蛋白质的表达、分离、纯化实验.doc
蛋白质的分离纯化
蛋白质的分离纯化蛋白质是生命体中最基本的分子之一,它在细胞内发挥着重要的功能。
由于蛋白质的复杂性和多样性,研究人员通常需要从复杂的混合物中分离和纯化蛋白质。
蛋白质的分离纯化是生物化学和生物技术领域中非常重要的一项工作,它为我们深入研究蛋白质的结构和功能提供了必要的条件。
蛋白质的分离纯化可以通过多种不同的方法实现,这些方法包括离心法、凝胶过滤法、电泳法、层析法等。
在选择合适的方法时,研究人员需要考虑到蛋白质的特性以及实验的要求。
离心法是最常用的分离方法之一,在离心过程中,通过调整离心力和离心时间,可以实现不同密度的蛋白质的分层。
这种方法适用于分离大分子量的蛋白质。
凝胶过滤法是利用孔径不同的凝胶将蛋白质分离开来。
通常使用的凝胶有琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶,这些凝胶具有不同的孔径,可以根据蛋白质的分子量选择合适的凝胶进行分离。
电泳法是基于蛋白质的电荷和分子量差异而进行分离的方法。
最常用的电泳方法是SDS-PAGE电泳,通过使用SDS(十二烷基硫酸钠)对蛋白质进行解性和蛋白质间的形成复合物,使得蛋白质在电泳过程中仅仅受到电场力的影响,从而实现蛋白质的分离。
层析法是一种利用物质在载体上的分配和吸附性质进行分离的方法。
常见的层析方法有凝胶层析、亲和层析、离子交换层析等。
凝胶层析是通过利用载体颗粒的孔径进行分离,亲和层析是将特定配体固定在载体上,与目标蛋白质结合,从而实现分离,而离子交换层析是利用载体表面电荷与目标蛋白质的电荷相互作用进行分离。
在进行蛋白质的分离纯化时,需要注意以下几个关键步骤。
首先是样品制备,通常样品要经过细胞破碎、蛋白质提取等步骤,使得目标蛋白质从复杂的混合物中提取出来。
其次是样品的处理,包括去除杂质、调整蛋白质的溶液环境等。
然后是选择合适的分离方法,根据蛋白质的特性和实验要求来确定最适合的方法。
最后是纯化过程中的监测和分析,通过使用各种蛋白质分析方法,如SDS-PAGE、Western blot等,来确定目标蛋白质的纯化程度和鉴定其存在。
蛋白质的表达、纯化及检测-分子实验报告
实验目的1.了解外源基因在大肠杆菌细胞中的诱导表达情况2.学会用SDS-PAGE电泳法分离不同分子量的蛋白质3.学习通过亲和层析法纯化目的蛋白4.学会考马斯亮蓝染色法和蛋白质杂交法检测蛋白质实验原理1.外源基因在大肠杆菌细胞中的诱导表达:将外源基因克隆在特殊的表达载体中,让其在E. coli中表达,该表达载体上含有lac操作子的启动子。
在不加诱导剂的条件下培养宿主菌,lacI基因表达的阻遏蛋白LacI与lac操作子结合,使外源基因不能表达;向培养基中加入诱导物IPTG后,LacI阻遏蛋白变构失活,不能与lac操作子结合,外源基因就表达。
2.蛋白质SDS-PAGE电泳分离:SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白质的电泳方式,特别是用于蛋白质纯度检测和测定蛋白质分子量。
其分离原理是根据蛋白质分子量的差异,因为SDS-PAGE的样品处理液及缓冲液的加入破坏了蛋白质的二级、三级、四级等结构,并使SDS与蛋白质充分结合形成SDS-蛋白质复合物,稳定地存在于均一的溶液中,SDS与蛋白质结合后使SDS-蛋白质复合物上带有大量的负电荷,远远超过其原来所带的电荷,从而使蛋白质原来所带的电荷可以忽略不计,消除了不同分子之间原有的电荷差别,其电泳迁移率主要取决于亚基分子质量的大小,这样分离出的谱带也为蛋白质的亚基。
3.考马斯亮蓝法检测蛋白质:考马斯亮蓝是一种蛋白质染料,主要有R-250和G-250两种类型。
考马斯亮蓝可以和蛋白肽链中碱性氨基酸残基或芳香族氨基酸残基(Arg,Trp,Tyr,His,Phe)结合。
考马斯亮蓝R250多用于聚丙烯酰胺凝胶电泳后蛋白质条带的染色;因为考马斯亮蓝R250中的R代表Red,偏红,红蓝色,与蛋白质结合虽然比较缓慢,但是染料可以穿透凝胶,染胶效果好,染色后为蓝色,且与胶的结合可以被洗脱下去,所以可以用来对电泳条带染色。
4.基因融合就是将两个或多个开放读码框按一定顺序连接在一起,融合阅读框架的表达产物是一个杂和蛋白。
蛋白质的表达纯化
完全紧贴。)正常安装则会形成一个密闭的容
器。
蛋白质的表达纯化
5.将底座的开关打开, 并向外拨动透明的架子, 使中间空隙增大,放入 电极架。
6.如图所示将电极架往下 压(约1~2mm),使底面 完全接触。
蛋白质的表达纯化
7.关上底座开关。
8.放入电泳槽内,加上加样 架加样。注意加样架与刚才 制胶所用的梳子齿数必须一 致。
• 3. 细胞裂解液3mL以10-15mL/h 流速上Ni2+-NTA柱,收集流 出液。
• 4.洗脱杂蛋白:用50mL洗涤缓冲液UWB以10-15mL/h流速洗柱, 分别取10ul洗涤开始与结束时的样品用于SDS-PAGE 分析。
• 5.洗脱目标蛋白:用10mL洗脱缓冲液洗柱,每管0.5-1 mL, 共收集6-10管,分别取1蛋0白u质l样的表品达纯用化于SDS-PAGE 分析。
蛋白质的表达纯化
实验步骤
• 一、氯霉素酰基转移酶重组蛋白的诱导 • 1. 接种含有重组氯霉素酰基转移酶蛋白的大肠杆菌
BL21菌株于5mL LB液体培养基中 (含100ug/mL 氨苄 青霉素),37℃震荡培养过夜。 • 2. 转接1mL过夜培养物于100mL(含100ug/mL 氨苄青霉 素)LB液体培养基中,37℃震荡培养至OD600 = 0.6 0.8。取10ul 样品用于SDS-PAGE 分析。 • 3. 加入IPTG至终浓度0.5 mmol/l, 37℃继续培养1-3h. • 4. 12,000rpm 离心10 min, 弃上清,菌体沉淀保存于20℃或-70℃冰箱中。
蛋白质的表达纯化
• 3.制浓缩胶:按所需的浓度配制4%的浓缩胶,配
方如下:
30%Arc- Tris-HCl H2O
Bis
蛋白质的表达、分离、纯化实验
蛋白质的表达、分离、纯化实验蛋白质表达、分离、纯化可以:(1)探索和研究基因的功能以及基因表达调控的机理;(2)供作结构与功能的研究;(3)作为催化剂、营养剂等。
实验方法原理携带有目标蛋白基因的质粒在大肠杆菌BL21中,在37℃,IPTG诱导下,超量表达携带有6个连续组氨酸残基的重组氯霉素酰基转移酶蛋白,该蛋白可用一种通过共价偶连的次氨基三乙酸(NTA)使镍离子(Ni2+)固相化的层析介质加以提纯,实为金属熬合亲和层析(MCAC)。
蛋白质的纯化程度可通过聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分析。
实验材料:大肠杆菌BL21试剂、试剂盒:LB液体培养基、氨苄青霉素、Washing Buffer Elution Buffer IPTG、蒸馏水、胰蛋白胨、酵母粉、氯化钠仪器、耗材:摇床、离心机、层析柱、离心管、移液枪、枪头盒、烧杯、玻璃棒实验步骤一、试剂准备1. LB液体培养基:Trytone 10 g,yeast extract 5 g,NaCl 10 g,用蒸馏水配至1000 mL。
2. 氨苄青霉素:100 mg/mL。
3. 上样缓冲液:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8M Urea,10 mM 2-ME,pH8.0。
4. Washing Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8 M Urea,pH6.3。
5. Elution Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mMTris,8M Urea,500 mM Imidazole,pH8.0。
6. IPTG:100mM IPTG(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷):2.38g IPTG溶于100ml ddH2O 中,0.22μm滤膜抽滤,-20℃保存。
二、获得目的基因1. 通过PCR方法:以含目的基因的克隆质粒为模板,按基因序列设计一对引物(在上游和下游引物分别引入不同的酶切位点),PCR循环获得所需基因片段。
生物化学实验-蛋白质分离纯化
蛋白质分离纯化
离子交换层析
蛋白质分离纯化
离子交换层析
蛋白质分离纯化
离子交换层析
蛋白质分离纯化
小
结
粗分级一般采用盐析、等电点沉淀、有机溶剂分级 等方法;
细分级一般采用层析法,包括凝胶层析、离子交换 层析、吸附层析、亲和层析等方法。必要时,还可 采用电泳法,包括等电聚焦等作为蛋白质的提纯步 骤。
型号:G200、 G150、 G100、 G75、 G50、 G25、 G15 分离大蛋白质、小蛋白质,除盐
琼脂糖凝胶(瑞典Sepharose、美国Bio-GelA)
孔径大,用于分离大分子物质
聚丙烯酰胺凝胶( Bio-GelP)
蛋白质分离纯化
凝胶层析
原理:
1、分子量大的物质不能进入凝胶粒子内部,随洗 脱液从凝胶粒子之间的空隙挤落下来,所以大分子 物质迁移速度快;
注意事项:1、时间相对长对分离有利; 2、也可用来测定蛋白质的等电点。
蛋白质分离纯化
等电聚焦( Isoelectric focusing)
蛋白质分离纯化
蛋白质分离纯化
等电聚焦( Isoelectric focusing)
蛋白质分离纯化
离子交换层析
可分为阳离子交换---与阴离子交换---。 1、树脂类:分离氨基酸,孔径小;
蛋白质分子量的测定
最小分子量测定法 如Mb含Fe为0.335%,则
M=55.8/0.335%=16700。这就是最小分子量。
其实,真实分子量是最小分子量的n倍,n指Fe 的数目,Mb的n=1,所以M=16700;而Hb用其他方法 测得分子量为68000,则说Hb含4个Fe原子。
蛋白质的分离、纯化和鉴定
三、蛋白质的胶体性质与蛋பைடு நூலகம்质沉淀
蛋白质是亲水胶体。 1. 蛋白质是亲水胶体。 水化层与双电层使蛋白质成为稳定的亲水胶体。 水化层与双电层使蛋白质成为稳定的亲水胶体。
球状的水溶性蛋白疏水基团借疏水作用聚合在分 子内部, 子内部,而亲水基团则分布于表面与周围水分子 结合形成水化层; 结合形成水化层; 水化层 同时蛋白质表面的可解离基团带有相同的净电荷, 同时蛋白质表面的可解离基团带有相同的净电荷, 与其周围的反离子构成稳定的双电层。 与其周围的反离子构成稳定的双电层。 双电层
影响盐析的因素有: 影响盐析的因素有: 温度 pH值 值 蛋白质浓度 常用的中性盐主要有硫酸铵, 常用的中性盐主要有硫酸铵,优点是温度系数小而溶 解度大 。
※ 有机溶剂沉淀反应
:用与水互溶的乙醇、丙酮等夺取 用与水互溶的乙醇、
水膜,降低介电常数,增加蛋白质之间的相互作用, 水膜,降低介电常数,增加蛋白质之间的相互作用,使 蛋白质颗粒凝集而沉淀。不同蛋白质所需溶剂浓度不同, 蛋白质颗粒凝集而沉淀。不同蛋白质所需溶剂浓度不同, 可进行分级沉淀,但易引起变性,与有机溶剂浓度、 可进行分级沉淀,但易引起变性,与有机溶剂浓度、作 用时间和沉淀温度有关。 用时间和沉淀温度有关。 例如:丙酮沉淀。使用丙酮沉淀时,必须在 ~ ℃ 例如:丙酮沉淀。使用丙酮沉淀时,必须在0~4℃低温 下进行,丙酮用量一般 倍于蛋白质溶液体积 倍于蛋白质溶液体积。 下进行,丙酮用量一般10倍于蛋白质溶液体积。蛋白质 被丙酮沉淀后,应立即分离。除了丙酮以外, 被丙酮沉淀后,应立即分离。除了丙酮以外,也可用乙 醇沉淀。 醇沉淀。
(2)不可逆沉淀
在强烈沉淀条件下,不仅破坏了蛋白质胶体溶液的稳定性, 在强烈沉淀条件下,不仅破坏了蛋白质胶体溶液的稳定性, 而且也破坏了蛋白质的结构和性质, 而且也破坏了蛋白质的结构和性质,产生的蛋白质沉淀不可 能再重新溶解于水。 能再重新溶解于水。 由于沉淀过程发生了蛋白质的结构 和性质的变化,所以又称为变性沉淀。 和性质的变化,所以又称为变性沉淀。 如加热沉淀、强酸碱沉淀、 如加热沉淀、强酸碱沉淀、重金属盐 沉淀和生物碱沉淀等都属于不可逆沉淀。 沉淀和生物碱沉淀等都属于不可逆沉淀。
蛋白质分离纯化设计
蛋白质分离纯化设计1. 简介蛋白质分离纯化是一项重要的实验技术,在生物医药、食品科学、农业等领域有着广泛的应用。
通过对蛋白质进行分离纯化,可以获得单一纯度的蛋白质用于后续研究及应用。
本文将详细介绍蛋白质分离纯化的设计方法和常用技术,包括样品准备、分离方法选择、纯化步骤设计等。
同时,我们还将讨论常见的挑战和解决方案,以及如何评估分离纯化效果。
2. 样品准备在进行蛋白质分离纯化前,首先需要准备好样品。
样品的选择和准备对于后续分离纯化过程非常重要。
2.1 选择合适的样品样品可以来自细胞、组织、体液、培养基等。
在选择样品时,需要考虑到蛋白质的种类、表达水平、目标纯化程度以及后续实验需要。
2.2 样品预处理样品在分离纯化前需要进行预处理,以去除可能干扰纯化过程的杂质。
常用的预处理方法包括细胞破碎、离心、除去非蛋白质成分等。
预处理方法的选择应根据样品类型和后续纯化方法进行优化。
3. 分离方法选择根据蛋白质分离的原理和样品特性,我们可以选择合适的分离方法。
常见的分离方法包括离子交换层析、凝胶过滤、透析、亲和层析等。
3.1 离子交换层析离子交换层析是一种基于蛋白质带电性质的分离方法。
可以根据蛋白质的以阴离子或阳离子带电来选择合适的离子交换树脂,实现不同蛋白质的分离纯化。
3.2 凝胶过滤凝胶过滤是一种基于蛋白质大小的分离方法。
通过选择适当的孔径大小的凝胶,可以分离不同分子大小的蛋白质。
3.3 透析透析是一种基于蛋白质分子量和溶液成分的分离方法。
通过选择适当的膜材料和透析缓冲溶液,可以实现蛋白质与小分子化合物的分离。
3.4 亲和层析亲和层析是一种基于蛋白质与配体之间的特异性结合来分离纯化的方法。
选择合适的亲和配体,可以选择性地结合目标蛋白质,从而实现其分离纯化。
4. 纯化步骤设计在选择合适的分离方法后,需要设计纯化步骤来实现目标蛋白质的分离和纯化。
纯化步骤的设计应根据分离方法的特点和目标蛋白质的性质进行优化。
4.1 样品加载将预处理的样品通过适当的装载方式加载到分离纯化柱中,如使用注射器将样品缓慢注入。
实验 蛋白质的诱导表达
一般融合载体图解
阅读框架的保证
原核表达使用的宿主菌
一般可使用的菌株有: JM109, BL21(DE3), Y1090等。
本实验使用的菌株为:BL21(DE3溶原菌) 噬菌体DE3 : 21抗性区,
LacI基因, LacUV5启动子 T7 RNA聚合酶基因
T7 RNA聚合酶:提高T7启动子启动 的蛋白质的表达水平
稀有密码Biblioteka :多数氨基酸都有一个以上的密码子, 但有一些 E.Coli很少 使用, 当异源目的基因的mRNA过表达时, tRNA 的数量直接 反应密码子的偏倚性, 一个或多个tRNA的稀有或缺少会导 致翻译的停止
毒性基因和质粒稳定性:
氨苄青霉素的使用 补充葡萄糖
提高表达水平的措施
提高翻译水平: 调整SD序列与AUG间的距离、点突变改变碱基、增 加mRNA稳定性 减轻细胞的代谢负荷,提高表达水平: 细菌的生长和外源基因的诱导表达分开。 化学诱导,温度诱导。 提高蛋白质稳定性,防止降解。 表达融合蛋白,表达分泌蛋白(防止降解,减轻代 谢负荷、恢复天然构象)
蛋白表达系统操作流程
主要步骤
制备表达载体
操作
1. 酶切, 去磷酸化
2. 胶回收纯化
制备目的DNA 1. 质粒纯化/PCR 2. 酶切 3. 胶回收纯化 将目的DNA 克隆到载体上 1. 目的片断与载体连接
2. 转化非表达型宿主菌
3. 筛选阳性克隆: 菌落PCR, 质粒 提取酶,测序确定阅读框
转化表达宿主菌
实验
蛋白质的诱导表达
背景知识介绍
基因工程的最终目的:外源基因的高效 表达,获得有重要价值的蛋白质产品 蛋白质的表达是指为获取大量的目标蛋 白而进行的有目的性的蛋白质合成 需将编码所需蛋白的基因插入质粒或其 他载体,然后导入活细胞。 包括外源基因的克隆、转录、翻译、加 工、分离纯化
重组蛋白质的表达纯化和结构鉴定
重组蛋白质的表达纯化和结构鉴定在生物医学领域中,重组蛋白质凭借其广泛的应用前景成为了研究热点。
然而,要想获得高纯度的重组蛋白质,并对其结构进行准确的鉴定,需要经历一系列复杂而细致的实验步骤。
本文将从表达、纯化和结构鉴定三个方面介绍重组蛋白质的研究过程。
一、表达重组蛋白质的表达是研究重组蛋白质最初的关键步骤之一。
通常采用大肠杆菌(Escherichia coli)作为表达宿主。
首先,需要将目标基因克隆至表达载体中,确保其与启动子、转录因子等相互配合,并携带一定的标签,如His 标签、GST 标签等。
接着,将修饰好的表达载体转化至大肠杆菌中,采用选择性培养基筛选出目标菌株。
最后,将筛选得到的菌株进行大规模培养,促使目标基因在细胞内表达。
二、纯化获得表达目标蛋白的菌株后,需要将蛋白从细胞中纯化出来。
首先,采用超声波或高压颠破细胞壁,释放出蛋白质。
接着,通过离心等手段将蛋白质与其他细胞组分分离。
此时,可以利用目标蛋白质特异性的亲和层析柱,如镍柱、葡聚糖柱等,吸附目标蛋白质,并通过逆向洗脱等方法,得到高纯度的目标蛋白质。
三、结构鉴定获得纯度较高的重组蛋白质后,需要对其结构进行进一步的鉴定。
常用的结构鉴定方法包括X射线晶体学、核磁共振(NMR)、电子显微镜等。
X射线晶体学是目前应用最广泛的方法,通过将蛋白质结晶并进行X射线衍射实验,得到蛋白质的高分辨率结构。
NMR则通过测量蛋白质中核自旋的相对位置和相互作用关系,获取蛋白质的三维结构信息。
电子显微镜是一种能够获得蛋白质高分辨率结构的技术,主要应用于研究大分子复合物和纤维形态的蛋白质。
除了上述常用技术外,近年来还涌现出一些新的结构鉴定方法,如质谱联用技术、光学显微镜成像、负染电镜等。
这些方法的出现,为蛋白质结构鉴定提供了更多的选择和便利。
由于篇幅所限,本文仅对重组蛋白质的表达、纯化和结构鉴定进行了简要介绍。
事实上,研究重组蛋白质的过程还包括目标基因的设计与合成、蛋白质的功能分析等环节。
血清清蛋白、γ-球蛋白的分离、纯化与鉴定实验报告
生物化学实验报告姓名:学号:专业年级:组别:生物化学与分子生物学实验教学中心格式要求:正文请统一用:小四号,宋体,1.5倍行距;数字、英文用Times New Roman;标题用:四号,黑体,加粗。
需强调的地方请用蓝颜色标出。
不得出现多行、多页空白现象。
一、实验目的1、掌握盐析法、凝胶层析法、离子交换层析法分离蛋白质的原理和基本方法。
2、掌握醋酸纤维素薄膜电泳法的原理和基本方法。
3、了解柱层析技术。
二、实验原理1、粗提(盐析法):蛋白质分子能稳定存在于水溶液中是因为有两个稳定因素:表面的电荷和水化膜。
当维持蛋白质的稳定因素破坏时,蛋白质分子可相互聚集沉淀而析出。
盐在水溶液中电离所形成的正负离子可吸引水分子,从而夺取蛋白质分子上的水化膜,还可中和部分电荷使蛋白质分子聚集而沉淀,从而达到盐析沉淀蛋白质的目的。
由于血清中各种蛋白质颗粒大小、所带电荷多少及亲水程度不同,因此,利用不同浓度的硫酸铵溶液分段盐析,便可将血清中清蛋白和球蛋白从溶液中沉淀出来,达到初步分离清蛋白、球蛋白的目的。
2、脱盐(凝胶层析法)凝胶层析法利用蛋白质与无机盐类之间分子量的差异。
当溶液通过凝胶柱时,溶液中分子量较大的蛋白质因为不能通过网孔进入凝胶颗粒,沿着凝胶颗粒间的间隙流动,所以流程较短,向前移动速度较快,最先流出层析柱。
而盐的分子量较小,可通过网孔进入凝胶颗粒,所以流程长,向前移动速度较慢,较晚流出层析柱。
从而可达到去盐的目的。
3、纯化(离子交换层析法)离子交换是溶液中的离子和交换剂上的离子进行可逆的的交换过程。
带正电荷的交换剂称为阴离子交换剂;带负电荷的交换剂称为阳离子交换剂。
本实验采用的DEAE纤维素是一种阴离子交换剂,溶液中带负电荷的离子可与其进行交换结合,带正电荷的离子则不能,这样便可达到分离纯化的目的。
脱盐后的蛋白质溶液尚含有各种球蛋白,利用它们的等电点的不同可进行分离。
血清中各种蛋白质的pI各不相同,因此,在同一醋酸铵缓冲液中,各蛋白质所带的电荷不同,可以通过DEAE离子交换层析将血清清蛋白和γ-球蛋白分离出来。
蛋白可溶表达与纯化的详细实验过程
蛋白可溶表达与纯化的详细实验过程2010年02月27日星期六09:02丁香园chrispp作品。
一、证明目的蛋白有表达1、挑取一单菌落接种于含氨苄(Amp,终浓度为100g/mL)的3mL液体LB培养基中37℃,250rpm培养过夜。
2、将过夜培养菌液以1:100转接于含上述抗生素的100mL液体LB中,37℃,250rpm,3.5h (大量培养至OD600=0.6左右)。
3、取出1mL菌液为未诱导的电泳对照,剩余培养液加入诱导物IPTG至终浓度为1mmol/L,继续振荡培养4h。
4、以未诱导菌液与IPTG诱导后菌液作对比,SDS-PAGE检测。
结果如下:图11:pET-32aA3未诱导,2:pET-32aA3未诱导,3:pET-32aA3诱导后,4:pET-32aA3诱导后二、表达的情况,是可溶还是沉淀1、将上述的37℃诱导菌液离心(4℃,12000g,5min),弃上清(LB培养液),沉淀重悬于0.9%NaCl溶液洗菌。
2、将重悬于0.9%NaCl的菌体溶液离心(4℃,12000g,5min),弃上清(0.9%NaCl洗菌液),得菌体,称菌体重量,重悬于8mL PBS(pH7.0)缓冲液,缓冲液用量根据50~100mg/mL的菌液终浓度。
3、超声破菌:冰浴条件下,超声波破碎大肠杆菌,超声设置如下功率:400W,工作:15s,间隔:45s,全程时间:30min(30次左右)以菌液由白变透明,且不粘稠为依据(少量菌液用液氮反复冻融7次以上效果也不错,而且简单,但是DNA 出来后会粘稠,可能加dna酶后会好些,那样好离心,我是用接近最高转速离心的(没加dan酶),不然分不开)4、将超声波破碎的菌液离心(4℃,12000g,15min),分别收集上清和沉淀,各取1mL,加入1mL2×上样缓冲液,沸水浴10min,SDS-PAGE检测。
结果如下:图21:pET-32aA3诱导上清,2:pET-32aA3诱导沉淀三、探索可溶表达条件有上述实验结果可知,目标蛋白在上清也有表达,即存在可溶性的表达,但是量很少,大部分也包涵体的形式存在(沉淀中),而包涵体的存在也证明了蛋白表达量很高,上清可溶蛋白的可操作性等因素都优于对包涵体蛋白的分离纯化,所以可通过探索可溶表达条件,最终来加大上清蛋白的含量,以利于下一步实验的进行。
蛋白质的离心机离心分离与纯化
蛋白质的离心机离心分离与纯化离心机在生物学及医学研究中被广泛应用于蛋白质分离和纯化实验。
本文将详细介绍使用离心机进行蛋白质分离与纯化的实验方法,并提供详尽的操作步骤。
一、实验准备准备所需试剂和仪器:离心机、离心管(0.5ml离心管,1.5ml离心管,2ml离心管,5ml离心管,10ml离心管,15ml离心管,50ml 离心管)、显微镜、磷酸盐缓冲液、样品(含蛋白质的混合物)等。
二、样品离心分离1. 将样品注入离心管:将样品(含蛋白质的混合物)注入清洁的离心管中。
确保离心管不超过容量的2/3,以防止离心时的溢出。
2. 平衡样品:将离心管放入冷藏,使样品在温度一致下平衡一段时间。
三、选择合适的离心机参数1. 选择合适的转速和离心时间:根据样品的特性和分离需求,选择合适的离心机转速和离心时间。
通常,较高的转速和较长的离心时间能够实现更好的分离效果。
2. 设定离心机参数:根据实验需求,在离心机上设定所选的转速和离心时间。
3. 使用转子:根据离心机型号,安装并选择合适的转子,确保样品均匀分布并提供较佳离心效果。
四、离心机离心1. 将离心管放入离心机中:将样品放入预先设定好参数的离心机中。
2. 启动离心机:关闭离心机盖,启动离心机开始离心过程。
确保离心机盖全部关闭,以保持安全。
3. 分离过程:离心机将通过高速旋转的方式对样本进行离心,中途不可打开盖子。
五、收集分离后的物质1. 离心结束后,打开离心机盖,小心取出离心管。
2. 分离沉淀和上清液:根据需要,将离心管中的上清液和沉淀吸取到不同的离心管中。
六、纯化蛋白质1. 浓缩蛋白质:使用适当的方法(如浓缩离心技术、超滤或聚集等)从上清液中浓缩目标蛋白质。
2. 蛋白质分析:使用适当的蛋白质分析方法(如SDS-PAGE、Western blot 等)对样品进行蛋白质鉴定和分析。
3. 纯化蛋白质:根据需要,使用柱层析、电泳等技术,进一步纯化目标蛋白质。
七、实验后处理1. 清洗离心机和离心管:完成实验后,清洗离心机和离心管,确保无任何污染物残留。
蛋白质的表达、纯化及检测-分子实验报告
实验目的1.了解外源基因在大肠杆菌细胞中的诱导表达情况2.学会用SDS-PAGE电泳法分离不同分子量的蛋白质3.学习通过亲和层析法纯化目的蛋白4.学会考马斯亮蓝染色法和蛋白质杂交法检测蛋白质实验原理1.外源基因在大肠杆菌细胞中的诱导表达:将外源基因克隆在特殊的表达载体中,让其在E. coli中表达,该表达载体上含有lac操作子的启动子。
在不加诱导剂的条件下培养宿主菌,lacI基因表达的阻遏蛋白LacI与lac操作子结合,使外源基因不能表达;向培养基中加入诱导物IPTG后,LacI阻遏蛋白变构失活,不能与lac操作子结合,外源基因就表达。
2.蛋白质SDS-PAGE电泳分离:SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白质的电泳方式,特别是用于蛋白质纯度检测和测定蛋白质分子量。
其分离原理是根据蛋白质分子量的差异,因为SDS-PAGE的样品处理液及缓冲液的加入破坏了蛋白质的二级、三级、四级等结构,并使SDS与蛋白质充分结合形成SDS-蛋白质复合物,稳定地存在于均一的溶液中,SDS与蛋白质结合后使SDS-蛋白质复合物上带有大量的负电荷,远远超过其原来所带的电荷,从而使蛋白质原来所带的电荷可以忽略不计,消除了不同分子之间原有的电荷差别,其电泳迁移率主要取决于亚基分子质量的大小,这样分离出的谱带也为蛋白质的亚基。
3.考马斯亮蓝法检测蛋白质:考马斯亮蓝是一种蛋白质染料,主要有R-250和G-250两种类型。
考马斯亮蓝可以和蛋白肽链中碱性氨基酸残基或芳香族氨基酸残基(Arg,Trp,Tyr,His,Phe)结合。
考马斯亮蓝R250多用于聚丙烯酰胺凝胶电泳后蛋白质条带的染色;因为考马斯亮蓝R250中的R代表Red,偏红,红蓝色,与蛋白质结合虽然比较缓慢,但是染料可以穿透凝胶,染胶效果好,染色后为蓝色,且与胶的结合可以被洗脱下去,所以可以用来对电泳条带染色。
4.基因融合就是将两个或多个开放读码框按一定顺序连接在一起,融合阅读框架的表达产物是一个杂和蛋白。
蛋白质的表达纯化及结晶
2.3.2.2 蛋白质表达、纯化(1)初始种子培养:挑取阳性克隆到10 mL的含有Amp抗生素的液体LB培养基中,在37℃过夜振荡培养。
(2)扩大培养:将初始种子接入1 L含抗生素的液体培养基中,37℃振荡培养至菌浓OD600为0.6-0.8时,降温至15℃或20℃;一个小时后加入终浓度为0.6 mM的IPTG,并诱导表达过夜。
(3)收集菌体:于4200 rpm,4℃下离心15 min,弃去上清,收获菌体;加入重悬溶液(25 mM Tris-HCl pH8.0,100 mM NaCl),悬浮菌体细胞;细胞破碎前加入终浓度为2 mM的蛋白酶抑制剂PMSF(Phenylmethyl sulfonyl fluoride,苯甲酸磺酰氟)。
(4)超声破碎细胞:400W下,超声3s,间隔6s,工作60次。
(5)超速离心:细胞裂解液于14000 rpm,4℃下离心50 min,收集上清液,进行下一步的分离纯化。
(6)Ni-NTA亲和层析:将上清液体倒入Ni-NTA柱中。
流净后,用wash buffer (25 mM Tris-HCl pH8.0,100 mM NaCl,15 mM imidazole)冲洗10个柱体积,除去杂蛋白;最后使用elution buffer(25 mM Tris-HCl pH8.0,100 mM NaCl,250 mM imidazole)将目的蛋白洗脱下来。
使用SDS-PAGE检测蛋白的可溶性、挂柱效率及蛋白的浓度。
由于本实验中YdiV等蛋白都是连接到pGl01载体中,带有可以用PPase切除的6×His标签。
为了获得更纯净的、不带标签的蛋白,我们在有那个wash buffer冲洗去除杂蛋白以后,每根镍柱中加入5 ml的重悬缓冲液然后加入100-200 μL的PPase,3-5 h后,用5 ml重选冲洗柱子,电泳检测酶切效率。
(7)阴离子交换层析纯化:先平衡离子交换柱。
然后将上一步洗脱下的蛋白用溶液A(25 mM Tris-HCl, pH8.0)稀释4-6倍,上样到离子交换柱Source Q上,使用溶液A与溶液B(25mM Tris-HCl pH8.0,1M NaCl)进行线性梯度洗脱。
生物化学中的蛋白质表达和纯化
生物化学中的蛋白质表达和纯化蛋白质是细胞中最基本的生物大分子之一,具有重要的结构和功能作用。
在生化实验研究中,常常需要大量的蛋白质作为实验材料。
蛋白质表达和纯化技术是生物化学研究中的关键技术之一。
本文将简要介绍蛋白质表达和纯化的原理和方法。
一、蛋白质表达技术蛋白质表达是将目的基因转录成RNA后再翻译成蛋白质的过程。
蛋白质表达主要有原核细胞和真核细胞两种方法。
原核细胞表达系统主要利用大肠杆菌,真核细胞表达系统则使用哺乳动物细胞,其主要的表达技术有以下几种:(一)重组蛋白质大规模表达重组蛋白质是指人为构建的同源或异源蛋白序列,利用基因工程技术将其导入到表达宿主中进行高效表达的蛋白质。
大肠杆菌是目前最常用的宿主。
一般来说,要将目的基因插入到选择性表达载体中,选用合适的启动子和终止子,将目的蛋白质与标签结合。
表达宿主随后被转化,蛋白质在生长过程中表达出来,随后进行纯化和鉴定。
(二)GST融合蛋白表达GST融合蛋白是利用GST (glutathione S-transferase)标签的蛋白质,将GST和目的蛋白质融合在一起表达,然后通过Glutathione 亲和层析纯化方法纯化目的蛋白质。
GST融合蛋白可以提高目的蛋白质的稳定性和可溶性,使得其在细胞内表达更加稳定。
(三)His标签蛋白表达His标签是一种聚组氨酸标签,可以与Ni2+螯合,因此可采用Ni2+亲和层析的方法纯化。
His标签融合蛋白表达时选择了较少的氨基酸标签,对目标蛋白的生物学性质和功能影响较小。
二、蛋白质纯化技术蛋白质表达和纯化是蛋白质生物化学研究的关键。
通常情况下,表达宿主细胞中的蛋白质必须经过纯化才能得到纯净的蛋白质,获得足够高纯度的蛋白质可用于测定其结构和功能。
(一)离子交换层析法离子交换层析法是利用蛋白质负荷(或正荷)的离子性质与相应的离子交换质团之间进行选择性结合的纯化方法。
离子交换层析法分为阴离子交换层析和阳离子交换层析两种。
蛋白质的分离纯化及亚基分子量测定
一、蛋白质的分离纯化及亚基分子量测定本实验的目的在于学习蛋白质的盐析沉淀、分子筛层析、离子交换层析等生物化学实验技术,实现系统、完整的蛋白质提取、分离、纯化及亚基分子量测定的基本实验技术和技能的综合训练。
本实验的内容主要两个部分:1)通过盐析沉淀和分离筛柱层析获得可用于分离纯化的蛋白质提取液;2)用离子交换柱层析进行蛋白质提取液的分离纯化。
每部分实验计划12课时完成,24课时(3天)完成全部实验内容。
实验技术原理1.蛋白质的盐析沉淀2.蛋白质的分子筛柱层析3.蛋白质的离子交换柱层析实验步骤一、蛋白质的提取及分离1.藻胆蛋白提取取红藻样品5-8 g,加25ml 50 mmol/L NaH2PO4-K2HPO4 pH 7.0缓冲液(内含NaN3 4 mmol/L,EDTA-Na 2 mmol/L,十六烷基三甲基溴化胺(CTAB) 0.1% (W/V)),研磨提取藻胆蛋白。
然后,用50 ml离心管,将提取液在4C︒、12000转/min离心30 min,保留上清液。
对沉淀再做两次相同的藻胆蛋白提取,合并三次提取的上清液,并量出总体积。
2.硫铵沉淀按每100 ml溶液36.1g硫酸铵,称取所需的硫酸铵。
研细后在搅拌条件下缓慢加入提取液(约1-2小时),使硫酸铵饱和度达到60%,置4C︒冰箱中过夜。
用50 ml离心管,在4C︒、12000转/min 离心30 min,小心弃去上清液。
红色沉淀用20 ml 50 mmol/L NaH2PO4-K2HPO4缓冲液充分溶解。
红色溶解液用50 ml离心管,在4C︒、16,000转/min离心30 min。
小心取出上清液,此藻胆蛋白提取液用作后续实验的样品。
3.分子筛柱层析取约60-70 ml溶涨好的Sephadex G-25葡聚糖凝胶,装一柱床体积约为2.6 cm⨯10 cm的分子筛柱。
用50 mmol/L的NaH2PO4-K2HPO4 pH 7.0缓冲液(内含NaN3 4 mmol/L,EDTA-Na 2 mmol/L)过柱平衡柱床,流速~20-30 ml/hr。
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蛋白质的表达、分离、纯化实验
蛋白质表达、分离、纯化可以:(1)探索和研究基因的功能以及基因表达调控的机理;(2)供作结构与功能的研究;(3)作为催化剂、营养剂等。
实验方法原理
携带有目标蛋白基因的质粒在大肠杆菌BL21中,在37℃,IPTG诱导下,超量表达携带有6个连续组氨酸残基的重组氯霉素酰基转移酶蛋白,该蛋白可用一种通过共价偶连的次氨基三乙酸(NTA)使镍离子(Ni2+)固相化的层析介质加以提纯,实为金属熬合亲和层析(MCAC)。
蛋白质的纯化程度可通过聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分析。
实验材料:大肠杆菌BL21
试剂、试剂盒:LB液体培养基、氨苄青霉素、Washing Buffer Elution Buffer IPTG、蒸馏水、胰蛋白胨、酵母粉、氯化钠
仪器、耗材:摇床、离心机、层析柱、离心管、移液枪、枪头盒、烧杯、玻璃棒
实验步骤
一、试剂准备
1. LB液体培养基:Trytone 10 g,yeast extract 5 g,NaCl 10 g,用蒸馏水配至1000 mL。
2. 氨苄青霉素:100 mg/mL。
3. 上样缓冲液:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8M Urea,10 mM 2-ME,pH8.0。
4. Washing Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8 M Urea,pH6.3。
5. Elution Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mMTris,8M Urea,500 mM Imidazole,pH8.0。
6. IPTG:100mM IPTG(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷):2.38g IPTG溶于100ml ddH2O中,0.22μm滤膜抽滤,-20℃保存。
二、获得目的基因
1. 通过PCR方法:以含目的基因的克隆质粒为模板,按基因序列设计一对引物(在上游和下游引物分别引入不同的酶切位点),PCR循环获得所需基因片段。
2. 通过RT-PCR方法:用TRIzol法从细胞或组织中提取总RNA,以mRNA为模板,逆转录形成cDNA第一链,以逆转录产物为模板进行PCR循环获得产物。
三、构建重组表达载体
1. 载体酶切:将表达质粒用限制性内切酶(同引物的酶切位点)进行双酶切,酶切产物行琼脂糖电泳后,用胶回收Kit或冻融法回收载体大片段。
2. PCR产物双酶切后回收,在T4DNA连接酶作用下连接入载体。
四、获得含重组表达质粒的表达菌种
1. 将连接产物转化大肠杆菌DH5α,根据重组载体的标志(抗Amp或蓝白斑)作筛选,挑取单斑,碱裂解法小量抽提质粒,双酶切初步鉴定。
2. 测序验证目的基因的插入方向及阅读框架均正确,进入下步操作。
否则应筛选更多克隆,重复亚克隆或亚克隆至不同酶切位点。
3. 以此重组质粒DNA转化表达宿主菌的感受态细胞。
五、氯霉素酰基转移酶重组蛋白的诱导
1. 接种含有重组氯霉素酰基转移酶蛋白的大肠杆菌BL21菌株于5 mL LB液体培养基中(含100 ug/mL 氨苄青霉素),37℃震荡培养过夜。
2. 按1∶50或1:100的比例稀释过夜菌,一般转接1 mL过夜培养物于100 mL(含100 ug/mL 氨苄青霉素)LB液体培养基中,37℃震荡培养至OD600 = 0.6 - 0.8(最好0.6,大约需3 h)。
取10 ul 样品用于SDS-PAGE 分析。
3. 对照组不加诱导剂,实验组加入IPTG至终浓度0.5 mmol/l,37℃继续培养1-3h。
4. 12 000 rpm 离心10 min,弃上清,菌体沉淀保存于-20℃或-70℃冰箱中。
六、氯霉素酰基转移酶重组蛋白的分离、纯化
1. NTA层析柱的准备:在层析柱中加入1 mL NTA介质,并分别用8 mL 去离子水,8 mL上样缓冲液洗涤。
2. 重组蛋白的变性裂解:在冰浴中冻融菌体沉淀,加入5 mL上样缓冲液,用吸管抽吸重悬,超声波破裂菌体,用振荡器等轻柔的混匀样品60 min,4℃12000 rpm 离心30 min,将上清吸至一个干净的容器中,并弃沉淀。
取10 ul 上清样品用于SDS-PAGE 分析。
3. 上清样品以10-15 mL/h 流速上Ni2+-NTA柱,收集流出液,取10 ul样品用于SDS-PAGE 分析。
4. 洗脱杂蛋白:用Washing Buffer以10-15 mL/h流速洗柱,直至OD280 = 0.01分步收集洗脱液,约3-4 h,取10 ul洗脱开始时的样品用于SDS-PAGE 分析。
5. 洗脱目标蛋白:用Elution Buffer洗柱,收集每1 mL 级分,分别取10 ul样品用于SDS-PAGE 分析。
注意事项
1. 选择表达载体时,要根据所表达蛋白的最终应用考虑。
如为方便纯化,可选择融合表达;如为获得天然蛋白,可选择非融合表达。
2. 融合表达时在选择外源DNA同载体分子连接反应时,对转录和转译过程中密码结构的阅读不能发生干扰。
3. 菌液OD值要小于1,否则细胞太浓太老,不易破碎,且质粒易丢失。
4. 诱导时间最好做一个梯度,不同蛋白诱导时间需摸索。
5. 诱导温度适当摸索:25、30℃。
6. IPTG浓度:一般在1 mM 以内,可适当摸索。
7. 超声条件可视实际情况改变,只要使菌体裂解充分即可,即菌液清亮不粘稠。
其他
一、原核表达
1. 原核表达简介
将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。
这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。
2. 大肠杆菌用于表达重组蛋白的特点
(1)易于生长和控制;
(2)用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵;
(3)有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的质粒可供选择;
(4)在大肠杆菌中表达的蛋白由于缺少修饰和糖基化、磷酸化等翻译后加工,常形成包涵体而影响表达蛋白的生物学活性及构象。
3. 原核表达载体
通常为质粒,典型的表达载体应具有以下几种元件:
(1)选择标志的编码序列;
(2)可控转录的启动子;
(3)转录调控序列(转录终止子,核糖体结合位点);
(4)一个多限制酶切位点接头;
(5)宿主体内自主复制的序列。
4. 原核表达一般程序
获得目的基因-准备表达载体-将目的基因插入表达载体中(测序验证)-转化表达宿主菌-诱导靶蛋白的表达-表达蛋白的分析-扩增、纯化、进一步检测。