大数据中心驱动学科数据资源整合和应用
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报告的结构化解析和标准化(数据集和语义)
根据病种数据集标准, 实现每份病历报告的非 结构化的数据的结构化
匹配规则
NCCN:T 分期定义
16
多维数据项关联查询
例如: • • 诊断名称(门诊诊断、住院诊断、还是都含) 住院病区、科室的范围
•
• • •
治疗方式:放疗、化疗……
用药名称 检查、检验结果里特征项目和数值 病理结果、病理分期筛选
•
• •
免疫组化筛选、肿瘤标志物筛选
影像结果筛选 手术记录筛选、现病史筛选等等。
高级筛选器:任意拖动组合条件完成复杂条件的筛选 快速、准确
17
实现基于数据的深度探索和研究
1. 多维组合查询条件筛选队列 (每个维度平均超过150万条数据)
2. 从21,687例重症患者中查 询出40例
3. 保存查询条件,随时查 看感兴趣队列的实时数据
大数据中心驱动学科数据资源整合和应用
恺恩泰(北京)科技有限公司 黄娟 2017年8月
CaradigmConfidential–ForInternalUseOnly
目录
2
临床科研数据收集和利用的现状
科研现状 – 数据收集处于原始阶段
病情变化 纳入 收集病人 HIS 电子病历 对着业务系 统抄写修改
数据不全
搜集病例数据耗时太多 各做各的,难再利用 数据标准不一,质量低,难以累积大量 数据 ……
……
5
基于数据中心的科研服务平台
恺恩泰医院信息平台总体架构
临床数据中心
基于平台的数据管理 – 数据中心
数据中心
多厂商 系统
随访
当前生产系统
HIS EMR LIS RIS/PACS 超声 心电 内镜 核医学 病理
翻看各个业务系统 /借阅纸质病案 /调阅扫描病历
信息科 帮忙导出
排除
病案首页 PACS 手麻
Excel整理CRF 其他科室 帮忙填写
比对系统人 为判断填写
4
随访
病理
临床科研工作的效率质量的提高需要统一服务平台的支撑
现状
数据分散
解决方法
一个平台 全量数据 快速检索 统一存储,授权管理 一套标准,提高质量
9
科研平台的主要功能
1 基于规则的自动入库 – 全样本多维病例库 2 3 4 5 数据探索 – 病例数据检索 研究对象管理 病例观察量表设计和数据收集、质控
科研 服务 平台
疾病数据应用服务 – 检索、统计、导出
10
实现临床 科研的全 流程
来源于数据中心的多维动态的全量病例库
动态:
1.基于预设规则的自动入库 2.与医生站\电子病历集成随时病历入组
全量数据
快速准确的多维联合查询
全院级科研数据平台,扩展性强
高度产品化的专业工具 数据安全
思考及体会
思考和体会
• 怎样提高科研数据收集的效率和质量 从数据发生的源头,病历、报告模版、数据规范-规范化、结构化 数据标准化
• 构建基于病种/专科的通用数据集/知识库
• 为临床服务(CDSS)- 促进科研转化,回归科研的本质
多院部
本部
异构数据源
结构化 Oracle
SQL Server
当前/历史
手麻 移动护理 临床路径
分院一
半结构化
MySQL 分院二 非结构化 PDF Excel ……
归档库
升级前老系统
……
文件
放疗 生物样本
基于数据中心的科研服务平台数据流
RDB
生产系统
临床数据中心 (CDR)
专科库 病种库
CRF
SPSS SAS
随时调阅患者360视图
快速准确收集和管理面向临床研究的主题数据 分阶段管理
25
专病特色,数据挖掘
原始检查报告
后 结 构 化
26
科研主题数据的应用
27
数据权限的灵活控制及后台审计
权限控制到每项具体操作 所有操作“留痕”
28
应用情况
学科数据资源及科研服务平台 支持
回顾性研究 前瞻性研究 横断面研究
20
研究对象的临床资料随时调阅(一)
21
研究对象的临床资料随时调阅(二)
22
观察指标收藏、病例收藏 趋势、对比
全面整合各类临床资料
23
同步于临床诊疗的全程研究对象管理
入组
筛 选
出组
CRF填写
24
面向临床研究的主题数据
精准参考信息 自动关联填写
自动 | 半自动
有效性校验
必填项 | 格式校验 | 条件判断 | 自动计算
自助式的高效、精准临床数据检索
18
帮助探索数据,提出假设
临床服务 –360患者医疗视图 患者识别和信息整合共享
生产系统现状 基于数据中心
•
•
同一患者在多院部就诊
各自独立; 同一患者在同院部门诊、 住院就诊可能使用不同
本部
患者信息 临床病历文书
用药 病理 手术麻醉
共 享
影像
ID;
• 同一患者在同院部门诊 就诊历史上使用多个ID。
荐 疗效评价
析
高风险预警
数据助力,共创未来 获得新知识、实现新决策、创造新价值
谢谢!
支持学科发展的战略资源中心
34
构建学科数据资源数据集标准
肿瘤病种库 大肠癌 淋巴癌 乳腺癌 胃癌 食管癌 宫颈癌 肝癌 肾癌 卵巢癌 甲状腺癌 软组织癌 膀胱癌 前列腺癌 黑色素癌 鼻咽癌 肺癌 胰腺癌 ……
统计分析及决策支持
基于标准化数据的 多维度统计分析 高级临床决策支持
人群特征分
诊疗方案推
全量:
1.来源于临床数据中心
专科库
专病库
2.外部数据导入
多维:
1.病种库:具备专病特色的数据模型和数据项
11
2.专科库:具备学科特征的数据模型和数据项
具备学科特征的专科数据模型
具备专病特色的病种数据模型
XX肿瘤病种库
13
专科/专病库科研数据库建设成果
部分科研数据库的病例数
专病特色,数据挖掘
15
分院一
ECG(心电) 生命体征 LIS(检验)
分院二
整 合
……
多号合一 一人一号
研究对象的临床资料随时调阅
以研究对象为中心的多种数据组织形式
以就诊时间 轴为主线
以临床信息 分类为主线
以检查检验 时间为主线
围绕单次门 急诊、住院 就诊、体检
收藏病例、 病例标签
历史对比 相关性对比 全部诊疗 概览
近期诊疗 情况
支持
临床试验 疾病全程数据管理 医院/科室/个人的数据
管理
快速、准确的全量病例数据筛选和临床 研究 连续、完整、再利用的信息资产的可持 续建设
3. 一套标准 2. 多类研究 1. 一个平台
我们的客户ຫໍສະໝຸດ 综合性、多院区、 集团化医院 专科医院
31
我们的优势
8年国内深耕
多家大型三甲医院落地 专科数据库特别是肿瘤数据经验丰富 汇集顶尖专家共建分享知识库 规范实施,见效快