微机模拟蛋白质纯化实验
蛋白质分离纯化及鉴定综合实验
百泰派克生物科技
蛋白质分离纯化及鉴定综合实验
在蛋白组学研究中,如果要对某一混合体系中的蛋白质进行定性或定量分析,就需要先对蛋白组分进行分离、纯化,然后再进行后续的鉴定分析。
这一系列实验环环相扣,每一步都至关重要,直接影响实验结果的准确性。
理想的蛋白质分离技术首先要有超高的分辨率,能够将成千上万不同类型的蛋白质包括它们修饰物进行有效的分离。
目前常用的蛋白质分离技术包括一维/二维凝胶
电泳技术、双向电泳技术以及凝胶色谱技术等。
经分离的蛋白质需要进行纯度检测来评价是否含有其他杂蛋白或者杂质,通常利用聚丙烯电泳法、免疫化学法、沉降速率测定法、色谱法、质谱法等进行纯度检测。
对于含有杂质的蛋白需进行纯化,如含有核酸、糖类或脂类杂质,可以利用核酸沉淀法或有机溶剂沉淀法对杂质进行去除。
对蛋白质进行鉴定主要是基于其基本的理化参数对其进行鉴定,包括相对分子量、等电点、翻译后修饰、氨基酸序列以及高级结构等,可以选择单一的性质进行鉴定,也可以进行全面分析,根据实验需求进行选择。
百泰派克生物科技基于先进的质谱仪以及专业的技术团队提供蛋白质分离纯化及鉴定一站式技术服务,包括蛋白样品分离、纯化、纯度鉴定以及定性和定量鉴定,还可提供定制化分析服务,满足不同的实验需求,欢迎免费咨询。
计算机模拟“蛋白质纯化”短学期实践报告(10号蛋白)
计算机模拟“蛋白质纯化”短学期实践报告姓名:学号:班级:成绩:一、计算机模拟实验初始条件:样品号:10样品稳定的条件:10号样品在pH3.5~11.5稳定;温度< 69°C稳定。
二、计算机模拟“蛋白质纯化”实验内容:(1)粗分离(盐析)硫酸铵饱和度沉淀蛋白(mg)沉淀酶活力(U)上清蛋白(mg)上清酶活力(U)沉淀比活力(U/mg)上清比活力(U/mg)酶回收率纯化倍数8%498 9800100% 1.0 9% 497.9 975799.8% 1.0 10% 497.5 958698.9% 1.0 18% 89.9 9029 100.4396.2% 5.1 19% 105.6 9543 90.3798.9% 4.6 20% 117.3 9713 82.8099.8% 4.221%126.1 9757 77.38100% 3.9计算机模拟“蛋白质纯化”短学期实践时间:20 年月日如表格中所示,根据相关理论及实验经验,选择了从8%硫酸铵饱和浓度起进行梯度盐析测定,经过数据对比,最终选择9%作为除杂(取上清液)的“低浓度”,因为该浓度下上清中酶的比活力和纯化倍数较相近浓度而言具有优势。
在选定低浓度并进行取上清液步骤后,我们就开始对选择高浓度。
同样地经过数据对比,最终选择了20%作为把绝大部分目标蛋白沉降的“高浓度”,其原则也是要保证在比活力和纯化倍数大的情况下,选择比活力最大的硫酸铵浓度。
注:比活力(U/mg)=酶活力(U):蛋白质量(mg)。
选择了9%和20%这两个浓度后,我们开始正式的盐析过程,即先在9%浓度下取上清液,然后20%浓度下取沉淀。
具体操作及所取上清/沉淀数据(如图1)。
图1 盐析结果计算机模拟“蛋白质纯化”短学期实践时间:20 年月日(2)细分离(各种纯化技术条件及结果)阴离子交换层析:Start conc设为0 M,End conc设为0.6M,Equilibration ph(平均PH)设为6,用100%的样品去进行跑样层析(如图2)。
微机模拟蛋白质纯化实验报告
微机模拟蛋⽩质纯化实验报告微机模拟蛋⽩质纯化实验⼀、实验⽬的:1. 了解模拟⽣化⼲实验的⽅法和意义,掌握⽤protein软件提纯蛋⽩质的⽅法。
2. 进⼀步熟悉层析、热变性、盐析等常⽤⽣化分离⽅法的原理和应⽤。
⼆、实验原理:“Protein”软件有36个任务,即36组待分离纯化的蛋⽩。
任务要求利⽤软件提供的⼏种实验技术,提纯每⼀个⽬的蛋⽩,最终达到单向电泳⼀条带,双向电泳⼀个点,⽽且使⽤的⼈时和经费(根据提取步骤计算得到)不得超过⼀个特定值。
在每个任务开始时,软件给出⽬的蛋⽩的⼀些性质,如热稳定的温度范围和pH稳定范围等,利⽤这些信息,可以使实验少⾛弯路。
“Protein”提供的分离纯化⽅法有七种:①热变性;②硫铵沉淀;③排阻层析(凝胶⾊谱);④离⼦交换层析;⑤吸附层析;⑥聚焦层析;⑦制备电泳。
在“Protein”所提供的各种分离纯化⽅法中,热变性法和盐析法是⽐较好的粗提⽅法,在提纯的早期使⽤效果较好。
层析是各种⽅法中最强有⼒的⽅法,制备电泳虽然纯化倍数⾼,但是回收率低。
在各种层析⽅法中,⼜以离⼦交换层析最为有效和易于使⽤,并且耗费的⼈时和经费也较少。
排层层析和聚焦层析耗费较⼤,但在某些特定情况下,这两种⽅法是不可替代的。
“Protein”提供了四种电泳⽅法:即,SDS-PAGE、PAGE、等电聚焦电泳和双向电泳。
这些电泳⽅法不但可以⽤以检测样品的纯度,⽽且也给出了样品的⼀些信息,如分⼦量、等电点等,这些信息对于后续提纯有重要的参考价值,等电聚焦电泳和PAGE还可以⽤于制备。
本实验要求完成实验软件中三种酶的分离纯化。
1 酸性条件下稳定的蛋⽩(Windows 3号酶)3号酶在62℃以下稳定,稳定pH范围3.8~5.8(酸性条件)。
分离纯化步骤:1 热变性:⽔浴温度61℃,⽔浴时间60min2 离⼦交换:然后进⾏PAGE和SDS-PAGE检测结果分析:在检测时出现两条带的时候可能是由于蛋⽩质的含有两个亚基。
蛋白纯化整体实验报告
蛋白纯化整体实验报告实验目的本实验的主要目的是学习和掌握蛋白纯化的基本原理和方法,通过实验操作了解蛋白质纯化的整体过程,从而得到纯净的蛋白质样品。
实验原理蛋白纯化是将复杂混合物中的目标蛋白提取出并得到纯净样品的过程。
蛋白质的纯化一般包括以下几个步骤:1. 细胞破碎:将含有目标蛋白的细胞破碎,使目标蛋白从细胞中释放出来。
2. 澄清:通过离心等方法去除破碎细胞中的固体残渣,得到澄清的蛋白质上清液。
3. 分离目标蛋白:根据目标蛋白的特性选择适当的分离方法,如对目标蛋白进行亲和层析、凝胶渗透层析等。
4. 浓缩:将目标蛋白从大量的上清液中浓缩,以得到更纯净的样品。
5. 纯化检验:对所得样品进行纯度和活性的检验,确保得到纯净的、具有活性的蛋白质样品。
实验步骤步骤一:细胞破碎1. 将待检测的细胞进行冻融处理,用PBS缓冲液洗涤细胞两次。
2. 加入细胞破碎缓冲液,使细胞完全破裂释放蛋白质。
3. 低速离心去除细胞碎片和核酸。
步骤二:澄清1. 取得上清液,初步除去细胞残渣。
2. 用高速离心对上清液进行超速离心,去除大部分颗粒和碎片。
3. 将上清液过滤,去除细微残渣。
步骤三:分离目标蛋白1. 根据目标蛋白的特性选择适当的分离方法,如亲和层析、凝胶渗透层析等。
2. 对蛋白质样品进行层析操作,同时根据各分离步骤的参数进行条件优化。
步骤四:浓缩1. 使用合适的蛋白质浓缩方法,将目标蛋白质从大量上清液中浓缩。
步骤五:纯化检验1. 对所得的蛋白质样品进行纯度检验,如SDS-PAGE电泳分析等。
2. 对纯化样品进行活性检验,如酶活性测定或其它适当方法。
实验结果和讨论在本次实验中,我们成功地利用细胞破碎、澄清、分离、浓缩等步骤对目标蛋白进行了纯化。
通过SDS-PAGE电泳分析,我们确定所得样品具有较高的纯度。
经过活性检验,我们也发现纯化后的蛋白具有一定的活性,符合预期结果。
然而,我们在实验过程中也遇到了一些问题。
首先,在细胞破碎过程中需要选择合适的破碎缓冲液和破碎时间,否则可能会导致目标蛋白的降解或损失。
蛋白质纯化实验步骤
蛋白质纯化实验步骤引言:蛋白质是生物体内重要的基本组成部分,对于深入了解蛋白质的结构和功能具有重要意义。
蛋白质纯化是一个关键步骤,可以从复杂的混合物中分离出目标蛋白质,并去除杂质。
下面将介绍一种常用的蛋白质纯化实验步骤。
一、样品制备在开始蛋白质纯化实验之前,首先需要准备样品。
样品可以是细胞提取物、培养基中的蛋白质等。
样品制备的关键是要保证样品的完整性和纯度,避免蛋白质的降解和杂质的污染。
二、离心将样品进行离心,以去除细胞碎片和细胞核等大颗粒物质。
离心过程中,可以根据颗粒物质的大小和密度来选择合适的离心条件,如转速、离心时间等。
三、初步分离将离心后的上清液取出,进行初步分离。
可以采用一些常用的分离技术,如离子交换色谱、凝胶过滤等。
这些技术可以根据蛋白质的电荷、大小等特性进行分离,从而使目标蛋白质得到部分纯化。
四、亲和层析亲和层析是一种常用的蛋白质纯化技术,通过利用目标蛋白质与某种亲和剂之间的特异性相互作用来实现纯化。
亲和剂可以是金属离子、抗体、配体等,可以根据目标蛋白质的性质和特点来选择合适的亲和剂。
五、凝胶电泳凝胶电泳是一种常用的蛋白质分离和分析技术,通过电场作用使蛋白质在凝胶中迁移,根据蛋白质的大小和电荷来实现分离。
凝胶电泳可以用于检测和鉴定目标蛋白质,同时也可以用于纯化蛋白质。
六、柱层析柱层析是一种常用的蛋白质纯化技术,通过将样品溶液通过填充在柱子中的吸附剂层析,实现蛋白质的分离和纯化。
柱层析可以根据蛋白质的性质和特点来选择合适的吸附剂,如离子交换柱、凝胶过滤柱等。
七、透析透析是一种常用的蛋白质纯化技术,通过溶液之间的渗透压差来实现目标蛋白质的分离和杂质的去除。
透析可以用于去除一些小分子杂质,如盐类、小分子药物等。
八、浓缩浓缩是一种常用的蛋白质纯化技术,通过去除大量的水分来提高目标蛋白质的浓度。
常用的浓缩技术有深度过滤、超滤等,可以根据蛋白质的分子量和颗粒大小来选择合适的浓缩方法。
九、纯化验证在蛋白质纯化实验结束之后,需要对纯化后的目标蛋白质进行验证。
蛋白表达纯化实验步骤
蛋白表达纯化实验步骤(待改进)1、取适当相应蛋白高表达的动物组织提total-RNA.2、设计蛋白表达引物。
引物要去除信号肽,要加上适当的酶切位点和保护碱基。
3、RT—PCR,KOD酶扩增获取目的基因c DNA。
4、双酶切,将cDNA.克隆入PET28/32等表达载体。
5、转化到DH5α感受态细菌中扩增,提质粒。
6、将质粒转化入表达菌株,挑菌检测并保种。
表达菌株如Bl21(DE3)、Rosetta gami(DE3)、Bl21 codon(DE3)等。
7、蛋白的诱导表达。
1)将表达菌株在3ml LB培养基中摇至OD=0.6左右,加入IPTG,浓度梯度从25μM到1m M。
37度诱导过夜(一般3h以上即有大量表达)。
2)SDS—PAGE电泳检测目的蛋白的表达.注:目的蛋白包涵体表达量一般会达到菌体蛋白的50%以上,在胶上可以看到明显的粗大的条带。
3)将有表达的菌株10%甘油保种,保存1ml左右就足够了,并记录IPTG浓度范围.甘油是用0。
22μm过滤除菌的,储存浓度一般是30%—60%,使用时自己计算用量.4)用上述IPTG浓度范围的最低值诱导10ml表达菌,18度,低转速(140-180rpm),诱导过夜作为包涵体检测样品。
注意:1。
如果表达的蛋白对菌体有毒性,可以在加IPTG之前的培养基中加入1%的葡萄糖用来抑制本底表达。
葡萄糖会随着细菌的繁殖消耗殆尽,不会影响后面的表达。
2.保种可以取一部分分成50μl一管,每次用一管,避免反复冻融。
8、包涵体检测.方案见附件29、如有上清表达,则扩大摇菌。
1)取保种的表达菌株先摇10ml,37度,300rpm摇至OD>=1.5,约5h左右,视菌种的活性而异,也可过夜摇菌.2)将上一步中的8ml加入300ml培养基中37度,250rpm摇至OD= 1。
0左右(约2.5h~3h),然后加IPTG(浓度同包涵体检测中使用的浓度.)注:菌液浓度要适当的浓一些,否则第二天收集不到足够的菌体,因为低温低转速细菌生长非常缓慢。
“干实验”研究——在微机上模拟蛋白质纯化实验
1 “ 干实验” 软件的开发
1 1 开发思 路和 功能 .
模 拟动 态的实 验过程 难度 较 大 , 目前成 熟 的实用 软 件还 不 多见 。而用计 算机 模拟 蛋 白质纯 化实 验是 其
蛋 白质纯 化实 验模 拟软件 的最 终形 态应该 是一 个人 机交 互 的模拟 程序 。 由于用户 主要是 在校 学 习 生物 化学 课程 的本科 生 和研究 生 ,程序应 该 面向用
据 中归 纳 出相应 的规律 。我 们在 多年实 验教 学 的过 程 中积 累了大量 的实验 数据 ,从 理论上 建模 或是 用
pe e y smu ain s f a e h d af rd v lp n h s C ot a e a d p o e u e ft e d v l p n r i- lt d b i lt ot r .T e ie o e eo i g ti AIs f r n rc d r s o h e eo me ta e d s o w w
c s e .T e e c ig e e t ,u ig cr u tn e ,a d c mme t f s d n s a o tt e s f a e a e i t d c d usd h n t a h n f cs sn i msa c s n o c ns o t e t b u h ot r y nr u e . u w o F n l ,t e i e rf rh ru d t n olw n e eo me t ft i s f a e i p o o e . ia y h d a f u t e p ae a d fl i g d v l p n s ot r s r p s d l o o o h w
微量蛋白纯化实验报告
实验目的:本实验旨在学习并掌握微量蛋白纯化的基本原理和方法,通过实验操作,实现对目标蛋白的有效提取和纯化,并对其纯度和活性进行初步评估。
实验原理:蛋白质的纯化是基于蛋白质在物理化学性质上的差异,如分子量、电荷、溶解度等,通过不同的分离技术将目标蛋白从复杂混合物中分离出来。
本实验采用离子交换层析和凝胶过滤层析相结合的方法进行微量蛋白纯化。
实验材料:1. 蛋白质样品:细胞裂解液或组织匀浆等。
2. 离子交换层析柱:Sephadex G-25或类似产品。
3. 凝胶过滤层析柱:Sephadex G-75或类似产品。
4. 蛋白质标记物:如考马斯亮蓝G-250等。
5. 试剂:Tris-HCl缓冲液、NaCl、Gel Loading Buffer等。
实验步骤:一、离子交换层析1. 准备样品:将蛋白质样品用Tris-HCl缓冲液(pH 7.4)稀释至适当浓度。
2. 洗柱:用Tris-HCl缓冲液(pH 7.4)平衡离子交换柱,去除柱中杂质。
3. 加样:将稀释后的样品上柱,控制流速,使样品均匀分布在柱床上。
4. 洗脱:用不同浓度的NaCl溶液进行梯度洗脱,收集洗脱液。
5. 分析:取部分洗脱液进行SDS-PAGE电泳,观察目标蛋白的洗脱峰。
二、凝胶过滤层析1. 准备样品:将离子交换层析后的目标蛋白样品用Gel Loading Buffer稀释。
2. 洗柱:用Gel Loading Buffer平衡凝胶过滤柱,去除柱中杂质。
3. 加样:将稀释后的样品上柱,控制流速,使样品均匀分布在柱床上。
4. 洗脱:用Gel Loading Buffer进行洗脱,收集洗脱液。
5. 分析:取部分洗脱液进行SDS-PAGE电泳,观察目标蛋白的洗脱峰。
三、蛋白纯度评估1. 蛋白质标记:取部分纯化后的样品,加入蛋白质标记物,进行比色法或荧光法测定蛋白质浓度。
2. SDS-PAGE电泳:取部分纯化后的样品,进行SDS-PAGE电泳,观察目标蛋白的条带。
蛋白质纯化实验方案与应用
蛋白质纯化实验方案与应用蛋白质纯化的步骤通常包括以下几个方面:初步纯化、分离和纯化以及终点纯化。
初步纯化是指通过一系列简单的预处理步骤,如澄清、沉淀或去除其它成分来将目标蛋白质从混合物中分离出来。
基于目标蛋白质的物理性质和特征,可以选择不同的方法进行初步纯化,如沉淀、离心、过滤、超滤等。
分离和纯化是指将初步纯化得到的目标蛋白质进一步分离并提高纯度。
常用的方法包括色谱技术(如凝胶过滤、离子交换、亲和层析、凝胶电泳等)和电泳技术(如SDS-、IEF等)。
终点纯化是指通过一系列高级技术和步骤进一步提高目标蛋白质的纯度,如高效液相层析、透析、冰冻干燥等。
蛋白质纯化实验的应用广泛,特别是在生物医药领域。
通过蛋白质纯化,可以制备得到高纯度的蛋白质样品,进而用于研究蛋白质的结构和功能,探究蛋白质在生物体内的作用机制以及与疾病发生发展的关联。
此外,蛋白质纯化也是生物医药制剂开发中不可或缺的一步,可以确保药物的纯度和安全性。
另外,蛋白质纯化还可用于工业生产中的酶、抗体、疫苗、血液制品等产品的制备。
在蛋白质纯化实验中,为了提高纯度和产率,并减少不必要的损失和污染,需要合理设计实验方案。
下面是一个常用的蛋白质纯化实验方案的示例:1.初步纯化-提取样品:将生物样本中的蛋白质溶解提取出来,去除其它成分。
-澄清:通过离心或滤过等方法去除大分子物质和固体杂质。
-浓缩:用浓缩设备或浓缩胶等方法将蛋白质溶液浓缩。
-洗脱:使用合适的缓冲液洗脱目标蛋白质。
2.分离和纯化-使用一种或多种分离技术(如色谱技术和电泳技术)将蛋白质纯化。
-根据蛋白质的性质和特征,选择适当的分离方法和条件,如酸碱度、温度、流速等。
-根据分离结果,收集含有目标蛋白质的样品,排除不需要的成分。
3.终点纯化-使用高级技术和步骤进一步提高目标蛋白质的纯度。
-使用高效液相层析技术(如逆流层析、亲和层析等)和透析、冰冻干燥等方法进行终点纯化。
-最终得到高纯度的蛋白质样品。
蛋白质纯化实验流程
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1. 蛋白质样品,含有目标蛋白质的溶液,例如细胞裂解液、组织提取物或发酵液。
蛋白共纯化实验报告
1. 学习蛋白质纯化的基本原理和方法。
2. 掌握利用亲和层析法进行蛋白质共纯化的技术。
3. 通过实验验证蛋白质共纯化的效果。
二、实验原理蛋白质共纯化是指从混合蛋白质样品中同时分离和纯化两种或两种以上的目的蛋白。
亲和层析法是蛋白质共纯化常用的技术之一,其原理是利用蛋白质与特定配体的亲和力,通过柱层析将目的蛋白从混合样品中分离出来。
三、实验材料1. 试剂:亲和层析柱、亲和配体、洗脱液、样品缓冲液、SDS-PAGE凝胶、考马斯亮蓝染色液等。
2. 仪器:离心机、层析柱、凝胶成像仪等。
四、实验方法1. 准备亲和层析柱:将亲和配体固定在层析柱上,制成亲和层析柱。
2. 样品处理:将混合蛋白质样品加入亲和层析柱,进行预平衡。
3. 亲和层析:将样品溶液通过亲和层析柱,目的蛋白与亲和配体结合,其他蛋白质通过柱。
4. 洗脱:用洗脱液洗脱亲和配体上的目的蛋白,收集洗脱液。
5. 检测:将洗脱液进行SDS-PAGE分析,观察目的蛋白的纯度。
6. 收集目的蛋白:将SDS-PAGE凝胶上的目的蛋白条带切割下来,进行后续处理。
五、实验结果与分析1. 亲和层析柱制备成功,亲和配体固定在层析柱上。
2. 样品溶液通过亲和层析柱,目的蛋白与亲和配体结合,其他蛋白质通过柱。
3. 用洗脱液洗脱亲和配体上的目的蛋白,收集洗脱液。
4. SDS-PAGE分析结果显示,洗脱液中含有目的蛋白,且纯度较高。
通过亲和层析法进行蛋白质共纯化实验,成功分离和纯化了两种目的蛋白,验证了实验方法的有效性。
七、实验注意事项1. 亲和层析柱制备过程中,要注意配体的固定量和固定效果。
2. 样品处理过程中,要确保样品溶液的浓度适宜,避免样品过浓或过稀。
3. 亲和层析过程中,要注意控制洗脱液的pH值和离子强度,以保证目的蛋白的稳定性。
4. 实验过程中,要注意层析柱的清洗和保存,避免污染。
5. 实验结束后,要对实验数据进行整理和分析,总结实验结果。
结合计算机模拟的蛋白质分离纯化实验2
结合计算机模拟的蛋白质分离纯化实验摘要本文利用数学建模的方法首次提出了衡量分离纯化效果优劣的定量指标——纯化效益;并对回纯系数的确定进行解释,以便让大家根据自己的需要选择适当的标准,从而达到最佳的实验效果。
建立了便于应用推广的聚乙二醇(polyethylene glycol , PEG和硫酸铵沉淀分离纯化模型并对模型进行求解、检验和应用。
提出了PEG和硫酸铵分级沉淀的最优实验方案求解模型,并对其步骤进行解释,以海芋过氧化物酶分离纯化为例,提供了求解的模板。
关键词纯化效益PEG沉淀硫酸铵沉淀数学建模计算机模拟实验、尸■、亠前言二十一世纪是生物科学的世纪,生物科学需要迅速发展就必须与自然科学的基础数学和现代化的象征——计算机技术相互结合。
将生化分离纯化实验与数学和计算机技术(即数学建模)相结合,可提高实验效率,使分离纯化上升到一个高层次,但是一般的分离纯化数学模型深度较大,对数学的要求很高不便于推广应用。
本文以海芋中过氧化物酶的分离纯化为例,就分离纯化中最常用的沉淀法建立便有应用推广的数学模型,只需测定有限的实验数据,用大众化的软件Excel 来拟合,求解出药品用量与实验效果之间的关系,就可以用Excel 进行无限的计算机模拟实验,寻找出最优的实验试剂用量。
对于分离纯化效果的优劣的判断,目前都是根据纯化倍数和回收率作大概判断的,这种判断较为粗糙,带有很强的主观性,而且有时候根本就很难分别出实验效果的优劣。
本文提出了用纯化倍数和回收率的函数——纯化效益来作为衡量分离纯化效果优劣的定量指标,使分离纯化效果优劣的判断更加客观、科学,而且实验优劣的判断变得更加简单。
也可以实现对不同分离方法之间的分离纯化效果进行比较。
以便实现最快速的找到最优的方法。
对于PEG沉淀分离纯化法,由于其对蛋白质的活性构象起保护作用,所以被广泛用作蛋白质分离的有效沉淀剂。
目前其沉淀原理还不清楚,沉淀的理论解释有多种,但都还仅仅是假设,其中已有的并被多数人接受的沉淀模型是空间阻排学说,⑴其数学表述为:IgS • f s = x—ac,式中S为蛋白质的溶解度,f s为溶液中蛋白质相互作用的摩擦系数,c为PEG的浓度,x、a在一定的条件下是常数,但当溶液中含的蛋白质种类较多时公式lg S • f s二x 一ac很难应用于分离纯化。
大量纯化蛋白的简易步骤
纯化蛋白的简易步骤纯化1.配制培养基LB, 挑取菌种至含有抗生素的LB液体培养基中(50ml+1管菌种),37 ℃ 220rpm培养。
2.取10mL培养的菌液转接到1000 mL新鲜的LB抗性培养基中,37 ℃220 rpm培养至OD600≈0.4-0.5。
3.将培养箱温度调至20℃,转速调至180rpm,继续培养约0.5h-1h(取出1mL菌液作为诱导前对照)。
之后加入1 M IPTG至终浓度为0.1-1 mM(本次实验的浓度为0.1mM),继续诱导培养大约9-10小时(取出1mL菌液作为诱导后对照)。
4.4℃,4000rpm离心,15min收集菌体。
沉淀可冻于-80℃保存(做蛋白结晶尽量不要冻存)。
5.配制buffer A,如下6.加入适当的buffer A (含有100mM PMSF 1:100、10mg/mL Dnase 1: 1000、2M MgCl21:2000)。
1000mL菌液收的菌,加入30mL即可,太少超声时容易起泡。
7.混匀后冰上放置20Min,期间不时的震荡。
混合物使用液压破碎(比超声破碎好)。
8.离心10000rpm,4℃,45min,彻底去除菌体碎片,取上清备用。
(一定不要菌体碎片!取4ul+4ulLB 作为binding前的对照)9.Ni beads的预处理:取适量beads,加入适量的buffer A,如800uL beads(1000mL菌液沉淀)加入1mL buffer A,800rpm,2.5min,洗3次。
10.将步骤6所得的上清与预处理好的beads加入50mL的离心管中,封口膜封口后,静音混匀器4℃binding1-2h(时间过长蛋白易降解)。
11.将binding后的溶液过柱(取4ul+4ulLB 作为binding后的对照),加入10CV wash buffer,放置10min后冲洗(取4ul+4ulLB 作为wash后的对照)。
Wash buffer: buffer A+20mM imidazole12.洗好的beads加入适量(5CV)的elution buffer,放置10min后洗脱。
蛋白质纯化实验技术报告
蛋白质纯化实验技术报告蛋白质是生物体内最基本的组成成分之一,它在维持生命的各个方面都起着重要的作用,因此,研究蛋白质的纯化技术具有重要的科学意义和应用价值。
本文将从蛋白质的纯化目的、方法选择、实验步骤和结果分析等方面进行详细介绍。
一、纯化目的二、方法选择蛋白质的纯化方法多种多样,常用的包括盐析、凝胶过滤、离子交换、亲和层析、逆流层析等。
在选择方法时,需要根据蛋白质的特性、溶液条件和设备条件等因素进行综合考虑。
三、实验步骤1.细胞破碎和初步纯化:将含有目标蛋白质的细胞悬液经离心分离细胞碎片,得到上清液,进行初步纯化。
2.过滤和沉淀:使用滤膜或沉淀物去除杂质,得到蛋白质溶液。
3.层析纯化:根据蛋白质的性质选择适当的层析柱,如离子交换柱、亲和柱等,进行层析纯化。
4.打破和再层析:对于较复杂的蛋白质混合物,可以使用还原剂或表面活性剂等打破蛋白质复合物,然后再次进行层析纯化,以提高纯化效果。
5.纯化评价:使用聚丙烯酰胺凝胶电泳或质谱等方法对纯化后的蛋白质样品进行评价,确认其纯度和活性。
四、结果分析根据实验结果,可以评估所选纯化方法的有效性和适用性,判断所得纯化样品的纯度和活性。
同时,还需对纯化条件进行优化,以进一步提高纯化效果。
五、结论本实验采用了其中一种纯化方法成功地获得了目标蛋白质的高纯度和高活性样品,并对其进行了初步的理化性质分析。
结果表明,所选的纯化方法具有较高的有效性和适用性,可以应用于进一步的研究和应用。
综上所述,蛋白质纯化实验是一项复杂而重要的工作,需要根据蛋白质的特性和实验条件等因素进行综合考虑,以选择合适的纯化方法。
通过详细的实验步骤和结果分析,可以得出纯化效果的评价和结论,并为进一步的研究提供有价值的参考。
蛋白分离纯化实验报告
一、实验目的1. 掌握蛋白质分离纯化的基本原理和操作方法。
2. 学习不同分离纯化技术的应用。
3. 提高实验操作技能和数据处理能力。
二、实验原理蛋白质是生物体内重要的生物大分子,具有复杂的结构和功能。
蛋白质分离纯化是研究蛋白质结构和功能的重要手段。
本实验采用多种分离纯化技术,包括:材料预处理、细胞破碎、离心分离、沉淀分离、膜过滤分离和色谱分离等,实现对蛋白质的分离纯化。
三、实验材料与仪器1. 实验材料:大肠杆菌细胞、质粒DNA、限制性内切酶、DNA连接酶、PCR产物、琼脂糖、电泳缓冲液、考马斯亮蓝R-250等。
2. 实验仪器:PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统、离心机、移液器、玻璃棒、培养箱、无菌操作台等。
四、实验步骤1. 蛋白质提取(1)将大肠杆菌细胞培养至对数生长期。
(2)收集细胞,用玻璃棒搅拌,加入预冷的提取缓冲液,低温条件下进行细胞破碎。
(3)离心分离,取上清液即为蛋白质粗提液。
2. 蛋白质沉淀(1)向蛋白质粗提液中加入一定量的硫酸铵,搅拌溶解。
(2)离心分离,收集沉淀,即为蛋白质沉淀。
3. 蛋白质溶解(1)将蛋白质沉淀溶解于适量的缓冲液中。
(2)调整pH值,使蛋白质处于适宜的溶解状态。
4. 蛋白质分离纯化(1)离子交换色谱:将蛋白质溶液上样至离子交换柱,用不同浓度的盐溶液进行梯度洗脱,收集目标蛋白峰。
(2)凝胶过滤色谱:将蛋白质溶液上样至凝胶过滤柱,用缓冲液进行洗脱,收集目标蛋白峰。
5. 蛋白质鉴定(1)聚丙烯酰胺凝胶电泳:将分离纯化的蛋白质样品进行SDS-PAGE电泳,分析蛋白质分子量。
(2)考马斯亮蓝R-250染色:观察蛋白质条带,判断蛋白质纯度。
五、实验结果与分析1. 蛋白质提取:通过细胞破碎和离心分离,成功提取出大肠杆菌细胞中的蛋白质。
2. 蛋白质沉淀:硫酸铵沉淀法成功地将蛋白质从粗提液中分离出来。
3. 蛋白质溶解:调整pH值后,蛋白质成功溶解于缓冲液中。
4. 蛋白质分离纯化:离子交换色谱和凝胶过滤色谱成功地将目标蛋白从粗提液中分离出来。
蛋白质分离纯化及鉴定综合实验
蛋白质分离纯化及鉴定综合实验一、实验内容将昆虫总蛋白通过匀浆的方法溶解于磷酸氢二纳/磷酸二氢纳缓冲液中,离心取上清液作为蛋白质粗提液用考马斯亮蓝G-250法测定蛋白质浓度;将粗提液通过Sephadex G-25凝胶层析柱进行分离,分部收集流出物,得到不同的组分,测定不同组分的蛋白质浓度;将蛋白粗提液和收集到的各组分进行SDS—PAGE分析,比较粗提液和各组分中蛋白质的成分,分析分离效果。
二、实验过程:1.蛋白质粗提液制备溶液配制:0.1mol/L pH7.4 磷酸缓冲液(1)1000ml 0.1mol/L磷酸氢二纳;磷酸氢二纳溶于800mL蒸馏水中,定容至1L;(2)250mL2.蛋白质浓度测定(1)溶液配制1mg/mL 牛血清白蛋白(BSA)标准溶液:5mg牛血清白蛋白溶于5ml水中;考马斯亮蓝G-250蛋白试剂:称取100mg考马斯亮蓝G250溶于50ml 90%的乙醇溶液中,加入85%的磷酸100mL,最后用蒸馏水定容到1000mL,滤纸过滤,避光保存。
(2)0~100ug/mL标准曲线测定:取6支试管,按下表配制蛋白质浓度梯度各2mL蛋白质浓度0 20 40 60 80 100µg/ml1mg/mL BSA溶0 40 80 120 160 200液(µl)蒸馏水(µl)2000 1960 1920 1880 1840 1800总体积(µl)2000 2000 2000 2000 2000 2000测定各个浓度的标准溶液595nm吸光值(OD595):500uL蛋白质溶液与2.5mL 考马斯亮蓝G250溶液混匀,用分光光度计测定OD595,每个溶液3次重复测定。
以OD595值(3次重复的平均值)为X,蛋白浓度为Y做直线,得出标准曲线Y=aX+b,R=?。
(3)测定粗提液蛋白浓度,将粗提液用蒸馏水稀释100倍(2mL),取稀释液500uL与2.5mL考马斯亮蓝G250溶液混匀,用分光光度计测定OD595,以500uL 蒸馏水+2.5mL考马斯亮蓝G250溶液混匀作为空白对照,3次重复测定,用平均值计算其浓度。
蛋白质纯化实验方案与应用
蛋白质纯化实验方案与应用1. 引言蛋白质是生物体内最重要的分子之一,它们参与调节细胞功能、传递信号、催化反应等生命活动。
为了全面了解蛋白质的功能和结构,需要进行蛋白质的纯化实验。
蛋白质纯化是从细胞提取蛋白质并去除其他成分的过程,通过纯化蛋白质可以获得高纯度的样品,便于后续的结构和功能研究。
本文将介绍常用的蛋白质纯化实验方案及其应用。
2. 蛋白质纯化的步骤蛋白质纯化可以分为几个关键步骤,包括细胞破碎、溶液处理、分离纯化和纯化蛋白质的检验。
2.1 细胞破碎细胞破碎是蛋白质纯化的第一步,目的是破坏细胞膜并释放蛋白质。
常用的方法有机械破碎、超声波破碎、冻融法等。
机械破碎是将细胞悬浮液通过高速离心等手段分离得到上清液,其中含有蛋白质。
超声波破碎则是利用超声波的机械作用产生震荡,破坏细胞膜。
冻融法则是通过多次冻结和融解来破坏细胞膜。
2.2 溶液处理在细胞破碎之后,需要对样品进行溶液处理,包括调节pH值、添加蛋白质稳定剂和抗菌剂等。
调节pH值可以提高纯化效果,一般在6-8之间为宜。
蛋白质稳定剂可以保护蛋白质避免其降解和失活,常用的有甘油、甜菜碱、牛血清白蛋白等。
抗菌剂可以防止细菌污染,常用的有氨基苄青霉素、氯霉素等。
2.3 分离纯化分离纯化是蛋白质纯化的核心步骤,其目的是将目标蛋白质与其他杂质进行有效的分离。
常见的分离纯化方法包括离子交换层析、凝胶过滤层析、亲和层析、凝胶电泳等。
离子交换层析是通过蛋白质与离子交换树脂之间的相互作用来分离目标蛋白质。
树脂上的固定的功能基团可以选择性地结合目标蛋白质,而其他杂质则被排除。
凝胶过滤层析是利用凝胶孔径的不同分离蛋白质,大分子量的蛋白质会被滞留在凝胶中,而小分子量的蛋白质则通过。
亲和层析是利用蛋白质与某些特定配体之间的特异性结合来分离目标蛋白质。
配体可以是金属离子、抗体、某些亲和剂等。
凝胶电泳是根据蛋白质在电场中的迁移速度不同来分离目标蛋白质。
凝胶电泳可通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)、等电聚焦电泳(IEF)等方法进行。
蛋白质纯化实验方案与应用
蛋白质纯化实验方案与应用1. 引言蛋白质纯化是研究蛋白质结构和功能的关键步骤之一。
在生物学、生物化学和生物医学研究中,纯化蛋白质可以为后续实验提供准确可靠的结果。
本文将介绍蛋白质纯化的基本原理和常用的实验方案,并讨论其在不同研究领域中的应用。
2. 蛋白质纯化的基本原理蛋白质纯化的基本原理是利用不同蛋白质的特异性质,如大小、溶解性、电荷等,通过一系列分离步骤将目标蛋白质从混合物中纯化出来。
蛋白质纯化的一般步骤包括:组织或细胞裂解、蛋白质分离、蛋白质纯化和纯化蛋白质的分析。
3. 蛋白质纯化实验方案根据蛋白质的特性,蛋白质纯化可以采用不同的实验方案。
常用的蛋白质纯化方法包括:3.1. 分子量筛选分子量筛选是一种常用的蛋白质纯化方法。
该方法利用蛋白质分子量的差异,通过分子量筛选柱将目标蛋白质从混合物中分离出来。
常用的分子量筛选柱包括凝胶过滤柱、凝胶电泳和超滤等。
3.2. 亲和纯化亲和纯化是通过蛋白质与特定配体之间的亲和作用实现的。
常见的亲和纯化方法包括亲和层析、亲和电泳和亲和吸附柱等。
这些方法利用蛋白质与配体之间的特异性相互作用,将目标蛋白质与其他蛋白质分离。
3.3. 离子交换层析离子交换层析是利用蛋白质与层析柱上载体表面的离子交换作用进行分离的方法。
该方法根据蛋白质的电荷性质,通过调节溶液pH值,使目标蛋白质与层析柱上的离子交换载体发生相互作用,从而实现分离。
3.4. 逆流层析逆流层析是一种高效的蛋白质纯化方法。
其原理是将样品溶液逆向通过填充物,使蛋白质在填充物中与流动相发生相互作用,从而实现蛋白质的分离和纯化。
4. 蛋白质纯化实验应用蛋白质纯化在不同的研究领域中有着广泛的应用。
以下是一些典型的应用领域:4.1. 生物学研究蛋白质纯化在生物学研究中起着关键的作用。
研究者可以通过纯化蛋白质来研究其结构和功能,并深入了解细胞过程和信号传导等生物学机制。
4.2. 生物化学研究通过蛋白质纯化,研究人员可以获得高纯度的目标蛋白质样品,以便进行生物化学分析。
模拟“蛋白质提取”实验设计
模拟“蛋白质提取”实验设计《高中生物(选修一)》中的“蛋白质提取技术”一节,利用Sephadex G-75进行蛋白质提取的操作。
该实验是当今蛋白质技术的真实反映,能够激发学生学习兴趣,但实验投入昂贵,且占用课时较多,在目前条件下,尚难以在中学普遍推广。
在此,笔者利用纯水制取工业中常用的阴-阳离子交换树脂代替Sephadex G-75进行模拟实验,不但能够说明蛋白质技术的基本原理,还大大降低了实验成本、缩短了实验课时,适合广大中学生物实验教学使用。
一、材料和方法1.树脂的清洗将市售732阳离子交换树脂、717阴离子交换树脂各称取3g,分别放置于50ml 小烧杯中。
加入30ml蒸馏水,用玻璃棒缓慢搅拌20s,倒去上层清液(留在烧杯中的水分不超过10ml)。
反复上述操作,直至上清液呈无色透明为止。
之后加入30ml 浓度为95%的乙醇,缓慢搅拌30s,室温浸泡过夜。
2.树脂的活化倒去乙醇,蒸馏水冲洗至无乙醇气味。
倒去多余水分后(留在烧杯中的水分不超过10ml),向阳离子树脂中加入30ml浓度为12%的盐酸,向阴离子树脂中加入30ml浓度为10%的NaOH溶液。
玻璃棒搅拌30s使溶液与树脂充分接触,静置4h。
3.装柱倒去盐酸、NaOH溶液,用蒸馏水冲洗3~5遍。
将阴、阳离子树脂各装填到1个10ml注射器中,分别记作阴离子交换柱和阳离子交换柱。
4.加入样品及检测用滴管吸取0.05mol/L的CuSO4溶液(记作溶液A),以1滴/s的速度滴入阳离子交换柱中。
用试管收集流出液体5ml,记作溶液B。
用滴管吸取3ml溶液B,以1滴/s的速度滴入阴离子柱中,用试管收集流出液体,记作溶液C。
分别将A,B,C溶液加入0.1mol/L的NaOH溶液和0.05mol/L的Ba(NO3)2中,观察现象。
二、结果与分析溶液A在NaOH和Ba(NO3)2溶液中都有沉淀,溶液B在NaOH溶液中无沉淀而在Ba(NO3)2溶液中有沉淀,C溶液在NaOH和Ba(NO3)2溶液中都没有沉淀(见表1)。
纯化蛋白,实验总结
实验汇总实验内容1近两周主要做了肿瘤多肽疫苗Vbp3的诱导表达和纯化以及鉴定实验。
2学习培养细胞一些技能,给细胞换液并传代,自己培养了一瓶E3细胞,并学习处理细胞,传代,计数。
学习使用倒置显微镜观察细胞,以及细胞实验室的一些注意事项。
3 取得杂交瘤细胞,然后我给小鼠注射,每只0.5ml制备抗体用。
实验结果1先培养了菌株进行原核表达多肽,经过表达后SDS-PAGE电泳鉴定可以得出目的蛋白得到了表达。
通过与Maker对比可以看出有目的蛋白表达。
2然后进行超声破碎菌体,使表达的蛋白裂解,然后进行洗脱纯化。
洗脱液的浓度梯度分别为5mM 咪唑,20 mM 咪唑,80mM 咪唑,250 mM 咪唑,500mM 咪唑。
通过SDS-PAGE电泳鉴定出,在250 mM 咪唑处有目的蛋白被洗脱出。
如下图所示:Maker 样品PBS洗脱5Mm 20 mM 80 mM 250 mM 500mM 250Mm图中开始加的为maker,然后为裂解后未洗脱的样品,然后pbs,接着是不同浓度的咪唑洗脱下来的蛋白。
在不同浓度洗脱液的紫外峰值分别为:3以bFGF 为抗原包板做ELISA实验,以鼠单抗和人源化抗体为一抗,以羊抗鼠酶标抗体为二抗,进行检测鼠单抗的效价。
结果如下表所示:Measurement count: 1 Filter:4501 2 3 420000 0.121 0.121 2.563 2.733 0.121 2.648 0 0.120208 40000 0.105 0.116 2.52 2.533 0.1105 2.5265 0.007778 0.009192 80000 0.11 0.131 2.15 1.93 0.1205 2.04 0.014849 0.155563 160000 0.084 0.084 1.361 1.654 0.084 1.5075 0 0.207182 320000 0.109 0.131 0.824 1.082 0.12 0.953 0.015556 0.182434 640000 0.112 0.113 0.578 0.632 0.1125 0.605 0.000707 0.038184 1280000 0.115 0.126 0.429 0.423 0.1205 0.426 0.007778 0.004243 2560000 0.111 0.12 0.112 0.082 0.1155 0.097 0.006364 0.021213ELISA 结果结果分析图标准误差图图中1,2中一抗为人源化抗体,3,4中一抗为鼠单抗。
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微机模拟蛋白质纯化实验一、实验目的:1. 了解模拟生化干实验的方法和意义,掌握用protein软件提纯蛋白质的方法。
2. 进一步熟悉层析、热变性、盐析等常用生化分离方法的原理和应用。
二、实验原理:“Protein”软件有36个任务,即36组待分离纯化的蛋白。
任务要求利用软件提供的几种实验技术,提纯每一个目的蛋白,最终达到单向电泳一条带,双向电泳一个点,而且使用的人时和经费(根据提取步骤计算得到)不得超过一个特定值。
在每个任务开始时,软件给出目的蛋白的一些性质,如热稳定的温度范围和pH稳定范围等,利用这些信息,可以使实验少走弯路。
“Protein”提供的分离纯化方法有七种:①热变性;②硫铵沉淀;③排阻层析(凝胶色谱);④离子交换层析;⑤吸附层析;⑥聚焦层析;⑦制备电泳。
在“Protein”所提供的各种分离纯化方法中,热变性法和盐析法是比较好的粗提方法,在提纯的早期使用效果较好。
层析是各种方法中最强有力的方法,制备电泳虽然纯化倍数高,但是回收率低。
在各种层析方法中,又以离子交换层析最为有效和易于使用,并且耗费的人时和经费也较少。
排阻层析和聚焦层析耗费较大,但在某些特定情况下,这两种方法是不可替代的。
“Protein”提供了四种电泳方法:即,SDS-PAGE、PAGE、等电聚焦电泳和双向电泳。
这些电泳方法不但可以用以检测样品的纯度,而且也给出了样品的一些信息,如分子量、等电点等,这些信息对于后续提纯有重要的参考价值,等电聚焦电泳和PAGE还可以用于制备。
本实验要求完成实验软件中三种酶的分离纯化。
三、实验步骤:实验中为了比较在样品性质不同情况下,如何有效分离,以及各种方法的优劣,拟分离如下三种样品:1. pH稳定范围较大的蛋白(Windows 1号酶)2. 酸性条件下稳定的蛋白(Windows 3号酶)3. 碱性条件下稳定的蛋白(Windows 36号酶)1.pH稳定范围较大的蛋白(Windows 1号酶)1号酶在50度下稳定,稳定范围2-11(稳定范围较大)(1)分离纯化步骤:先通过DI-DEM看一下样品的情况:pH3~10,分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)由图片可以看出,杂蛋白含量比较少,各种蛋白的Mr和pI相差较大。
A.硫铵沉淀法初始百分饱和度0,终末饱和度50%,收集沉淀B.离子交换层析:填料:DEAE-Sephadex A-50,柱长=10CM,柱内径=2CM;缓冲体系:乙酸-乙酸钠(pH3.6-5.8),pH4.4,流速0.3ml/min;离子强度梯度洗脱:0.01mol/L-0.15mol/L,洗脱体积:300ml。
(如下图)洗脱曲线如下图:由洗脱曲线可以看出,目的酶和杂蛋白有一定的重合,可以通过收集来避免一些杂蛋白的干扰,收集70-95ml的组分,做如下检验。
(2)检测纯化结果:A.二维电泳:pH3-10,分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)已达一个点的要求。
B.PAGE 缓冲体系:乙酸-乙酸钠(3.6-5.8),pH=5结果显示一条带,证明纯化效果不错。
再用SDS-PAGE对比一下。
C.SDS-PAGE:分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)经检验,发现有两条很近的带,故目的蛋白提纯不够彻底,应对收集到的70-95ml的组分继续用离子交换层析。
(3)第二次离子交换层析:填料DEAE-Sephadex A-50,柱长:10cm,柱内径:2.0cm,缓冲体系:磷酸氢二钠-Citrate(2.2-8.0),pH 4.3,流速:0.3ml/min,离子强度梯度洗脱:0.01mol/L-0.15mol/L,洗脱体积:300ml。
(如下图)洗脱曲线如下:收集10-40ml组分后进行蛋白质纯化检测(4)第二次检测纯化结果:A.二维电泳,pH 3~10,分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)已达到一个点的要求。
B.PAGE 缓冲体系:乙酸-乙酸钠(3.6-5.8),pH=5用PAGE检验,已达到一条带的要求,作为对比再用SDS-PAGE检验。
C.SDS-PAGE:分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)SDS-PAGE检验结果显示,有一条带。
此次分离效果很好,整体的分离效果比较好,花费较少。
(5)实验结果分析:1号目的酶的Mr约为29000,PI=4.4。
稳定pH 2~11,稳定温度<50℃。
2.酸性条件下稳定的蛋白(Windows 3号酶)3号酶在62℃以下稳定,稳定pH范围3.8~5.8(酸性条件)(1)分离纯化步骤:先通过DI-DEM看一下样品的情况:pH3~10,分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)由图片可以看出,杂蛋白含量比较少,各种蛋白的Mr和pI相差较大。
我们可以利用热变性或者是硫铵沉淀的办法进行初提纯处理。
A.热变性:水浴温度61℃,水浴时间60min,可以得到22.162g,99%的酶活力初提取效果很好。
B.硫铵沉淀:初始百分饱和度40%,终末百分饱和度80%(质量分数),收集沉淀组分。
C.吸附层析:填料Bio-Gel HTP,柱长:35cm,柱内径:2.0cm,缓冲体系:乙酸-乙酸钠(3.6-5.8),pH 5.0,流速:0.3ml/min,离子强度梯度洗脱:0.02mol/L-0.30mol/L,洗脱体积:300ml洗脱曲线如下:由洗脱曲线可以看出,目的酶和杂蛋白有一定的重合,可以通过收集来避免一些杂蛋白的干扰,收集72-96ml的组分,做如下检验。
(2)检测纯化结果:二维电泳:pH3-10,分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)出现两个点,不符合要求,进行凝胶层析分析。
(3)凝胶层析:填料Sephadex G-75,柱长:100cm,柱内径:2.0cm,缓冲体系:磷酸氢二钠-Citrate(2.2-8.0)pH 5.6,浓度0.02mol/L,流速:0.3ml/min,洗脱曲线如下收集290-340ml的组分,做如下检验。
(4)第二次进行蛋白纯化检验:A.二维电泳:pH3-10,分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)已达到一个点的要求。
B.PAGE 缓冲体系:分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数),缓冲体系:磷酸二氢钾-NaOH,pH 8.0用PAGE检验,已达到一条带的要求,作为对比再用SDS-PAGE检验。
C.SDS-PAGE:分离胶浓度20%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)已达到一条带的要求,此次分离效果很好,整体的分离效果比较好,花费较少。
(5)结果分析:3号蛋白Mr约为6800,p I=6.0,稳定pH 3.8~5.8,稳定温度<62℃。
3.碱性条件下稳定的蛋白(Windows 36号酶)36号酶在31度下稳定,稳定pH范围7.7-10(1)分离纯化步骤:先通过DI-DEM看一下样品的情况:pH3~10,分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)由图片得知,蛋白比较杂,在pH7.2-10这个范围内,蛋白质的分子量差异较大,比较分散。
目的酶的温度比较低,故不用热变性法,在用硫铵沉淀法后发现对杂蛋白的分离效果不大,所以直接用细分离。
A.吸附色谱填料:氧化铝,柱长=35CM,直径=2CM;缓冲体系:Gly-NaOH(pH8.6-10.6),pH8.6。
洗脱曲线如下:由洗脱曲线可以看出,目的酶和杂蛋白有一定的重合,可以通过收集来避免一些杂蛋白的干扰,收集210-280ml的组分,做如下检验。
(2)蛋白纯化检验:发现各种蛋白的Mr和pH差异比较大,用凝胶过滤层析和离子交换层析都可以。
(3)第二次分离纯化:离子交换层析:填料:DEAE-Sephadex A-50,柱长=10CM,柱内径=2CM;缓冲体系:Gly-NaOH(pH8.6-10.6),pH=8.6,流速0.3ml/min;离子强度梯度洗脱:0.01mol/L-0.15mol/L,洗脱体积:300ml。
(如下图)洗脱曲线如下:由洗脱曲线可以看出,目的酶和杂蛋白有一定的重合,可以通过收集来避免一些杂蛋白的干扰,收集70-100ml的组分,做如下检验。
(4)第二次蛋白纯化检验:A.二维电泳:pH3-10,分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)已达到一个点的要求。
B.PAGE 缓冲体系:Gly-NaOH(pH8.6-10.6),pH8.6。
由图可以看出,除了目的蛋白的条带外,在它上面还有一条浅浅的带,杂蛋白未除尽。
由杂蛋白和目的蛋白条带的接近程度可大致得出,杂蛋白和目的蛋白的PI接近。
作为对比再用SDS-PAGE 检测一下。
C.SDS-PAGE:分离胶浓度10%(体积分数),浓缩胶浓度3%(体积分数)结果显示,只有一条清晰的带。
二维电泳一条带,PAGE虽两条带,不过杂蛋白的量很少,条带不明显。
如果接下来的实验对蛋白纯度要求不是特别高,达到上述纯度即可。
(5)实验结果分析:36号目的酶的Mr约为30800,PI=8.4。
稳定pH 7.7~10,稳定温度<31℃。
实验小结:这次实验的情况让我了解了各种蛋白质的相关性质的测定方法,同时也了解到了相关的方法的一些具体的操作过程,学到了很多书本上没有的知识。
实验的结果整体比较令人满意,用的相关步骤也是比较简单省钱的,所以效果比较好!不过还是有些遗憾就是第三个在等点检测和PAGE 检测的时候是出现了两条带,说明自己还有很多的不足需要进一步的学习!。