肠道病毒71型收获液蛋白成分的分析
肠道病毒71型致轻症手足口病患儿血清蛋白质组分析
论 鉴定得 到 Ｅ Ｖ 一 ７ １ 感染后轻症手足 口病 患者血清 中差异表达 的多种蛋 白 ， 这些与炎症反应 、 免疫应答 和神经 系统相 关蛋 白质 的差 异表达与病毒 的感染和宿 主的防御过程有关 ， 为进一步研究 Ｅ Ｖ 一 ７ １ 致病机 理提供一定的理论 基础 ， 也 为 寻找潜在 的治疗靶点提供 了思路 。 关键词 ： 手足 Ｉ ： １ 病； 肠道病毒一 ７ ｌ 病毒 ； 差异凝胶 电泳 ； 蛋 白质组
结果 建立 了轻症手足 口病与正 常对 照的 ２ Ｄ — Ｄ Ｉ Ｇ Ｅ图谱 ， 经 ＭＡ Ｌ Ｄ Ｉ — Ｔ Ｏ Ｆ — ＭＳ ／ ＭＳ 鉴定得到 ｌ ４ 个 差异 蛋白。与对 照组 相比， 在轻症手 足 口病组 中表达 下调的是 ： Ａ ｌ ｐ ｈ ａ 一 ２ 一 ａ ｎ ｔ ｉ ｐ ｌ ａ ｓ ｍｉ ｎ 、 Ａ ｎ ｔ ｉ ｔ ｈ ｒ ｏ ｍ ｂ ｉ ｎ —Ｉ Ｉ Ｉ 、 Ｖ ｉ ｔ ａ ｍ ｉ ｎ Ｄ — ｂ ｉ ｎ ｄ ｉ ｎ ｇ ｐ ｒ ｏ ｔ ｅ ｉ ｎ 、 Ｆ ｉ ｂ ｉ ｆ ｎ ｏ ｇ ｅ ｎ
Ｃ ｏ ｒ ｒ ｅ ｓ ｐ ｏ ｎ ｄ ｉ ｎ ｇ ａ ｕ ｔ ｈ ｏ ｒ ： Ｃ Ｈ Ｅ Ｎ Ｇ Ｊ ｉ ｎ — ｑ ｕ ａ ｎ， Ｅ — ｍａ ｉ ｌ ： ｃ ｉ ｆ ｎ ｑ ｕ ａ ｎ ＠ ｖ ｉ ｐ ． ｓ ｏ ｈ ｕ ． ｃ ｏ ｍ
中图分类 号 ： Ｒ ３ ７ ３ ． ２ 文献标识码 ： Ａ 文章编 号 ： １ ０ ０ ９ — ９ ７ ２ ７ （ ２ ０ １ ４ ） ４ — ３ ８ ７ — ０ ５
Ｐｒ ｏ ｔ ｅ ｏｍｉ ｃ ａ ｎ ａ ｌ ｙ ｓ ｉ ｓ ｏ ｆ ｓ ｅ ｒ ｕ ｍ ｐ ｒ ｏ ｔ ｅ ｉ ｎ ｓ ｆ ｒ ０ ｍ ｍｉ ｌ ｄ ＨＦ ＭＤ ｃ ｈ ｉ ｌ ｄ ｒ ｅ ｎ ｉ ｎ ｆ ｅ ｃ ｔ ｅ ｄ ｂ ｙ ｅ ｎ ｔ ｅ ｒ ｏ ｖ ｉ ｒ ｕ ｓ ７ １
肠道病毒71型强神经毒分离株VP1蛋白的表达鉴定_胡燕
文章编号:1006-3110(2012)11-1615-03#论著#肠道病毒71型强神经毒分离株VP1蛋白的表达鉴定胡燕,白冰珂,沈宏辉,侯俊,高蓉,罗声栋,貌盼勇摘要:目的利用大肠杆菌原核表达系统表达肠道病毒71型强神经毒分离株V P1蛋白,为抗体制备和病毒诊断试剂盒的开发奠定基础。
方法利用一步法RT-PCR扩增出病毒VP1基因,构建重组原核表达质粒,I PT G诱导后经SDS-PAG E和Western blot验证蛋白表达的特异性。
结果重组质粒在1mmol/L的IPT G37e诱导6h后可诱导表达得到约33KD的蛋白,且表达的蛋白主要以不溶性的包涵体形式存在。
VP1蛋白特异性单抗和His蛋白单抗验证了蛋白表达的特异性。
结论获得特异性的EV71病毒河南分离株V P1蛋白,可用于开发病毒诊断试剂盒。
关键词:肠道病毒71型;V P1蛋白;原核表达中图分类号:R373.2文献标识码:A DOI:10.3969/j.iss n.1006-3110.2012.11.005Expression and Identification of VP1Protein of Enterovirus71Isolates from Henan H U Y an,Bai Bing-ke,S hen H ong-hui,et al.(302M ilitary H osp ital of China,Beij ing100039,China)Abstract:Objective T o expr ess VP1pr otein of enterovir us71iso lates from Henan Province in E.coli,and to prov ide basis for antibody preparation and virus detection kit development.Methods V P1gene was amplified by one-step RT-PCR and cloned into pET28a to construct the recombinant prokaryotic ex pression plasmid,pET-VP1.Specific VP1protein was ex pressed by IPT G-induction and test ed by SDS-PAGE and Western blot.Results A protein of about33K D w as obtained six hours after IPT G-induction at37e.I t mainly ex isted as an insoluble inclusion body.T he specificity of the expressed protein was indicated by W estern blo t with anti-V P1monoclonal antibody and anti-His mo noclonal antibody.C onclusions T he specific V P1pro tein of enterovirus71isolates from Henan is obtained.It can be applied in the development of virus diagnosis kit.Key words:Enter ovirus71;V P1protein;Prokaryotic expression手足口病是婴幼儿的一种常见传染病。
湖北肠道病毒EV71型流行株VP1基因以及蛋白结构特征分析
为９ ６ ． ５ ～９ ８ ． ７ 和９ ８ ． ３ ～１ ０ ０ 。ＶＰ １蛋 白特 征 分 析 发 现 该 区 主 要 免 疫 表 位 均 没 有 发 生 变异 且 存 在 较 多 亲 水 性 区域 。 二 级 结 构 以无 规 则 卷 曲 为 主 ， 其 次 为 ０片 层 。 蛋 白质 同源 建 模 未 发 现 不 同毒 株 ｒ ． － Ｊ ＶＰ １蛋 白 三 级 结 构 差 别 。结 论 ２ ０ １ １ 年湖
ｏ ｆ ＶＰ１ ｇ ｅ ｎ ｅ ｏ ｆ ｅ ｎｔ ｅ ｒ ｏ ｖ ｉ ｒ ｕ ｓ ７１ ｓ ｔ ｒ ａ ｉ ｎ ｓ ｉ ｎ Ｈｕ ｂ ｅ ｉ Ｐｒ ｏ ｖ ｉ ｎｃ ｅ
Ｌ Ｉ Ｊ ｉ ｎ ｇ， Ｌ ＥＩ Ｙａ — ｋ ｅ ， Ｊ Ｉ ＡＮＧ Ｘｉ ａ ｏ — ｑ ｉ ｎ ｇ， ＹＡＮＧ Ｚ ｈ ａ ｏ — ｈ ｕ ｉ ， ＺＨＡＮＧ Ｔｉ ｎ ｇ， ＺＨＡＮ Ｊ ｉ ａ ｎ — ｂ ｏ
湖北肠道病毒 Ｅ Ｖ ７ １型 流 行 株 Ｖ Ｐ １基 因 以及 蛋 白结 构 特 征 分 析
李 静， 雷亚克 ， 蒋 晓清 ， 杨朝晖， 张 婷， 占建波
摘 要 ： 目 的 全 面 研 究 和 了解 ２ ０ １ １年 湖 北 省 肠 道 病 毒 ７ １型 的 ＶＰ １基 因及 蛋 白结 构 特 征 ， 分析 Ｅ Ｖ７ １型 病 毒 在 湖 北 省 的 基 因型 别 ， 探 讨 该 型 病 毒 在 全 省 的地 理 分 布 特 征 。 方 法 对 ２ ０ １ １年 湖 北 省 ８个 区市 的 ２ ｏ株 Ｅ Ｖ７ １流 行 株 进 行 ＶＰ １区全 长 基 因序列测定 ， 并 对 核 苷 酸 序 列 进 行 同源 性 比较 及 系 统进 化 分 析 ， 并 对 ＶＰ １蛋 白序 列 的 亲 水 性 、 柔 韧 性 等 二 级 和 三 级 结 构 进
肠道病毒71型灭活疫苗(Vero细胞)说明书
（2） 免疫原性及持久性研究结果 本研究免疫原性观察亚组进行了免后为期两年的持久性研究，评价接种两剂
免疫后抗 EV71 中和抗体阳转率（免前抗体阴性易感者免后中和抗体≥1:8，免前 抗体阳性非易感者免后中和抗体 4 倍及以上增长）和抗体几何平均滴度值 （GMT）。结果如表 5 所示。
表5
统计项
免疫原性亚组人群全程免疫后不同时期抗体水平和阳转率(PPS)*
6
7
0
1342.9 0.000
-
16
1319.7
1.212 0.743-1.979
发病保护率
（95%CI）
82.7(40.9-94.9) 96.6(86.0-99.2)
-
本品还进行了接种第2年的临床持续保护力观察(试验组观察4881.0人年，安 慰 剂 组 观 察 4771.8 人 年 ) ， 估 计 疫 苗 预 防 EV71 感 染 手 足 口 病 的 保 护 率 为 95.1%(95%CI:63.6-99.3)。
其他病毒类灭活疫苗在上市使用过程中还观察到如下不良反应：1）接种部 位局部淋巴结肿大；2）疫苗任一组分引起的变态/过敏反应：荨麻疹、过敏性皮 疹和紫癜、过敏性休克。3）出现惊厥（伴或不伴发热）等；虽然在本品上市前 临床研究中尚未观察到前述不良反应，但仍需在本疫苗使用中关注。
如出现以上未提到的不适感觉，应及时与医生取得联系。 【禁忌】
①患有血小板减少症或者出血性疾病者，肌肉注射本疫苗可能会引起出血。 ②正在接受免疫抑制治疗或免疫功能缺陷的患者，接种本疫苗产生的免疫 反应可能会减弱。接种应推迟到治疗结束后或确保其得到了很好的保护。 对慢性免疫功能缺陷的患者，即使基础疾病可能会导致有限的免疫反应， 也应推荐接种本疫苗。 ③未控制的癫痫患者和其他进行性神经系统疾病患者，如格林巴利综合征 等。 （4）同其它疫苗一样，接种本疫苗的人群不一定产生 100%的保护效果。 （5）本疫苗须置于儿童不可触及处。 （6）使用时应充分摇匀，如疫苗瓶有裂纹、标签不清或失效者、疫苗瓶内有异
肠道病毒71型分子生物学研究
肠道病毒71型分子生物学研究【摘要】就有关EV71病毒生物学特征、病毒的复制、诊断技术、EV型别鉴定及分子流行病学等方面作一综述。
【关键词】肠道病毒71型基因型分子流行病学Molecular Biological Research on 7I Intestinal VirusLin Xin, Han GuangenZhejiang Chinese Medical University, Hangzhou(310053)Abstract: It makes review on EV 71 intestinal virus about its biological characteristic, replication, diagnosis technology, EV type identification and molecular epidemic science.Key words: intestinal virus; EV 71; gene type; molecular epidemic science近年，肠道病毒71型(EV71)感染在世界各地不断出现爆发流行的报道。
EV7I感染主要引起手足口病，但所致的神经系统并发症可导致死亡或永久性肌麻痹。
本文从有关EV71病毒生物学特征、病毒的复制、诊断技术、EV型别鉴定及分子流行病学等方面作一综述。
1 病毒的一般特征1.1 病毒颗粒结构及理化性质肠道病毒71型(EV71)属于小RNA病毒科(Picornaradae)肠道病毒属(Enterovirus)的成员［1］。
EV71的病毒颗粒为二十面体立体对称的球形结构，无包膜和突起，直径大约在24～30nrn，核酸为单股正链RNA。
病毒粒子的衣壳组成非常复杂，首先由VPI、VPZ、VP3和VP4四种外壳蛋白构成原聚体(Protomer)，再由5个原聚体拼装成具有五聚体样结构的亚单位(Pentamer)。
肠道病毒71型重组VPl蛋白的原核表达及初步鉴定
抗体 （ 国 Ｓｇ ， ： ０ ） ３ 美 ｉｍａ １ ２０ ０ ，７Ｃ孵 育 ｌ ， Ｂ Ｔ洗 ５ ｈＰ Ｓ 次后 用显 色液显 色 ，Ｍ Ｏ 终止 反 应 ， ２ Ｈ Ｓ 酶标 仪 检 测 吸光度 Ａ值 。 １ ６ ２ Ｗｅｔｒ ｌｔ 定 ： 纯 化 的 蛋 白经 Ｓ Ｓ ． ． ｓｅｎ Ｂ ｏ 鉴 将 Ｄ — Ｐ ＡＧＥ电泳后 ， 移 至 硝 酸纤 维 素膜 上 。 用 ３ 脱脂 转 ％ 奶 室温封 闭 １ ， 入病人 血清 （ ：０ ） 温轻柔 振荡 １ ｈ加 １５０ 室
１ 江 苏省 疾病预 防控 制 中心 ， ． 南京 ２ ０ ０ ；． １ ０ ９ ２ 南京 医科 大 学公 共卫 生 学院 ， 南京 ２ ０ ２ ； １０ ９ ３ 南京农业 大 学兽 医学 院， ． 南京 ２ ０ ９ １０ ５
摘 要： 目的 利 用 大 肠 杆 菌原 核表 达 系 统 表 达 并 纯 化 肠 道 病 毒 ７ ｌ型 （ Ｖ７ ） １蛋 白 ， 对 重 组 蛋 白 功 能 进 行 初 步 鉴 Ｅ １ ＶＰ 并
ｈ Ｐ Ｓ洗 ３次 每 次 洗 １ ｎ ，Ｂ ０ ｍｉ。加 入 ＨＲＰ标 记 抗 人
ＩＧ 全 抗 （ ： ０ ） 温轻 柔振 荡 １ｈ后 ， Ｂ ｇ １ ２０ ０ 室 Ｐ Ｓ洗 ３次
后 Ｄ ＡＢ 显 色 。
上清 收 获 细 胞 待 用 。采 用 Ｇ ＡＧ Ｎ 公 司 的 Ｒ ａｙ Ｉ Ｅ Ｎｅｓ
ｐ ｅ ｓ ｄ ａｎ ｒ ｓ ｅ ｄ ｐｕｒｆｅ ． Ｔ ｈ ｅ ｏ ｂｉ ｎｔＶ Ｐ１ｃ ｎ ｂ ｏ ｄ ｂ ｉｉ ｄ ｅ ｒ ｃ ｍ ｎａ ａ ｅ ｆ ｕｎ ｙ ＥＶ ７１ ｐ ｉｉ ｅ ａ ｗ ｉｈ ｈｇｈ ａｆｉ ｔ ｎｄ ｓ ｅ ｉｉｉｙ ｉ ＳＡ ｎｄ ｏｓｔｖｅｓ ｒ ｔ ｉ ｆｎｉｙ ａ ｐ ｃｆｃｔ ｎ ＥＩＩ ａ
我国分离的肠道病毒71型_SHZH03病毒株_全基因组核苷酸序列分析
我国分离的肠道病毒71型(SHZH 03病毒株)全基因组核苷酸序列分析周世力1,2,李琳琳23,何雅青2,杨洪2,喻子牛1,金奇2(1.华中农业大学生命科学技术学院,武汉 430070;2.中国疾病预防控制中心 病毒基因工程国家重点实验室,北京 100052)摘要:对肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)中国(深圳)分离株SHZH03进行了全基因组(未包括多聚腺苷尾)7406个碱基的核苷酸序列测定。
结果表明,SHZH03株与其它肠道病毒71型毒株相比,在编码区没有核苷酸的缺失和插入,其5′U TR 和3′U TR 区的长度和序列有一定的差异。
核苷酸同源性比较结果表明,在P1区SHZH03株与SHZH98株、中国台湾流行株(TW2086、TW2272)的同源性较高(分别为92.5%,90.1%和87.9%),与新加坡流行株SIN5666、SIN5865及标准株MS 、BrCr 的同源性则在81%左右,而与Coxsackievirus A16(Cox.A16)的同源性最低(63.6%)。
氨基酸同源性比较结果表明,在P1区SHZH03株与Cox.A16的同源性最低,但在P2和P3区SHZH03株与Cox.A16的同源性最高。
P1区的遗传进化分析表明,SHZH03株和中国台湾1998年流行的EV71毒株的亲缘关系较近,属于同一型(genogroup ),而与标准株BrCr 和MS 的亲缘关系较远。
上述结果有助于肠道病毒71型的基础研究和中国对于EV71所致疾病的预防。
关键词:肠道病毒71型;核苷酸序列分析;同源性分析中图分类号:R373.2 文献标识码:A 文章编号:1000-8721(2004)01-0007-05收稿日期:2003-11-19;修回日期:2003-12-03作者简介:周世力(1966-),男,江汉大学副教授,博士,从事病毒基因工程方面的研究。
3同等贡献通讯作者:金奇,中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室研究员,北京100052,E 2mail :zdsys @ 肠道病毒71型(enterovirus71,EV71)是小RNA 病毒科(Picornaviridae )肠道病毒属(En 2terovi rus )成员,其感染主要引起患者手足口病(hand 2foot 2and 2mouth disease ,HFMD )。
肠道病毒71型(EV71)的检测
肠道病毒71型（EV71）的检测作者：张宪华来源：《中国现代医生》2015年第20期[摘要] 目的探讨肠道病毒71型（EV71）的检测方法。
方法采用酶联免疫法（ELISA 法）、免疫胶体金法（胶体金法）、荧光定量PCR法（PCR法）对1399例手足口病患儿的样本进行检测，并对检测结果进行卡方检验。
结果 1399例手足口病患儿样本ELISA法、金标法、PCR法结果的阳性率分别为37.8%、36.0%、39.8%，三种方法检验结果无显著性差异（χ2=4.197，P>0.05）。
ELISA法与胶体金法及PCR法结果比较均无显著性差异（χ2=0.959，P>0.05；χ2=1.180，P>0.05）；胶体金法与PCR法两者之间差异有统计学意义（χ2=4.26，P[关键词] 肠道病毒；EV71；胶体金法； ELISA；PCR[中图分类号] R446.6；R450 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701（2015）20-0093-03Detection of enterovirus 71 （EV71）ZHANG XianhuaLaboratory Department， the Fifth People's Hospital of Anyang City in He'nan Province，Anyang 455000， China[Abstract] Objective To investigate the enterovirus 71 （EV71） detection methods. Methods Samples from 1399 children with hand， foot and mouth disease were detected by enzyme-linked immunosorbent assay （ELISA）， immune colloidal gold method （colloidal gold method） and fluorescence quantitative PCR method （PCR method）， and the chi-square test was conducted on these detention results. Results The positive rates of samples from 1399 children with hand， foot and mouth disease by the ELISA method， the gold standard method and the PCR method were 37.8%，36.0% and 39.8%， respectively， without significant difference（χ2=4.197， P>0.05）. The colloidal gold method and the PCR method had no significant differences （χ2=0.959， P>0.05；χ2=1.180， P> 0.05）. The colloidal gold method and the PCR method， had significant difference between the two methods （χ2=4.26， P[Key words] Enterovirus； EV71； Colloidal gold method； ELISA； PCR肠道病毒71型（EV71）是一类常见的经呼吸道和消化道感染人体的病毒。
肠道病毒71型检测与VP1基因特征分析
肠道病毒71型检测与VP1基因特征分析摘要】目的分析肠道病毒71型2011年本地流行株VP1基因特征学特征。
方法收集2011年本地手足口病患者临床标本332份，进行EV71荧光定量RT-PCR鉴定，采用RT-PCR对15株分离到的EV71进行VP1编码区基因扩增，并对扩增产物进行核苷酸序列测序和分析。
根据VP1测序结果与国内外报道的各基因型和基因亚型EV71 VP1序列进行同源性和亲缘进化分析。
结果 165份标本鉴定为EV71，分离株的VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别是97.5%～99.9%和99.4%～100%。
与C4a亚型的核苷酸和氨基酸最高。
亲缘进化树显示，本地株全部属于C4基因亚型的C4a进化分支。
结论本地区分离的EV71与近几年国内其他地区EV71分离株亲缘关系很近，有共同进化的趋势，属于C4基因亚型的C4a进化分支，并存在多个传播链。
【关键词】肠道病毒71型基因特征遗传进化手足口病（hand，foot and mouth disease， HFMD）是由多种肠道病毒引起的，严重威胁儿童健康的全球性传染病。
临床表现为手、足、口腔等部位的疱疹，伴有发热、咽痛、倦怠乏力等症状，个别重症患儿病情进展快，可发生死亡。
为全面了解本地区手足口病病原学分布的情况，对本市446份手足口病临床诊断标本进行检测，现将结果报告如下。
1 材料和方法1.1 标本来源2009～2010年各医院送检的HFMD临床诊断标本共332份，其中粪便、咽拭子、肛拭子、脑脊液、气管洗液标本各201、72、43、12、4份。
1.2 核酸提取和荧光定量RT-PCR检测采用QIAGEN Reansy Mini Kit试剂盒，操作步骤参照Rneasy Mini kit Handbook。
上海之江生物科技有限公司生产的肠道病毒71型荧光检测试剂盒和柯萨奇病毒A 组16型荧光检测试剂盒。
1.3 EV71 VP1基因扩增将检测为EV71阳性的病毒核酸进行全长VP1编码区的核苷酸序列测定和分析。
肠病毒71型Enterovirus71
EV 71感染控制的展望 1. Public health surveillance 公共衛生的監測
2. Antiviral agents 抗病毒的試劑 “WIN” 讓病毒與受器接合後，核殼蛋白 仍穩定存在，避免脫殼的發生（phase III）
Vaccine development 疫苗的發展
沒有症狀的感染多發燒或類似一般感冒的症狀特殊臨床表現手足口病handfootandmouthdisease手腳與腎部周圍出現隆起的紅疹頂端大多有小水泡口腔也會有潰瘍疱疹性咽唊炎herpangina發燒口腔後部出現水泡破掉成潰瘍無菌性腦膜炎病毒性腦炎心肌炎肢體麻痺症候群急性出血性結膜炎acutehemorrgagicconjunctivitis?1998台灣ev71所引起的腦膜炎可分為3種等級肌肉痙攣運動失調可復原5有神經性後遺症肌肉痙攣運動失調顱骨神經麻痺可復原20有神經性後遺症肌肉痙攣運動失調顱骨神經麻痺併發快速心肺衰竭神經性肺水腫死亡率80復原者都有神經性後遺症?可當作臨床上重症的重要的指標?引起神經性肺水腫的原因
今日新聞網
腸病毒疫苗 9月可望人體試驗 兩岸將先 舉辦專家會議(2010/05/18 19:56)
由於國家衛生研究院研發近10年的腸病毒71型疫苗，可望今 年9月展 開人體試驗，關於這點，楊志良也透露，由於兩岸在對腸病 毒疫苗研發進度都差不多，所以最近對岸要在上海召開一個 專家會議；另外一個，結核病抗藥性，多重抗藥病人，這是 兩岸都非常頭痛的，這方面「變成我們做東」，在下半年在 台北舉行，來共同合作。 根據國衛院與衛生署食品藥物管理局「腸病毒71型疫苗開發 諮詢輔導第5次會議」結論，基於安全考量，腸病毒71型疫 苗第 1型臨床試驗會先以成人為受試對象，分低劑量組與高 劑量組，每組30人各打2劑。 今日新聞網
肠道病毒71型VP1蛋白结构与功能的生物信息学分析
变链菌和血链菌全代谢途径分析李鸣宇上海交大附属九院 ２０００１１目的 比较变链菌和血链菌全代谢途径。
方法 依据ＫＥＧＧ数据库，对变链菌和血链菌的全部代谢途径作逐项比对。
结果 变链菌和血链菌参与了８５个代谢途径。
在最原始的糖酵解途径，二者有多数相同的酶。
与一般厌氧菌相似，二者均无完善的三羧酸循环途径。
二者共有相似的磷酸戊糖途径，但血链菌比变链菌多了三个酶。
二者的脂肪代谢和合成途径完全相同，核酸代谢途径相同或很相似。
氨基酸代谢则差异较大，变链菌无半胱氨酸和甲硫氨酸代谢酶，血链菌无苯丙氨酸代谢酶，变链菌的丙氨酸、天门冬氨酸、谷氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸代谢酶也很少。
二者的淀粉和蔗糖代谢，以及磷酸酶转运系统和丙酮酸也基本相似。
关键词：变异链球菌；血链菌；代谢网络肠道病毒７１型ＶＰ１蛋白结构与功能的生物信息学分析徐鸿绪１周惠玲１胡旭初２１．中山大学附属第一医院检验医学部２．中山大学中山医学院病原生物学教研室 ５１００８０目的 分析肠道病毒７１型（ＥＶ７１） ＶＰ１基因及其编码蛋白的结构与功能，用于指导其生物学功能的实验研究。
方法 利用多种生物信息在线分析工具和分析软件包分析ＥＶ７１ ２００８－ＧＺＣＨ０７株、Ｐ１基因及编码蛋白与其他代表株的序列，进行多序列同源比对，并构建分子进化树；预测该基因编码的蛋白质的理化特性，二级结构、三维结构等结构特性，酶学特性和抗原表位等免疫学特性。
结果 ２００８－ＧＺＣＨ０７株与ＺＪ００１株同源性最高为９７％，与Ｈｕｍａｎ ｃｏｘｓａｃｋｉｅｖｉｒｕｓ Ａ １６同源性最低，与ＥＶ７１Ａ、Ｂ、Ｃ型病毒的同源性为８６％～９８％； ２００８－ＧＺＣＨ０７株与ＺＪ００１株和ＢＪ０８－Ｚ０２５－５株的进化距离较近，属于Ｃ４亚型；Ａ、Ｂ、Ｃ三型ＶＰ１蛋白中，ＧＺＣＨ０７株ＶＰ１编码蛋白与Ｂ、Ｃ型进化距离较Ａ型为近；该ＶＰ１蛋白基因全长５１０ｂｐ，开放读框位于１１６ｂｐ～５１０ｂｐ区域，编码１３２个氨基酸，等电点为４．３９；该蛋白富含α螺旋和无规卷曲，无跨膜区域，含５个高疏水性区域，属于胞外蛋白。
肠道病毒71型VP1蛋白二级结构及B细胞表位的预测
肠道病毒71型VP1蛋白二级结构及B细胞表位的预测王锦;许国章;倪红霞【摘要】The purpose of this study was to predict the secondary structure and B cell epitopes of enterovirus type 71 of VP1 Gene of C4 subgenotype, so as to provide theory evidence for the study of vaccine preparation for EV71. EV71 strains were isolated from hand ,foot and mouth disease in Ningbo in 2010. Homology and phylogenetic analysis based on VP1 with others EV71 have published in GenBank were conducted. The secondary structure of EV71 based on VP1 was analyzed using the GOR4 and SOPMA,and the B cell epitope of EV71 was predicted by combining the hydrophilicity, flexility and surface probability. The Ningbo strain shared the highest homology of nucleotide and amino acid with the type C4a were 93. 6%-99.3% and 98. 35%-100%, phylogenetic analysis revealed that Ningbo strains clusterd within the C4a evolution branch of C4 subgenotype. The secondary structure of EV71 VP1 showed random coils and |3-sheet mainly with a number of antigen index higher section. The B cell epitopes was probably located at the regions of 39-40,159-167.212-220, and 287-290 of VP1 Gene. The secondary structure and B cell epitopes of EV71 VP1 could be predicted by bioinformatics methods, which providing theory evidence for the study of vaccine preparation for EV71.%目的预测C4基因亚型肠道病毒71型的VP1蛋白二级结构及B细胞表位,为EV71疫苗研制提供理论基础.方法本研究将宁波地区EV71分离株与国内外EV71代表株进行同源性分析和并构建亲缘进化树.以VP1基因序列为材料,应用EX-PASY服务器上的GOR4、SOPMA两种方法分析预测蛋白质二级结构,并结合蛋白质的亲水性、柔韧性、表面可能性等指标综合评价VP1蛋白的B细胞抗原表位.结果同源性分析和亲缘进化分析得出,2010年宁波EV71分离株属于C4a基因亚型,与基因库检索到的C4a基因亚型代表株核苷酸和氨基酸同源性较高,分别为93.6％～99.3％和98.3％～100％.VP1蛋白二级结构以无规则卷曲和β-片层为主,有多处抗原指数较高的区段,结合亲水性、柔韧性、表面可能性等指标,综合预测VP1蛋白的B细胞抗原表位在第39～40、159～167、212～220、287～290位氨基酸残基的可能性较大.结论 EV71 VP1蛋白多个区段具有抗原潜力通过生物信息学方法预测VP1蛋白二级结构及B细胞表位为EV71疫苗研制提供理论基础.【期刊名称】《中国人兽共患病学报》【年(卷),期】2011(027)010【总页数】4页(P905-908)【关键词】肠道病毒71型;VP1;蛋白质二级结构;B细胞表位【作者】王锦;许国章;倪红霞【作者单位】宁波大学医学院,宁波 315211;宁波市疾病预防控制中心,宁波315010;宁波市疾病预防控制中心,宁波315010【正文语种】中文【中图分类】R373.2肠道病毒71型（Enterovirus 71，EV71）是小RNA病毒科（Picornaviridae）肠道病毒（Enterovirus，EV）A组成员，1969年由Schmidt等从美国加利福尼亚州患有中枢神经系统疾病的婴儿粪便标本中分离到。
1543例肠道病毒71型抗体(EV71-IgM)检测结果分析
1543例肠道病毒71型抗体（EV71-IgM）检测结果分析摘要] 目的：探讨小儿手足口病的临床特征及诊治方法。
方法：对1543例普通手足口病的临床资料进行回顾性分析。
结果：手足口病多见于5岁以下的婴幼儿及学龄前儿童，男性患儿发病率较女性患儿多；发病时间集中在春夏季。
手足口病患儿均有不同程度的皮疹表现；所有患儿有口腔疱疹或溃疡；约有50.8%的患儿存在发热。
结论：经喜炎平、利巴韦林、施保利通片、蒲地蓝等综合治疗，全部治愈，预后较好。
[关键词] 手足口病；临床分析【中图分类号】R725.1 【文献标识码】A手足口病(Hand-Foot-Mouth disease，HFMD)是由肠道病毒引起的一种常见疾病，严重危害儿童健康。
2008 年5月被列入《中华人民共和国传染病防治法》法定丙类传染病。
其病原体复杂，引发手足口病的肠道病毒有20 多种(型)，包括柯萨奇病毒A 组的16、4、5、9、10 型等，B 组的2、5 型等，以及肠道病毒71 型等，其中以柯萨奇病毒A16 型(Cox A16)和肠道病毒71 型(EV 71)最为常见。
EV71病毒与CA16 型病毒感染虽然在临床表现上比较接近，但EV71病毒还可以引起如无菌性脑膜炎、脑干脑炎和脊髓灰质炎样的麻痹等多种中枢神经系统疾病，致死率较高，因此备受关注。
自2012 年1 月至2013 年11 月我院收治手足口病患者1543 例,均符合手足口病诊疗指南[1]。
现对其临床资料进行回顾性分析，报告如下:1 临床资料1. 1 一般资料本组1543 例中，男821 例，女722 例。
病程5～ 7 d，最长9 d。
发病年龄: 0 ～ 1 岁(含1 岁)，94 例(占6%); 1 ～ 2 岁(含2 岁)， 230 例(占15%);2 ～3 岁(含3 岁)，401 例(占26%); 3 ～4 岁(含4 岁)，460 例(占29%); 4 ～5 岁(含5 岁)， 210 例(占14%); ＞ 5 岁， 148 例(占10%)。
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中国生物制品学杂志2013年9月第26卷第9期Chin J Biologicals September 2013，Vol.26No.9手足口病（hand -foot -mouth disease ，HFMD ）是由肠道病毒引起的传染病，多发生于婴幼儿，可引起手、足、口腔等部位的疱疹，个别患者可引起心肌炎、肺水肿、无菌性脑膜炎等并发症。
可引起HFMD 的肠道病毒有20多种（型），其中以柯萨奇病毒A16型（Coxsackie A16virus ，CoxA16）和肠道病毒71型（enterovirus 71,EV71）最为常见，而发病死亡的患儿主要是因为感染了EV71［1-3］。
目前，尚无公认的可用于人的有效疫苗可供使用［4］。
因此，该疫苗的研制十分紧迫。
本实验对EV71疫苗制备过程中病毒收获液的蛋白成分进行初步分析，以期为该类疫苗的研发及质控提供参考。
肠道病毒７１型收获液蛋白成分的分析高嵩，李爱灵，黄浩，赵玉秀，苏桂民，王辉北京天坛生物制品股份有限公司，北京100024摘要：目的分析肠道病毒71型（enterovirus 71，EV71）收获液中的蛋白成分，为该类疫苗的研发及质控提供参考。
方法将EV71安徽阜阳株接种于Vero 细胞，病毒培养72h 后，收获病毒液，经蔗糖密度梯度超滤离心、甲醛灭活、DEAE Sephorase FF 介质离子交换层析纯化，获得纯化样品。
应用透射电镜分析样品中病毒颗粒的形态；对非还原型SDS -PAGE 检测疑似病毒衣壳抗原蛋白VP1和VP3条带进行N -末端氨基酸序列分析；液相色谱（liquid chromatogra －phy ，LC ）与电喷雾电离质谱（electrospray ionization ，ESI -MS ）结合的方法分析样品中所含的蛋白成分。
结果纯化的EV71样品在透射电镜下可观察到20～30nm 的球形EV71颗粒，呈典型的肠道病毒形态；经SDS -PAGE 分析，第2和第3条带所在位置与文献报道的EV71衣壳蛋白VP1和VP3大小相符，N -末端氨基酸序列与GenBank 报道的安徽阜阳株序列（ACD63039.1）一致；LC ／ESI -MS 质谱分析显示，纯化EV71样品中病毒蛋白成分占绝对优势，包括EV71的蛋白多聚体、VP1、VP2、VP3、VP4蛋白。
结论对EV71疫苗制备过程中病毒收获液的蛋白成分进行了初步分析，为该类疫苗的研发及质控提供了参考。
关键词：肠道病毒71型；纯化；蛋白成分中图分类号：R373.2+3R392-33文献标识码：A 文章编号：1004-5503（2013）09-1201-05Analysis of protein component of harvested liquid of enterovirus 71GAO Song,LI Ai -ling,HUANG Hao,ZHAO Yu -xiu,SU Gui -min,WANG HuiBeijing Tiantan Biological Products Co.Ltd,Beijing 100024,China Corresponding author:WANG Hui,E -mail:wh6247@Abstract ：Objective To analyze the protein component in harvested liquid of enterovirus 71（EV71）and provide a ref －erence for development and quality control of EV71vaccine.MethodsEV71Anhui Fuyang strain was inoculated toVero cells and cultured for 72h,and the harvested liquid was concentrated by sucrose density gradient centrifugation combined with ultrafiltration,inactivated with formaldehyde and purified by DEAE Sepharose FF ion exchange chromatog －raphy.The morphology of virus particles in test samples was analyzed by transmission electron microscopy,while the amino acids at N -terminus of suspected virus capsid protein VP1and VP3bands determined by non -reduced SDS -PAGE were sequenced ，and the protein component by liquid chromatography （LC ）and electrospray ionization （ESI -MS ）.Re －sults Spheroidal particles at sizes of 20~30nm were observed in purified EV71samples under transmission electron microscope,which showed typical morphology of enterovirus.SDS -PAGE showed that the locations of the 2nd and 3rd bands were consistent with those of VP1and VP3of EV71reported respectively.The amino acid sequences at N -terminus of the two bands were consistent with that of EV71Anhui Fuyang strain reported in GenBank （ACD63039.1）.LC ／ESI -MS showed that viral protein components were prominent in purified EV71,including polymer,VP1,VP2,VP3and VP4.Conclusion The protein component of virus liquid during preparation of EV71vaccine were preliminarily analyzed,which provided a reference for development and quality control of the vaccine.Key words ：Enterovirus 71（EV71）；Purification ；Protein component·疫苗研究·通讯作者：王辉，E -mail ：wh6247@1201··DOI:10.13200/ki.cjb.0001401材料与方法1.1毒株及细胞EV71安徽阜阳株（AHYF087-P5V3工作毒种）由北京生物制品研究所有限责任公司李秀玲研究室提供；Vero细胞（129代，第2007-0117批工作代）由天坛生物制品股份有限公司疫苗四室提供。
1.2主要试剂199培养基由北京天坛生物制品股份有限公司培养基室提供；新生牛血清购自杭州四季青生物工程材料有限公司；人血白蛋白购自成都蓉生药业有限责任公司；DMEM培养基购自美国SAFC公司；测序级胰蛋白酶购自瑞士Roche公司；丙酮购自北京北化精细化学品有限公司；DTT购自北京化学试剂公司；SDS、HCl、APS、TEMED、丙烯酰胺、三叉丙烯酰胺、Trish和溴酚蓝购自北京化工厂；DEAE Sephorase FF介质购自美国GE公司。
1.3细胞培养及病毒接种复苏冻存的129代Vero细胞，用含10%小牛血清的199培养基培养细胞，按1∶6的比例传代扩增。
待细胞传至133代时，按MOI0.014接种EV71，于33℃培养病毒。
病毒接种20h后，用0.013mol／L的PBS（pH7.4）洗涤3次，加入含0.1%人血白蛋白的DMEM维持液（pH7.4）维持培养。
病毒培养至72h后，收获病毒。
1.4病毒的浓缩、灭活及纯化收获的病毒液经28000r／min蔗糖密度梯度超滤离心16h，1∶4000甲醛25℃灭活7d后，经DEAE Sephorase FF介质进行离子交换层析纯化。
1.5纯化ＥＶ７１样品的鉴定1.5.1电镜分析将纯化EV71样品送中国农业科学院原子能研究所进行透射电镜扫描分析。
1.5.2SDS-PAGE及VP1和VP3N-末端氨基酸测序分析纯化的EV71样品经12%非还原型SDS-PAGE分析后，对与文献报道相符的疑似病毒衣壳抗原蛋白VP1和VP3条带进行N-末端氨基酸序列分析［5］。
1.5.3LC／ESI-MS质谱分析纯化EV71样品送北京蛋白质组研究中心，采用液相色谱（liquid chro-matography，LC）与电喷雾电离质谱（electrospray io-nization，ESI-MS）结合的方法，应用ESI-FTICR液质联用仪对样品中所含蛋白组分进行初步鉴定，设置条件为：检索NCBI-2009数据库、胰蛋白酶酶解方式、最大允许肽质量误差±0.5Da；每个肽只允许有1个不完全裂解位点；可能的修饰方式Carbami-domethyl（C）和Oxidation（M）。
2结果2.1纯化ＥＶ７１样品的电镜分析结果纯化的EV71样品在透射电镜下可观察到20～30nm的球形EV71颗粒，呈典型的肠道病毒形态，见图1。
A：200nm；B：500nm。
图1纯化EV71样品的透射电镜扫描图（×80000）Fig1.Transmission electron microscopy of purified EV71（×80000）2.2纯化ＥＶ７１样品的ＳＤＳ-ＰＡＧＥ及ＶＰ１和ＶＰ３Ｎ-末端氨基酸测序结果纯化EV71样品经12% SDS-PAGE分析，第2和第3条带所在位置与文献报道的EV71衣壳蛋白VP1和VP3大小相符，见图2。
测序结果显示，条带2的N-末端氨基酸序列为Gly Asp Arg Val Ala，条带3的N-末端氨基酸序列为Gly Phe Pro Ala Glu，与GenBank报道的安徽阜阳株序列（ACD63039.1）一致，条带1为VP2和VP4的组合（前体蛋白VP0）。