鸽过氧化物还原酶基因的克隆与进化分析
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ＡＧＡ ＡＡＣ ＴＴＴ ＡＴ Ｇ ＧＡＧ ＡＴＣ ＣＴＧ ＡＧＡ ＧＴＧ ＧＴＧ ＧＡＣ ＴＣＣ ＣＴＧ ＣＡＧ ＣＴＧ ＡＣＡ ＧＣＡ
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Ｙ Ｋ Ｋ Ｖ Ａ Ｔ Ｐ Ｖ Ｄ Ｗ Ｋ Ｐ Ｇ Ｄ Ｓ Ｖ Ｍ
ＧＴＣ ＧＣＡ ＣＣＣ ＡＣＣ ＴＴＡ ｅＣＴ ＧＡＴ Ｇ ＧＡＡ ＡＧ ＧＣＣ ＡＡＧ ＡＡＧ ＣＴ Ｃ ＴＴＴ ＣＣＣ ＡＡＡ ＧＧＡ Ｖ Ａ Ｐ Ｔ Ｌ Ｐ Ｄ Ｅ Ｅ Ａ Ｋ Ｋ Ｌ Ｆ Ｐ Ｋ Ｇ
选 用 Ｃ ｕｔｌ 和 Ｍｅａｖｒｉ ． 种 分 子 ｌｓ ａｗ ｇ ｅｓ ｎ４０两 ｏ
ＧＣＣ ＣＴＴ ＴＣＣ ＡＴ Ｔ Ｇ ＡＧＴ ＡＣ ＧＴＣ ＣＡＡ ＧＡＣ ＣＡＣ ＣＴＣ ＴＣＣ ＴＧＧ ＡＧＣ ＡＡＧ ＧＡＣ ＡＴＣ
Ａ Ｌ Ｓ Ｎ Ａ
Ｉ Ｄ Ｓ Ｎ Ｇ
根系统发育树（ ０ ０ １ ０ 次抽样） 结果见图 ２ 。其 中鸽
子、 、 鸡 斑胸草雀首先聚在一起 ， 与啮齿类动物、 草 食动物 、 灵长类动物的遗传距离逐渐增大 ， 而鸭嘴
ＧＴＣ ＴＴＣ ＡＣＧ ＡＡＧ ＡＡＣ ＣＴＣ ＣＣＡ Ｔ ＧＧＣ ＡＣ ＡＡＧ ＡＡＧ ＴＡＣ ＣＴＧ ＣＧＴ ＴＡＣ ＡＣＣ ＣＣＧ
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Ｅ Ｑ
Ｅ Ｌ
Ｍ Ｐ Ｇ Ｌ
仅 ３ ｐ ３ ，结果见图 １ ｂ 。拼接后 的序列经 ＣｕｔＷ ｌｓ ｌ ａ
排序 ， 并用 Ｍ Ｇ ｅ ｉ ． Ｅ Ａｖｒｏ ４ ｓ ｎ ０转换格式后 ， 计算序
列的碱基组成 ，所得到的 Ｐｘ ｒ 基因中 Ａ、 、 Ｔ ｃ和 Ｇ
碱 基 平 均 含 量分 别 为 ２ ． ３ ５％ 、８ ７％ 、０３ ８ １． ６ ３． ７％
Ｗ Ｇ Ｉ
ＣＴＣ ＴＴＣ ＴＣＴ ＣＡＣ ＣＣＧ ＡＧＧ ＧＡＣ ＴＴＣ ＡＣＧ ＣＣＣ ＧＴＣ ＴＧＣ ＡＣＣ ＡＣＴ ＧＡＧ ＣＴＴ ＧＧＣ Ｔ Ｐ Ｖ Ｃ Ｙ Ｔ Ｅ Ｌ Ｇ
ＣＧＧ ＧＣＧ ＧＣＡ ＡＡＧ ＣＴＧ ＧＣＡ ＣＣＣ ＧＡＧ ＴＴＣ ＡＧＧ ＡＡＧ ＣＧＣ ＡＡＣ ＧＴＧ ＡＡＧ ＡＴＧ ＡＴＣ
一
６ ８一
＠ 目卜技 一 禽 学 轱占 考
Ｌ Ｌ Ｇ Ｄ Ｅ Ａ Ｐ Ｎ Ｆ Ｅ Ａ Ｅ Ｔ
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Ａ （ ｊ ＣＣＧ ＧＧＣ ＣＴＧ ＣＴＧ ＣＴＧ ＧＧＣ ＧＡＣ ＧＣＧ ＣＣＣ ＡＡＣ ＴＴＣ ＧＡＧ ＧＣＧ ＧＡＧ ＡＣＣ
Ｅ Ｏ Ｄ
Ｋ Ｄ
Ｇ
Ｍ Ｐ Ｌ
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Ｒ Ｖ Ｖ
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Ｆ
生物学软件对 Ｐｘ 因氨基 酸序 列与 １ 种脊椎 ｒ基 １ 动物的 Ｐｘ ｒ 基因 ｃ Ｎ Ｄ Ａ序列进行 比对 ，并用 Ｍ ｇ ｅａ ｖ． ４０软件进 行 聚类分析 ，２种不 同的脊 椎动 物 １
Ｒ Ａ Ａ Ｋ Ｌ Ａ Ｐ Ｅ Ｆ Ｒ Ｋ Ｒ Ｎ Ｖ Ｋ Ｍ Ｉ
和 ２．１ ，其 中 Ａ Ｔ的含量为 ５ ． ７１ ％ ＋ ７ ８％，高于 ４
Ｇ Ｃ含量 ４ ． ＋ ２ ２％。 ５ 就每个氨基酸密码子来看 ， 碱 基组成在不 同位点差异较大。
２２ 不 同物种 Ｐｘ 因 ｃ Ｎ － ｒ基 Ｄ Ａ序 列的 聚 类分 析
Ｐｘ 因基 于氨 基 酸序 列 的 Ｎ （ ｉ ｂｒｊ ｎ ｇ ｒ基 Ｊ ｅ ｈｏ ｏ ｉ ） ｎ ｇ — ｉ ｎ 无
ＧＧＣ ＣＣＡ ＧＡＴ ＡＡＧ ＡＧ Ａ ＣＴＧ ＡＡＡ ＣＴＣ ＴＣＣ ＡＴＣ ＣＴＧ ＴＡＣ ＣＣＡ ＧＣＣ ＡＣＣ ＡＣＴ ＧＧＧ
Ｇ Ｐ Ｄ Ｋ Ｋ Ｌ Ｋ Ｌ Ｓ Ｉ Ｌ Ｙ Ｐ Ａ Ｔ Ｔ Ｇ
Ｖ Ｆ Ｔ Ｋ Ｎ Ｌ Ｐ Ｓ Ｇ Ｋ Ｋ Ｙ Ｌ Ｒ Ｙ Ｔ ｐ
ＣＡＧ ＣＣＡ ＧＡＧ ＴＧＡ ０ Ｐ Ｅ
兽孤立形成一条分支 ， 说明鸭嘴兽的物种特殊性 。
Ｅ Ｅ Ｌ
Ｇ
Ｐ Ｆ
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ＧＣＴ ＧＡＴ ＧＣＣ ＡＣＣ ＣＧＧ ＧＡＧ ＣＴＴ ＧＣＴ ＧＴ Ｃ ＡＡＧ ＣＴＧ ＧＧＣ ＡＴＧ ＣＴＧ ＧＡＣ ＣＣ Ａ ＧＡＴ
Ａ Ｄ Ａ Ｎ Ａ Ｖ Ｋ Ｌ Ｄ Ｐ Ｄ
ＧＡＡ ＣＡＧ ＧＡＣ ＡＡＧ ＡＴ Ｇ ＧＧＧ ＡＴＧ ＣＣＣ ＣＴＧ ＡＣＧ ＧＣＴ ＣＧＴ ＧＴＧ ＧＴＧ ＴＴＣ ＡＴＴ ＴＴＴ
ＡＣＧ ＣＡＧ ＧＧＣ ＣＧＣ ＡＴＣ ＣＧＣ ＴＴＣ ＣＡＣ ＧＡＣ ＴＴＣ ＣＴＧ ＧＧ Ａ ＧＡＣ ＴＣＡ ＴＧＧ ＧＧ Ｃ ＡＴＣ
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