#安庆一中理科试验班生物竞赛讲义
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专题2 生物化学
第3章蛋白质及其代谢
第1节蛋白质
一、氨基酸:
(一)结构:脯氨酸除外。
1.天然蛋白质中存在的氨基酸都是α-氨基酸;
2.除甘氨酸外,天然蛋白质中存在的氨基酸都是L-α-氨基酸。
(二)分类:
1.据R基团化学结构分类:
脂肪族+芳香族+杂环族。
脂肪族氨基酸据R基团化学结构分类:
(1)1氨基1羧基(中性氨基酸):Gly,Ala,Val,Leu,Ile;
(2)1氨基2羧基(酸性氨基酸):Asp,Glu;
(3)2氨基1羧基(碱性氨基酸):Lys,Arg;
(4)含羟基:Ser,Thr;
(5)含酰胺基:Asn,Gln;
(6)含硫:Cys,Met。
2.据R基团极性分类:
非极性氨基酸(8种)+不带电荷极性氨基酸(7种)+带正电荷极性氨基酸(3种)+带负电荷极性氨基酸(2种)。
3.据营养学分类:必需氨基酸+半必需氨基酸+非必需氨基酸。
(三)氨基酸的性质:
1.旋光性:甘氨酸除外。
2.氨基酸的紫外吸收:
20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(<220nm)均有光吸收。
在近紫外区(220-300nm)只有R基团含有苯环共轭双键的酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有光吸收。
利用紫外光法可以测定氨基酸的含量。
3.重要化学反应:
(1)α-氨基、α-羧基共同参和的反应:
①成肽反应;
②和茚三酮的反应:
【注意】
a.脯氨酸、羟脯氨酸和茚三酮反应生
成黄色物质。
b.此反使用于定性、定量鉴定氨基酸。
(2)α-氨基参和的反应:
①和亚硝酸反应产生氮气:
【注意】α-氨基可和亚硝酸反应产生氮气,在标准条件下测定氮气体积,即可计算出氨基酸的量。
凯氏定氮法:测定蛋白质含量的经典方法。
②和2,4-二硝基氟苯的反应:
【注
意】鉴
定多
肽或
蛋白质的N-末端氨基酸。
③和苯异硫氰酸酯(PITC)的反应:Edman反应。
【注意】鉴定多肽或蛋白质的N-末端氨基酸;由于此反应能够不断重复循环,将肽链N-末端氨基酸残基逐一进行标记和解离,所以是测定蛋白质氨基酸序列的最基本、最有效的手段,蛋白质测序仪就是该反应原理
设计的。
(3)α-羧基参和的反应:
成盐和成酯反应。
(4)侧链R基团参和的反应。
4.氨基酸的酸碱性质:
(1)氨基酸的两性解离:
氨基酸在晶体或水中主要以兼性离子存在。
①氨基酸是一类两性电解质,它既起酸(质子供体)的作用,又起碱(质子受体)的作用:
②中性氨基酸的解离(以Gly为例):
【注意】K1和K2分别为-COOH 和-+NH3的解离常数。
(2)氨基酸的等电点:
①概念:调节溶液pH值,使氨基酸处于兼性离子状态,此时氨基酸所带正负电荷数相等,即净电荷为0,在电场中既不向阳极又不向阴极移动,这时溶液的pH值即为氨基酸的等电点(pI)。
②公式:
a.中性氨基酸:pI=(pK1+pK2)/2;
b.酸性氨基酸:pI=(pK1+pK R)/2;
c.碱性氨基酸:pI=(pK2+pK R)/2。
【注意】
氨基酸的等电点:
各种氨
基酸的
等电点不同,当溶
液的pH=pI时,净
电荷为0;当溶液
的pH<pI时,氨基酸主要为正离子;当溶液的pH>pI时,氨基酸主要为负离子。
在一定pH范围内,pH离pI越远,氨基酸所带静电荷越大。
氨基酸在等电点时,溶解度最小,最易沉淀,利用这一性质可以分离制备各种氨基酸;亦可通过电泳法、离子交换层析法进行分离。
(四)分离:
1.纸层析:最简单的液-液分配层析,采用滤纸作为支持物。
2.离子交换层析:一种用离子交换树脂作为支持物的层析法。
氨基酸的洗脱顺序:酸性氨基酸、中性氨基酸、碱性氨基酸。
目前具有全自动的氨基酸分析仪。
【例题】2008年预赛
计算天冬氨酸的pI值。
它的pK1值2.09,pK2值为3.86,pK3值为9.82。
()
A.5.26 B.2.98 C.5.96 D.6.84
【例题】2010年预赛
能出现在蛋白质分子中的下列氨基酸,哪一种没有遗传密码?()
A.酪氨酸B.苯丙氨酸C.异亮氨酸D.羟赖氨酸
【例题】2010年联赛
1.在氨基酸的分类中,下面哪一个氨基酸属于芳香族氨基酸?()(1分)
A.丙氨酸B.丝氨酸C.色氨酸D.亮氨酸
2.蛋白质的肽键是以下列哪一种方式形成的?()(1分)
A.α-氨基和α-羧基缩合而成B.α-氨基和β-羧基缩合而成
C.β-氨基和α-羧基缩合而成D.β-氨基和β-羧基缩
合而成
二、蛋白质:
(一)结构:
1.一级结构:
【肽键】
(1)C-N键具有部分双键性质;
(2)肽键一般为反式构型。
【例题】2009年联赛
下图示部分多肽链的结构,1、2、3、4所标的4个化学键中的哪些键不能如右图所示那样旋转?()
A.1 B.2 C.3 D.4 【维持蛋白质构象的作用力】
主要是较弱的相互作用,即非
共价键或次级键。
a.盐键(离子键);
b.氢键;
c.疏水键;
d.
范德华力;e.二硫键
2.二级结构:指多肽链本身绕曲折叠成有规律的
结构或构象。
这种结构是以肽链内或肽链间的氢键
来维持的。
(1)α-螺旋:多肽链中氨基酸残基以100°的角度
围绕螺旋轴心盘旋上升(每个残基沿轴上升
0.15nm),每3.6个残基就旋转一圈,螺距为0.54nm,
螺旋直径0.5nm;右手旋转;多肽链内的氢键由肽链中一个肽键的-CO
的氧原子和第四个肽键的-NH的氢原子组成,每个氢键所形成的环内
共有13个原子,这种螺旋称为
3.613-螺旋。
【影响α-螺旋形成的因素】
①R基的电荷性质:同种电荷可产生静电斥力。
pH=7,多聚Lys R基带正电荷,破坏α-螺旋的形成。
②R基的大小:R基大,空间位阻大。
多聚Ile、Val、Leu,由于R基大,阻碍α-螺旋的形成。
③R基的结构:
多聚Pro由于肽键上不具有亚氨基氢,无法形成氢键,因此多
肽链中只要有Pro残基,α-螺旋即被中断,使多肽链主链产生一个“结节”。
(2)β-折叠:邻近两链以相反
或相同方向平行排列成片层状。
两个氨基酸残基之间的轴心距
离为0.35nm,β-折叠结构的氢键
是由两条肽链中的一条的-CO
基和另一条-NH基之间所形成。
②反平行式。
(3)β-转角:多肽链上出现的180°回折,由第一个氨基
酸残基的-CO和第四个氨基酸残基的-NH之间形成氢键。
(4)自由绕曲:没有一定规律的松散结构,酶的功能部位
常常处于这种构象区域里。
3.超二级结构和结构域:
(1)超二级结构:蛋白质中,由若干相邻的二级结构单元
组合在一起,彼此相互作用,形成有规则、在空间上能辨认
的二级结构组合体,以充当三级结构的构件。
基本组合形式:
(2)结构域:多肽链在超二级结构基础上进一步绕曲折叠成紧密的球状结构,在空间上彼此分隔的各自具有部分生物功能的亚结构。
一般情况下,酶的活性部位位于两个结构域之间的裂缝中。
4.三级结构:
(1)纤维状蛋白质一般
只有二级结构,而球状
蛋白质在二级结构的基
础上,经过超二级结构
和结构域,进一步组装成三级结构。
(2)维持三级结构的作用力主要是一些次级键,包括氢
键、盐键、疏水键和范德华力等。
5.四级结构:由相同或不同的称作亚基的亚单位按照一
定排布方式聚合而成的蛋白质结构,维持四级结构稳定的
作用力是疏水键、离子键、氢键、范德华力。
亚基本身都
具有球状三级结构,一般只包含一条多肽链,也有的由二条或二条以上由二硫键连接的肽链组成。
(二)性质:
1.大小和分子量:
(1)道尔顿;
(2)沉降系数(S):单位离心场下的沉降速度。
1S=10-13秒。
蛋白质、核酸、核糖体的沉降系数介于1~200S之间。
2.酸碱性质:
(1)蛋白质是两性电解质;
(2)蛋白质在等电点时溶解度最低。
可采用电泳法和离子交换层析分离蛋白质混合物。
3.胶体性质:
(1)具有胶体的特征:布朗运动、丁达尔现象、不能通过半透膜;蛋白质颗粒比较稳定,不易沉淀。
①透析法:将含有小分子杂质的蛋白质纯化。
②盐析法:使蛋白质颗粒集聚而生成沉淀。
4.蛋白质的沉淀:
(1)盐析法;
(2)等电点沉淀;
(3)有机溶剂沉淀法:如酒精棉球的作用。
(4)重金属盐沉淀法;
(5)生物碱试剂及某些酸沉淀法;
(6)加热变性沉淀法。
5.蛋白质的变性和复性:
(1)变性:蛋白质分子的空间结构改变,导致其理化性质、生物活性都发生改变。
但不发生一级结构的破坏,而主要发生氢键、疏水键和二硫键等次级键的破坏。
生物活性丧失,溶解度降低。
(2)复性:蛋白质的变性如果不过于剧烈,则是一种可逆过程,变性蛋白质通常在除去变性因素后,可缓慢地重新自发折叠成原来的构象,恢复原有的理化性质和生物活性。
6.蛋白质的紫外吸收:280nm的紫外光下,有最大吸收峰。
这是由于肽链中酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸的R基团引起的。
紫外分光光度法在280nm的光吸收值来测定蛋白质的含量。
(三)分离纯化:
1.根据蛋白质的溶解度差异进行分离:
(1)盐析法;
(2)等电点沉淀;
(3)有机溶剂分级沉淀。
2.根据蛋白质分子大小进行分离:
(1)透析;
(2)密度梯度离心;
(3)凝胶过滤:分子筛效应。
3.
根据蛋白质带电性质不同进行分离:
(1)电泳;
(2)离子交换层析;
【例题】2010年联赛
在生物大分子的分离纯化过程中,能将生物大分子和无机盐及有机小分子分离的方法是以下哪些?()(3分)
A.离子交换层析B.凝胶过滤层析C.滤纸过滤D.透析E.离心
1.蛋白质的化学分类:
(1)简单蛋白质:球蛋白、白蛋白、组蛋白等。
(2)结合蛋白质:由简单蛋白质和非蛋白质物质两部分组成。
①糖蛋白:由简单蛋白和糖类物质组成。
如细胞膜中的糖蛋白等。
②脂蛋白:由简单蛋白和脂类结合而成。
如血清α-,β-脂蛋白等。
③核蛋白:由简单蛋白和核酸结合而成。
如细胞核中的核糖核蛋白等。
④色蛋白:由简单蛋白和色素结合而成。
如血红素、过氧化氢酶、细胞色素c等。
⑤磷蛋白:由简单蛋白质和磷酸组成。
如胃蛋白酶、酪蛋白、角蛋白、弹性蛋白、丝心蛋白等。
2.蛋白质的功能分类:结构蛋白和酶。
第2节蛋白质的异化
一、蛋白质的降解:
(一)细胞内蛋白质的降解:
1.溶酶体的降解;
2.泛素化降解。
(二)机体对外源蛋白的消化作用。
二、氨基酸代谢:
(一)脱氨基作用:
1.氧化脱氨基作用:
谷氨酸脱氢酶是为人所知的唯一种氧化脱氨基作用的线粒体酶,辅酶为NAD+或NADP+。
2.转氨基作用:
(1)大多数氨基酸可参和转氨基作用,但赖氨酸、脯氨酸、羟脯氨酸除外。
(2)血清转氨酶活性,临床上可作为疾病诊断和预后的指标之一:
GPT(谷丙转氨酶)/GOT(谷草转氨酶)。
(3)转氨基作用的机制:转氨酶的辅酶是磷酸吡哆醛/磷酸吡哆胺。
作用:
方
式
既
是氨基
酸脱氨
基的主
要方
式,也
是体内
合成非
必需氨
基酸的
主要方
式。
主要在肝、肾组织进行。