GeneXpert 质量控制

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赛沛方法学

赛沛方法学

赛沛方法学
赛沛方法学是一种基于GeneXpert 系统的分子诊断技术,具有准确性、快速性和安全性的特点。

其主要优势体现在以下几个方面:
- 自动化分子诊断流水线解决方案:GeneXpert® Infinity System 型号有 Infinity-80 和 Infinity-48s,通量分别为1280T/8h 和 768T/8h,兼容菜单有9项,可检测 Flu/RSV 等项目。

- 全院分子诊断 POCT 解决方案:GeneXpert® Dx System 包括 GX-II R2、GX-IV R2、GX-XVI R2 等型号,小通量为4通道,检测通量为16T/10h,并行项目有4个,可检测 MTB 项目;中通量为16通道,检测通量为64T/10h,并行项目有16个,也可检测 MTB 项目。

- 先进的样品制备和试剂稳定系统:采用超声装置进行样品制备,能够破碎原始样品并释放 DNA。

试剂采用冻干技术,只需常温运输和保存,降低了对运输和存储的要求。

- 独特的荧光定量 PCR 系统:采用模块化设计,每个样品通道有独立的加热/冷却系统、光学信号和检测系统。

每个模块都可以独立操控运行,并且各模块能同时进行多个反应程序互不干扰。

- 内部质量控制:包括探针检测、内参、样品制备质控三个内部质量控制系统,保证反应过程的严谨性。

赛沛方法学不仅提供了一个检测结果,还能帮助医生优化诊疗流程,改善病人的治疗效果。

其多机型、模块化和可扩展性的特点,也能满足不同场景下的用户需求。

赛沛 genexpert 原理

赛沛 genexpert 原理

赛沛 genexpert 原理以赛沛 Genexpert 是一种用于快速检测病原体的分子诊断技术。

它采用核酸扩增技术,能够在短时间内检测出病原体的存在,对于临床诊断和疾病控制具有重要意义。

Genexpert 技术原理是基于聚合酶链式反应(PCR)的扩增技术。

PCR 是一种体外快速扩增DNA的方法,将目标DNA片段经过多轮循环扩增后,可以得到数量可观的目标DNA。

Genexpert 利用PCR 技术扩增病原体的核酸,然后通过荧光探针实时检测扩增产物。

Genexpert 的扩增过程主要分为三个步骤:变性、引物结合和延伸。

首先,将样本中的病原体核酸变性,使其变为单链。

然后,引物与目标核酸的特异性序列结合,形成DNA-RNA 复合物。

最后,DNA 聚合酶以引物为模板,延伸目标核酸链,合成新的DNA 链。

这个过程将在循环中重复多次,每一轮都会使目标核酸的数量成倍增加。

Genexpert 的关键之处在于荧光探针的设计和检测系统的优化。

在扩增过程中,荧光探针会与目标DNA 片段结合,形成荧光信号。

这个信号会被检测系统实时监测,通过荧光信号的强度可以确定扩增产物的数量。

通过监测荧光信号的变化,可以确定样本中是否存在病原体。

Genexpert 技术的优点在于其快速、准确和高灵敏度。

相比传统的病原体检测方法,Genexpert 可以在短时间内完成检测,节省了时间和人力资源。

此外,Genexpert 还可以进行多种病原体的同时检测,提高了检测效率。

它的灵敏度高,能够检测到低浓度的病原体,有助于早期诊断和治疗。

Genexpert 技术在临床应用中有着广泛的用途。

它可以用于检测各种感染性疾病,如结核病、性病、呼吸道感染等。

此外,Genexpert 还可以用于判断病原体的耐药性,为临床治疗提供重要参考。

它还可以用于疫情监测和疾病防控,及时掌握病原体的传播情况,采取相应的措施。

总结起来,以赛沛Genexpert 是一种基于PCR 技术的分子诊断技术,能够快速、准确地检测病原体的存在。

genexpert技术及原理

genexpert技术及原理
个性化治疗
根据病原体基因变异情况,为患者提供个性化治 疗方案。
生物制药研发应用案例
靶点发现
利用genexpert技术筛选潜在的生物药物靶点。
药物筛选
通过比较药物处理前后基因表达谱的变化,筛选出具有潜在治疗 作用的候选药物。
药物作用机制研究
分析药物对生物体基因表达的影响,揭示药物的作用机制。
农业生物育种应用案例
稳定可靠
GenExpert技术经过长时 间的临床验证,具有稳定 可靠的性能,能够满足不 同实验室的需求。
适用于多种样本类型
适用多种样本类型
GenExpert技术可以应用于多种样本类型,如血液、组织、分泌物等,为不同 疾病的研究和治疗提供了便利。
兼容性强
GenExpert技术可以与多种试剂和仪器兼容,方便实验室根据自身需求进行选 择和组合。
02
03
序列捕获技术
序列分析
通过特定的探针与目标基因组 DNA进行杂交,从而捕获目标基 因组的所有序列。
对捕获的基因组序列进行深度测 序,获得高质量的基因组序列数 据。
基因组编-Cas9等基因编辑技术,对目标基因进行精确的敲
除、插入或替换。
靶向敲除
02
通过设计特定的sgRNA,引导Cas9核酸酶对目标基因进行精准
genexpert技术及原理
汇报人: 日期:
目录
• genexpert技术概述 • genexpert技术原理 • genexpert技术优势 • genexpert技术挑战与解决
方案 • genexpert技术应用案例 • genexpert技术未来发展趋

01
genexpert技术概述
genexpert技术定义

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制标题:GeneXpert 质量控制引言概述:GeneXpert 是一种广泛应用于临床诊断的快速核酸检测技术,其准确性和可靠性对于确保检测结果的准确性至关重要。

因此,进行 GeneXpert 检测时必须严格遵循质量控制标准,以确保检测结果的可靠性和准确性。

一、设备维护和校准1.1 定期清洁设备表面和内部零部件,保持设备干净整洁。

1.2 定期检查设备的校准情况,确保设备的准确性。

1.3 定期维护设备的零部件,及时更换损坏的部件,以保证设备的正常运行。

二、标本采集和处理2.1 确保标本采集时采用无菌技术,避免污染。

2.2 标本采集后,及时进行处理,避免标本变质影响检测结果。

2.3 标本处理时,严格遵守操作规程,避免交叉污染。

三、质控品使用3.1 定期使用质控品进行检测,确保 GeneXpert 检测结果的准确性。

3.2 质控品的使用应严格按照使用说明书上的要求进行操作。

3.3 记录质控品的使用情况,及时发现问题并进行纠正。

四、操作人员培训4.1 对操作人员进行系统的培训,确保其熟悉 GeneXpert 检测流程。

4.2 培训内容应包括设备操作、标本处理、质控品使用等方面。

4.3 定期进行操作人员的考核,确保其操作技能和知识水平。

五、质量控制文件管理5.1 建立完善的质量控制文件管理制度,包括设备维护记录、质控品使用记录等。

5.2 质量控制文件应保存完整、清晰,方便查阅和追溯。

5.3 定期对质量控制文件进行审查,及时发现问题并进行整改。

结论:严格遵循 GeneXpert 质量控制标准是确保检测结果准确性和可靠性的关键。

通过设备维护和校准、标本采集和处理、质控品使用、操作人员培训以及质量控制文件管理等方面的措施,可以有效提高 GeneXpert 检测的质量和可靠性,为临床诊断提供更准确的结果。

GeneXpert应用五年的得与失

GeneXpert应用五年的得与失

GeneXpert应用五年的得与失点击上方“结核帮”可以订阅哦!GeneXpert应用五年的得与失2015年12月5日,南非,开普敦,UNION第46届全球肺部健康大会2010年12月,世界卫生组织首次推荐使用GeneXpert应用于耐药高危人群以及HIV/TB感染高风险人群的早期检测。

GeneXpert以其高准确性、便捷性受到实验室的青睐,迅速在全球110个国家和地区获得推广。

为了充分分享结核病高负担国家将GeneXpert用于结核病及耐多药结核病的快速检测的经验,同时为未来开发结核病新诊断工具提供重要依据,2015年12月5日,来自巴西、南非和白俄罗斯等国家的结核病实验室人员在“国际肺部健康大会”第18分会场报告了5年来使用GeneXpert的收获及发现。

来自巴西NTP的Junior Ruy De Souza博士报告了巴西使用GeneXpert的经验。

巴西目前有143家结核病实验室配备了179台GeneXpert,通过系统的培训,巴西目前有250名实验室技术人员掌握了GeneXpert操作方法,实验室人员定期将实验室完成GeneXpert 检测的数据上报国家实验室,国家实验室工作人员对数据进行汇总,每隔两月公布GeneXpert完成检测例数、利福平耐药率以及无效比例等主要技术数据。

通过装备GeneXpert,从2013年到2015年,所有菌阳患者中,通过使用GeneXpert检出的比例由26%提高到90%。

目前GeneXpert主要用于对结核病及耐药结核病的检测,同时巴西将该技术用于耐药监测工作。

南非是世界结核病和艾滋病双重高负担国家,来自南非开普敦大学的Grant Theron博士介绍了南非使用GeneXpert用于TB/HIV双感患者的发现。

在开展GeneXpert前,南非在地区级检测中心开展线性探针用于耐多药结核病的诊断,一方面,与应用线性探针相比,GeneXpert大幅缩短耐药结核病患者的检出时间,使患者的死亡率下降20%;另一方面,患者发现率显著提高,由原先的87%提高到95%。

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制标题:GeneXpert 质量控制引言概述:GeneXpert是一种用于快速检测疾病的分子诊断技术,其准确性和可靠性对于临床诊断至关重要。

为了确保GeneXpert的质量控制,需要采取一系列措施来监测和维护其性能。

本文将详细介绍GeneXpert的质量控制措施。

一、设备维护1.1 定期清洁和消毒GeneXpert设备,保持其表面干净,避免交叉污染。

1.2 定期校准GeneXpert设备,确保其测量结果的准确性和稳定性。

1.3 定期检查设备的各项功能,包括温度控制、离心速度等,以确保设备正常运行。

二、试剂质量控制2.1 定期检查试剂的保质期和存储条件,避免使用过期试剂或受损试剂。

2.2 每次使用前,检查试剂的外观和标签,确保没有异常。

2.3 定期进行试剂的质量控制实验,验证试剂的准确性和稳定性。

三、操作规范3.1 操作人员需接受专业培训,熟悉GeneXpert设备的使用方法和操作流程。

3.2 操作人员需严格按照操作手册的要求进行操作,避免操作失误。

3.3 每次操作前,进行设备的自检程序,确保设备正常运行。

四、质量控制记录4.1 每次使用GeneXpert设备进行检测时,都要记录相关信息,包括操作人员、样本信息、试剂批号等。

4.2 定期进行质量控制记录的审核,确保记录的完整性和准确性。

4.3 建立质量控制记录的档案,便于追溯和分析。

五、质量控制评估5.1 定期进行GeneXpert设备的质量控制评估,包括内部质控和外部质控。

5.2 根据评估结果,及时调整和改进质量控制措施,确保GeneXpert设备的准确性和可靠性。

5.3 定期进行质量控制的培训和交流,提高操作人员的质量意识和技能水平。

结论:GeneXpert的质量控制是确保其准确性和可靠性的关键步骤,只有严格遵守质量控制措施,才能保证检测结果的准确性和可靠性,为临床诊断提供有力支持。

希望本文介绍的GeneXpert质量控制措施能够对相关人员有所帮助。

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制标题:GeneXpert 质量控制引言概述:GeneXpert是一种用于检测病原体的快速份子诊断技术,广泛应用于临床诊断和流行病学研究。

然而,为了确保GeneXpert检测结果的准确性和可靠性,必须进行严格的质量控制。

本文将详细介绍GeneXpert质量控制的重要性以及如何有效进行质量控制。

一、质量控制的重要性1.1 确保检测结果准确性GeneXpert技术对病原体的检测非常敏感,但如果质量控制不到位,可能会导致假阳性或者假阴性结果,影响诊断结果的准确性。

1.2 保证检测可靠性质量控制可以确保GeneXpert仪器的稳定性和可靠性,减少误差和不确定性,提高检测结果的可靠性。

1.3 符合监管要求临床实验室必须符合监管机构的要求进行质量控制,否则可能会受到处罚或者影响医疗机构的声誉。

二、质量控制的内容2.1 内部质量控制内部质量控制是指实验室自行制定的质控程序,包括日常监测仪器性能、标本处理和检测流程等。

2.2 外部质量评价外部质量评价是通过参加外部质量评价方案,与其他实验室进行比对,评估实验室的检测水平和准确性。

2.3 样品质量控制样品质量控制是指使用已知浓度的标准样品进行质控,确保GeneXpert仪器对样品的检测结果准确可靠。

三、质量控制的方法3.1 标准曲线法通过建立标准曲线,校准GeneXpert仪器的检测灵敏度和准确性,确保检测结果符合标准要求。

3.2 内部质控品使用内部质控品监测每次检测的准确性,及时发现仪器性能异常或者操作错误,保证检测结果可靠。

3.3 外部质量评价定期参加外部质量评价方案,与其他实验室进行比对,发现并纠正实验室检测中存在的问题,提高实验室的检测水平。

四、质量控制的标准4.1 准确性质量控制的标准是确保GeneXpert检测结果与实际情况一致,减少误差和偏差,提高检测结果的准确性。

4.2 稳定性质量控制的标准是确保GeneXpert仪器的稳定性,保证长期使用时检测结果的一致性和可靠性。

脑脊液GeneXpert检测方法和多种生物标志物在结核性脑膜炎诊疗中的应用研究演示课件

脑脊液GeneXpert检测方法和多种生物标志物在结核性脑膜炎诊疗中的应用研究演示课件

多种生物标志物的表达与结核性脑膜炎的相关性:研究结果显示,多种生物标志物(如细胞因子、趋化因子、急性期反应蛋白等)在结核性脑ห้องสมุดไป่ตู้炎患者脑脊液中的表达水平与健康对照组存在显著差异,这些生物标志物的变化与结核性脑膜炎的病理生理过程密切相关。
生物标志物在结核性脑膜炎诊疗中的应用价值:通过综合分析生物标志物的表达谱和临床数据,发现某些生物标志物可以作为结核性脑膜炎的早期诊断指标、疾病活动度监测指标以及治疗反应预测指标,为结核性脑膜炎的精准诊疗提供了新的思路和方法。
实验对象
收集患者的脑脊液样本,并进行相关生物标志物的检测。
样本收集
脑脊液GeneXpert检测方法
采用GeneXpert MTB/RIF技术对脑脊液样本进行结核分枝杆菌及其耐药性的快速检测。
生物标志物的检测
利用免疫学、生化学等方法检测脑脊液中多种生物标志物,如腺苷脱氨酶、乳酸、C反应蛋白等。
数据记录
早期诊断
通过对治疗过程中患者脑脊液样本的连续检测,可以实时监测治疗效果,及时调整治疗方案。
疗效监测
根据检测结果可以评估患者的预后情况,为临床医生制定个性化治疗方案提供依据。
预后评估
多种生物标志物在结核性脑膜炎诊疗中的应用
03
病原相关生物标志物
如结核分枝杆菌特异性抗原、抗体等,用于结核性脑膜炎的诊断和病情监测。
病情监测
动态观察生物标志物的变化,可以评估结核性脑膜炎患者的病情严重程度和治疗效果。
预后评估
某些生物标志物的水平与结核性脑膜炎患者的预后密切相关,可用于预测患者的预后情况。
敏感性比较
不同生物标志物在结核性脑膜炎患者中的敏感性存在差异,需根据具体情况选择合适的标志物进行检测。

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制引言概述:GeneXpert是一种常用的分子诊断技术,用于检测病原体的核酸序列。

然而,为了确保GeneXpert的准确性和可靠性,质量控制至关重要。

本文将介绍GeneXpert质量控制的重要性,并详细阐述其四个方面的内容。

一、质量控制的概念和意义1.1 简介:质量控制是指通过一系列的标准和程序来确保实验室分析结果的准确性和可靠性。

1.2 重要性:质量控制可以帮助实验室发现和纠正分析过程中的错误,提高实验结果的可靠性。

1.3 目的:通过质量控制,可以评估实验室的性能,并确保分析结果符合预期。

二、GeneXpert质量控制的方法2.1 内部质量控制:使用已知浓度的阳性和阴性对照样本进行测试,以评估GeneXpert的准确性和灵敏度。

2.2 外部质量控制:参加外部质量评估计划,与其他实验室共同进行检测,以评估GeneXpert的一致性和可比性。

2.3 质量控制记录:建立质量控制记录,记录每次质量控制的结果,以便追溯和分析。

三、GeneXpert质量控制的指标3.1 精确度:通过与已知结果的对比,评估GeneXpert的测量结果与真实值之间的接近程度。

3.2 灵敏度:评估GeneXpert的检测限度,即它能够检测到的最低浓度的目标核酸序列。

3.3 特异性:评估GeneXpert对非目标核酸序列的识别能力,以避免误报结果。

四、GeneXpert质量控制的实施和管理4.1 培训和教育:对实验室人员进行培训,使其了解GeneXpert质量控制的重要性和操作方法。

4.2 定期维护:定期检查和维护GeneXpert设备,确保其正常运行和准确性。

4.3 质量控制监测:建立监测机制,定期监测GeneXpert质量控制的结果,并及时采取纠正措施。

结论:GeneXpert质量控制是确保该分子诊断技术准确性和可靠性的重要手段。

通过正确实施和管理质量控制,可以提高实验室的分析结果的可靠性,并确保病原体的检测结果符合预期。

GeneXpert技术及原理pptx

GeneXpert技术及原理pptx
PCR扩增
将合成的cDNA作为模板,加入特异性引物进行PCR扩增。
cDNA合成
将提取得到的总RNA反转录为cDNA,常用的方法包括反转录酶法、试剂盒法等。
凝胶电泳
将PCR扩增产物进行凝胶电泳分析,根据电泳条带的位置和数量判断基因表达谱情况。
引物设计
根据目标基因序列,设计特异性引物。
数据分析
根据凝胶电泳的结果,进行数据分析,包括基因表达量的计算、差异表达基因的筛选等。
xx年xx月xx日
genexpert技术及原理pptx
介绍genexpert技术概述genexpert技术工作原理genexpert技术的应用genexpert技术的实验结果讨论和结论
contents
目录
介绍
01
探讨genexpert技术及原理,分析其在基因检测中的应用价值。
研究目的
基因检测在医学和生物学领域具有广泛应用,但目前存在一些技术瓶颈和挑战。
基因专家技术的创新性和实用性
基因专家技术的结论
总结基因专家技术的结论,包括技术发展的意义、应用前景和社会效益等。
基因专家技术的未来发展前景
展望基因专家技术的未来发展趋势和应用前景,包括未来的发展方向、技术瓶颈和社会影响等。
基因专家技术的结论和前景
THANKS
谢谢您的观看
通过提取样品中的总RNA,反转录为cDNA,利用特异性引物进行PCR扩增,对得到的扩增产物进行凝胶电泳,通过分析电泳条带的位置和数量,对基因表达谱进行分析。
基因突变检测
根据不同基因型对特异性引物的识别能力不同,通过设计针对突变位点的特异性引物,进行PCR扩增,通过分析扩增产物的大小和特异性引物的识别能力,检测基因突变。
论文框架:本文将分别从目的、背景、综述、研究方法、结果和结论等方面对genexpert技术及原理进行详细介绍和分析。主要内容genexpert技术及原理的综述genexpert技术在医学和生物学领域的应用genexpert技术的实验方法和结果分析genexpert技术的优势和局限性结论和展望

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制引言概述:GeneXpert是一种常用于诊断和监测疾病的份子诊断技术。

然而,为了确保GeneXpert的准确性和可靠性,质量控制至关重要。

本文将探讨GeneXpert质量控制的重要性以及如何进行有效的质量控制。

一、GeneXpert质量控制的重要性1.1 提高结果的准确性:GeneXpert质量控制可确保份子诊断结果的准确性,减少误诊和漏诊的风险。

1.2 保证实验的可重复性:通过进行质量控制,可以确保GeneXpert实验在不同时间和不同实验室中的可重复性,提高实验结果的可靠性。

1.3 提高实验室的信誉度:通过有效的质量控制,实验室可以建立良好的声誉,吸引更多的合作火伴和客户。

二、GeneXpert质量控制的方法2.1 内部质量控制:内部质量控制是通过使用已知浓度的标准样品来验证GeneXpert的准确性和可靠性。

实验室应定期检测标准样品,比较实际结果与预期结果,以评估实验的准确性。

2.2 外部质量控制:外部质量控制是通过参预外部质量评估计划来验证GeneXpert的准确性。

实验室应定期发送样本给认可的质量评估机构进行检测,比较实验结果与其他实验室的结果,以评估实验的可靠性。

2.3 设备维护和校准:定期进行设备维护和校准是GeneXpert质量控制的重要环节。

实验室应按照设备创造商的建议,定期清洁和校准设备,确保设备的正常运行和准确性。

三、GeneXpert质量控制的指标3.1 灵敏度:灵敏度是评估GeneXpert的检测能力的重要指标。

实验室应使用已知阳性样本进行测试,确保GeneXpert能够准确检测到目标基因。

3.2 特异性:特异性是评估GeneXpert的识别能力的重要指标。

实验室应使用已知阴性样本进行测试,确保GeneXpert不会产生假阳性结果。

3.3 重复性:重复性是评估GeneXpert实验可重复性的指标。

实验室应重复测试同一样本,比较结果的一致性,以评估实验的可靠性。

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制(针对于所有的Cepheid 检测试剂)GeneXpert系统是针对于一次性使用、充分整合及组合式检测试剂盒的全封闭式操作系统.在每个检测试剂盒(每个病人样本检测)内均有控制和检查系统。

其作用是检查试剂、病人样本、裂解、扩增、以及检测试剂盒本身完整性。

使用Cepheid 检测盒进行检测的每个病人样本,其在检测的每一个步骤过程中均包含了内部控制检查,且这种检查并不局限于某一天.日常使用的外部质量控制并不能提供在每个特定的病人(样本)在Cepheid检测盒检测中的,超越内部质量控制系统额外信息。

内部控制被用在了每一个病人样本上(见下表)1.样本处理控制(SPC):它控制每个病人标本中的联合提取和联合扩增,控制样本的处理步骤包括裂解和提取、核酸的完整性检查以及试剂冻干珠的复溶。

因为每个特定的测试被视为有1个或者其他的序列变异,所以在基因分型实验中,样本的功能作为自带的内部控制,监测正常的和突变的基因序列。

•如果在一个阴性样本中,SPC 检测失败,将会显示一个“无效”的结果报告。

•如果没有信号出现在基因分型的测试中,将会显示一个“无效”的结果报告。

2.扩增控制(AC):这种控制能监测酶的完整性和可能存在的PCR抑制剂,因为每个特定的测试将会被视为有1个或者其他的序列变异,所以在基因分型实验中,样本的功能作为自带的内部控制,将监测正常的和突变的基因序列.确保实验所需的最小数量的人类样本细胞,能被联合提取的和联合扩增,获得的目标靶向基因将被用来以确保样本的收集、准备。

•如果在一个阴性样本中,扩增控制失败,将会显示一个“无效”的结果报告。

•如果没有信号出现在基因分型的测试中,将会显示一个“无效”的结果报告。

3.试剂控制(探针检查):这个监控检查的是探针的完整性和试剂盒内部各类试剂的溶合重建状态。

•根据不同的测试,将有2-6个特异性的荧光测量标准,如果探针检查失败,将会显示一个“错误"的结果报告4.仪器系统控制:这个监控检查光路、温度、模块和每个试剂盒的机械完整性。

最新TSPOT与gene-xpert的优劣比较

最新TSPOT与gene-xpert的优劣比较

TSPOT与gene-xpert的优劣比较:1. 首先gene-xpert的优势是可以检测是结核病,如若可以规避其弊端的话可以证明是活动性结核进行抗痨治疗,但是TSPOT检测的是现症感染,就是说机体感染了结核分枝杆菌,对于潜伏性结核患者有很高的检出率,可以在机体免疫状况比较好,疾病还没有爆发的时候检测到感染状态,根据发展为活动性结核的危险程度制定治疗方案,简单讲可以早发现早治疗,有利于患者健康。

2. gene-xpert称其灵敏度有90%以上,实际上基于患者是菌阳结核患者,如果是菌阴结核患者灵敏度约68%。

而且值得一提的是CFDA(国家食品药品监督管理局)批文中指出gene-xpert用于菌阳患者,也就是说gene-xpert 在采样时很难取到带菌标本,而且有很大一部分结核患者是菌阴结核,另外对于肺外结核更难取样,此时gene-xpert容易出现假阴;相比而言,tspot采用外周血,不需要带菌标本且对于肺外结核的诊断具有很大优势。

3. gene-xpert的实验操作复杂,专业要求高,需要分子的扎实基础和娴熟的实验操作,另外实验室安全级别高,实验室如果达不到要求则会严重影响实验的准确性和灵敏度,操作过程中容易有外源物质的引入进而影响结果,出现假阳性。

而TSPOT 实验相对简单,实验中提取PBMC( 外周单个核细胞,其中主要是淋巴细胞)时有洗涤去除了背景因素(红细胞、药物、内毒素等)的影响,原理上尽可能排除假阳性的结果。

4. 另外对于第一点的补充,在风湿科等科室中用药前要结核筛查,而这部分患者中一般没有典型的结核中毒症状(注:心脏病患者中大部分同样也没有典型的结核中毒症状),不知道病灶部位,不适合采用gene-xpert方式,此时TSPOT 具有很大优势。

5. gene-xpert取样是病灶部位的样本如心包积液但并不是其独有的有点,TSPOT 同样在可以做非血样本(胸水、腹水等,注:针对我们心脏病专科医院的话就是心包积液),且特异性和灵敏度都很好,甚至针对所有结核患者的话其灵敏度远远高于gene-xpert。

TSPOT与gene-xpert的优劣比较

TSPOT与gene-xpert的优劣比较

TSPOT与gene-xpert的优劣比较:1. 首先gene-xpert的优势是可以检测是结核病,如若可以规避其弊端的话可以证明是活动性结核进行抗痨治疗,但是TSPOT检测的是现症感染,就是说机体感染了结核分枝杆菌,对于潜伏性结核患者有很高的检出率,可以在机体免疫状况比较好,疾病还没有爆发的时候检测到感染状态,根据发展为活动性结核的危险程度制定治疗方案,简单讲可以早发现早治疗,有利于患者健康。

2. gene-xpert称其灵敏度有90%以上,实际上基于患者是菌阳结核患者,如果是菌阴结核患者灵敏度约68%。

而且值得一提的是CFDA(国家食品药品监督管理局)批文中指出gene-xpert用于菌阳患者,也就是说gene-xpert 在采样时很难取到带菌标本,而且有很大一部分结核患者是菌阴结核,另外对于肺外结核更难取样,此时gene-xpert容易出现假阴;相比而言,tspot采用外周血,不需要带菌标本且对于肺外结核的诊断具有很大优势。

3. gene-xpert的实验操作复杂,专业要求高,需要分子的扎实基础和娴熟的实验操作,另外实验室安全级别高,实验室如果达不到要求则会严重影响实验的准确性和灵敏度,操作过程中容易有外源物质的引入进而影响结果,出现假阳性。

而TSPOT 实验相对简单,实验中提取PBMC( 外周单个核细胞,其中主要是淋巴细胞)时有洗涤去除了背景因素(红细胞、药物、内毒素等)的影响,原理上尽可能排除假阳性的结果。

4. 另外对于第一点的补充,在风湿科等科室中用药前要结核筛查,而这部分患者中一般没有典型的结核中毒症状(注:心脏病患者中大部分同样也没有典型的结核中毒症状),不知道病灶部位,不适合采用gene-xpert方式,此时TSPOT 具有很大优势。

5. gene-xpert取样是病灶部位的样本如心包积液但并不是其独有的有点,TSPOT 同样在可以做非血样本(胸水、腹水等,注:针对我们心脏病专科医院的话就是心包积液),且特异性和灵敏度都很好,甚至针对所有结核患者的话其灵敏度远远高于gene-xpert。

芯片解密系列之三-Cepheid公司的GeneXpert芯片

芯片解密系列之三-Cepheid公司的GeneXpert芯片

Cepheid公司的GeneXpert芯片第一部分:公司产品简介Cepheid公司(中文名为赛沛)于1996年3月成立于加利福尼亚州,其成立目标是解决使用常规PCR分析仪进行分子诊断过程中的各种痛点:操作过程复杂,需要专业技术人员进行操作,测试过程容易被污染,导致测试失败,检测结果容易出现“假阳性”等。

目前,Cepheid公司已经开发出了各种各样的GeneXpert分子诊断试剂盒和专门对该试剂盒进行全自动分析的测试仪器,凭借其雄厚的技术实力,Cepheid公司已经成为全球分子诊断行业的领导企业,目前GeneXpert在全球的装机量已经超过了1.1万台,在美国医院的分子诊断同类设备中,GeneXpert的装机量占比最高,接近25%。

正因为该公司具有良好的发展潜力,2016年9月6日,丹纳赫公司宣布计划以40亿美元收购Cepheid公司。

如下图为2010年至2014年GeneXpert仪器在全球的装机总量累计图和测试盒Xpert MTB/RIF的销售总数累计图。

图1.1 GeneXpert在全球的装机总量累计图和Xpert MTb/RIF试剂盒销售数量累计图。

Cepheid公司产品的发展目标是在任何时候对任何病人的任何样品进行任何分子方面的诊断,其GeneXpert产品也是按照这一理念进行开发的。

2000年5月,该公司发布第一代产品Smart Cycler检测系统,该检测系统从开始研发之初便设立了全自动分子诊断的标准,以后开发的GeneXpert测试仪便是在此严格的开发流程和标准之下进行不断更新换代而来。

图1.2 Cepheid公司的GeneXpert检测仪器以及检测芯片。

到目前为止,GeneXpert产品已经发展成为世界上最先进的全自动分子诊断平台,它能够将样品制备,核酸扩增与检测完全整合到一个小小的检测试剂盒中,使得即使不具备专业技术的人员也可以进行复杂的分子检测,而且针对不同的疾病或病原菌,该公司已经开发出了功能齐全的试剂盒产品,满足患者从常规传染病到癌症基因检测的各个领域。

支气管肺泡灌洗液GeneXpert-MTBRIF检测在活动性肺结核诊断中的效能

支气管肺泡灌洗液GeneXpert-MTBRIF检测在活动性肺结核诊断中的效能

支气管肺泡灌洗液GeneXper,MTB/RIF检测在活动性肺结核诊断中的效能虞忻吴海燕赵静张建平【摘要】目的探讨支气管肺泡灌洗液XperwMTB/RIF检测对肺结核早期诊断的价值。

方法选择2017年9月~2018年9月在苏州大学附属传染病医院肺科住院,临床诊断肺结核患者共158例,分别对其支气管肺泡灌洗液及痰标本行GeneXperwMTB/RIF法(简称“Xpert法”)检测,同时对其支气管肺泡灌洗液行涂片抗酸染色镜检、MGIT960培养、荧光定量PCR,并对Xpert法检测法结果进行分析。

结果Xpert法检测支气管肺泡灌洗液阳性率明显高于涂片找抗酸杆菌,差异有统计学意义(!<0.05);支气管肺泡灌洗液培养阳性率也明显高于涂片找抗酸杆菌,差异有统计学意义(P<0.05);支气管肺泡灌洗液PCR检测结核分枝杆菌DNA阳性率也明显高于涂片找抗酸杆菌,差异有统计学意义(P<0.05)。

Xpert法检测阳性率明显高于PCR 检测结核分枝杆菌DNA,差异有统计学意义"P<0.05);上述四项联合检测阳性率明显高于Xpert法、结核培养等,差异有统计学意义(P<0.05)o而Xpert法检测阳性率与痰培养阳性率比较,差异无统计学意义(P> 0.05)。

以支气管肺泡灌洗液结核培养为金标准,Xpert法检测敏感度78.75%,特异度为65.38%。

支气管镜 BALF Xpert法检测阳性率57.0%,痰Xpert法检测阳性率32.3%,支气管肺泡灌洗液Xpert法检测阳性率明显高于痰标本,差异有统计学意义(P<0.05)0结论支气管肺泡灌洗液Xpert法检测相比痰检及其他传统检测方法快捷、安全、高敏感性,能很大程度提高结核病及耐药结核的早期诊断率,有极大的临床应用前景。

【关键词】Xpert MTB/RU;结核病;支气管镜;BALF;结核培养Efficiency of Xpert MTB/RIF detection in bronchoalveolar lavage fluid in the diagnosis of active tuberculosis YU Xin,WU Hai-yan,ZHAO Jing,ZHANG Jian-pingDepartment of Pulmonary and Laboratory,Soochow University Afi—ated Hospital for Infectious Disease,the Fifth Peo­ple s Hospital f Suzhou,Suzhoo,Jiangse215000,China+Abstract]Objective To evaluate different detection methods in Bronchoscope BALF for early diagnosis of pulmonag tuberculosis.Methods From September2017to September 2018,158cases of BALF and sputum sam­ples were examined with XpeW-MTB/RIF.Meanwhile,158cases of BALF were examined with acid-fast staining,sputum culture,drug sensitivity test in vitro,fluorescence quantitative PCR,and the data of XpeW-MTB/RIF was an­alyzed.Results The positive rate of Xpert MTB/RU in bronchoalveolar lavaac fluiO was sivnificantly higher than that in smear(P<0.05).The DNA positive rate of Mycobacterium tuberculosis detected by BALF PCR was also sig­nificantly higher than that of acid-fast bacillus smear(P<0.05).The positive rate of Xpert MTB/RIF was signifi­cantly higher than that of PCR in detecting Mycobacterium tuberculosis DNA(P<0.05).The positive rate of the a­bove four combined tests was significantly higher than that of Xpert MTB/RIF and tuberculosis culture(P<0.05),but the positive rate of Xpert MTB/RIF was not significantly different from that of sputum culture(P>0.05).Using BALF tuberculosis culture as the gold standard,the sensitivity of Xpert MTB/RIF was78.75%and the specificity was65.38%.The positive rates of BALF Xpert MTB/RIF and Xpert MTB/RIF in sputum were57.0%and32.3% respectively.The positive rate of BALF Xpert MTB/RIF in bronchoscopy was significantly higher than that in sputum (P<0.05).Conclusion Compared with sputum examination and other traditional detection methods,bronchoscopy BALF Xpert MTB/RIF can improve the early diagnosis rate of tuberculosis and drug-resistant tuberculosis to a great extent,and it has a great clinical application prospect.+Keywords]Xpert MTB/RIF;tuberculosis;bronchoscope;BALF;tuberculosis culturedot:10.3969/j.issn.1009-6663.2021.06.003基金项目:苏州市科技局民生科技项目(No.SYS201778、SS201880);江苏省青年医学人才项目(No.QNRC2016226)作者单位:215000江苏苏州,苏州大学附属传染病医院苏州市第五人民医院科和检验科通信作者:张建平;E-mail:906168980B 结核病是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tu­berculosis,MTB)感染的慢性呼吸系统传染病,其中以肺结核为最常见,并严重威胁人类健康和生命安全。

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制

GeneXpert 质量控制引言概述:GeneXpert是一种常用于份子诊断的设备,它能够快速、准确地检测出特定基因或者病原体。

然而,为了确保GeneXpert的结果准确可靠,质量控制是必不可少的。

本文将详细介绍GeneXpert质量控制的重要性以及如何进行质量控制。

一、GeneXpert质量控制的重要性1.1 提高结果准确性GeneXpert质量控制的主要目的是确保设备的结果准确可靠。

通过进行质量控制,可以检测GeneXpert的性能是否正常,避免因设备故障或者操作错误导致的误差,从而提高结果的准确性。

1.2 保证实验重复性在份子诊断中,实验的重复性非常重要。

通过进行质量控制,可以确保不同实验之间的结果一致性,避免实验误差对结果的影响。

这对于临床诊断的准确性和可靠性至关重要。

1.3 提高实验室的信誉度质量控制是实验室质量管理的重要组成部份。

通过进行质量控制,可以提高实验室的信誉度,使其在同行评审、认证和认可等方面更具竞争力。

这对于实验室的长期发展和声誉至关重要。

二、GeneXpert质量控制的方法2.1 内部质控内部质控是实验室自身进行的质量控制。

通过使用已知的阳性和阴性样本进行测试,可以评估GeneXpert的性能。

内部质控的方法包括使用质控品、人工制备样本和盲测等。

2.2 外部质控外部质控是通过参加由独立机构组织的质控项目来评估实验室的性能。

参预外部质控可以提供与其他实验室的比较,评估实验室的准确性和可靠性。

常见的外部质控项目包括国家和地区的质控计划以及国际质控组织组织的质控项目。

2.3 设备维护和校准设备的维护和校准是确保GeneXpert性能稳定的重要步骤。

定期进行设备的维护和校准,可以发现和解决潜在的问题,保证设备的正常运行。

此外,还应定期检查设备的使用环境,确保符合要求。

三、GeneXpert质量控制的指标3.1 灵敏度和特异性灵敏度和特异性是衡量GeneXpert性能的重要指标。

结核分枝杆菌GeneXpert核酸扩增检测操作步骤

结核分枝杆菌GeneXpert核酸扩增检测操作步骤

结核分枝杆菌GeneXpert核酸扩增检测操作步骤-CAL-FENGHAI-(2020YEAR-YICAI)」INGBIAN结核分枝杆菌GeneXpert核酸扩增检测操作步骤一.准备工作:1. 开机①依次开启:UBS电源、仪器电源、打印机电源、笔记本电脑电源;⑥ 等待笔记本电脑进入系统,出现四个用户图案时,选择用户Cepheid,输入密码:cphd,等待约一分钟后系统弹出登录窗口,依次输入用户名和密码;③等待Gene-Xpert操作软件的启动与自检过程,自检过程中软件出现“数据库管理”提示窗,点选“否”;再在“存档”提示窗点选“否”,待模块进展显示“可用” o④仪器预热15分钟后再进行检测。

2. 耗材准备①标本处理液.©Cartridge反应盒、③前处理管(带有盖子的试管)、④塑料滴管(每个标本准备2支)、⑥待检标本。

3 •样品预处理①询处理管标号或粘贴条形码,再吸取2ml标本处理液在前处理管中,加入lml标本;②旋紧盖子,旋涡仪振荡10秒或剧烈摇动10-20次,室温静置10分钟,再旋涡仪振荡10秒或剧烈摇动10-20次,室温静置5分钟,观察无可见块状痰标本存在。

4.试剂盒①拆开Cartridge反应盒包装,小心取出,不要接触到正面的二维码、上面胶盖和后面有尖端区域,避免污染,可在侧面编号或粘贴条码。

②小心上拔开启Cartridge反应盒蓝色上盖的前部,取处理后的样品2ml,沿样品加入口的内壁缓缓加入反应盒内(避免吸到未液化的粘液部分,吸液量可以略超过两毫升,把尖端残液保留不注入,以免产生气泡)。

二、测定操作:1 .在GeneXpert Dx系统窗口的工具栏点击『创建测试』;2•在“扫描患者ID条形码”弹窗,选“手动输入患者条形码”,再输入患者的姓名:3. 在“扫描样品ID条形码”弹窗选“手动输入”,再在弹窗内输入痰检的实验室编号:4•在“扫描检测盒条形码”弹窗内,用扫码方法(或手动)输入测试盒上的条码,成功后软件自动指定待运行板块((注意:为了保障每个模块有均等的运行机会,软件会选择运行次数最少的模块;但手工可以选择不同的模块)。

GeneXpert全自动荧光定量PCR系统及其检测意义

GeneXpert全自动荧光定量PCR系统及其检测意义

GeneXpert全自动荧光定量PCR系统及其检测意义一、GeneXpert全自动荧光定量PCR系统介绍Xpert MTB/RIF以实时荧光PCR为原理,检测结核分枝杆菌复合群特有的利福平耐药基因(rpoB基因),能快速报告患者样本中是否有结核分枝杆菌及其是否利福平耐药。

该系统完全整合了基于定量PCR的分子遗传检测所需的三个步骤(样品准备,扩增,检测)并将其自动化,只需将样品加入系统专用反应盒中,系统就会自动按照“核酸提取→扩增→检测”方式运行。

所有的稀释及提取步骤均在试剂盒的不同通道中完成,最大程度地减少了污染的发生。

GeneXpert系统在准备样品及核酸的提取环节完全实现自动化。

DNA提取所需的复杂步骤都在其microfluidic微流样品池里完成。

GeneXpert反应盒可以容纳各种容积的样品,并将初始样品浓缩。

样品的浓缩和纯化增加了测试结果的敏感度。

样品核酸被提取后,进入反应管并在其中扩增至被检测。

GeneXpert系统在扩增过程中使用的模块具有高精度定量PCR所需的快速升温降温循环功能,同时还可以实时监测每个上样孔内的化学反应,以便快速复制出足够的样品核酸拷贝数并在第一时间将其检测出来。

GeneXpert系统中每个模块都是独立工作的,因而可以同时进行不同的检测。

GeneXpert系统对目标核酸序列的检测具有高度的光学敏感性,实时的光学监测使得软件可以一经发现目标序列就给出结果,极大缩短了得到检测结果所需的时间。

GeneXpert全自动荧光定量PCR系统可以满足临床对于结核的诊断快速、准确的要求,并能获得耐药结果,及时干预,可以达到“检测即治疗”、防止耐药性结核传播的目的。

二、GeneXpert定量PCR的检测意义GeneXpert在结核病诊断中具有高敏感度和高特异度,其敏感性及特异性均大于抗酸杆菌染色,与结核杆菌培养及药敏试验结合使用能大大提高结核杆菌检出率,如果检查结果显示阳性提示发现了结核杆菌的存在,可能是结核感染引起,还能够评估是否存在耐药结核的现象,但是也需要结合具体综合性的评估。

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GeneXpert质量控制(针对于所有的Cepheid 检测试剂)
GeneXpert系统是针对于一次性使用、充分整合及组合式检测试剂盒的全封闭式操作系统。

在每个检测试剂盒(每个病人样本检测)内均有控制和检查系统。

其作用是检查试剂、病人样本、裂解、扩增、以及检测试剂盒本身完整性。

使用Cepheid 检测盒进行检测的每个病人样本,其在检测的每一个步骤过程
中均包含了内部控制检查,且这种检查并不局限于某一天。

日常使用的外部质量控制并不能提供在每个特定的病人(样本)在Cepheid检测盒检测中的,超越内部质
量控制系统额外信息。

内部控制被用在了每一个病人样本上(见下表)
1.样本处理控制(SPC):它控制每个病人标本中的联合提取和联合扩增,
控制样本的处理步骤包括裂解和提取、核酸的完整性检查以及试剂冻干珠的
复溶。

因为每个特定的测试被视为有1个或者其他的序列变异,所以在基因
分型实验中,样本的功能作为自带的内部控制,监测正常的和突变的基因序
列。

•如果在一个阴性样本中,SPC 检测失败,将会显示一个“无效”的结果报告。

•如果没有信号出现在基因分型的测试中,将会显示一个“无效”的结果报告。

2.扩增控制(AC):这种控制能监测酶的完整性和可能存在的PCR抑制剂,
因为每个特定的测试将会被视为有1个或者其他的序列变异,所以在基因分
型实验中,样本的功能作为自带的内部控制,将监测正常的和突变的基因序
列。

确保实验所需的最小数量的人类样本细胞,能被联合提取的和联合扩增,获得的目标靶向基因将被用来以确保样本的收集、准备。

•如果在一个阴性样本中,扩增控制失败,将会显示一个“无效”的结果报告。

•如果没有信号出现在基因分型的测试中,将会显示一个“无效”的结果报告。

3.试剂控制(探针检查):这个监控检查的是探针的完整性和试剂盒内部各类
试剂的溶合重建状态。

•根据不同的测试,将有2-6个特异性的荧光测量标准,如果探针检查失败,
将会显示一个“错误”的结果报告
4.仪器系统控制:这个监控检查光路、温度、模块和每个试剂盒的机械完整性。

•热力和机械检查运行,如果系统控制失败,将会显示一个“错误”的结果报告
5.结果的可靠性:
•对多重性的基因遗传和感染性疾病进行检测,采用相关的运算方法对每个扩增分析物进行分析,当相应的运算方法不被满足的情况下,将显示“错误”或
者“无效”的报告
当上述控制发现不符合规范标准,针对于病人样本和测试运行,一个错误的
代码,没有结果或者无效的结果会明确的被显示出来。

而在一个单独的试剂盒内运行一个外部控制并不能预测特定的测试样本。

外部控制可以提供有关于运输,批号,储存条件,操作能力和同类比较的有
价值信息。

因此,当面对许多变化,包括新的运输方式、或经历了重要的服务活动,或每隔30天后,在每一个实验室里,对于性能测试的验证,外部控制依然是被推
荐的。

Cepheid 承认,这些都是基于科学依据,相应的验证性研究和临床试验而
得出的结论。

最终的决定和责任依然取决于实验室负责人,实验应遵循和适用于当地的法规。

Xpert检测试剂盒中的全部控制过程示意表格*
*特定的利用控制依赖于对目标的分析。

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