遗传图构建原理 作业
2 遗传图绘制
ABO 血型基因座上具有编码不同半乳糖转移酶复等位基因
其特异性决定了血型的差别
2.2.1 基因标记
基因是非常有用的标记,但并不是理想的。原因: 1. 可用作标记的基因十分有限,许多性状都涉及 多基因。 2. 高等生物基因组中存在大量的基因间隔区,遗 传图中留下大片的无标记区段。 3. 只有部分基因其等位基因成员可以通过常规实 验予以区分,因而产生的遗传图是不完整的。
子标记。
2. 简单序列长度多态性(SSLP)
1) 可变排列的简单重复序列, 即重复次数不一, 在染色体的同一座位重复序列拷贝数不同; 2) SSLP的类型: 小卫星序列(minisatellite), 有时又称可变串联 重复(VNTR),重复单位较长。重复序列为16100个核苷酸,主要分布在染色体端粒及着丝粒 微卫星序列(micrisatellite), 或称简单串联重 复(STR),重复单位较短。重复序列只有2-6个 核苷酸,分布在整个基因组。
•SNP只涉及单个碱基的变异,这种变异可以由单个碱基的转 换(包括C与T互换,G与A互换),或颠换(包括C与A、G与 T、C与G、A与T互换)引起。
•点突变,位于密码子的摇摆位置,表现为沉默突变而被大 量保留下来。大多数不能被限制酶识别,必须采取测序或寡 聚核苷酸杂交检测 •在人类基因组中可达到300万个,平均每1000个碱基对就 有一个
2.2.2 DNA标记
基因之外的作图工具统称为DNA标记。与基 因标记一样,DNA标记必须有至少两个等位 基因才是有用的。有三种类型的DNA序列特 征可以满足这一要求:
1. 限制性片段长度多态性(restriction fragment
length polymorphisms, RFLP)
2. 简单序列长度多态性(simple sequence length
高中生物遗传图谱题做法及习题
遗传图谱题做法1.伴性遗传的概念2. 人类红绿色盲症〔伴X染色体隐性遗传病〕特点:⑴男性患者多于女性患者.⑵交叉遗传.即男性→女性→男性.⑶一般为隔代遗传.1.抗维生素D佝偻病〔伴X染色体显性遗传病〕特点:⑴女性患者多于男性患者.⑵代代相传.4、伴性遗传在生产实践中的应用遗传图谱题解法1.看是否为伴y遗传:只有男性患病,而且代代相传〔如:胡须〕2.判断显性和隐形:无中生有为隐性:父母没病,子女有病有种生无为显形:父母有病,子女没病二者都没有,说明既可能为显性,也可能为隐形.3.〔1〕若为显性:看"男患者的母亲和女儿是否一定患病.〞若是,则既可能为伴X显性遗传病,也可能为常染色体显性遗传病.若有一个不患病,都说明一定是常染色体显性遗传病.若找不到男患者,说明既可能为伴X显性遗传病,也可能为常染色体显性遗传病.〔2〕若为隐形:看"女患者的父亲和儿子是否一定患病.〞若是,则既可能为伴X隐性遗传病,也可能为常染色体隐性遗传病.若有一个不患病,都说明一定是常染色体隐性遗传病.若找不到女患者,说明既可能为伴X隐性遗传病,也可能为常染色体隐性遗传病.4.如果考虑细胞质遗传:只要有女性患病,而且女性子女全部患病.则极有可能为细胞质遗传〔母系遗传特点〕1.右图为甲种遗传病〔设显性基因为A,隐性基因为a〕和乙种遗传病〔设显性基因为H,隐性基因为h〕的遗传系谱图〔其中一种遗传病的基因位于x染色体上〕下列叙述正确的是〔〕A.就乙病来看,I2、II2的基因型一定相同B.II1、II2产生的基因型为aX H的生殖细胞含有完全相同的遗传物质C.II1、II2所生的子女中,两病兼发的几率为1/8D.两种病的相同特点都是来自于基因重组2.如果科学家通过转基因技术,成功改造了某女性血友病患者的造血干细胞,使其凝血功能全部恢复正常,那么预测该女性与正常男性结婚后,所生子女的表现型为〔〕A.儿子女儿全部正常B.儿子、女儿中各一半正常12 3 4 7 8 56 9 11 I II III 10 12 C .儿子全部患病女儿全部正常D .儿子全部正常女儿全部患病 3.右边遗传系谱图中,可能属于X 染色体上隐性基因控制的遗传病是4. 人的血友病属于伴性遗传,苯丙酮尿症属于常染色体遗传.一对表现型正常的夫妇生下一个既患血友病又患苯丙酮尿症的男孩.如果他们再生一个女孩,表现型正常的概率是 A .9/16 B . 3/4 C .3/16 D .1/45.雌雄异株的高等植物剪秋罗有宽叶、窄叶两种类型,宽叶〔B 〕对窄叶〔b 〕为显性,等位基因位于X 染色体上,其中窄叶基因<b>会使花粉致死,如果杂合体宽叶雌株同窄叶雄株杂交,其子代的性别与表现型分别是 A .子代全是雄株,其中1/2是宽叶,1/2是窄叶B .子代全是雌株,其中1/2是宽叶,1/2是窄叶C .子代雌雄各半,全为宽叶D .子代中宽叶雌株:宽叶雄株:窄叶雌株:窄叶雄株=1:1:1:16. 右图是一个某遗传病的家谱.3号与4号为异卵双生.他们的基因型相同的概率是A. 5/9B. 1/9C. 4/9D. 5/167.右图是人类某跗病的系谱图〔该病受一对基因控制〕则其最可能的遗传方式是 A .X 染色体显性遗传 B .常染色体显性遗传C .X 染色体隐性遗传D .常染色体隐性遗传 8.三倍体西瓜之所以无籽,是因为三倍体植株不能形成正常的卵细胞.不能形成正常卵细胞的原因是减数分裂时A .第一次分裂染色体联会紊乱B .第一次分裂同源染色体不能分离C .第二次分裂着丝点不分裂D .第二次分裂染色体不能平均分配 9.下列各项中,产生定向变异的是A .DNA 碱基对的增添、缺失或改变B .染色体结构或数目发生变异C .良好的水肥条件或基因工程D .不同物种间的杂交10.已知人的红绿色盲属X 染色体隐性遗传,先天性耳聋是常染色体隐性遗传〔D 对d 完全显性〕.下图中Ⅱ2 为色觉正常的耳聋患者,Ⅱ5为听觉正常的色盲患者.Ⅱ4〔不携带d 基因〕和Ⅱ3婚后生下一个 男孩,这个男孩患耳聋、色盲、既耳聋又色盲的可能 性分别是〔 〕A .0、1/4、0B .0、1/4、1/4C .0、1/8、0D .1/2、1/4、1/811、下面是一个特殊家庭的遗传病系谱图,分析正确的是〔 〕 A 、甲病很可能为伴x 隐性遗传,乙病很可能为伴X 显性遗传 B .甲、乙两病很可能均为伴X 显性遗传 C .甲、乙两病很可能均为常染色体显性遗传D .甲病很可能为伴Y 染色体遗传,乙病很可能为细胞质遗传12.右图是患甲病<基因A 、a>和乙病<基因B 、b>两种遗传病的系谱图<Ⅱl 与Ⅱ6不携带乙病基因>.对该家系描述错误的是 < >A .甲病为常染色体显性遗传病B .乙病由X 染色体隐性基因控制C .Ⅲ1与Ⅲ4结婚生出同时患两种病的孩子 的概率是1/16D .Ⅲ2与Ⅲ3结婚生出病孩的概率是1/813、自然状况下,鸡有时会发生性反转,如母鸡逐渐变为公鸡.已知鸡的性别由性染色体决定.如果性反转公鸡与正常母鸡交配,并产生后代,后代中母鸡与公鸡的比例是〔 〕1 2 3 4 A B C D4 2 3 6 15 A .1:0 B .1:1 C .2:1 D .3:114.人的X 染色体和Y 染色体大小、形态不完全相同,但存在着同源区<Ⅱ>和非同源区<I 、Ⅲ>,如右图所示.下列有关叙述中正确的是A 、I 片段上隐性基因控制的遗传病,男性患病率低于女性B .Ⅱ片段上基因控制的遗传病,男性患病率等于女性C .Ⅲ片段上基因控制的遗传病,男患者的比例高于女患者D .由于X 、Y 染色体互为非同源染色体,故人类基因组计划要分别测定 二、简答题.1.已知果蝇中,灰身与黑身为一对相对性状〔显性基因用B 表示,隐性基因用b 表示〕;直毛与分叉毛为一对相对性状〔显性基因用F 表示,隐性基因用f 表示〕,两只亲代果蝇杂交得到子代类型的比例如下表:灰身、直毛灰身、分叉毛黑身、直毛黑身、分叉毛雌蝇 3/4 0 1/4 0 雄蝇3/83/81/81/8请回答:〔1〕控制灰身与黑身的基因位于______;控制直毛与分叉毛的基因位于_________. 〔2〕亲代果蝇的表现型为__________、__________. 〔3〕亲代果蝇的基因型为__________、__________〔4〕子代表现型为灰身直毛的雌蝇中,纯合体与杂合体的比例为_________.〔5〕子代雄蝇中,灰身分叉毛的基因型为__________、__________;黑身直毛的基因型为________.2.在一个远离大陆且交通不便的海岛上,居民中有66%为甲种遗传病〔基因为A,a 〕致病基因携带者.岛上某家族系谱中,除患甲病外,还患有乙种遗传病〔基因为B,b 〕.两种病中有一种为血友病.请据图回答问题:〔1〕__________病为血友病,另一种遗传病的基因在___________染色体上,为________性遗传病. 〔2〕III —11在形成配子时,在相关的基因传递中,遵循的遗传规律是:________________. 〔3〕若III —11与该岛一个表现型正常的女子结婚,则其孩子中患甲病的概率为_________. 〔4〕II —6的基因型为_________,III —13的基因型为____________. 〔5〕我国婚姻法禁止近亲结婚,若III 一11和III 一13婚配,则其孩子中只患甲病的概率为__________,只患乙病的概率为______________;只患一种病的概率为_____________;同时患有两种病的概率为________________. 3..一对表现正常的夫妇,男方的父亲是白化病患者,女方的父母均正常,但女方的弟弟是白化病患者.这对夫妇生出白化病孩子的概率是.4.家兔的黑毛与褐毛是一对相对性状.现有4只家兔甲、乙、丙、丁,其中甲和乙为雌兔,丙和丁为雄兔.甲、乙、丙兔均为黑毛,丁兔为褐毛.已知甲和丁交配的后代全部为黑毛子兔;乙和丁交配的后代中有褐毛子兔.请回答: ⑴判断黑毛和褐毛的显隐性,并用符号B 和b 表示.⑵推断甲、乙、丁三只兔的基因型.5.某家庭多指〔显性致病基因P 控制〕遗传情况如右图. ⑴若1、2再生一个孩子,该孩子患多指的可能性是. ⑵图中3与一正常女性结婚,生正常男孩的可能性是;⑶图中6和一个与自己基因型相同的男性结婚,生患病女孩的可能性是.⑷图中4手指正常但患先天性聋哑〔隐形致病基因d 控制〕,这对夫妇所生子女中,只患多指的可能性是. 6.两个个体相杂交得到1/8的aabb 个体,则这两个个体的基因型为〔 〕 A. Aabb ×aabb B. Aabb ×Aabb C. Aabb ×AaBb D.AaBb ×AaBb7.基因型分别为aaBbCCDd 和AABbCCdd 的两种豌豆杂交,其子代中纯合子比例为.将基因型为AaBbCc 和AABbCc 的向日葵杂交,按照基因的自由组合定律,后代中基因型为AABbCC 的个体比例应为. 8.某研究性学习课题小组调查人群中双眼皮和单眼皮〔控制眼皮的基因用E 、e 表示〕的遗传情况,统计结果如下表. 组别 婚配方法 家 庭子女父母单眼皮双眼皮 单眼皮双眼皮⑴根据上表第组调查结果可判断该性状的显隐性. ⑵第二组抽样家庭中父亲的基因型可能是.⑶调查中发现第三组某家庭的单眼皮儿子同时患有白化病,那么这对肤色正常的夫妇再生一个肤色正常的双眼皮儿子的几率为.⑷第一组某家庭中母亲去美容院将单眼皮变成双眼皮后,再生一个双眼皮女儿的几率为.9.现有高秆抗锈病、双隐性矮秆易感锈病2个纯种小麦杂交,获得子二代4000株,其中应有矮秆抗锈病纯合子株. 10.下图是两个家族系谱图.甲家族中的遗传病与A 、a 基因有关;乙家族患色盲,相关基因B 、b.⑴图甲中的遗传病,其致病基因位于染色体上,是性遗传,判断理由是.其中Ⅱ-4基因型为. ⑵图甲中Ⅲ-7表现型正常,则Ⅲ-8表现型是否一定正常?,原因. ⑶图乙中Ⅰ-1的基因型是,Ⅰ-2的基因型是.⑷若图甲中的Ⅲ-8〔不患色盲但患有其家族的遗传病〕与图乙中的Ⅲ-5〔不携带甲家族的遗传病基因〕结婚,则他们所生子女中:男孩两病兼患的概率是;女孩不患甲病但患色盲的概率为;两病都不患的概率为.11.血友病是遗传性凝血因子生成障碍出血性疾病.其中以血友病甲〔缺乏凝血因子Ⅷ〕最为常见.致病基因位于X 染色体上.目前,治疗血友病主要是输入外源性凝血因子Ⅷ.由于不能根治,这种治疗将伴随一生.据以上材料与所学知识回答:〔1〕当人体内存在血友病甲基因时是否就得血友病?为什么?〔2〕若一对夫妻都不是血友病患者,但女方的哥哥是血友病患者,那么,如果这个女人怀了一男孩,要不要对胎儿作血友病甲的有关检查?为什么?如果怀的是一个女孩呢? .〔3〕某男孩为血友病患者,他的父亲、祖父是血友病患者,而他的母亲、外祖父母都不是患者.则男孩的血友病基因获得的途径是.〔4〕你认为根治血友病可采用的最佳方法是.12.下图是白化病〔a 〕和色盲〔b 〕的遗传系谱图,请据图回答下列问题.〔1〕Ⅰ2的基因型是;Ⅰ3的基因型是. 〔2〕Ⅱ5是纯合子的几率是.〔3〕若7和8再生一个小孩,两病都没有的几率是;两病都有的几率是.〔4〕若7和8再生一个男孩,两病都没有的几率是;两病都有的几率是. 13.小家鼠中,有一突变基因使尾巴弯曲.现有乙Ⅰ Ⅱ Ⅲ白化兼色盲男女 ⅡⅢ2 弯曲 正常 1/2弯曲,1/2正常 1/2弯曲,1/2正常3 正常 正常 全部正常 全部正常 4弯曲 弯曲全部弯曲1/2弯曲,1/2正常请分析回答〔以D 和d 表示有关基因〕〔1〕控制小家鼠尾巴形状的基因染色体上,突变基因是性基因.〔2〕请写出第2组亲代基因型:雌;雄.〔3〕让第1组后代中的一只雌鼠和一只雄鼠交配,生下两只小鼠,这两只小鼠的尾巴形状可能是〔无需考虑性别〕.〔4〕如果让第4组的子代中尾巴弯曲的雌雄鼠互交,所产生的后代中弯曲和正常的理论比例是.14.下图为某遗传病家谱图,设白化病的致病基因为a,色盲基因为b.请分析回答: 〔1〕III 10的色盲基因来自第I 代的号个体. 〔2〕写出下列个体可能的基因型:II 4II 6 〔3〕II 3与II 4生育色盲男孩的概率是.〔4〕若III 8和III 10结婚,生育子女中患白化病的概率是,就两种遗传病而言,正常后代的概率为. 15.女娄莱是一种雌雄异株的植物了其叶_形有披针叶和狭披针叶两种,受一对等位基因<B 、b>控制.某校生物研究小组用两个披针叶的亲本进行杂交实验,后代出现了一定数量的狭披针叶.请回答:<1>狭披针叶是___________性状. <2>该研究小组打算利用杂交买验以验证女娄菜叶形的遗传属于伴x 遗传还是常染色体遗传,那么他们应该选择何种表现型的杂交组合?父本_________,母本__________.预测可能的结果:①___________________________________________ ②____________________________________________<3>另一个研究小组试图研究玉米的叶形遗传是否为伴性遗传,你认为他们的研究是否有意义,为什么? 16.图为先天愚型的遗传系谱图.请分析回答: 〔1〕若发病原因为减数分裂异常.则患者2体内的额外染色体来自于___________________.减数分裂的差错发生在___________________时期.〔2〕除上述发病原因外,出现先天愚型的原因还可能是___________________.17.下表是四种遗传病的发病率比较,请分析回答:病名代号 非近亲婚配子代发病率 表兄妹婚配子女发病率甲 1:310000 1:8600 乙 1:14500 1:1700 丙 1:3800 1:3100 丁1:40001:3000〔1〕4种疾病中可判断属于隐性遗传病的有________________.〔2〕表兄妹婚配子代的发病率远高于非近亲婚配子代的发病率,其原因是_________.〔3〕某家属中有的成员患丙种遗传病〔设显性基因为B,隐性基因为b 〕,有的成员息丁种遗传病〔设显性基因为A,隐性基因为a 〕,见图所示的系谱图,现已查明Ⅱ6不携带致病基因.请问:①丙种遗传病的致病基因位于___________染色体上,丁种遗传病的致病基因位于____染色体上.②写出下列个体的基因型1 2 3 4 7 8 56 910 正常男女 色盲男女 白化病男女 Ⅱ632145丙病患者丁病患者 ⅠⅢ8_______________Ⅲ9_________________________________________.③若Ⅲ8和Ⅲ9婚配,子女中只患丙或丁一种遗传病的概率为________,同时患两种遗传病的概率为____.18.图表示人体内苯丙氨酸代谢过程的部分图解.根据图解回答问题:(1)控制酶2和酶3合成的基因中的任何一个基因发生突变,都会引起黑色素无法合成而形成白化病.但是如果控制酶1合成的基因发生突变,却不会引起白化病,原因是_________________.如果一对患白化病的夫妻,生了5个小孩都是正常的,最可能的原因是___________________________.(2)<2>E过程叫____________________作用,除了产生苯丙酮酸之外,同时还会产生________________.<3>当控制酶1合成的基因发生突变后,人的血液中______________的含量将会增加,损害大脑,形成白痴.这种疾病叫做______________________.<4>已知控制酶1的基因和控制酶2的基因在两对同源染色体上<假设控制酶3的基因都是正常的>.如果一对正常的夫妻,生下了一个白化白痴的女儿,那么这对夫妻再生一个小孩,则只患一种病的几率是_________;表现型完全正常的几率是___________;完全正常且不含致病基因的几率是____________.19.基因型为AaBb的一对夫妇〔a,b分别代表甲、乙两种致病基因,分别位于两对常染色体上〕,他〔她〕们一个健康儿子和一个携带甲、乙两种致病基因的正常女子结婚.〔1〕该对夫妇健康儿子的基因型有__________种,占子代基因型类型的比例为__________.〔2〕该儿子结婚后,生一个患甲、乙两种病的孩子的概率为___________.〔3〕该儿子结婚后,生一个只患乙病的孩子的概率为____________.〔4〕该儿子结婚后,生一个只患一种病的孩子的概率为________.〔5〕该儿子结婚后,生一个正常孩子的概率为_______.20.科学家利用辐射诱变技术处理红色种皮的花生,获得一突变植株,其自交所结的种子均具紫色种皮.这些紫色种皮的种子长成的植株中,有些却结出了红色种皮的种子.<1>上述紫色种皮的花生种子长成的植株中,有些结出了红色种皮种子的原因是__________.<2>上述紫色种皮的种子,可用于培育紫色种皮性状稳定遗传的花生新品种.假设花生种皮的紫色和红色性状由一对等位基因控制,用文字简要叙述获得该新品种的过程:____________________.21.一个家庭住在一化工厂附近,最近生了一个患一怪病的女儿,因怀疑饮用水受化工厂污水污染,故将化工厂告上法院,引起了纠纷.后经检查,该患病女孩的致病基因是由一显性基因导致,且该致病基因位于第4号染色体上.而患病女孩的父母、祖父母与外祖父母从未患过这种病.由此,用你所学过的生物知识分析,在这场纠纷中,该家庭和化工厂,谁胜诉的可能性较大?为什么?。
实验三 分子标记连锁图的构建
遗传标记
有可以识别的标记, 有可以识别的标记,才能确定目标的方位 及彼此之间的相对位置。 及彼此之间的相对位置。 构建遗传图谱就是寻找基因组不同位置上 的特征标记。 的特征标记。 包括: 包括: 形态标记 细胞学标记 生化标记 DNA分子标记 DNA分子标记
多态性( 多态性(polymophism) )
所有的标记都必须具有 多态性! 多态性
花色:白色、 花色:白色、红色 株高:高、矮 株高: 淀粉: 淀粉:糯、非糯
形态标记
形态性状:株高、颜色、 形态性状:株高、颜色、白化症等 又称表型标记 数量少 很多突变是致死的 受环境、 受环境、生育期等因素的影响
最早建立的果蝇连锁图, 最早建立的果蝇连锁图,就是利用控制 果蝇眼睛的形状、颜色,躯体的颜色、 果蝇眼睛的形状、颜色,躯体的颜色、 翅膀的形状等形态性状作为标记, 翅膀的形状等形态性状作为标记,分析 它们连锁关系及遗传距离,绘制而成的。 它们连锁关系及遗传距离,绘制而成的。 控制性状的其实是基因, 控制性状的其实是基因,所以形态标记 实质上就是基因标记。 实质上就是基因标记。
总数
6708
交换值的计算
sh-wx sh-c
+ wx c sh + + + + c
2708 2538 626 601 113 116 4 2 6708
}亲 型
}单交换
18.29%
sh wx + sh + c + wx + + + +
}单交换
3.41%
} 双交换
0.09%
0.09%
sh wx c 总数 交换值
18.38%
3.50%
遗传系谱图及习题汇总ppt 优秀课件
aX X a X Y A_ A_
1
2
Ⅰ AA XBY
a
b a XBX_ A_ 8
A_ a XbY
4 5 6 7
Ⅱ Ⅲ
正常
3
A_(1/3AA 2/3Aa)aa
10 BY A_ X 白化
9
11 b B A_ X X_
aa X 12
白化兼色盲
bY
色盲
B b AaX Y AaX X。 (1) Ⅰ1 的基因型是________, Ⅰ2 的基因型是________
一对表现型正常的夫妇生了一个患色盲的儿 子,若他们再生一个儿子,患色盲的可能 性是 。若他们再生一个孩子,是色盲 男孩的可能性是 。
(1)—对夫妻性状都正常,他们的父母也正常,妻 子的弟弟是色盲,则他们生育的男孩是色盲的几率 是多少?
(2)一对夫妻性状都正常,他们的父母也正常,妻 子的弟弟是色盲,则他们生育色盲男孩的几率是多 少?
3、如果II5与IV14同时还患血友病,家谱中其他人不 患血友病,则IV13为纯合体的几率为 1/6 ;
例:下图为某家族患两种病的遗传系谱(甲种病基因 用A、a表示,乙种病的基因用B、b表示), Ⅱ6不携 带乙种病基因。请回答: 隐 性遗传病,致病基因在 ____ 常 染色体 (1) 甲病属于 ___ X 上,乙病属于隐 ___ 性遗传病,致病基因在 _____ 染色 体上。 (2)Ⅱ4和Ⅱ5基因型 AaXBXb __。 是____ (3)若Ⅲ7和Ⅲ9结婚, 子女中同时患有两 1/24 , 种病的概率是_____ 只患有甲病的概率 7/24,只患有乙 是____ 病的概率是_____ 1/12 。
例4、(2004年江苏高考)人的血友病属于伴性遗传,苯 丙酮尿症属于常染色体遗传。一对表现型正常的夫妇,生 下一个既患血友病又患苯丙酮尿症的男孩。如果他们再生 一个女孩,表现型正常的概率是( B ) A、9/16 B、3/4 C、3/16 D、1/4
2.3遗传作图的方法
2.3遗传作图的方法2.3 遗传作图的方法染色体作图:确定相互连锁的基因在染色体上的相对位置以及它们之间的遗传距离的过程,又称为基因定位(gene mapping)。
连锁图:根据基因在染色体上直线排列的定律,构建的基因位置以及相互交换值的图谱称为连锁图(linkage map)或遗传学图(genetic map)2.3.1 构建遗传图谱的基本原理假设交换是随机发生的,一对并列的染色单体上任何两点发生交换的机会是均等的;两个彼此靠近的基因之间因交换而分离的的几率要比互相远离的2个基因之间发生分离的几率要小。
随机的染色体上两个任意基因座越远,它们越容易被染色体断裂所分离。
因此重组率可以成为测量两个基因之间相对距离的尺度。
计算出不同基因间的重组率,就可以构建出显示基因在染色体上相对位置的图。
真核生物遗传过程中会发生减数分裂,此过程中染色体要进行重组和交换,这种重组和交换的概率会随着染色体上任意两点间相对距离的远近而发生相应的变化。
根据概率大小,就可以推断出同一条染色体上两点间的相对距离和位置关系。
正因为如此,得到的这张图谱也就只能显示标记之间的相对距离。
我们称这一距离(概率)为遗传距离(cM),由此构建的图谱也称为遗传图谱。
重组率:是指重组型配子占总配子数的百分比,用Rf表示。
Rf =(重组型配子数/总配子数) ×100%交换值:重组率通常又称为交换值。
但严格地讲,交换值不能等同于重组率。
因为非等位基因之间可能发生多重交换,但不一定形成重组型配子,导致用重组率代表交换值会造成偏低估计。
基因间距离与交换值、遗传距离、连锁强度遗传图的偏离与造成遗传图偏离的原因重组热点(r e c o m b i n a t i o n h o t s p o t):染色体上某些比其他位点有更高交换频率的位点。
近端粒区和远着丝粒区有较高重组率。
性别之间也表现重组率的差异。
双交换的出现,产生距离减少的假象。
遗传学图的绘制1)测定基因所属连锁群2)确定基因在染色体上的顺序连锁群(linkage map):位于同一染色体上的所有基因构成一个连锁群。
第02章 遗传图绘制
最早涉及RFLP的论文
1) Botstein D, White RL, Skolnick M, Davis RW (1980) Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. Am J Hum Genet 32:314–331 [PubMed] 2. Gusella JF, Wexler NS, Conneally PM, Naylor SL, Anderson MA, Tanzi RE, Watkins PC, Ottina K, Wallace MR, Sakaguchi AY, Young AB, Shoulson I, Bonilla E, Martin JB (1983) Polymorphic DNA marker genetically linked to Huntington’s disease. Nature 306:234–238 [PubMed] doi: 10.1038/306234a0. 3. Knowlton RG, Cohen-Haguenauer O, Van Cong N, Frezal J, Brown VA, Barker D, Braman JC, Schumm JW, Tsui LC, Buchwald M, Donis-Keller H (1985) A polymorphic DNA marker linked to cystic fibrosis is located on chromosome 7. Nature 318:380–382 [PubMed] doi: 10.1038/318380a0.
基因组路标(landmarker)
(完整word版)遗传系谱图解题技巧练习题及答案
遗传系谱图解题技巧1、判断显、隐性性状此类试题从表现型来看,是对性状的显、隐性作出判断;从基因水平看,是对基因的显、隐性作出判断。
所以一旦判断出某种性状是由显性还是隐性基因控制,同时也就可以对个体的基因型作出判断。
解题规律:(1)选择相同性状的个体杂交,如果后代出现了新的性状,且比例较大,则可以判定新出现的性状为隐性性状。
(2)选择相对性状的个体进行杂交,如果后代只表现某一种性状,则可以判定后代表现出来的性状为显性性状。
2、判断基因位于常染色体上还是性染色体上研究性状的遗传时,首先应该判断所研究性状是显性还是隐性,其次要明确控制相应性状的基因位于常染色体上还是性染色体上,这是解决遗传类习题的规律。
解题规律:(1)若通过一次杂交就可以确定基因位于常染色体上还是性染色体上,则一定要选择雄性为显性性状,雌性为隐性性状的亲本进行杂交.后代雄性只表现隐性性状,雌性均表现显性性状,则基因位于X染色体上,如果后代雌、雄个体中表现型相同且都有显性和隐性性状或均表现为显性性状,则基因位于常染色体上。
(2)种群中个体随机杂交,如果后代雌雄中表现型及其比例相同,则为常染色体遗传,如果后代雌雄中表现型及其比例不同,则为伴性遗传.(3)正交和反交法,正交和反交结果不同,且性状的出现与性别有关,则为伴性遗传,如果正交和反交结果不同,但性状的出现与性别无关,只与母本性状一致,则为细胞质遗传。
3、判断纯合体还是杂合体判断纯合子与杂合子,即判断是否可以稳定遗传;还可以与基因空谈相联系,对突变后的个体基因型进行判断。
隐性性状的个体基因型为纯合子,所以判断个体基因型一定是对显性性状的个体进行判断。
解题规律:(1)测交是最常用的方法,将显性性状的个体与隐性性状的个体进行杂交,后代出现隐性个体,则显性性状的个体为杂合子;后代只有一种表现型,则显性性状的个体则为纯合子.(2)自交是最简单的一个方法,亲本为显性性状的个体,如果后代有性状分离,则亲本为杂合子,反之亲本为纯合子。
遗传作图
4. 对数量性状作图
QTL定位理论: •早在1923 年, Sax就对菜豆种子的大小(数量性状) 与种 皮色素(离散的单基因性状) 之间的遗传关联进行了研究; •Thoday首次提出利用两个单基因标记对控制数量性状的多 基因进行系统定位的构想, 认为当标记位于要定位的基因 两侧时, 标记和要定位基因之间的共分离基因型易于鉴别, 定位也更准确,因而主张应首先筛选这样的标记; •数量性状基因座(quantitative trait loci ,简称QTL) 定位的理论,即分析标记基因型和数量性状值之间的连锁; QTL定位的群体: 单交组合产生后代F2、F3、F4;回交群体BC;重组自交系 群体(Recombinant inbred lines,RILs);加倍单倍体 (Double haploid lines,DH) QTL 定位方法:
♪ 性别之间也会表现重组率的差异
♪ 同一染色体发生多起交换的现象
3. 不同模式生物的连锁分析 连锁分析的三大范畴: ♪ 有性杂交实验 ♪ 系谱分析 ♪ DNA转移
3.1 杂交实验的连锁分析
杂交实验的连锁分析的程序: 选择已知基因型的亲本 → 设计杂 交方案 → 获得交配的子代 → 分析其表 型及基因型
本章主要内容: 第一节 遗传作图基本概念 第二节 遗传作图的分子标记 第三节 遗传作图的方法
第一节 遗传作图基本概念
1. 遗传作图定义 采用遗传学分析方法将基因或其他 DNA顺序标定在染色体上构建连锁图。
2. 遗传作图的基本原理 随机的染色体上两个任意基因座越远, 它们越容易被染色体断裂所分离。
3.遗传图距的单位 厘摩(cM):每单位厘摩为1%交换率。 交换率或交换值或重组频率= 减数分裂的重组产物\减数分裂的总产物
遗传图解
豌豆一对相对性状的杂交、自交实验遗传图解:2、1、2 豌豆两对相对性状的杂交、自交实验遗传图解(从亲代到F2):(说明:上述图解中F1自交至F2过程在高中教材中就是以棋盘式展示的,在此以竖写式呈现2、1、3 豌豆一对与两对相对性状测交实验的遗传图解:2、2 规范书写遗传图解的基本要点仔细观察以上5个遗传图解,然后归纳、总结其相同点,读者不难发现,规范的遗传图解应该包括以下几个基本要点:①左侧标注。
一般在遗传图解的左侧做出鲜明的标识,代表这一行表示的内容,起到引领作用。
如:P,配子,F1,F2等,其中P、F1、F2也可以用汉字表述。
②亲代的基因型、表现型要明确写出。
有时还需要在亲代基因型旁侧标上父本、母本(或♀、♂符号),尤其就是题上明确要求谁做父本,谁做母本时,还有需要区分正交与反交时必须标明(上面的4个图解都没标明父本、母本,那就是因为孟德尔做上述实验时,无论谁做父本,谁做母本结果都就是一样的)。
至于具有明确性别决定的伴性遗传(如XY型,ZW型)的图解,亲代可以不用标出父本、母本。
③杂交(×)、自交(×)符号,以及连接亲代与子代之间的箭头(注意不就是线段)要具备。
④子代的基因型、表现型以及相关的比例要呈现。
这个比例可以就具体解释的遗传问题确定就是否写出。
⑤适当的旁注以说明遗传图解不能很好表达的或需要强调的内容。
如杂交育种与单倍体育种(见图6)选育优良品种的遗传图解。
⑥关于伴性遗传(包括X、Y与Z、W染色体同源区段的遗传)的图解的书写,以上几点依然适用,只不过写亲、子代及配子基因型的时候,写出基因的同时还要写出该基因所在的染色体(基因标注在染色体右上角)。
如果就是常染色体与性染色体复合基因型书写,一般习惯上把常染色体上的基因型写在左边。
关于遗传图解中就是否需要书写配子的问题,一些老师有不同的瞧法,认为配子的书写可以省略,学生在此也存在一定的困惑。
对此笔者认为应视具体的情况而定。
每周例题-遗传图谱--生物奥赛
50.以下哪些是作基因组的高密度连锁图所必需的(多选)A.SSRB.FISHC.STSD.SNPE.DNA指纹图谱这周为大家分享的是有关于人类基因组计划中,遗传图谱的绘制,接下来还会为大家分享有关于物理图谱、序列图谱等的相关知识,希望大家能够掌握。
首先,什么是高密度连锁图?就是基因组的遗传图谱。
遗传图谱又称连锁图谱(linkage map),它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因,在群体中的出现频率皆高于1%)的遗传标记为“路标”,以遗传学距离(在减数分裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率,1%的重组率称为1cM)为图距的基因组图。
相信大家都还记得摩尔根的连锁互换定律,遗传图谱就是运用了这样的方法,先选定遗传学标记(一些多态性的小片段,你可以把它当做一对等位基因来考虑)之后测定后代中交换类型配子占总配子的比例,来确定这些多态性片段之间的遗传学距离,经过计算机整合,绘制出这个基因组中,各片段标记之间的距离。
首先确定的前提是,基因是有多态性的。
什么是多态性?多态性是指在一个生物群体中,同时和经常存在两种或多种不连续的变异型或基因型(genotype)或等位基因(allele),亦称遗传多态性(genetic polymorphism)或基因多态性。
从本质上来讲,多态性的产生在于基因水平上的变异,一般发生在基因序列中不编码蛋白的区域和没有重要调节功能的区域。
生物群体基因多态性现象十分普遍,其中,人类基因的结构、表达和功能,研究比较深入。
人类基因多态性既来源于基因组中重复序列拷贝数的不同,也来源于单拷贝序列的变异,以及双等位基因的转换或替换。
按引起关注和研究的先后,通常分为3大类:DNA片段长度多态性、DNA重复序列多态性、单核苷酸多态性。
✧DNA片段长度多态性(FLP),即由于单个碱基的缺失、重复和插入所引起限制性内切酶位点的变化,而导致DNA片段长度的变化。
又称限制性片段长度多态性,这是一类比较普遍的多态性。
《遗传作图》课件
对收集到的数据进行清洗、整 理和标准化处理,以确保数据 的准确性和可靠性。
统计分析
利用统计分析方法,计算遗传 标记与表型之间的关联度,并 确定基因在染色体上的位置。
数据收集
收集个体的基因型和表型数据 ,以及相关的生物样本和临床 信息。
遗传标记选择
选择与表型相关的遗传标记, 并进行基因分型。
良手段。
抗逆性研究
分析植物在各种环境压力下的基因 表达和变异,揭示植物抗逆性的分 子机制,培育抗逆性更强的新品种 。
植物系统发育研究
利用遗传作图技术,研究植物物种 间的亲缘关系和系统发育,揭示植 物多样性的演化历程。
动物遗传作图的应用案例
动物育种
通过遗传作图技术,定位和克隆 控制动物生长、繁殖和品质性状 的基因,为动物育种提供关键的
结果解读
对分析结果进行解读和解释, 并提供相关的生物信息和医学 建议。
04
遗传作图的发展与展望
遗传作图的发展历程
遗传作图的起源
遗传作图最早起源于20世纪初,随着生物学和遗传学的发 展,科学家开始尝试对生物体的遗传信息进行组织和分类 。
分子标记技术的发展
随着分子生物学技术的不断发展,科学家开始利用分子标 记技术进行遗传作图,这为遗传作图提供了更准确、更可 靠的工具。
高通量测序技术的兴起
近年来,随着高通量测序技术的兴起,遗传作图的技术手 段得到了极大的提升,可以更加快速、准确地获取生物体 的遗传信息。
遗传作图的未来展望
1 2
全面解析生物体的遗传信息
随着技术的不断发展,未来遗传作图将更加深入 地解析生物体的遗传信息,为生物体的研究和应 用提供更加全面的信息。
跨物种比较和进化研究
遗传图谱
学情分析基础,对于知识不能灵活运用课题遗传图谱分析学习目标与考点分析学习目标:1、对基因的分离定率和基因的自由组合定律能熟练的牢记把握考点分析:1、遗传图谱的分析与把握学习重点重点:1、基因的分离定律和自由组合定律学习方法讲练结合练习巩固学习内容与过程知识点梳理第三章遗传和染色体第一节基因的分离定律一、相对性状性状:生物体所表现出来的的形态特征、生理生化特征或行为方式等。
相对性状:同一种生物的同一种性状的不同表现类型。
二、孟德尔一对相对性状的杂交实验1、实验过程(看书)2、对分离现象的解释(看书)3、对分离现象解释的验证:测交(看书)例:现有一株紫色豌豆,如何判断它是显性纯合子(AA)还是杂合子(Aa)?相关概念1、显性性状与隐性性状显性性状:具有相对性状的两个亲本杂交,F1表现出来的性状。
隐性性状:具有相对性状的两个亲本杂交,F1没有表现出来的性状。
附:性状分离:在杂种后代中出现不同于亲本性状的现象)2、显性基因与隐性基因显性基因:控制显性性状的基因。
隐性基因:控制隐性性状的基因。
附:基因:控制性状的遗传因子(DNA分子上有遗传效应的片段P67)等位基因:决定1对相对性状的两个基因(位于一对同源染色体上的相同位置上)。
3、纯合子与杂合子纯合子:由相同基因的配子结合成的合子发育成的个体(能稳定的遗传,不发生性状分离):显性纯合子(如AA的个体)隐性纯合子(如aa的个体)杂合子:由不同基因的配子结合成的合子发育成的个体(不能稳定的遗传,后代会发生性状分离)4、表现型与基因型表现型:指生物个体实际表现出来的性状。
基因型:与表现型有关的基因组成。
(关系:基因型+环境→表现型)5、杂交与自交杂交:基因型不同的生物体间相互交配的过程。
自交:基因型相同的生物体间相互交配的过程。
(指植物体中自花传粉和雌雄异花植物的同株受粉)附:测交:让F1与隐性纯合子杂交。
(可用来测定F1的基因型,属于杂交)三、基因分离定律的实质:在减I分裂后期,等位基因随着同源染色体的分开而分离。
遗传系谱图的解题方法及练习
遗传系谱图的解题方法及练习一学情分析高中生物高考要求学生对遗传系谱图应达到综合分析应用水平.遗传系谱题多涉及一系列问题的解答,如①判别遗传类型,②写出指定个体的基因型,③计算患病机率.而教材中有关内容又较少,因而准确分析遗传系谱即成为一个难点.对学生来说经常出现听得懂,看得明白,就是不会做题.学生普遍认为解题过程中思路不清晰,书写紊乱.因此需要突破这一难点。
二教学目的1)让学生理顺解题思路,排除干扰解题的非智力因素2) 掌握解题技巧3)能够说出生活中常见遗传病的相关特点三教学过程遗传系谱图是遗传学中的一个重点内容、也是公认的难点,平时练习时要多注意归纳总结,概括出此类题试题的规律和解题思路,从而可以达到从容应对。
1、确定是否是Y染色体遗传特点:“父传子,子传孙,子子孙孙无穷尽也”。
即患者都是男性,且有“父—子—孙”的规律。
如外耳道多毛症2、确定显隐性:分析下列遗传图,判断致病基因的显隐性(1)“无中生有”为隐性致病基因(2)“有中生无”为显性致病基因3)再确定致病基因的位置1.隐性遗传A.常染色体隐性遗传:“父母正常生病女为常隐”。
如白化病等B.伴X隐性遗传:“女患父必患,母患子必患”如人类红绿色盲、血友病;果蝇的白眼2.显性遗传:A.常染色体显性遗传:“父母患病女正常为常显”如人的多指B.伴X显性遗传:“父患女必患,子患母必患”如抗维生素D佝偻病遗传病种类的判断例1、定相同?图一图二中Ⅰ-2一定是杂合子吗?例2总结回顾1、先确定是否伴Y遗传2、再区分显隐关系。
习题训练1、下列最可能反映红绿色盲的遗传系谱图是2、右图是一种伴性遗传病的家系图,下列叙述错误的是()A.该病是显性遗传病,Ⅱ—4是杂合体B.Ⅲ—7与正常男性结婚,子女都不患病C.Ⅲ—8与正常女性结婚,儿子都不患病D.该病在男性人群中的发病率高于女性人群3右图为白化病(A、a)某家族遗传系谱图表示,据图分析回答问题1)图中I2的基因型是________2)图中Ⅱ3的基因型为________ Ⅱ3为纯合子的几率是_________ ____ .3)若Ⅱ3与一个杂合女性婚配,所生儿子为白化病人,则第二个孩子为白化病女孩的几率是________。
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二、遗传图构建理论
遗传作图 (Genetic mapping) 即遗传 图谱的构建。它是利用遗传学的原理和方 法,构建能反映基因组中遗传标记之间遗 传关系的图谱。
孟德尔遗传定律: • 等位基因随机分离 如果亲本的等位基因是A和a,那么F1代的 成员得到A或a的概率相等。
• 非等位基因自由组合 基因A的等位基因遗传与基因B的等位基因 遗传相互独立。
7.7 13.2 6.9 9.8 2.8 17.5 41.6
(128) RZ574 37.1 15.6 18.5 2.5 5.0 28.6 1.9 22.5 15.0 32.1 7.1 9.2 17.9 (173) (13) (94) (62) Pgi -1 CDO87 RG910 RG418A (109) RZ284 (115) RZ394 (156) (118) (40) (4) (112) (121) (124) pRD10A RZ403 RG179 CDO337 RZ337A RZ448 RZ519
• 两个彼此靠近的基因之间因交换而分离的的几率 要比互相远离的2个基因之间发生分离的几率要小。
• 因此重组率可以成为测量两个基因之间相对距离 的尺度。 • 计算出不同基因间的重组率,就可以构建出显示 基因在染色体上相对位置的图。
二、怎样构建遗传图
步骤:
1. 选用合适的遗传标记 2. 测定群体中不同个体的遗传标记 3. 对遗传标记数据进行连锁分析,构建连锁 图
2.2 分子遗传图
其构建步骤:
主要包括构建合适的遗传群体,包括亲本 的选择,分离群体类型的选择及群体大小 的确定等;利用合适的分子标记进行分析; 利用计算机软件进行图谱构建,建立标记 间的连锁排序和遗传距离; 利用计算机软 件绘出遗传图谱这几个部分.
不同模式生物的连锁分析方法
• 有性杂交实验:可进行遗传学实验的材料, 如老鼠、果蝇、水稻等。
(143) RZ801 (90) RG810 (55) RG331
三、遗传图的发展历程
由于遗传理论和检测技术的不断进步,带来了遗传图 的演变和发展。 1、自1980 年第1次提出采用限制性片段长度多态性 ( restriction fragment length polymorphism, RFLP) 绘制 连锁图。 2、第2 代简短串联重复( short tandem repeats, STR )连 锁图 。 3、第3 代单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphism, SNP)连锁图 。 目前, 除了单核苷酸多态性位点的开发仍在进行之外, 遗传图的绘制工作可以说已经完成。这标志着遗传图已全 面进入应用阶段, 并日益成为“功能基因组计划”不可或 缺的工具。
4
Mar ker Id Name (47) (107) (42) (92) (93) (67) (89) (127) (138) (35) (130) (46) (31) (79) RG218 RZ262 RG190 RG908 RG91 RG449 RG788 RZ565 RZ675 RG163 RZ590 RG214 RG143 RG620
• 谱系分析:不能进行遗传实验的材料,如 人类、多年生树木。
• DNA转移:不发生减数分裂的生物,如细 菌、酵母。
有性杂交实验
有性杂交实验的标准方法——测交分析(test cross)一个亲本为双杂合 子,另一个亲本为双纯合子。 所以测交便于分析子代个体基因型的分离比。 AB/ab×ab/ab
AB Ab aB ab F1基因型 ABab Abab aBab abab
ab ab ab ab AB Ab aB ab 表型
• 两点杂交
确定两个位点是否连锁。
• 多点杂交
确定多个位点的相对位置与排序。
遗传图绘制-分子标记的等位型式
遗传图绘制-F2基因型分析
数据库的建立: 把基因型重组的结果数字化, 按作图的要求,整理数据, 建立计算机文件。
准备资料(prepare data): 如果是F2群体的资料,阅读资料后,屏幕上将出现: data type f2 intercross 146 362 0 symbols 1=A 2=H 3=B 0=(个体数 座位数 QT数) 其中: 1=A—亲本A的纯合基因型(aa) 2=H—杂合基因型(ab) 3=B—亲本B的纯合基因型(bb) 4=C—非亲本A纯合基因型(ab,bb) 5=D—非亲本B纯合基因型(aa,ab) 0=- — 缺资料
连锁与部分连锁:
20世纪初遗传学家认识到基因位于染色体上, 同一染色体上的两个基因理论上应该共同 传递给下一代。但事实上同一染色体上的 完全连锁的想象只有极少数。大多数的基 因是部分连锁的。
摩尔根用减数分裂时染色体的行为解释了同 一染色体上的基因部分连锁的现象。
部分连锁的原因是基因之间发生了交换
四、遗传图的应用
1、确定基因在染色体上相对位置
2、对可疑疾病易感基因进行定位, 从而为今 后致病基因的克隆奠定基础。
资料来源
• 中国知网: ①刘旭《遗传标记和遗传图谱构建》 ②张霁 侯一平《遗传图及Mar ker Id Name (71) RG472 RG246 K5 U10 RG532 W1 RG173 Amy1B RZ276 RG146 RG345 RG381 RZ19 RG690 RZ730
Dist cM
2
Mar ker Id Name (66) (76) (37) (33) RG437 RG544 RG171 RG157
遗传图(genetic map): 又称为连锁图(linkage map),是指基因或 DNA标志在染色体上的相对位置与遗传距离,后 者通常以基因或DNA片段在染色体交换过程中的 分离频率厘摩(图距单位:cM)来表示,cM值 越大,两者之间距离越远。 遗传距离: 减数分裂时两个基因间重组值为1% =连锁图 中两个基因间图距1厘摩 1cM大约相当于1×106个核苷酸对(1Mb).
遗传图构建原理
————遗传学
人 类 基 因 组 计 划
遗传图 物理图 序列图 转录组研究的第一步。
遗传图
• • • • 什么是遗传图? 怎样构建遗传图(即遗传图的构建原理)? 遗传图的发展历史? 构建遗传图的功能、意义?
一、遗传图谱的相关定义
Dist cM
3
Mar ker Id Name (25) (58) (111) (145) (23) (43) (139) RG104 RG348 RZ329 RZ892 RG100 RG191 RZ678
Dist cM 8.1 8.6 12.6 13.7 3.2 16.1 8.4 16.8 21.4 28.2 2.7 12.2 5.9
13.0 5.3 22.2 27.4 6.3 29.3 10.2 8.8 12.8 8.4 5.1 10.0 5.4 13.1
(110) RZ318 (167) PalI (129) (12) (162) (95) (82) (52) (104) (99) (74) RZ58 CDO686 Amy1A/C RG95 RG654 RG256 RZ213 RZ123 RG520
分群(group):
通过两点分析,计算各座位之间的连锁关系,并 把基因座位划分为若干个连锁群。屏幕上将出现: group 1:1 4 12 35 … group 2:2 7 18 42 … … 通过设置LOD值,可以改变连锁群的数目。 LOD值增大,连锁群的数目也会增大。LOD值 >3.0时,其分群的可靠性较大。当座位数足够大 时,连锁群的数目与单倍体的染色体数目相同。
2.1 遗传作图的方法
从摩尔根时代开始,连锁(linkage) 分析便成为遗传分析的重要手段,更是遗 传作图的基础。遗传标记之间的遗传关系 主要是通过连锁关系来反映。而连锁关系 是通过重组率来反映的。 重组型数目 重组率 (RF) = ———————— 总数目
遗传作图的理论基础:
• 假设交换是随机发生的,一对并列的染色单体上 任何两点发生交换的机会是均等的;
任何一类图谱都有可识别的标记。遗传图 谱的标记是什么呢?
染色体上的基因和DNA序列 均可作为路标, 路标具有 标记1 物理属性,他们由特定的 标记2 DNA顺序组成. 路标位于染 色体上的位置是固定的,不 会更改的,因而提供了作图 的依据
标记3
遗传作图的常用标记
1.基因是首先被使用的标记
• 在经典遗传学中,研究一种性状的遗传必须要求同一性状 至少2种不同的存在形式或称表型。 • 起初只有那些能通过视觉区分的基因表型用于研究。最初 的遗传图谱是在20世纪初针对果蝇等生物使用基因作为标 记构建的。
• 排序(sequence): 通过多点分析,可以计算出在同一连锁群 内不同排列顺序下,各座位之间的距离和 连锁群的总长度。 • 比较(compare): 通过比较同一连锁群内不同排列顺序的作 图结果,找出log-likelihood(对数似然值) 为最大的排列方式为最合理的排列方式。
作图(map):显示最后的作图结果。
2. DNA标记
基因之外的作图工具统称为DNA标记。有三种 类型的DNA序列特征可以满足这一要求: 1.限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphisms, RFLP) 2.简短串联重复( short tandem repeats, STR ) 3.单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)
一、遗传图谱的相关定义
遗传标记:
遗传标记是遗传物质的特殊的易于识别的表现形式,可以是任何一 种呈现孟德尔遗传的性状或物质形式,如:基因、血型、血清蛋白、 DNA多肽标记等,确定其在基因组中的位置后,可作为参照标记用于 遗传重组分析,研究基因遗传和变异的规律。
目前, 遗传标记主要分4 大类: