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利用生物信息技术分析喉癌的关键基因

利用生物信息技术分析喉癌的关键基因董周威王启威张丽萍林丽红徐丹摘要目的利用生物信息技术探讨喉癌的发生机制，寻找用于喉癌诊断和治疗的关键基因。

方法本研究从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载基因芯片数据集GSE51985和GSE59102,筛选差异表达基因，并进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析，使用STRING在线数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)，并利用CyLoscape进行了模块分析，筛选关键基因。

然后用Oncomine数据库对关键基因进行泛癌分析,从癌症和肿瘤基因图谱数据库(The Cancer Genome ALlas,TCGA)下载喉癌相关基因表达数据和临床资料,对关键基因进行基因表达差异和生存分析。

结果共筛选出差异基因218个o KEGG途径分析显示，差异基因主要富集于唾液分泌、ECM受体相互作用、细胞周期等途径。

利用CysLoscape软件筛选关键基因，筛选出CHEK1、SERPINE1、SPP1、COL1A1、FOXM1、MMP9、CXCL12和MMP1共8个基因为关键基因。

将关键基因输入GEPIA数据库寻找相似基因,将所有基因输入MeLascape进行富集分析,主要富集于细胞外组织结构、PID整合素1途径、有丝分裂染色体分离等。

利用TCGA数据库数据进行关键基因在喉癌组织与正常组织表达差异分析,8个关键基因差异均有统计学意义，在生存分析中，笔者发现COL1A1和MMP1的表达与喉癌总生存率显著相关。

结论本研究中发现的差异基因和关键基因有助于深入了解喉癌发生、发展的分子机制，为喉癌的诊断和治疗提供新的候选靶点。

关键词喉癌生信分析关键基因差异分析中图分类号R76文献标识码A DOI10.11969/j.issn.1673-548X.2021.01.021Analysis of the Hub Genes in Laryngeal Carcinoma by Bioinformatics.Dong Zhouwei,Wang Qiwei,Zhang Liping,et al.Department of Otolaryngology,the Fourth Hospital of Harbin,Heilongjiang150020,ChinaAbstract Objective To explore Lhe mechanism of laryngeal cancer by using bioinformaLics and Lo find Lhe key genes for diagnosis and LreaLmenL of laryngeal cancer.Methods In Lhis sLudy,gene chip daLaseLs GSE51985and GSE59102were downloaded from Gene Expression Omnibus(GEO)Lo screen differentially expressed genes,and funcLional enrichmenL analysis of Gene OnLology(GO)and KyoLo Encyclopedia of genes and genomes(KEGG)was carried ouL.The proLein-proLein inLeracLion neLwork(PPI)was consLrucLed by using STRING online daLabase,and Lhe key genes were screened by using Lhe module analysis of CyLoscape.Then,Oncomine daLabase was used for pan一cancer analysis of key genes,and Lhe gene expression daLa and clinical daLa relaLed Lo laryngeal cancer were downloaded from Lhe Cancer Genome ALlas(TCGA)Lo conducL gene expression differences and survival analysis of Lhe key genes.Results ToLally218differ-enLial genes were screened ouL.KEGG paLhway analysis showed LhaL Lhe differential genes were mainly enriched in salivary secreLion,ECM recepLor inLeracLion,cell cycle and oLher pathways.The key genes of CHEK1,SERPINE1,SPP1,COL1A1,FOXM1,MMP9,CXCL12 and MMP1were screened ouL by using cysLoscape software.The key genes were inpuL inLo GEPIA daLabase Lo search for similar genes, and all genes were inpuL inLo MeLascape for enrichmenL analysis,mainly concenLraLed in exLracellular Lissue sLrucLure,PID inLegrin1paLh-way,miLoLic chromosome separation,eLc.The differences of expression of key genes in laryngeal cancer Lissues and normal Lissues were analyzed using TCGA daLabase daLa,and all key genes had sLaLisLical significance.In Lhe survival analysis,we found LhaL Lhe expressions of COL1A1and MMP1were significanLly correlated wiLh Lhe overall survival raLe of laryngeal cancer.Conclusion The differenLial genes and key genes found in Lhis sLudy can help us Lo understand Lhe molecular mechanism of laryngeal cancer and provide a new candidate Lar-geL for Lhe diagnosis and LreaLmenL of laryngeal cancer.Key words Laryngeal cancer；BioinformaLics analysis；Key genes；Differential analysis基金项目：黑龙江省卫生健康委员会科研基金资助项目(2019-225)；黑龙江省卫生和计划生育委员会科研基金资助项目(2018019)作者单位：150020哈尔滨市第四医院耳鼻喉科(董周威、张丽萍、林丽红、徐丹)；150001哈尔滨医科大学附属第一医院耳鼻咽喉头颈外科(王启威)通讯作者：王启威，电子信箱:aaaqww@喉癌的发生率在呼吸道肿瘤中位居第2位，仅次于肺癌，每年新增病例超过15万，大多数的喉癌患者处于临床m期和N期才被发现，喉癌的发生率和病死率较高，这就要求通过有针对性的筛查寻找用于喉癌早期诊断的分子标志物和治疗靶点[l]o喉癌的病因复杂，与环境和生活方式有关,如吸烟、饮酒、接触有・97・毒物质、饮食习惯、辐射、乳头状瘤病毒感染和咽喉返流等⑵。

Oncomine：一个肿瘤相关基因研究的数据库--转载

Oncomine：⼀个肿瘤相关基因研究的数据库--转载如果你获得了⼀个肿瘤差异表达基因，想研究其是否可作为某种肿瘤的潜在标志物和靶点，⼜怕做实验会得到阴性结果，浪费时间和⾦钱，这时候你就应该想到Oncomine数据库了()。

Oncomine整合了GEO、TCGA和已发表的⽂献等来源的RNA和DNA-seq数据，只要你⽤⾮营利机构邮箱注册了就可以免费使⽤了。

下⾯就以ERBB2基因为例跟着⼩诺⼀步⼀步搞定Oncomine吧。

第⼀步：ERBB2在肿瘤中的表达在搜索框中输⼊ERBB2并设定P值、差异表达倍数和差异的排序就可以得到这个基因在各类肿瘤中的差异表达数据。

如下图所⽰，在有差异表达的数据中，ERBB2在膀胱癌、脑和神经瘤、乳腺癌和前列腺癌中⾼表达的⼏率较⾼（红⾊表⽰⾼表达，颜⾊越深表达量越⾼，蓝⾊反之）。

第⼆步：ERBB2在乳腺癌中的表达为进⼀步分析ERBB2在我感兴趣的乳腺癌中的表达，点击左侧的数据筛选区⾥选择Breast cancer、Cancer vs. Normal和Clinical Specimen 即可知道其在乳腺癌组织中的表达量是否升⾼。

第三步：ERBB2的表达与乳腺癌TNM分期、分化和⽣存时间等临床病理特点及预后的关系点击样本量较⼤、数据可信度⾼的TCGA Breast或Curtis Breast，在GROUPED BY窗⼝中选择相应的临床资料分组就可得出ERBB2在相应的临床资料分组中的表达量。

第四步：ERBB2共表达基因分析在Analysis Type中选择Coexpression Analysis，即可获得与ERBB2表达正相关性较⾼的基因。

第五步：寻找差异表达基因若是还不知道从哪个基因下⼿，没关系，Oncomine也能帮你解决。

在左侧选择Cancer Type和Cancer vs. Normal即可得到差异表达基因。

选择多个乳腺癌，点击compare即可获得多个数据中肿瘤⾼表达基因。

基于GEPIA2和Oncomine数据库分析ITGA6基因在卵巢癌中的表达及意义

作者单位：510317广州，广东省第二人民医院妇科（欧阳振波、李群、张敏、李凤、吴嘉雯、万子贤、张秋实）；中山大学附属肿瘤医院华南肿瘤学国家重点实验室（冯国开）；南方医科大学南方医院妇产科（尹倩）通讯作者：尹倩，E-mail ：****************DOI ：10.3868/j.issn.2095-1558.2021.01.005·论著·基于GEPIA2和Oncomine 数据库分析ITGA6基因在卵巢癌中的表达及意义欧阳振波冯国开尹倩李群张敏李凤吴嘉雯万子贤张秋实【摘要】目的基于GEPIA2数据库和Oncomine 数据库分析ITGA6基因在卵巢癌中的表达及意义。

方法检索GEPIA2和Oncomine 数据库中关于卵巢癌的数据集，并结合文献资料进行二次综合分析。

对比卵巢癌与正常对照组织间ITGA6表达的差异，并利用GEPIA2数据库进行在线生存分析。

结果Oncomine 数据库中共收集了359项ITGA6在不同癌症与正常组织中表达对比的研究结果，表达差异有统计学意义的有81项，其中50项呈高表达，31项呈低表达。

共有7项研究涉及ITGA6在卵巢癌与正常组织中的表达对比，共包括1043个肿瘤样本。

与正常对照组相比，卵巢癌中的ITGA6呈显著的高表达（P ＜0.001）。

利用GEPIA2数据库分析发现，ITGA6与卵巢癌的预后生存（总生存和无病生存）无相关性（P ＞0.05）。

结论尽管ITGA6的表达与卵巢癌的预后无显著相关性，但是其在卵巢癌中的显著高表达，使其可作为卵巢癌分子成像及基因药物研制的靶标。

【关键词】卵巢肿瘤；整合素；ITGA6基因；mRNA ；生存预后；数据库【中图分类号】R737.31【文献标志码】AExpression and significance of ITGA6gene in ovarian cancer ：An analysis based on GEPIA2and Oncomine databasesOUYANG Zhen-bo ，FENG Guo-kai ，YIN Qian*，LI Qun ，ZHANG Min ，WU Jia-wen ，WAN Zi-xian ，ZHANG Qiu-shi.*Department of Obstetrics and Gynecology ，NanFang Hospital ，Southern Medical University ，Guangzhou 510515，China Corresponding author ：YIN Qian ，E-mail ：****************.【Abstract 】Objective To analyze the expression and significance of ITGA6gene in ovarian cancer based on the GEPIA2and Oncomine databases.Methods All datasets about ovarian cancer were searched in the GEPIA2and Oncomine databases ，and conduct a secondary comprehensive analysis of the data based on the pare the differential ITGA6expressions between ovarian cancer and normal control tissue ，and use GEPIA2database for online survival analysis.Results A total of 359researches on the expression of ITGA6in different types of cancer and normal tissues were collected in the Oncomine database.There were 81with statistically significant differences in expression ，of which 50were high expression and 31were low expression.7studies involved the expression of ITGA6in ovarian cancers and normal tissues ，including a total of 1043tumor pared with the normal control group ，the ITGA6in ovarian cancer group showed asignificantly higher expression（P<0.001）.Analysis using the GEPIA2database found that ITGA6is not correlated with the survival（overall survival and disease free survival）of ovarian cancer（P> 0.05）.Conclusions Although the expression of ITGA6is not significantly correlated with the survival of ovarian cancer，its significantly high expression in ovarian cancer makes it a reasonable target for molecular imaging and gene drug development of ovarian cancer.【Keywords】Ovarian neoplasm；Integrin；ITGA6gene；mRNA；Survival；Database卵巢癌是妇科三大恶性肿瘤之一，由于其发病隐匿、症状不典型，患者就诊时已多为晚期，因此预后差［1-3］。

oncomine应用实例 ppt课件

Oncomine数据库的应用
oncomine应用实例
Oncomine简介
Oncomine是大型肿瘤基因芯片数据库，涵盖65个基因芯片数据集、4700个芯片及4亿8千万个基因表达数据，可用于分析基因表达差异、寻找离群值、预测共表达基因等，并可根据肿瘤分期、分级、组织类型等临床信息进行分类，还可依据已知的基因—药物分析寻找可能的分子标记物与治疗靶点。下面仅介绍如何分析表达差异，更多内容可参考网站 online help
oncomine应用实例
5、Data TypemRNA
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六、按限定的条件搜索
我们选定的条件会出现在筛选框中, 点击搜索，右边的界面如下图
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右边的柱状图默认为第一个机构的研究结果onFra bibliotekomine应用实例
七、对多组数据进行meta分析
勾选各研究机构所做onc的omin研e应用究实例
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点击Graphs下方的 Data 1即显示最侧散点图
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点击Results出现onc右omine方应用实对例话框，点击OK
继续点击OK
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自动计算出P值，按oPnco<mi0ne.应0用5实例，差异有统计学意义
十、结论
对于该基因，Yu Prostate机构的研究表明，该基因在前列腺癌组织中相对正常前列腺组织低表达且具有统计学意义
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将鼠标移至每个柱子上，会分别跳出一个说明框，统计每个柱子的Exponrcoemsines应i用o实n例 value
分别统计正常前列腺和前列腺癌的

oncomine数据库的应用

研究结果为该基因高表达的机构
研究结果为该基因相对低表达的机构
八、结果分析
选择一个较为可信的机构作数据统计并分析
展开该机构右边的下拉箭头，点击其下方的研究，会出现右边所示柱状图
将鼠标移至每个柱子上，会分别跳出一个说明框，统计每个柱子的Expression value
分别统计正常前列腺和前列腺癌的
expression value并用
GraphPad Prism 5作图
九、作散点图
录入正常前列腺和前列腺癌的 exprhs下方的 Data 1即显示最侧散点图
点击Results出现右方对话框，点击OK
继续点击OK
自动计算出P值，按P<0.05，差异有统计学意义
十、结论
对于该基因，Yu Prostate机构的研究表明，该基因在前列腺癌组织中相对正常前列腺组织低表达且具有统计学意义
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Oncomine数据库的应用
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四、键入要搜索的基因
五、限制搜索条件
1、Analysis TypeDifferential AnalysisCancer vs. Normal Analysis
3、Cancer TypeProstate Cancer
4、Sample TypeClinical Specimen
5、Data TypemRNA
六、按限定的条件搜索
我们选定的条件会出现在筛选框中, 点击搜索，右边的界面如下图
右边的柱状图默认为第一个机构的研究结果
七、对多组数据进行meta分析
勾选各研究机构所做的研究

基于oncomine和tcga数据库分析chrna5在肺鳞癌中的表达及临床意义

Abstract:Toanalyzetheexpressionofcholinergicreceptornicotinicalpha5subunit (CHR灢
* 收稿日期:2019灢11灢03 基金项目 :国家自然科学基金项目 (81602593);山东省自然科学基金项目 (ZR2018MH021) 作者简介 :张玉洁 (1992- ),女 ,河南洛阳人 ,在读硕士研究生 ,研究方向 :肿瘤分子生物学通讯作者 :马晓丽 (1971- ),女 ,山东淄博人 ,教授 ,博士 ,研究方向 :肿瘤分子生物学 ,mxl7125@
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陕西科技大学学报
第 38 卷
NA5)anditsclinicalsignificanceinlungsquamouscellcarcinoma (LUSC),weanalyzedthe expressionofCHRNA5inlungcancertissuesby Oncominedatabase.Thecorrelationbe灢 tweentheexpressionofCHRNA5inLUSCandclinicalparameterswereanalyzedbyTCGA. Immunohistochemicaldetection wasperformedin52 LUSCtissuesand52para灢carcionma tissues.Therelationshipbetween毩5灢nAchR expressionandclinicopathologicalparameters wasanalyzed.Theresultsshowthat402studiesontheexpressionlevelsofCHRNA5indif灢 ferenttumorswerecollectedfrom the Oncominedatabase,in whichthere were27studies

基于生物信息学数据库分析CDC20_基因在膀胱癌中的表达及临床意义

[收稿日期]2021-07-06　[修回日期]2021-12-31[作者单位]1.蚌埠医学院研究生院,安徽蚌埠233030;2.浙江省嘉兴市第二医院泌尿外科,314000[作者简介]汪家盛(1997-),男,硕士研究生.[通信作者]沈瑞林,博士研究生,硕士生导师,主任医师.E⁃mail:shenrlmd@[文章编号]1000⁃2200(2023)11⁃1557⁃05㊃临床医学㊃基于生物信息学数据库分析CDC20基因在膀胱癌中的表达及临床意义汪家盛1,沈晓鹏1,蒋恩琰2,蔡丹丹2,沈瑞林1,2[摘要]目的:探讨膀胱癌中CDC20基因的表达及其临床预后意义㊂方法:使用Oncomine 数据库和GEPIA 数据库分析CDC20基因在膀胱癌中的表达水平㊂采用Kaplan⁃Meier Plotter 分析CDC20表达水平与膀胱癌病人总体生存时间的关系,采用LinkedOmics 数据库分析CDC20基因表达与膀胱癌病人年龄及临床病理特征的相关性,通过STRING 数据库绘制CDC20有关蛋白网络图,分析蛋白富集的生理过程㊂结果:膀胱癌组织中CDC20基因的表达水平明显高于正常膀胱组织(P <0.01)㊂Kaplan⁃Meier 生存分析显示,CDC20高表达的膀胱癌病人生存时间低于CDC20低表达的膀胱癌病人(P <0.05)㊂STRING 数据库分析显示,与CDC20相关的蛋白有FBXO5㊁CCNB1㊁AURKA 等,主要富集在细胞周期㊁卵母细胞减数分裂㊁孕酮介导的卵母细胞成熟㊁泛素介导的蛋白水解等生理过程㊂LinkedOmics 数据库分析显示,CDC20的表达与病人年龄㊁人种均有相关关系(P <0.05和P <0.01),与TNM 分期及病理分期均无明显相关关系(P >0.05)㊂结论:CDC20基因在膀胱癌中高表达,且与膀胱癌病人预后负相关㊂[关键词]膀胱肿瘤;CDC20基因;预后[中图法分类号]R 737.14 [文献标志码]A DOI :10.13898/ki.issn.1000⁃2200.2023.11.017Expression and clinical significanceof CDC20gene in bladder cancer based on bioinformatics databaseWANG Jia⁃sheng 1,SHEN Xiao⁃peng 1,JIANG En⁃yan 2,CAI Dan⁃dan 2,SHEN Rui⁃lin 1,2(1.School of Graduate ,Bengbu Medical College ,Bengbu Anhui 233030;2.Department of Urology ,The Second Hospital of Jiaxing ,Jiaxing Zhejiang 314000,China )[Abstract ]Objective :To investigate the expression of CDC20gene in bladder cancer and its clinical prognostic significance.Methods :The expression level of CDC20gene in bladder cancer was analyzed using Oncomine database and GEPIA database.Kaplan⁃Meier Plotter was used to analyze the relationship between the expression level of CDC20and overall survival of bladder cancer patients,LinkedOmics database was applied to analyze the correlation between CDC20gene expression and age,clinicopathological characteristics of bladder cancer patients,and the CDC20⁃related protein network map was drawn by STRING database to analyze the physiological process of protein enrichment.Results :The expression level of CDC20gene in bladder cancer tissue was significantly higher than that in normal bladder tissue(P <0.01).Kaplan⁃Meier survival analysis showed that the overall survival of bladder cancer patients with high CDC20expression was lower than that of bladder cancer patients with low CDC20expression(P <0.05).STRING database analysis showed that CDC20⁃related proteins included FBXO5,CCNB1,AURKA,and so on,which were mainly enriched in physiological processes including cell cycle,oocyte meiosis,progesterone⁃mediated oocyte maturation,ubiquitin⁃mediated proteolysis,and so on.LinkedOmics database analysis showed that the expression of CDC20was correlated with patients′age and race(P <0.05and P <0.01),but was not significantly correlated with TNM stage and pathological stage(P >0.05).Conclusions :CDC20gene isoverexpressed in bladder cancer and negatively correlated with the prognosis of bladder cancer patients.[Key words ]bladder neoplasms;CDC20gene;prognosis 膀胱癌是泌尿外科临床上最常见的恶性肿瘤之一,在世界范围内膀胱癌发病率居恶性肿瘤的第4位,泌尿系肿瘤第二位,仅次于前列腺癌[1]㊂近年来膀胱癌的诊治取得了长足进步,然而目前对于膀胱癌的发病机制尚不完全清楚㊂随着高通量测序与生物信息分析技术的发展,研究[2]表明膀胱癌的发生㊁发展与多种基因的差异表达相关,为膀胱癌的早期诊断㊁治疗靶点及预后评价提供了更多的可能,但当前对膀胱癌的治疗手段仍有限,其复发率及转移率仍较高,预后不理想㊂因此,通过生物信息学方法深入挖掘与膀胱癌相关的生物标记物,可以提高诊断,增加临床疗效,改善病人预后㊂CDC20是一种细胞周期调节因子,在有丝分裂中,CDC20通过结合APC/C复合体促使姐妹染色单体分离,进而完成细胞分裂从中期到后期的转变[3]㊂近年来,在多种人类肿瘤中观察到CDC20的过表达,如胰腺癌[4]㊁乳腺癌[5]㊁前列腺癌[6]等㊂但目前无相关证据表明CDC20可作为膀胱癌的候选预后生物标志物和潜在治疗靶标㊂因此,本研究通过生物信息学方法探讨CDC20在膀胱癌中的表达及其临床意义,为膀胱癌的临床诊疗提供新思路㊂1　材料与方法1.1　Oncomine数据库　Oncomine(https://www. /)是一个大型肿瘤基因芯片数据库,涵盖65个基因芯片数据集㊁4700个芯片及4.8亿个基因表达数据,可用于分析基因表达差异㊁寻找离群值㊁预测共表达基因等[7]㊂使用该数据库分析CDC20基因在癌组织与正常组织中的表达情况㊂注册账号并筛选条件:(1)Gene:CDC20;(2) Analysis Type:cancer vs Normal Analysis;(3)Date type:mRNA;(4)Threshold(P⁃value):P<0.001;(5) Threshold(fold change):fold change>0.5;(6) Threshold(gene rank):Top10%㊂检索时间:2021年5月㊂1.2　GEPIA数据库　GEPIA(http://gepia2.cancer⁃/)是一个由北京大学团队研发的用于癌症和正常基因表达谱分析的公共数据库㊂可基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据进行基因差异表达分析㊁生存分析㊁类似基因筛选等研究[8]㊂利用该数据库分析膀胱癌组织与正常组织中CDC20表达差异情况㊂筛选条件:(1) Expression Analysis:Expression DIY;(2)Box Plot;(3)Gene:CDC20;(4)log2FC Cutoff:2,P⁃value Cut off:0.001;(5)Cancer name:BLCA;(6)MatchTCGA normal and GTEx data㊂检索时间:2021年5月㊂1.3　Kaplan⁃Meier Plotter数据库　Kaplan⁃Meier Plotter(/analysis/)能够评估5.4万个基因(mRNA㊁miRNA㊁蛋白质)对21种癌症类型生存率的影响,数据库的来源包括GEO㊁EGA和TCGA㊂该工具的主要目的是基于meta分析的生存生物标志物的发现和验证㊂应用该数据库分析CDC20表达水平与病人总体生存时间(overall survival,OS)之间的联系㊂筛选条件:(1)Gene symbol:CDC20;(2)Cancer:Bladder carcinoma;(3) Survival:OS㊂检索时间:2021年5月㊂1.4　LinkedOmics数据库　LinkedOmics(http:// )数据库包含来自TCGA32种癌症和11158例病人的多组学数据和临床数据㊂该数据库包含LinkFinder㊁LinkCompare和LinkInterpreter模块,用于分析和比较肿瘤内和肿瘤间的多组学数据[9]㊂运用该数据库进行CDC20与膀胱癌病人年龄㊁种族及临床病理分期的相关性的研究㊂在该数据库中注册账号后选定筛选步骤: (1)Select cancer cohort:BLCA;(2)Select search dataset:Data,stype:RNAseq;(3)Select sample dataset:No input;(4)Select search dataset attribute: CDC20;(5)Select target dataset:Clinical;(6)Select statistical method:Nonparametric test㊂检索时间: 2021年5月㊂1.5　STRING数据库　STRING(https://www. string⁃/)数据库可用于整合蛋白质之间所有已知和预测的关联,包括物理相互作用和功能关联[10]㊂本研究通过该数据库构建CDC20基因相关蛋白的网络图,并进一步发掘其相关蛋白的富集分析㊂检索时间:2021年5月㊂1.6　统计学方法　采用t检验和Kaplan⁃Meier生存分析㊂2　结果2.1　CDC20在膀胱癌中的表达情况　Oncomine数据库检索结果显示,CDC20基因在正常组织与癌组织中存在差异表达共有321个㊂CDC20在膀胱癌㊁脑和中枢神经系统癌症㊁乳腺癌㊁结直肠癌㊁肺癌㊁卵巢癌等肿瘤中高表达,在血液及骨髓系统肿瘤中低表达㊂进一步荟萃分析该数据库涉及的6项关于CDC20在膀胱癌中差异表达的研究,结果发现, CDC20在膀胱癌中高表达,在基因表达差异中排名118(P<0.01)㊂在GEPIA数据库中,共432例样本,其中膀胱癌组织404例,正常膀胱组织28例, CDC20基因在膀胱癌中的表达量(6.12±0.82)明显高于正常膀胱组织(1.96±1.21)(t=25.05,P< 0.01),与Oncomine数据库结果相符㊂2.2　CDC20与膀胱癌病人预后的关系　为了进一步明确CDC20表达与膀胱癌预后的关系,采用Kaplan⁃Meier Plotter数据库分析CDC20与膀胱癌病人的OS 的关系㊂根据约登指数最大,计算截断值为1401㊂当样本中CDC20表达大于截断值时为高表达组,否则为低表达组㊂结果显示,CDC20高表达的膀胱癌病人OS 低于CDC20低表达的膀胱癌病人(P <0.05)(见图1)㊂2.3　CDC20表达与膀胱癌病人年龄及临床病理分期的关系　采用LinkedOmics 数据库分析CDC20表达与年龄㊁种族及临床病理分期的关系,结果显示,CDC20的表达与年龄(n =407,FDR =0.0334,P <0.05)㊁人种(n =391,FDR =0.0001,P <0.01)均有相关关系,与病理分期(n =406,FDR =0.2930,P >0.05)㊁T 分期(n =375,FDR =0.1946,P >0.05)㊁N分期(n =366,FDR =0.2377,P >0.05)㊁M 分期(n =207,FDR =0.4486,P >0.05,)均无明显相关关系㊂2.4　CDC20相关蛋白网络及其功能分析　在STRING 数据库筛选,发现CDC20相关蛋白主要包括:FBXO5㊁CCNB1㊁AURKA㊁UBE2S㊁SKP2㊁ANAPC5㊁CCNA2㊁CENPE㊁NDC80㊁ESP21等(见图2),主要参与的生物过程包括:细胞周期㊁卵母细胞减数分裂㊁孕酮介导的卵母细胞成熟㊁泛素介导的蛋白水解㊁病毒致癌机制㊁FoxO 信号通路等(见表1)㊂3　讨论膀胱癌是泌尿生殖系统中最常见的肿瘤之一㊂近年来由于受到环境污染及吸烟等因素影响,膀胱癌的全球发病率在逐渐上升,也是中国老年人死亡的主要原因[11]㊂目前治疗膀胱癌的治疗策略主要包括:手术治疗㊁化学治疗㊁放射治疗及生物治疗,但膀胱癌的十年复发率仍高达74.3%[12]㊂现阶段膀胱镜是诊断膀胱癌的金标准,但由于操作的复杂性及侵入性,容易造成部分病人的不良医疗体验,增加出血和感染的风险[13]㊂尿细胞学检查也是膀胱癌诊断和术后随访的主要方法之一,然而这种诊断方法对低级别膀胱癌的诊断敏感性较低[14]㊂随着肿瘤基因组学和肿瘤分子生物学研究的快速发展,极大地提高了人们对膀胱癌发生发展的认识,虽然现有研究已经确定了一些在膀胱癌的发生发展中起重要作用的基因,但膀胱癌的治疗效果和预后并未得到令人满意的改善,因此仍需进一步探究在膀胱癌的发生㊁发展中起关键作用的相关分子标志物,为早期诊断㊁预后判断寻求新的基因治疗靶点提供依据㊂CDC20作为一种细胞周期调节因子,通过结合APC/C复合体使姐妹染色单体分离,使细胞在有丝分裂中完成中期到后期的转换㊂以往的研究[15]中,在人类的多种肿瘤中都观察到CDC20基因的过表达,并与病理临床分期具有明显相关性㊂在CHANG 等[16]的一项回顾性研究中,发现CDC20在胰腺肿瘤组织中的表达明显高于慢性胰腺炎组织和正常胰腺组织中的表达,且与低分化的胰腺肿瘤的5年无复发生存率相关㊂ALFARSI等[17]证实了CDC20基因的高表达致雌激素受体阳性的乳腺癌病人预后不良,对内分泌治疗效果不理想㊂XIONG等[18]揭示了CDC20可能是肝癌中免疫相关的治疗靶标㊂因此,我们猜测CDC20可能参与膀胱癌的发生㊁发展,通过生物信息学的数据整合,从CDC20在膀胱癌中的表达,与膀胱癌的临床病理特征相关性,CDC20基因相关蛋白及富集分析等方面,多维度评估CDC20在膀胱癌中的表达与预后意义㊂表2　CDC20基因相关蛋白及信号通路分类编号生理过程基因错误发现率参与蛋白标签hsa04110细胞周期6 4.19E⁃10CCNB1,ESPL1,ANAPC5,CCNA2,SKP2,CDC20hsa04114卵母细胞减数分裂6 4.19E⁃10AURKA,FBXO5,CCNB1,ESPL1,ANAPC5,CDC20hsa04914孕激素介导的卵细胞成熟通路4 1.14E⁃6AURKA,CCNB1,ANAPC5,CCNA2hsa04120泛素介导的蛋白水解4 3.38E⁃6ANAPC5,UBE2S,SKP2,CDC20hsa05203病毒致癌作用30.00047CCNA2,SKP2,CDC20hsa04068FoxO信号通路20.0072CCNB1,SKP2hsa04218细胞衰老20.0087CCNB1,CCNA2hsa05169EB病毒感染20.0116CCNA2,SKP2hsa05166人类嗜T淋巴细胞病毒Ⅰ型感染20.0168ANAPC5,CDC20 本研究通过Oncomine㊁GEPIA数据库证实了CDC20在膀胱癌中高表达,再通过Kaplan⁃Meier方法分析生存数据发现,CDC20高表达的病人OS较低,说明CDC20的表达与膀胱癌病人的预后有关,提示其可能成为膀胱癌病人预后评估的生物学指标㊂有研究[19]证实,CDC2基因的功能障碍可导致包括膀胱癌在内的多种癌症的分化不良㊁肿瘤非整倍体和不良预后㊂通过LinkedOmics数据库,本研究发现CDC20与年龄和人种具有相关性,遗憾的是,并未发现CDC20与TNM分期及病理分期具有相关性㊂分析其原因可能是由于本研究是通过多个统计步骤得出的,设置不同的检索标准,使用不同的工具,结果可能有所不同㊂因此,该结论仍然是理论性的,未来仍需进一步验证研究以确认其临床效果,期待有样本量更大㊁临床信息更详细的生物信息学和实验研究来进一步扩展我们的研究㊂[参考文献][1]　SIEGEL RL,MILLER KD,JEMAL A.Cancer statistics,2018[J].CA Cancer J Clin,2018,68(1):7.[2]　LOPEZ⁃BELTRAN A,CIMADAMORE A,MONTIRONI R,et al.Molecular pathology of urothelial carcinoma[J].Hum Pathol, 2021,113:67.[3]　SCHROCK MS,STROMBERG BR,SCARBERRY L,et al.APC/C ubiquitin ligase:functions and mechanisms in tumorigenesis[J].Semin Cancer Biol,2020,67(Pt2):80.[4]　DONG S,HUANG F,ZHANG H,et al.Overexpression ofBUB1B,CCNA2,CDC20,and CDK1in tumor tissues predictspoor survival in pancreatic ductal adenocarcinoma[J].BiosciRep,2019,39(2):BSR20182306.[5]　CHENG L,HUANG YZ,CHEN WX,et al.Cell division cycleproteinising prognostic biomarker of breast cancer[J].Biosci Rep,2020,40(5):BSR20191227.[6]　ZHANG Q,HUANG H,LIU A,et al.Cell division cycle20(CDC20)drives prostate cancer progression via stabilization of beta⁃catenin in cancer stem⁃like cells[J].EBio Medicine,2019, 42:397.[7]　RHODES DR,KALYANA⁃SUNDARAM S,MAHAVISNO V,etal.Oncomine3.0:genes,pathways,and networks in a collection of18,000cancer gene expression profiles[J].Neoplasia,2007,9(2):166.[8]　TANG Z,LI C,KANG B,et al.GEPIA:a web server for cancerand normal gene expression profiling and interactive analyses[J].Nucleic Acids Res,2017,45(W1):W98.[9]　VASAIKAR SV,STRAUB P,WANG J,et al.LinkedOmics:analyzing multi⁃omics data within and across32cancer types[J].Nucleic Acids Res,2018,46(D1):D956.[10]　SZKLARCZYK D,GABLE AL,LYON D,et al.STRING v11:protein⁃protein association networks with increased coverage,supporting functional discovery in genome⁃wide experimentaldatasets[J].Nucleic Acids Res,2019,47(D1):D607. [11]　CHEN W,ZHENG R,BAADE PD,et al.Cancer statistics inChina,2015[J].CA Cancer J Clin,2016,66(2):115. [12]　CHAMIE K,LITWIN MS,BASSETT JC,et al.Recurrence ofhigh⁃risk bladder cancer:a population⁃based analysis[J].Cancer,2013,119(17):3219.[13]　GEAVLETE B,JECU M,MULTESCU R,et al.Narrow⁃bandimaging cystoscopy in non⁃muscle⁃invasive bladder cancer:aprospective comparison to the standard approach[J].Ther AdvUrol,2012,4(5):211.[14]　SUO L,VEGA I,THRALL M.Cyto⁃histo correlations ofplasmacytoid and micropapillary variants of high⁃grade urothelialcarcinoma:do they fit well in The Paris System for reportingurinary cytology?[J].J Am Soc Cytopathol,2021,10(1):20.[15]　CHENG S,CASTILLO V,SLIVA D.CDC20associated withcancer metastasis and novel mushroomderived CDC20inhibitorswith antimetastatic activity[J].Int J Oncol,2019,54(6):2250.[16]　CHANG DZ,MA Y,JI B,et al.Increased CDC20expression isassociated with pancreatic ductal adenocarcinoma differentiationand progression[J].J Hematol Oncol,2012,5:e15. [17]　ALFARSI LH,ANSARI RE,CRAZE ML,et al.CDC20expressionin oestrogen receptor positive breast cancer predicts poorprognosis and lack of response to endocrine therapy[J].BreastCancer Res Tr,2019,178(3):535.[18]　XIONG C,WANG Z,WANG G,et al.Identification of CDC20asan immune infiltration⁃correlated prognostic biomarker inhepatocellular carcinoma[J].Invest New Drug,2021,39(5):1439.[19]　CHOI JW,KIM Y,LEE JH,et al.High expression of spindleassembly checkpoint proteins CDC20and MAD2is associatedwith poor prognosis in urothelial bladder cancer[J].VirchowsArch,2013,463(5):681.(本文编辑　赵素容)(上接第1556页)[17]　黄修平,邓志美.经桡动脉行冠状动脉介入诊疗中桡动脉痉挛的发生及其预测因素分析[J].中国卫生标准管理,2017,8(27):31.[18]　张文,周丽,钟远慎.早期心脏康复程序护理对经桡动脉入路冠状动脉介入术病人术后心功能及生活质量的影响[J].全科护理,2021,19(29):4104.[19]　赵睿冬,李一,谷新顺.远端桡动脉入路在冠状动脉造影及介入中的研究进展[J].心脏杂志,2021,33(1):87. [20]　KIEMENEIJ F,FRASER D,SLAGBOOM T,et al.Hydrophiliccoating aids radial sheath withdrawal and reduces patientdiscomfort following transradial coronary intervention:arandomized doubleblind comparison of coated and uncoatedsheaths[J].Catheter Cardiovasc Interv,2003,59:161. [21]　HUDELO C,MAILLARD L,QUILLIET L,et parision ofcoronaryangiography by the left radial and right femoral approachwith4French Catheters[J].Arch Mal Coeur Vaiss,2000,93(7):813.[22]　胡凌云,田杰,胡建川,等.老年患者经桡动脉径路与股动脉径路行选择性冠状动脉和脑动脉联合造影的对比研究[J].中华老年心脑血管病杂志,2021,23(2):200. [23]　SUMINO H,NAKAJIMA K,MURAKAMI M.Possibility of newcirculating atherosclerosis⁃related lipid markers measurement inmedical and complete medical checkups:small dense lowdensitylipoprotein cholesterol and lipoprotein lipase[J].Rinsho Byori,2016,64(3):298.[24]　苏保满,杨琳梅,叶中倪.sdLDL⁃C和LDL⁃C水平与冠状动脉粥样硬化病变程度的相关性分析[J].武警后勤学院学报(医学版),2020,29(5):28.[25]　毕希乐,樊延明,汪雁博,等.经桡动脉入径行经皮冠状动脉介入术后桡动脉慢性闭塞危险因素分析[J].中国介入心脏病学杂志,2017,25(10):573.(本文编辑　刘畅)。

数据库基础与应用(Access 2010) 第10章应用案例

1 需求分析
整个开发过程从分析系统的需求开始。系统的需求包括对数据的需求和对功能的需求两方面的内容，它们分别是数据库设计和应用程序设计的依据。虽然在数据库管理系统中，数据具有独立性，数据库可以单独设计，但应用程序设计和数据库设计仍然是相互关联、相互制约的。具体地说，设计应用程序时将受到数据库当前结构的约束，而在设计数据库的时候，也必须考虑实现功能的需要。
第10章应用实例
本章要点数据库应用系统的开发过程系统需求分析系统设计系统实现应用系统的集成
10.1 数据库应用系统的开发过程
数据库应用系统的开发过程一般包括需求分析、系统设计、系统实现、系统测试和系统交付 5 个阶段，每阶段应提交相应的文档资料，包括需求分析报告、系统设计报告、系统测试大纲、系统测试报告及操作使用说明书等。
10.3 系统设计
系统设计主要包括数据库设计和系统功能设计，本节结合企业人力资源管理系统进行介绍。
10.3.1 数据库设计（1）员工基本信息（2）员工评价信息（3）员工奖惩信息（4）员工调动信息（5）员工工资（6）员工工资发放信息（7）员工出勤记录（8）员工出差记录（9）员工加班记录（10）员工请假记录
从分析可以确定，企业人力资源管理数据库应包括“员工基本信息”表、“员工评价信息”表、 “员工奖惩信息”表、“员工调动信息”表、“员工工资”表、“员工工资发放信息”表、“员工出勤记录”表、“员工出差记录”表、“员工加班记录”表、“员工请假记录”表共10个表。
10.3.2 系统功能设计
企业人力资源管理系统主要实现员工基本信息、员工工资管理、员工考勤管理、员工信息查询这 4 个主要功能模块，根据前面对用户需求的分析，依据系统功能设计原则，对整个系统进行了模块划分，系统模块结构如图所示。

ANDERSEN为科龙做的业务和信息诊断报告(PPT140页)

容声直冷冰箱138珍珠白容声无氟抽屉直冷冰箱182/HC湖绿色容声无氟抽屉直冷冰箱201B/HC珍珠白
容声无氟冰箱180/HC珍珠白容声无氟冰箱185K/HC珍珠白容声节能碳氢风直冷冰箱189WA/HC珍珠白
其他257个型号的冰箱
2001年1－9月科龙不同型号冰箱的销售量
8.40 7.16 6.78
11:55-12:15
5. 下阶段项目工作计划及重点 12:15-12:25
6. 会议总结
12:25-12:30
第三页，共139页。
主持人潘卫东顾总、徐总潘卫东安达信
安达信安达信科龙、安达信安达信安达信
汇报会目的(mùdì)
回想第一阶段项目停顿状况汇报第一阶段的义务(yìwù)效果战略明晰报告业务流程诊断剖析报告转变促进报告信息技术战略报告确定需求尽快决策的事项汇报下阶段项目义务(yìwù)方案及重点
OEM出口势头微弱，但外销未见很大起色
电冰箱年度销售(xiāoshòu)剖析
销量(xiāo liànɡ)(单位：万台) 160
140
120 6
100
80
60
100
40
20
11 0
2000年9月
科龙容声出口 31
98
9 2001年9月
资料来源：科龙财务
空调年度销售剖析
销量(单位：万台)
90
80
科龙
1,500
1,000
500
-
冰冰箱箱顺顺德德冰冰箱箱成成都都冰冰箱箱营营口口空空调调小小家家电电配配件
模模具具
26 塑塑胶胶
4,690 合算计计
资料来源：科龙财务，包括冰箱空调等上市业务及小家电、模具等未上市业务的销售数据，因此算计数与年报有不同

基于Oncomine数据库的数据挖掘在头颈鳞状细胞癌研究中的应用实例

基于Oncomine数据库的数据挖掘在头颈鳞状细胞癌研究中的应用实例房娟;宋晶晶;马达;王艳琼;周芳静;王智【期刊名称】《国际口腔医学杂志》【年(卷),期】2014(000)006【摘要】Objective This study is aimed to get the gene expression signatures of calmo dulin by mining data from Oncomine database as well as proving them with o ur samples. Methods Differential calmudulin mRNA expression levels in the head and neck squamous cell carcinoma(HNSCC) were got from Oncomine d atabase, and the expression of calmodulin on mRNA and protein level of the c linical samples and oral carcinoma cell lines was analyzed by real-time polymerase chain reaction and Western Blotting, respectively. Results T he results indicated that in most of databases of HNSCC samples compared t o adjacent non-tumor(or normal) tissue presented a significant increase in calmodulin mRNA level, but only a few not. The results from our experiments show that the expr ession of calmodulin on mRNA and protein level of normal tissue is more high er than that of tumor tissue. Conclusion We can get the information about th e expression of calmodulin mRNA level on HNSCC quickly and exactly by com bining data-mining from Oncomine database with our verified experiment. This can make a ground for the developmental research about calmodulin.%目的：利用Oncomine数据库结合自身样本验证，获取靶分子钙调蛋白在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的表达信息。

数据通讯工作原理_CAN_K-line_LIN_

1 系统简要说明1.1 系统综述由于法规在汽车的排放、能耗和安全性能方面的要求日益严格，顾客对汽车舒适性要求也不断提高，现代汽车往往使用大量电控单元来控制其正常行驶。

执行一个较复杂的控制时,需要在设备之间进行大量的数据交换。

当控制系统变得复杂时,交换数据的信号线连接将变得更复杂,同时费用将提高。

因此,BOSCH公司开发了CAN总线(Controller AreaNetwork),并已取得国际标准化组织认证(ISO11898)，被国外各大汽车公司广泛应用。

其总线结构参照ISO/OSI参考模型。

同时,国际上一些大的半导体厂商也积极开发出支持CAN总线的专用芯片。

CAN BUS系统，即局域网络控制系统。

CAN BUS技术的最大优点，是减少了线束的数量和控制器接口的引脚数目，减少线束，降低成本。

实现分布（集成）网络式控制系统，与此同时可以更简单、迅速地实现在线编程、在线诊断，甚至多个控制器共同作用等新功能。

同时，CAN BUS系统可以提高车辆功能扩展性和控制可靠性，降低开发成本和缩减开发周期，也能大大降低汽车的故障率。

对于CAN BUS系统，奇瑞公司需要从正常网络通信，工厂在线检测和售后服务诊断三方面来考虑其具体的实现。

1.2 产品执行标准(1) 产品满足QC/T 413-2002 《汽车电气设备基本技术条件》(2) 产品电子抗干扰性能满足：GB/T 17619《机动车电子电器组件的电磁辐射抗扰性限值和测量方法》；GB 18655-2002 《用于保护车在接收机的无线电骚扰特性的限值和测量方法》1.3 典型系统框图根据具体车型网络可以配置不同的节点，这形成了CAN网络拓扑结构，上图为一个典型的CAN BUS网络拓扑结构。

在这个示意图里，整个网络由三部分网段组成，分别是动力系统部分，车身控制部分，音响娱乐部分。

通常情况下，动力系统采用高速CAN进行通信，而车身控制及音响娱乐系统采用低速CAN进行通信。

这里的高速CAN通常指通信速度高于125Kbps的网络，如250Kbps 和500Kbps，低速CAN则是指通信速度小于等于125Kbps的网络，如125Kbps，64Kbps,50Kbps等。

基于Oncomine等数据库分析CDCA基因家族在胃癌中的表达

基于Oncomine 等数据库分析CDCA 基因家族在胃癌中的表达①陈晓萍②吴美珠②刘丽雅②沈阿灵②陈友琴②③彭军②（福建中医药大学中西医结合研究院，福州350122）中图分类号R735.2文献标志码A文章编号1000-484X （2022）06-0691-07［摘要］目的：分析细胞分裂周期CDCA 基因家族成员在胃癌中的表达。

方法：通过Oncomine 等多个数据库分析CDCA基因家族在不同肿瘤组织中的表达，采用GEPIA 平台进一步分析TCGA 数据库中CDCA 基因家族在胃癌组织中的表达。

结果：在Oncomine 数据库中共收集了2664个不同类型肿瘤的研究结果，CDCA 基因家族成员表达差异有统计学意义的研究结果共有427个，其中，表达上调的392个，表达下调的35个；在胃癌中高表达的研究有38个，低表达的研究有0个。

在GEPIA 数据库中有正常胃组织211例，胃癌组织有408例，CDCA1、CDCA2、CDCA3、CDCA4、CDCA5、CDCA6、CDCA7和CDCA8基因在胃癌组织的表达水平均显著高于癌旁组织（P <0.05），其改变倍数分别为2.756、2.275、2.734、1.719、2.991、1.080、3.399、3.880倍。

结论：CDCA 基因家族在胃癌中高表达，可能与胃癌的发生发展密切相关，有望成为胃癌早期诊断的潜在标志物。

［关键词］CDCA 基因家族；胃癌；Oncomine ；TCGAExpression of CDCA gene family in gastric cancer ：analysis based on databses such as OncomineCHEN Xiaoping ，WU Meizhu ，LIU Liya ，SHEN Aling ，CHEN Youqin ，PENG Jun.Academy of Integrative Medicine ，Fujian University of Traditional Chinese Medicine ，Fuzhou 350122，China［Abstract ］Objective ：To explore the expression of CDCA gene family in gastric cancer.Methods ：Expression of CDCA genefamily in different tumors were analyzed through Oncomine database and multiple databases ，and their expressions in gastric cancer in TCGA database were further analyzed using GEPIA platform.Results ：A total of 2664studies of CDCA gene family expression indifferent types of tumors were collected in Oncomine database ，and 427studies with significantly different expression of CDCA gene family was identified ，392of studies were significantly up -regulated ，while 35of studies were significantly down -regulated.In all 38of studies on gastric cancer ，CDCA gene family expression were all up parison between 211normal gastric tissues and 408gastric cancer tissues through GEPIA database revealed that expressions of CDCA1，CDCA2，CDCA3，CDCA4，CDCA5，CDCA6，CDCA7and CDCA8in gastric cancer tissues were significantly higher than adjacent tissues （P <0.05），and the fold changes were 2.756，2.275，2.734，1.719，2.991，1.080，3.399and 3.880，respectively.Conclusion ：CDCA gene family is highly expressed in gastric cancer and might involve in development of gastric cancer ，which may serving as a potential marker for early diagnosis of gastric cancer.［Key words ］CDCA gene family ；Gastric Cancer ；Oncomine ；TCGA胃癌是常见的恶性肿瘤之一，据2018年全球癌症数据分析显示：胃癌在全球发病率居常见肿瘤的第5位，病死率居第3位，严重威胁人们的生命和健康［1-3］。

管理学第三章数据仓库-联机分析处理课件

多维数组：由多个维和变量组合起来，称为多
维数组，是多维数据的表达方式。
（维1，维2，…，维n，变量）单元格：多维数组的取例:（值南称京,为一季单度元,计算格机（,82数5）据单
元)，可表示为
（维1维成员，…，维n维成员，变量值）
5
SQL Server 的Analysis 三种多维数据存储方式:
Q3 1034 1034 45 1002 940 759 58 728 812 1023 30 501
Q4 1142 1090 54 984 978 864 59 784 927 1038 38 580
23
3-D数据立方体表示：维是时间、类型、地区；度量为万元
地区
上海 1087 968 38 872
北京 818 746 43 591
南京
Q1 605 825 14 400
Q2 680 952 31 512
时间
Q3 812 1023 30 501
Q4 927 1038 38 580
计算机
安全
家庭娱乐
电话
类型
24
3.3.1 数据立方体
－由表到数据立方体
假定我们想从四维的角度观察销售数据，再附加一维供应商。观察4-D事物变得麻烦，可把4-D立方体看成3D立方体的序列：
3.旋转
改变一个页面显示的维方向的操作称为旋转（或转轴）。
32
广州城上海市北京
南京 605 825 14 400
【例3】类型和地区在一个2-D切片上转动。
计算机安全家庭娱乐电话
类型
旋转
类型
家庭娱乐计算机电话
安全
上海
605
825 14

不做肿瘤研究，有哪些好用的数据库？

不做肿瘤研究，有哪些好⽤的数据库？
在我们介绍的数据库中，TCGA、oncomine等等这些都是以肿瘤为主，GEO则是各种数据都包括的，⼤家常说我们⽐较偏⼼肿瘤研究的同学，让介绍⼀些不做⾮肿瘤⽅向的数据库，今天我们尽量推荐⼀些给⼤家。

1. ⼼⾎管系统——CardioGenBase：/
收录的疾病有冠⼼病、⾼⾎压等6种：
数据库整理了pubmed和medline中与这6种疾病有关的基因，我们可以直接搜索和查询相关的1500多个基因：
每个基因收录的信息包括了：表达、network、SNP、信号通路和药物：
2.⼼⾎管系统——CVDHD:/CVDHD/index.php
这个数据库收录了⼼⾎管系统疾病有关的35230种⼩分⼦药物以及2395蛋⽩、通路和分⼦标志物，我们可以直接查看和搜索：
3. 神经系统（阿尔茨海默症AD）——AlzBase：/alzBase/home
数据库收录了阿尔茨海默病相关的14145个基因，以及这些基因之间的⽹络关系，我们可以直接通过多个Gene ID进⾏检索：
4. 综合性的强⼤数据库：RGD Disease——/wg/portals/
这⾥⾯包括了肿瘤、⾎液病、⼼⾎管、糖尿病、神经系统、免疫等相关的各个分⽀，⽐如我们看⼀下糖尿病的结果，我们选择糖尿病并发症——糖尿病⾜，可以看到⼈、⼤⿏和⼩⿏物种⾥糖尿病⾜有关的基因信息：
包括了这些基因在三个物种中的信息，GO注释的信息，以及更多的每个基因的注释信息：
包括疾病、物种保守性、作⽤的化合物、miRNA等等：
当然，除了疾病外，RGD的功能还⾮常强⼤：
我们下次再介绍。