第三章 核酸化学
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《动物生物化学》授课内容
内容
第三章核酸化学与结构
核酸(nucleic xcids)属生物大分子,是一切生物必不可少的组成物质。
DNA 脱氧核糖核酸(dexyribonucleic acid)
RNA 核糖核酸(ribonucleic acid)
种类分布功能
DNA 原核生物:核质区
真核生物:95%在细胞核、
5%在线粒体和叶绿体遗传信息的载体
RNA tRNA 原核生物:细胞质携带、转移aa mRNA 真核生物:75%在细胞质肽链合成的模板
15%在线粒体和叶绿体
10%在细胞核
rRNA 核糖体主要成分
DNA主要分布细胞核,少量在线粒体、叶绿体;
RNA主要分布细胞质,少量在线粒体和叶绿体;
所有细胞(真核、原核)都含有DNA 和RNA。
病毒只含一种核物质;有DNA病毒和RNA 病毒之分。
一般情况下,真核细胞的核酸与某种特殊蛋白质组合在一起,形成复合物。
DNA:贮存全部生物信息的载体(以核苷酸排列方式,对信息进行多层次、结构复杂的组合贮存)。
通过DNA自我复制进行完整的结构与信息遗传;
通过转录,把DNA信息转抄在指导合成的RNA上;
通过翻译,将RNA信息转抄在指导合成的蛋白质上;
以蛋白质结构与功能形式,表达出DNA生物信息的物质形态、结构特征与生物功能等。转录翻译
DNA RNA 蛋白质合成其他物质
mRNA 或行使功能复制tRNA
rRNA
生物遗传的中心法则(1958年提出)
1、DNA是生物遗传信息的载体。
2、信息从DNA →RNA(主要指mRNA )→蛋白质的单向传
递过程;
3、信息从DNA →DNA的单向传递(复制)过程;
*4、信息从模板RNA →DNA的单向传递(逆转录)后,再沿联
DNA →RNA(mRNA )→蛋白质进行单向传递。注:* 70年代克瑞克进行了修正。
1、RNA病毒以模板RNA为信息载体,这种RNA与三类RNA在构成上
基本相似,但功能不同:只能指导合成对应的DNA,再以DNA为
模板,合成mRNA等三类RNA,再指导合成蛋白质。
2、模板RNA具有相应的复制酶,可以进行自我复制。
遗传中心法则
复制
转录翻译
DNA RNA 蛋白质合成其他物质
mRNA 或行使功能反转录tRNA
模板RNA rRNA
复制
3.1 核酸化学组成
核酸分子的最基本组成单位是核苷酸(Nucloticle 简称Nt)。它又是由更小的单元所构成。
核糖有脱氧、非脱氧两种
核苷
核酸核苷酸碱基有四种碱基
磷酸
一、碱基(base)是核酸的特征性物质。
DNA和RNA均有四种:
DNA 腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(T)
RNA 腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)胞嘧啶(C)尿嘧啶(U)
嘌呤由嘧啶环和咪唑环组成。
另外嘌呤和嘧啶还有几种衍生物称为稀有碱基,(如次黄嘌呤和5—甲基胞嘧啶等)均在代谢过程中生产,在代谢及调控方面方面有重要作用。不同物种还可产生特殊的衍生物,如可可碱、茶碱、咖啡碱等。
二、核糖(ribose)
两种核酸的核糖都是戊糖——五碳糖。
DNA C 2上无OH基,称脱氧核糖核酸。
RNA C 2上有OH基,称核糖核酸。
由于分子结构中C 1为手性碳,故构型上有α、β两种,天然核酸中的戊糖均为β型;C 4也为手性碳,则有D、L型之分,天然核酸中均为D型;核糖形成的五元环为呋喃环。
三、核苷(Nucleoside )
核糖C 1上的OH与碱基上的N 1 或N 9 脱去一分子水,以β—糖苷键相连(又称N—糖苷键)。
四、核苷酸(nucleotide)
戊糖C5上的OH被磷酸化,形成磷酸酯键的即为单核苷酸。
1、三磷酸核苷酸
单核苷酸上的磷酸基,一定条件下可再连接一个或二个磷酸基,形成的磷酸酯键具有极高的能量(比一般的磷酸键能量高2—4倍),称为高能磷酸酯键。是生物代谢中最重要的能量贮存、转换、运输载体,参与很多代谢过程,并直接提供能量。
对应于四种碱基,则有四种类型。每类有三种。
例AMP含1个磷酸,称腺苷一磷酸;
ADP含1个高能磷酸键,称腺苷二磷酸;
ATP含2个高能磷酸键,称腺苷三磷酸。
2、环化核苷酸
单核苷酸分子内环化形成。是生物体重要的信息载体。如cAMP、cGMP 等。
cAMP(环化腺苷酸):5′的磷酸基与3′的OH形成双酯键六元环。
cAMP在细胞内由环化酶合成,二酯酶分解。
A TP 腺苷酸环化酶cAMP 磷酸二酯酶5′—AMP
ppi
cAMP是很多激素的信息传递物质,激素称为第一信使,cAMP称为第二信使。
它通过一定机制,将激素信号传递到细胞内,并将信号放大后再传递给胞内其他
介质;有些组织中的cAMP还可传递神经信号、遗传信号等不同形式的化学、电子信息等。
五、核酸
由核苷酸之间以磷酸二酯键相连排列成线性结构。并具有严格的5′ 3′方向性。
3.2 DNA分子结构
核酸均为无分枝的多核苷酸长链结构。核苷酸间均以3′5′磷酸二酯键相连,构成长链的主轴。
核酸上的四种碱基,只能A/T、G/C以氢键相配,且物质的总含量符合[A+C]=[G+T]规则,称为碱基当量定律。
一级结构核苷酸以3′5′磷酸二酯键连结成的线性排列结构。
因核酸链5′端有一个P ,3′端有一个OH基,故规定序列写法:5′→3 ′
从结构上看,一级结构决定高级结构;
从功能上看,一级结构的精确排列决定了遗传信息内容。
1977年英国的桑格首先测出了噬菌体φχ174的单链环状DNA的5386NT的线性排列结构。90年代中期,开始进行多国合作的人类基因组大规模测序工作。现在有专门的设备来进行测序,时间短,工作效率极高。
二级结构
1953年,美国沃森(Watsosn)和克瑞克(Crick)提出:DNA右手双螺旋模型。
“Right handed B-form DNA Double helix Model ”
特征要点:
①每条DNA链均由2条平行的多核苷酸链相反平行构成,并围绕同一个中心轴,形成右手螺旋状。
②疏水性碱基层叠于螺旋内侧,亲水性磷酸和戊糖形成DNA骨架主链,位于螺旋的外侧。
③碱基平面间距0.34 nm,并与中心轴垂直;螺旋每周有10对核苷酸;螺距3.4 nm ;相邻碱基转角36º。
④双螺旋直径20 nm,因碱基对所占空间不对称,故在螺旋结构中留下大、小两条沟。大沟更有利于和专一性蛋白质结合。
⑤两条链的碱基之间互补配对:嘧啶/嘌呤(即A—T,G—C);碱基间以氢键相连,A T,G C。
按此原则,确定单链排列后,就可知另一条互补链序列。
上述特征是天然DNA中最主要的、最稳定的B型结构。