用EST-SSR标记评价21份黄瓜种质的遗传多样性

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用SRAP标记分析黄瓜品种遗传多样性及鉴定品种

通讯作者，ｈｎｘａｙｎ＠ｎｒｖｔｍｚｅｇｉｉｇｅｃ．ｏｏ
摘要
利用相关序列扩增多态性（Ｓ
）分子标记技术对３不同类型的黄瓜品种进行了指纹图谱遗传５份
多态性分析，３从８对引物组合中筛选出３个多态性高的引物组合，３对引物扩增得到的图谱可将３黄此５份
研究报告
ＲｅｅｒｈＲｅｒｓａｃｐｏｔ
用ＳＡＲＰ标记分析黄瓜品种遗传多样性及鉴定品种
李丽－郑晓鹰柳李旺
１京市农林科学院蔬菜研究中心，京，００７２南京农业大学园艺学院，京，１０５北北１０９；南２０９
瓜品种完全区分开来。依据ＳＡＲＰ指纹图谱聚类分析结果确定了品种之间的遗传距离以及鉴别的难易程度。用ＳＡＲＰ分子标记技术得到了两个黄瓜品种杂交组合Ｆ与亲本的指纹图谱中的鉴别条带，以用于黄瓜杂。可交种的纯度检测。
关键词黄瓜，指纹图谱，种鉴定，ＲＰ品ＳＡ
ＡｎｌｓｓｏｎｔｖｒｉｎｄｎｉｃｔｎｏｃｍｂｒＶａｉｔｓｂａｙｉｆＧｅｅｉＤｉｅｓｙａｄＩｅｔｆａｉｆＣｕｕｃｔｉｏｅｒｅｉｙｅ
ＫｅｗｏｄＣｃｂｒＣｃｍｓｓｔｕ）ＦｎｅｒｔＩｅｔｃｔｎｏｖｒｔｓＳＡＰｙｒｓｕｕｅ（ｕｕｉａｉｓ，ｉｇｒｉ，ｄｎｉａｉｆａｉｉ，Ｒｍｖｐｎｉｆｏｅｅ

用SRAP标记分析黄瓜品种遗传多样性及鉴定品种

分子植物育种，２００６年，第４卷，第５期，第７０２－７０８页ＭｏｌｅｃｕｌａｒＰｌａｎｔＢｒｅｅｄｉｎｇ，２００６，Ｖｏｌ．４，Ｎｏ．５，７０２－７０８研究报告ＲｅｓｅａｒｃｈＲｅｐｏｒｔ用ＳＲＡＰ标记分析黄瓜品种遗传多样性及鉴定品种李丽１郑晓鹰１＊柳李旺２１北京市农林科学院蔬菜研究中心，北京，１０００９７；２南京农业大学园艺学院，南京，２１００９５＊通讯作者，ｚｈｅｎｇｘｉａｏｙｉｎｇ＠ｎｅｒｃｖ．ｃｏｍ摘要利用相关序列扩增多态性（ＳＲＡＰ）分子标记技术对３５份不同类型的黄瓜品种进行了指纹图谱遗传多态性分析，从３８对引物组合中筛选出３个多态性高的引物组合，此３对引物扩增得到的图谱可将３５份黄瓜品种完全区分开来。

依据ＳＲＡＰ指纹图谱聚类分析结果确定了品种之间的遗传距离以及鉴别的难易程度。

用ＳＲＡＰ分子标记技术得到了两个黄瓜品种杂交组合Ｆ１与亲本的指纹图谱中的鉴别条带，可以用于黄瓜杂交种的纯度检测。

关键词黄瓜，指纹图谱，品种鉴定，ＳＲＡＰＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＧｅｎｅｔｉｃＤｉｖｅｒｓｉｔｙａｎｄＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆＣｕｃｕｍｂｅｒＶａｒｉｅｔｉｅｓｂｙＳＲＡＰＬｉＬｉ１ＺｈｅｎｇＸｉａｏｙｉｎｇ１＊ＬｉｕＬｉｗａｎｇ２１ＢｅｉｊｉｎｇＶｅｇｅｔａｂｌｅＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒ，ＢｅｉｊｉｎｇＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｙＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ，１０００９７；２ＮａｎｊｉｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＨｏｒｔｉ－ｃｕｌｔｕｒａｌＩｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｎａｎｊｉｎｇ，２１００９５＊Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ，ｚｈｅｎｇｘｉａｏｙｉｎｇ＠ｎｅｒｃｖ．ｃｏｍＡｂｓｔｒａｃｔＧｅｎｅｔｉｃｆｉｎｇｅｒｐｒｉｎｔａｎａｌｙｓｉｓｆｏｒ３５ｃｕｃｕｍｂｅｒｖａｒｉｅｔｉｅｓｆｒｏｍａｌｌｏｖｅｒｃｏｕｎｔｒｙｓｉｄｅｒｅｖｅａｌｅｄｂｙＳＲＡＰｍａｒｋｅｒｓｗａｓａｍｐｌｉｆｉｅｄｆｏｒｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｒｅｇｉｓｔｅｒｏｆｖａｒｉｅｔｉｅｓ．Ｉｎｔｈｉｓｓｔｕｄｙ３８ｐｒｉｍｅｒｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｓｗｅｒｅｓｃｒｅｅｎｅｄｆｏｒ３５ｖａｒｉｅｔｉｅｓ．Ｔｈｒｅｅｐｒｉｍｅｒｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｓｇｅｎｅｒａｔｅｄｈｉｇｈｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃｆｒａｇｍｅｎｔｓ，ｗｈｉｃｈｃａｎｄｉｓｔｉｎｇｕｉｓｈａｌｌｏｆ３５ｃｕｃｕｍｂｅｒｃｕｌｔｉｖａｒｓ．Ｔｈｅｓｔｕｄｙｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｅｄｔｈａｔｍｏｌｅｃｕｌａｒｍａｒｋｅｒｓｗｉｌｌｐｒｏｖｉｄｅｓｍｏｒｅｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙｅｖｉ－ｄｅｎｃｅｆｏｒｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｖａｒｉｅｔｉｅｓｒｅａｌｉｔｙ．ＫｅｙｗｏｒｄｓＣｕｃｕｍｂｅｒ（Ｃｕｃｕｍｉｓｓａｔｉｖｕｓ），Ｆｉｎｇｅｒｐｒｉｎｔ，Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｖａｒｉｅｔｉｅｓ，ＳＲＡＰ黄瓜是营养价值高的蔬菜之一，在世界范围内广泛种植。

EST-SSR标记在黄瓜F_1种子纯度鉴定中的应用

叶片基因组ＤＡ。称取黄瓜叶片于预冷的研钵中，Ｎ加入
液氮研磨成粉末，移至一２冷的１５ｍＩ离心管转ＯＣ预．
态性，并得出ｌ个黄瓜品种问遗传多样性值在０１～１．８
第一作者简介：（９２）女，读硕士，从事黄瓜杂交种子卢锐１８一，在现
为种子的纯度鉴定提供了一种更为快速、效的方高法［，中ＳＲ标记技术是最为简便、其Ｓ可靠的鉴定方法
之一。
瓜ＥＴ或ｅＮＡ序列，过ＳＲＴ（ｔ：／ｗ．ＳＤ通ＳＩｈｔ／ｗｗｐｇａｍｅｏｇｇａｅｅｓａｈｓｓｒＯ）线搜索具有ｒｍ．ｒ／ｒｎｎ／ｅｒｅｓｔ１在ｃ／ＯＳＲ序列的ＥＴ序列。根据侧翼保守序列，ＳＳ应用引物设
引物设计原则为：ＳＥＴ序列长度大于１０ｂ；０ｐ引物长度为１￣２ｐＧ８５ｂ；Ｃ含量４０Ａ～６；Ｃｏｂ。同时，免错配、避引物二聚体或发夹结
构的形成ｕ。共设计１２对ＥＴＳＲ引物，０Ｓ－Ｓ引物由上
计软件Ｐｉｅｒｍｅ５０（ｉ６设计合成引物］ｒｒｅｉ．，）ｇｍＰｒｌｏ。
ＳＲ标记由于具有数量丰富、Ｓ多态性高、遗传上呈共显性、实验操作简单、结果稳定可靠、引物序列易交流等优点，已成为杂交种子纯度鉴定的一种理想分子标记。ＥＴＳＲ标记是基于表达序列标签数据信息，Ｓ－Ｓ并结合ＳＲ标记特点开发出的一种新型分子标记。具有Ｓ

青海高原以礼草属主要物种的多样性评价

青海高原以礼草属主要物种的多样性评价本实验以青海高原地区的以礼草属的3个主要物种21个居群为研究材料,从穗部性状、核型分析及基于EST-SSR分子标记分三个水平研究了以礼草属植物种内的多样性及相似性,种间差异性、亲缘关系及其进化趋势,研究结果如下:1、通过对青海高原以礼草属三个主要物种21个居群的7个穗部性状进行研究,结果表明:梭罗草组群的平均变异系数为14.10%,7个指标中穗长的变异系数最大,2014631028梭罗草的变异系数最大;糙毛以礼草组群平均变异系数为18.43%,7个指标中稃毛长变异系数最大,2014631008糙毛以礼草变异系数最大。

大颖草组群的平均变异系数为16.29%,7个指标中穗长变异系数最大,2012631113居群变异系数最大。

通过主成分分析提取出了4个主成分:小穗特征因子、穗部大小特征因子及两个穗部密度特征因子,其中颖长、稃毛长、穗长、稃长是引起是引起以礼草属植物形态性状变异的主要性状。

通过聚类分析在欧氏平方距离为15处将21个以礼草属居群分为3类,在欧氏平方距离为20处分为2类。

其中克图尼哈糙毛以礼草与其他糙毛以礼草差异较大。

2、核型分析发现青海高原以礼草属三个主要物种间的核型差异较大,同物种居群间的核型也存在较高的差异。

梭罗草组群核型除了2012631155梭罗草为2C型其余3个都为2B型;糙毛以礼草组群核型都为2B型;大颖草组群核型除了2012631132大颖草为2B型其余的都为2C型,12个居群都有随体的存在。

以礼草属种内表现出了一定的多样性,并得出3个物种的进化趋势。

3、利用EST-SSR分子标记技术对青海高原以礼草属3个物种的21份材料进行遗传相关分析。

在遗传多样性分析中发现97对引物中共有50对引物扩增出103条条带,各个引物的扩增条带数从1到5,每个位点的平均等位变异数2.06。

经过Popgene pc软件分析,梭罗草的遗传多样性水平最高[PP=62.14%,h=0.2345],糙毛以礼草次之[PP=58.25%,h=0.2211],大颖草最低[PP=44.66%,h=0.1687]。

黄瓜抗霜霉病相关EST—SSR的信息分析

（Ｃ８３）１０Ｃ４；东北农大学自然科学基金，作者简介：乇丽娟（９７）１６一，女，副研究员，硕士生导师，研究方向为植物胚胎发育与分子生物。Ｅｍｉｌｗｎ＠６．ｏ－ａｊａｇ１３ｃｒｈ＿ｎ通讯作者：秦智伟，教授，博士生导师，研究方向为蔬菜遗传育种。－ａ：ｚ３３２．ｏＥｍｉｑｗ０＠１６ｃｎｌ
ｃＤＮＡｉｒｒｉｈｗｅｒｏｎｔｃｅｄｗｉｕｕｂｒｌａｅｎｃｄｂｅｄｐｒｎｓｏａｃｂｎ￣．ＡｌａｙｗｈｃｂｅｃｓｒｔｔｃｃｍｅｅｖｓｉｄｕｅｙＰｓｕｏｅｏｏｐｒｕｅｓｕｈｔｔｌｆ２５７ｕｉｅｅｅｕｎｅｏａ０ｎｇｎｓｓｑｅｃｓｗｅｒｂａｎｄａｅｒｃｓｉｇａｄｓｉｉｇＴｈｉｔｉｕｉｒｑｅｎｙｏｅｏｔｉｅｆｒｐｏｅｓｎｎｐｌｎ．ｅｄｓｒｔｔｃｂｏｎｆｅｕｃ
ｏ【０ＧｏＹＳＨｕｎ，ｉ，ｔａ．ｏｔｌｔｒｄｘｎｇｎ２】ｕ，ａｇＣＪＸｅＹｅ１Ａｔｍａｇｕａｅｏｉｅｅ
ＳＧＸＩｒｇｌｔｓｐａｔｒｓｏｓｓｔｘｄｔｅｒｕｈｎａｔＩＲｅｕａｅｌｎｅｐｎｅｏｏｉａｉ，ｄｏｇｔａｄｓｌｖ
Ｋｅｏｒ：ｕｕｅ；ｏｙｍｉｅＥＴＳＲ；ｅｅｔｔｙｗｄｓｃｃｍｂｒｄｗｎｌｗ；Ｓ－Ｓｒｐａｉｄｍｏｆ

利用SSR标记分析黄瓜种质资源的遗传多样性

利用SSR标记分析黄瓜种质资源的遗传多样性杨瑞环;陈德富;闵微;陈喜文【期刊名称】《南开大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2012(045)002【摘要】利用SSR标记对国内外102份黄瓜种质资源进行了遗传多样性分析.从48个SSR标记中筛选出17个多态性标记,共检测到42个等位基因,其中10个为稀有等位基因,各标记PIC值介于0.019～0.384之间.在4个不同生态类群中,华南型含等位基因数最多,日本东南亚型次之,其它类型均最低;多态性位点比例以华南型和日本东南亚型最高,华北型最低;华南型遗传多样性指数较其它类型均高.聚类分析表明,102份种质资源的相似性系数在0.42～1.00之间.在相似性系数0.65处,102份种质资源被分成3大类,基本上按刺瘤特征被区分.主成分分析表明,华北型和欧洲型分布比较集中,其它生态型分布则较为宽广;密刺型和无刺型各自分布在一定区域,而刺瘤中等与稀少的中间类型处于2者之间.%Simple sequence repeat markers were utilized to characterize the genetic diversity of 102 cucumber accessions originating from China and other countries. A total of 48 SSR markers were analyzed and 17 of them were polymorphic. The 17 SSR markers revealed a total of 42 alleles, 10 of them were rare alleles. The Polymorphic information content (PIC) values of the markers varied from 0. 019 to 0. 384. Among four different ecological populations, the total number of alleles was highest in Southern China population, while medium in South-east Asia population and lowest in other three populations. The proportion of polymorphic loci is highest in Southern China populationand South-east Asia population, while lowest in Northern China population. The genetic diversity index value is highest in Southern China population. The similarity coefficients in the 102 cucumber accessions range from 0. 42 to 1. 00. Three main groups, mainly according to the density of fruit wart or spine, can be distinguished by truncating the dendrogram at GS valueof 0. 65. PCA analysis showed that the Northern China population and European greenhouse population concentrated whereas other populations distributed dispersedly. Dense and none fruit wart or spine cucumbers concentrated in a respective region and was separated from other types, whereas the intermedium and sparse fruit wart or spine cucumber distributed between them.【总页数】5页(P17-21)【作者】杨瑞环;陈德富;闵微;陈喜文【作者单位】天津科润黄瓜研究所,天津300192;南开大学生命科学学院,天津300071;南开大学生命科学学院,天津300071;南开大学生命科学学院,天津300071;南开大学生命科学学院,天津300071【正文语种】中文【中图分类】Q37【相关文献】1.利用SSR标记分析糯高粱种质资源的遗传多样性 [J], 倪先林;赵甘霖;刘天朋;龙文靖;胡炯凌;丁国祥2.利用ISSR分子标记分析辣椒种质资源遗传多样性 [J], 刘君;李东;曾林;邓刚;李纱;钟小蓉3.利用SSR标记分析高含油量甘蓝型油菜种质资源遗传多样性 [J], 薛艳; 李英; 谌国鹏; 张星; 陈乔; 何忠军; 王风敏; 李虎4.利用SSR和ISSR分子标记分析崇明白扁豆种质资源的遗传多样性 [J], 沈千; 陈岳; 顾立君; 潘俊松5.利用RAPD、ISSR标记分析白芨种质资源遗传多样性的研究 [J], 陈锦;杨侃侃;王志伟;朱菲莹;秦忠良;贺爱国;梁志怀因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

黄瓜SSR遗传图谱的构建及黄瓜重要农艺性状的QTL定位

黄瓜SSR遗传图谱的构建及黄瓜重要农艺性状的QTL定位摘要黄瓜(Cucumis sativus L.)是我国的重要蔬菜作物，培育高产、优质、多抗的新品种是黄瓜育种者的共同目标。

分子标记辅助选择(MAS)育种技术的应用，极大地加速了育种进程。

而高效的MAS 技术依赖于饱和的遗传图谱和农艺性状的准确定位，因此，黄瓜饱和遗传图谱的构建和性状准确的QTL定位越来越被重视。

本研究以黄瓜野生变种PI 183967(Cucumis sativus L. hardwickii)和新泰密刺选系931为亲本，建立了包含179个单株的F2分离群体，利用SSR标记技术，构建了一张较饱和的黄瓜SSR遗传图谱，并结合对F2群体及F2:3家系主要农艺性状的调查结果，对黄瓜瓜长、瓜瘤大小、瓜刺密度、瓜纹密度、第一分枝节位、第一雌花节位进行了QTL定位分析。

具体结果如下：(1)利用来源于黄瓜全基因组序列的2112对SSR引物，对亲本进行筛选，得到996对有多态性的引物，多态率为47.2 %，结合本所已经发表的黄瓜SSR高密度遗传图谱，对996对多态性引物进行有目的性地选择，挑选出319对SSR引物，以包含179个单株的F2群体为作图群体，构建了野生黄瓜SSR遗传图谱，该图谱包含234个SSR标记、7个连锁群，图谱覆盖基因组长度 829.7 cM，平均图距3.5 cM，标记分布均匀，不存在较大的间隙。

与黄瓜高密度遗传图谱进行比较后，确定了7个连锁群与黄瓜7条染色体的对应关系。

(2)分别对F2群体及F2:3家系的瓜长、瓜瘤大小、瓜刺密度、瓜纹密度、第一分枝节位、第一雌花节位进行了调查，利用本研究构建的SSR遗传图谱，对这些性状进行了QTL定位研究。

共检测到19个QTLs(F2代9个，F2:3家系10个)，其中，瓜长检测到的QTLs最多，为5个；瓜刺密度fsd6.2的贡献率最大，为32.5%；每个性状都至少能检测到1个贡献率大于10%的主效QTL 位点，共检测到主效QTL位点12个；存在不同性状QTL聚集的现象，如fmd1.1和fws1.1均定位在了1号染色体的SSR16671(65.2cM)～SSR15739(74.5cM)之间、第一分枝节位QTL flbn1.2和瓜纹密度QTL fmd1.2均定位在1号染色体的SSR12719(125cM)～ SSR04986(134.8cM)之间；存在高效稳定的QTL位点：fsd6.1和fsd6.2，结合与其紧密连锁的SSR标记(SSR15802和SSR17133)，可将其用于黄瓜的分子辅助育种。

应用SSR_分子标记分析烟台地区黄瓜种质资源遗传多样性

中国瓜菜收稿日期：2023-04-23；修回日期：2023-08-15基金项目：国家重点研发计划项目子课题（2018YFD1000805-03）；中国农业大学烟台研究院政策引导性项目（Z202206）；中国农业大学本科生URP 项目（U2022067）作者简介：满孝源，男，在读本科生，研究方向为设施农业科学与工程。

E-mail ：*****************通信作者：陈晓峰，男，副教授，研究方向为作物遗传育种。

E-mail ：*****************黄瓜（Cucumis sativus L.，2n =14）是葫芦科黄瓜属一年生蔓生植物，是一种世界性蔬菜，又名王瓜、胡瓜、青瓜，在果菜类蔬菜中具有很高的地位[1]。

我国是黄瓜生产大国，其栽培面积占世界黄瓜栽培总面积的一半以上，产量和规模均居世界第一位。

山东黄瓜地方品种由于栽培历史较久和引入途径不同，加之山东省不同地区气候差异较大，在长期自然和人工定向选择下，形成类型多、品种资源丰富的特点[2-3]。

以白黄瓜和地黄瓜为代表的烟台地方黄瓜，因其具有品质优良、营养丰富、口感鲜脆等特点，市场地位不断提高[4-5]。

随着市场需求扩大，黄瓜栽培及其选育品种逐渐增多，原优良品种在选育过程中纯度逐渐降低，在生产中重名现象普遍，烟台地区种质资源研究相对落后，导致优质种质流失严重[6]。

21世纪以来，分子生物学得到了突飞猛进的发展，越来越多的分子标记技术相继出现，并逐渐广泛应用于作物遗传育种、植物亲缘关系鉴别、基因库构建等各个领域，例如RFLP 、ISSR 、RAPD 、AFLP 、SSR 等[7-10]。

SSR （Simple Sequence Repeat ）称应用SSR 分子标记分析烟台地区黄瓜种质资源遗传多样性满孝源，王湘懿，张凯歌，胡凌，陈晓峰（中国农业大学烟台研究院山东烟台264670）摘要：以22份黄瓜为材料，利用SSR 分子标记技术进行遗传分析，构建22份黄瓜种质的指纹图谱和分子身份证。

EST-SSR标记与人工接种鉴定黄瓜种质褐斑病抗性

２结果与分析
２１标记用于黄瓜育种材料的抗性检测．
对２１黄瓜高代自交系，利用引物组合ＣＦ３３份ＳＲ３进行
褐斑病抗性检测，结果见图１、表１。可以检测出１９０份抗病
记，在此研究利用该标记对部分育种材料进行抗病性批量检测，并与部分材料的人工接种抗病性鉴定结果相比较，检验标记的符合度。该研究主要目的：（）１调查我们现有黄瓜种质材料对褐斑病的抗性，（）中筛选抗源，获得一批２从
连锁的ＥＴＳＲ记ＩＳ－Ｓ标９１。
３结论与讨论
利用抗病品种是防御病害的一条最安全、经济、有效的途径，但植物抗病育种依赖于抗病基因的鉴定和利用。黄瓜褐斑病是为害露地和保护地黄瓜生产的重要病害之一，在抗褐斑病育种工作中，抗病基因的传统鉴定、转育方法速度慢、效率低，易受环境影响。抗性相关基因ＥＴＳＲＳ—Ｓ
种抗性鉴定结果相比较，二者的符合率达９．５５ｊ％。在实际应用中可通过标记初步进行大量材料的抗性检测，在此基础上根据需要有针对性地做人工接种抗病性鉴定，可以大大提高黄瓜种质资源抗性筛选的效率。抗病资源的获得可为抗褐斑病黄瓜新品种的选育奠定基础。
关键词：黄瓜种质；褐斑病；抗性；ＥＴｓＲＳ— ｓ
黄瓜褐斑病【ｏｊｅｇｒａｓｃｌ（ｅｋ．ｕｔ）ＣｒｒｓｏａｃｓｉｏａＢｒ＆Ｃｒ．ｎｌｉ
Ｗｅ．ｉ】，又称靶斑病，是一种世界性分布的病害Ⅲ 目前已。

利用SSR标记技术构建黄瓜遗传连锁图谱

自１８年Ｆｎｕａｉｌ构建了第一张黄瓜连锁９７ａｏｒｋｓ等１图谱以来，今已有多张黄瓜的遗传连锁图谱［。其至２。中，子标记技术应用于黄瓜遗传图谱的构建始于１９分９４年Ｋｎａｄｅｎｒｃ建的遗传图谱。ＳＲ（ｉｌＳｑｅｃ构ＳＳｍｐｅｕｎｅｅＲｐａｓ标记技术由于共显性遗传、点特异性、多态ｅｅｔ）位高
１０ｔＴｑＥ５Ｕ／ｚ）０１Ｌ。．Ｌａ（ｔＬ；Ｌ．
图谱构建研究，旨在为黄瓜抗ＣＭＶ的ＱＩ定位鉴定Ｔ
基础。
ＳＡＣＲ反应程序： ’ ５ｍｉ，个循环；４ｌｍｎ９Ｃｎ１４９ ℃ ｉ，
Ｘ１ｒｎ７ ℃ ２ｍｉ，５循环；２７ｍｉ（为不同 ℃ ｉ，２ｎ３个ａ７℃ ｎＸ
在记录数据时，因型的判断以带型为基础。带型基
瓜材料ＨＬ４１Ｚ０－为母本进行杂交获得Ｆ代，然后再将
Ｆ进行单株自交获得Ｆ群体，Ｆ群体由１０个单株２该２９
构成。１２黄瓜基因组ＩＮＡ提取．）
ＳＡ反应体系（Ｏ／包括：Ｎ５ｇ／）０５ＣＲ１，）ＩＤＡ（０ｎ／Ｌ．￣
ｆ上游引物（０ｇｆ．５ｔ下游引物（０ｇＩ；１０ｎ／Ｉ）０１ｚＬ；１０ｎ／
Ｌ）０１Ｉ；ＮＴＰ（０ｍＭ）０２Ｌ；．ｆｅ（０Ｘ）

黄瓜果实EST-SSR标记的开发

黄瓜果实EST-SSR标记的开发
关媛;李效尊;潘俊松;何欢乐;吴爱忠;蔡润
【期刊名称】《分子植物育种》
【年(卷),期】2007(5)5
【摘要】黄瓜EST序列数量的迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源。

本研究从GeneBank上公布的黄瓜EST序列中检索到902条来自果实的序列,利用SSRIT软件分析得到63条包含SSR的EST序列,设计了37对EST-SSR引物,结果显示有9对引物在7份黄瓜自交系上扩增有多态,占所设计引物总数的24.3%,平均等位变异数为2.1个,7份自交系间C8和S06遗传相似系数最小为0.22。

有27对引物在3份甜瓜上有扩增产物,其中1对引物扩增有多态。

这为今后黄瓜基因组研究奠定了一定基础。

【总页数】4页(P725-728)
【关键词】黄瓜;表达序列标签;EST-SSR标记
【作者】关媛;李效尊;潘俊松;何欢乐;吴爱忠;蔡润
【作者单位】上海交通大学农业与生物学院
【正文语种】中文
【中图分类】S513
【相关文献】
1.用EST-SSR标记评价21份黄瓜种质的遗传多样性 [J], 刘俊青;李佩芳;胡建斌;李建吾;陶翠
2.基于荧光标记的紫娟茶树转录组EST-SSR标记开发 [J], 陈春林;田易萍;陈林波;邓少春;徐丕忠;李朝云
3.黄瓜基因组EST-SSRs的分布规律及EST-SSR标记开发 [J], 胡建斌;李建吾
4.EST-SSR标记在黄瓜F1种子纯度鉴定中的应用 [J], 卢锐;叶永亮;冯国军
5.EST-SSR标记与人工接种鉴定黄瓜种质褐斑病抗性 [J], 付海朋;魏杰;李淑菊;杨瑞环;管炜;王惠哲
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黄瓜种质资源果实性状遗传多样性分析

黄瓜种质资源果实性状遗传多样性分析作者：王荣董邵云刘小萍官健涛苗晗李森张圣平来源：《中国瓜菜》2024年第07期摘要：為深入了解黄瓜果实性状的遗传多样性，优化育种策略，对221份种质资源的13个果实农艺性状进行遗传多样性分析、相关性分析、主成分分析、聚类分析。

结果表明，221份黄瓜种质资源的遗传多样性指数平均为1.392，平均变异系数为30.78%。

相关性分析表明，除瓜瘤大小外，其他12个性状均有与其关联性较高的性状；主成分分析表明，前4个主成分（PC1～PC4）的累积贡献率为68.82%，包含了黄瓜果实性状的大部分信息。

通过表型性状及分子标记分别对种质资源进行聚类分析，结果表明，在欧式距离为0.003时，将221份种质资源的表型性状分为5类，每一类分别包含90、65、9、38、19份种质资源；在欧式距离为1.400时，将221份种质资源采用分子标记分为5类，分别包含了35、70、45、54、17份种质资源。

表型数据和分子标记聚类结果对比，发现两者具有一定的吻合度，但仍存在差异。

研究结果为优良育种亲本的选配奠定了一定的基础，也为后续工作提供了参考。

关键词：黄瓜；遗传多样性；表型性状；分子标记中图分类号：S642.2 文献标志码：A 文章编号：1673-2871（2024）07-020-09Genetic diversity analysis of fruit-related traits in cucumber germplasm resourceWANG Rong1， 2， DONG Shaoyun2， LIU Xiaoping2， GUAN Jiantao2， MIAO Han2，LI Sen1， ZHANG Shengping2（1. College of Horticulture， Shanxi Agricultural University， Taigu 030801， Shanxi，China; 2. The State Key Laboratory of Vegetable Biobreeding/Institute of Vegetables and Flowers，Chinese Academy of Agricultural Sciences， Beijing 100081， China）Abstract： To understand the genetic diversity of cucumber fruit traits and optimize breeding strategies， genetic diversity analysis， correlation analysis， principal component analysis and cluster analysis were performed for 13 fruit agronomic traits of 221 germplasm resources. The results showed that the average genetic diversity index of 221 cucumber germplasm resources was 1.392，with the average coefficient of variation of 30.78%. Correlation analysis showed that except the size of fruit tumor， the other 12 traits had high correlation. Principal component analysis showed that the cumulative contribution rate of the four principal components （PC1-PC4） was 68.82%， which contained most of the information of cucumber fruit traits. Cluster analysis was conducted on germplasm resources using phenotypic traits and molecular markers. The results showed that the phenotypic traits of 221 germplasm resources were divided into 5 categories when the Euclidean distance was 0.003， and each category contained 90， 65， 9， 38 and 19 germplasm resources，respectively. When the Euclidean distance was 1.400， the molecular markers of 221 germplasm resources were divided into 5 categories， including 35， 70， 45， 54 and 17 germplasm resources， respectively. The comparison between phenotype data and molecular marker clustering results showed that there was a certain degree of agreement between them. The results have laid a foundation for the selection of excellent breeding parents and provided a reference for the subsequent work.Key words： Cucumber; Genetic diversity; Phenotypic characters; Molecular marker黄瓜（Cucumis sativus L.）是重要的葫芦科蔬菜作物，在全球范围内广泛种植。

EST-SSRs检测油菜(Brassica napus)亲本遗传多样性

农业生物技术学报Journal of Agricultural Biotechnology 2007,15(4):661~667 · · 研究论文ESTSSRs 检测油菜( )亲本遗传多样性 * 李小白, 崔海瑞, 张明龙 **（浙江大学原子核农业科学研究所, 杭州 310029）中开发的一种新型 SSR 标记， ESTSSRs 摘要：是从 ESTs 序列（表达序列标签）蕴涵着丰富的表达基因信息。

将其用于油菜遗传研究可直接反映相关基因在不同油菜品种间的表达差异。

采用 21 对油菜（ESTSSRs 标记检测了 42 个）的遗传多样性。

油菜 ESTSSRs 引物均可获得清晰的扩增产物，共检测到 85 个等位位点，其中有 49 个等位变异，油菜品种（系）42 份材料遗传距离范围 0.0087~0.3190，在遗传距离占总检测位点 57.65%。

应用 NTSYS 软件的聚类方法分析，结果表明，（系）的地源差异。

0.1508 下，可把材料分为 5 组，基本反映了品种ESTSSR；关键词：油菜；遗传多样性 S188 A 10061304(2007)04066107 中图分类号：文献标识码：文章编号： Detecting the Genetic Diversity of by ESTSSRs LI Xiaobai, CUI Hairui, ZHANG Minglong** ESTSSR marker is a new kind of SSR markers developed from ESTs (expressed sequence tags) which contained much information of expressed gene. Analyzing Fortytwo could reveal differences in expression of correlative gene among varieties. varieties were analysed by the 21 ESTSSR markers for the genetic diversity. All the primer sets produced discernible DNA fragments. Eightyfive allels were checked among the 42 varieties, of which 49 allels accounting for 57.65% showed polymorphic. The range of the 42 varieties' genetic distance was between 0.0087~0.3190 computed by NTSYS (software). On level of genetic distance 0.1508, the varieties were divided into 5 groups, which was approximately in accordance with their diversity of cultural area. ESTSSR； genetic diversity ；杂种优势利用是提高作物产量最有效的途径之一，研究者一般根据亲本的配合力大小 (LefortBuson , 1987；张向群 , 1987) 及通过地理., 1996；朱作峰等, 2001)、玉米 (Bernardo, 1992； Benchimol ., 2000；高兰锋等 , 2006)、小麦 (Liu ., 1998) 等 , 1999；王军卫等 , 2005)、大豆 (Zhu , 1995；远近来估计亲本间的遗传差别 (Ali Brandle and McVetty, 1990； Grant and Beversdorf, 1985) 或通过同功酶技术研究亲本间遗传距离与杂 Price 种优势的关系(Hunter and Kannenberg, 1971；地 , 1986)。

黄瓜线粒体基因组SSR标记开发及其在种子纯度鉴定中的应用[发明专利]

专利名称：黄瓜线粒体基因组SSR标记开发及其在种子纯度鉴定中的应用
专利类型：发明专利
发明人：陈劲枫,李海梅,沈佳,娄群峰,李季,钱春桃
申请号：CN201410727972.0
申请日：20141201
公开号：CN105886602A
公开日：
20160824
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明基于黄瓜线粒体父系遗传的特性，使用线粒体基因组SSR标记技术鉴定黄瓜杂交种纯度的一种方法，涉及黄瓜线粒体基因组SSR标记开发，用开发的黄瓜线粒体标记分别对不同生态型的黄瓜品种进行多态性筛选，以及利用多态性标记对黄瓜F种子进行纯度检测，属于生物技术育种领域。

本发明首次应用黄瓜线粒体基因组序列开发SSR标记来检测黄瓜杂种一代种子纯度，以期区分母本黄瓜植株上其他花粉来源的假杂交种和自交种，相对于核基因组SSR标记技术对品种鉴定方面的研究，其主要利用黄瓜线粒体父系遗传特性而多了一种新的检测方法，同时为追踪杂交过程中父系/母系线粒体基因组做技术准备。

该方法也可以应用于其他父系植物材料杂种一代种子的检测。

申请人：南京农业大学
地址：210095 江苏省南京市玄武区卫岗1号南京农业大学科技处
国籍：CN
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黄瓜无苦味种质资源的SSR标记鉴定

黄瓜无苦味种质资源的SSR标记鉴定张立杰;麻艳超;李康;东方阳;王建设【期刊名称】《华北农学报》【年(卷),期】2015(000)002【摘要】鉴定无苦味种质，选育无苦味品种是控制黄瓜苦味、改善品质的有效方法。

利用黄瓜营养器官苦味基因的标记 SSR02309和果实苦味基因的标记SSR10795，对78份种质资源进行苦味基因型分析，表明黄瓜种质间和种质内苦味基因的标记基因型存在遗传变异性。

明确了78份种质苦味基因的标记基因型。

初步鉴定出7份无苦味种质。

在田间逆境胁迫条件下，利用感官品尝方法对标记鉴定的7份无苦味种质的苦味性状进行了感官品尝鉴定，结果与标记鉴定的一致。

为无苦味黄瓜品种改良奠定了技术与种质基础。

【总页数】5页(P140-144)【作者】张立杰;麻艳超;李康;东方阳;王建设【作者单位】宁夏大学农学院，宁夏银川 750021;北京市农林科学院蔬菜研究中心，农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室，北京 100097; 河北科技师范学院生命科技学院，河北秦皇岛 066004;北京市农林科学院蔬菜研究中心，农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室，北京 100097;河北科技师范学院生命科技学院，河北秦皇岛 066004;北京市农林科学院蔬菜研究中心，农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室，北京 100097【正文语种】中文【中图分类】S642.2【相关文献】1.利用SSR标记分析黄瓜种质资源的遗传多样性 [J], 杨瑞环;陈德富;闵微;陈喜文2.SSR标记和苗期人工接种鉴定黄瓜抗黑星病种质资源 [J], 王惠哲;邓强;张有为;李淑菊;杨瑞环;曹明明3.SSR标记在植物种质资源鉴定的应用进展 [J], 卓蕾;向成丽;肖杰;叶媛丽4.黄瓜无苦味基因bi的分子标记研究 [J], 池秀蓉;顾兴芳;张圣平;王晓武;王烨5.基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源 [J], 叶新如;刘建汀;李永平;朱海生;温庆放因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

黄瓜单性结实和种质资源遗传多样性的ISSR分析的开题报告

黄瓜单性结实和种质资源遗传多样性的ISSR分析的开题报告题目：黄瓜单性结实和种质资源遗传多样性的ISSR分析研究背景及意义：黄瓜是一种重要的绿色蔬菜，其果实味美、营养丰富，深受人们的喜爱。

黄瓜的单性结实是其最为重要的遗传特征之一，而黄瓜中单性结实和传统性的结实之间的遗传机制尚不清楚，这直接影响到黄瓜产量和品质的提高。

同时，黄瓜作为一种广泛栽培的作物，其种质资源具有丰富的遗传多样性，对其进行遗传多样性研究，不仅可以为黄瓜的育种提供理论依据，而且有助于保护和利用黄瓜的遗传资源。

方法及步骤：选取不同表型的黄瓜品种和杂交种作为研究材料，采用ISSR分子标记技术，通过PCR扩增和电泳分析，检测其遗传多样性和单性结实与遗传多样性之间的关系。

具体步骤如下：1. 提取黄瓜基因组DNA。

采用CTAB法或商用基因组DNA提取试剂盒对黄瓜的叶片等组织进行基因组DNA的提取，纯化后得到基因组DNA。

2. ISSR-PCR扩增。

根据ISSR引物序列设计ISSR引物，进行PCR扩增。

PCR反应条件为：50~100 ng基因组DNA，1.5 mM MgCl2、0.2 mM dNTP、0.4 μM引物、1 U Taq DNA聚合酶，总体积为25 μl。

PCR扩增反应程序为：94℃预变性5 min，94℃变性1 min，某一温度退火1 min，72℃延伸1 min，步骤③重复35次，最后72℃延伸10 min。

3. 电泳分析。

将PCR扩增产物与DNA分子量标准通过琼脂糖凝胶电泳分离，并利用紫外光照射仪进行可视化检测，得到基因型数据。

预期结果与经济效益：通过ISSR分子标记技术检测黄瓜的遗传多样性和单性结实与遗传多样性之间的关系，可以获得黄瓜种质资源的遗传多样性信息，并探究单性结实与遗传多样性之间可能存在的关联性，为黄瓜的育种和保护与利用提供理论支持和实践参考。

同时，研究成果可以拓展并深化遗传学和分子生物学的理论，为相关领域提供新的研究思路和方法，具有较高的应用和经济效益。

利用SSR标记技术构建黄瓜遗传连锁图谱

利用SSR标记技术构建黄瓜遗传连锁图谱王军辉;崔兴华;张桂华;杜胜利;张显【期刊名称】《北方园艺》【年(卷),期】2010(000)022【摘要】利用抗黄瓜花叶病毒病(CMV)的黄瓜材料F-3和感CMV的黄瓜材料HZL04-1为亲本,构建包含190个F2后代的遗传作图群体.结果表明:采用SSR、EST-SSR和SCAR 3种分子标记技术对该群体进行遗传连锁分析,获得1个包含170个SSR 标记,6个EST-SSR标记,3个 SCAR标记的黄瓜遗传连锁图谱,该图谱涉及7个连锁群,总长度为862.886 cM,平均图距为4.79 cM.该图谱的构建为黄瓜抗CMV的QTL定位奠定了基础,并确定了连锁群与染色体之间的对应关系.【总页数】4页(P115-118)【作者】王军辉;崔兴华;张桂华;杜胜利;张显【作者单位】西北农林科技大学,园艺学院,陕西,杨凌,712100;天津科润黄瓜研究所,天津,300192;天津科润黄瓜研究所,天津,300192;天津科润黄瓜研究所,天津,300192;西北农林科技大学,园艺学院,陕西,杨凌,712100【正文语种】中文【中图分类】S642.2【相关文献】1.利用SSR和ISSR标记技术构建西瓜分子遗传图谱 [J], 易克;徐向利;卢向阳;许勇;肖浪涛;王永健;康国斌2.利用SRAP、SSR和AFLP标记构建甘蓝型油菜遗传连锁图谱 [J], 李媛媛;沈金雄;王同华;傅廷栋;马朝芝3.利用 SSR 分子标记构建四倍体杂交冰草的遗传连锁图谱 [J], 姜志艳;于肖夏;于卓;张志成;石悦;姜超4.利用SRAP和SSR标记构建红麻遗传连锁图谱 [J], 武耀龙;李德芳;李建军;黄思齐;李辉;唐慧娟;陈安国5.利用ISSR和SRAP分子标记技术构建红优甜瓜指纹图谱 [J], 张永平;范红伟;张文献;顾海峰;陈幼源因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。