b3肝细胞癌中的肝癌相关mRNA的筛选和分析

合集下载

肝癌的细胞信号通路与靶点

肝癌的细胞信号通路与靶点

肝癌的细胞信号通路与靶点肝癌是一种常见的致死性恶性肿瘤,其发病机制非常复杂。

研究表明,肝癌的发展与多个细胞信号通路的异常活化以及相关靶点的改变密切相关。

本文将探讨肝癌中的几个主要信号通路以及与之相关的潜在靶点。

1. Wnt/β-catenin信号通路Wnt/β-catenin信号通路是细胞生长与分化调控中的重要通路,而它在肝癌中的异常激活与肿瘤细胞的增殖及转移密切相关。

一般情况下,Wnt信号以“关闭”状态存在,通过抑制β-catenin的分解,使其在胞浆内积累,并进入细胞核,调控靶基因的转录。

然而,在肝癌中,Wnt信号通路常常发生异常激活,导致β-catenin在细胞核内过度积累,从而促进肿瘤细胞的增殖、转移与侵袭。

因此,Wnt/β-catenin信号通路成为了抗肝癌治疗的重要靶点。

2. PI3K/Akt/mTOR信号通路PI3K/Akt/mTOR信号通路是一个广泛参与细胞生长、存活及代谢的关键通路。

在正常情况下,岛上细胞外的生长因子通过PI3K激活Akt,然后激活mTOR,进而促进细胞的生长与代谢。

然而,在肝癌中,这个信号通路经常被异常激活。

研究发现,PI3K/Akt/mTOR信号通路的异常激活与肝癌的发生、进展及耐药性有关。

因此,该信号通路的相关蛋白成为了潜在的肝癌治疗靶点。

3. EGFR信号通路EGFR(表皮生长因子受体)信号通路是一个重要的细胞生长信号通路,它在正常情况下能够调节细胞增殖、分化和凋亡等生理过程。

然而,在肝癌中,EGFR信号通路常常发生异常激活。

这常常是由于EGFR基因突变、过表达以及其配体的异常表达所导致的。

EGFR的异常激活会促进肿瘤细胞的生长、转移和耐药性。

因此,EGFR信号通路的抑制被认为是治疗肝癌的重要策略之一。

4. MAPK信号通路MAPK(中游型丝裂原活化蛋白激酶)信号通路是一个重要的调控细胞生长与分化的信号通路。

肝癌的研究表明,MAPK信号通路在肝癌的发生与发展中起着重要的作用。

肝细胞性肝癌中MAZ基因的表达及意义

肝细胞性肝癌中MAZ基因的表达及意义

肝细胞性肝癌中MAZ基因的表达及意义刘伟;罗伟;朱小年;贝春华;谭盛葵;侯巧燕;仇小强【摘要】目的探讨MAZ基因在肝细胞性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)及其癌旁正常组织中的表达,分析其与HCC各临床病理特征及预后的关系.方法采用组织芯片技术和免疫组化法检测75例HCC及其对应癌旁正常组织中MAZ基因的表达,分析其与HCC临床病理特征及与患者预后的关系.结果 MAZ在HCC中的表达(48%,36/75)明显高于其癌旁正常组织(22.67%,17/75),组间比较差异有统计学意义(P<0.05).MAZ表达与HCC患者性别、年龄、病理分级、临床分期、TNM分期、是否合并肝硬化、是否合并乙肝病毒感染、是否有肝癌家族史以及血清AFP、CEA、γ-GT、ALT、AST和ALB水平、是否有淋巴结转移等均无明显相关性,而与肿瘤直径、吸烟与否、饮酒与否显著相关(P<0.05).HCC中MAZ阳性组和阴性组的累计生存率差异有显著性(P<0.05),MAZ阳性组患者的术后无瘤生存时间明显低于阴性组,提示MAZ表达上调可能导致患者的预后更差.结论 MAZ基因表达上调可能与HCC的发生、发展密切相关.【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》【年(卷),期】2016(032)006【总页数】5页(P606-610)【关键词】肝肿瘤;肝细胞性肝癌;MAZ;免疫组织化学;预后【作者】刘伟;罗伟;朱小年;贝春华;谭盛葵;侯巧燕;仇小强【作者单位】桂林医学院附属医院肝胆外科,桂林541004;桂林医学院附属医院肝胆外科,桂林541004;桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,桂林541004;桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,桂林541004;桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,桂林541004;桂林医学院附属医院病理科,桂林541004;广西医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,南宁530000【正文语种】中文【中图分类】R735.7MAZ(Myc-associated Zinc-finger protein)即MYC相关的锌指蛋白,在人体各组织器官中广泛表达,其编码基因位于人常染色体16p11.2,其转录产物为2.7 kb的mRNA,编码477个氨基酸而得到一个相对分子质量约为6.0×104的MAZ蛋白[1,2]。

肝细胞肝癌中PED/PEA-15mRNA及蛋白表达的临床意义

肝细胞肝癌中PED/PEA-15mRNA及蛋白表达的临床意义
展过程 中发挥 重要 作用
关键词 癌 , 细疫组 化 肝 E / E .5
E p es n a ds nf a c f E P A-5mR A i e aoellrc rio S N D —un , x rs o n i icn eo D/ E 1 N nh p tcl a a c ma U eg ag i gi P u n
U l - , e , ,
G hnm n ,LA u,Z AN hn - n A0 Z e — ig 1NG R i HU G C eg u ,WA i n .T eT i e a m n G nr ugr,t j NG L— g h hr D p r e t mi d t eea S re l y h e
03 1 nH C, w i a gicnl hg e ta oei a —a io su ( .4 .0 C i hc w s in a t i rhnt s pr cr nma i e 06 1±01 1 a dnr l e ac h s f i y h h n a c ts .0 ) n o p t ma h i
03 106 1 . 1和 05 5±00 7 P D P A 1 N . 、 .4 ±01 0 0 . 6 .7 ,E / E 一5mR A在肝 癌组织 中表 达较 癌 旁组 织、 正常肝组织显 著升 高( P
<00 ) .1 。免疫 组织化 学显 示 ,肝 癌组 织 、癌 旁组 织及正 常肝组 织 中 P D P A 1 白的表达 率分 别为 7 .%、 E / E 一5蛋 2 5 3 .%和 1.%。肝癌组织 中 P D P A一5蛋 白表 达较 癌旁组织及正 常肝组 织显著升 高( 25 67 E /E 1 P<0o ) .1 。且 P D P A一 E /E 1 R A及蛋 白的表 达与肝 癌病理分级 、 5m N 临床 分期有关 ( P<00 ) 而与发病年龄 、 别、 瘤大 小、 . , 5 性 肿 肿瘤数 目差异 无显 著性( P>00 ) .5 。结论 :E / E 1 N P D P A一5mR A及蛋 白在 肝癌组 织中表 达水平 明显升高 , 可能在肝癌 的发生及发

mRNA肿瘤疫苗:研究进展及临床应用前景

mRNA肿瘤疫苗:研究进展及临床应用前景

mRNA肿瘤疫苗:研究进展及临床应用前景
江俊山;李利毛;蔡华忠
【期刊名称】《现代肿瘤医学》
【年(卷),期】2024(32)9
【摘要】免疫疗法为肿瘤治疗提供了有效的辅助作用,其中信使RNA(messenger RNA,mRNA)肿瘤疫苗有着较好的肿瘤免疫激活作用,为肿瘤辅助治疗提供了一个潜在的应用前景。

mRNA疫苗能够激活或者增强人体免疫系统特异性识别抗原的能力,从而实现抗肿瘤作用。

相比较于其他疫苗平台,mRNA肿瘤疫苗具有安全、不被整合、负载多种抗原等特点。

肿瘤的不同突变类型导致了肿瘤治疗存在一定的个体差异性,肿瘤抗原的选择就显得尤为重要。

同时,mRNA修饰可以增强mRNA的稳定性及翻译效率。

这些因素都影响着mRNA疫苗的抗肿瘤效应。

目前多种个体化mRNA肿瘤疫苗在临床试验中表现出较好的安全性及免疫原性。

因此,通过本综述能更好的了解mRNA肿瘤疫苗的作用以及开发个性化肿瘤疫苗的临床价值,并且联合现有的治疗方式能为肿瘤辅助治疗提供更为有效的治疗方案。

【总页数】9页(P1740-1748)
【作者】江俊山;李利毛;蔡华忠
【作者单位】江苏大学医学院;江苏大学附属医院
【正文语种】中文
【中图分类】R730.3
【相关文献】
1.肿瘤疫苗热休克蛋白-多肽复合物(HSP-PCs)的临床应用研究进展
2.肿瘤疫苗热休克蛋白-多肽复合物的临床应用研究进展
3.肿瘤干细胞研究进展及临床应用前景
4.输卵管伞的临床研究进展和肿瘤应用前景
5.mRNA肿瘤疫苗的免疫学机制和临床研究进展
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

survivin mRNA和NF-кB mRNA在原发性肝癌中的表达及其意义──附30例检测结果

survivin mRNA和NF-кB mRNA在原发性肝癌中的表达及其意义──附30例检测结果
维普资讯
新 医学 20 0 7年 6月第 3 8卷第 6期
31 6
srii NA和 N .B mR u vvnmR F K NA在 原 发 性肝 癌 中 的表 达及 其 意 义
一 一
附3 O例检测结果
陈远 能 陆永伟 姜海行 唐 国都
广 西医科 大学第一ห้องสมุดไป่ตู้属 医院 消化 内科 ( 30 1 502 )
22 方 . 法
2 2 1 试 剂 和 仪 器 R A 提 取 试 剂 盒 购 自美 国 . . N
Ivt gn公 司 ,逆转 录试 剂盒 购 自美 国 MB 公 司 , nioe r I 荧 光 探针 及 目的基 因引物 委托上 海生 物工 程技 术 服 务公 司设 计 及 合 成 ,P R 试 剂 购 自大 连 宝 生 生 物 C 工程 有 限公 司 。I c r 时 荧 光 定 量 P R仪 为美 c l 实 ye C
可 能 与 肝 癌 的 发 生 、发 展 有 关 。
[ 关键词 ] 原发性肝细胞癌
存 活素信使核糖核酸
肿 瘤
核 因子一B信使核糖核酸 K
细胞 凋 亡
实时 荧 光 定 量 逆 转 录 聚合 酶链 反 应
1 引 言
近年来 的研 究表 明 ,肿瘤 不仅 是一 种 细胞增 殖 失 控 的疾 病 ,而且 也是 一种 细 胞 凋 亡 异 常 的疾 病 。 细胞增 殖与 凋亡 之 间的 动态平 衡是 维持 机体 稳 态 的 重 要基 础 ,一旦 这种 平 衡 被 打 破 ,肿 瘤 就会 发 生 。
亡 。 目前 ,对 sri nmR A和 N K R A在 uv i v N F—B m N 原 发性 肝癌 ( 癌 ) 中表 达 的研 究 不多 ,而 且 sr 肝 u— v i mR A和 N —B m N in v N F x R A在 肝 癌 癌 组 织 中 的 关

肝细胞肝癌患者的血清蛋白质组学研究

肝细胞肝癌患者的血清蛋白质组学研究

肝细胞肝癌患者的血清蛋白质组学研究雷霆;孙青丽;张健;韩水平;赵文宝【期刊名称】《西安交通大学学报(医学版)》【年(卷),期】2012(033)001【摘要】Objective To profile the global serum proteins of hepatocellular carcinoma and try to discover novel factors that can act as biomarkers for diagnosis, prognosis assessment and therapeutic monitoring. Methods We collected 50 serum samples of hepatocellular carcinoma (HCC) patients and ran 2-DE separation and silver staining after the top 6 proteins were removed by MARS column, compared the scanned images of HCC with those of normal sera, and identified the differentially expressed spots by MS/MS. Results We identified totally 20 spots corresponding to 11 proteins that were differentially expressed in HCC and normal sera. Among these 11 proteins, 7 were up-regulated whereas the other 4 were down-regulated in HCC serum samples. Seven different spots were identified simultaneously as ai-antitrypsin and all were up-regulated in HCC, indicating that the protein was degraded more quickly in HCC than in normal samples. Western blotting analysis further confirmed that more fragments of ai-antitrypsin appeared in most of the HCC serum samples. Conclusion Serum is a very important clinical sample for HCC diagnosis and therapeutic monitoring. Although the identified proteins in this study cannot be used as specific biomarkers for diagnosis in clinic, these proteinsare useful for proteomic analysis of HCC serum.%目的分析肝细胞肝癌患者的血清蛋白质谱,寻找诊断肝癌和检测治疗的特异性标志物.方法收集了50例肝癌患者血清,在去除血清中6种高丰度蛋白后进行双向凝胶电泳分离及银染,将凝胶扫描图像与正常人血清比较分析,然后经质谱鉴定20个差异表达蛋白质点.结果共鉴定了11种差异表达蛋白质,其中7种蛋白质在肝癌患者血清中表达水平上调,其余4种蛋白质表达水平下调.有7个点被同时鉴定为α1-抗胰蛋白酶,均在肝癌患者血清中表达上调,提示α1-抗胰蛋白酶在肝癌中降解加快.Western blotting检测进一步证实多数肝癌血清中的α1-抗胰蛋白酶小片段增多.结论血清是诊断肝癌和检测治疗非常重要的临床标本,本实验中鉴定的蛋白质虽不能作为临床诊断标志物,但对分析肝癌血清蛋白谱的改变有一定的参考价值.【总页数】5页(P14-18)【作者】雷霆;孙青丽;张健;韩水平;赵文宝【作者单位】西安交通大学医学院病理系,陕西西安710061;中国电子科技集团第二十研究所职工医院,陕西西安710068;西安交通大学医学院病理系,陕西西安710061;西安交通大学医学院病理系,陕西西安710061;西安交通大学医学院病理系,陕西西安710061【正文语种】中文【中图分类】Q592.1【相关文献】1.肝细胞肝癌患者血清中成纤维细胞生长因子19表达对早期诊断的意义 [J], 胡晓菡;田新宇;沈瀚2.血清肝细胞生长因子与未经治疗的肝细胞性肝癌患者的生存率之间的关系 [J],Vejchapipat P.;Tangkijvanich P.;Theamboonlers A.;Y. Poovorawan;姜志茹3.肝细胞肝癌患者血清SDF-1、MCP-1水平及临床意义 [J], 黄培芝;刘灵芝;汪柳;赵钢艳;吴芳;何树光4.血清miRNA-155联合IL-6水平检测对肝细胞肝癌患者预后的评估价值 [J], 陈院朝;齐惠丽;芦晗;王升5.血清低病毒载量HBV-DNA乙型肝炎相关性肝细胞肝癌患者的检测分析 [J], 唐敏;陈倩;郭姗因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

原癌基因HCCR mRNA、FBI-1 mRNA在肝癌相关患者血液中的表达及意义

原癌基因HCCR mRNA、FBI-1 mRNA在肝癌相关患者血液中的表达及意义
12 主 要试剂 与仪 器 .
Ti l ( nioe 公 司 ) 逆 转 录 试 剂 盒 r o Iv rgn z t ,
( u a ev a c ne n oe e h m ncri l a cr cgn )最 先 在 人 宫 颈 癌 c o
中分离 。研究 显示 ,HC R是 p 3基 因的 负调 控 因 C 5
平 高 于肝 硬 化 患者 ,健 康 者 血 液 中未 发 现 两 基 因 的 m N 表 达 。 同时 发 现 ,血 液 中 F I1m N 与 甲 胎 蛋 白 ( F 水 平 R A B一 R A A P)
显著相 关 ( 00 ) B一 mR A 与 H C N 的表达 水平 显著相 关 ( 0 0 ) 【 P< . 1 ,F I N 1 C R mR A P< . 1 。 结论 】肝 细胞 癌 、肝硬化 患者血
用 荧光 定量 聚合 酶 链 反 应 ( C P R) 技 术 ,检 测 4 1例 肝 细 胞 癌 、3例 肝 硬 化 患 者 术 前 血 液 标 本 及 1 O例 健 康 者 血 液 标 本 中
HC R m N C R A、F I N B— mR A含量 ,分析其与 临床指标 的关 系。 【 l 结果 】肝 细胞 癌患者血液 中 HC R mR A、F I1m N C N B 一 R A水
( em n s 司 ) Fr et 公 a ,荧 光定 量聚 合酶链 反 应 ( C P R)
所用 试 剂 盒 ( 安 基 因 诊 断 公 司 ) 引 物 、探 针 达 ,
子 ,能 下调 p 1 A。 因启 动 子 活性 ,其 蛋 白在 人 2 Ⅳ 基 乳腺 、肾 、淋 巴 、胃、结 肠 、卵巢 等肿瘤 中异常 高 表达 ~ 。 本 研 究 检 测 了 肝 癌 相 关 患 者 血 液 中

肝癌的转录组和表观遗传学研究

肝癌的转录组和表观遗传学研究

肝癌的转录组和表观遗传学研究肝癌是一种高度复杂且致命的肿瘤类型,其发病机制至今尚不完全清楚。

然而,随着转录组学和表观遗传学的快速发展,我们对于肝癌发生和发展的研究取得了突破性进展。

本文将对肝癌的转录组和表观遗传学研究进行探讨,以期增加对这一疾病的认识。

一、转录组学研究转录组学是研究细胞内所有转录本的产物,即mRNA的全集。

通过转录组学研究,我们可以全面了解肝癌中基因表达的变化情况,从而揭示其发生机制。

研究表明,与正常细胞相比,肝癌细胞中存在大量基因的异常表达。

这些异常表达的基因涉及到细胞生长、凋亡、血管生成等重要生物学过程,从而导致了肝癌的发展。

1. 转录组变异与肝癌研究发现,肝癌细胞中存在大量的基因变异。

这些变异可能是由致癌基因的点突变、染色体结构异常或基因拷贝数的改变所导致。

通过对这些变异基因的分析,我们可以发现一些与肝癌进展相关的重要驱动基因。

例如,肝癌中常见的TP53基因突变在细胞凋亡的调控中起着关键作用。

2. 转录组学的亚型分类基于转录组学的研究,肝癌可以被进一步分为不同的亚型。

这些亚型在基因表达模式、临床症状和预后上存在差异。

通过对肝癌亚型的研究,我们可以更好地了解肝癌的异质性,并为个体化治疗提供依据。

3. 转录组学在预后评估中的应用转录组学研究不仅可以帮助我们理解肝癌的发生机制,还可以用于预测肝癌患者的预后。

通过分析肝癌组织中的基因表达谱,我们可以得到与预后相关的基因指标,为临床预后评估提供参考。

二、表观遗传学研究表观遗传学是研究影响基因表达的可逆性调控机制。

在肝癌中,表观遗传学调控的异常常常导致基因的错配表达,从而促进肿瘤的发展。

1. DNA甲基化DNA甲基化是表观遗传学中最为重要的调控方式之一。

研究发现,在肝癌中存在大量基因的异常DNA甲基化。

这些异常的DNA甲基化可能导致基因的沉默或过度表达,从而促进肝癌的发生。

2. 组蛋白修饰组蛋白修饰是另一种常见的表观遗传学调控方式。

研究表明,在肝癌中存在组蛋白修饰的异常,如乙酰化、甲基化和泛素化等。

β—catenin在原发性肝细胞癌中的表达及其临床意义

β—catenin在原发性肝细胞癌中的表达及其临床意义

β—catenin在原发性肝细胞癌中的表达及其临床意义作者:王敏朴金松高蔚樱郑一玮谭小军来源:《中国现代医生》2014年第13期[摘要] 目的探讨肝细胞癌肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)β-catenin的表达与HCC 临床病理特征的关系。

方法应用Envsion法检测333例HCC,168例癌旁肝组织及89例正常肝组织的β-catenin表达;RT-PCR检测37例HCC及癌旁组织,肝癌细胞株HepG2和正常肝细胞株LO2的β-catenin mRNA表达。

结果β-catenin在HCC胞质、胞核的阳性表达率为79%/37%;在癌旁和正常肝组织中的表达率为72%/0%、70%/0%。

差异均有统计学意义(P均[关键词] β-catenin;肝细胞癌;组织芯片;免疫组织化学;RT-PCR[中图分类号] R735.7 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701(2014)13-0031-04Wnt/β-catenin信号途径调节控制着许多生命过程,包括生物体的生长、发育、疾病、衰老与死亡等。

同时,Wnt/β-catenin信号途径也与肿瘤的发生密切相关,有十几种目前已知的高发性癌变源于Wnt/β-catenin信号转导途径的失调[1]。

β-catenin是Wnt信号途径中具转录调控活性的关键成员,β-catenin能在细胞核内与Wnt途径的另一类成员LEF1/TCFs 结合从而激活靶基因的转录。

β-catenin在正常成体细胞胞浆内含量少,而在肿瘤中常出现胞浆内累积和核内表达。

因此,本研究拟通过检测β-catenin在大样本肝细胞癌病例中的表达,并对其阳性表达与肝细胞癌的临床病理特征进行分析,探讨其在肝细胞癌发生和发展中的作用,以期进一步阐明肝细胞癌的发病机制。

1 材料与方法1.1 材料石蜡标本:收集广州医科大学附属肿瘤医院病理科1998年1月~2008年1月明确诊断的肝细胞癌标本333例、癌旁肝组织168例及正常肝组织89例。

肝癌相关基因的筛选及功能研究的开题报告

肝癌相关基因的筛选及功能研究的开题报告

肝癌相关基因的筛选及功能研究的开题报告一、研究背景肝癌是最严重的癌症之一,具有高致死率和高再发率。

在许多国家,肝癌排名第五个最多的癌症,肝癌为全球肿瘤疾病致死的第三位原因。

在美国,从1990年到2014年,肝癌的发病率增长了 75%,死亡率增长了 169%。

另外,许多患者难以接受传统的治疗方案,并且缺乏有效的预防方法。

了解肝癌相关基因和它们的功能可以更好地理解肝癌的发生和治疗。

二、研究目的和意义本研究旨在筛选肝癌相关基因,并通过分子生物学、细胞生物学、生物信息学等手段,揭示这些基因的功能及其在肝癌发生中的作用,以期为肝癌的预防和治疗提供新的思路和方法。

三、研究内容和研究方法1. 筛选肝癌相关基因。

通过文献检索和数据库分析,筛选与肝癌发生相关的基因作为研究对象。

2. 生物信息学分析。

利用生物信息学工具对筛选出的基因进行生物信息学分析,了解这些基因的生物学特性和功能。

3. 基因表达谱分析。

采集正常肝组织和肝癌组织样本,利用实时荧光定量PCR和Western blotting技术, 检测筛选基因的表达水平变化,了解这些基因在肝癌发生过程中的表达变化情况。

4. 细胞实验。

通过移植实验、细胞增殖和凋亡实验等,探究肝癌相关基因对肝癌细胞的影响及相关机制。

5. 基因敲除实验。

采用CRISPR/Cas9技术,对筛选出的肝癌相关基因进行敲除实验,进一步确定基因在肝癌发生中的作用。

四、研究预期结果通过筛选和分析肝癌相关基因,揭示这些基因在肝癌发生中的作用及其相关机制,有望为肝癌的预防和治疗提供新的思路和方法。

IMP-3和Glypican-3在肝细胞癌中的表达及意义

IMP-3和Glypican-3在肝细胞癌中的表达及意义

IMP-3和Glypican-3在肝细胞癌中的表达及意义肝细胞癌(HCC)是一种恶性肿瘤,具有高度侵袭性和转移性。

虽然HCC的病因复杂,但HCC患者通常具有肝硬化、病毒性肝炎和酗酒等风险因素。

近年来研究表明,IMP-3和Glypican-3的表达水平在HCC中显著增加,因此这两种蛋白质成为研究HCC的热门靶点,本文将对其表达和作用进行探究。

IMP-3(Insulin-like growth factor 2 mRNA-bindingprotein 3)是一种RNA结合蛋白,存在于胚胎、癌变和干细胞中。

IMP-3在正常成人组织中表达较低,但在许多恶性肿瘤中表达升高。

在HCC中,IMP-3的表达水平较以往的良性疾病和正常组织中显著升高。

IMP-3通过促进肿瘤细胞增殖和控制细胞的分化和凋亡来增加肿瘤的恶性程度。

此外,IMP-3还能够提高HCC细胞对凋亡和化疗的耐受性。

IMP-3与HCC患者的预后也有关,IMP-3的高表达与较差的预后有关。

Glypican-3是一种外膜蛋白,在正常成人组织中表达较低。

但在多种癌症中,其表达水平会显著升高。

在HCC中,Glypican-3表达水平高达95%,因此成为研究HCC的热门靶点之一。

研究发现Glypican-3促进HCC的肿瘤发生和生长,同时抑制T细胞的免疫应答。

因此,Glypican-3可以作为HCC疫苗、免疫治疗和靶向治疗的潜在靶点。

IMP-3和Glypican-3在HCC中的表达水平不仅具有诊断HCC的价值,还可作为预测HCC预后和指导治疗的重要标志物。

一些研究表明,IMP-3和Glypican-3的联合检测效果较单个检测更好,并且能有效区分HCC和其他良性疾病,如肝血管瘤、肝脓肿等。

此外,IMP-3和Glypican-3还可作为靶向治疗的药物设计的依据。

例如,在胚胎发育中,IMP-3通过抑制微小RNA的表达来调节癌细胞的增殖和凋亡,因此小RNA-506的阳离子脂质纳米粒可以靶向IMP-3并有效抑制HCC的发生和生长。

肝癌耐药细胞中MDR1 mRNA、P-糖蛋白的表达变化及意义

肝癌耐药细胞中MDR1 mRNA、P-糖蛋白的表达变化及意义

本研 究 以人肝 癌 细胞 为研 究 对 象 , 在体 外 经 A r d 多
表达量 比较 ( ) i±
次筛选 、 传代建立肝癌细胞耐药模 型 H p 2A r研 eG d,
究肝 癌 耐药 细胞 MD 1m N R R A和 P糖 蛋 白的变 化 。 . 结果 表 明 , 癌 耐 药 细 胞 H p 2A r的 MD R 肝 eG d R1m .
目前 , 究 最 多 且 得 到 大 家 广 泛 认 可 的 是 研
MD 1途径 。 与 P糖 蛋 白 有 关 的 基 因有 3种 , R 即
体化治疗 , 以获得更好的治疗效果。 参 考文 献 :
[ ]魏 若 晶 , 宁 , 文增 , 膀 胱癌 组 织 中 MD 1 贾 杨 等. R基 因产 物 P — G 10的表达及 意义 [ ] P7 J .军医进 修学 院学 报 , 0 9 2 3 : 2 0 , ( 0)
1 材料 与方 法
3, 游 引 物 为 5一G C T G C_C A C_G3 , 下 A T C c T 1rA A 1r -
片段 大小为 1 7b 。 5 p
12 3 H p 2 H p 2A r .. eG 、 eG d 细胞 中 P糖 蛋 白检 测 方 一 法 采 用免疫 组 化 s P法 。取 对数 生 长 期 的 HeG p2 及 不 同 A r 度梯 度下 的 H p 2A r d浓 eG d 细胞 , 胞 爬 细 片后 经多 聚 甲醛 固定 , 入 14 0兔 抗 人 P糖 蛋 白 加 :0 . 单 克 隆抗体 , 剂 盒说 明染 色 。P糖 蛋 白阳性 细 胞 按 - 为肿 瘤细 胞膜 和 ( ) 或 细胞 质 出现 棕 黄 色 颗 粒 。每 组随 机 观察 1 高倍 视 野 , 算 P糖 蛋 白 阳性 细 0个 计 - 胞所 占百分 比 , 以此表 示 P糖蛋 白表 达量 。 一 12 4 统计 学方法 .. 差异 有统 计学 意义 。

核转录因子EBF3 mRNA在肝癌和食管癌组织中表达水平的研究

核转录因子EBF3 mRNA在肝癌和食管癌组织中表达水平的研究
M AO L—ig 。JNG R n —o g ,I i —u 。W ANG Hu— n ( . p r n f L brtr i n ,I o g rn JN X a y n , p o i 1De a t t a oaoy, mi me o ;ae o i l no gUnv r t Ja g uNa tn 2 0 1C ia l tdH s t Na t iesy,in s no g 2 6 0 , hn ; i p a o f n i 2De a t n o a oaoy . pr me t L br tr , f ;ae nog No 3Hoptl l t Na tn . si i d a f Na tn iesy,in s no g 2 6 0 , hn ) o no g Unv r t Ja g u Na tn 2 0 6 C ia i
关键 词 : 期 B细胞 因子 3 实时荧 光定 量 R P R; 肿瘤 ; 管肿瘤 早 ; T— C 肝 食
中 图分类号 : 3 . 3 R 3 ; 4 . 2 文献标 志 码 : 文章编 号 : 6 17 1 (0 8 0 — 6 —3 R7 0 4 ; 7 5 R4 6 6 A 1 7 —4 4 2 0 ) 10 40 St y o pr s i n o r y B l c or 3 m RNA ud n Ex e s o f Ea l Ce lFa t i s u s o i a y I e a O e l l r a o a e l Ca c n m a n Ti s e f Pr m r { p t c lu a nd Es ph g a r i o
Ab ta tOb e t e Toiv sia et esg ic n eo a l - elfco ( sr c : jci v n etg t h inf a c f ryB c l at r3 EBF )m RNA e e ntsu so r r e a i e 3 lv l is e fp i yh p — i ma

安罗替尼在肝癌中耐药的差异mRNA筛选

安罗替尼在肝癌中耐药的差异mRNA筛选

!8?@A!安罗替尼在肝癌中耐药的差异mRNA筛选谷俊谋1,王立博1,曾德俊1,陆勤伟1,董 凯1,梁若鹏1,王维杰1,朱荣涛1,孙玉岭1,2,31郑州大学第一附属医院肝胆胰外科,郑州450052;2郑州大学肝胆胰疾病研究所,郑州450052;3郑州市肝胆胰疾病基础与临床研究重点实验室,郑州450052摘要:目的 运用ceRNA芯片筛选可能参与肝癌细胞对安罗替尼耐药过程的mRNA。

方法 利用大剂量冲击联合低剂量诱导的方法建立对安罗替尼耐药的肝癌细胞,用CCK8实验进行验证耐药细胞在安罗替尼作用下的细胞增殖差异;运用ceRNA芯片检测耐药肝癌细胞与正常肝癌细胞的基因表达差异;运用实时荧光定量PCR(real-timePCR)对部分芯片测出的部分基因差异进行验证。

计量资料两组间比较采用独立样本t检验,Kaplan-Meier法对肝癌样本的总生存期进行生存分析,log-rank检验比较生存率差异。

芯片筛选结果使用Fisher精确检验。

结果 耐药肝癌细胞与正常肝癌细胞基因表达差异较大,通过缩减范围筛选出差异最大的10个基因进行分析。

与耐药和肿瘤生长相关的基因有4个,分别为BIRC2、BIRC7、ABCC2、MAPK8。

其中BIRC2、ABCC2、MAPK8表达水平下降(P值分别为0.0014、0.0012、0.0118),BIRC7的表达水平增多(P<0.001)。

real-timePCR的验证结论与芯片一致(t值分别为10 74、32 65、18 34、2 80,P值分别为0.0004、0.0001、0.0001、0.0448)。

BIRC7的高表达与MAPK8的低表达对应显著减少的生存期(P值分别0.0220、0.0056)。

结论 BIRC2、BIRC7、ABCC2、MAPK8在对安罗替尼耐药的肝癌细胞中差异表达,可能参与了肝癌细胞对安罗替尼耐药的过程。

关键词:肝肿瘤;安罗替尼;抗药性,肿瘤;RNA,信使中图分类号:R735.7 文献标志码:A 文章编号:1001-5256(2021)02-0358-06DifferentiallyexpressedmRNAinvolvedintheresistanceoflivercancertoanlotinibGUJunmou1,WANGLibo1,ZENGDejun1,LUQinwei1,DONGKai1,LIANGRuopeng1,WANGWeijie1,ZHURongtao1,SUNYu ling1,2,3.(1.DepartmentofHepatobiliaryandPancreaticSurgery,TheFirstAffiliatedHospitalofZhengzhouUniversity,Zhengzhou450052,China;2.InstituteofHepatobiliaryandPancreaticDiseases,ZhengzhouUniversity,Zhengzhou450052,China;3.ZhengzhouMunicipalKeyLaboratoryofBasicandClinicalResearchonHepatobiliaryandPancreaticDiseases,Zhengzhou450052,China)Abstract:Objective ToscreenoutthemRNAsinvolvedintheresistanceofhepatomacellstoanlotinibusingceRNAmicroarray.Meth ods High-doseshockcombinedwithlow-doseinductionwasusedtoculturehepatomacellsresistanttoanlotinib,andCCK8assaywasusedtoverifythedifferenceintheproliferationofdrug-resistanthepatomacellstreatedbyanlotinib.TheceRNAmicroarraywasusedtoscreenoutthedifferentiallyexpressedgenesbetweendrug-resistanthepatomacellsandnormalhepatomacells,andreal-timePCRwasusedtoverifythedifferentiallyexpressedgenesdetectedbysomemicroarrays.theindependentsamplest-testwasusedforcomparisonofcontinuousdatabetweentwogroups,andtheKaplan-Meiermethodwasusedtoanalyzetheoverallsurvivalofhepatomacellssamples,andthelog-ranktestwasusedtocomparesurvivalrates.Fisher’sexacttestwasusedforchipscreening.Results Therewasasignificantdifferenceingeneexpressionbetweendrug-resistanthepatomacellsandnormalhepatomacells,and10geneswiththegreatestdifferencewerescreenedoutforanalysisbyreducingtherange.Therewere4genesassociatedwithdrugresistanceandtumorgrowth,i.e.,BIRC2,BIRC7,ABCC2,andMAPK8.ThereweresignificantreductionsintheexpressionlevelsofBIRC2,ABCC2,andMAPK8(P=0 0014,0 0012,and0.0118),andtherewasasignificantincreaseintheexpressionofBIRC7(P<0.001).Theresultsofreal-timePCRwereconsistentwiththoseofmicroarray(t=10.74,32.65,18.34,and2.80;P=0.0004,0.0001,0.0001,and0.0448).Thehighexpres sionofBIRC7andthelowexpressionofMAPK8wereassociatedwiththesignificantreductioninsurvivaltime(P=0.0220and0.0056).Conclusion BIRC2,BIRC7,ABCC2,andMAPK8aredifferentiallyexpressedbetweenanlotinib-resistanthepatomacellsandnormalhepatomacellsandmaybeinvolvedintheresistanceofhepatomacellstoanlotinib.Keywords:LiverNeoplasms;Anlotinib;DrugResistance,Neoplasm;RNA,MessengerDOI:10.3969/j.issn.1001-5256.2021.02.022收稿日期:2020-09-29;修回日期:2020-11-27基金项目:国家自然科学基金(81870457,81900558)作者简介:谷俊谋(1993—),男,主要从事肝脏相关疾病的研究通信作者:孙玉岭,doctorssh@126.com 原发性肝癌是一种常见的恶性肿瘤,具有起病隐匿、进展迅速、恶性程度高、治疗难度大等特点[1]。

热点解读:肿瘤相关RNA甲基化经典套路,能发12分!

热点解读:肿瘤相关RNA甲基化经典套路,能发12分!

热点解读:肿瘤相关RNA甲基化经典套路,能发12分!RNA甲基化近来很受高分期刊的亲睐,让我们一起看看近日中山大学药学院王红胜课题组在Nature Communications杂志发表的文章RNA m6A methylation regulates the epithelial mesenchymal transition of cancer cells and translation of Snail的研究思路。

文章主要发现肿瘤细胞上皮间质化(EMT)过程中mRNA的m6A显著上调,其可通过促进EMT关键转录因子Snail的翻译从而促进肿瘤EMT及侵袭转移。

文中图片及数据均来源于Lin X, Chai G, Wu Y, et al. RNA m6A methylation regulates the epithelial mesenchymal transition of cancer cells and translation of Snail. Nat Commun. 2019;10(1):2065. Published 2019 May 6. doi:10.1038/s41467-019-09865-9.(篇幅较长,耐心读,一定受益匪浅)文章的主要内容为:与对照细胞相比,在肿瘤细胞EMT过程中,mRNAs的m6A修饰增加。

敲低甲基转移酶METTL3的表达或过表达ALKBH5可以抑制癌细胞迁移、侵袭和EMT。

m6A-seq和功能实验显示,Snail的表达受m6A动态调节,并且过表达Snail能逆转METTL3缺失导致的细胞EMT抑制。

另外,Snail mRNA的CDS区而非3’UTR区的m6A修饰。

功能研究摆明,Snail的CDS区域中的m6A 可以通过与YTHDF1和eEF-2的相互作用而触发其翻译延伸。

临床数据显示,肿瘤组织内含有与癌旁组织相比, METTL3和YTHDF1的表达量更高,这导致肝癌患者的预后更差。

极性蛋白AF-6mRNA在肝细胞肝癌中的表达及其对侵袭的影响

极性蛋白AF-6mRNA在肝细胞肝癌中的表达及其对侵袭的影响

极性蛋白AF-6mRNA在肝细胞肝癌中的表达及其对侵袭的影响吴天春;冯留顺;李捷;李德旭【期刊名称】《世界华人消化杂志》【年(卷),期】2015(0)31【摘要】目的:检测肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)癌组织、癌旁组织(adjacent normal liver tissue,ANLT)及不同侵袭能力细胞系中极性蛋白AF-6 m RNA的表达情况,分析其在不同组织及不同细胞系中的表达差异及意义.方法:利用实时定量PCR检测(real-time quantitative,q RT-PCR)检测AF-6 m RNA在3 0对癌组织、A N LT和4种细胞系(L 0 2、Hep G2、MHCC97-H和HCCLM3)中的表达情况.结果:AF-6 m RNA在93.3%(28/30)的HCC中呈低表达;正常肝细胞株L02中AF-6 m RNA含量明显高于肝癌细胞株(P<0.05);高侵袭转移能力的细胞系MHCC97-H及HCCLM3只有极低的AF-6 m RNA表达,且明显低于低侵袭转移能力的细胞系Hep G2(P<0.05).结论:AF-6 m RNA在肝癌中的低表达可能与高侵袭能力相关,提示AF-6 m RNA在将来可能会成为治疗侵袭性HCC的潜在靶点.【总页数】5页(P5045-5049)【关键词】极性蛋白;AF-6;mRNA;肝细胞肝癌;侵袭;转移【作者】吴天春;冯留顺;李捷;李德旭【作者单位】郑州大学第一附属医院肝移植科;郑州大学第一附属医院肝胆胰外科【正文语种】中文【中图分类】R735.7【相关文献】1.肝细胞癌组织中PTEN蛋白的表达以及与肝癌侵袭转移的关系 [J], 段小娴;陈立霞;曹骥;欧超;李瑗;苏建家;杨春;岳惠芬2.肝细胞肝癌中极性蛋白AF-6mRNA的表达及对侵袭的影响分析 [J], 孙鹏;宋远;周晓晶3.赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1在肝细胞型肝癌组织的表达及对细胞增殖及侵袭力的影响 [J], 何艳新;庞志刚;申东方;张发贵;刘超4.E钙粘蛋白、syndecan-1蛋白在肝细胞性肝癌中的表达与肝癌侵袭的关系 [J], 成峰;王学浩;钱建民;张峰;李相成5.KIAA1199在原发性肝细胞肝癌中的表达及其对肝癌细胞侵袭转移的影响 [J], 王伟忠因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

肝细胞肝癌组织中FN和PTEN基因表达水平及意义

肝细胞肝癌组织中FN和PTEN基因表达水平及意义

肝细胞肝癌组织中FN和PTEN基因表达水平及意义许桐林;吴金柱;蔡卫华【期刊名称】《交通医学》【年(卷),期】2016(030)005【摘要】目的:研究FN和PTEN基因在肝细胞肝癌中的表达情况,探讨其在肝细胞肝癌发生发展中的作用及意义。

方法:应用荧光实时定量PCR方法,检测84例肝细胞肝癌及癌旁组织中FN蛋白、PTEN蛋白、mRNA表达情况。

分析FN和PTEN基因表达及肝细胞肝癌的关系。

结果:FN蛋白主要定位于肝癌细胞外基质中。

FN mRNA在肝细胞肝癌中的阳性率为79.76%,高于癌旁肝组织的阳性率9.52%,差异具有统计学意义(P<0.05)。

PTEN蛋白明确定位于肝细胞胞质内。

PTEN mRNA在肝细胞肝癌中的阳性率为38.09%,明显低于癌旁肝组织的阳性率100%,差异具有统计学意义( P<0.05)。

FN在合并癌栓,淋巴结转移,AFP阳性,肿瘤数目多发的肝癌组织中的表达高,而在不同分化程度及不同肿瘤直径的肝癌组织中表达差异无统计学意义;PTEN在低分化肝癌细胞,合并癌栓,AFP阳性,淋巴结转移,肿瘤直径≥2cm的肝癌组织中表达较低,而在不同肿瘤数目的肝癌组织中表达无统计学意义,PTEN蛋白表达与HBsAg无关,与组织学分级及转移有关。

结论:肝癌组织中FN mRNA的表达量高于癌旁组织,而肝癌组织中PTEN mRNA的表达量低于癌旁组织,FN和PTEN基因可能与肝细胞肝癌的发生发展有关,其可能在肝癌的发生发展、侵袭转移中起一定的促进或抑制作用。

%Objective:To study FN and PTEN gene expression in hepatocellular carcinoma and to explore its role in the development of hepatocellular carcinoma. Methods: The expression of PTEN protein mRNA in 84 cases ofhepatocel-lular carcinoma and corresponding adjacent tissues was detected by real-time fluorescence quantitative PCR method. Anal-ysis of FN and PTEN gene expression and the relationship between hepatocellular carcinoma and hepatocellular carcinoma. Results:FN protein was mainly localized in the extracellular matrix of liver cancer. The positive rate of mRNA FN in hep-atocellular carcinoma was 79.76%(67/84), higher than the positive rate of 9.52%(8/84), and the difference was statistically significant (P<0.05). PTEN protein was localized in the cytoplasm of hepatocytes. The positive rate of mRNA PTEN in hep-atocellular carcinoma was 38.09%(32/84), which was significantly lower than that in the adjacent liver tissues 100%(84/84), the difference was statistically significant(P<0.05). Conclusion:The expression of FN mRNA in hepatocellular carcino-ma (HCC) is higher than that in adjacent tissues, and the expression of PTEN mRNAin hepatocellular carcinoma (HCC) is lower than in paracancerous tissues, FN and PTEN gene may be related with the occurrence and the development of hepa-tocellular carcinoma (HCC), which may play a role of promotion or inhibition in the occurrence, development, invasion and metastasis of hepatocellular carcinoma.【总页数】5页(P438-442)【作者】许桐林;吴金柱;蔡卫华【作者单位】南通市第三人民医院普通外科,江苏226006;南通市第三人民医院普通外科,江苏226006;南通市第三人民医院普通外科,江苏226006【正文语种】中文【中图分类】R735.7【相关文献】1.肝细胞肝癌组织中PTEN、CyclinD1及C-myc的表达及相关性研究 [J], 张小英;匡志鹏;何杰宾2.肝细胞性肝癌组织中Thrombin和VEGF的表达水平及其临床意义 [J], 杨天波;吴飞翔;王琪;黄山;赵荫农3.PTEN在肝硬化、肝细胞性肝癌组织中的表达及临床意义 [J], 黄宁霞;周彩云;潘美华4.FN及PTEN在肝细胞肝癌中的表达和临床相关性研究 [J], 吴金柱;蔡卫华;朱任飞;吴建军5.肝癌组织中FN和PTEN的表达及其临床意义 [J], 吴金柱;蔡卫华;陆仁飞;顾春燕;王卫兵;邱烽;许桐林因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

circRNA和母基因通过不同的pathway影响肝癌细胞的生长,迁移和侵袭

circRNA和母基因通过不同的pathway影响肝癌细胞的生长,迁移和侵袭

circRNA和母基因通过不同的pathway影响肝癌细胞的生长,迁移和侵袭研究背景肝细胞癌(HCC)是最常见的一种恶性肿瘤,同时,中国也是肝癌的癌症大国。

虽然现在的医疗诊断技术发展很快,但是,对与肝癌的现有诊断技术还是受限很大。

因此,开发新的诊断biomarker,并理解这些biomarker的作用机制,是很多科研人员想做的事情。

本研究从circRNA,一类非常适合做biomarker的候选分子出发,深入研究了一个锌指家族基因ZKSCAN1及其产生的circZKSCAN1,在HCC 中的作用机制及作为biomarker的潜在价值。

研究结果1.基因表达模式分析ZKSCAN1,是一个锌指蛋白家族,该家族基因在肿瘤发生,发展,转移和药物耐受方面都发挥着非常重要的作用。

同时,现有的研究也发现,ZKSCAN1基因的第二个和第三个外显子部分能形成一个circRNA,在人脑部和肝脏表达丰富。

因此,研究人员首先验证了ZKSCAN1和circ ZKSCAN1在HCC组织中的表达情况。

102个HCC 组织和配对癌旁的RT-PCR结果显示,他们在HCC样本中的表达显著降低。

进一步将ZKSCAN1和circ ZKSCAN1的表达与临床指标进行关联分析,发现低的ZKSCAN1表达与肿瘤大小显著相关;而circ ZKSCAN1的表达与不同肿瘤数目,硬化程度,血管侵袭,微血管侵袭,肿瘤grade都显著相关。

ROC曲线分析显示,circ ZKSCAN1的AUC 值达到0.834,敏感性和特异性能达到82.2%和72.4%,相比而言,ZKSCAN1的AUC值只有0.474。

因此,circ ZKSCAN1的表达更合适作为肿瘤组织的诊断biomarker。

2. circRNA与母基因表达相关性分析对于circRNA的研究,第一个想到的是circRNA的表达是否会和母基因表达有关联。

因此,研究人员先在不同人HCC细胞系中检测了ZKSCAN1 mRNA和circZKSCAN1的表达。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

lml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen公司),按照试剂说明,分别从正常肝组织和肝癌组织抽提总RNA。

4.cDNA样品合成、标记和杂交:利用Invitrogen公司提供的ds—cDNA合成试剂盒进行逆转录,合成双链互补DNA;利用Nimblegen公司的单色DNA标记试剂盒进行双链互补DNA的标记,使用分光光度计检测荧光标记效率,以保证后续芯片实验结果的可靠性;利用Nimblegen提供的杂化系统进行排列杂交,利用Nimblegen清洗液试剂盒进行清洗。

5.图像采集和数据分析:利用Axon基因芯片4000B芯片扫描仪(分子设备公司)扫描芯片的荧光强度,然后将扫描图像输入NimbleScan软件(版本2.5),以进行网格对齐与表达数据分析。

通过分位数标准化以及NimbleScan软件内将表达数据进行规范,规范化之后,然后利用AgilentGeneSpringSoftware软件进一步分析,进行GO分析以揭示这些差异表达的mRNA的生物功能和细胞定位。

结果
1.芯片杂交结果:共检测出17379条mRNA,将肝癌组mRNA表达量与正常对照组比较,其中2倍以上变化,差异有统计学意义(P<0.05)的mRNA认为是差异表达的mRNA,共991条,占所有基因总数的5.7%,2倍以上升高的共733条;其中2倍以上降低的共258条;5倍以上升高的共94条;其中5倍以上降低的共39条;10倍以上升高的共18条;其中10倍以上降低的共1l条(表1)。

10倍以上升高的mRNA共18条,按其由高到低排列依次为GPC3、RTN2、HLA-DQBl、FAT、LAMA3、MAGEA6、C100rfl0、CPE、VWF、FABP4、HLA-DRB5、TMEM98、CTGF、CRELD2、AZINl、COIAAl、PAIJ.D和EPDRl,GPC3升高最为明显,升高了192倍。

降低10倍以上降低的mRNA共11条,按其由高到低排列依次为:DMKN、MPPEDl、PZP、APO纠4,THRSP?PTHRl7CNDPI,HGFAC?SLC6A13,
・565・
MAMDC4和RAPHl。

2.利用火山散点图(Volcanoplots)分析2倍以上变化,差异有统计学意义(P<0.05)的mRNA,观察2倍以上变化mRNA的分布及统计学的差异。

3.GO分析将差异表达的mRNA进行功能分类和细胞定位:GO分析包括分子功能(Molecularfunctions)、生物过程(biologicalprocess)和细胞组成(cellulartom-ponent)3个部分。

(1)进行分子功能分析,将差异表达的基因功能分类,如图2,主要包括连接功能、催化活性和酶调节活性3类,其下又分为:蛋白连接、p53连接、转移酶活性、转录因子连接、转录抑制活性、羧酸连接、锰离子连接、结构特异性蛋白连接、生长因子连接、单链DNA连接、蛋白N端连接、蛋白转运活性、蛋白激酶抑
制活性、MAP激酶活性、周期素依赖蛋白激酶、蛋白丝氨彰苏氨酸/酪氨酸激酶等。

利用富集分析找出现在富集的功能分类如表1。

(2)进行生物过程分析,将差异表达的基因分类,主要包括细胞构成组件和生物学调节等。

利用富集分析找出现在富集的分类见表1。

(3)差异基因的细胞组成分析见表l。

图2差异基因的分子功能分析
讨论
HCC是最常见的恶性肿瘤之一。

目前的治疗手段很难根治肝癌,因此探讨肝癌发生的分子机制及如何控制肝癌转移和术后复发已成为研究的热点‘1|。

在我国主要为HBV相关性肝癌,肝癌的发生是众多分
表1GO分类富集分析
细胞周期素蛋白激酶抑制剂活性
二肽激酶活性
磷脂酰肌醇-3,4,5-三羟甲基氨基甲烷磷酸盐连接核苷二磷酸激酶活性
血小板源性生长因子连接
维生素转运活性
神经鞘氨醇酶活性
周期素依赖蛋白激酶
蛋白丝/苏氨酸激酶抑制剂
p53连接7.15维甲酸代谢
7.15UTP代谢
5.90UTP生物合成
5.90GTP代谢
5.36C佃代谢
4.913上调细胞外分泌
4.913下调细胞周期依赖性蛋白激酶活性
4.62核酸的生物合成
4.37核酸代谢
4.37CTP生物合成
6.34蛋白酶体复合物6.97
5.7l转录因子ⅡH复合体5.23
5.71内质网一高尔基体间隔膜4.51
5.71小核仁核糖蛋白体复合物4.42
5.19循环内含体膜4.26
5.19线粒体小核糖体亚基4.26
5.19细胞器小核糖体亚基4.26
5.19MHC-Ⅱ复合物4.11
5.19染色质重塑复合体3.83
5.19SWI/SNF型复合体
3.83。

相关文档
最新文档