链分开,然后是引物模板退火,二者碱基配对,DNA聚合酶随即以4种dNTP为底物,在引物的引导下合成与模板互补的DNA新链。
重复此过程,DNA以指数方式扩增。
引物为特定引物。
RAPD,随机扩增多态性。
其方法是用一个随机核苷酸序列为引物对基因组DNA 进行PCR扩增,产生不连续的DNA产物,再通过凝胶电泳来观察扩增片段的多态性,获得特异分子标记。
化学酶工程/生物酶工程
化学酶工程又称初级酶工程,指的是天然酶、化学修饰酶、固定化酶及模拟酶的研究和利用。
生物酶工程又称高级酶工程,是酶学与以DNA重组技术为核心的生物技术相结合的产物,主要涉及基因工程技术大量制备酶(克隆酶)、对酶基因进行修饰,产生遗传修饰酶(突变酶)、设计新的基因,合成自然界不曾有的新酶。
胞间信号/胞内信号
二者是按照作用范围来分的
当环境刺激的作用位点与效应位点处于生物体的不同部位时,需要作用位点细胞产生信号,传递给效应位点,引起细胞反应。
这个作用位点细胞产生的信号就是胞间信号,也称为第一信使。
胞内信号是胞间信号由膜上信号转换系统产生的,有调节活性的细胞内因子,也称为第二信使。
HGP
人类基因组计划,由多国政府支持的一个国际项目,即测定人类基因组的全部DNA序列,从而解读所有遗传密码,揭示生命的所有奥秘。
RFLP
限制性片段多态性,由限制性内切酶把很大的DNA分子降解成许多长短不同的较小片段,其数目和长度反映了限制性内切酶的切点在DNA分子上的分布,它能作为某DNA或含这种DNA生物所特有的“指纹”,不同个体的等位基因之间碱基代换、重排、插入、缺失等都会引起这种“指纹”的多态性。
K cat 型抑制剂
该类抑制剂与底物结构类似,但分子中还有潜伏的反应基团。
当它与底物结合后,其潜伏的反应基团被酶催化而活化,并立即与酶活性中心某基团呈不可逆结合,使酶遭受抑制。
此类抑制剂亦称酶的自杀性底物。
信号肽
常指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移(定位)的N-末端氨基酸序列(有时不一定在N端)。
化学渗透学说
电子传递的自由能驱动H+从线粒体基质跨过内膜进入到膜间隙,从而形成H+
跨线粒体内膜的电化学梯度,这个梯度的电化学势(Δ H+)被膜上的ATP-ase 利用,驱动ATP的合成。
拓扑异构酶
通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二脂键,然后重新纠缠和封口来改变DNA连环数的酶。
分子伴侣
这是一类可以介导蛋白质正确折叠与装配,但其本身并不构成被介导的蛋白质组成部分的一类蛋白因子,在原核生物和真核生物钟广泛存在。
生物传感器
用固定化生物成分或生物体作为敏感元件的传感器称为生物传感器,由分子识别部分(敏感元件)和转换部分(换能器)构成,前者是作为信息供体的生物学识别系统,专一地识别基质并给出特定信息,后者由电、光或热的信息转换器构成的生物识别系统,感觉到前一部分给出的信息,测出其大小,再换算成原来物质的量或浓度。
受体
受体是细胞表面或细胞组分中的一种天然分子,可以识别并特异地与有生物活性的化学信号分子(配体)结合,从而激活或启动细胞内一系列生物化学反应,最后导致该信号物质特定的生物效应。
绝大多数受体为蛋白质,极少数为非蛋白质受体。
超螺旋DNA
DNA双螺旋的弯曲欠旋(负超螺旋)或过旋(正超螺旋)的结果。
.蛋白质的可逆磷酸化
在信号转导过程中,蛋白质的可逆磷酸化是生物体内的一种普遍的翻译后修饰方式,蛋白质磷酸化与脱磷酸化分别由蛋白激酶和蛋白磷酸酶催化完成,前者催化ATP或GTP的磷酸基团转移到底物蛋白质的氨基酸残基上,后者催化逆转的反应。
酶联免疫分析法
酶联免疫分析法是将酶作为标记物质,使之与抗原(或抗体)结合形成酶与抗原(或抗体)复合物,然后再根据待测抗体(或抗原)与复合物专一且定量的结合关系,通过测定与待测抗体(或抗原)结合的标记酶活力,从而计算出抗体或抗原的量。
deoxyribozyme
脱氧核酸酶,是利用体外分子进化技术合成的一种具有催化功能的单链DNA片段,具有高效的催化活性和结构识别能力。
肽核酸:
肽核酸是一种以中性酰胺键为骨架并兼有多肽和核酸性质的独特化合物,不能被蛋白酶和核酸酶所降解,可以高度亲和并序列特异地与DNA和RNA 结合,而
且形成的杂交复合物具有相当高的热稳定性以及独特的耐离子强度变化性质。
prion
朊病毒,是一类高度保守的糖蛋白,其广泛表达于脊椎动物,且与神经系统功能的维持、淋巴细胞信号转导、核酸代谢等有关;当其发生构象改变之后可变成致病性朊病毒(PrP sc),PrP sc 可引起包括疯牛病在内的一系列致死性神经变性疾病(统称prion病)。
足迹法(footprint)
是一种利用蛋白质和DNA特异结合的方法,DNA某段序列被蛋白质结合后被修饰而不会断裂或免受DNase的分解,然后和无蛋白质结合的DNA分别进行测序,就可以得到被蛋白质保护的片段究竟包含了哪些碱基对的排序。
光合磷酸化与氧化磷酸化
光合磷酸化是指在叶绿体ATP合成酶的催化下依赖于光的由ADP和Pi合成ATP 的过程。
氧化磷酸化是指电子从一个底物传递给分子氧的氧化与酶催化的由ADP和Pi生成ATP相偶联的过程。
SDS-PAGE
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,在去垢剂SDS(十二烷基硫酸钠)存在下的聚丙烯酰胺凝胶电泳,当SDS与蛋白质结合后,蛋白质分子即带有大量的负电荷,并远远超过了其原来的电荷,从而使天然蛋白质分子间的电荷差别就降低乃至消除了,与此同时蛋白质在SDS作用下结构变得松散,形状趋向一致,所以各种SDS-蛋白质复合物在电泳时产生的脉动率差异,就反映了分子量的大小。
抗体和抗原:
当外源物性物质,如蛋白质、毒素、糖蛋白、脂蛋白、核酸、多糖、颗粒(细菌、细胞、病毒)进入人或动物体内时,机体的免疫系统便产生相应的免疫球蛋白,并以之结合,以消除异物的毒害。
此反应称为免疫反应,此异物便是抗原,此球蛋白便是抗体。
多克隆抗体和单克隆抗体
如果给动物注射抗原,虽然抗原与各种抗体产生细胞的亲和性有所不同,但是还是有大量抗体产生细胞将与之结合,结果血液中出现的抗体源于数种不同的细胞克隆,这些抗体就是多克隆抗体。
如果可以分离到抗体产生细胞的单克隆,然后使所有的抗体均来自同样的克隆,这样制备的抗体称为单克隆抗体。
活性肽:
在生物体中,多肽最重要的存在形式是作为蛋白质的亚单位,有许多分子量比较小的多肽以游离状态存在,这类多肽通常都具有特殊的生理功能,常称为活性肽。