分子生物学常用名词解释
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分子生物学常用名词解释
常用缩写
bp=base pair(s)
nt=nucleotide(s)
CTD=c-terminal domain
NTD=n-terminal domain
CAP=cAMP binding site
=catabolite Activator Protein代谢产物激活蛋白
UTR=untranslated region
RBS=ribosome binding sequence
Inr=initiator
DPE=downstream promoter elements
ORF=open reading frame
snRNA=small nuclear RNA
snRNP=small nuclear ribonucleoproteins,小核核糖核蛋白,蛋白及5个snRNA复合物
IGS=internal guide sequence内部引导序列
CDS=Coding sequence,=ORF
RBS(SD序列)ribosomal binding site,核糖结合位点AARS=Amino acid tRNA synthetases
EF=elongation factors
DB=DNA binding domain
CCR=carbon catabolite repression,分解代谢产物阻遏CRP=cAMP Receptor Protein,cAMP受体蛋白
SAM=S-adenosyl Met硫代腺苷甲硫氨酸
HDAC=Histone deacetylases组蛋白去乙酰酶
Histone acetyltransferase组蛋白乙酰化酶
RNAi=RNA interference,RNA干扰
RISC=RNA-induced silencing complex
PTGS=Post-transcriptional gene silencing,转录后基因沉默
名词解释
1.极性效应,极性突变Polarity of Mutation,Polar Effect:在同一个操纵子中,一个结构基
因发生突变后,它除了影响该基因本身产物的表达外,还(在转录或翻译水平)影响其后结构基因的表达,并且具有极性梯度的特征。
2.端粒酶Telomerase:是一种蛋白质-RNA复合物,reverse transcriptase-like RNA-dependent
DNA polymerase.It extends the3’-end of chromosome using its RNA component as template.
3.基因表达gene expression:指基因的遗传信息通过转录和翻译传递到蛋白质和功能性
RNA等基因产物的过程。
4.转录transcription:是基因表达的第一步,以dsDNA中的一条作为模板,在依赖DNA
的RNA聚合酶的作用下,以NTP为底物,根据A=U,G≡C的规则,经由5’->3’方向不需要引物的合成RNA。
转录有三个过程:initiation,elongation and termination.
5.转录单位transcriptional unit:从启动子(promoter)到终止子(terminator)的一段DNA
称为转录单位(transcriptional unit)
6.close complex:promoter与聚合酶刚结合时的复合物,此时DNA仍为双链,酶与螺旋
的一个面结合
7.open complex:DNA解旋,出现了在起始位点左右的14bp的开环,为转录的bubble form
8.Abortive transcription:the enzyme synthesizes and releases short RNA molecules about9nt.
9.Abortive intiation:RNA polymerase synthesizes several short RNAs before entering the
elongation phase
10.DNA的复性,也称重退火:已发生变性的DNA溶液在逐渐降温的条件下,两条核苷酸链
的配对碱基间又重新形成氢键,恢复到天然DNA的双螺旋结构。
11.terminator:the sequences that trigger the elongation
polymerase to dissociate from the
DNA
12.attenuator:基因内部终止子or衰减子,ρ-independent terminator,or intrinsic terminator.
13.转录后加工:指细胞核内对mRNA前体(Pre-mRNA)进行各种修饰、剪接和编辑,生
成成熟mRNA,使编码蛋白质的外显子部分连接成为一个连续的开放阅读框(open reading frame ORF)的过程。
14.核不均一RNA,heterogenous nuclear RNA(hnRNA):The hnRNAs synthesized by RNA Pol II
is mainly pre-mRNA and rapidly becomes covered by proteins to form heterogeneous nuclear ribonucleoproteins(hnRNPs) 15.核不均一核糖核蛋白hnRNA:The hnRNP proteins are thought to help keep the hnRNA in a
single-stranded form and to assist in the various RNA processing reactions
16.5’剪切位点,5’splice site:the exon-intron boundary at the5’end of the intron
17.3’剪切位点,3’splice site:the intron-exon boundary at the3’end of the intron
18.分支位点,branch point sit e:a n A close to the3’end of the intron,which is followed by a
polypyrimidine tract(Py tract)多嘧啶束.
19.Self-splicing introns:Introns that can fold into a specific conformation within the precursor
RNA,and catalyze the chemistry of their own release and the exon ligation.
20.RNA编辑,RNA editing:是与剪接不同的一种mRNA加工方式,指mRNA在转录后因插
入、缺失或核苷酸替换,从而改变DNA来源的遗传信息。
21.开放可读框OPR:The protein coding region of each mRNA is composed of a contiguous,
nonoverlapping string of codons,starts with a start codon &ends with a stop codon.
22.Genetic code遗传密码:决定蛋白质中氨基酸顺序的DNA或mRNA核苷酸序列,由核
苷酸三联体密码子所构成,生物有61个编码蛋白质氨基酸的密码子,以及3个终止密码子。
23.codon密码子:是mRNA上连续排列的3核苷酸序列,一个三联体密码编码一个氨基酸
信息或蛋白翻译的终止信息。
24.错误突变:An alternation that changes a codon specific for one amino acid to a codon
specific for another amino acid.
25.无义突变:An alternation causing a change to a stop codon
26.移码突变:Insertions or deletions of one or a small number of base pairs that alter the
reading frame.
27.简并性degeneracy:一种氨基酸由2个以上密码子编码的现象
28.codon family密码子家族:编码同一个氨基酸的多个codon,仅在codon的第三位核苷
酸上存在差异。
A group of codons that code for the same amino acid and differ only in the nucleotide that occupies the third codon position.
29.isoacceptor:负载同一AA,但识别不同密码子的不同tRNA
30.Kozak consensus sequence:GCCACCAUGG.可促进真核基因从该AUG正确起译,避免漏读
31.转肽反应:将延伸中的肽链从肽酰tRNA转到氨酰tRNA,即形成新的肽键
32.effector效应物:一些化学小分子,能够结合影响调控蛋白的活性
33.corepressor辅阻遏物:指与调控蛋白结合能阻止转录的小分子化合物
34.inducer诱导物:指与调控蛋白结合后能诱导转录的小分子
化合物
35.recruitment regulation招募调控:Activators contain two binding sites to bind a DNA
sequence and RNAPol simultaneously,can therefore enhance the RNAPol affinity with the promoters and increases gene transcription.activator结合DNA和RNAP,提高了RNAP对promoter亲和性,增强转录。
36.operon:An operon is a unit of prokaryotic gene expression and regulation which includes
coordinately regulated structural genes and control elements which are recognized by regulatory gene products.一组能被调节蛋白特异识别的原核基因,包括调节基因、结构基因和调控元件。
37.结构基因:指受调控的编码特定生物合成和代谢过程中的酶/蛋白质的基因
38.控制元件:调控结构基因转录的一段DNA序列e.g. operator,cap binding site
39.调节基因:制造识别控制元件产物的基因。
40.乳糖启动子Plac:控制多顺反子mRNA lacZYA转录的启动子
41.Riboswitch核糖开关:mRNA结构的一部分,通常位于5′UTR,可通过与小分子结合改
变构象影响基因的表达。
42.表观遗传学Epigenetics:是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达和细
胞表型发生可遗传的变化的一门遗传学分支学科。
43.RNA干扰,RNAi:外源和内源性的短双链RNA在生物体内特异性诱导同源基因mRNA
的降解,从而导致转录后基因沉默的现象。
44.microRNA:small noncoding RNA regulators recognizing 3’UTRs found in eukaryotic cells真
核细胞内非编码(蛋白质)的调控RNA分子,识别3’非编码区。