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临床分子生物学检验标志物

临床分子生物学检验标志物

分子生物学检验标志物生物标志物(biomarker)可测定并定量的生物学参数,可作为健康和生理状态的评估指标。

生物标志物具重要价值,贯穿疾病的全过程 治疗中发生前 发生后★ 筛选;★ 风险评估; ★ 诊断、分期、分级; ★ 指导治疗的选择; ★ 监控治疗过程;★ 指导修改治疗方案;生物标志物的特征是可以客观的测量和评价,作为正常的生理过程、疾病过程或药物对治疗干预的反应的指标。

生物标志物的分类•0型(疾病自然病史标志物)•1型(药物活性标志物)•2型(替代终点)生物标志物分类(根据来源):来自生物样本(血样、尿样、组织等);记录值(体温、血压或心电图等);影像学检查(超声、CT或MRI等);生物标志物分类(根据用途):预测性生物标志物、筛查性生物标志物、诊断性生物标志物、分级性生物标志物、预后性生物标志物、替代终点等。

分子生物标志物(molecular biomarker)是生物标志物的一种类型,是指可以反映机体生理、病理状态的核酸、蛋白质(多肽)、代谢产物等生物分子。

分子生物标志物的分类:核酸分子生物标志物(DNA和RNA)蛋白质生物标志物代谢产物生物标志物DNA生物标志物基于基因突变的分子生物标志物(点突变,插入/缺失突变,动态突变);基于基因多态性的分子生物标志物(限制性片段长度多态性、小卫星和微卫星多态性、单核苷酸多态性、拷贝数多态性);基于DNA甲基化修饰的分子生物标志物;基于线粒体DNA的分子生物标志物;RNA生物标志物基于转录产物的分子生物标志物mRNA标志物miRNA标志物lncRNA标志物蛋白质生物标志物免疫组织化学Western blot质谱分析液体活检与肿瘤循环肿瘤细胞(circulating cell)循环DNA(circulating DNA)循环RNA(circulating RNA)外泌体(exosomes)。

外泌体(exosomes)是细胞外囊泡中的较小组分,由细胞内的多泡内体与细胞膜融合后以外分泌的形式释放到细胞外基质中的一种膜性囊泡,是细胞之间信息传递的重要载体。

bIOMARKERS生物标志物

bIOMARKERS生物标志物

• Control series (3 jars)
• 6 series run with fungicide (3 jars/series)
• first fungicide series 4 ml fungicide
:128 ml
of water
• diluted 5 times for each successive 5 series
Initial Purpose
• To observe any effects of the fungicide on the red worms
• To determine ld50 for our population of red worms
SOIL ECOTOXICOLOGY EXPERIMENT
• pesticide added after week 1
• Data collected weekly
• worms sorted and analyzed for lesions, swelling, writhing, Number on and below surface
fungicide concentration series
Further objectives
• Additional objectives of this experiment: • 1. examine effects of pollution on non-
target organisms • 2. Accuracy of results, if any, in real
conclusions
• The highest fungicide concentration used (4 times the suggested concentration) appears to have a fairly strong impact on the worms

生物标志化合物名词解释

生物标志化合物名词解释

生物标志化合物名词解释
生物标志化合物 (biomarker) 是指能够用于识别和追踪生物体内或周围环境中生物化学反应或生物过程的物质。

这些物质通常是特定生物分子的代谢产物或反应产物,具有高度的特异性和敏感性,能够反映特定生物体的生理和病理状态。

生物标志化合物广泛应用于生物监测、疾病诊断、药物研发等领域。

在生物化学领域,生物标志化合物通常指一类来源于生物体的含氢化合物,包括类异戊二烯型烷烃、甾体激素、维生素等。

这些物质在有机质演化过程中具有一定稳定性,基本保存了原始生化组分的碳骨架,记载了原始生物母质的特殊分子结构信息。

因此,它们具有特殊的标志作用,可以用来研究生物体的历史演化和生命起源等问题。

Biomarkers in mCRC生物标志物变化

Biomarkers in mCRC生物标志物变化

KRAS mutovaný
Cetuximab plus FOLFOX4 vs FOLFOX4 (n=99)
NR
5,5 vs 8,6 HR=1,83, 95% CI: 1.09, 3,06
(p=0,019)
33 vs 49 OR=0,51, 95% CI: 0,22, 1,15
(p=0,106)
OR = odds ratio; NR = nehlášeno
Bokemeyer, et al. JCO 2009
Další nemocní nebudou zřejmě odpovídat na léčbu inhibitory EGFR i z důvodu BRAF mutací
Nemocnís mCRC léčení panitumumabem či cetuximabem, n=114
Stav KRAS (hodnotitelnínemocnín=113)
odpovídající neodpovídající
mutace KRAS 34/113 (30%)
2/34 (6%)*
32/34 (94%)*
Divokýtyp KRAS 79/113 (70%)
22/79 (28%)*
57/79 (72%)*
Tie-2
TNFαR Stabilizované a
zralékrevnícévy
Krevní cévy/endoteliální buňky
Ang = angiopoietin; FGF = růstový faktor pro fibroblasty MMP = matrix metaloproteinázy; TNF = tumor nekrotizujícífaktor; VEGFR = receptor pro VEGF

生物标志物

生物标志物

生物标志物(biomarker)思路总结:第一部分:Biomarkers Introduction1.什么是生物标志物?生物标志物是生物体内对于单个或多个环境压力(污染物)和非化学的。

生物标志物反应,因此能够提供不良反应的早期预警。

生物标志物反应通常在亚致命毒性范围内观察到,作为对生长、繁殖和生存影响的前兆。

它们包括正常生理功能的细微变化,如生殖行为、疾病复原力和捕食能力,这些能力会对生物体的长期生存和生殖输出产生深远影响;最终,这些会影响生态系统健康(生物体受到严重损害之前,在不同生物学水平(分子、细胞、个体等)上因受环境污染物影响而异常化的信号指标。

它可以对严重毒性伤害提供早期警报。

这种信号指标可以是细胞分子结构和功能的变化、的变化或生成异常的代谢产物或其含量,可以是某一生理可以是个体表现出的异常现象,可以是种群或群落的异常变化,可以是系统的异常变化。

)2. 生物标志物的选择原则:1) 生物标志物必须能够表明暴露于污染物。

2) 生物标记物的反应必须能够与对个体和生态系统的影响联系起来 3) 必须具有足够的灵敏度,即所选标志物的水平与外接触水平要有剂量-反应关系,在无害效应接触水平下仍能维持这种关系。

3. 生物标志物的具体应用:种群或群体-- 但在这一水平上的影响通常是由于许多个体适应度的变化而产生的。

对于一个个体的有机体来说,接触污染物是有害的,因为它们改变了个体的正常生理,而这些变化通常可以在分子或亚细胞水平上测量。

在分子或亚细胞水平上的损伤是由酶过程、蛋白质表达和功能的变化、突变或Pollutant Exposure MolecularSub-cellular (organelle)CellularTissueSystematic (organ)OrganismPopulationCommunityEcosystem ‘Early’ biomarker signals ( rapid ) ‘Later’ effects ( slow )细胞膜降解导致细胞死亡引起的。

临床试验中收集的biomarker

临床试验中收集的biomarker

一、介绍临床试验(clinical trials)是评估药物、医疗器械、诊断工具、治疗策略、预防措施等医疗产品和服务安全性和有效性的研究。

临床试验中,收集的生物标志物(biomarker)是对健康或疾病状态的指示,有助于评估治疗效果和预测个体对治疗的反应。

二、生物标志物的分类1. 遗传标志物:包括基因型、染色体改变、单核苷酸多态性等。

2. 蛋白标志物:包括激素、酶、免疫球蛋白等。

3. 代谢标志物:包括代谢产物、代谢途径产物等。

4. 显像标志物:包括医学影像、组织学检查等。

三、生物标志物在临床试验中的应用1. 治疗效果评估:生物标志物可用于评估治疗效果,如肿瘤标志物、炎症标志物等。

2. 预测个体反应:生物标志物可预测个体对治疗的反应,指导个性化治疗方案的制定。

3. 疾病早期诊断:生物标志物可用于疾病早期诊断,提高治疗效果和生存率。

4. 药物安全性评估:生物标志物可用于评估药物的安全性,减少不良反应和毒副作用。

四、生物标志物在临床试验中的挑战1. 标准化问题:生物标志物的收集、检测、解读需要标准化,确保数据的可靠性和可比性。

2. 复杂性问题:不同生物标志物的复杂性不同,有些标志物受到多因素影响,可能存在误解。

3. 难度问题:有些生物标志物的检测技术和方法尚未成熟,难以准确测量。

4. 伦理问题:生物标志物的收集和使用涉及隐私保护和知情同意等伦理问题。

五、展望未来,随着生物技术和医学技术的不断发展,生物标志物在临床试验中的应用将得到进一步拓展和深化。

标准化的生物标志物收集、检测和解读将成为临床试验的重要环节,有助于精准医学的实现。

随着质控和伦理方面的问题得到解决,生物标志物将更好地为临床试验和个体医疗服务所用。

六、生物标志物的标准化问题在临床试验中,生物标志物的标准化问题是一个关键的挑战。

标准化是指通过制定、实施和监督一系列规范和流程,以确保生物标志物数据的可靠性和可比性。

在临床试验中,生物标志物的标准化包括对样本采集、保存、检测方法和数据分析等方面的规范。

生物标志物简介

生物标志物简介

生物标志物简介
目录
•1拼音
•2英文参考
•3注解
•4参考资料
1拼音
shēng wù biāo zhì wù
2英文参考
biomarker[GBZ/T 224—2010 职业卫生名词术语]
biological marker[GBZ/T 157—2009 职业病诊断名词术语]
3注解
生物标志物(biomarker)又称生物学标记或生物标志,指反映生物体系与外源化学物、物理和生物因素之间相互作用的任何可测定的指标,包括化学、生化、生理、行为或其他的改变。

它可分为接触生物标志物、效应生物标志物和易感性生物标志物[1]。

生物标志物可视为接触外源性物质与健康损害之间关系的一种重要手段。

它利用人体内各种生物材料,检查机体接触外源性物质或其代谢产物的含量、外源性物质引起的生物效应以及机体对接触外源性物质产生反应的能力等。

[2]
4参考资料
1.^ [1] 中华人民共和国卫生部.GBZ/T 224—2010 职业卫生名词术语[Z].2010012
2.
2.^ [2] 中华人民共和国卫生部.GBZ/T 157—2009 职业病诊断名词术语[Z].20090316.
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生物标志物_biologicalmarker_

生物标志物_biologicalmarker_

倍,经χ2检验,差异均有显著性;二项分布拟合与Edward检验均显示,扬中胃癌的发病存在明显的家庭聚集性,符合多基因遗传方式;先证者家庭成员发生胃癌的危险性显著高于均衡可比的对照家庭成员,核心家系成员间患病率的差异,可能与胃癌遗传易感性和家庭内环境因素暴露的差异有关[5,6]。

分析胃癌家族史在家庭聚集性中的作用,结果显示(资料未列出):先证者家系有胃癌家族史的比例为28134%(761/2685),对照家系胃癌家族史的比例为2170%(69/2557),两者差异有极显著性,χ2 =64612,P=01001;同样,胃癌病例有家族史的比例为41175%(291/697),也显著高于非胃癌对照家族史的比例11186%(539/4545),表明遗传易感性因素在胃癌发生中有重要地位。

同时,也应该看到,以肿瘤发病率为观察研究的终点指标,对遗传易感性作用相对较弱的散发性肿瘤而言,敏感性较低,出现一些难于解释的阴性结果,需要借助分子遗传学、分子生物学技术,准确判断肿瘤早期生物学表型与遗传易感性(基因型)之间的关系。

根据国内外现有流行病学资料:胃癌是在多种环境和遗传因素长时间、多步骤、交互作用下的结果[2,7],无论是外源性致癌物,或是机体产生的内源性致癌物,都要通过宿主遗传易感性因素(研究比较成熟的是各种代谢酶基因多态性)的作用,才能最终导致癌变,因此,有必要采用分子流行病学方法,进一步阐明在致癌物代谢的各条通路中,易感基因及其多态性所起的作用[8212],我们已经利用在扬中胃癌高发区获得的环境暴露与基因多态性资料,对此进行了探讨。

有关结果将另文报道。

参考文献1李茂森,耿昌友,朱阳春,等.扬中市1991~1995年恶性肿瘤发病及死亡情况调查研究1肿瘤,1997,17:477247812C orrea P1Human gastric carcinogenesis:a multistep and multifactorial process2first American cancer s ociety award lecture on cancer epidemiology and prevention1Cancer Res,1992,52:67352674013Perera FP1Environment and cancer:who are susceptible?Science, 1997,278:10682107314S tadtlander CT,W aterbor JW1M olecular epidemiology,pathogenesis and prevention of gastric cancer1Carcinogenesis,1999,20:2195222081 5Nagase H,Ogino K,Y oshida I,et al1Family history2related risk of gastric cancer in Japan:a hospital2based case2control study1Jpn J Cancer Res,1996,87:10252102816La Vacchia C,Negri E,Franceschi S,et al1Family history and the risk of stomach and colorectal cancer1Cancer,1992,70:5025517T oy oshima H,Hayashi S,Hashim oto S,et al1Familial aggregation and covariation of diseases in a Japanese rural community:com paris on of stomach cancer with other diseases1Ann E pidemiol,1997,7:446245118K ato S,Onda M,M atsukura N,et al1G enetic polym orphisms of the cancer related gene and Helicobacter pylori in fection in Japanese gastric cancer patients1An age and gender matched case2control study1Cancer, 1996,77:16542166119K ato S,Onda M,M atsukura N,et al1Helicobacter pylori in fection and genetic polym orphisms for cancer2related genes in gastric carcinogenesis1 Biomed Pharmacother,1997,51:1452149110Ng EK,Sung JJ,Ling TK,et al1Helicobacter pylori and the null genotype of glutathione2S2trans ferase2mu in patients with gastric adenocarcinoma1Cancer,1998,82:2682273111National Institute of Environmental Health Science.Research on environment2related disease1Environmental G enome Project119981 Available from:http://w w w1niehs1nih1g ov/envgenom112沈靖.人类基因组计划与肿瘤预防研究面临的机遇.肿瘤,2000, 20:682721(收稿日期:2000202220)(本文编辑:邵隽一)・名词小词典・生物标志物(biological marker) 能够反映致病因素或毒物从暴露到效应过程各个环节性质的特异性生物分子,如DNA、蛋白质、酶、脂质、糖类等。

地球化学-第四章生物标志物1.

地球化学-第四章生物标志物1.


正构烷烃

无环类异戊二烯烷烃

二环-四环异芳香烃

含氮化合物、卟啉
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
二、生物标志化合物的研究意义
生物标志化合物在有机质热演化过程中:
一方面在各种作用下,发生一定的结构变化, 以达到热力学上的稳定性。这些变化包括失去不 稳定的官能团,不饱和的链加氢变为饱和的结构, 发生芳构化以及异构化和分子的重排等。
生物标志化合物从何而来?
沉积有机质在成岩作用 阶段演化的产物
不溶于有机溶剂的干酪根
生物体中原生烃及其它类 脂化合物的游离分子(生
物标志化合物)
一般具有明显的结构特征和较高的分子量。它们可 以是直接来自于继承的生物类脂组分,也可以是结合于 或吸附于干酪根中的类脂化合物,在生油早期阶段从干 酪根主结构中完整脱落下来的有机分子。
油气运移提供证据:烃源岩和疏导层对油气 运移起到色层效应,利用这种效应可以追溯 油气运移路径和方向。
研究原油生物降解程度:成藏以后油藏进入 细菌活动带,细菌会选择性地破坏一些生物 标志物,通过检测生物标志物被细菌降解的 情况,可以确定油藏形成以后演化的历史。
生物标志化合物
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
结构上的“变异性”使其能够用于追溯有 机质的演化历程。
另一方面仍然保留其母体基本碳骨架
正是这种结构上的继承性使其具有标志 有机质来源及沉积环境的作用。
油源对比:为原油及其油源岩的成因联系、油-油、 气-油、气-岩成因联系提供一系列参数 和指标。

2011-11-24,FDA 药品 Biomarker

2011-11-24,FDA 药品 Biomarker

Oncology Dermatology and Dental Oncology Psychiatry Allergy Gastroenterology Gastroenterology Neurology Psychiatry Psychiatry Reproductive Oncology Gastroenterology Dermatology and Dental Psychiatry Psychiatry Rheumatology Psychiatry Psychiatry Psychiatry Oncology Neurology Oncology Oncology Psychiatry Oncology Oncology Oncology Oncology
Psychiatry Oncology Cardiovascular Oncology Hematology Antivirals Oncology Cardiovascular Psychiatry Psychiatry Musculoskeletal Psychiatry Antivirals Oncology Oncology Psychiatry Oncology Oncology Gastroenterology Psychiatry Antivirals Psychiatry Neurology Psychiatry Cardiovasar
92 Sodium Phenylbutyrate94 93 Tamoxifen95 94 Telaprevir96 95 Terbinafine97 96 Tetrabenazine98 97 Thioguanine99 98 Thioridazine100 99 Ticagrelor101 100 Timolol102 101 Tiotropium103 102 Tolterodine104 103 Tositumomab105 104 Acetaminophen106 105 Trastuzumab107 106 Tretinoin108 107 Trimipramine109 108 Valproic Acid110 109 Vemurafenib111 110 Venlafaxine112

生物标志物的发现与应用

生物标志物的发现与应用

生物标志物的发现与应用生物标志物(biomarkers)是用来反映生物体内部状态或过程的一种物质或指标。

目前广泛应用于医学、环境、食品等领域。

在医学领域,生物标志物被用来诊断疾病、预测疾病发展、评估治疗效果等。

而在环境、食品等领域,生物标志物则被用来监测环境污染、检测食物卫生状况等。

生物标志物的发现和应用对人类健康与环境保护起到了极为重要的作用。

一、生物标志物的种类和来源生物标志物主要分为两类:体液标志物和组织标志物。

体液标志物是指在生物体内分泌或释放的物质,如血液、尿液、口腔分泌物等。

组织标志物则是指在体内特定组织中表达的蛋白质或基因等物质。

生物标志物的来源十分广泛,可以来自细胞、组织、器官及生物体内各种液体等。

例如,血液标志物可以来自血细胞、血浆、血小板等;尿液标志物可以来自肾脏、泌尿系统、骨骼肌等;组织标志物则可以来自肿瘤细胞、肝脏、肾脏、心脏等。

二、生物标志物的发现方法生物标志物的发现利用了许多生物学技术,例如蛋白质组学、基因组学、代谢组学等。

其中,蛋白质组学是目前最为常用的生物标志物发现方法之一。

其方法是先使用蛋白质质量分析技术对一系列蛋白质进行分析,进而筛选出与疾病相关的蛋白质。

这些蛋白质可能存在于体液或组织中,经过验证后可以成为生物标志物。

基因组学也可以用于生物标志物的发现。

通过对基因表达或突变情况的分析,可以筛选出与疾病相关的基因。

例如,乳腺癌基因BRCA1和BRCA2的突变和乳腺癌的发生有密切关系,因此它们可以成为乳腺癌的生物标志物。

代谢组学则利用质谱技术对代谢物进行分析,寻找与疾病相关的代谢物。

例如,脂质代谢的紊乱与心血管疾病的发生有关系,因此相关代谢物可以作为心血管疾病的生物标志物。

三、生物标志物的应用生物标志物的应用广泛,尤其在医学领域中起到了重要作用。

它们能够帮助医生更准确地诊断疾病、预测疾病的发展情况、评估治疗效果等。

例如,对于肝癌这种隐匿性较强的恶性肿瘤,早期发现对治疗具有至关重要的作用。

临床分析中的生物标记物

临床分析中的生物标记物

临床分析中的生物标记物生物标记物(Biomarkers)是指能够在生物体内或体外通过测量获取的生物特征,可以用于监测疾病的发展、诊断、预后预测以及疗效评估等临床应用。

随着科技的发展和医学研究的进步,越来越多的生物标记物被发现和应用于临床实践中。

1. 生物标记物的分类和应用生物标记物可以根据其来源、性质和测量方法进行分类。

根据来源,生物标记物可以分为体液标记物、实体标记物和遗传标记物等。

体液标记物包括血液、尿液、唾液等生物体内的液体成分,如肿瘤标志物、血液生化指标等;实体标记物是指通过医学影像技术观察到的异常结构或信号,如肿瘤组织形态学特征等;遗传标记物则与个体的遗传信息相关,如基因突变、染色体异常等。

不同类型的生物标记物在临床上具有各自特定的应用价值。

例如,体液标记物适用于血液肿瘤标志物的检测,实体标记物可用于肿瘤的影像学诊断,而遗传标记物则可用于遗传疾病的筛查及诊断。

此外,生物标记物还可以通过纳米技术等进行活体成像,以实现早期癌症的早期诊断和监测。

2. 生物标记物的价值和挑战生物标记物在临床诊断和治疗中具有重要的价值。

通过监测生物标记物的变化,可以了解疾病的进展情况,及时调整治疗方案,提高治疗效果。

此外,生物标记物还可以用于筛查高风险人群、早期诊断、评估预后和预测治疗反应等。

然而,要将生物标记物应用于临床实践中存在一些挑战和困难。

首先,生物标记物的选择和鉴定需要经过严格的验证和验证,并且需要建立相关的国际标准和准则。

其次,不同的疾病可能涉及多个生物标记物的联合应用,因此需要建立多指标模型,并进行复杂的数据分析。

此外,由于个体间的生物变异性,生物标记物的敏感性和特异性也需要进一步提高。

最后,生物标记物的检测方法和设备需要不断改进和创新,以提高检测效率和准确性。

3. 临床应用案例生物标记物在临床中的应用案例丰富多样。

例如,在癌症的早期诊断中,乳腺癌标志物CA15-3和CA125可以帮助医生筛查高风险人群并进行进一步检查。

最新整理BiomarkerDiscovery生物标志物发现的蛋白质组学.ppt

最新整理BiomarkerDiscovery生物标志物发现的蛋白质组学.ppt
在生物标志物发现实验中使用sieve?建立在可靠的技术基础上?ltqxl更快更灵敏更准确?ltqorbitrap和ltqftultra终极的分辨率和精确质量?稳定的易用的xcalibur工作站?内嵌sequest的bioworks工业标准被引用最多的蛋白搜索算法?自动的差别表达软件?强制性的工作流程?色谱图校正对齐递归的基峰framing蛋白鉴定?建立在严格统计学基础上确保定量的可靠结果?使用易于追溯的流程产生高度互动的图形化的界面?完全不用同位素标记的方法学labelfree?没有在样品制备中加入变量的危险?不必使用及其昂贵的同位素标记物试剂耗材sieve概述?sieve提供统计学上可靠的工具来分析在蛋白生物标志物发现的试验中获得的数据并可比较2100个lcmsn数据文件
15399
7285
10480
0
60
70
Biomarkers (新方法)
所有不同浓度的肌红蛋白产生的5个肽的合并的色谱峰面积
胰蛋白酶 酶解肽的峰面积
100000 10000 1000 100 10 1 1
R2 = 0.991
10
100
1000
肌红蛋白浓度 fmol
10000 100000
SD
0.276 0.260 0.130 0.225 0.324 0.229 0.205 0.250 0.169 0.171 0.141 0.167 0.101 0.093 0.084
-
共有 280 个蛋白, 被鉴定和被定量
左图是不存在差别 的蛋白
Effect of EGF on A431 cells
➢如果一种蛋白在一种体系中和另一种体系中的表达量不同,或者是 有/无的差异,或者是浓度的差异,在LC-MS/MS中,就可以体现:

6-第四章生物标志物1

6-第四章生物标志物1

目前是将原油、 目前是将原油、氯仿沥青等混合物 分离成单个化合物从而进行鉴定的主要 技术。 技术。
(1)色谱技术原理 利用流动的稳定流体带着待分离样品 在装有吸附剂的细管中流动, 在装有吸附剂的细管中流动,使混合物在 流动过程中不断吸附-解吸, 流动过程中不断吸附-解吸,最终分子结 构简单、 构简单、分子量小的组分先从色谱柱出口 流出,分子结构复杂、 流出,分子结构复杂、分子量大的组分后 从色谱柱口流出, 从色谱柱口流出,达到对混合样品的分离 作用。再利用检测仪器进行检测。 作用。再利用检测仪器进行检测。
生物标志化合物
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
三、生物标志化合物的分析
原油及烃源岩样品分析流程
1.岩石中可溶有机质抽提 1.岩石中可溶有机质抽提
可溶有机质:沉积物(岩)中可以被有机溶剂淬取 可溶有机质:沉积物( 抽提)出来的吸附或残留在岩石中的有机质。 (抽提)出来的吸附或残留在岩石中的有机质。
生物标志化合物
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
生物标志化合物
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 生物标志化合物:是沉积物( )、原油、 生物标志化合物:是沉积物(岩)、原油、 原油 油页岩和煤中那些来源于生物体,在有机质 油页岩和煤中那些来源于生物体, 演化过程中具有一定稳定性, 演化过程中具有一定稳定性,没有或很少发 生变化,基本保存了原始生化组分的碳骨架, 生变化,基本保存了原始生化组分的碳骨架, 记载了原始生物母质特殊分子结构信息的有 机化合物。 机化合物。 生物标志化合物从何而来? 生物标志化合物从何而来?

临床分析生物标志物在疾病诊断中的应用

临床分析生物标志物在疾病诊断中的应用

临床分析生物标志物在疾病诊断中的应用生物标志物(biomarkers)是指生物体内的某些分子或物质,通过其在体液、组织等样本中的检测,能够反映机体的生理、病理状态,提供诊断、分期、预后判断、疗效评估等信息。

临床分析生物标志物的应用已成为现代医学的重要领域,对疾病的早期诊断、个体化治疗等具有重要意义。

本文将从不同疾病领域,探讨临床分析生物标志物在疾病诊断中的应用。

一、癌症的早期诊断癌症的早期诊断对于患者的治疗和预后有着至关重要的影响。

传统的癌症诊断手段主要依靠各种影像学检查和临床症状,然而这些方法在早期诊断上存在一定的局限性。

而临床分析生物标志物的应用则为癌症的早期诊断提供了新的方向。

以肺癌为例,近年来,临床上常用的肿瘤相关标志物如CEA、CA125、CA153等,已经成为肺癌诊断和疗效评估的重要参考指标。

通过检测这些生物标志物在血液或其他体液中的水平变化,可以对肺癌的存在、发展阶段、预后情况进行初步评估,有助于选择合适的治疗方案。

同样的,对于其他常见的肿瘤疾病,如乳腺癌、结直肠癌等,临床分析生物标志物也被广泛应用于早期诊断。

这些标志物的检测方法越来越精准,不仅可以在临床上帮助医生提前发现肿瘤,还可以在治疗过程中监测疾病的进展,评估治疗效果。

这为患者提供了更加个体化的治疗选择,提高了生存率和生活质量。

二、心血管疾病的诊断与监测心血管疾病一直是全球范围内最常见的死因之一,因此,早期发现和及时干预心血管疾病对于患者的生命安全具有重要意义。

临床分析生物标志物的应用在心血管疾病的诊断和监测中有着广泛的应用。

例如,高敏心肌肌钙蛋白(hs-cTn)是一种常用的心肌损伤标志物,可用于急性冠状动脉综合征的早期诊断。

hs-cTn的检测灵敏度高,能够在症状出现前几小时就检测出心肌损伤,为急救医生提供及时的治疗方案。

此外,B型钠尿肽(BNP)是一种用于心力衰竭诊断与评估的生物标志物。

BNP的水平与心室舒张功能的障碍程度密切相关,有助于诊断心力衰竭、鉴别其他呼吸困难的原因,并可用于监测治疗效果。

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world situations
• 3. Consider effects of toxin on different organisms
• 4. How this experiment would be improved if carried out for a longer time and replicated
Ld50 & LC50
• Ld50 - median lethal dose (amount of a chemical in one dose that will kill 50% of the population)
• Lc50 - concentration of material in air that will kill 50% of the test subjects
• 1st dilution: 1/2 the fungicide concentration of series 1 (2:128 ml)
• 2nd dilution: 1/4 the concentration of series 1 (recommended concentration)
• 3rd dilution: 1/8 the concentration of series 1
results
• Slight trend in mortality rates and increased fungicide concentration
• in soil samples from jason and lindsey, mortality rate low except in soil taken from oil container site
1-
(4-CHLOROPHENOXY)-3,2,4-
TRIAZOL-1-YL)-2-
BUTANONE)
Experiment layout
• 10 worms added to each jar
• Worms allowed to adjust to new soil habitat
is not supported
• pH of each soil was taken after soil was mixed and again after the fungicide was added
• Initial pH of the soils were about 6.0 6.5
• pH after addition of fungicide ranged from 4.5 (in the more highlyconcentrated soils) to 5.5 (in the less highly-concentrated soils)
• Control series (3 jars)
• 6 series run with fungicide (3 jars/series)
• first fungicide series 4 ml fungicide
:128 ml
of water
• diluted 5 times for each successive 5 series
• The other soils with varying concentrations of fungicides provided no worse a habitat for the worms than did the control series
• overall reproductive ability did not appear to be altered
• 5. Ethical issues involved in animal experimentation
data
M a c in to s h P IC T im a g e fo rm a t
is n o t s u p p o rte d
M acintosh PIC T im age form at
conclusions
• The highest fungicide concentration used (4 times the suggested concentration) appears to have a fairly strong impact on the worms
• The soil sample from the oil container was not a good habitat for the worms since there was a fairly immediate drop in the worm count two weeks after the worms were introduced into this soil
Initial Purpose
• To observe any effects of the fungicide on the red worms
• To determine ld50 for our population of red worms
SOIL ECOTOXICOLOGY EXPERIMENT
Further objectives
• Additional objectives of this experiment: • 1. examine effects of pollution on non-
target organisms • 2. Accuracy of results, if any, in real
• pesticide added after week 1
• Data collected weekly
• worms sorted and analyzed for lesions, swelling, writhing, Number on and below surface
fungicide concentration series
Biomarkers
by heather seavolt and stephanie mCPHERSON
Types of biomarkers
• DNA, RNA or protein adducts and enzymes • cytogenic markers • tissue markers and whole body alterations • behavioral markers • measure toxicants in body fluids & tissues • death of marker animals
container
mortality
• Mortality is defined in this experiment as lack of movement in response to stimulus or absence, since the worms disintegrate rapidly
• 4th dilution: 1/16 the concentration of series 1
• 5th dilution: 1/32 the concentration of series 1
• Samples of lindsey and jason’s soil • 1. sample from the copper pipe area • 2. sample from site 1 • 3. sample from around suspicious oil
• Materials:
• 24 pint mason jars with lids
• Worms
• Soil mixture - composed of silica sand, kaolin
clay, peat moss, CaCO3, water • Litmus paper
• Pesticide - 0.88%
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