DNA提取方法和试剂作用
DNA提取过程中各种常用试剂的作用
DNA提取过程中各种常用试剂的作用
1.破碎细胞的试剂
细胞破碎是DNA提取中的第一步,它破坏细胞壁和细胞膜,释放出胞外DNA。
常见的细胞破碎试剂有:
-细胞裂解液:包含高浓度的盐离子,用于破坏细胞膜和胞外结构。
-磷酸盐缓冲液:调节溶液的pH值,维持酶的活性和反应性。
2.脱脂肪试剂
脂肪在DNA提取过程中会干扰其纯化和测量结果。
因此,需要使用脱脂肪试剂来去除脂肪。
常见的脱脂肪试剂有:
-酚/氯仿:用于分离DNA溶液中的有机相,其中含有脂肪和蛋白质。
-异丙醇/乙醇:能够沉淀DNA,可去除脂肪和蛋白质。
3.蛋白质降解试剂
蛋白质的存在会对DNA的纯化和测量产生干扰。
因此,在提取DNA之前,需要使用蛋白酶来降解蛋白质。
常见的蛋白质降解试剂有: -蛋白酶K:能够特异性地降解蛋白质,而不会对DNA产生破坏。
4.DNA沉淀和纯化试剂
在DNA提取的最后阶段,需要使用试剂使DNA沉淀并纯化。
这些试剂帮助去除杂质,如蛋白质、RNA和其他杂质。
常见的DNA沉淀和纯化试剂有:
-氯化钠:用于提高DNA的溶液的离子强度,促进DNA的沉淀。
-吐温-20:用作高盐缓冲液的成分,以帮助稳定沉淀的DNA。
-乙醇/异丙醇:用于沉淀DNA。
由于DNA具有亲和力,可以与乙醇或异丙醇结合形成可见的沉淀。
5.纯净水和缓冲液
纯净水是在整个实验过程中用来制备溶液和洗涤DNA的必要试剂。
此外,缓冲液用于维持溶液的pH值,以提供适宜的环境来发挥其他试剂的作用。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理修订稿
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理修订稿下面是DNA提取过程中各种试剂的作用及原理的详细解释:1. 胰蛋白酶(Proteinase K):在DNA提取过程中,胰蛋白酶主要用来消化蛋白质。
在胰蛋白酶作用下,会将蛋白质降解为小片段,从而释放出DNA。
胰蛋白酶对于许多细胞外蛋白质以及细胞核和线粒体内的蛋白质都有较高的活性,因此在DNA提取中常常使用胰蛋白酶来消化蛋白质。
2.细胞裂解缓冲液:细胞裂解缓冲液主要含有一些表面活性剂和盐,它的作用是破坏细胞膜和核膜,释放出细胞内的DNA。
其中的表面活性剂可以破坏细胞膜的脂质双层结构,使细胞裂解,而盐对于细胞内的离子平衡起到保护作用。
3.蛋白质沉淀剂(如盐和高浓度乙醇):DNA提取过程中,蛋白质沉淀剂的主要作用是沉淀DNA溶液中的蛋白质。
这些沉淀剂可改变DNA和蛋白质的溶液环境,使DNA与蛋白质相互作用并形成沉淀。
通过离心可以分离出DNA沉淀。
4.蛋白酶抑制剂(如蛋白酶抑制剂PMSF):蛋白酶抑制剂的作用是抑制在DNA提取过程中可能存在的DNA酶类,避免它们降解提取的DNA。
PMSF是一种有效的蛋白酶抑制剂,具有抗蛋白酶A、蛋白酶K和胰蛋白酶等多种蛋白酶的活性。
5.去蛋白化剂(如十二烷基硫酸钠,SDS):去蛋白化剂的作用是在细胞裂解后去除DNA溶液中的蛋白质。
SDS是一种表面活性剂,可以破坏蛋白质的结构,使其失去功能,并分散在DNA溶液中。
这样,可以将蛋白质与DNA分离。
6.胱硫酸:胱硫酸的作用是抑制DNA提取过程中可能存在的DNA酶类的活性。
DNA酶是一类能够降解DNA的酶,胱硫酸具有抑制DNA酶的活性。
通过加入胱硫酸可以保护提取的DNA不受DNA酶的降解。
7.离心管:离心管在DNA提取过程中主要用于离心,通过离心可以将DNA与其他物质分离。
离心过程中,DNA颗粒被推向离心管底部,其他物质则沉淀在上层。
离心过程中加入离心管中的试剂会与DNA颗粒一同移动,从而实现DNA的纯化。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理大家好,今天我们来聊聊DNA提取过程中的各种试剂,它们到底是怎么发挥作用的呢?别着急,我会用最简单易懂的语言,让大家轻松掌握这些知识。
我们要了解DNA是什么。
DNA,就是脱氧核糖核酸,是生物体内遗传信息的载体。
那么,DNA提取又是什么呢?简单来说,就是从生物体中提取出DNA分子的过程。
这个过程包括了很多步骤,而试剂则是其中的关键环节。
接下来,我们就来看看这些试剂都是怎么发挥作用的吧!1. 细胞破碎剂在DNA提取过程中,首先要将生物体破碎成碎片,这样才能方便后续的提取操作。
而细胞破碎剂就是用来实现这个目的的。
它们的作用就是破坏细胞膜和细胞壁,让细胞内的DNA分子释放出来。
常用的细胞破碎剂有胰蛋白酶、胶原蛋白酶等。
大家可能会问,这些酶是怎么把细胞破碎的呢?其实,这些酶能够识别并分解细胞内的特定蛋白质,从而达到破坏细胞的目的。
不同的酶对不同类型的细胞也有不同的作用效果,所以在实验中需要根据实际情况选择合适的酶种。
2. 洗涤剂在细胞破碎后,我们还需要将释放出来的DNA分子进行纯化。
这时候,洗涤剂就派上用场了。
洗涤剂的作用就是去除细胞碎片、蛋白质等杂质,使得DNA分子更加纯净。
常用的洗涤剂有TE缓冲液、PBS等。
这些洗涤剂都有一个共同的特点,那就是能够溶解很多物质,包括DNA分子在内。
因此,通过多次洗涤,我们就可以有效地去除杂质,提高DNA的纯度。
3. 聚乙二醇(PEG)在纯化DNA的过程中,还有一个关键的试剂就是聚乙二醇(PEG)。
PEG是一种非常特殊的溶剂,它可以与水形成氢键,使得DNA分子在水中保持悬浮状态。
这样一来,我们就可以通过离心等方法将不同纯度的DNA分离开来。
而且,PEG还可以调节DNA 的亲和力,使得某些特定的DNA结合得更加紧密。
这对于后续的PCR扩增等实验非常重要。
4. DNA连接酶在纯化出目标DNA后,我们还需要将其与其他DNA片段进行连接。
这时,DNA 连接酶就派上用场了。
DNA提取方法和试剂作用详解
DNA提取方法和试剂作用详解DNA提取方法是生物学研究的一项重要技术,它能够从生物样本中提取出纯净的DNA,为后续的分子生物学研究提供基础。
目前常用的DNA提取方法有酚-氯仿法、盐法、硅胶柱法和商业化试剂盒法等。
下面将对这些方法及其试剂的作用进行详细介绍。
1. 酚-氯仿法(Phenol-Chloroform Method)酚-氯仿法是最早被广泛采用的DNA提取方法之一、其基本过程包括细胞破碎、蛋白质沉淀和DNA沉淀。
酚-氯仿法的优点是能够提取较高质量的DNA,但操作过程较复杂且使用的试剂有毒。
2. 盐法(Salting-out Method)盐法是一种简单而高效的DNA提取方法,其基本原理是利用盐的溶液可使DNA凝聚并沉淀。
盐法操作简单,而且试剂价格低廉,适用于大规模DNA提取工作。
但其提取的DNA质量相对较低。
3. 硅胶柱法(Silica Column Method)硅胶柱法是一种基于DNA在硅胶膜表面吸附的原理进行的DNA提取方法。
硅胶柱能够高效地去除污染物,提取纯净的DNA。
硅胶柱法操作简单,适用于高质量DNA提取。
但硅胶柱试剂的价格较高,可能限制其在大规模DNA提取中的应用。
商业化试剂盒法是目前常用的DNA提取方法,其原理和操作流程已经被开发商精细化和商业化,使用方便,能够提取高质量的DNA。
商业化试剂盒法中的试剂通常包括细胞破碎缓冲液、蛋白酶、提取缓冲液、洗涤缓冲液和洗脱缓冲液等。
细胞破碎缓冲液用于破碎细胞膜,释放细胞内的DNA。
蛋白酶用于分解和去除蛋白质。
提取缓冲液中含有离子,可以使DNA溶解并与其他污染物分离。
洗涤缓冲液用于去除残留的污染物,洗脱缓冲液用于溶解并收集DNA。
商业化试剂盒法具有操作简单、提取效果稳定、重现性好等优点,逐渐取代了传统的DNA提取方法。
总结起来,DNA提取方法中常用的试剂包括酚、氯仿、盐、硅胶、蛋白酶等。
这些试剂分别用于破坏细胞膜、沉淀蛋白质、分离DNA并去除杂质,最终获得纯净的DNA样品。
DNA提取方法和试剂作用详解
DNA提取方法和试剂作用详解DNA提取是分子生物学和遗传学研究中非常重要的步骤。
其作用是从生物样本中提取出纯度高的DNA,以便进行进一步的实验和分析。
DNA提取的方法和试剂作用有很多种,下面详细介绍一种常用的DNA提取方法和相应试剂的作用。
常用的DNA提取方法有酚/氯仿法、盐酸法、离心法和柱式法等。
下面以酚/氯仿法为例进行介绍。
酚/氯仿法是一种传统的DNA提取方法。
它利用了DNA、RNA和蛋白质在不同溶剂中溶解性的差异来分离DNA。
主要步骤如下:1.细胞破碎:首先将待提取DNA的样本(如动物组织或细菌)进行细胞破碎,使细胞膜破裂释放出细胞质和细胞核。
2.蛋白质沉淀:加入酚/氯仿(以1:1:0.7的比例混合)使细胞膜溶解,并沉淀DNA上层浮游的蛋白质和脂类,然后离心分离。
3.DNA与RNA沉淀:将上层液体转移到新离心管中,加入等体积的异丙醇,使DNA和RNA沉淀,然后离心分离。
4.DNA纯化:将DNA沉淀物洗涤去除残留的溶液和盐类,然后再次离心分离,脱水干燥或用缓冲液溶解。
除了上述步骤外,还需要一系列的试剂来协助完成DNA提取过程。
1.细胞破碎液:用于破裂细胞膜,释放出细胞内的DNA。
破碎液通常是一种含有酶和盐的缓冲液,可以有效地破坏细胞膜结构。
2. 蛋白酶:用于降解细胞核和线粒体中的蛋白质,以达到去除蛋白质的目的。
常用的蛋白酶有蛋白酶K和蛋白酶ase K。
3.酚/氯仿:用于沉淀和去除蛋白质。
酚是一种有机溶剂,它与蛋白质和脂类发生相互作用,从而使它们沉淀到底部。
氯仿能与酚混溶,形成一个界面,便于底部上层液体的分离。
4.异丙醇:用于沉淀DNA和RNA。
异丙醇能够调节DNA和RNA的溶解度,使其在溶液中沉淀下来,从而方便提取。
5.盐溶液:用于洗涤去除DNA沉淀物中的盐类和杂质,以提高DNA的纯度。
常用的盐溶液有EDTA和盐酸。
通过酚/氯仿法,可以得到高质量、高纯度的DNA样品,适用于进一步的PCR、测序和片段长度分析等实验。
DNA提取中各种实验试剂作用原理
DNA提取中各种实验试剂作用原理1、STE 是Tris-Hcl 、EDTA、Nacl的混合液。
其总体作用是为DNA提供保护环境,在此环境下DNA可以呈稳定态,最少限度地受到破坏。
Tris.HCl提供缓冲体系,DNA在这一体系中呈稳定态。
EDTA:是DNA酶的抑制剂,可以防止细胞破碎后DNA酶降解DNA。
NaCl,有利于DNA的溶解。
2、SDS的作用:利用高浓度的阴离子去垢剂 SDS(十二烷基磺酸钠,Sodium dodecyl sulfate)使DNA 与蛋白质分离,在高温(55~65℃)条件下裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,释放出核酸,然后采用提高盐浓度及降低温度的方法使蛋白质及多糖杂质沉淀,离心后除去沉淀,3、苯酚的作用:使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase的活性。
Tris酚的颜色,一般为黄色。
如果变成粉红色,说明被氧化,不能再用。
4、氯仿的作用克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。
(酚易溶于氯仿中)5、异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
6、用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或 NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
7.为什么在保存或抽提DNA过程中,一般采用TE缓冲液?在基因操作实验中,选择缓冲液的主要原则是考虑DNA的稳定性及缓冲液成分不产生干扰作用。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理1. 细胞裂解缓冲液(Cell Lysis Buffer):作用:细胞裂解缓冲液用于破坏细胞膜和细胞核膜,并释放细胞内的DNA分子。
原理:细胞裂解缓冲液主要含有非离子性洗涤剂(如Triton X-100和Tween-20)和盐溶液(如NaCl)。
洗涤剂可以溶解和破坏细胞膜,并释放内部的细胞器和DNA。
高盐浓度可破坏细胞核膜,进一步释放核内的DNA分子。
2. RNase A缓冲液(RNase A Buffer):作用:RNase A缓冲液用于降解细胞内的RNA分子,以避免在DNA提取过程中的RNA污染。
原理:RNase A是一种内切核糖核酸酶,可以特异性地水解单链的RNA。
在DNA提取中,RNase A会降解细胞裂解液中的RNA分子,使其无法干扰后续DNA的纯化步骤。
3. 蛋白酶K缓冲液(Proteinase K Buffer):作用:蛋白酶K缓冲液用于分解和去除DNA周围的蛋白质。
原理:蛋白酶K是一种特异性的蛋白酶,可以水解蛋白质。
在DNA提取中,蛋白酶K会分解细胞裂解液中的蛋白质,包括DNA结合蛋白和酶,以便纯化DNA。
4. 盐溶液(Salt Solution):作用:盐溶液用于沉淀DNA分子,将其从细胞裂解液中分离出来。
原理:DNA可以在高盐浓度下形成沉淀,并从溶液中沉淀出来。
通过加入盐溶液,DNA分子会和盐结合形成可见的凝胶状物质(DNA凝胶)。
5. 酒精沉淀缓冲液(Ethanol Precipitation Buffer):作用:酒精沉淀缓冲液用于使DNA形成可见的物质,并沉淀下来。
原理:通过将酒精加入DNA溶液中,可以改变溶液的物理性质,使DNA凝析成不可溶的颗粒,从而方便后续的离心沉淀。
6. 纯化缓冲液(Purification Buffer):作用:纯化缓冲液用于洗涤和纯化沉淀下来的DNA样品。
原理:纯化缓冲液中含有适当的离子浓度和pH值,可以提供适当的条件,以去除影响DNA纯化的杂质。
DNA提取中各种实验试剂作用原理
DNA提取中各种实验试剂作用原理DNA提取是分子生物学和遗传学的基础实验之一。
DNA提取过程中需要使用一系列实验试剂,这些实验试剂的作用原理如下:1. 细胞破碎试剂细胞破碎试剂包括物理方法、化学方法和生物学方法等多种方法。
其中,化学方法使用最广泛的试剂是SDS(十二烷基硫酸钠),它可以破坏脂质双层,使细胞膜和细胞壁解离,从而释放含有DNA的核酸复合物。
同时还需要加入蛋白酶、RNase等试剂去除蛋白质和RNA 的干扰。
2. 蛋白质沉淀试剂DNAs在细胞破碎后不同于RNA、蛋白质和其他多余的杂质,需要将其分离出来。
蛋白沉淀试剂(如氯化钠)虽然不能直接分离DNA,但可以使蛋白质集聚,促进DNA 快速分离。
3. DNA的分离试剂DNA分离是DNA提取的关键步骤,以氯仿、异丙醇、丙酮等的有机试剂可以分离出水相的DNA,其中丙酮和异丙醇是传统方法中的常用分离试剂。
DNA分离后,样品中的DNA可以缓慢晶体化,在低盐浓度下将其沉淀,形成可检测的膜状物质。
在分离后将DNA进行沉淀集中到样品中央,为此DNA需要一个很小的盐浓度。
传统方法中,纯化引物和DNA缓冲剂使用NaCl来沉淀DNA;现在,同种DNA沉淀试剂、紫膜、异丙醇混合而成的试剂QIA quick也是一个选择。
DNA沉淀后,需要加入溶解试剂以使其溶解,以便后续的PCR、电泳等实验。
溶解试剂常用20~50mM的Tris-HCI缓冲盐溶液,使得DNA迅速和充分地溶解。
综上所述,DNA提取是一个多步骤的过程,其中需要使用多种试剂以分离、沉淀和溶解目标DNA,并且必须保证其稳定、纯度、特异性和良好的质量,具有重要的生物学意义和广泛的应用价值。
DNA提取 Protocol
DNA提取是将生物体中的DNA分子从细胞或组织中分离出来,并将其纯化成为一个可进行分析的过程。
下面是DNA提取的实验原理、所需试剂和耗材、实验仪器、准备工作、实验方法、注意事项、常见问题及解决方法。
一、实验原理DNA提取的实验原理是基于DNA分子的特性,它具有以下几个特点:1.DNA分子是细胞核中的主要遗传物质,它与蛋白质等其他物质结合成染色体。
2.DNA分子具有极性,即亲水基团和疏水基团。
在细胞中,DNA分子的疏水基团与蛋白质结合,亲水基团暴露于水中。
3.在一定浓度的氯化钠溶液中,DNA分子会从细胞中释放出来,并与蛋白质等其他物质分离。
4.通过加入一些化学试剂,如苯酚、氯仿等,可以将DNA分子进一步纯化,去除蛋白质等杂质。
二、所需试剂和耗材1.试剂:o氯化钠:用于溶解细胞中的DNA分子。
o苯酚:用于沉淀DNA分子。
o氯仿:用于去除蛋白质等杂质。
o乙醇:用于沉淀和洗涤DNA分子。
o氢氧化钠、盐酸:用于调整pH值。
2.耗材:o移液器及枪头:用于精确加样。
o离心管和盖子:用于混合和离心溶液。
o过滤器:用于过滤溶液中的杂质。
o无菌水:用于稀释和配制溶液。
o无菌塑料袋:用于保存样品。
三、实验仪器1.实验室搅拌器:用于混合溶液。
2.高速冷冻离心机:用于离心和分离DNA分子。
3.水浴锅:用于加热溶液。
4.无菌工作台或超净工作台:用于进行无菌操作。
5.分光光度计:用于测量DNA浓度和质量。
6.电泳仪和电泳槽:用于分析DNA样品。
7.显微镜:观察细胞生长状态和DNA提取过程。
四、准备工作1.仔细阅读实验步骤和注意事项,了解所需的试剂和耗材及其使用方法。
2.准备好所需的试剂和耗材,并确保它们处于保质期内。
3.检查实验室内是否具备上述实验仪器,并确保其正常运行。
4.用70%乙醇擦拭实验台面,以确保无菌环境。
5.用高压蒸汽灭菌法灭菌所有的实验器具,包括离心管、移液器等,需在适当的压力和温度下进行灭菌处理,以消除所有潜在的污染源。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA提取中实验试剂作用原理1.溶液I—溶菌液:溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌的作用。
当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA:(1)螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase 作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。
2.溶液II-NaOH-SDS液:NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。
但当pH>12或pH<3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。
在溶液II中的NaOH浓度为0.2mo1/L,加抽提液时,该系统的pH就高达12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA 的变性。
SDS:SDS是离子型表面活性剂。
它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。
(2)解聚细胞中的核蛋白。
(3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。
但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase 去除RNA时)受到干扰。
3. 溶液III--3mol/L NaAc(pH4.8)溶液:NaAc的水溶液呈碱性,为了调节pH至4.8,必须加入大量的冰醋酸。
所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。
用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6的抽提液,调回pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。
而高盐的3mol/L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。
前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS -蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。
DNA提取中各种实验试剂作用原理
DNA提取中各种实验试剂作用原理1.细胞破碎缓冲液:细胞破碎缓冲液主要由高渗溶液(如盐溶液)和蛋白酶等组成。
高渗溶液的作用是通过渗透压的变化使细胞膜破裂,从而释放细胞内的DNA。
蛋白酶则可以降解细胞膜和细胞核等蛋白质,以避免蛋白质的干扰。
2.蛋白酶:蛋白酶是一种水解蛋白质的酶,可以降解DNA提取过程中的蛋白质,如细胞膜和核蛋白等。
蛋白酶的作用是将蛋白质分解成小分子,使其能够被其他试剂更容易地去除或分离。
3.EDTA缓冲液:EDTA是一种螯合剂,可以与金属离子形成稳定的络合物。
在DNA提取中,EDTA能够与细胞质中的酶和其他金属离子结合,从而抑制DNA的降解和酶的活性。
此外,EDTA还具有稳定细胞膜结构的作用,有助于维持细胞的完整性。
4.蛋白酶K:蛋白酶K是一种特定的蛋白酶,能够降解细胞膜和细胞核中的蛋白质。
在DNA提取中,蛋白酶K的作用是去除细胞膜和细胞核中的蛋白质,使DNA从细胞内被释放出来。
5.胰蛋白酶:胰蛋白酶是一种常用的消化酶,能够特异性地水解蛋白质的胶原、凝血蛋白和纤维蛋白等。
在DNA提取中,胰蛋白酶的作用是降解细胞膜和细胞核中的蛋白质,从而使DNA充分暴露,并便于后续的提取步骤。
6.盐溶液(如NaCl溶液):在DNA提取中,盐溶液的作用是通过渗透压的变化使细胞膜破裂,从而释放细胞内的DNA。
盐溶液具有高渗透压,能够使细胞膜发生渗透压失衡,导致细胞膜破裂并释放细胞质,包括DNA分子。
7.酒精:酒精是DNA提取中用于沉淀DNA的试剂。
通过在DNA溶液中添加酒精,可以使DNA分子结合成不溶于水的颗粒。
酒精中的醇与DNA结合时会形成弱的静电吸引力,促使DNA分子聚集,形成可见的白色颗粒。
8.离心管:离心管在DNA提取过程中用于离心沉淀DNA。
通过离心作用,DNA分子被迅速沉淀到管底,而其他杂质则留在上层液体中。
离心能够有效分离DNA和其他组织细胞碎片等杂质,使得DNA可以更纯净地得到提取。
综上所述,DNA提取中各种试剂的作用原理不同,但它们的共同目标都是使DNA从细胞中得到分离和提取。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理1.溶液I—溶菌液:溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌的作用。
当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA:(1)螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase 作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。
2.溶液II-NaOH-SDS液:NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。
但当pH>12或pH<3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。
在溶液II中的NaOH浓度为0.2mo1/L,加抽提液时,该系统的pH就高达12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。
SDS:SDS是离子型表面活性剂。
它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。
(2)解聚细胞中的核蛋白。
(3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。
但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase去除RNA时)受到干扰。
3. 溶液III--3mol/L NaAc(pH4.8)溶液:NaAc的水溶液呈碱性,为了调节pH至4.8,必须加入大量的冰醋酸。
所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。
用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6的抽提液,调回pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。
而高盐的3mol/L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。
前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS-蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理1-溶液I—溶菌液:溶菌酶:它是糖昔水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的B-1,4糖昔键,因而真总溶菌的作用。
当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压'防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA:(1)螯合Mg2+. Ca2+等金属离子,拗制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作舷);(2) EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。
2.溶液 II-NaOH-SDS 液:NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。
但当pH>12或pH〈3时,就会引起双链之间氢鍵的郴而变性。
在溶液II中的NaOH浓度为0. 2mol /L,加抽提液时,该系统的pH就高达 12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。
SDS:SDS是离子型表面活性剂。
它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。
(2)解趣胞中的核蛋白。
(3)SDS能与蛋白质结合成为RP-S03-…R+-蛋白质的复合物,蟆蛋白质变性磁旋下来。
但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase去除RNA时)受到干扰。
3.溶液HI—3mol/L NaAc (pH4.8)溶液:NaAc的水溶液呈碱性,为了调节 pH至4.8,必须加入大量的冰醋酸。
所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。
用pH4. 8的NaAc溶液是为了把pH12. 6 的抽提液,调回pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。
而髙盐的3mol / L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。
前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS—蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。
DNA提取所用试剂作用
DNA提取所用试剂作用DNA提取是对细胞中的DNA分子进行纯化和分离的一种实验操作,以获得高质量的DNA样本,并用于后续的分析和研究。
DNA提取的目的是通过破坏细胞膜和蛋白质、溶解核酸蛋白复合物等步骤,将DNA从细胞中释放出来,并去除其他的细胞组分。
对于DNA提取,常用的试剂有细胞裂解液、蛋白酶、脂脢酶、EDTA、盐溶液、异丙醇、以及各种洗涤缓冲溶液等。
首先,细胞裂解液是DNA提取过程中最重要的试剂之一,它能够破坏细胞膜和核膜,以将DNA释放出来。
细胞裂解液通常是由含有各种离子和酶的缓冲溶液组成,它们可破坏细胞膜的完整性,并用于去除细胞蛋白等杂质。
常见的细胞裂解液有含有离子如Na+、K+、Mg2+、Ca2+的缓冲液,如PBS(磷酸盐缓冲盐溶液),TE(三甲基乙酸和EDTA)缓冲液。
这些离子对细胞膜有破坏作用,有助于释放DNA。
其次,蛋白酶是DNA提取中的另一个重要试剂。
蛋白酶可以降解蛋白质,去除细胞中的蛋白质杂质和核酸蛋白复合物。
常见的蛋白酶有蛋白酶K和蛋白酶酶解剂,它们能够迅速降解细胞中的核酸蛋白复合物,使DNA从中得以解脱。
脂脢酶是DNA提取中常用的试剂之一,它可以降解细胞膜上的脂肪酸酯,以防止DNA粘连在脂层上。
脂脢酶会切断细胞膜上的磷脂酰胆碱酯键或磷脂酰酸酯键,从而破坏脂质层结构,使DNA能够容易地释放出来。
EDTA(乙二胺四乙酸)是DNA提取中常用的螯合剂,它可以减少细胞裂解液中的金属离子对DNA酶的抑制作用。
EDTA可以与金属离子(如Mg2+和Ca2+)形成络合物,从而降低它们与DNA酶的结合,减少酶的抑制作用,有助于保护DNA不被降解。
盐溶液在DNA提取中也起到重要的作用。
盐溶液可以用于调节DNA溶液的离子强度,促使DNA分子在溶液中形成凝胶状,从而有利于DNA的分离和纯化。
常见的盐溶液有NaCl溶液和TE缓冲液。
异丙醇是一种有机溶剂,常用于DNA提取的沉淀步骤中。
在向DNA溶液中加入异丙醇时,DNA会从水相逐渐转移到有机相中,形成可见的DNA沉淀。
DNA提取中实验试剂作用原理
DNA提取中实验试剂作用原理实验中常用的DNA提取试剂包括裂解试剂、蛋白酶、盐酸试液、乙醇和双酚鳞溶液等。
这些试剂在DNA提取过程中各有作用,如下所述:1.裂解试剂:裂解试剂用于破坏细胞膜和核膜,使得DNA从细胞内释放出来。
裂解试剂通常包括CTAB(阳离子型表面活性剂)、SDS(阴离子型表面活性剂)等。
CTAB形成的复合物非常稳定,能够将DNA包裹在内,从而避免DNA的降解。
SDS则是通过与脂质结合,破坏细胞和核膜的结构。
2.蛋白酶:蛋白酶用于降解细胞内蛋白质和核酸酶,从而防止蛋白质和核酸酶对DNA的降解。
常用的蛋白酶有蛋白酶K和胰蛋白酶等,它们能够将核酸链断裂的酶活性降低至最小。
3.盐酸试液:盐酸试液用于将DNA溶解在水溶液中。
DNA分子含有大量的负电荷,通过加入盐酸试液可以中和DNA的负电荷,从而使得DNA变得溶解于水中。
4.乙醇:乙醇的作用是用来沉淀DNA。
加入乙醇后,DNA分子会聚集在一起,形成可见的白色沉淀。
乙醇使得DNA分子水化度降低,从而迫使DNA分子之间发生相互作用,进一步形成沉淀。
5.双酚鳞溶液:双酚鳞溶液能够与DNA结合形成复合物,在DNA提取的过程中起到分离DNA和其他细胞成分的作用。
双酚鳞可以与DNA的A-T碱基对之间发生氢键作用,从而形成稳定的DNA-双酚鳞复合物。
此后可以通过离心将复合物沉淀下来,从而实现DNA的纯化。
在DNA提取过程中,实验试剂的作用主要包括细胞破裂、DNA溶解、DNA纯化和去除杂质等。
上述试剂通过不同的作用机制协同起作用,最终使得DNA从细胞中提取出来并得到纯化。
这些试剂的选用和使用方法要根据具体的DNA提取方案进行调整,以保证提取到高质量和高纯度的DNA样品。
DNA提取试剂的作用
DNA提取试剂的作用DNA提取试剂是用于从细胞中提取DNA的化学试剂。
DNA提取是分子生物学和遗传学研究的基础步骤,可以用于各种应用,包括基因克隆、PCR扩增、测序等。
DNA提取试剂的作用主要包括细胞破碎、蛋白质除去、DNA稳定和纯化等方面。
首先,DNA提取试剂可以有效地破坏细胞膜和细胞壁,使细胞释放出来的DNA能够被提取出来。
对于真核细胞,细胞膜可以通过使用洗涤剂来破坏,例如Tween-20、SDS、 Triton X-100等。
对于细菌细胞,细胞壁是一个额外的障碍,需要使用酶来降解细菌细胞壁,例如利用裂解酶等。
其次,DNA提取试剂能够去除蛋白质等杂质,使提取的DNA更纯净。
蛋白质的存在会干扰下游实验的进行,例如PCR扩增和测序等,因此需要对DNA溶液进行蛋白质酶解,例如蛋白酶K、蛋白酶ase等。
此外,还有一些DNA提取试剂可以与蛋白质结合并沉淀,如酚-氯仿法,利用酚和氯仿来分离DNA和蛋白质。
DNA提取试剂还可以稳定DNA分子,在提取过程和储存过程中防止DNA的降解。
DNA分子容易被核酸酶降解,因此在提取过程中要采取一些措施来防止核酸酶的存在,例如在提取过程中使用酸性和碱性的缓冲液来抑制核酸酶。
此外,DNA提取试剂中还可以加入一些酶来修复DNA分子上的损伤,例如由于光照、热等导致的DNA切断。
最后,DNA提取试剂还可以纯化DNA,去除其他的核酸(如RNA)、杂质和化学物质,使得提取的DNA更加纯净。
DNA提取试剂可以利用DNA与其他核酸的物理和化学性质之间的差异来实现纯化,常见的有酚-氯仿法、离心柱纯化法和磁珠纯化法等。
此外,还可以使用一些离心步骤来去除细胞碎片、蛋白质等杂质。
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1试剂的作用氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。
(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
2 DNA提取分为三个基本步骤每个步骤的具体方法可根据样品种类、影响提取的物质以及后续步骤的不同而有区别。
.细胞的破碎细菌有坚硬的细胞壁,首先要破碎经胞。
方法有三种;①机械方法:超声波处理法、研磨法、匀浆法;②化学试剂法:用SDS处理细胞;③酶解法:加入溶菌酶或蜗牛酶,都可使细胞壁破碎。
利用研磨或者超声破碎细胞,并通过加入去污剂以除掉膜脂。
加入蛋白酶,醋酸盐沉淀,或者酚/氯仿抽提,以除掉细胞内的蛋白,如与DNA 结合的组蛋白。
将DNA在冷乙醇或异丙醇中沉淀,因为DNA在醇中不可溶而黏在一起,这一步也能除掉盐分。
另外,目前也有利用吸附过柱的方法提取DNA 的商业化试剂盒。
DNA提取的几种方法(1).浓盐法A. 利用RNA和DNA在电解溶液中溶解度不同,将二者分离,常用的方法是用1M 氯纳抽提,得到的DNA粘液与含有少量蛋白质氯仿一起摇荡,使乳化,再离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA位于上层水相中,用2倍体积95%乙醇可将DNA 钠盐沉淀出来.B. 也可用0.15 MNaCL液反复洗涤细胞破碎液除去RNA,再以1MNaCL提取脱氧核糖蛋白,再按氯仿---异醇法除去蛋白.两种方法比较,后种方法使核酸降解可能少一些.C.以稀盐酸溶液提取DNA 时,加入适量去污剂,如SDS可有助于蛋白质与DNA 的分离。
在提取过程中为抑制组织中的DNase对DNA 的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子的烙合剂.通常用.15MNaCL,0.015M柠檬钠,并称SSC 溶液,提取DNA. (2).阴离子去污剂法; 用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA .由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA(3).苯酚抽提法:苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
离心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含DNA 的水相,利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA 。
此时DNA是十分粘稠的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取出。
此法的特点是使提取的DNA保持天然状态(4).水抽提法:利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低盐溶液除去RNA,然后将沉淀溶于水中,使DNA充分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体氯化钠调节至2.6M.加入2倍体积95%乙醇,立即用搅拌法搅出.然后分别用66% ,80%和95%乙醇以及丙铜洗涤,最后在空气中干燥,既得DNA样品.此法提取的DNA中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法加以改良,在提取过程中加入SDS.1.动物来源的DNA的提取1. 1经典提取方法酚抽提法、异丙醇沉淀法以及甲酞胺裂解法是提取DNA最为经典的方法,目前很多方法的改进都是在这些方法的基础上进行的,这三种方法均利用蛋白酶K和十二烷基硫酸钠(SDS)消化破碎细胞。
在前两种方法中裂解液先用酚/氯仿去除蛋白质,再分别用乙醇或异丙醇沉淀DNA。
甲酞胺法是利用高浓度的甲酞胺解聚蛋白质与DNA的结合,然后利用透析来处理DNA样品。
这些经典方法获得的DNA纯度很高,能够满足各种试验的要求,但操作繁琐,用时长,且所用试剂具有一定的毒性。
1.2 玻璃棒缠绕法该法用盐酸肌裂解细胞,然后将细胞裂解物小心铺在离心管中的乙醇上,用一个带钩的或前端为U形的玻璃棒在这两层液体的交界面慢慢搅动,沉淀出的胶状DNA缠绕在玻璃棒上。
玻璃棒上的DNA经多次乙醇浸泡并于室温下蒸干乙醇,由胶状逐渐回缩,然后浸人TE 中过夜,使其重新吸水膨胀进而和玻璃棒分离。
这种方法对操作技术要求较高,但简单快速。
1.3 血细胞DNA的快速提取法采用非离子变性剂NP40(乙基苯基聚乙二醇)代替SDS裂解细胞,提取细胞核,然后用酚/氯仿抽提DNA。
这样从血液中分离获得的DNA纯度高,能够满足各种临床检验和实验的需要。
也可采用NP40和Tween -20同时作用破碎细胞膜,以避免SDS对以后步骤的负面作用。
Ba sun i等[‘〕采用了4种常用的从血液中提取DNA的方法:High Pure Viral Nucleic 试剂盒法、QlAamp试剂盒法、Tri- PureTM试剂分离提取法以及经典酚抽提法,对通常作抛弃处理的血凝块进行人DNA 及病毒DNA的抽提,发现前两种方法可以迅速高效获得目的DNA,从而建立了由血凝块中提取DNA的方法,扩大了临床检验样本的来源。
1. 4 玻璃颗粒吸附法在该法中首先利用含异硫氰酸肌的细胞裂解液裂解细胞,然后加人含有能够与DNA 结合的玻璃颗粒的缓冲液,经沉淀收集结合染色体DNA的玻璃颗粒,利用洗脱液进行洗脱获得DNA。
不仅玻璃颗粒可以与DNA 进行结合,一定大小的硅胶颗粒也可以与DNA进行结合,据此,不少实验工作者实践了很多利用颗粒结合DNA 的提取方法。
Pichler等[2〕在从抹香鲸(Physeter macrocephalus) 牙齿及骨骼中抽提DNA时采用了一种以二氧化硅为吸附介质的方法,从抹香鲸标本骨骼组织中钻取的少量粉末中获得了足够用于分析的DNA产物,此方法扩大了对稀有哺乳动物DNA研究的取材范围。
Caldarelli-stefano等[3〕在从福尔马林固定、石蜡包埋的人体组织标本中提取DNA时利用小磁珠作为结合核,也获得了理想的纯化DNA。
很多试剂公司也依此设计生产了许多颗粒提取试剂盒,Pint。
等[4]就探讨了采用Gibc。
公司的GlassMAX系统,对福尔马林固定的组织进行DNA提取的具体操作方法,目前这些试剂盒在临床上广为应用,省时省力。
1.5 三乙醇胺月桂基硫酸盐(TLS)法由于常规方法中使用的蛋白酶K的水解条件不好掌握,采用TLS来提取组织、细胞以及外周血DNA可以克服这一弊端。
TLS是一种较强的表面活性剂,将其直接作用于细胞或组织匀浆,可迅速溶解细胞膜、核膜,而且蛋白质与其结合后即失去对DNA 的结合,进一步的纯化可采用常规方法。
1. 6 临床病理标本的DNA提取方法由于PC R技术不仅可用于基因分离、核酸序列分析,还可用于突变体和重组体的构建、基因表达调控研究、基因病的诊断及肿瘤发生机理的探讨等。
近年来,PCR技术已广泛应用于病理学研究,尤其对福尔马林固定石蜡包埋病理标本进行相关的研究更成为关注的焦点。
对于从这些病理标本中提取DNA的方法研究也很多。
一般采用酚/氯仿抽提法,该法虽然效率较高,但费时费力,而且其操作中要求多次离心,增加了样品污染的可能性。
近年来很多高效灵敏的方法在实践中得以采用,这些方法通常采用加热或微波法〔s〕去除包埋的石蜡,使用Sephadex G- 5。
柱色谱或盐析法[s7等去除蛋白质。
高文涛[71等在研究福尔马林固定石蜡包埋组织DNA提取方法对PCR的影响时,发现在组织切片中加人鳌合树脂(Chelating Resin,亚氨基二乙酸)提取获得的DNA可取得较好的PCR扩增结果。
Coombs 等〔s〕则采用热循环方法,将标本上的蜡融人样品溶液,在酶的作用下进行裂解,然后用Chelex-100进行吸附,离心去蜡,这种方法安全、简便、有效、经济。
1.7 盐析法该法用饱和氯化钠代替有机溶剂去除蛋白质,所获得的DNA质量可以满足PCR模板的要求,但产率相对较低,纯度较差。
谭建明等[9]对上述盐析法进行了改进,即将处理过的样本加人SDS和蛋白酶K后,在56'C 消化1h,然后用饱和氯化钠沉淀蛋白质,并经离心除去,上清直接用乙醇沉淀DNA。
该法简化了DNA的抽提步骤,可用于人体各种样本DNA 的提取,所获DNA的纯度可以满足各种检测的需要。
2 植物来源的DNA提取利用基因工程手段对植物进行定向改造,已成为当今植物育种学发展的一个新领域,植物基因工程操作离不开植物基因组总DNA的制备,不同植物的核酸结合蛋白的情况各不相同,因而要采取不同的提取方法[10]。
由于植物中次生代谢产物—多酚类化合物可介导DNA 降解,而多糖的污染也是影响植物DNA纯度最常见的问题,这些多糖能抑制限制酶、连接酶及DNA聚合酶等酶类的生物活性。
因此要从富含多酚和多糖的植物组织中分离获得高质量的基因组DNA也并非易事[11l。
目前采用的方法有以下几种。
2.1 十六烷基三乙基澳化按(CTAB)法CTAB 是一种阳离子去污剂,它能与核酸形成复合物,这些复合物在低盐溶液中会因溶解度的降低而沉淀,而在高盐溶液中可解离,从而使DNA和多糖分开,再用乙醇沉淀DNA 而除去CTAB。
在该法中使用的聚维酮(PVP)与多酚结合形成复合物,从而可有效避免多酚类化合物介导的DNA降解[121。
王卓伟等[13〕在对桑叶DNA提取方法研究过程中发现PVI〕还能有效地去除多糖。
罗志勇等[14〕在研究中对这种方法进行了几点改进: ①提高CTAB的浓度;②对于含多酚类较多的植物,增加CTAB提取缓冲液中琉基乙醇的含量,同时加人PVP使其与多酚类物质结合形成复合物;③增加低盐沉淀缓冲液的量;④增加高盐溶液中盐的浓度。
用改进的方法从人参、西洋参、三七等药用植物中分离获得了高纯度的DNA,Porebski等[1s]在沉淀粗提DNA时,将提取缓冲液中氯化钠的浓度提高至2.5m o卜L-’以使DNA在高盐缓冲条件下优先沉淀,可更有效地除去多糖。
Stein等[16] 对传统的CTAB 法进行了优化,创建了一种从新鲜草本植物样本中提取DNA的方法。
首先在特制的有96个孔的托盘上种植植物样本,并依照不同样本在托盘中的位置进行编号,然后取适量植物叶子分装在充满提取液的塑料袋中,除去袋中的空气并封口,再用特制的手工匀化器将各袋中的样本混匀,56`C孵育1h后将袋中的液体取出进行离心以及DNA 的沉淀。
Xin等〔17〕则采用简易的96孔托盘作为提取时的容器,将多种植物样本经研磨处理后分别放在不同的孔中进行提取,在一天内由一人就可完成上千个样本的DNA提取,为高通量植物基因分析及筛选提供了极大的便利。