猪源性乙型脑炎病毒分离株全基因序列测定和分析
猪乙型脑炎病毒SH0601株基因组序列分析及全长cDNA的构建
Ge o i e u n i g a d c n m cs q e cn n DNA ln n fJ p n s n e h l i co i g o a a e ee c p a i s t
v r s S 0 0 t a n io a e r m r i i u H 6 s r i s l t d f o po c ne 1
n ee i n o o d lt f o SH0 0 e u n e wa o n 。wh l G”wa s r e 0 0 p o 6 1 s q e c sf u d i a” e s i e t d i 1 7 1 b f NTR fS n n 3 o H0 0 。a d 9 . 6 1 n 7 2 n ce t e u lo i d
1— u tTOPO n Ble cit olwe yd tr n t no ulln t e o csq e c .Th o peeg n m i sq e c f I Bln- a dp u s r 。fl p o db eemiai ffl e g hg n mi e u n e o - ec m lt e o c e u n eo
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Chi e e J ur a o s s n s 0 n lof 报
2 08, 2 ( 0 4 2)
文 章 编 号 :0 2 6 4 2 0 ) 2 1 0 5 1 0 —2 9 ( 0 8 0 —0 4 —0
ZH ENG l Hf O,YU n da Da - n,SUN Zhi ,GAO i YUAN - h n Fe , Shis a
( e a t e t fAn m lI f ciu sa e S a g a e rn r sa c n t ue C iaAc d m f Ag i l r l D p rm n i a n et sDi s 。 h n h i t ia yRee rh I s tt ・ h n a e y o r ut a o o e V e i c u S i c , h y L b r tr f Anma a a i lg hn s M ii r o rc l r 。S a g a 0 2 2 h n ) c n e te e Ke a o ao y o i l r s oo y C iee n s y f Ag iut e h n h i 0 3 ・C ia P t t u 2
猪脑心肌炎病毒广西株的分离及其全基因组序列分析_硕士论文 精品
猪脑心肌炎病毒广西株的分离及其全基因组序列分析 二○○九 年 六 月硕士学位论文猪脑心肌炎病毒广西株的分离及其全基因组序列分析学科专业预防兽医学指导教师教授副研究员论文答辩日期学位授予日期答辩委员会主席论文评阅人广西大学学位论文原创性声明和学位论文使用授权说明学位论文原创性声明本人声明:所呈交的学位论文是在导师指导下完成的,研究工作所取得的成果和相关知识产权属广西大学所有。
除已注明部分外,论文中不包含其他人已经发表过的研究成果,也不包含本人为获得其它学位而使用过的内容。
对本文的研究工作提供过重要帮助的个人和集体,均已在论文中明确说明并致谢。
论文作者签名:年月日学位论文使用授权说明本人完全了解广西大学关于收集、保存、使用学位论文的规定,即:本人保证不以其它单位为第一署名单位发表或使用本论文的研究内容;按照学校要求提交学位论文的印刷本和电子版本;学校有权保存学位论文的印刷本和电子版,并提供目录检索与阅览服务;学校可以采用影印、缩印、数字化或其它复制手段保存论文;在不以赢利为目的的前提下,学校可以公布论文的部分或全部内容。
请选择发布时间:□即时发布□解密后发布(保密论文需注明,并在解密后遵守此规定)论文作者签名:年月日导师签名:年月日猪脑心肌炎病毒广西株的分离及其全基因组序列分析中文摘要脑心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus, EMCV)属于微RNA病毒科(Picornaviridae)、心病毒属(Cardiovirus)的成员,可引起猪的以脑炎、心肌炎或心肌周围炎为主要临床特征的急性传染病。
针对猪EMCV VP3/VP1基因序列设计并合成一对特异性引物,以构建的含有该引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测EMCV核酸的SYBR Green I real-time PCR方法。
该方法线性关系好,标准曲线的相关系数达到0.991;敏感性高,初始模板的检出下限为1×101拷贝/μL,比常规PCR方法高100倍;特异性强,与其它猪源病毒均不发生交叉反应;重复性好,组内与组间的变异系数均小于3%。
猪乙型脑炎病毒广西分离株FC792E基因主要抗原域的原核表达及抗原性鉴定
猪乙型脑炎病毒广西分离株FC792E基因主要抗原域的原核表达及抗原性鉴定卢冰霞;李斌;秦毅斌;赵武;梁家幸;韦超文;何颖;苏乾莲;梁保忠【摘要】对广西猪JEV FC792株的E基因主要抗原域Ⅰ、Ⅱ基因(Ea基因)进行原核表达及抗原性鉴定,为猪流行性乙型脑炎病毒(JEV)诊断抗原和基因工程疫苗的研制奠定基础.结果:成功构建广西猪JEV FC792株Ea基因的克隆重组质粒pMD18-T-Ea及表达重组质粒 pET32a-Ea,经SDS-PAGE及Western blot鉴定表明,JEV FC792株Ea蛋白在Roetta(DE3)菌中成功进行融合表达,表达出约58 KDa的融合蛋白;经抗原性鉴定表明,表达的融合蛋白Ea能与猪JEV阳性血清抗体发生特异性反应,融合蛋白Ea具有良好的JEV抗原性.%In order prepare for the development of diagnostic antigens and genetic engineering vaccine of swine Japanese encephalitis virus (JEV),prokaryotic expression and antigen identification for major antigenic domain Ⅰ,Ⅱ gene (Ea gene) of E gene of swine JEV strain FC792 isolated from Guangxi wereperformed.Results:Guangxi swine JEV FG792 strain Ea gene cloning recombinant plasmid pMD18-T-Ea and expressing recombinant plasmid pET32a-Ea were successfully constructed.By SDS-PAGE and Western blot analysis showed that protein Ea of JEV FC792 strain was successfully fusion expressed in Rosetta(DE3) bacteria,and about 58 KDa fusion protein Ea was expressed.Antigenic identification showed that the expressed fusion protein Ea specifically react with swine JEV positive serumantibody,indicating the fusion protein Ea has good JEV antigenic.【期刊名称】《西南农业学报》【年(卷),期】2013(026)003【总页数】6页(P1258-1263)【关键词】猪流行性乙型脑炎病毒;Ea基因;原核表达;抗原性鉴定【作者】卢冰霞;李斌;秦毅斌;赵武;梁家幸;韦超文;何颖;苏乾莲;梁保忠【作者单位】广西兽医研究所,广西南宁530001;广西畜禽疫苗新技术重点实验室,广西南宁530001;广西大学动物科学技术学院,广西南宁530005;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西畜禽疫苗新技术重点实验室,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西畜禽疫苗新技术重点实验室,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西畜禽疫苗新技术重点实验室,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西畜禽疫苗新技术重点实验室,广西南宁530001;广西田林县动物疫病预防控制中心,广西田林533300;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西畜禽疫苗新技术重点实验室,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西畜禽疫苗新技术重点实验室,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西畜禽疫苗新技术重点实验室,广西南宁530001【正文语种】中文【中图分类】S858.28流行性乙型脑炎(Japanese encephalitis,JE)是由日本乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)引起的以中枢神经系统发生病变的传染病,可导致怀孕母猪流产、产死胎或弱仔,公猪睾丸炎,给养猪业造成巨大的经济损失。
一株猪源乙型脑炎病毒的分离及鉴定
一株猪源乙型脑炎病毒的分离及鉴定唐波;张道华;张雪花;常晨;刘国阳;唐应华;华涛;侯继波【摘要】从江苏某发病猪场采集的母猪流产胎儿脑组织样本中成功分离到一株猪源乙型脑炎病毒(JEV)毒株,并对该毒株的相关生物学特性进行了鉴定.利用BHK-21细胞传代和脑内接种小鼠方法,对疑似阳性病料做病毒分离.通过RT-PCR,CPE和IFA等方法对JEV分离株进行鉴定,并测定其TCID50.结果成功分离获得一株JEV 毒株(JEV JS01株),该毒株能够在BHK-21细胞上增殖并产生细胞病变,TCID50为每1 mL10 7 0,免疫荧光检测可观察到JEV特异性荧光.RT-PCR扩增E基因并测序分析表明,与GenBank中登录的JEV毒株序列具有较高的同源性,属基因Ⅲ型.小鼠致病力试验表明该分离株对易感动物具有较高致病性.本研究为进一步开展乙脑病毒流行病学与疫苗免疫研究奠定了基础.【期刊名称】《浙江农业学报》【年(卷),期】2015(027)010【总页数】6页(P1698-1703)【关键词】猪源乙型脑炎病毒;分离鉴定;生物特性【作者】唐波;张道华;张雪花;常晨;刘国阳;唐应华;华涛;侯继波【作者单位】江苏省农业科学院国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014;江苏省农业科学院国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014;江苏省农业科学院国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014;江苏省农业科学院国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014;江苏省农业科学院国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014;江苏省农业科学院国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014;江苏省农业科学院国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014;江苏省农业科学院国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014【正文语种】中文【中图分类】S852.65+9.6乙型脑炎(Japanese encephalitis,JE)是一种重要的人畜共患病,其病原乙型脑炎病毒是一种虫媒病毒,属黄病毒科黄病毒属。
猪肠道病毒的分离鉴定及其全基因组序列测定与分析
猪肠道病毒的分离鉴定及其全基因组序列测定与分析猪肠道病毒的分离鉴定及其全基因组序列测定与分析导言:猪肠道病毒(Porcine Epidemic Diarrhea Virus, PEDV)是一种能引起幼猪急性腹泻的病毒。
自20世纪80年代末爆发以来,PEDV已经成为全球养猪业的主要威胁之一。
为了更好地了解PEDV的分布、演变和传播机制,就需要对PEDV进行准确的分离鉴定,并获取其全基因组序列。
一、PEDV的分离鉴定1. 采集样品为了对PEDV进行分离鉴定,需要采集疑似感染PEDV的猪粪样品。
采集时应注意避免样品受到污染。
2. 细胞培养将采集到的猪粪样品置于适当的培养基中,在37℃的条件下培养细胞。
PEDV会感染并破坏肠道上皮细胞,因此可以通过细胞病变观察来初步判断是否存在PEDV。
3. PEDV的鉴定进行酶联免疫吸附试验(ELISA)或免疫荧光试验(IFA)来确定细胞中是否存在PEDV。
这些试验可以通过特定的抗体与PEDV间发生特异性反应来检测。
4. 病毒复制如果样品经鉴定确实存在PEDV,可以进行病毒复制以获取更多的病毒颗粒。
二、PEDV的全基因组序列测定为了进一步了解PEDV的遗传特征和演化历史,需要对PEDV进行全基因组序列测定。
1. 核苷酸提取通过核苷酸提取试剂盒对病毒颗粒中的RNA进行提取。
提取后的RNA可进一步用于测定PEDV的全基因组序列。
2. 逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)用特异性引物进行逆转录聚合酶链式反应,合成PEDV的cDNA。
3. PCR扩增使用PEDV特异性引物对PEDV的全基因组进行扩增。
选择适当的引物片段长度和PCR条件,可确保PCR扩增的特异性和准确性。
4. 基因测序通过基因测序技术对PCR扩增产物进行测序,获取PEDV的全基因组序列。
三、PEDV全基因组序列的分析1. 序列比对将获取的PEDV全基因组序列与已知PEDV序列进行比对,通过相似性分析来判断其跟已知PEDV的关系。
猪乙型脑炎病毒SA14-14-2疫苗株基础种子的全面鉴定
猪乙型脑炎病毒SA14-14-2疫苗株基础种子的全面鉴定巢伟,张桂红,徐雷*(湖南中岸生物药业有限公司,长沙410100)摘要:建立了猪乙型脑炎活疫苗基础种子库,对三批基础种子进行了全面鉴定。
结果表明,三批猪乙型脑炎基础种子无外源病毒污染,对敏感实验动物小鼠、乳猪和怀孕母猪接种均安全、无异常反应,原代地鼠肾细胞传代至F12代,免疫原性保持稳定、毒力不返强。
由此可见,猪乙型脑炎SA14-14-2疫苗株基础种子无外源病毒污染,具有可靠安全性和良好、稳定的免疫原性,可用于疫苗生产,为研制猪乙型脑炎活疫苗打下基础。
关键词:猪乙型脑炎病毒;SA14-14-2株;基础种子;全面鉴定The Comprehensive Identificationfor Foundation Seed of Swine Japanese Encephalitis Virus Vaccine Sal4-14-2 StrainCHAO Wei, ZHANG Gui-hong, XU Lei(Hunan Sinoland Bio-Pharmacy Co., Ltd, Changsha 410100, China)Abstract:To establish the foundation seed bank of swine Japanese encephalitis live vaccine and finish a comprehensive test for the three batch foundation seeds. The test results show that the three batch foundation seeds of Japanese encephalitis vaccine are not polluted by exogenous virus and safe, no abnormal reaction for sensitive mice, pigs and pregnant sows. To the F12 generation cultured by primary hamster kidney cell, immunogenicity of the virus were stable and strong virulence of the virus does not return. Therefore, foundation seeds of Japanese encephalitis vaccine SA14-14-2 strain show no exogenous virus, reliable security, good and stable immunogenicity, can be used for vaccine production and lay the groundwork for the development of Japanese encephalitis live vaccine.Key words: swine Japanese encephalitis virus;SAl4-14-2 strain;foundation seed;comprehensive identification乙型脑炎(Japanese encephalitis,JE)又称流行性乙型脑炎、日本乙型脑炎,简称乙脑,是由乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis Virus,JEV)引起的致人和动物中枢神经系统症状的人畜共患急性传染病。
猪乙型脑炎病毒广西分离株FC792 E基因主要抗原域的原核表达及抗原性鉴定
猪 乙型脑 炎 病 毒广 西分 离株 F C 7 9 2 E 基 因主 要抗 原 域 的原 核 表 达及 抗 原 性鉴 定
卢冰 霞 2 , 李 斌 , 秦毅斌 . 一 , 赵 武 , 一, 粱家幸 , 韦超 文4 , 何
,
颖 ,
苏乾莲 , 梁保 忠 , 李莹莹 , 2 ・ 。 姜佳佳 , 杨盛斌 , 黄伟 坚。 一
S h nj a i a n g C o u n y t L i n x i A q u a t i c A n i m a l H u s b a n d r y nd a V e t e i r n a r y S t a t i o n , G u ng a x i S h a n j i a n g 5 4 5 5 0 5, C h i a) n
5 3 3 3 0 0 ; 5 . 广西三江县林溪水 产畜牧兽医站 , 广西 三
摘
要: 对广西猪 J E V F C 7 9 2株的 E基因主要抗原域 I、 Ⅱ基 因( E a基 因) 进行原核表达及抗原 性鉴定 , 为猪流行性乙型脑炎 病毒
( J E V ) 诊断抗 原和基 因工程疫苗的研制奠定基础。结果 : 成功构建广西猪 J E V F C 7 9 2株 E a基因 的克 隆重组质粒 p M D I 8 - T . E a 及
L U Bi n g ・ x i a 。 - ’ ¨
,
L I B i n ・ ,Q I N Y i — b i n ‘ . - , Z H A O Wu ・ “ , L I A N G J i a - x i n g 。 - - , WE I C h a o - w e n , HE Yi n g - 一 ,
( 1 . 广西兽医研究所 , 广西 南宁 5 3 0 0 0 1 ; 2 . 广西畜禽疫苗新技术重点实验室, 广西 南宁 5 3 0 0 0 1 ; 3 .广西 大学 动物科学技术学 院, 广西 南宁 5 3 0 0 0 5 ; 4 .广西田林县动物疫病预防控制 中心 , 广西 田林
乙型脑炎病毒SXBJ07株的分离鉴定及序列分析
乙型脑炎病毒SXBJ07株的分离鉴定及序列分析王韦华;张旭;张彦明;邢福珊;徐彦召【摘要】[目的]分离鉴定乙型脑炎病毒(JEV),确定分离毒株的基因分型及其E区段氨基酸的序列特征.[方法]采用BHK-21细胞培养法,从猪脑组织标本中分离出1株病毒,对其进行细胞和免疫荧光试验,同时采用RT-PCR扩增并克隆该毒株的PrM、E区段核苷酸序列,利用PrM(456~695位)区核苷酸序列与36株参考序列进行基因分型分析,并对E区核苷酸序列与减毒活疫苗株SA-14-14-2株的相应序列进行比对,分析分离株和疫苗株氨基酸的同源性及关键结构域的差异.[结果]分离出的病毒经细胞病变和直接免疫荧光试验证实为乙脑病毒,命名为SXBJ07;用该病毒感染BHK-21细胞,72 h后所有细胞均发生病变(CPE);用该病毒接种3日龄乳鼠,72 h之内即可导致乳鼠死亡;SXBJ07株PrM(456~695位)区基因分型证实,分离株属于基因Ⅰ型,E区段核苷酸和氨基酸与减毒活疫苗株SA-14-14-2株的同源性分别为87.7%和 97.0%,但在E蛋白的活性关键结构域有13个氨基酸存在差异.[结论]从陕西省境内首次成功分离到1株Ⅰ型乙脑病毒,初步确定了该分离株的分子特征,对乙型脑炎的流行病学研究及其防治具有重要意义.【期刊名称】《西北农林科技大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2009(037)004【总页数】7页(P1-6,12)【关键词】猪;乙型脑炎乙脑病毒;分离鉴定;PrM基因分型;E基因【作者】王韦华;张旭;张彦明;邢福珊;徐彦召【作者单位】西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100【正文语种】中文【中图分类】S852.65+9.6;Q78流行性乙型脑炎(Japanese encephalitis,JE)是由黄病毒科(Flaviridae)黄病毒属(Flavivirus)乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)引起的一种重要的蚊媒性人兽共患传染病,多种动物易感,库蚊是JEV的主要传播媒介[1]。
猪乙脑病毒WHe株的PrM-E、NS1、E-NS2A基因的克隆及序列测定
猪乙脑病毒WHe株的PrM-E、NS1、E-NS2A基因的克隆及序列测定乔宪凤;熊东海;郑新民;徐涤平;赵浩斌;魏庆信【期刊名称】《中国预防兽医学报》【年(卷),期】2003(025)003【摘要】本文通过RT-PCR扩增了猪乙型脑炎病毒WHe株主要抗原基因NS1(约1.14 kb)、prM-E(约2.1 kb)、E-NS1-NS2A (约3.0 kb),并将NS1、E-NS1-NS2A、PrM-E基因克隆、测序.与Genbank发表的JEV基因序列进行序列分析,发现WHe株与其他12种典型的JEV强毒株的同源性在88.3 %~99.4 %之间.WHe株与K94P05株的同源性最低(88.3 %),与P3株的同源性最高(99.4 %),可认为WHe株是由P3株衍生而来的.在JEV基因组5'端389~3910的长3522 nt 的决定JEV抗原性的C-prM-E-NS1-NS2A区中,WHe株与P3株仅有21个碱基不同,其中的14个单碱基突变为同义突变,另外7个为错义突变,导致相应的氨基酸序列(1173个)中的6个氨基酸发生了变异,其中的5个氨基酸变异出现在含有各关键的抗体中和决定簇的E蛋白内,另一个位于NS1蛋白内.【总页数】4页(P191-194)【作者】乔宪凤;熊东海;郑新民;徐涤平;赵浩斌;魏庆信【作者单位】湖北省农业科学院,湖北,武汉,430064;华中农业大学,湖北,武汉,430070;湖北省农业科学院,湖北,武汉,430064;湖北省农业科学院,湖北,武汉,430064;湖北省农业科学院,湖北,武汉,430064;湖北省农业科学院,湖北,武汉,430064【正文语种】中文【中图分类】S852.65;Q78【相关文献】1.日本脑炎病毒WHe株NS1基因的克隆、测序及表达 [J], 乔宪凤;唐青海;郑新民;熊忠良;刘西梅;华文君;周荆荣;何维明2.猪产肠毒素性大肠杆菌野生株K88菌毛蛋白结构基因的克隆与序列测定 [J], 李鹏;戴鼎震;陈焕春;金升藻3.猪圆环病毒2型分离株的基因组克隆、序列测定与分析 [J], 全滟平;崔尚金;宋木霞;姜艳玲4.猪圆环病毒2型分离株的基因组克隆、序列测定与分析 [J], 全滟平; 崔尚金; 宋木霞; 姜艳玲5.猪乙脑病毒HW株的全基因组克隆及分析 [J], 付文鹏;陈建军;岳桂平;熊东海;徐涤平;杨在清因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
猪源乙型脑炎病毒河南分离株的全基因组测序及进化分析
猪源乙型脑炎病毒河南分离株的全基因组测序及进化分析禹乐乐;滕蔓;罗俊;迟佳琦;余祖华;柴书军;梁晓晓;张改平;王爱萍【期刊名称】《华北农学报》【年(卷),期】2012(027)005【摘要】为了解猪源乙型脑炎病毒(JEV)的全基因组结构及其分子进化规律,测定了3个JEV猪源分离株(BSF.ZZ-1、BSF.ZZ-3和CSF.XZ-2D)的全基因组序列,并对它们的氨基酸序列进行了分析.结果表明,CSF.XZ-2D全长为10 976 nt,而BSF.ZZ-1和BSF.ZZ-3全长均为10977 nt,在后2个毒株基因组的10701 nt位点处均有1个插入碱基“G”.BSF.ZZ-1、BSF.ZZ-3、CSF.XZ-2D与SA14株核苷酸和氨基酸同源性较高,核苷酸同源性都为99.4%,氨基酸同源性均为99.0%,与猪源分离株HW(HW1)、HWe(HW2)和SH0601的核苷酸与氨基酸同源性均为98.0%以上.用涵盖全部5个基因型的30个JEV毒株的全基因组序列构建系统进化树,发现这3个猪源分离株位于同一进化分支,均属于基因Ⅲ型.【总页数】7页(P184-190)【作者】禹乐乐;滕蔓;罗俊;迟佳琦;余祖华;柴书军;梁晓晓;张改平;王爱萍【作者单位】郑州大学生物工程系,河南郑州450001;河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002;河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002;河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002;河南科技大学动物科技学院,河南洛阳471003;河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002;河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002;河南科技大学动物科技学院,河南洛阳471003;河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002;河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002;河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002;郑州大学生物工程系,河南郑州450001【正文语种】中文【中图分类】Q78;S436【相关文献】1.野猪源与家猪源PRRSV陕西分离株全基因测序与遗传进化分析 [J], 张冲;武小椿;王波;韩青松;杨增岐2.猪流行性乙型脑炎病毒种猪精液分离株的鉴定及进化分析 [J], 王兴涛;罗俊;滕蔓;樊剑鸣;鄂巍;禹斌;刘力;张改平3.猪源性乙型脑炎病毒分离株全基因序列测定和分析 [J], 赵灵燕;谢荣辉;朱函坪;徐芳;杨章女;姚苹苹;周小龙;朱智勇4.1株猪源基因I型乙型脑炎病毒的分离鉴定及遗传进化分析 [J], 侯力丹;王文涛;曹胜波;黄少梅5.不同猪源副猪嗜血杆菌河南分离株16S rRNA基因的遗传进化分析 [J], 常洪涛;刘慧敏;陈陆;杨霞;赵军;姚惠霞;王新卫;王川庆因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
猪乙型脑炎病毒病一步法RT-PCR诊断试剂盒说明书
猪乙型脑炎病毒病一步法RT-PCR 诊断试剂盒说明书[注意] 用前请认真阅读注意事项。
[用途] 用于猪乙型脑炎病毒病的检测、诊断和流行病学调查。
[试剂][操作步骤]1. RNA 提取(1)取疑似猪乙型脑炎病毒病的病料(脑、肺脏、脾脏等)1~4g 于无菌研钵,研磨并用 Hanks 液(pH7.2~7.4)稀释成 1:4 乳剂,分装 1.5ml 灭菌EP 管,反复冻融 2~3 次,8000r/min 离心5 分钟。
(2)取300ul 上清液,移入新的 1.5ml 灭菌EP 管中,加入 600ul SR-I,反复颠倒几次混匀,室温放置 5~10 分钟.。
(3)加入 180ul 氯仿,漩涡振荡 15 秒混匀。
室温下放置 2~3 分钟。
(4)12000r/min 离心10 分钟,取 450ul 上层水相,转移到一个新的 EP 管中,再加入 500ul 异丙醇混匀,室温放置 10 分钟。
(5)12000r/min 离心10 分钟,弃去上清,加入SR-II 700ul,充分洗涤沉淀 RNA 后,12000r/min 离心 5 分钟,小心吸去上清(注意:严格防止 RNA 丢失)。
(6)室温晾干或到置于超净工作台内风干,15-30 分钟。
用 30ul TU-9 溶解(难于溶解时,可56℃水浴 15 分钟),即为模板,即用或-70℃冻存备用。
2.One-Step RT- PCR 加样体系TU-1 5ulTU-2 4ulTU-3 8ul1ul(现用现取,用完后立TU-4 TU-5 TU-6即放回) 1ul(现用现取,用完后立即放回) 1ul(现用现取,用完后立即放回)3.反应程序:4.电泳:TU-7 1ulTU-8 1ulTU-9 15ul模板13ul50℃45min94℃预变性5min94℃变性60s55℃退火60s 30 个循环72℃延伸60s72℃延伸10min称量 0.25g 琼脂糖,放入锥形瓶,加入 25ml 1×TAE 液(可配置 50×浓缩液,储存备用),于微波炉中熔解,加入 1.5ul 的TU-12 混匀。
猪乙型脑炎病毒广西分离株FC792E基因主要抗原域的原核表达及抗原性鉴定
中国畜牧兽医文摘
2 0 1 4 年
3 0ห้องสมุดไป่ตู้卷
第5 期
散养 家畜 防疫工作 的现状及建 议
陆 志 龙
( 贵州省晴隆县大 田乡农业服务 中心,贵州兴义
建立和健全 防疫机构 ,防控家畜传染病,积极开展综合性防 科技 知识 。 疫措施 ,保护畜牧业稳定、健康发展 ,是我国家畜传染病防制的 2 建议
注射 而引 起 的家畜 死 亡或副 反应 ,采 取养 殖 户 自愿形 式 ,影 响 防 2 . 4 普及 防疫 知 识 控 质量 。 ( 3 ) 缺 乏有力 监督 :检 查缺 乏随 机性 ,检查 形式 局限 , 乡镇 兽 医 、政府 主 管职 能部 门 大力 配合 ,利 用 标语 、广播 、 宣 传车 、电视 等各 种宣 传 工具 ,使 相关 人 员认 识到 动物 防疫为 一 对 抗体 水平 、免疫 密切 较少 涉及 ,缺乏 工作 主动 性 。
5 6 1 4 0 3 )
根本 原 则 。但 受农 村 散养 户 防疫 意识 掌握 程度 不 等 ,各地 区发展 2 . 1 深 化 改革 不平衡等多因素影响 ,防疫工作开展存在一定难度 ,分析农村散 为推 动兽 医队伍 建设 ,省市 级需 给 予一 定支 持 ,县 级 积极 参 养 家畜 防疫 现 状 ,并 提 出针对 性建 议 ,是 推 动相 关工 作顺 利 开展 与 ,在省 市 财政 支 持下 ,各 县需 有 强有 力 的动 物防疫 监 督机 构 和 的保 障 。 畜牧兽医主管部 门。乡镇为兽医队伍改革的关键 ,因动物防疫 、
1 . 2 防 疫 队 伍 建设 缺 乏严 谨 性
年龄偏大 、文化水平偏低 ,无系统培训经历 ,工作跟不上动物防 村 散养 家 畜集 中防疫 的落 实 ,防疫 人员 作 用可 充分 发 挥 ,应 切实 做好检测和免疫接种工作 ,开展集 中防疫 ,抓好消毒灭源、强制 疫发 展的需 要 ,故需 对人 才进行 培养 。 1 . 2 . 1 养殖户防疫意识不强 传统养殖方式根深蒂 固,在一定 免疫、动物卫生监督、疫病监测等各项综合防控措施 ,完善应急 程度 上 限制 了 防疫 知识 水平 的普 及 ,知识 掌握 情况 不 等 ,少部 分 机 制 加 大技 术 培训 ,强 化预 警预 报 ,保 障农 村散 养 家畜 防疫 工 养殖 户缺 乏 防疫 意识 ,认 为 防 与不 防不 重要 ,家畜 不会 得 病或 无 作 顺利 进 行 。另外 ,畜牧 、财 政 、 当地 政 府 的有力 监 管也 是 提高 防疫质量的关键 ,可发挥警示 、引导和督促作用 ,引起有关部门 病,使集中防疫时出现漏防情况 。 1 . 2 . 2 冷 链 装备 不足 乡镇 以下 单 位 应有 冷 链 装备 ,但 有些 部 的重视 ,增强 关注 力度 ,全 面推动 防疫 工作高 质量 完成 。 门对此不重视 ,认为疫苗随便存放即可,无需冷藏,造成疫苗失 参考文献
猪乙型脑炎病毒广西分离株FC792的囊膜糖蛋白E基因克隆及生物信息学分析
S u Q i a n l i a n 。C h e n Z h o n g w e i 。 Bi B i n g f e n ' Du a n Q u n p e n g , L i Y i n g y i n g 。 , J i a n g J i a j i a , 々
段群 棚 t . 2 李 莹莹 2 , 3 姜 佳佳 0 梁 保忠 1 , 2 黄伟坚
1 广西兽医研究所, 南 宁, 5 3 0 0 0 1 ; 2广西畜禽疫苗新技术重点实验室, 南宁, 5 3 0 0 0 1 ; 3广西大学动物科学技术学 院, 南宁, 5 3 0 0 0 5 ; 4广 西 田林县 动物疫病预防控制中心, 田林, 5 3 3 3 0 0
国内猪传染性乙型脑炎的检测及预防
传染 性 乙型脑 炎又称 日本 乙型脑 炎 ( ) 是 一 增区域 。崔奕杰 [ 吕晓丽同 J , E 5 3 与 分别利用针对 E蛋 白基 因的引物扩 增出特 异性片段 32b 和 39b , 6 D 4 p 后者 种人畜共 的大范 围应用, 近年来发生率大幅下 降。 但因 还 同时 建立 了可 定量 的荧 光 R — C T P R法及 可 同 时 为猪和蚊 虫的储 存与传 播作用,导致 该病 并不能完 检测 乙脑 、猪 流感 和蓝 耳病 3种 病毒 的 多重 R — T
全 消灭 。 调查发现 , 人群中该病 的发生通常要较猪群 的感染晚 3 4周左右 ,因此加强猪群 的检测 对人群 ~ 的防控 具有重要指导意义 ,而 做好猪 群的预防工作 则可 以进 一步减少发生几率 。本文仅就近年来有关 猪传染性 乙型脑 炎检测 及预防方面的国 内相关研究 进 行综述 , 以期能够为临床应用提供 一定参考 。 1 检测方 面
10 l
养 猪 S N R D C IN ( WIEP O U TO 2 )
2 l 02
国 内 猪 传 染 性 乙 型 脑 炎 的 检 测 及 预 防
朱 秀高 (. 1山东滨州沃华生物工程有限公司, 山东 滨州 2 6 0 ;. 5 6 02山东滨州博莱威生物技术研究所, 滨州 2 6 0 ) 5 6 0
P R; C 孙圣福[ 7 1 使用针对 N 1 S 基因保守区的特异性 引 物 建立 了一种 R — C T P R方法 ,其 扩增 片段 大 小 为 4 0b 。R — C 3 D T P R方法 除在研 究中使用外 , 目前 G / B T 23 3 0 8和 S / 4 2 2 1 2 3 —2 0 NT 2 7 - 00均 已将 其 作 为 标准检测方法进行推广 。临床 中, 吕晓丽等_ 利用 8 还 l 建立的 R — C T P R法 对发 生于 新郑 地 区 的一例 初产 母猪 流产病例 的病料进 行检测 ,结果显 示为 J E阳 性。 在引物设计参考区选择上 , 唐青海等[ 9 1 选用 3 末 11 病 原 检 测 . 通过对 乙脑病 毒 的检测 可 以进行 疾病 诊 断及 端 保 守区建 立 的 R — C T P R方 法也 具 有高特 异 性和 2p ) 流行病 学调查 。在进 行抗原检 测时 , 从疾病 诊断角 灵敏 性 ( g 。 度考虑 ,可 以只对流 产胎儿等病 料组 织进行检 测 ; 12 抗 体 检 测 . 如果要进行 的是流 行病学调 查 , 则应 扩大检 测范 围 抗 体检测 即检验血 清 中抗 体有无及 其含 量 , 由 至蚊 虫及猪 群 附近 其他 易感 动物 。时问安排 上 , 疾 于 不伤 害动物 生命 及方法 简单多样等特 点 ,成为 目 病诊 断应遵 循 随到 随检原则 ; 病原追 踪则应 考虑 乙 前流 行病 学调查及 血清 学诊断的主要措施 ,同时也 t 。 o 脑发 生的温 度相 关性 ( 在一 定区域表 现为季 节性) 可以作为评价疫苗免疫效果的重要手段[ q检测 中, , 在发 生前 、 后 一定 时 间 内对 处于 流行环 节 上 的 时间及对 象的选择 是影响结果的主要因素 。流行病 中、 相关 动物 进行 随 机检测 ,以确定 一 定区 域范 围 内 学调查方面 ,中间宿主蚊 在乙型脑炎的发生中起到 该 病 的流 行趋 势 及 规律 , 为 乙脑 的 防治 提 供数 重要作用,而蚊 虫的出现 与活动 受到环境温度 的显 ] , 据参考 。 著制 约 , 研 究 , 温 2 据 气 5℃~ 0℃ 、 对 湿 度 大于 3 相 0 随着分 子生物学 技术 的飞速 发展 , 近年 来早 期 7 %为蚊虫 的最 适繁殖条件 ,因此 时间的选 择上应 病 原检测技术如免疫细胞化 学法 、荧光抗体染色 法 该考虑 当地气候条件 , 在蚊虫 出现之前 、 出现之后及 及 反 向被动血凝试验等 由于操作 复杂等 因素逐 渐被 消失之后的一定时 间内进行相关检测工作 ;另一方 更加灵敏 、 确、 准 简便 的 R — C [ T P R4 1 方法取代 , 过 由 面 ,蚊虫孳生季节 由于环境 中野毒 的持续刺激可 能 不 于前者 的经济性 , 一些基层地 区还在使 用。 采用 R — 使猪体 内含有一定水平抗体 ,如果此时进行疫苗免 T P R时 , C 扩增 片段 的选 择及 引物 设计是影 响结果 准 疫 效果 监测 则应 在免 疫前 后分 别进 行抗 体水 平测 确性 的重要 因素 。 目前研 究 已知 乙脑病 毒有 3 结 定 。目前 国内大部分猪场及散养户都较 为重视该病 个 构基因 (、r / E 和 7个非结构基 因(S 、 S A 的预 防, cpe M、 ) M N 1N 2 、 一般初春后母猪配种前均会给其注射疫 苗, N 2 N 3 N 4 、 S B N 5 组 成 , 中 E 和 N 1 仔猪 出生后可通过母 乳中的母源抗体获得 对 乙脑病 S B、 S 、 S A N 4 、 S ) 其 S 因此对仔猪进行抗体检测 时, 应在 母源 基 因 由于在 刺激 机 体产 生保 护性 免疫 反应 上 的重 毒 的抵抗力 , 一般在 出生 6 0d以后) 进行 。 规模 化 要性而研究最 多,也经常 被用来 作为分子检 测的扩 抗体消 失之 后 ( 猪场 中, 除仔猪外 , 还应选择 一部 分肥育猪及 后备种
猪乙脑病毒河南分离株CSF.ZMD-3的分离鉴定及分子进化分析
毒 。使 用 ME GA3 1软件 对 C F Z . S . MD一3毒株 主要 结构蛋 白 E蛋 白的基 因序 列进 行分 子进 化 分
析, 定 C FZ 确 S . MD 一 3为 基 因 Ⅲ型 乙脑 病 毒 。
关键词 :乙型脑 炎病毒 ;分 离鉴 定 ; 基 因;E基 因 ; 因进 化树 M 基
f o a g g f r s i e a o i e. nd a s a e n m e s CSF.ZM D 一 3 a bt i e y r m l r e pi a m n H n n pr v nc a n iolt a d a w s o a n d b i oc a i g PK 一 1 e l nd i n ii d b n ultn c lsa de tfe y RT — PCR. o pa i g t e E e e s q e c fCSF. 5 By c m rn h g n e u n e o
(1 De arm e tofBi n ne i . p t n oe gi erng, Zhe gz u U nie st Zh ng ho 5 01, i n ho v r iy, e z u 4 00 Chna; 2 .H e n Pr vi i lK e b a or na o nca y La or t y ofAni a m m un l gy, y La r t r fA ni a m m u ol ft m lI oo Ke bo a o y o m lI n ogy o he M i s r fA grc t e, e n A c d m y o g iu t a ce e , en z u 4 0 nit y o iulur H na a e fA rc lur lS inc s Zh g ho 50 02, i a; Ch n 3. Col g fA nm a us a d y a trn r e cne He a rc lur lUnie st Zh n z o 50 0 Chia l e o i lH b n r nd Ve ei a y M dii , n n Ag iu t a e v riy, e g h u 4 0 2, n )
猪乙脑病毒河南分离株CSF.ZMD-3的分离鉴定及分子进化分析
猪乙脑病毒河南分离株CSF.ZMD-3的分离鉴定及分子进化分析卜丹;罗俊;樊剑鸣;王爱萍;滕蔓;游雷鸣;陈陆;张改平【摘要】采集河南省规模化猪场流产母猪死胎脑脊液作为样本,通过细胞盲传培养分离乙型脑炎病毒流行毒株,对新分离的病毒进行分子生物学鉴定,获得1株分离株并命名为CSF.ZMD-3.DNA序列测定及比对分析该分离株与已报道毒株基因的序列同源性,确定该分离毒株为乙脑病毒.使用MEGA3.1软件对CSF.ZMD-3毒株主要结构蛋白E蛋白的基因序列进行分子进化分析,确定CSF.ZMD-3为基因Ⅲ型乙脑病毒.【期刊名称】《河南农业科学》【年(卷),期】2010(000)004【总页数】4页(P101-104)【关键词】乙型脑炎病毒;分离鉴定;M;基因;E基因;基因进化树【作者】卜丹;罗俊;樊剑鸣;王爱萍;滕蔓;游雷鸣;陈陆;张改平【作者单位】郑州大学,生物工程系,河南,郑州,450001;河南省农业科学院,农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南,郑州,450002;河南省农业科学院,农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南,郑州,450002;河南省农业科学院,农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南,郑州,450002;郑州大学,生物工程系,河南,郑州,450001;河南省农业科学院,农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南,郑州,450002;河南省农业科学院,农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南,郑州,450002;河南农业大学,牧医工程学院,河南,郑州,450001;河南省农业科学院,农业部动物免疫学重点开放实验室,河南省动物免疫学重点实验室,河南,郑州,450002【正文语种】中文【中图分类】S852.65流行性乙型脑炎(Japanese encephalitis,JE)是一种人畜共患的蚊媒病毒性疾病,具有隐性感染、散发性、季节性的特点[1]。
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AB TRACT:no d rt n esa dt eg n tcc aa trsiso a a e ee cp aii vr sfo s n ,a EV sioa S I r e Ou d rtn h e ei h rce itc f p n s n e h l s iu r m wie nJ J t wa sl
Co lt e u n e a a y i o a a e e e c p a ii i u X6 t a n f o s n mp e es q e c n lss fJ p n s n e h l sv r sJ sr i r m wi e t 1
ZH A O ng y n, E ng hu , Li — a XI Ro — i ZH U a— ng, H lpi XU ng, Fa
c e td e ue c om o o m o he ,whih r s t d i 4. 一 9. loies q n eh l gy a ng t m c e ule n 9 9 9 6 a io a i e ue e ho ol y. Phylge tc a a y m n cd s q nc m og o ne i n l —
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赵 灵燕 , 荣辉。 朱 函坪。 徐 芳 杨 章女 姚 苹苹 周 小龙。 朱智 勇 谢 , , , , , ,
摘 要 : 目的 了解 猪 源 性 乙型 脑 炎 病 毒 ( 乙脑 病 毒 ) 基 因 特 征 。方 法 对 猪 源 性 乙脑 病 毒 株 ( X 1 进 行 全 基 因组的分 析 。结 果 猪 源 性 乙脑 病 毒 J 6 X 1株 全 基 因组 全 长 均 为 l 6 O 9 4个 核 苷 酸 , 有 一 个 开 放 阅 读 框 含
t d fom w i e r s ne,a d isc n t om p e e g no e w a e e e nd a a y e pa a i l T he r s t e ue i ft l t e m s s qu nc d a n l z d c om r tvey. e uls ofs q ncng o he nuce lo 一
中 国 人 兽 共 患 病 学 报
Ch ne e J ur a f Zoo os s i s o n lo n e 37
文 章 编 号 :02 6 4 2 1 ) 1 0 7 4 1 0 —2 9 ( O 2 0 —0 3 —0
猪 源 性 乙 型脑 炎病 毒 分 离株 全 基 因序 列 测 定 和 分 析 *
YANG a — Zh ng nu, YA O n — i g,ZH OU a —o Pi g p n Xi o l ng, ZH U Zhiy g — on
( n r f i lDi a eC n r lo Zh ja g Pr vn e Ha gz o 1 0 0, ia Ce teo An ma s s o to / e ei n o ic , n h u 3 0 2 Ch n )
ss t r u h f l l n t e o h we h t t e J s r i eo g d t e o y e i h o g u l e g h g n me s o d t a h X6 t an b l n e o g n t p I. Th h l g n tc a ay i a e n t e — 1 e p y o e e i n l ss b s d o h e tr e o e n ta e h t X6 t an h s t en a e tg n t ea in h p wi P 1 n h X6 g tb l n O t e n ie g n me d mo s r td t a J 1s r i a h e r s e e i r l t s i t xJ 6 3 a d t eJ 1 mi h eo g t h c o h
架 , 码 34 2个 氧 基 酸 。 与 G n a k中选 择 的 4 编 3 eBn 1株 乙脑 病 毒 全 基 因 序 列 比 较 发 现 , 核 苷 酸 同源 为 8 . ~ 9 . , 基 其 36 93 氨 A 0
酸 总体 同源 性 为 9 . ~ 9 . 。通 过 全 基 因 序 列进 行 系 统 进 化 分 析 均 显 示 该 毒 株 属 于 基 因 I型 乙 脑 病 毒 。结 论 猪 源 性 49 96 乙脑 病 毒 J 6 X 1株 属 于基 因 I , 国 内分 离 株 X P 1 型 与 J 6 3关 系 最为 接 近 。提 示 猪 体 内的 乙脑 病 毒 基 因 型 别 有 了新 的变 化 , 也 这 是 浙 江 省在 猪 体 第 一 次 分 离基 因 I 乙脑 病 毒 。 型 关键词 : 乙脑 病 毒 ; 列 分 析 ; 系 发 生 序 种 中 图分 类号 : 3 3 3 文 献 标 识 码 : R 7 . A