载体通用引物序列 - 360文档中心

常用载体及相关通用引物

常用载体及相关通用引物默认分类2008-10-06 13:16:31 阅读512 评论0 字号：大中小载体一端另一端pBlueScriptSK(+) M13F(-77)/M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-88)/M13R(-48)/M13R/T3 pcDNA3 H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 BGHpcDNA3.1(+) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.0(+)/myc-His C/A/B H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 BGHpcDNA3.1(+)/myc-His C/A/B H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1(+)/myc-His/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/His C/A/B H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/His/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Hygro(-) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Hygro(+) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Hygro/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/V5-His C/A/B H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/V5-His/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/V5-His-TOPO H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/V5-His-TOPO/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Zeo(-) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Zeo(+) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Zeo/CAT H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpColdI DNA p-GEX3’pColdII DNA p-GEX3’pColdIII DNA p-GEX3’pColdIV DNA p-GEX3’pDream2.1 H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 SP6pEGFP-N1,2,3 H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5 pEGFP-N-3’/pEGFP-C-5’/pEGFP-C-3' pET15b T7 T7terpET20b T7 T7terpET22b T7 T7terpET28a T7 T7terpET28b T7 T7terpET30b T7 T7terpFastBac Dual pEGFP-C-3'pFastBac HT A,B,C pEGFP-C-3'pFastBac1 pEGFP-C-3'pGEM-T Easy M13F(-77)/M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-88)/M13R(-48)/M13RpGEX-4T-1/3 p-GEX5’ p-GEX3’pGS-21a p-GEX5’ T7terpLenti6/V5-D-TOPO M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-48)/M13R/T3pLenti6/V5-GW/lacZ M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-48)/M13R/T3pMAL-p2x M13F(-47)/M13F/PBV220R M13R(-48)pMD18-T M13F(-77)/M13F(-47)/M13F M13R(-88)/M13R(-48)/M13RpMD19-T M13F(-77)/M13F(-47)/M13F M13R(-88)/M13R(-48)/M13RpMTBiPV5-His GFP p-GEX3’/ M13F(-47)/M13F M13R(-88)/M13R(-48)/M13R /pEGFP-C-3'/BGH pPCR script M13F(-77)/M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-88)/M13R(-48)/M13R/T3pPIC3.5 5’AOX 3’AOXpPIC9 5’AOX 3’AOXpPICZ C/A/B 5’AOX 3’AOXpPICZalpha C/A/B 5’AOX/α-Factor 3’AOXpSecTag2 A,B,C H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 BGHpTWIN T7 T7terpUC57 M13F(-77)/M13F(-47)/M13F M13R(-88)/M13R(-48)/M13RpUC18 M13F(-47)/M13F M13R(-48)/M13RpUC19 M13F(-47)/M13F M13R(-48)/M13R其他…… ……注：1）排列顺序为：有左到右==（离插入为点）由远到近；2）若有多个引物，红色的为首选引物：3）选择测序通用引物时，以距离插入位点约50碱基为佳；4）同时有T7，T7ter的载体，单反应首选T7ter；5）同时有T7，pCDNA3.1R的载体，单反应首选pCDNA3.1R ；6）同时有T7，BGH的载体，单反应首选BGH；7）同时有pCMV-F，BGH的载体，单反应首选BGH；。

测序常见问题分析与解答

测序常见问题分析与解答1、DNA测序样品用什么溶液溶解比较好?答：溶解DNA测序样品时，用灭菌蒸馏水溶解最好。

DNA的测序反应也是Taq酶的聚合反应，需要一个最佳的酶反应条件。

如果DNA用缓冲液溶解后，在进行了测序反应时，DNA溶液中的缓冲液组份会影响测序反应的体系条件，造成Taq酶的聚合性能下降。

有很多客户在溶解DNA测序样品时使用TE Buffer。

的确，TE Buffer能增加DNA样品保存期间的稳定性，但TE Buffer对DNA测序反应有影响，根据我们的经验，我们还是推荐使用灭菌蒸馏水来溶解DNA测序样品。

2、提供DNA测序样品时，提供何种形态的比较好？答：我们推荐客户提供菌体，由我们来提取质粒，这样DNA样品比较稳定。

如果您要以提供DNA样品，我们也很欢迎，但一定要注意样品纯度和数量。

提供的测序样品为PCR产物时，特别需要注意DNA的纯度和数量。

PCR产物应该进行切胶回收，否则无法得到良好的测序效果。

有关DNA测序样品的详细情况请严格参照“DNA测序样品准备及注意事项”部分的说明。

3、提供的测序样品为菌体时，以什么形态提供为好？答：一般菌体的形态有：平板培养菌、穿刺培养菌，甘油保存菌或新鲜菌液等。

我们提倡寄送穿刺培养菌或新鲜菌液。

平板培养菌运送特别不方便，我们收到的一些平板培养菌的培养皿在运送过程中常常已经破碎，面目全非，需要用户重新寄样。

这样既误时间，又浪费客户的样品。

一旦是客户非常重要的样品时，其后果更不可设想。

而甘油保存菌则容易污染。

制作穿刺菌时，可在1。

5ml的Tube管中加入琼脂培养基，把菌体用牙签穿刺于琼脂培养基(固体)中，37℃培养一个晚上后便可使用。

穿刺培养菌在4℃下可保存数个月，并且不容易污染，便于运送。

4、与测序引物有关的问题：答：对于通用测序引物，只要正确使用，一般不会有太大问题，测序引物问题主要发生在客户自己提供的PCR引物上。

应该明确的一点是并不是所用的用于PCR的引物都可以用来作测序，以下几种PCR引物将是不适合用作测序引物的：(1)简并引物，简并引物必然要在测序模板上有多个结合位点，直接影响测序结果。

常用pGEX载体图谱

常用pGEX载体图谱Rosetta系列的表达菌株可以提供T7 RNA聚合酶，它能表达PET系列载体上的外源基因。

pGEX系列载体上的外源基因不需要T7 RNA 聚合酶，普通的大肠杆菌经IPTG诱导即可表达Tac启动子是一组由Lac和trp启动子人工构建的杂合启动子，受Lac阻遏蛋白的负调节，它的启动能力比Lac和trp都强。

其中Tac 1是由Trp启动子的－35区加上一个合成的46 bp DNA片段(包括Pribnow 盒)和Lac操纵基因构成，Tac 12是由Trp的启动子-35区和Lac 启动子的-10区，加上Lac操纵子中的操纵基因部分和SD序列融合而成蛋白标签：A myc tag is a polypeptide proteintag derived from the c-myc gene product that can be added to a proteinusing recombinant DNA technology. It can be used for affinity chromatography, then used to separate recombinant, overexpressed protein from wild type protein expressed by the host organism. Itcan also be used in the isolation of protein complexes with multiple subunits.A myc tag can be used in many different assays that require recognition byan antibody. If there is no antibody against the studied protein, adding a myc-tag allows one to follow the protein with an antibody against the Myc epitope. Examples are cellular localization studies by immunofluorescence or detectionby Western blotting.The peptide sequence of the myc-tag is (in 1- and 3-letter codes, respectively):N-EQKLISEEDL-C,N-Glu-Gln-Lys-Leu-Ile-Ser-Glu-Glu-Asp-Leu -C, where N stands for Amino-terminus and C stands for Carboxy terminus. The tag is approximately 1202 Daltons in atomic mass and has 10 amino acids.It can be fused to the C-terminus andthe N-terminus of a protein. It is advisablenot to fuse the tag directly behind the signal peptide of a secretory protein, since it can interfere with translocation intothe secretory pathway.A monoclonal antibody against themyc epitope, named 9E10, is available from the non-commercial Developmental Studies Hybridoma BankpGEX4T1载体基本信息出品公司: GE别名: pGEX-4T-1, pGEX4T1, pGEX 4T 1质粒类型: 大肠杆菌蛋白表达载体表达水平: 高拷贝启动子: Tac克隆方法: 多克隆位点，限制性内切酶载体大小: 4969 bp5' 测序引物及序列: pGEX5': GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG3' 测序引物及序列: pGEX3': CCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGG载体标签: N-GST载体抗性: Ampicillin 氨苄备注: 复制子是pMB1产品目录号: 27-4580-01稳定性: 瞬时表达 Transient组成型: 诱导表达病毒/非病毒: 非病毒pGEX4T1载体质粒图谱和多克隆位点信息原核生物DNA复制起始点，是DNA链上独特的具有起始DNA复制功能的碱基序列。

DNA测序常见问题分析及解决办法总结

DNA测序常见问题分析及解决办法总结PCR类型测序模板注意事项PCR类型测序模板注意事项•总反应体积建议为50uL或100uL，扩增结束后取3ul用1%左右的琼脂糖电泳检测，应为单一的条带。

3ul样品总量不低于50ng(非常小的PCR产物可以酌情减小)，PCR产物产量过低说明PCR扩增结果不是很理想，应改进条件重新扩增。

•对于有杂带和扩增弥散的PCR产物，需经琼脂糖电泳将目的片段切下来并回收，建议将PCR 产物作克隆后进行测序。

有杂带的和扩增弥散的PCR产物即使通过琼脂糖电泳纯化，测序仍有可能出现双峰等异常结果。

•经上述检测合格的PCR产物，需经过琼脂糖电泳纯化去除未反应的引物，dNTP，引物二聚体等影响测序反应的组分。

有多种纯化方法可供选择，Promega，Qiagen和生工等公司都有相应的产品可供选择。

纯化后的PCR产物经电泳检测估计总量应不低于200ng/Kb(非常小的PCR产物可以酌情减小)。

•与质粒模板相比，PCR产物彼此间差异很大，因此，每个PCR模板应尽可能提供相应的PCR 退火温度和PCR产物的长度，以供测序时参考。

•PCR模板一般不应短于200bp，过短的PCR产物应经克隆后进行测序。

•纯化好的PCR产物应溶于双蒸水中，TE缓冲液会严重影响测序反应。

•若让公司对PCR产物进行纯化，PCR产物需满足∶总量不低于1ug/kb，片段长度不低于200bp •各种PCR测序模板均应提供相应的测序引物，并尽可能提供引物的全序列，并将引物浓度准确稀释到5pmole/ul 。

引物浓度的换算关系∶总ng数 = pmole x 分子量/1000由于PCR产物测序相对较难，为使您能拿到一个好的结果，请尽量满足上述要求。

DNA测序常见问题分析及解决办法总结测序常见问题分析序列中出现N值的常见原因：通常有以下几种情况将造成测序结果中N值较多：•PCR产物直接进行测序，在PCR产物长度以后将无反应信号，机器将产生许多N值。

pMD18-T使用说明书(附序列)

●使用注意
1. Solution I 请于冰中融解。 2. 克隆时使用的 Insert DNA 片段（PCR 产物）建议进行切胶回收纯化，否则 PCR 产物中的短片段
DNA（甚至是电泳也无法确认的非特异性小片段）、残存引物等杂质都会影响 TA 克隆效率。 3. 按照本实验操作进行连接后，直接进行转化时的连接液不要超过 20 μl。当要转化的 DNA 量较大或
4）全量（10 μl）加入至 100 μl JM109 感受态细胞中，冰中放置 30 分钟。 5）42℃加热 45 秒钟后，再在冰中放置 1 分钟。 6）加入 890 μl SOC 培养基，37℃振荡培养 60 分钟。 7）在含有 X-Gal、IPTG、Amp 的 L-琼脂平板培养基上培养，形成单菌落。计数白色、蓝色菌落。 8）挑选白色菌落，使用 PCR 法确认载体中插入片段的长度大小。
40.4
0
* 效率是指白色菌落中的目的 DNA Insert 片段的连入效率。
■一般 DNA 片段的克隆实验
1）在微量离心管中配制下列 DNA 溶液，全量为 5 μl。
pMD®18-T Vector*1
1 μl
Insert DNA*3
0.1 pmol～0.3 pmol
dH2O
up to 5 μl
-2-
准备进行电转化时，需对连接液进行乙醇沉淀，纯化 DNA 后再进行转化。进行乙醇沉淀时使用核酸共沉剂（TaKaRa Code：D605A）可以提高 DNA 的回收率。 4. 连接反应请在 25℃以下进行，温度升高（>26℃）较难形成环状 DNA。连接效率偏低时，可适当延长连接反应时间至数小时。 5. 本制品来源于 pUC18 载体，因此，适合 pUC18 载体的感受态细胞都可以使用，如：JM109 等。

常见载体引物与序列

3’AOX
3'AOX 无反向引物 pQE-R: T7TER
3.0REV
2.0REV M13R T3 SP6 T7/M13R T3 T3/M13R M13R pTarget.R T7TER pTRC99C-R T7 T7TER(客户确认再用）
M13R(-48)
M13R BGH T3/M13R/M13R(-48) SP6
GTT CTG AGG TCA TTA CTG G TGA GCG GAT AAC AAT TTC AC TCA AGC CTC AGA CAG TGG TTC TGA AGC GCA TGA ACT CCT TG TCC CAC AAC GAG GAC TAC AC ATT ATA GAG GAC ACC TAG TC TTC CAA AAT GTC GTA ATA AC TGC GTA CTG CGG TGA TCA AC CTG CAA GGC GAT TAA GTT GG ACG CAC AGA ATC TAG CGC TT AAC CAT CTC GCA AAT AAA TA TAA GAG TCA CTT TAA AAT TTG TAT AC CCA GGA TTT TCC CAG TCA C GGC TTT ACA CTT TAT GCT TC ACA TCC ACT TTG CCT TTC TC TCG GTT AGA GCG GAT GTG TCA TCG GAA GAG AGT AG AAG AGT TAC TCA AGA ACA AGA A GGT AGG CGT GTA CGG TGG GCA CTG GAG TGG CAA CTT CTT ACT GAC ATC CAC TTT GC CAC TGC ATT CTA GTT GTG GT CCA GGC TTT ACA CTT TAT GC

总结了测序中经常遇到的问题及原因分析,希望对大家有帮助!

总结了测序中经常遇到的问题及原因分析，希望对大家有帮助！Q:测序结果中为什么找不到引物序列?A:找不到用来测序的引物，这是正常的，因为测序的方法是荧光标记测序法，仪器通过检测 ddNTP 上的荧光来读取所测序列，而引物本身是不被标记的，所以仪器无法检测到；找不到所测片段的扩增引物，这种情况是因为您所采用的酶切位点离所用的测序引物距离太近，一般荧光燃料会干扰几十个碱基的读取，这部分碱基会损失掉，损失掉的序列很可能就包含引物的序列，所以引物的序列无法找到；测出的引物序列是原引物序列的反向互补序列，这是因为 TA 克隆的插入没有方向性，如果插入片段是相反的，这时就要反向互补查找引物；测出的结果为空载体，这是因为由于某种原因导致质粒上没有插入外源片段，这时所测的为载体序列，所以就找不到引物了；存在单引物扩增，有一条引物的特异性不好，有多个结合位点，导致只有一条引物参与扩增。

Q:为什么测序结果中引物的序列有个别碱基不同了?A: 这是因为引物区同样存在错配的可能，出现这种可能性有两种: 合成错误和引物区有错配我们可以挑选同批次 2个以上的克隆进行测序验证，如果结果完全相同，应该是合成错误；如果在引物的相同位置错误的碱基不一样那就应该是引物区有错配。

Q:哪些引物不适合作为测序引物?A:①兼并引物：简并引物要在测序模板上有多个结合位点，直接影响测序结果；②随机引物：如 RAPD 引物，随机引物一般都比较短，所用退火温度低，在测序反应的条件下，不能很好地与模板结合；③过长的引物：一般要求测序引物不大于 24bp，过长的引物在测序反应的较低的条件下容易在测序模板上有多个结合位点，导致测序结果背景增高。

另外，较长的引物纯度也将难以保证。

通常用于测序的引物纯度要在 90%以上，引物纯度低时，测序反应的背景将明显增大，直接影响到测序结果；④有特殊标记的引物：该情况主要指荧光标记的引物。

我们测序反应的四种碱基都是荧光标记的，这样，荧光标记的引物将产生干扰。

测序通用引物序列

测序通用引物序列常见载体的测序引物：Primer of Vector:Vector：Primer(F)；Primer(R)pACT T7 T3pACT2 GAL4 AD pACT2-RpAS2-1 GAL4 BD pAS2-1.RpB42AD pB42ADF pB42ADRpBACPAK8 BAC1 BAC2pBK-CMV T7 T3PBS(SK/KS)/M13- M13F/T7 T3/M13RpBV220 PBV220F PBV220RpCAMBIA 1301(1300) P1 P2pCAMBIA 2300 M13R(-48) M13F(-47)PCANTB5E S1/M13R S6pCAT3-enhancer RVP3 此载体无反向引物pcDNA3.0 CMV-F/T7 SP6/BGHpcDNA3.1 T7 BGHpcDNA4 T7/CMV-F BGHpcDNA6 T7/CMV-F(J21025在T7前面）BGHpcDNAII T7 SP6pCE2.1 M13F M13RpCEP4 pCEP-F EBV-RpCF-T M13F M13RpCI T7（17Base）此载体无反向引物pCI-neo T7（17Base）T3pCMS-EGFP T7 T3pCMV-3Tag-4A T3 /PFLAG-CMV-F T7pCMV5 pCMV5F pCMV5RpCMV5-Flag pCMV5F pCMV5RpCMV-MYC/HA pCMV-F pCMV-RpCMV-Sport M13F/T7 SP6/M13RpCMV-Tag(KAN+) T3 T7pCR2.1-TOPO M13F/T7 M13RpCR3.1 T7 BGHpCS2 SP6 T7pDonar M13F M13RpDONR221 M13F M13RpDrive T7 SP6pDRIveR(KAN+) T7 SP6pDsRED1-C1 pDsRED-ex-C1-F pEGFP-N-3’(距离很近,一般不用) pDsRED2-C1(KAN+) pDsRED-ex-C1-F pEGFP-N-3’pDSRED-N1(KAN+) pEGFP-N-5’ PDSRED-N-RpECFP-C pEGFP-C-5’ pECFP-C-3′pECFP-N1 pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pEF/myc/ER pEF-F pCDNA3.1RpEGFP-C(KAN+) pEGFP-C-5’ pEGFP-C-3′pEGFP-N(KAN+) pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pENTR/D-TOPO(KAN+) M13F M13RpET-*(His)(KAN+) T7 T7 TerpET22(a,b,c)(AMP+) T7 T7 TerpET28,30,24,49(KAN+) T7 T7 TerpET32(a,b,c)(AMP+) T7/S.tag T7 TerpET50(amp+) T7/s.tag T7TERpET44(AMP+) T7/s.tag T7 TerpEYFP-N1 pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pEYFP-C1 pEGFP-C-5’ pEGFP-C-3′pFLAG-CMV pFLAG-CMV -F pFLAG-CMV -R pGAD424 GAL4 AD 3′ADpGADGH GAL4 AD 3′ADpGADT7-Rec GAL4 AD/T7 3′ADpGAPZa-A a-FACTOR 3′AOXpGBKT7(Kana+) T7 3′BDpGEM-T(-Easy) M13F/T7 SP6/M13RpGEX-(*)T pGEX-4T-5’ pGEX-4T-3’pGL2 GLP1 GLP2pGL3 RVP3 GLP2(RVP4)(没有特别说明用GLP2) PinpointTM Vector Pinpoint Primer SP6pIRES PIRES-F/T7 T3/PIRES-R (J40720)pIRES2-EGFP pIRES2-EGFP.P5’ pIRES2-EGFP.P3’pLXSN pLXSN-F pLXSN-RpMAL-c2E MalE primer M13F(-47)pMAL-C2x P5’ P3’pMAL-p2X MalE primer M13F(-47)PMD18-T M13R(-48) M13F(-47)PMD19-T M13F(-47) M13R(-48)pPIC9K(AMP+、ZEO+）5’AOX/a-factor 3’AOX pPICZa 5′AOX/PPICZa-F 3′AOXpPROEXHTA M13R(-48) 无反向引物pQE30or40 pQE30-F pQE-R:pRSET T7 T7TERpSilencer3.1-H1 hygro M13F(-47) 3.0REV pSILENCEV2.0-U6 T7 2.0REVpSK01-T M13F M13RpSK-CMV(KAN+) T7 T3pSP72 T7 SP6pSport1 SP6/M13F(-47) T7/M13RpSUPER T7 T3pTA2 M13F/T7(优先使用M13F）T3/M13RpT-Adv M13F /T7 M13RpTARGET TM pTarget.F(在T7前面）/T7 pTarget.R pTO-T7 T7 T7TERpTRC99a-c pTRC99C-F pTRC99C-RpTriPLEx2 5′pTriPLEx2 T7pTWIN-1 T7 T7TER(客户确认再用）pUC18(19)/118(119) M13F(-47) M13R(-48)pUCm-T M13F/T7 M13RpVAX1 T7 BGHpWSK29 T7/M13F/M13F(-47) T3/M13R/M13R(-48)pXT7 T7 SP6pYES2 T7 pYes2.RpLEXA pLEXA-F pLEXA-RpLNCX pLNCX-F pLNCX-RpRECEIVER CMV-F 此载体无反向引物pSHUTTLE-CMV PSHUTTLE-CMV-F PSHUTTLE-CMV-R pSP64/65 SP6 此载体无反向引物pSTBlue-1 T7 SP6pT7Blue(R) T7 M13F(-47)引物名称序列(5′-3′)：M13R：CAG GAA ACA GCT ATG ACCM13F：TGT AAA ACG ACG GCC AGTM13F(-47)：CGC CAG GGT TTT CCC AGT CAC GACM13R(-48)：AGC GGA TAA CAA TTT CAC ACA GGAM13(-96)：CCC TCA TAG TTA GCG TAA CGSP6：ATT TAG GTG ACA CTA TAGT7：TAA TAC GAC TCA CTA TAG GGT7 terminator：TGC TAG TTA TTG CTC AGC GGT3：ATT AAC CCT CAC TAA AGG GApGEX-4T-5′：GGG CTG GCA AGC CAC GTT TGG TG pGEX-4T-3′：CCG GGA GCT GCA TGT GTC AGA GG GLp1：TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TGGLp2：CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CARVp3：CTA GCA AAA TAG GCT GTC CCRVp4：GAC GAT AGT CAT GCC CCG CGpcDNA3.1R：TAG AAG GCA CAG TCG AGGPinPoint primer：CGT GAC GCG GTG CAG GGC G pCMV-F：TCT AAA AGC TGC GGA ATT GTpCMV-R：TCCAAACTCATCAATGTATCpTRC99C-F: TTG CGC CGA CAT CAT AACpTRC99C-R: CTGCGTTCTGATTTAATCTGpCEP-F: AGA GCT CGT TTA GTG AAC CGEBV-R : GTG GTT TGT CCA AAC TCA TCpIRES2-EGFP.P5’: GTA GGC GTG TAC GGT GGG AG pIRES2-EGFP.P3’: AAC GCA CAC CGG CCT TAT TC3′AD: AGA TGG TGC ACG ATG CAC AGCMV -F：CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTGS1：CAA CGT GAA AAA ATT ATT ATT CGCS6：GTA AAT GAA TTT TCT GTA GTA GG5`AOX1：GAC TGG TTC CAA TTG ACA AGC3`AOX1：GCA AAT GGC ATT CTG ACA TCCα-Factor：TAC TAT TGC CAG CAT TGC TGCGAL4 AD：TAC CAC TAC AAT GGA TGpACT2-R：GTGCACGATGCACAGTTGAApB42ADF：CCA GCC TCT TGC TGA GTG GAG ATGpB42ADR：AAG CCG ACA ACC TTG ATT GGA GpEGFP-N-5’：TGG GAG GTC TAT ATA AGC AGA G pEGFP-N-3’：CGT CGC CGT CCA GCT CGA CCA G pEGFP-C-5’：CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G pEGFP-C-3′ ：TAT GGC TGA TTA TGA TCA GTPBV220F：AAG AAG GGC AGC ATT CAA AGPBV220R：CTG CGT TCT GAT TTA ATC TGU6：ATG GAC TAT CAT ATG CTT ACC GTA2.0rev primer：AGG CGA TTA AGT TGG GTA3.0rev：GAG TTA GCT CAC TCA TTA GGCS.tag：GAA CGC CAG CAC ATG GAC5′TriplEx2：CTC CGA GAT CTG GAC GAG CRVP4：GAC GAT AGT CAT GCC CCG CGRVP3：CTA GCA AAA TAG GCT GTC CCpQE30-R：GTT CTG AGG TCA TTA CTG GpQE30-F：TGA GCG GAT AAC AAT TTC ACpEF-F：TCA AGC CTC AGA CAG TGG TTCpDSRED-N1-R：TGA AGC GCA TGA ACT CCT TG pDsRED-express-C1-F：TCC CAC AAC GAG GAC TAC AC pCMV5R：ATT ATA GAG GAC ACC TAG TCpCMV5F：TTC CAA AAT GTC GTA ATA ACP5′：TGC GTA CTG CGG TGA TCA ACP3′：CTG CAA GGC GAT TAA GTT GGBAC2：ACG CAC AGA ATC TAG CGC TTBAC1：AAC CAT CTC GCA AAT AAA TA3′BD：TAA GAG TCA CTT TAA AAT TTG TAT AC pTarget.F：CCA GGA TTT TCC CAG TCA CpTarget.R：GGC TTT ACA CTT TAT GCT TCT7(17base)：ACA TCC ACT TTG CCT TTC TCpYes2.R：TCG GTT AGA GCG GAT GTGGAL4 BD：TCA TCG GAA GAG AGT AGpAS2-1.R：AAG AGT TAC TCA AGA ACA AGA ApFlag-CMV-F: GGT AGG CGT GTA CGG TGGpFlag-CMV-R: GCA CTG GAG TGG CAA CTTpIRES-F: CTT ACT GAC ATC CAC TTT GCpIRES.R: CAC TGC ATT CTA GTT GTG GTP1：CCA GGC TTT ACA CTT TAT GCP2：GCG ATT AAG TTG GGT AAC GCpLEXA-F：CGT CAG CAG AGC TTC ACC ATpLEXA-R：TAA AAC CTA AGA GTC ACT TTpLNCX-F：AGC TCG TTT AGT GAA CCG TCA GAT CG pLNCX-R：ACC TAC AGG TGG GGT CTT TCA TTC CC pLXSN-F：CTT GAA CCT CCT CGT TCG ACpLXSN-R：GTT GCT GAC TAA TTG AGA TGpSHUTTLE-CMV-F：GGT CTA TAT AAG CAG AGG TG pSHUTTLE-CMV-R：GTG GTA TGG CTG ATT ATG ATC AG MalE Primer：GGT CGT CAG ACT GTC GAT GAA GCC。

载体及通用引物

pCANTB5E
S1
S6
pCAT3-enhancer
RVP3
此载体无反向引物
pCDFDuet-1(MCSI)
ACYCDuetUP1 Primer
DuetDOWN1
pCDFDuet-1(MCSII)
DuetUP2
T7TER
pcDNA1.1
CMV-Profor,T7
pCDM8-3
pcDNA2.1
M13for/T7
EGFP-Nrev/ PEGFP-N-3′
pEGFP-C
PEGFP-C-5′
PEGFP-C-3′
pEGFP-C1
EGFP-Cfor
SV40-pArev
pEGFP-C2
EGFP-Cfor
SV40-pArev
pEGFP-C3
EGFP-Cfor
SV40-pArev
pEGFP-F
EGFP-Cfor
SV40-pArev
T7
T7-Terminator
pET-25b(+)
T7
T7-Terminator
pET-26b(+)
T7
T7-Terminator
pET-27b(+)
T7
T7-Terminator
pET-28a(-b,-c)(+)
T7
T7-Terminator
pET-29a(-b,-c)(+)
S.tag/T7
T7-Terminator
T7-Terminator
pET-20b(+)
T7
T7-Terminator
pET-21(-a,-b,-c,-d)(+)
T7

常用载体构建说明书

常用载体构建说明书步骤：一、基本耗材准备（抗生素、LB液体培养基、LB固体培养基、离心管、枪头、三角瓶）二、制备感受态大肠杆菌三、设计引物四、Pcr扩增五、Pcr产物检测六、Pcr产物回收七、双酶切pcr产物和质粒八、酶切产物回收九、目的基因与载体连接十、转化感受态大肠杆菌十一、单克隆检测十二、测序比对十三、提质粒十四、酶切验证十五、转化感受态农杆菌十六、单克隆检测十七、侵染液配制一、基本耗材准备1、抗生素的制备（抗生素为索来宝公司）常用抗生素Kan（卡那）Amp（氨苄）Rif（利福平）母液浓度：Kan 50mg/ml Amp 100 mg/ml Rif 100 mg/ml工作浓度：Kan 50ng/ul Amp 100 ng/ul Rif 100 ng/ul举例：称取kan固体1g 于注射器中，加入20ml ddH2O，溶解后用过滤器注入灭过菌的离心管中，-20度保存，使用比例1:1000注意：Rif溶解时加入DMSO2、培养基的配制LB液体培养基1000ml 200ml牛肉膏5g 1g蛋白胨10g 2g氯化钠10g 2gLB固体培养基1000ml 200ml牛肉膏蛋白胨氯化钠琼脂粉5g10g10g15g1g2g2g3g120℃高温高压灭菌15-20min，固体培养基冷却后加入相应抗性，加入比例1:1000，然后把培养基倒90cc的培养皿中，一般情况下一个培养皿可倒20ml培养基。

3、离心管、枪头、三角瓶0.2ml、1.5ml、2.0ml离心管各200-500个，50ml离心管2个10ul、200ul、1000ul 枪头各2盒50ml、100ml、250ml 、500ml三角瓶各2个去离子水或双蒸水500ml二、制备感受态大肠杆菌（所用超级感受态细胞制备试剂盒购于上海生工）BT Media 培养基制备：1支BT Media加50 ml蒸馏水配制，放入250ml三角瓶，高压灭菌即可准备工作：将BT Buffer A和BT Buffer B 放冰上遇冷，遇冷低温离心机至4℃1、用超低温冰箱中保存的菌种在LB平板上进行划线，置37℃培养箱中静置培养12-16h待菌落生长到1-2mm大小。

常用载体通用引物

pBR322(BamHI-site)
PBRforBam
PBRrevBam
pBR322(EcoRI/HindIII-sites)
pBRforEco
pBRrevHind
pBR325(BamHI-site)
PBRforBam
PBRrevBam
pBR329(BamHI-site)
PBRforBam
PBRrevBam
pDONR223
M13F
M13R
pDrive
T7/M13rev
SP6/M13for
pDsRED1-C1
(DsRed1-N-f)
DsRed1-C-r
pDsRed1-N1
CMV-Profor
RFP-Nrev,CMV-R?
pDsRed2-N1
(DsRed1-N-f)
DsRed1-C-r
pDsRed2-C1
BGH rev
pcDNA6/myc-His(A,B,C)
CMV-Profor,T7
BGH rev,c-mycrev
pcDNA6/V5-His(A,B,C)
CMV-Profor,T7
BGH rev,V5rev
pCEP4
pCEP-F/CMV-Profor
EBVrev
pCI
T7(17BASE)
EBVrev
T7,CMV-Profor
BGH rev,c-mycrev
pcDNA4/TO
TREfor/CMV-Profor
BGH rev
pcDNA4/V5-His(A,B,C)
CMV-Profor,T7
BGH rev,V5rev
pcDNA4-TET/0N/AMP+

秦银兵载体和通用引物

Forward Primer T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7（需与客户确认） T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 T7 PET upstream primer/T7 PET upstream primer/T7 PET upstream primer/T7 PET upstream primer/T7/S.tag PET upstream primer/T7/S.tag PET upstream primer/T7/S.tag PET upstream primer/T7/S.tag
T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER ColiDown ColiDown
pET-43.1-44 Ek/LIC pET-44a(+) pET-44b(+) pET-44c(+) pET-45b(+) pET-46 Ek/LIC pET-47b(+) pET-48b(+) pET-49b(+) pET-50b(+)
Reverse Primer T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER T7TER

常用载体及相关通用引物

常用载体及相关通用引物默认分类2008-10-06 13:16:31 阅读512 评论0 字号：大中小载体一端另一端pBlueScriptSK(+) M13F(-77)/M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-88)/M13R(-48)/M13R/T3 pcDNA3 H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 BGHpcDNA3.1(+) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.0(+)/myc-His C/A/B H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 BGHpcDNA3.1(+)/myc-His C/A/B H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1(+)/myc-His/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/His C/A/B H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/His/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Hygro(-) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Hygro(+) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Hygro/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/V5-His C/A/B H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/V5-His/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/V5-His-TOPO H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/V5-His-TOPO/LacZ H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Zeo(-) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Zeo(+) H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpcDNA3.1/Zeo/CAT H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 pCDNA3.1R/BGHpColdI DNA p-GEX3’pColdII DNA p-GEX3’pColdIII DNA p-GEX3’pColdIV DNA p-GEX3’pDream2.1 H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 SP6pEGFP-N1,2,3 H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5 pEGFP-N-3’/pEGFP-C-5’/pEGFP-C-3' pET15b T7 T7terpET20b T7 T7terpET22b T7 T7terpET28a T7 T7terpET28b T7 T7terpET30b T7 T7terpFastBac Dual pEGFP-C-3'pFastBac HT A,B,C pEGFP-C-3'pFastBac1 pEGFP-C-3'pGEM-T Easy M13F(-77)/M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-88)/M13R(-48)/M13RpGEX-4T-1/3 p-GEX5’ p-GEX3’pGS-21a p-GEX5’ T7terpLenti6/V5-D-TOPO M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-48)/M13R/T3pLenti6/V5-GW/lacZ M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-48)/M13R/T3pMAL-p2x M13F(-47)/M13F/PBV220R M13R(-48)pMD18-T M13F(-77)/M13F(-47)/M13F M13R(-88)/M13R(-48)/M13RpMD19-T M13F(-77)/M13F(-47)/M13F M13R(-88)/M13R(-48)/M13RpMTBiPV5-His GFP p-GEX3’/ M13F(-47)/M13F M13R(-88)/M13R(-48)/M13R /pEGFP-C-3'/BGH pPCR script M13F(-77)/M13F(-47)/M13F/T7 M13R(-88)/M13R(-48)/M13R/T3pPIC3.5 5’AOX 3’AOXpPIC9 5’AOX 3’AOXpPICZ C/A/B 5’AOX 3’AOXpPICZalpha C/A/B 5’AOX/α-Factor 3’AOXpSecTag2 A,B,C H1.3F/pCMV-F /pEGFP-N-5/T7 BGHpTWIN T7 T7terpUC57 M13F(-77)/M13F(-47)/M13F M13R(-88)/M13R(-48)/M13RpUC18 M13F(-47)/M13F M13R(-48)/M13RpUC19 M13F(-47)/M13F M13R(-48)/M13R其他…… ……注：1）排列顺序为：有左到右==（离插入为点）由远到近；2）若有多个引物，红色的为首选引物：3）选择测序通用引物时，以距离插入位点约50碱基为佳；4）同时有T7，T7ter的载体，单反应首选T7ter；5）同时有T7，pCDNA3.1R的载体，单反应首选pCDNA3.1R ；6）同时有T7，BGH的载体，单反应首选BGH；7）同时有pCMV-F，BGH的载体，单反应首选BGH；。

a18引物序列 -回复

a18引物序列-回复什么是a18引物序列？a18引物序列是一种用于分子生物学实验的引物。

引物是DNA或RNA的短片段，它们可以定向地结合到目标序列上，作为DNA复制或基因扩增的起始点。

a18引物序列是在DNA分析和研究中经常使用的一种引物序列。

为什么要使用a18引物序列？使用a18引物序列有多种原因。

首先，它具有高度特异性，可以准确地选择目标序列。

这对于需要特定目标序列的实验非常重要，如PCR（聚合酶链式反应）扩增特定基因片段。

其次，a18引物序列在设计时考虑了目标序列的特性，如长度和碱基组成，以确保引物与目标序列的完全匹配。

最后，a18引物序列已经在许多实验中得到验证和应用，因此可以提供可靠和重复的实验结果。

如何选择a18引物序列？选择a18引物序列时，需要考虑许多因素。

首先，引物的长度通常在18-25个碱基对之间，这可以确保引物在PCR或其他实验中的特异性。

其次，引物的碱基组成应符合目标序列的特点，如GC含量和碱基间的配对规则。

此外，引物的末端通常要求有一些特定的结构，如3'末端带有一定长度的单链DNA，以便于PCR扩增。

最后，引物的选择还需要考虑目标序列的位置和互相之间的空间关系，以确保引物可以完全结合到目标序列上。

如何设计a18引物序列？设计a18引物序列需要借助一些基因分析软件或在线工具。

这些工具可以根据输入的目标序列自动设计合适的引物序列。

在设计引物时，首先需要将目标序列输入到软件中，然后根据需要选择引物的参数，如长度和碱基偏好性。

设计软件会根据这些参数生成多个可能的引物序列，并提供相关的评估指标，如特异性和二聚体形成的潜在。

根据这些指标和需求，研究人员可以选择最适合实验的a18引物序列。

如何使用a18引物序列？一旦获得了适当的a18引物序列，可以将其应用于各种分子生物学实验中。

最常见的应用是PCR扩增。

在PCR反应中，引物序列与目标序列特异性结合后，通过酶的作用逐渐扩增目标序列。

pet28a通用引物序列

pet28a通用引物序列
Pet28a 是一种常用的原核高效表达载体，通常用于大肠杆菌中表达融合蛋白。

为了在大肠杆菌中克隆 Pet28a 载体上的特定基因，需要使用 Pet28a 的通用引物。

Pet28a 的通用引物是 T7 正向和反向引物。

T7 正向引物通常位于基因的上游区域，用于向载体的 DNA 序列中引入 T7 启动子，以便在宿主细胞中的表达。

T7 反向引物通常位于基因的下游区域，用于向 DNA 序列中引入终止子，以便在表达过程中产生合适的肽链。

Pet28a 通用引物的序列如下:
- T7 正向引物:5"-CTAAGTAACATAAGGAGAAGGAGAA-3"
- T7 反向引物:5"-CTAAGGAAAAAAGAAAAACTGA-3"
请注意，这些引物只能在特定的细菌中使用，并且应该在进行克隆之前进行优化。

PCR类型测序模板注意事项

PCR类型测序模板注意事项总反应体积建议为50uL或100uL，扩增结束后取3ul用1%左右的琼脂糖电泳检测，应为单一的条带。

3ul样品总量不低于50ng(非常小的PCR产物可以酌情减小)，PCR 产物产量过低说明PCR扩增结果不是很理想，应改进条件重新扩增。

对于有杂带和扩增弥散的PCR产物，需经琼脂糖电泳将目的片段切下来并回收，建议将PCR产物作克隆后进行测序。

有杂带的和扩增弥散的PCR产物即使通过琼脂糖电泳纯化，测序仍有可能出现双峰等异常结果。

经上述检测合格的PCR产物，需经过琼脂糖电泳纯化去除未反应的引物，dNTP，引物二聚体等影响测序反应的组分。

有多种纯化方法可供选择，Promega，Qiagen和生工等公司都有相应的产品可供选择。

纯化后的PCR产物经电泳检测估计总量应不低于200ng/Kb(非常小的PCR产物可以酌情减小)。

与质粒模板相比，PCR产物彼此间差异很大，因此，每个PCR模板应尽可能提供相应的PCR退火温度和PCR产物的长度，以供测序时参考。

PCR模板一般不应短于200bp，过短的PCR产物应经克隆后进行测序。

纯化好的PCR产物应溶于双蒸水中，TE缓冲液会严重影响测序反应。

若让公司对PCR产物进行纯化，PCR产物需满足∶总量不低于1ug/kb，片段长度不低于200bp各种PCR测序模板均应提供相应的测序引物，并尽可能提供引物的全序列，并将引物浓度准确稀释到5pmole/ul 。

引物浓度的换算关系∶总ng数 = pmole x 分子量/1000由于PCR产物测序相对较难，为使您能拿到一个好的结果，请尽量满足上述要求。

测序常见问题分析序列中出现N值的常见原因：通常有以下几种情况将造成测序结果中N值较多：∙PCR产物直接进行测序，在PCR产物长度以后将无反应信号，机器将产生许多N 值。

通常我们很容易辨别PCR产物结束的位点，PCR产物测序一般末端的一个碱基为A（绿色峰），这是由于Taq酶能够在PCR反应的末端非特异性地加上一个A碱基，我们用T载体克隆PCR产物就是根据该原理的。

蛋白透析时产生的絮状沉淀真的令很多人痛心不已,有时明

蛋白透析时产生的絮状沉淀真的令很多人痛心不已，有时明明看了又看，都没发觉哪里不对，那么，这其中可能是哪里显现问题，还有这些问题从哪些方面着手解决最适合呢?请看下文分析：蛋白透析产生沉淀可能有以下缘故：1.由高浓度的蛋白变性试剂(如8m尿素)，到低浓度，再到不含变性剂的buffer，若是条件转变猛烈，使得蛋白不正确折叠而沉淀，这种情形比较常见。

若是选择透析的方式，必然要多加几个中间浓度梯度，而且注意低温(4度)，这有利于蛋白正确折叠。

2.透析袋本身有必然的吸附，能够通过磁力搅拌来降低吸附。

3.透析液PH靠近等电点，像catzp说的，换buffer。

4.透析袋不干净?楼主可不能范这种错误吧。

或没认真处置，有杂质、金属离子建议：1 能够采纳梯度浓度透析，先采纳与你纯化后蛋白盐浓度相近的透析液透析，4-8小时后换更小浓度的盐溶液透析，最后采纳生理盐水或(pH 7.4)透析。

例如：用6M盐酸胍沉淀的目的蛋白，第一步透析可采纳4M盐酸胍透析，4-8小时后采纳2M 盐酸胍透析，再以后能够利用PBS或生理盐水。

2 透析液的pH值不要和目的蛋白的等电点接近，如此目的蛋白可能会更易沉淀。

3 维持蛋白浓度在mg/ml量级上面。

4 用20mM的醋酸透析也能降低沉淀5 加一些爱惜剂，如蔗糖，甘油，巯基乙醇等。

6 减少脱盐时刻。

可考虑用超滤或G系列的凝胶脱盐，如现在刻较快，减少蛋白质的变性。

7 增加蛋白质浓度也可在必然程度上减少透析进程中蛋白质的沉淀，只是成效不是专门好的。

8 最后，不排除是蛋白不稳固的可能性，可在提纯开始时加点甘油，浓度操纵在10-25%左右。

测序进程常见问题分析与解答一、什么缘故找不到PCR引物?答：以下几种情形，将无法找到做PCR时的引物序列(1)用PCR引物作为测序引物进行测序时，所测序列是从引物3’结尾后第一个碱基开始的，因此自然就找不到您的引物序列了。

有两种方式能够取得您的引物序列。

关于较短的PCR产物(<800bp)，能够用另一端的引物进行测序，从另一端测序能够一直测到序列的结尾，就能够够在序列的结尾取得您的引物的反向互补序列。