产品方案-药物筛选及药理生物系统

药物筛选及药理生物系统

01-01 基因大数据表达搜索可视化引擎

1、可查询人类，大小鼠，猪，果蝇等物种的感兴趣基因表达，找到满足感兴趣基因高表达的实现条件，并允许这些条件在统一界面操作比较。

2、人类的样本不得少于七万例,大小鼠的样本合起来不得少于3万例。

★3、可针对感兴趣的癌症组织,细胞系,药物处理等,寻找标志物基因群,进行热图,散点图,盒形图可视化。

4、可满足同时对几千例样本进行共表达图,聚类分析,双聚类分析,满足类似结果的条件寻找,得到结果的同时可以可视化展示。

★5、拥有Affy, illumina, 安捷伦芯片平台，RNA-seq高通量平台的基因数据。

6、允许加入自己的基因表达差异数据，与该系统的数据进行比较，允许找到趋势相反的数据集合，并用热图展示。01-02 多组学高通量测序计算展示一体化工具

★1、分析功能：

1.1 RNA-seq测序分析；

1.2 DNA-seq测序分析；

1.3 Methyl-seq测序分析；

1.4 ChIP-seq测序分析

1.5 Small RNA-seq测序分析。

★2、测序数据可视化：

2.1基因/外显子/转录本/reads可视化；

2.2 基因SNP/indel可视化；

2.3 Peak/motif可视化；

2.4 Small RNA二级结构可视化；

2.5多组学数据并行展示；

2.6热图/PCA/聚类/GO饼图/通路图/网络图。

3、实时查询测序reads与分析区段之间的可视化关系，可查看大片断插入缺失，可变剪切，CNV，SNP以及基因融合，基因的各个转录本信息以及外显子信息可视化；实时搜索感兴趣的基因和区段上reads的落入情况。

★4、图形式操作界面，可接受R语言的嵌入。

5、可以支持多种二代测序平台的数据分析，还可以接受Ion Torrent， Pacific Biosciences测序数据进行分析。

6、可接受原始数据fastq, 也可接受第三方软件产出的结果（BAM/SAM）进行后续分析。