分子生物学第二章基因与基因组-新
分子生物学课件第二章DNA的结构
• 复性(Renaturation):热变性的DNA缓慢冷却, 单链恢复成双链。
• 减色效应:随着DNA的复性,260nm紫外线吸收 值降低的现象。 (一)复性的条件 1,消除磷酸基的静电斥力; 2,破坏链内氢键 (二)复性的机制 1.随机碰撞 取决于DNA浓度、溶液温度、离子强度等 2.成核作用(nucleation) 3.拉链作用(zippering)
8.5 Å 11.7 Å Major Groove
Minor
7.5 Å 5.7 Å
Groove
• 大沟和小沟,特别是大沟,对于在遗传上有重要 功能的蛋白质识别DNA双螺旋结构上的特定信息 是非常重要的,只有在沟内,蛋白质才能“感觉” 到不同碱基顺序,而在双螺旋结构的表面全是相 同的磷酸和脱氧核糖的骨架,没有什么信息可言。
• DNA的碱稳定性 DNA对碱相对稳定 RNA在碱性溶液中易降解为2’,3’环式单核苷酸中间
产物,然后很快转变为2’ 单核苷酸和3’单核苷酸。
• DNA结构的表示法
DNA一级结构的重要性
•携带遗传信息 •决定DNA的二级结构 •决定DNA的空间结构
第二节 DNA的双螺旋结构
绕DNA双螺旋表面上出现的螺旋槽(沟),宽的沟 称为大沟,窄沟称为小沟。大沟,小沟都是由于碱基 对堆积和糖-磷酸骨架扭转造成的。
酰胺等。 计算Tm值的经验公式: 在0.15mol/L NaCl+0.015mol/L柠檬酸钠溶液中,当
DNA长链G+C百分含量在30%~70%时 Tm = 69.3+0.41(G+C)% 当DNA链长度≦18nt时,可近似认为 Tm = 4(G+C)+2(A+T)
Effect of [Salt] on Tm
医学分子生物学-2.基因与基因组-coco
非编码序列 >95%
59
5. 功能相关基因构成各种基因家族
核苷酸序列或编码产物的结构上具有一定程
度同源性的一组基因。家族内成员由同一个祖先 基因进化而来。
人生长激素(hGH)与绒毛膜生长催乳素(hCS)序列
真核生物基因组的结构特点
• 每一种真核生物都有一定的染色体数目 • 基因组庞大,结构复杂,多个复制起点 • 转录产物为单顺反子 • 存在大量重复序列 • 非编码序列多于编码序列 • 功能相关基因构成各种基因家族
二、原核生物基因组
以大肠杆菌(Escherichia coli)为例
染色体DNA
质粒DNA
36
(一)原核生物基因组特点
1.由一条环状双链DNA分子组成,
2.通常只有一个DNA复制起点。
OriC
4.6×106 bp
TerC 大肠杆菌染色体DNA
37
3.结构基因大多组成操纵子
掌握概念
操纵子(operon):多个功能相关的结构基因成簇 串联排列,与上游共同的调控区和下游转录终止 信号组成的基因表达单位。
单链线性RNA
双链线性DNA
双链线性RNA 单链环状DNA
2.不同病毒基因组大小相差较大
例如:痘病毒:130-375kb;HBV:3.2kb
26
3. 除逆转录病毒外,通常为单倍体基因组。
二倍体基因组
逆转录病毒基因组的复制与基因表达
逆转录病毒的复制与表达
单链线性RNA,二倍体;
有三个基本的结构基因:gag、pol、env;
2. 顺式作用元件有哪些? 主要有启动子和上游启动子元件、增强子、 沉默子、反应元件、Poly(A)加尾信号。
第二节 基因组(genome)
现代分子生物学复习重点
现代分子生物学复习资料第一章绪论分子生物学:是研究核酸、蛋白质等所有生物大分子的形态、结构及其重要性、规律性和相互关系的科学分子生物学的主要研究内容1、DNA重组技术2、基因表达调控研究3、生物大分子的结构功能研究——结构分子生物学4、基因组、功能基因组与生物信息学研究5、DNA的复制转录和翻译第二章染色体与DNA半保留复制:DNA在复制过程中碱基间的氢键首先断裂,双螺旋解旋并被分开,每条链分别作为模板合成新链,产生互补的两条链。
这样新形成的两个DNA分子与原来DNA分子的碱基顺序完全一样,因此,每个子代分子的一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合成的,所以这种复制方式被称为DNA半保留复制DNA半不连续复制:DNA双螺旋的两条链反向平行,复制时,前导链DNA的合成以5′-3′方向,随着亲本双链体的解开而连续进行复制;后随链在合成过程中,一段亲本DNA单链首先暴露出来,然后以与复制叉移动相反的方向、按照5′-3′方向合成一系列的冈崎片段,然后再把它们连接成完整的后随链,这种前导链的连续复制和后随链的不连续复制称为DNA 的半不连续复制原核生物基因组结构特点:1、基因组很小,大多只有一条染色体2、结构简练3、存在转录单元,多顺反子4、有重叠基因真核生物基因组的结构特点:1、真核基因组庞大,一般都远大于原核生物的基因组2、真核基因组存在大量的重复序列3、真核基因组的大部分为非编码序列,占整个基因组序列的90%以上,该特点是真核生物与细菌和病毒之间最主要区别4、真核基因组的转录产物为单顺反子5、真核基因是断裂基因,有内含子结构6、真核基因组存在大量的顺式作用元件,包括启动子、增强子,沉默子等7、真核基因组中存在大量的DNA多态性8、真核基因组具有端粒结构DNA转座(移位)是由可移位因子介导的遗传物质重排现象DNA转座的遗传学效应:1、转座引入插入突变2、转座产生新的基因3、转座产生的染色体畸变4、转座引起生物进化转座子分为插入序列和复合型转座子两大类环状DNA复制方式:θ型、滚环型和D-环型第三章生物信息的传递(上)从DNA到RNA转录:指拷贝出一条与DNA链序列完全相同的RNA单链的过程启动子:是一段位于结构基因5′段上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地结合并具有转录起始的特异性原核生物启动子结构:存在位于-10bp处的TATA区和-35bp处的TTGACA区,其是RNA聚合酶与启动子的结合位点,能与σ因子相互识别而具有很高的亲和力终止子:是给予RNA聚合酶转录终止信号的DNA序列(促进转录终止的DNA序列)终止子的类型:不依赖于ρ因子和依赖于ρ因子增强子:能增强或促进转录起始的序列增强子的特点:1、远距离效应2、无方向性3、顺式调节4、无物种和基因的特异性5、具有组织特异性6、有相位性7、有的增强子可以对外部信号产生反应上升突变:增加Pribnow区共同序列的同一性,将Pribnow区从TATGTT变成TATATT的启动子突变,会提高启动子的效率,提高乳糖操纵子基因的转录水平下降突变:把Pribnow区从TATAAT变成AATAAT的启动子突变,会大大降低其结构基因的转录水平RNA编辑及其生物学意义:RNA的编辑是某些RNA,特别是mRNA前体的一种加工方式,如插入、删除或取代一些核苷酸残基,导致DNA所编码的遗传信息的改变生物学意义:1、校正作用2、调控翻译3、扩充遗传信息RNA的再编码:mRNA在某些情况下不是以固定的方式被翻译,而可以改变原来的编码信息,以不同的方式进行翻译,科学上把RNA编码和读码方式的改变称为RNA的再编码比较原核和真核基因转录起始位点上游区的结构:1、原核基因启动区范围较小,一般情况下,TATAAT的中心位于-10——-7,上游-70——-30区为正调控因子结合序列,-20——+1区为负调控因子结合序列;真核基因调控区较大,TATAA/TA区位于-30——-20,而-110——-40区为上游激活区-2、除Pribnow区之外,原核基因启动子上游只有TTGACA区作为RNA聚合酶的主要结合位点,参与转录调控;而真核基因除了含有可与之相对应的CAAT区之外,大多数基因还拥有GC区和增强子区第四章翻译:所谓翻译是指将mRNA链上的核苷酸从一个特定的起始位点开始,按每3个核苷酸代表一个核苷酸的原则,依次合成一条多肽链的过程。
《分子生物学》课程教学大纲
《分子生物学》课程教学大纲(理论学时:16学时)使用教材:医学分子生物学(供8年制及7年制临床医学等专业用)分子生物学是一门从分子水平研究生命现象、生命的本质、生命活动及其规律的科学。
医学分子生物学是分子生物学的一个重要分支,是从分子水平研究人体在正常及疾病状态下生命活动及其规律的一门科学。
它主要研究人体生物大分子和大分子体系的结构、功能、相互作用及其同疾病发生、发展的关系。
作为一门课程,医学分子生物学涵盖了医学各专业学生必须学习的分子生物学基础知识,以及分子生物学在医学领域中形成的专门研究领域及相关知识。
医学分子生物学既要较系统地了解分子生物学的基础理论知识和技术理论知识,同时也要了解分子生物学在医学领域的应用和相关研究进展。
本书共二十三章,包括5个方面内容。
第二章至第十章介绍分子生物学基本知识,主要介绍基因和基因组的基本概念和基本特点,基因组核酸复制与损伤修复、基因表达和功能蛋白形成与降解、基因表达调控、细胞间通讯与信号转导的基本概念和基本理论,细胞增殖与凋亡的相关分子生物学机制。
第十一章至第十三章介绍基因操作的基本知识,包括基因分析、基因功能研究和基因克隆与表达的相关基本知识和研究策略。
第十四章至第十八章介绍疾病分子生物学机制,介绍了基因和基因组、细胞间通讯和信号与人类健康和疾病之间关系。
第十九章至第二十一章介绍分子生物学理论与技术在医学中应用,包括基因诊断和基因治疗概念与相关研究。
最后两章介绍分子生物学新兴研究领域、生物信息学在基因和蛋白质研究中的应用。
本大纲正是从上述目的出发,在要求学生掌握分子生物学基本知识与基本技术,同时了解分子生物学在医学领域的应用与相关研究。
使学生们在分子水平上研究人体在正常及疾病状态下生命活动及其规律,为从事临床医学打下深厚的基础。
绪论一、目的要求了解分子生物学的定义、研究对象和研究内容;分子生物学发展简史;生物遗传物质的发现;现代分子生物学的建立和深入发展;分子生物学与相关学科的关系;分子生物学在医学和生物学中的应用。
分子生物学期末复习资料
、分子生物学期末复习资料检疫1111班)考试题型:1、单项选择(1分/题,共50题);2、多项选择(分/题,共10题);3、名词解释(2分/题,共5题);4、问答题(共15分,4题);5、论述题(共10分,1题)·第二章基因与基因组一、基因的概念(一)基因概念的发展1、孟德尔:一个因子决定一种性状。
2、摩尔根:性状单位,突变单位和交换单位。
3、顺反子:功能单位,决定一条多肽链的表达4、操纵子:基因表达调控单元(原核)•`•结构基因、调节基因(可表达)•控制基因(启动基因和操纵基因)(二)现代基因概念的发展1、重叠基因:一个基因包含或部分包含另一基因2、断裂基因:内部含间隔区,即由外显子和内含子互相间隔组成的嵌合体3、跳跃基因:转座元件,可移动遗传元件4、假基因:拟基因,没有功能,序列与功能基因相似。
(三)基因的分子生物学定义、是编码多肽链或RNA的DNA片段,包括编码序列:外显子(exon)、插入序列:内含子(intron)、侧翼序列:含有调控序列(四)基因组基因组:一个细胞或病毒的全部遗传信息二、病毒基因组1、病毒基因组核酸的类型(7种)双链DNA(dsDNA)病毒;单链DNA(ssDNA)病毒;双链RNA(dsRNA)病毒;单链正链RNA病毒;单链正链RNA病毒;逆转录RNA病毒;逆转录DNA病毒2、病毒基因组的特点•一种核酸,DNA/RNA ,线性或环形•…•大小相差很大;•一般为单拷贝;•一条或几条核酸链;•连续或间隔;•编码序列大于90%;•相关基因往往丛集形成一个功能单位或转录单元;•有重叠基因。
三、原核生物基因组,1、原核生物基因组特点(1)一般由一条环状双链DNA分子组成;(2)通常只有一个DNA复制起点;(3)结构基因大多组成操纵子;(4)编码序列不重叠(5)没有内含子(6)编码序列(结构基因)在基因组中所占比例较大,基因密度非常高(非编码—调控序列)(7)结构基因多为单拷贝,rRNA基因为多拷贝;[(8)有编码同工酶的同基因(isogene)(9)转座现象:插入序列和转座子等(10)具有多种功能识别区域(往往具有特殊的序列,并且含有反向重复序列。
分子生物学2第二章-DNA结构
第四节 DNA的物理、化学性质
DNA双股链的互补 是其结构和功能上的一个基本特征 也是DNA研究中一些实验技术的基础
一、DNA分子的变性
变性(denaturation 或融解 melting):DNA双螺旋区 的
氢键断裂,使双螺旋的两条链完全分开变成单链,这 一双链分离的过程叫做变性 1、条件:加热, 极端pH,有机溶剂( 尿素、 酰胺 ),低盐浓度等
PolyT/A TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA
TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA
b、 分子组成
☆ PY/PU + PU (偏碱性介质中稳定) G*G 、 A*A 、
G*A+
☆ PY/PU + PY (偏酸性介质中稳定) 常见类型
点的A260值绘制成DNA 1.185
的熔解曲线
1.0
℃
Tm = OD增加值的中点温度(一般为8595℃) 或DNA双螺旋结构失去一半时的温度
这也是一般PCR实验技术中把变性温度定为94 ℃的原因
1、 影响 Tm值的因素 (1) 在 A, T, C, G 随机分布的情况下 ,决定于GC含量 GC%愈高 → Tm值愈大 GC%愈低 → Tm 值愈小 (2)GC%含量相同的情况下 AT形成变性核心,变性加快,Tm 值小 碱基排列对Tm值具有明显影响
* 类病毒(viroid): 使高等植物产生疾病的传染性因子 分子结构:含246~375 个核苷酸的单链环状RNA 分 子,没有蛋白质外壳。专性活细胞内寄生。
三、 是否存在核酸以外的遗传物质 Prion (proteinaccous infections particle) 朊病毒---蛋白质样的感染因子
基因与基因组名词解释
基因与基因组名词解释
基因是生物体遗传信息的基本单位,它是DNA分子上的一段特
定序列,携带着编码特定蛋白质或RNA分子的遗传信息。
基因决定
了生物体的遗传特征和功能。
基因组是指一个生物体或一个物种所有基因的集合。
它包含了
该生物体或物种的全部遗传信息。
基因组可以分为核基因组和线粒
体基因组两个部分。
核基因组是指生物体细胞核内的DNA分子构成的基因组。
它包
含了大部分基因,编码了控制生物体发育、生长、代谢和功能的蛋
白质。
线粒体基因组是指线粒体内的DNA分子构成的基因组。
线粒体
是细胞内的一种细胞器,负责产生细胞所需的能量。
线粒体基因组
编码了一些与能量产生相关的蛋白质。
基因组的大小和组成可以因生物体的类型和复杂程度而异。
例如,人类基因组大约由30亿个碱基对组成,包含了大约2万个基因。
不同生物体的基因组大小和基因数量也有很大差异。
基因组研究对于了解生物体的遗传特征、进化过程以及与疾病
的关联具有重要意义。
通过对基因组的分析,科学家可以揭示基因
之间的相互作用关系,进而深入理解生物体的生物学功能和复杂性。
基因组学的发展也为基因治疗、基因编辑等领域的研究提供了基础。
(整理)分子生物学 (2)
名词解释基因:产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。
基因组:生物有机体的单倍体细胞中的所有DNA,包括核中的染色体DNA和线粒体、叶绿体等亚细胞器的DNA。
基因组大小:是指一个基因组中所拥有的DNA含量,一般以重量计算,单位通常是皮克(10-12克),写成pg;有时也用道耳顿;或是以核苷酸碱基对的数量表示,单位为百万计,写成Mb或Mbp。
1pg等于978Mb。
C值矛盾:也称C值反常现象,C值谬误。
C值,通常是指一种生物单倍体基因组DNA的总量,以每细胞内的皮克(pg)数表示。
而C值矛盾则是C值往往与种系的进化复杂性不一致的现象,即基因组大小与遗传复杂性之间没有必然的联系,某些低等的生物C值却很大,如一些两栖动物的C值甚至比哺乳动物还大。
核型:是指染色体组在有丝分裂中期的表型, 是染色体数目、大小、形态特征的总和。
在对染色体进行测量计算的基础上, 进行分组、排队、配对, 并进行形态分析的过程叫核型分析。
CpG岛:C pG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,CpG保持或高于正常概率,GC含量大于50%,长度超过200bp。
卫星DNA:又称随机DNA。
因为真核细胞DNA的一部分是不被转录的异染色质成分,其碱基组成与主体DNA不同,因而可用密度梯度沉降技术如氯化铯梯度离心将它与主体DNA分离。
卫星DNA通常是高度串联重复的DNA。
基因簇:指基因家族中的各成员紧密成簇排列成大串的重复单位,定于染色体的的特殊区域。
基因簇少则可以是由重复产生的两个相邻相关基因所组成,多则可以是几百个相同基因串联排列而成。
他们属于同一个祖先的基因扩增产物。
也有一些基因家族的成员在染色体上排列并不紧密,中间还含有一些无关序列。
但总体是分布在染色体上相对集中的区域。
基因家族:在基因组进化中,一个基因通过基因重复产生了两个或更多的拷贝,这些基因即构成一个基因家族,是具有显著相似性的一组基因,编码相似的蛋白质产物。
中南大学医学分子生物学试题库答案
中南大学医学分子生物学试题库答案医学分子生物学习题集(参考答案)第二章基因与基因组一、名词解释1.基因 (gene):是核酸中储存有功能的蛋白质多肽链或RNA序列信息及表达这些信息所必需的全部核苷酸序列。
2.断裂基因(split gene):真核生物基因在编码区内含有非编码的插入序列,结构基因不连续,称为断裂基因。
3.结构基因 (structural gene):基因中用于编码RNA或蛋白质的DNA序列为结构基因。
4.非结构基因(non-structural gene):结构基因两侧一段不编码的DNA片段,含有基因调控序列。
5.内含子 (intron):真核生物结构基因内非编码的插入序列。
6.外显子 (exon):真核生物基因内的编码序列。
7.基因间DNA (intergenic DNA):基因之间不具有编码功能及调控作用的序列。
8.GT-AG 法则 (GT-AG law):真核生物基因的内含子5′端大多数是以GT开始,3′端大多数是以AG结束,构成RNA剪接的识别信号。
9.启动子(promoter):RNA聚合酶特异识别结合和启动转录的DNA序列。
10.上游启动子元件(upstream promoter element ):TATA合上游的一些特定的DNA序列,反式作用因子,可与这些元件结合,调控基因转录的效率。
11.反应元件 (response element):与被激活的信息分子受体结合,并能调控基因表达的特异DNA序列。
12.poly(A)加尾信号(poly(A) signal) :结构基因末端保守的AATAAA顺序及下游GT或T富含区,被多聚腺苷酸化特异因子识别,在mRNA 3′端加约200个A。
13.基因组(genome):细胞或生物体一套完整单倍体的遗传物质的总称。
14.操纵子(operon):多个功能相关的结构基因成簇串联排列,与上游共同的调控区和下游转录终止信号组成的基因表达单位。
基因与分子生物学第二章复习题
基因与分子生物学第二章复习题一、名词解释1.核小体:指由DNA链缠绕一个组蛋白核构成的念珠状结构,是用于包装染色体的结构单位。
2.DNA的高级机构:DNA双螺旋结构进一步扭曲盘绕形成的超螺旋结构。
3.DNA拓扑异构酶:通过改变DNA互绕值引起拓扑异构反应的酶。
4.启动子:能被RNA聚合酶识别,结合并启动基因转录的一段DNA序列。
5.复制叉:双链DNA在复制起点解开成两股链,分别进行复制。
这时在复制起点呈现叉子的形式,被称为复制叉。
6.半不连续复制:前导链的连续复制和后随链不连续复制的DNA复制现象。
7.C值:一种生物单倍体基因组DNA的总量值称为C值。
8.冈崎片段:DNA合成过程中,后随链的合成是不连续进行的,先合成许多片段,最后各段再连接成为一条长链。
这些小的片段叫做冈崎片段。
9.DNA二级结构:两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。
10.半保留复制:由亲代DNA生成子代DNA时,每个新形成的子代DNA中,一条链来自亲代DNA,而另一条链则是新合成的,这种复制方式称半保留复制。
11C值矛盾:C值指一种生物单倍体基因组DNA的总量。
一种生物单倍体的基因组DNA的总量与其种族进化的复杂程度不一致的现象称为C值矛盾。
12复制子:DNA复制从起点开始双向进行直到终点为止,每一个这样的DNA单位称为复制子或复制单元。
13重叠基因:指两个或两个以上的基因共有一段DNA序列,或是指一段DNA序列为两个或两个以上基因的组成部分。
14.染色体:由核蛋白组成、能用碱性染料染色、有结构的线状体,是DNA的主要载体15.DNA的修复:是细胞对DNA受损伤后的一种反应,这种反应可能使DNA结构恢复原样,重新能执行它原来的功能\或\使细胞能够耐受DNA的损伤而能继续生存16.DNA的一级结构:就是指4种核苷酸的连接及排列顺序,表示了该DNA分子的化学结构。
17.基因:一段有功能的DNA序列。
18.基因组:特定生物体的整套(单倍体)遗传物质的总和19.组蛋白:是指所有真核生物的核中,与DNA结合存在的碱性蛋白质的总称。
分子生物学第二章基因的概念21
in euchromatin) 常染色质
W
Ww whБайду номын сангаасte eye
(W gene be silenced
w
in heterochromatin)
异染色质
剂量效应(dosage effect)
如在细胞或个体中既有重复又有缺失,总的基 因组平衡的话,除染色体重排引起的效应外,个体 表型是正常的。但若总量因重复而增加,那么某些 基因及其产物的剂量也随之增加,如这些基因或产 物十分重要的话必然会引起表型异常。
1.1 融合遗传理论 (Blending inheritance)
公元前5世纪 Hippocrates
+ 母本体液
父本体液
子代具有父、母双亲的性状
直到19世纪以前人们对子代与亲代之间相似现象的原因还存在着许多错误的认识。 如:古希腊的希波克拉底认为亲代双方通过血液贡献出他们的胚芽,然后通过有性 繁殖传给后代。亚里士多德则认为,雄性为胚胎提供了“蓝图”,母体为胚胎提供 了物质。柏拉图认为,有关孩子生下来更像父亲还是更像母亲,取决于受孕时父亲 的感情更浓烈些,还是母亲的感情更浓烈些。
X-chromosome
16A
Wild type
779个
Duplication 复制
现代分子生物学第3版【第二章】课后习题答案
现代分子生物学第3版【第二章】课后习题答案第二章染色体与DNA一、染色体具备哪些作为遗传物质的特征?1、分子结构相对稳定;2、能够自我复制,使亲子代之间保持连续性;3、能够指导蛋白质的合成,从而控制整个生命过程;4、能够产生可遗传的变异。
二、什么是核小体?简述其形成过程。
核小体是染色质(体)的基本结构单位,由DNA和组蛋白组成。
形成过程:四种组蛋白H2A、H2B、H3、H4各两个分子生成八聚体,约200bp的DNA 盘绕在八聚体外面,形成一个核小体,而H1则在核小体的外面,每个核小体只有一个H1,该过程使分子收缩之原尺寸的1/7。
三、简述真核生物染色体的组成及组装过程。
组成:蛋白质+DNA组装过程:①核小体形成:DNA盘绕组蛋白形成的八聚体外,该阶段分子尺寸压缩7倍。
②染色质细丝及螺线管:前者由核小体串联形成,后者为细丝盘绕而成,该阶段分子尺寸压缩6倍。
③螺线管压缩为超螺旋:该阶段分子尺寸压缩40倍。
④超螺旋形成染色单体:该阶段分子尺寸压缩5倍。
四、简述DNA的一、二、三级结构特征。
1、一级结构:脱氧核苷酸排列顺序,相邻核苷酸通过磷酸二酯键相连。
2、二级结构:双螺旋结构。
a)两条平行的脱氧核苷酸链螺旋盘绕而成。
b)外侧骨架为脱氧核苷和磷酸,内侧为碱基序列。
c)两条链通过碱基之间形成氢键而结合,碱基结合遵循互补配对原则,A-T,G-C。
3、三级结构:空间结构,即超螺旋,包括正超螺旋和负超螺旋,二者可以在拓扑异构酶的作用下相互转变。
四、原核生物DNA具有哪些不同于真核生物DNA的特征?整体特点概括为以下三点:1、一般只有一条染色体,且大多为单拷贝基因。
2、整个染色体DNA几乎全部由功能基因加调控序列所组成。
3、几乎每个基因序列都与编码的蛋白质序列呈线性对应关系。
从基因组的组织结构来看,原核细胞DNA有如下特点:1、结构简练:绝大部分都用来编码蛋白质,与真核DNA的冗余现象不同。
2、存在转录单元:功能相关的RNA和蛋白质基因往往丛集在基因组的特定部位,形成功能单位或转录单元,可以被一起转录为含多个mRNA的分子,称为多顺反子mRNA。
医学分子生物学复习重点
第二章基因【目的要求】掌握:基因的概念及结构特点;结构基因;基因转录调控相关序列;顺式作用元件;多顺反子,单顺反子。
一、基因:是负责编码RNA或一条多肽链的DNA片段,包括编码序列、编码序列外的侧翼序列及插入序列。
二、结构基因:基因中编码RNA或蛋白质的DNA序列成为结构基因。
三、基因转录调控相关序列:1原核生物基因的调控序列中最基本的是启动子和终止子,有些基因中还有不同的调节蛋白结合位点或操纵元件。
操纵元件:是一段能够被不同基因表达调控蛋白识别和结合的DNA序列,是决定基因表达效率的关键元件。
2真核生物基因中的调控序列一般被称为顺式作用原件,包括启动子和上游启动子元件、增强子、反应元件和poly(A)加尾信号。
启动子和上游启动元件:TATA盒-TFIID-RNA聚合酶复合物(启动转录);CAA盒-CTF(决定转录的效率);GC盒-Sp1(促进转录)。
增强子:可特异性的与转录因子结合,增强转录因子的活性。
四、顺式作用元件:真核生物基因中的调控序列一般被称为顺式作用原件。
包括启动子和上游启动子元件、增强子、反应元件和poly(A)加尾信号。
五、多顺反子:原核生物的结构基因多转录为多顺反子mRNA,即每一个mRNA分子带有几种蛋白质的遗传信息(来自几个结构基因),利用共同的启动子及终止信号,组成“操纵子”的基因表达调控单元。
转录出来的mRNA分子可以编码几种不同的、但是多为功能相关蛋白质。
六、单顺反子:真核生物结构基因转录为单顺反子mRNA,即一个编码基因转录生成一个mRNA分子、经翻译生成一条多肽链,基本上没有操纵子的结构。
转录生成的mRNA前体中既有编码序列(外显子),又有间隔序列(内含子),需要进行转录后的剪切加工以及各种修饰,形成成熟的mRNA。
1熟悉:基因型;表现型;基因突变;;外显子;内含子;选择性剪接。
一、基因型:指逐代传递下去的成对因子的集合,因子中一个来源于父本,另一个来源于母本。
分子生物学--基因与基因组课件
2、物理图ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ:
以特异DNA序列为界标所展示的染色体图,它能反映生物 基因组中基因或标记间的实际距离,图上界标之间的距离是以 物理长度即核苷酸对数如bp、kb、Mb等来表示的。这些特 定的DNA序列可以是多态的,如RFLPs,但主要是非多态的如 STS、STR、EST和特定的基因序列等。
作图的基本方法:
1、家系分析定位
通过分析、统计家系中有关性状的连锁 情况和重组率而进行基因定位的方法。
有用的遗传标记: 取材方便 按孟德尔方式遗传 多态性标记位点
多态性:在一个群体中,某遗传特性存在若干种类型。
家
系性
分连
析
锁 分
定析
位
外祖父法
深绿代表红绿色盲患者,浅绿代表红 绿色盲基因携带者,黄色代表正常
家常
细胞融合技术
体
鼠细胞
人细胞
细
胞
杂
交
定
位
含全套鼠染色体 , 人 1号染色体,肽酶C
3、核酸分子杂交定位
• 应用已知的核酸探针与待定位的DNA序列进行杂交 对基因进行定位的方法 •具有互补序列两条单链核酸分子在一定条件下 按碱基互补配对原则退火形成双链的过程。 • 杂交的双方是待定位的核酸和已知核酸序列,已知 核酸序列称探针。
5’、、、AGCCGACTATGTCGAAGCTT、、、、、、 GCTTGACTATAAGACA、、、3’
3‘、、、TCGGCTGATACAGCTTCTAA、、、、、、 CGAACTGATATTCTGT、、、5‘
转录调控区
贮存RNA或蛋白质结构信息区 转录终止区
原核基因的结构特点
真核基因的结构特点
(二)基因作图的方法:
1、遗传图谱:
Ch2基因与基因组201909
一、人类基因组计划
概念
人类基因组计划(human genome project)是 测定人类基因组DNA约 30亿个碱基对的排列顺 序,在此基础上发现所有人类基因并确定它们 在染色体上的位置,从而破译人类全部遗传信 息的生命科学研究计划。
研究内容
对基因组作遗传图(genetic map)、物理图 (physical map)、转录图(transcription map) 和 序列 图(sequence map)等四张图。
SINE
LINE
DNA 转座子
二、真核生物基因组DNA序列的分类
(一)高度重复序列 (二)中度重复序列 (三) 低度重复序列(单拷贝序列)
(一)高度重复序列
高度重复序列是拷贝数在基因组中 达数百万(106)以上的DNA序列,因此 具有很快的复性速度。在基因组中约占 10-60%。典型的高度重复序列有卫星 DNA 和反向重复序列两类。
一、基因概念的发展
(四)操纵子及其基因 操纵子(operon)是原核生物基因表达调
控单元。 操纵子基因根据功能可分为结构基因
(structure gene)、调节基因 (regulatory gene)和控制基因(包括启动 基因和操纵基因)三类。结构基因和调节基因 是可表达的基因,控制基因是不可表达的基因。
操纵子
一、基因概念的发展
(五)现代基因概念的扩展
重叠基因(overlapping genes) 断裂基因(split gene) 跳跃基因(jumping gene) 假基因(pseudogene)
断裂基因(split gene)
二、基因的分子生物学定义
一个基因不仅是编码有功能的蛋白质 多肽链或RNA所必需的核酸序列(通常指 DNA序列),而且还包括为保证转录所必 须的调控序列、5'端非翻译序列、内含子 以及 3'非翻译序列等核酸序列。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
20世纪40年代末至50年代初,基因 是通知控制特定蛋白质合成来控制代谢 ,进而决定生物性状的原理变得清晰起 来。
•
(三) 顺反子 1957年,法国遗传学家本兹尔的噬菌体重 组试验结果表明:
基因可被分为更小的单位;
一个顺反子就相当于一个基因,它是一个 功能单位,决定一个酶或一条多肽链的表达。
•
•
• 指表达一种或多种蛋白质或功能RNA的遗传物 质的基本单位。
• 一段制造功能产物的完整的染色体片段(a complete chromosomal segment responsible for making a functional product.*)。包含基因的产物、基因的功能 性及完整性(包括一个蛋白质或RNA的全部编码序列 和编码区之外对编码区转录功能所必要的非编码的调 控区。)
•
基因的分子生物学定义
一个基因不仅是编码有功能的蛋白 质多肽链或RNA所必需的核酸序列(通 常指DNA序列),而且还包括为保证转 录所必需的调控序列、5’端非翻译序列 、内含子以及3’非翻译序列等核酸序列 。
•
根据基因是否具有表达功能可以将其分为三类
第一类是编码蛋白质的基因,它具 有转录和翻译功能,包括编码酶、其他 功能蛋白和结构蛋白的结构基因以及编 码阻遏蛋白的调节基团。
杂交试验》的论文中提出生物体的各种 特定性状受遗传因子所控制,一个因子 决定一种性状。
作为基因雏形名词的遗传因子,只 是一种逻辑推理概念,没有任何物质内 容。
•
(二)摩尔根的基因概念 染色体遗传学之父摩尔根和他的学
生们通过果蝇研究把基因定位在染色体 上,首先使基因物质化了。
1953年沃森-克里克DNA双螺旋结构 模型的提出,这个模型表明基因实际上 就是DNA分子的一段核苷酸序列。
蛋白质:LacZ,LacY,LacA。
•
另外还采用特殊惯例命名B.subilis 的孢子发生基因。
这些基因以spo后加上表示孢子发生
的形态阶段的罗马数字表示,再用大写 字母表示表示操纵子,而后为基因座,
例如,spoⅡGA就表示在第二阶段表
达的操纵子G的第一个基因座。
•
酵母
•
三个字母表明基因功能,而后的数
•
4. 假基因 假基因也称“拟基因”,是一类没有功 能的特殊基团。 假基因的核苷酸序列与其相应的有 功能基因基本相同,原来也可能是有功 能的基因,由于缺失或点突变等原因失 去活性,成为无功能基因。
•
二 . 基因的概念 (一) 基因的概念
基因(gene)是生物体传递和表达遗 传信息的基本单位。
从化学角度观察,基因则是一段具有 特定功能和结构的连续的脱氧核糖核酸 序列,是构成巨大遗传单位染色体的重 要组成部分。
•
第二类是只有转录功能而没有翻译 功能的基团,包括tRNA基因和rRNA基 因。
第三类是不转录的基因,它对基因 表达起调节控制作用,包括启动基因和 操纵基因,这类基因也称控制基因。
•
(二) 基因的命名法
目前对基因的命名一般根据种属习 惯,方法并未统一。
基因的命名一般用斜体字,按种属 字母和数学符号来表示。
•
果蝇 • 来自突变表型的描述可以用1-4个字
母表示。
• 例如,基因white(w), tailless(tll),hedgehog(hh);而蛋白
为White,Tailless,Hedgehog。
•
植物 虽然没有适用于所有植物的惯用法
,但大多数用1-3个小写字母表示。
Arabidopsis基因用果蝇的方法命名 ,但使用大写字母,例如,基因 AGAMOUS(AG),蛋白AGAMOUS。
(四)操纵子及其基因 1961年,法国分子生物学家雅各布 和莫诺基于细菌酶诱导的研究,提出了 关于原核生物基因表达调控的“乳糖操纵 子模型”。
作为原核生物基因表达调控单元的 操纵子,其基因根据功能可分为结构基 团、调节基团(?)和控制基团(包括启 动基因和操纵基团)三类。
•
(五) 现代基因概念的扩展
•
这种基因内部的间隔区DNA序列称 为内含子,
出现在成熟RNA中的各个DNA区段 称为外显子。
由若干个外显子和内含子互相间隔 而组成的嵌和体称为断裂基团。
•
3. 跳跃基因 跳跃基团又称为转座元件,它是指 那些可从染色体的一个位置跳到另一个 位置,或从一条染色体跳到另外一条染 色体上的可移动遗传元件。
分子生物学第二章基因 与基因组-新
2020年6月2日星期二
第一节 基因与基因组的概念
一. 基因概念的发展 从遗传学史的角度看,基因概念
的发展大致分以下几个阶段:孟德尔 的遗传因子阶段,摩尔根的基因阶段 ,顺反子阶段,操纵子阶段和现代基 因阶段。
•
(一)孟德尔的遗传因子 1865年,奥地利的孟德尔在《植物
字表示不同的基因座。
• 啤酒酵母基因GAL4,CDC28;
•
蛋白质:GAL4,CDC28。
• 非洲蜀酒酵母基因gal4,cdc2;
•ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
蛋白质:Gal4,Cdc2。
•
线虫 • 用三个小写字母表示突变表型,如
存在不只一个基因座,用连字符号接数 字表示, • 例如,基因unc-86,ced-9;蛋白 UNC-86;CED-9。
1. 重叠基因 重叠基因即一个基因包含或部分 包含另一基因。 重叠基因的发现揭示了遗传物质 的一种经济而巧妙的编排——密码子 共用核苷酸序列,通过不同的三联体 密码子读框编码不同的多肽链。
•
2. 断裂基因 出现在成熟的mRNA上的DNA序列
是不连续的,它们被一些间隔区DNA序 列所分隔。
这些间隔区序列在RNA的转录后的 加工成熟过程中被切除。
•
脊椎动物 一般以描述基因功能的1-4个小写字
母和数字表示其基因功能。 例如,基因sey,myc,蛋白Sey,Myc
。
人类 方法如脊椎动物但需大写。 例如基因MYC、ENO1。
•
二. 基因组的概念
基因组(genome)是细胞或生物体的全套遗传物 质。
如果表示蛋白产物和表型,就用大 写字母。
•
如果表示隐性突变,用小写字母。表 示显性突变,第一个字母要大写。
在其它一些种属包括人的基因命名 中,基因全由大写字母表示。
•
大肠杆菌和其他细菌 三个小写字母表示一个操纵子,接
着的大写字母表示不同基因座。
例如:lac操纵子;基因座:lacZ, lacY,lacA。