RNA marker 1000
RNA的提取
RNA的提取
一、试剂
1、depc处理水:在1000ml的去离子水中加入1ml depc ,充分摇匀,并用磁力搅拌
器搅拌2h,过夜,第二天高温灭菌(121℃、30min)。
2、0.1%depc水:在1000ml水中加入1ml depc ,用磁力搅拌器搅拌2h以上。
3、5xTBE缓冲液(1000ml)
Tris 54g
硼酸27.5g
EDTA-2Na 3.2g
加depc处理水至1000ml,搅拌至溶解
4、GenGree(荧光染料RNA专用)
5、Biowest Agarose
6、总RNA提取试剂盒
7、Marker
8、DEPC
二、耗材
1、枪头(10ul、200ul、1000ul):应用未开封过的枪头,应用0.1%depc水处理过的枪
头盒装。
2、EP管(1.5ml、200ul):用未开封的EP管,应用0.1%depc水处理过的容器装。
3、电泳槽:用0.1%depc水浸泡至过夜,后让其自然晾干。
4、制胶槽和梳子:用0.1%depc水浸泡至过夜,后让其自然晾干。
三、步骤
1、Rna的提取步骤为天根公司总RNA提取试剂盒
2、1%琼脂糖凝胶:
Biowest Agarose 0.2g
0.5xTBE 20ml
微波炉中加热至溶解,待其温度不烫手时,加入GenGree(荧光染料RNA专用),轻
轻摇匀倒入已放好梳子的制胶槽中,待其冷却备用。
3、将配好的胶放入电泳槽加入depc水至将其淹没,取Rna样品5ul加1ul 6 x loading bulf
(RNA双染料)混匀加入到胶孔中,取6ul Marker加入孔中,200V 10min。
单细胞测序marker基因
单细胞测序marker基因单细胞测序(marker基因)——实现生命的大数据读取随着生命科学、医学和工业等领域的不断发展,越来越多的研究者对细胞的精细调控和功能进行研究。
传统的细胞测序对于细胞组的研究已经发展了较成熟的技术,但是对于单个的细胞的研究,还需要一些新型的技术来解决技术瓶颈。
“单细胞测序(marker基因)”是一种新型的技术,可以快速、高效地研究单个细胞及其藏在内部的信息,这对于我们探究细胞特异性和癌症等疾病的研究有着重要的意义。
一、单细胞测序技术的基本原理单细胞测序(marker基因)技术允许研究者从单个细胞中提取RNA或DNA,以此了解单个细胞的基因表达情况。
其关键技术是marker基因,通过特定的基因筛选可以筛选出我们所需要的细胞进行检测。
在此基础上,研究者们可以通过单细胞测序技术获取虚拟的单细胞间差异,从而探寻这些差异所带来的生物学意义。
二、单细胞测序技术的优势传统的细胞总RNA提取和RNA测序技术在浓度和纯度上有严格的要求,在样本数量和带酸性它池的素质限制下严重制约着后期高通量测序的质量。
单细胞测序(marker基因)技术完全不需要这种复杂的前期实验,它可以抱错从细胞形态学、免疫学、局部特异性等等解剖学信息,以便输出拟人工细胞、信仰病毒的技术开发,这些应用半推半就都迫切需要单细胞测序技术。
三、单细胞测序的应用场景举例单细胞测序(marker基因)技术在诸如肿瘤单细胞转化研究、小鼠特异性脑神经元染色、抑制小鼠隐形眼镜亚类转化测试、优化细胞接口分析构建等领域都有广泛的应用场景。
同时,在大数据的背景下,单细胞测序技术也成为了了解生命的有效途径。
现在,越来越多的研究者和企业将单细胞测序(marker基因)技术作为重点开展的技术研究领域。
四、单细胞测序技术的未来前景随着单细胞测序(marker基因)技术的不断发展,其未来研究前景也会变得更加广阔。
从识别单细胞基因表达、诊断某些癌症、研究发展细胞生命周期等角度入手,都有足够的理由相信,单细胞测序marker基因必将成为生命科学和医学领域研究的重要工具,为人类健康事业和生命科学领域作出更多的贡献。
分子量Marker
12分子量Marker210211212214215216216216217218218218219219219DNA 分子量Marker 图预混合的即用型DNA Marker DNA Step Ladders DNA Ladders 常用DNA Marker 放射自显影Marker 超螺旋DNA Ladder 染色体DNA Marker 荧光DNA Marker RNA Markers 蛋白Marker 体外翻译Marker 基因组DNA 上样染料其它常见水生植物(亚马逊河之剑)Echinodorus paniculatus 的花粉。
放大倍数:1325×。
单个花粉直径为25µm ,这些植物生长在水中,或露出水面,但是花蕾只在水上开放。
DNA 分子量Marker 图分子量Marker核酸分子量Marker说明: Promega 提供用于传统及脉冲电场凝胶电泳(PFGE )所需的范围广泛的DNA 及RNA 分子量Marker (molecular weight marker )。
传统双链DNA 电泳Marker 包括ladders ,限制性内切消化的lambda, φX174和pGEM ® DNA 。
蓝色/橙色上样染料与大多数DNA Marker 一同提供。
同时提供未消化的DNA (如, Lambda, φX174,pBR322等) 以用于自制分子量Marker 。
提供的RNA Marker 的大小范围为281到6,583个碱基。
PFGE 大小Marker 包含Promega-Markers ® Lambda Ladders 。
PFGE Marker 大小范围大约为50kb 到1.0Mb 。
提供的PFGE Marker 为储存于50mM EDTA 缓冲液的橙色琼脂糖系列条带。
Promega 同时还提供蛋白Marker 及体外翻译Marker 。
BenchTop DNA MarkersAgarose, LE, Analytical Grade24Ethidium Bromide Solution, Molecular Grade 29Wizard ®SV Gel and PCR Clean-Up System 92– 1,353bp– 1,078– 872– 603– 310– 281/271– 234– 194– 118– 722% agarose3176T A 12_0ABenchTop φX174 DNA/HaeIII Markers Cat.# G7511 Load 5µl/lane.– 2,645bp– 1,605– 1,198– 6762% agarose– 517– 460– 396– 350– 222– 179– 126– 75/65 [51,36]3177T A 12_0ABenchTop pGEM ®DNA Markers Cat.# G7521 Load 5µl/lane.bp – 1,000– 750– 500– 300– 150– 502% agarose0094T A 05_3ABenchTop PCR MarkersCat.# G7531 Load 6µl/lane.bp– 250, 253– 500– 750– 1,000– 1,500– 2,000– 2,500– 3,000– 4,000– 5,000– 6,000– 8,000– 10,0000.7% agarose1409T A03_6ABenchTop 1kb DNA LadderCat.# G7541 Load 6µl/lane.bp – 1,500– 1,000– 900– 800– 700– 600– 500– 400– 300– 200– 1002% agarose0973T C 03_5ABenchTop 100bp DNA LadderCat.# G8291 Load 6µl/lane.预混和的即用型DNA Marker分子量Marker说明: BenchTop DNA Markers 可以方便地储存于室温(22-25℃),并可以在琼脂糖凝胶上直接上样。
总 RNA 的电泳检测
总RNA 的电泳检测,原来我使用Lambda DNA/EcoR I (或者Hind III)酶切Marker,现在基本上不再用Marker 了。
指示剂一定是溴酚蓝加二甲苯氰,胶浓度1-1.2%。
加样后,开始电泳(电压的选择的唯一依据是,我后面的时间安排。
)。
溴酚蓝出孔2 -3cm 后终止电泳,紫外观察。
首先能吸引我的一定是非常亮的位置(是否上样过量),然后观察溴酚蓝到二甲苯氰之间的条带情况(降解情况),再就是加样孔(杂质残留情况),最后是23kb 处是否有条带(基因组DNA 残留情况)。
如果同时抽提的样品是多个,而且类似,在具体分析某一个问题样品前,要先综合一下该批次抽提的总的成败。
如果全部有某现象,可能与试剂有关,也可能与样品有关,还可能与操作有关;如果只有部分有该现象,更可能与操作有关,少部分与样品有关(先做的和后做的可能也有区别)。
只有在宏观上有了一个概念,微观分析才有价值,才准确。
微观分析重点要看如下几个位置:1 溴酚蓝偏下一点点。
这个位置提供的是小片段rRNA (5S 等)的信息及降解的辅助指标。
有可能有,也可能没有。
没有不是问题,因为柱子抽提方法及TRIzol 的高盐沉淀方法,都会去除大部分小的RNA 片段。
问题一:特别亮,宽度甚至超过了加样孔的宽度。
特别亮首先提示上样量过大,而过大的上样量是很容易掩盖一些信息的,导致判读错误。
不管能否看见大片段RNA,也不管带型如何,碰到小片段非常亮的情况,最好大大降低上样量重新跑一次,再判读。
2 指示剂溴酚蓝到二甲苯氰之间或者上面一点点。
这个位置提供的是大片段的rRNA (28S/18S 等)完整性的信息。
条带清晰弥散轻微,表示完整性好;否则表示完整性差。
问题一:比例达不到2:1。
条带亮度比例,没有必要太放在心上,因为比例不是非变性电泳的结论;同时,有些物种本身就不具备这样的比例(从DXY 上战友处首次学到)。
关键是条带是否清晰,弥散少。
问题二:有多条带。
rna marker制备流程
rna marker制备流程
RNA Marker制备过程其实也不难,先说说要准备啥吧。
得准备MOPS、DEPC处理水、NaOH、CH3COONa、EDTA、琼脂糖这些。
都是基础材料,但选的时候可得挑好的,不然后面制备出来的Marker效果可就差了。
MOPS这玩意儿得先溶解在DEPC处理水里,大概700ml左右。
搅拌的时候别太快,也别太慢,得让MOPS完全溶解,但又别弄出太多泡沫来。
调pH值这一步也挺关键的。
得用2N NaOH调到7.0,得反复测试,一点点调,不然影响后面的实验。
再加点1M CH3COONa和0.5M EDTA pH8.0进去,这俩能让溶液更稳定。
最后,再加点DEPC处理水,让溶液总量达到1L。
过滤一下,放那避光保存。
这样制备出来的RNA Marker就能用了。
说来说去,制备RNA Marker这事儿得细心,每一步都得注意,
不然出来的效果就不好。
所以,大家在做实验的时候,一定得按照步骤来,别马虎。
同科生物DNA Marker 1000产品说明书
同科生物DNA Marker1000产品说明书
产品编号:TK02013
通用名称:DNA分子量标准1000
产品规格:500μL(100次量)
储存条件:长期保存于-20±5℃,频繁使用保存于4℃,避免反复冻融。
有效期:半年(4℃);两年(-20±5℃)。
产品介绍:
本产品仅供科研使用,由1000bp、700bp、500bp、400bp、300bp、200bp和100bp 共7条线性的双链DNA组成,其中400bp的DNA含量约为30ng/μL,其它6条DNA含量均约为10ng/μL,本产品已含有1×上样缓冲液,可以直接用于琼脂糖凝胶电泳。
存储液成分:
终浓度为10mM的Tris-HCl(pH8.0)、10mM的EDTA、0.02%的溴酚蓝和5%的甘油。
使用方法介绍:
(1)直接取5μL上样,电压选择4-10V/cm。
(2)琼脂糖凝胶浓度建议为2-3%之间。
DNA Marker1000
2%的琼脂糖凝胶电泳
上样量为5μL,电压为5V/cm
电泳缓冲液为1×TAE。
DNAMarker
DNAMarkerDNA Marker 类100bpDNAMarkerⅠ概述: 100bpDNAMarkerⅠ是由单独的 PCR 扩增⽬录号包装价格PBZ0301-1 PBZ0301-1 50 次 100 次 75.00 140.00 产物混合⽽成,已含有 1xLoading Buffer,可以直接电泳。
包括 11 条双链DNA ⽚断:100bp、 200bp、300bp、400bp、500bp、600bp、700bp、 800bp、900bp、1000bp 和 1500bp。
特异性加强500bp。
每次上样 4~5µL。
100bpDNAMarkerⅡ概述: 100bpDNAMarkerⅡ是由单独的 PCR 扩增⽬录号包装价格PBZ0302-1 PBZ0302-2 50 次 100 次 75.00 140.00 产物混合⽽成,已含有 1xLoading Buffer,可以直接电泳。
包括 6 条双链DNA ⽚断: 100bp、 200bp、 300bp、400bp、500bp 和 600bp,适⽤于短⽚断 DNA ⼤⼩的分析。
特异性加强 500bp。
每次上样 4~5µL。
200bpDNAMarker 概述:200bpDNAMarker 是由单独的 PCR 扩增⽬录号包装价格PBZ0303-1 PBZ0303-2 50 次 100 次 75.00 140.00 产物混合⽽成,已含有 1xLoading Buffer,可以直接电泳。
包括 10 条双链DNA ⽚断:200bp、 400bp、 600bp、 800bp、 1000bp、 1200bp、 1400bp、 1600bp、 1800bp 和 2000bp,特异性加强1000bp。
每次上样 4~5µL。
1kbDNAMarker 概述: 1kbDNAMarker 是由 8 条 DNA 条带组成,由⼩到⼤分别为: 1.0kb, 2.0kb, 3.0kb, 4.0kb,⽬录号包装价格PBZ0303-1 PBZ0303-2 50 次 100 次 75.00 140.005.0kb,6.0kb, 8.0kb 和 10.5kb 。
小鼠单细胞分群出的各个细胞的marker基因
小鼠单细胞分群出的各个细胞的marker基因最近几年,单细胞RNA测序技术的快速发展使得对小鼠细胞的深入研究成为可能。
通过单细胞RNA测序,可以获得大量的细胞表达数据,并且能够进行细胞分群,从而揭示出不同细胞类型之间的差异。
在小鼠单细胞分群的研究中,marker基因是非常重要的指标,可以用来鉴定和描述不同细胞类型。
下面我们将介绍一些小鼠单细胞分群中常见的细胞类型及其marker基因。
1.神经元细胞:神经元细胞是大脑的基本功能单位,主要负责信息传导和处理。
在小鼠单细胞分群中,可以通过一些特定的marker基因来鉴定神经元细胞,比如Tubb3、Snap25、Syn1和Nefh等。
这些基因主要参与神经元的结构和功能,通过它们的表达水平可以鉴定出神经元细胞。
2.神经胶质细胞:神经胶质细胞是神经组织中的非神经细胞,主要承担起支持、维持和修复神经元的功能。
在小鼠单细胞分群中,神经胶质细胞可以通过一些特定的marker基因来鉴定,比如Aqp4、Gfap、Optc等。
这些基因主要参与神经胶质细胞的结构和功能,通过它们的表达水平可以鉴定出神经胶质细胞。
3.免疫细胞:小鼠的免疫系统中含有多种不同类型的免疫细胞,包括B细胞、T 细胞、巨噬细胞等。
在小鼠单细胞分群中,可以通过一些特定的marker基因来鉴定免疫细胞的不同亚群,比如Cd19、Cd3d、Cd68等。
这些基因主要涉及免疫细胞的特定表面标记物或功能酶,通过它们的表达水平可以鉴定出不同类型的免疫细胞。
4.干细胞和前体细胞:在小鼠单细胞分群中,还可以鉴定出一些干细胞和前体细胞,这些细胞具有多向分化能力,在组织发育和修复中具有重要的作用。
一些常见的marker基因如Sox2、Olig2、Nestin和Pax6等,它们主要参与细胞的发育和分化过程,通过它们的表达水平可以鉴定出干细胞和前体细胞。
总的来说,小鼠单细胞分群的研究中使用了许多marker基因来鉴定不同细胞类型。
电泳marker的原理
电泳marker的原理
电泳marker通常是一种特殊的DNA分子,具有不同大小的片段并带有特定的标记,如荧光染料或放射性同位素。
它们用于在凝胶电泳实验中确定样品DNA 或RNA的大小。
电泳marker的原理如下:
1. 准备标准DNA:标准DNA是已知长度的DNA分子,通常由质粒DNA或从特定细菌中提取的DNA片段组成。
这些片段具有已知的长度,通常是以基对(bp)为单位测量的。
它们与染料或放射性同位素标记的特定序列结合。
2. 混合标准DNA与样品DNA:在凝胶电泳实验之前,将标准DNA与待测样品DNA混合在一起,并将其加载到凝胶中的样品孔中。
3. 运行凝胶电泳:将电泳室中的凝胶连接到电源,施加一定的电压,使DNA 带电并在凝胶上移动。
较短的DNA片段移动得更远,而较长的片段移动较短的距离。
4. 染色和可视化:完成电泳后,通过染色(如乙溴橙染色)或通过荧光方法(如果使用荧光标记的marker)来可视化凝胶上DNA的带。
5. 分析结果:观察凝胶上标准DNA和样品DNA的迁移位置,并使用标准DNA
片段的大小与迁移距离之间的关系来确定样品DNA的大小。
电泳marker的原理基于DNA片段的电荷、大小和凝胶的孔径之间的相互作用,从而使凝胶电泳实验能够帮助确定DNA或RNA的大小。
植物总RNA的提取和电泳
⑨ 加入500μl RPE到离心柱内,最大转速 离心2min,干燥离心柱,弃去搜集管;
植物细胞内旳RNA主要是 rRNA(占80~85 %)、tRNA及小分子RNA(占10~15%)和 mRNA(占1~5%)。rRNA含量最丰富,由 25S、18S和5S几类构成。mRNA种类繁多,分
子量从数百至数千碱基不等,但绝大多数 mRNA在3’端都有一种polyA尾巴,所以,可 根据此特征用寡聚脱氧胸苷(OligodT)层析柱 从总RNA中将 mRNA分离出来。一般情况下, 提取旳总RNA也可用于Northern blot试验。
⑩ ⑩把离心柱接在一种新旳1.5 ml Eppen 管上,加入30~50μl 无RNase水 (0.1%DEPC处理),10000 rpm离心 1min,洗出RNA。若RNA产量在20μg 以上,用30~50 μl无RNase水再洗脱1 次。RNA样品保存于-20℃备用。
琼脂糖凝胶非变性电泳
所需试剂: 10ⅹ凝胶缓冲液
2. 样品制备:在离心管里,将RNA样品与 10×样品缓冲液以9:1百分比混合。65oC 温浴5-10分钟, 迅速在冰上冷浴5分钟 , 瞬时离心数秒。对于Northern杂交试 验,总RNA上样量可到达10-30g。
3. 上样前凝胶须预电泳5min,随即将样品加 入上样孔。以5V/cm旳电压电泳1.5h-2.0h。
3. 试验材料与试剂
材料: 新鲜植物组织 (水稻) 试剂:Qiagen RNeasy植物试剂盒, 甲醛,琼脂糖电泳系统 ,凝胶成象系 统等。
从RNA 提取到荧光定量PCR 完整解决方案
旋仪;高速离心机;紫外分光光度计;凝胶成像仪;通风厨等。 配胶所需工具:天平;微波炉;三角瓶;RNA 专用的电泳仪、电泳槽、梳子、制胶版。
相关溶液配制:
1.操作前在 RL 中加入 β-巯基乙醇至终浓度 1%,如 1 ml RL 中加入 10 µl β-巯基乙醇。 2.取 60ml 无水乙醇加入到漂洗液 RW 中。 3.DNase I 储存液的配制:将 DNase I 干粉(1500 U)溶解在 550 µl RNase-free ddH2O 中,轻柔混匀。
仪等。 配胶相关工具:天平;微波炉;三角瓶;电泳仪;电泳槽;梳子;制胶版。
操作步骤:
一、RT 反应(cDNA 第一链合成):
1. 将模板 RNA 在冰上解冻;引物、10×RT mix、dNTP 混合液、RNase-free ddH2O 在室温(15-25℃) 解冻,解冻后迅速置于冰上。使用前将每种溶液涡旋振荡混匀,简短离心收集残留在管壁的液体。
rpm(~13,400×g)离心 60 秒,弃废液,将吸附柱 CR3 放回收集管中。 9. 重复步骤 8。 10. 12,000 rpm(~13,400×g)离心 2 分钟,倒掉废液。将吸附柱 CR3 置于室温放置 5 分钟,以彻底晾干吸
附材料中残余的漂洗液。 11. 将吸附柱 CR3 转入一个新的 RNase-free 离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加 100 µl RNase-free
TRNzol-A+总 RNA 提取试剂 RNAsimple 总 RNA 提取试剂盒
RNAplant 植物总 RNA 提取试剂
TIANamp 病毒 DNA/RNA 提取试剂盒 RNAclean RNA 纯化试剂盒 RNAsafe (RNase 抑制剂) RNasin (RNase 抑制剂) DNase I
rna 分子量标准marker
RNA分子量标准marker是分子生物学研究中常用的试剂,用于测量RNA分子的大小和浓度。
本文将从以下几个方面对其进行详细介绍和分析。
一、RNA分子量标准marker的概念和作用1. RNA分子量标准marker是一种含有已知大小的RNA分子的混合物,通常由几种不同大小的RNA分子组成。
2. 在电泳实验中,将RNA分子量标准marker与待测RNA样品一起加载到琼脂糖凝胶中,通过对照标准marker的迁移距离,可以确定待测RNA样品的分子大小。
3. RNA分子量标准marker还可以用于评估RNA样品的质量和纯度,为后续的实验设计提供基础数据。
二、RNA分子量标准marker的种类和选择1. 目前市面上有多种不同类型的RNA分子量标准marker,主要根据其包含的RNA分子大小范围和数量的不同进行区分。
2. 选择合适的RNA分子量标准marker需要根据实验的具体要求来确定,一般来说,如果需要测量较小的RNA分子,可以选择包含较小大小RNA的标准marker;反之,若需要测量较大的RNA分子,则选择包含较大大小RNA的标准marker更为合适。
三、RNA分子量标准marker的使用注意事项1. 在实验操作中,应严格按照标准marker的说明书进行使用,包括稀释比例、加载量等操作步骤。
2. 需要保证RNA分子量标准marker的储存条件,避免长时间曝光于阳光下或长时间存放在高温环境中。
3. 在实验结果分析中,需要考虑到标准marker的迁移距离可能受到实验条件的影响,如电泳时间、电场强度等因素,需要进行适当的修正和校正。
四、RNA分子量标准marker的市场现状和发展趋势1. 目前,随着分子生物学研究的不断深入,RNA分子量标准marker的需求量也在不断增加,市场规模逐渐扩大。
2. 随着技术的不断进步,新型的RNA分子量标准marker也在不断涌现,包括使用荧光标记的标准marker、多种RNA组合的混合标准marker等,以满足不同实验需求。
RNA提取方法
RNA提取⽅法总RNA的提取(Trizol法提取)在收集到⽣物材料之后,最好能即刻进⾏RNA制备⼯作。
若需暂时储存,则应以液氮将⽣物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。
在制备RNA时,将储存于冷冻柜的材料取出,⽴即以加⼊液氮研磨的⽅式打破细胞,不可以先⾏解冻,以避免RNase 的作⽤。
1.提取组织RNA时,每50~100mg组织⽤1ml Trizol试剂对组织进⾏裂解;提取细胞RNA时,先离⼼沉淀细胞,每5-10 ╳106个细胞加1ml Trizol后,反复⽤枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;2.将上述组织或细胞的Trizol裂解液转⼊EP管中,在室温15~30C下放臵5分钟;3.在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加⼊氯仿,盖上EP管盖⼦,在⼿中⽤⼒震荡15秒,在室温下(15℃~30℃)放臵2~3分钟后,12000g(2℃~8℃)离⼼15分钟;4.取上层⽔相臵于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加⼊异丙醇,在室温下(15℃~30℃)放臵10分钟,12000g(2℃~8℃)离⼼10分钟;5.弃上清,按照每1ml TRIZOL加1ml 75%⼄醇进⾏洗涤,涡旋混合,7500g(2℃~8℃)离⼼5分钟,弃上清;6.让沉淀的RNA在室温下⾃然⼲燥;7.⽤Rnase-free water 溶解RNA沉淀。
PCR实验室常⽤DNA聚合酶有三种:TaKaRa Taq TM,TaKaRa E X Taq TM和Pyrobest TM DNA Polymerase。
TaKaRa Taq TM 是⼀般的DNA聚合酶,保真性较差,但价钱便宜,⼀般⽤于基因表达的检测等。
TaKaRa E X Taq TM是具有Proof reading 活性的耐热性DNA聚合酶,具有⼀定的保真性,⽽且其扩增得到的PCR产物3’端附有⼀个“A”碱基,如果希望直接将产物克隆到T-vector可以⽤此酶。
体外转录RNA系统使用说明
RiboMAX TM Large Scale RNA Production Systems-T7保存方法:避免反复冻融或者经常变换温度,以防影响产品稳定性。
保存温度:-20℃试剂组成:ATP 100µlCTP 100µlGTP 100µlUTP 100µlRQ1 RNase-Free DNase 110U醋酸钠3.0M(pH 5.2) 1mlT7线性化对照DNA 10µl酶混合物,T7 RNA聚合酶120µlT7 5×转录缓冲液240µl无核酸酶水1.25ml质量控制:32P标记RNA除另外加入5µCi α-32P CTP 400Ci/mmol之外,其它参照TB166所述方案进行。
在这些条件下,经TCA沉淀计算,会有>40µg的RNA合成。
RNA完整性:上述转录反应产物经凝胶电泳分析和放射自显影分析,最低标准应当有90%的RNA按预期大小迁移成一条单一的带。
I.概述体外转录反应广泛用于从重组DNA模板合成微克量的RNA探针。
大多数用于生产RNA探针的转录反应多用于放射标记核糖核酸的合成,而不是合成大量的RNA。
但体外转录也用于需要大量具生物活性RNA的时候。
大量的RNA产物可用于体外翻译、合成tRNA、rRNA或其它小的功能性RNA、RNA病毒基因组和核酶,亦用于RNA拼接的底物、RNA的二级结构、反义RNA以及RNA-蛋白相互作用的研究。
RiboMAX TM Large Scale RNA Production Systems可产生微克量的RNA,转录产物可达14kb;但是,通常用于生产5~6kb的转录产物。
RiboMAX TM Systems在1ml反应体系中可稳定地合成2~5mg RNA,大约比标准Riboprobe® System转录反应多10~20倍。
RiboMAX TM Systems不同于Riboprobe® System之处主要有三个基本方面:(1) 使用HEPES(pH 7.5)缓冲液而不是Tris-HCl(pH 7.9)缓冲液,rNTP和镁浓度调整到接近T7 RNA聚合酶活性浓度。
细胞亚群的marker基因
细胞亚群的marker基因
在免疫学研究中,常用的细胞亚群marker基因包括CD4和CD8,它们分别标记辅助T细胞和细胞毒性T细胞。
另外,对于单个细胞RNA测序研究,常用的marker基因还包括细胞表面受体和细胞特异
性的转录因子。
这些基因的表达模式可以帮助鉴定和区分不同的细
胞类型。
除了免疫学研究外,在肿瘤学和神经科学等领域,也存在特定
的marker基因用于鉴定和分类不同的细胞亚群。
例如,在肿瘤研究中,常用的marker基因包括HER2(人类表皮生长因子受体2)和
ER(雌激素受体),它们用于分类乳腺癌的亚型。
总的来说,细胞亚群的marker基因在细胞生物学和医学研究中
起着至关重要的作用。
通过对这些基因的研究和应用,科学家们能
够更好地理解细胞的多样性和功能,为疾病诊断和治疗提供更精准
的方法。
因此,对marker基因的研究和应用具有重要的科学意义和
临床应用前景。
DNA分子量标准
Bioteke
详细 100bp Ladder 本产品用于凝胶电泳中双链线状 DNA 分子量大小的参照。100bp Ladder 由单 一的 DNA 条带混合而成,条带长度准确,明亮清晰,背景较低,稳定性很好。 参照片断(bp):100 、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、 PR3001 1500bp 每条带的量约为 50ng,可用以相对定量。使用方法:直接上样电泳, 每次加样量为 5μl. 100bp DNA MarkerⅡ 条带长度准确,明亮清晰,背景较低,稳定性很好。参照片断(bp): PR3101 100,200,300,400,500,600,700,800,900,1000,1500,2000,3000,5000bp 50 次 50 次
50 次
DNA Marker 1 本产品用于凝胶电泳中双链线状 DNA 分子量大小的参照。50bp Ladder 由单 一的 DNA 条带混合而成,条带长度准确,明亮清晰,背景较低,稳定性很好。 参照片断(bp):100 、200、300、400、500、600bp 每条带的量约为 50ng, 可用以相对定量。使用方法:直接上样电泳,每次加样量为 5μl。 DNA Marker 2 本产品用于凝胶电泳中双链线状 DNA 分子量大小的参照参照片断 (bp)100 、 : PR3701 300、500、700、900、1200bp 每条带的量约为 50ng,可用以相对定量。使 用方法:直接上样电泳,每次加样量为 5μl。DNA Marker2 由单一的 DNA 条 带混合而成,条带长度准确,明亮清晰,背景较低,稳定性很好。
琼脂糖凝胶电泳markerw型原因
琼脂糖凝胶电泳markerw型原因琼脂糖凝胶电泳marker是在琼脂糖凝胶电泳分析中常用的参考标记物,可以用来确定DNA或RNA样品的大小和迁移距离。
在琼脂糖凝胶电泳分析中,marker通常以不同的浓度和大小提供,以帮助确定待测样品的大小和浓度。
在marker中,常见的类型包括w型原因。
本文将详细解释琼脂糖凝胶电泳marker中w型原因的原因及其相关知识。
第一步:琼脂糖凝胶电泳原理介绍在开始解释w型原因之前,我们先了解琼脂糖凝胶电泳的原理。
琼脂糖凝胶电泳是一种常见的分离和分析DNA或RNA片段的方法。
它利用琼脂糖凝胶作为分离介质,通过电场将DNA或RNA样品分离成不同大小的片段。
在电泳过程中,DNA或RNA片段会向阳极(正极)移动,移动的速率取决于片段的大小。
在分析过程中,需要参考标记物来确定待测样品的大小和浓度,而marker就是一种常用的参考标记物。
第二步:琼脂糖凝胶电泳marker的作用琼脂糖凝胶电泳marker的作用是将一系列已知大小的DNA片段加入到琼脂糖凝胶电泳中,用于和待测样品进行对比。
通过与marker的比较,我们可以确定待测样品中DNA片段的大小和浓度。
此外,marker还可以用作准确测定待测样品的迁移距离,从而帮助我们判断琼脂糖凝胶电泳分析的准确性。
第三步:marker的分类marker根据其所含的DNA片段大小和浓度的不同,可以分为多种类型。
其中,w型原因是一种常见的marker类型。
w型原因通常包含一系列大小从100bp到10,000bp的DNA片段。
由于其范围广泛,w型原因能够提供较高的解析力,适用于分析不同大小的DNA分子。
第四步:w型原因的原因为什么w型原因能够被广泛应用于琼脂糖凝胶电泳分析中呢?这是因为w型原因的DNA片段范围广泛,可以满足不同种类和大小的DNA片段的分析需求。
除此之外,w型原因中每个DNA片段的浓度都是根据比例控制的,使得在电泳过程中,每个片段都能够清晰可见。
DL1000 DNA Marker
DL1,000 DNA Marker
使 用 说 明 书
●使用注意
●TaKaRa Code:D526A
1. 电泳时的加样孔宽度小于6 mm 时,每次取5 μl
制品电泳便可得到清晰条带。
如果加样孔增宽,须适当增加Marker 制品的加样量。
●包 装 量: 500 μl(约100次) ●浓 度: 约450 ng/5 μl ●保存温度
2. 对DNA 电泳而言,Agarose 的纯度对DNA 条
带的清晰度影响很大。
因此,电泳时应尽量选用质量好的Agarose,推荐使用胶浓度为2%~3%。
4℃(长期保存请置于-20℃)。
●制品说明
3. 进行Agarose 电泳时,Agarose 的浓度与DNA
片段的分离性能关系密切。
Agarose 浓度越大,对短片段DNA 分离性能越好;反之,Agarose 浓度越小,越有利于长片段DNA 的分离。
DL1,000 DNA Marker 为已含有1×Loading Buffer 的DNA 溶液,可取5 μl 直接电泳,使用十分方便。
DL1,000 DNA Marker 由DNA 片段1,000 bp、700 bp、500 bp、400 bp、300 bp、200 bp、100 bp 组成,共7条带。
每次取5 μl 电泳时,每条带的DNA 量约为50 ng,其中400 bp 的DNA 片段量约为150 ng,显示亮带。
V2010.02。
Ambion RNA MARKER TEMPLATE SET (产品号 R 4142) 产品说明书
RNA MARKER TEMPLATE SET Product Number R 4142Lot Number 122K1286Storage Temperature: below –20 °CProduct DescriptionConcentration: 0.52 µg/µlStorage Buffer: 10 mM Tris, pH 7.5, 1 mM EDTASet provides a mixture of 7 DNA templates that upon transcription with T7 RNA polymerase results in7 transcripts suitable for use as RNA size markers.The RNA Marker Template set is a mixture of7 linearized DNA templates, each containing the promoter for T7 RNA polymerase. Transcription withT7 RNA polymerase, results in 7 transcripts of the following lengths: 100, 200, 300, 400, 600, 800, and 1,000 bases. The concentration of each template has been adjusted so all 7 bands are approximately equal in intensity. The transcripts can be labeled with radioisotopes, biotin or any non-radioactive tag compatible with T7 RNA polymerase. These markers are ideal as size standards for single stranded nucleic acid work.For non-labeled marker, add 0.5 µg of RNA Marker Template Set to a 20 µl reaction containing 0.5 mM of each of the ribonucleotide triphosphates with 10 units of T7 RNA polymerase (Product No. R 0884).Procedure1. Prepare a 20 µl reaction mix as follows:2 µl 10X Transcription Buffer (400 mM Tris-HCl,pH 8.0, 80 mM MgCl2, 500 mM NaCl, 20 mMspermidine)1 µl 200 mM dithiothreitol1 µl 10 mM ATP1 µl 10 mM GTP1 µl 10 mM UTP1 µl 10 mM CTP1 µl RNA Marker Template Set (diluted ifnecessary to 0.5 µg/µl)1-3 µl α32P-UTP or -CTP, 800 Ci/mmol (10 mCi/ml in aqueous solution)1 µl T7 RNA polymerase (10 units/µl)Q.S. to 20 µl with RNase-free water (Product No.W 4502)2. Incubate at 37 °C for 1 hour.3. Add 1 µl (2 units/µl) RNase-free DNase I (ProductNo. D 7291) to degrade DNA template, mix welland incubate at 37 °C for 15 minutes.4. Add equal volume of gel loading buffer(80% formamide, 0.1% xylene cyanole,0.1% bromophenol blue, 2 mM EDTA)5. Heat for 3 minutes at 95 °C to inactivate theenzyme and denature the transcript.6. Separate transcripts by electrophoresis on a 5%polyacrylamide/8 M urea gel.NotesThe 100 nucleotide band runs between the xylene cyanole and the bromophenol blue. The remaining bands migrate slower than the xylene cyanole.The markers can be stored at –20 °C for several weeks. Use of RNase inhibitor may be helpful in transcription reaction.Reheating markers prior to use is not necessary. Approximate exposure times for radiolabeled markers:10 min for 10-20 µl1 hour for 1-3 µl12-16 hours for 1-3 µl of 1:10 dilutionUsing an intensifying screen:3 hours for 2-5 µl of 1:10 dilution12-16 hours for 1-5 µl of 1:50 dilutionIncrease volume of marker loaded on the gel proportionally as the 32P-label decays.References1. Sambrook, J., et al., Molecular Cloning: ALaboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, p. 10.27- 10.37 (1989). 2. Krieg, P.A. and Melton, D.A. Nucleic Acids Res. 12,7057-7070 (1984).3. Melton, D.A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 144-148.1/03Sigma brand products are sold through Sigma-Aldrich, Inc.Sigma-Aldrich, Inc. warrants that its products conform to the information contained in this and other Sigma-Aldrich publications. Purchaser must determine the suitability of the product(s) for their particular use. Additional terms and conditions may apply. Please see reverse side ofthe invoice or packing slip.。
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制品内容
RNA Marker RL1,000 6×Loading Buffer DEPC 处理水
20 μl 100 μl
1 ml
使用方法 A. 普通琼脂糖凝胶电泳时
1. 按下列组份配制 RNA Marker 样品。
RNA Marker RL1,000 6×Loading Buffer DEPC 处理水
RNA Marker RL1,000
使用说明书
Takara Code : D508A
包 装 量 : 约 20 次量
浓 度 : 约 200 ng/μl
保 存 : -80℃(短期保存可放置于-20℃)
制品说明 RNA Marker RL1,000是由体外转录得到的8条高纯度的单链RNA片 段组成的,其长度分别为1,000、800、600、500、400、300、200 和100 Bases,每微升本制品的RNA量约为200 ng。可用于RNA的 琼脂糖变性凝胶电泳(甲醛或乙二醛)或者普通的RNA琼脂糖凝胶 电泳等。每次取1 μl电泳时可使用约20次。
4. 甲醛变性琼脂糖凝胶配制方法如下: 加 6.0 g 高质量的琼脂糖到 93 ml DEPC 水中,煮沸直至完全溶 解,再加入适量的 DEPC 水定容至 93 ml。溶液冷却至 60℃左 右后,加入 30 ml 5×MOPS-EDTA Buffer 和 27 ml 37%甲醛(在 通风橱中操作),倒胶后于室温静置 1 小时。
1 μl 2 μl up to 10 μl
2. 均匀混合后 65℃加热 10 分钟,迅速冷却至室温(最好用 PCR 仪)。
3. 使用高质量的琼脂糖,用 1×TAE Buffer 制备 5%凝胶,制胶时 凝胶中请加入溴乙锭(终浓度:1 μg/ml)。
4. 将上述操作 2 配制的 Marker 样品加样后,在 1×TAE Buffer 中 电泳。
7. 电泳结束后,将凝胶在 DEPC 处理水中浸泡 15 分钟,除去凝胶 中的甲醛。
8. 使用 DEPC 处理水制备的 EtBr(5 μg/ml)染色 2~3 分钟。用 DEPC 处理水脱色 30 分钟,再换水脱色 30 分钟后成像观察。 如果背景偏高时可以进一步进行过夜凝胶脱色。 注意:甲醛凝胶用 EtBr 染色比较麻烦,即使 RNA 样品染上了 明显的条带也会带来较高的背景。因此,应控制凝胶在 染色剂中的浸泡时间小于 5 分钟,以降低背景。
使用例 取本制品 1 μl、2 μl 进行 5%的琼脂糖凝胶电泳(使用 1×TAE Buffer)时 的结果如下。
V2012.01
5. 加样前将胶在 1×MOPS-EDTA Buffer 中 10 V/cm 条件下预电泳 10 分钟。
6. 混匀电泳槽中的 1×MOPS-EDTA Buffer(电泳液),加入上述 操作 2 配制的 RNA Marker 样品后,10 V/cm(恒压)条件下 电泳至溴酚蓝迁移至胶的 2/3 左右位置,电泳过程中应每隔 30 分钟混匀电泳槽中的电泳液一次。
使用注意 1. RNA 极易分解,应严格防止核酸分解酶的混入。实验操作时应
戴手套,实验的仪器及溶液应经 Drker 中的条带不清晰或不完整。 2. RNA Marker 中的 RNA 为单链线性 RNA,因此,当进行体外转 录得到的 RNA、或经提取得到的 mRNA 等单链线性 RNA 电泳 时,可使用本制品作为分子量大小的参照标准,但对于 Total RNA,本 Marker 只能作为定性参照标准。 3. 若脱色后观察不到 Marker 的条带,可能是由于胶被染上了较高 的背景,此时可以进行反复脱色或过夜和脱色后再进行观察。
2. 按下列组份配制 RNA Marker 样品。
RNA Marker RL1,000 甲醛 甲酰胺 5×MOPS-EDTA Buffer 6×Loading Buffer DEPC 处理水
4.0 μl 3.5 μl 4.0 μl 4.0 μl 3.0 μl up to 20 μl
3. 均匀混合后,70℃加热 5 分钟,迅速冷却至室温(最好用 PCR 仪)。
B.甲醛变性琼脂糖凝胶电泳时
1. 按下列方法配制 5×MOPS-EDTA Buffer(0.1 M MOPS pH7.0, 5 mM EDTA,10 mM NaOAc)。 ① 称量 20.9 g MOPS 置于 1 L 烧杯中。 ② 加量约 700 ml 的 DEPC 处理水,搅拌溶解。 ③ 使用 2 N NaOH 调节 pH 值至 7.0。 ④ 向上述溶液中加入 10 ml 的 1 M NaOAc(DEPC 处理水配制)。 ⑤ 溶液中加入 10 ml 的 0.5 M EDTA pH8.0(DEPC 处理水配制)。 ⑥ 加入 DEPC 处理水将上述溶液定容至 1 L。 ⑦ 使用 0.45 μm 滤膜过滤后室温避光保存。