生物芯片应用生物芯片检测细胞中microRNA 的表达

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小rna表达

小rna表达

小rna表达小RNA(小分子RNA)是一类非编码RNA分子,其长度通常在20-30个核苷酸左右。

小RNA在细胞内起着重要的调控作用,参与多种生物学过程,如基因表达调控、蛋白质合成、细胞分化和发育等。

本文将从不同角度介绍小RNA的功能和应用。

一、小RNA在基因表达调控中的作用小RNA通过与靶基因的mRNA序列特异性碱基互补配对,介导靶基因的转录后调控。

其中,miRNA(microRNA)是一类重要的小RNA分子,通过与mRNA的3'非翻译区(3' UTR)结合,可以促进mRNA的降解或抑制翻译。

miRNA的调控网络广泛参与细胞的生长、分化、凋亡等重要生理过程。

二、小RNA在疾病诊断和治疗中的应用由于小RNA在疾病发生发展过程中的重要调控作用,其异常表达常与多种疾病的发生发展相关。

例如,miRNA的异常表达与多种肿瘤的发生发展密切相关。

通过检测体液中的小RNA水平,可以实现一些疾病的早期诊断和预后评估。

此外,针对小RNA的干扰技术(如miRNA的mimic和抑制剂)也被广泛应用于疾病治疗研究中。

三、小RNA在植物生长发育中的调控作用在植物中,小RNA也发挥着重要的调控作用。

其中,siRNA(small interfering RNA)是一类重要的小RNA分子,通过与靶基因的mRNA序列碱基互补配对,介导靶基因的降解。

siRNA在植物的基因沉默调控中起着重要作用,调控植物的生长发育、抵抗病原体和逆境胁迫等。

四、小RNA在神经系统发育和功能调控中的作用小RNA在神经系统中也发挥着重要的作用。

研究发现,miRNA参与了神经细胞的分化和轴突的生长导向。

此外,miRNA还参与了神经系统的突触可塑性和学习记忆等功能的调控。

五、小RNA在药物研发中的应用小RNA作为一种具有调控功能的分子,已经成为药物研发的重要靶点。

针对小RNA的药物研发主要包括两个方面:一是针对小RNA 的干扰技术,如miRNA的mimic和抑制剂;二是针对小RNA的靶向药物,通过设计合成靶向小RNA的化合物来实现对小RNA的调控。

miRNA简介

miRNA简介

miRNA简介Micro RNA简介1.关于microRNAmicroRNAs (简称miRNA)是⼀类进化上⾼度守的⼩分⼦⾮编码RNA,长度⼤约22nt左右,具有转录后调控基因表达的功能。

第⼀个microRNA 于1993 年被发现。

2000年之后,关于miRNA 的研究取得了很⼤进展,⽬前已经有1000多个⼈类被发现,这些miRNA调控⾄少 30% 以上的基因表达,参与多种⽣理病理过程。

编码miRNA的基因可能位于功能基因编码区、⾮编码区,可能成簇表达或独⽴表达。

在细胞核内,基因组DNA 转录⽣成较长的pri-pre-microRNA,之后被Drosha酶切割pri-pre-miRNA 成形成长度⼤约70-100 碱基的、具发夹结构的pre- microRNA。

这些发夹结构的RNA 被核输出蛋⽩exportin5转运到细胞质,在呗胞浆中的Dicer 酶切割形成19-23nt ⼤⼩的成熟的miRNAs 产物。

成熟的单链miRNAs 与⼀系列蛋⽩形成miRNA诱导的沉默复合物(miRISC),结合于靶mRNA的3ˊ-UTR区,阻⽌所结合的mRNA 的翻译或直接降解靶miRNA。

每个miRNA可以调控多个(甚⾄上百个)靶基因,⽽特定靶miRNA也可以同时被多个miRNAs调节。

成熟的miRNA具有如下特点:(1)通常的长度为20~24 nt , 但在3′端可以有1~2 个碱基的长度变化;(2)5′端有⼀磷酸基团, 3′端为羟基, 这⼀特点使它与⼤多数寡核苷酸和功能RNA 的降解⽚段区别开来;(3)具有⾼度保守性、时序性和组织特异性。

序列(特别是种⼦序列)⾼度同源的miRNA被归为⼀个miRNA家族,但这些miRNA并不⼀定是成簇表达的。

例如miR-34 家族3个成员miR-34a、b、c,其中,miR-34a位于1号染⾊体1p36基因座位,单独表达;⽽miR-34b和-34c位于11号染⾊体11q23基因座位,成簇表达(图1),但它们都具有相同的种⼦序列(图1),并且都受到转录因⼦TP53的调控。

生物芯片在基因组测序中的应用

生物芯片在基因组测序中的应用

生物芯片在基因组测序中的应用基因组测序是近年来生物学领域的热门研究课题,其重要性不言而喻。

然而,传统的基因组测序工具存在着高昂的成本、复杂的流程和数据量大等问题,致使其应用受限。

而随着生物芯片技术的不断发展,其在基因组测序中的应用已逐渐走向成熟。

本文将深入探讨生物芯片在基因组测序中的应用现状和前景。

一、什么是生物芯片?生物芯片属于一种包含多个微小探针的装置,可以一次性检测成千上万个样本的基因表达水平,从而提供大量的生物信息。

生物芯片分为两种类型:基因表达芯片和蛋白芯片。

基因表达芯片用于检测不同组织或疾病状态下基因表达水平的变化,从而揭示不同生物学过程的分子机制。

蛋白芯片则可用于检测蛋白质与蛋白质、蛋白质与配体之间的相互作用,从而帮助解析蛋白质相互作用网络和信号通路。

二、1.基因组芯片测序传统的基因组测序方式是将DNA放到一片载玻片上逐个拆开进行测序,且需要高成本和大量的数据处理和存储。

在这里,基因组芯片的应用将极大的缩减着测序的成本和复杂程度。

基因组芯片使用的原理是先将要测序的DNA杂交到预先设计好的探针中,然后检测每个探针的信号强度,就能够推断出物种基因组序列的相应信息。

随着技术的不断发展,以基因组芯片作为基因分型和DNA序列分析是越来越普及的。

2.表达谱芯片测序表达谱芯片测序可以更好地帮助我们了解一种生物的基因表达情况。

基因表达谱是体内每个基因在不同生理过程和状态下的相对表达程度,由此可以呈现出基因功能定位,同时也揭露了基因调节机制。

表达谱芯片利用物种基因数据库设计了一些互补于探针,然后测量样本表达谱的差异并标记相应的信号强度。

3.miRNA芯片测序miRNA(microRNA)是新近被发现的一类长度较短的RNA分子,目前已被证实在基因表达调控中起到重要的作用。

miRNA芯片测序则是基于逆转录实时PCR技术,能够同时检测百余个miRNA的表达水平,从而揭示miRNA在不同疾病阶段和生物过程中的作用及机制。

microRNA知识大全

microRNA知识大全

microRNA知识大全microRNA知识大全MicroRNA(miRNA)是一类内生的、长度约20-24个核苷酸的小RNA,是发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer 酶加工后生成。

其在细胞内具有多种重要的调节作用。

每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNAs也可以调节同一个基因。

这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNAs的组合来精细调控某个基因的表达。

随着miRNA调控基因表达的研究的逐步深入,将帮助我们理解高等真核生物的基因组的复杂性和复杂的基因表达调控网络。

miRNA广泛存在于真核生物中,是一组不编码蛋白质的短序列RNA,其本身不具有开放阅读框(ORF)。

成熟的miRNA,5′端有一个磷酸基团,3′端为羟基。

编码miRNAs的基因最初产生一个长的pri-RNA分子,这种初期分子还必须被剪切成约70-90个碱基大小、具发夹结构单链RNA前体(pre-miRNA)并经过Dicer 酶加工后生成。

成熟的miRNA 5’端的磷酸基团和3′端羟基则是它与相同长度的功能RNA 降解片段的区分标志。

miRNA 5'端第一个碱基对U(尿苷)有强烈的倾向性,而对G却排斥,但第二到第四个碱基缺乏U。

一般来讲,除第四个碱基外,其他位置碱基通常都缺乏C。

这些分子能够与那些和它的序列互补的mRNA分子相结合,有时候甚至可以与特定的DNA片断结合。

这种结合的结果就是导致基因的沉默。

这种方式是身体调节基因表达的一个重要策略。

据推测,miRNA调节着人类三分之一的基因。

microRNA - 形式1 . pre-miRNA约70bp含microRNA茎环结构的pre-miRNA。

制备方式:化学合成、生物转录合成、pre-miRNA质粒表达载体、pre-miRNA病毒。

2. pri-miRNA天然pri-miRNA从染色体基因文库中调取300bp-1000bp完整的microRNA基因,克隆到质粒载体(普通载体或病毒载体),以强大的CMV启动子操纵该300bp-1000bp microRNA。

miRNA的常用检测方法研究

miRNA的常用检测方法研究

miRNA的常用检测方法研究miRNA (microRNA)是一类长度约为20~22个核苷酸的非编码RNA分子,广泛存在于真核生物的细胞内,并在基因表达调控、细胞周期调控、细胞分化和发育等生物过程中发挥重要作用。

miRNA的检测方法研究对于揭示miRNA的功能机制以及其在疾病诊断和治疗中的潜在应用具有重要意义。

本文将介绍miRNA的常用检测方法研究的进展。

常用的miRNA检测方法主要有以下几种:实时荧光定量PCR (real-time PCR)、Northern blot、微阵列芯片 (microarray)、测序技术和表达定量检测 (expression profiling) 等。

实时荧光定量PCR是一种常用的miRNA检测方法。

该方法利用特异性结合miRNA的引物和荧光探针来定量miRNA的表达水平。

相比于传统的定量PCR方法,实时荧光定量PCR具有灵敏度高、特异性强和定量性好等优点,能够快速、准确地测定miRNA的表达水平。

Northern blot是一种传统的miRNA检测方法,通过将miRNA转录成RNA探针,在琼脂糖凝胶上进行电泳分离,再通过膜转移、固定和杂交等步骤检测miRNA的存在。

这种方法能够直接检测miRNA,但需要较大数量的样本和较长的检测时间,且对于低表达的miRNA不够敏感。

微阵列芯片是一种高通量的miRNA检测方法,能够同时检测上千个miRNA的表达水平。

该方法基于RNA探针定向杂交的原理,将不同miRNA的探针固定在芯片上,再将标记的miRNA样本与其杂交,通过芯片扫描仪检测出荧光信号来分析miRNA的表达水平。

尽管微阵列芯片具有高通量和高灵敏度的优点,但由于其特异性和准确性可能受到限制,因此需要进一步验证。

测序技术是一种新兴的miRNA检测方法,通过高通量测序技术,可以对miRNA的全基因组进行检测。

该方法能够准确地测定miRNA的长度、结构和表达量,并发现新的miRNA序列,对于探索miRNA的功能和机制具有重要意义。

MicroRNA研究概况以及MicroRNA芯片技术简述MicroRNA的研究

MicroRNA研究概况以及MicroRNA芯片技术简述MicroRNA的研究

MicroRNA 研究概况以及MicroRNA 芯片技术简述一、MicroRNA 的研究概况1.MicroRNAMicroRNA(miRNA , miR)是由约21-25个核苷酸组成的分子,microRNA 通过抑制mRNA 的翻译或者促进其降解而起到负性调控的作用。

最初miRNA 的功能在植物学、癌症、病毒性感染和发育生物学中得到了验证。

但最近的研究发现,患有心脏疾病的小鼠对照正常状态miRNAs 失调,并且在肥大的心脏中也检测到了数种miRNA 的上调或者下调,同时体外实验也证实了它们对心肌细胞形态的影响。

2.MicroRNA 的研究进展miRNA现象的最早报道是在佃80年的Genetics和Cell上。

佃93年在线虫中发现的lin-4 是第一个被确定的miRNA [31],它的基因产物是21 个核苷酸的RNA 分子并且部分序列互补于lin-14 mRNA的3' UTR区域。

这些互补序列使lin-4间断地与lin-14 mRNA结合。

奇怪的是,lin-4没有明显地改变lin-14 mRNA的量,但是Lin-14蛋白表达却明显降低。

2000年又在线虫中发现了与lin-4相似的miRNA ―― let-7,它们参与线虫发育的时空调节。

miRNA基因首先被RNA聚合酶H转录为较长的初始转录本,该转录本含有数千个核苷酸,称其为pri-miRNA。

在pri-miRNA内,miRNA位于由大约70个核苷酸构成的环柄结构内。

在动物体内,该环柄结构在细胞核内被RNA酶川Drosha和其辅助蛋白Pasha/DGCR8 识别和切割,形成pre-miRNA 。

之后,pre-miRNA 迅速被核质/细胞质转运蛋白Exportin5转运至细胞质,被位于细胞质内的RNA酶川Dicer 进一步切割。

产生一个类似于siRNA 的miRNA :miRNA* 复合体,随后,该双链体解旋为成熟的miRNA和miRNA*,成熟的miRNA在一种ATP-依赖的沉默复合体(RISC )中,形成非对称的RISC 复合物。

mirna芯片

mirna芯片

mirna芯片Mirna芯片是一种用于检测和研究微小RNA(mirna)的技术。

在过去的几十年中,研究者发现,微小RNA在基因调控中起着重要的作用,并且与多种疾病的发展和进展密切相关。

由于其在许多生理和病理过程中的重要性,科学家们对于微小RNA的研究日益增加,而mirna芯片正是其中一种用于研究和检测microRNA的技术。

Mirna芯片是一种利用高通量技术检测和分析微小RNA的工具。

其原理是通过非编码RNA在生物样本中的表达水平的检测来确定微小RNA的存在和数量。

芯片上涂覆有数千个特异性引物,这些引物可以与已知的微小RNA序列配对并杂交,形成稳定的结合。

随后,通过荧光探测技术来确定每个探针的信号强度,从而确定微小RNA的表达水平。

Mirna芯片具有许多优势。

首先,它可以同时检测数千个微小RNA,大大提高了研究效率。

其次,它具有高灵敏度和高特异性,可以检测到非常低水平的微小RNA。

此外,它还可以提供不同组织或条件下微小RNA的表达差异,为研究者提供了宝贵的信息。

此外,mirna芯片还可以通过与其他实验技术的结合,如定量PCR、Western印迹等,进一步验证微小RNA的表达结果。

在疾病研究和临床应用方面,mirna芯片也具有广阔的应用前景。

通过分析不同疾病状态下微小RNA的表达差异,研究者可以发现新的疾病标志物,并且有望为疾病的早期诊断和治疗提供新的靶点。

此外,mirna芯片还可以用于评估药物的效果和副作用,以及预测疾病的发展和预后。

因此,mirna芯片被认为是一种非常有前景的技术,在生物医学研究和临床实践中具有广泛的应用。

总之,mirna芯片是一种用于检测和研究微小RNA的高通量技术。

通过对微小RNA的表达水平进行检测和分析,研究者可以了解微小RNA在基因调控中的作用,并且探索其与疾病发展之间的关系。

在生物医学研究和临床实践中,mirna芯片具有广泛的应用前景,有望为疾病的早期诊断和治疗提供新的突破。

生物芯片技术在微生物检测中的应用

生物芯片技术在微生物检测中的应用

生物芯片技术在微生物检测中的应用随着科技的发展,生物芯片技术逐渐应用于多个领域,其中微生物检测是其中的一个重要应用方向。

生物芯片技术是指将微米级的生物材料(如DNA、RNA等)沉积到芯片上,通过芯片上的微小管道、电极等结构,快速检测目标生物物质。

生物芯片技术在微生物检测方面的应用可以分为两个方向:一是针对单一菌株的检测,另外一个是面向整个微生物群体的鉴定。

下面,本文将分别探讨这两个方向。

针对单一菌株的检测针对单一菌株的检测主要是针对某些常见的致病菌(如沙门氏菌、葡萄球菌等)的检测。

通过对这些菌株存在特定的基因序列进行设计,制备相应的芯片,再将样品中提取的DNA或RNA等生物材料置于芯片上进行检测。

这样的检测方法,通常具有灵敏度高、可靠性好、检测速度快的特点,并且可以通过多重PCR技术实现菌株的一次性检测。

目前,国内外已经多家企业开发了相应的微生物检测芯片。

例如,英国的Nimblegen公司和美国的Affymetrix公司分别研制了针对霍乱弧菌、肠道致病菌等多种常见感染病原菌的芯片。

而中国的基因生物技术公司,则推出了针对大肠杆菌、沙门氏菌、痢疾杆菌等致病菌的芯片。

除了上述常见的菌株外,生物芯片技术还可以用于新型病原菌的检测。

例如,在2019年爆发的新冠病毒疫情中,多家国内外的医学研究机构,利用生物芯片技术对新冠病毒进行了检测,其灵敏度和特异性均得到了验证。

面向整个微生物群体的鉴定单一菌株的检测只适用于已知菌株的检测,而面向整个微生物群体的鉴定,则适用于对未知微生物进行检测。

这种检测方式通常包括多种微生物检测技术的组合,例如16S rRNA测序、荧光原位杂交(FISH)技术、生物芯片技术等。

在这种检测方式中,先利用某些微生物检测方法,将样品中的微生物分离出来,接下来通过对微生物的生长特性、形态特征、代谢产物等进行分析,最后将得到的结果代入生物芯片中,获取微生物群体信息。

其中,生物芯片技术主要用于生成基于微生物代谢物和群体特征的鉴定模式和分析体系,并且在分析结果的数值处理和分析上具有优势。

MicroRNA在肿瘤分子诊断中的应用

MicroRNA在肿瘤分子诊断中的应用

MicroRNA在肿瘤分⼦诊断中的应⽤MicroRNA 在肿瘤分⼦诊断中的应⽤欧志英 夏慧敏[摘 要] MicroRNA (miRNA )在⼤多真核⽣物中表达,通过抑制翻译或诱导靶mRNA 降解。

miRNA 是⼀种新的转录后基因表达调控模式,在复杂疾病形成过程中发挥着重要作⽤,调节了多种⽣物学过程,包括⽣长发育、信号转导、免疫调节、细胞凋亡、增殖及肿瘤发⽣等。

越来越多的证据表明异常表达的miRNA 是⼈类疾病的标志,包括肿瘤。

差异表达的miRNA 可能作为疾病早期诊断、分⼦分型及预后判断的指标,同时也可能成为多种肿瘤耐药新的治疗靶标。

因此,miRNA 在肿瘤中可能作为诊断、预测和治疗的⽣物标志。

[关键词] 肿瘤;MicroRNA (miRNA );分⼦诊断;治疗;预测;⽣物标志物Application of microRNA in cancer molecular diagnosisOU Zhiying ,XIA Huimin(Molecular Biology Lab, Guangzhou Women and Children's Medical Center, Guangdong, Guangzhou 510623, China) [ABSTRACT] MicroRNA (miRNA) is a new mode of post-transcriptional regulation of gene expression. It is expressed in most of the eukaryotes, which can inhibit translation or induce target mRNA degradation. miRNA plays an important role in the formation of complex diseases and regulates a variety of biological processes, including growth and development, signal transduction, immune regulation, apoptosis, proliferation and tumor genesis and so on. More and more evidences show that the abnormal expression of miRNA is a sign of human diseases, including cancer. Differentially expressed miRNA may be used as the indicators of early diagnosis, molecular typing and prognosis. It may also be a variety of tumor-resistant new therapeutic targets. Therefore, miRNA may be used as cancer biomarkers for diagnosis, prediction and treatment.[KEY WORDS] Tumor ;MicroRNA(miRNA);Molecular diagnosis ;Therapy ;Prediction ;Biomarker基⾦项⽬:⼴东省⾃然科学基⾦(20121054);⼴州市重⼤民⽣科技专项(2010U1-E00741)作者单位:⼴州市妇⼥⼉童医疗中⼼分⼦⽣物学实验室,⼴东,⼴州 510623通讯作者:欧志英,E-mail: ouzhiying@/doc/5e6817334.htmlmiRNA 作为⼀类重要的参与基因表达调控的分⼦,代表了⼀种新的基因表达调控模式,它在细胞中调节约30%的蛋⽩编码基因,在致病过程中起着重要作⽤。

微小RNA及其在医学中的应用

微小RNA及其在医学中的应用
miR-421靶蛋白实验结果
Jiang C, Guo J,et al. Journal of Gastroenterology. DOI 10.1007/S00535-009-0135-6
筛选微小RNA匹配度最高的肿瘤相关靶基因、检测靶基因在蛋白质水平上的变化
单击此处添加正文,文字是您思想的提炼,为了演示发布的良好效果,请言简意赅地阐述您的观点。您的内容已经简明扼要,字字珠玑,但信息却千丝万缕、错综复杂,需要用更多的文字来表述;但请您尽可能提炼思想的精髓,否则容易造成观者的阅读压力,适得其反。正如我们都希望改变世界,希望给别人带去光明,但更多时候我们只需要播下一颗种子,自然有微风吹拂,雨露滋养。恰如其分地表达观点,往往事半功倍。当您的内容到达这个限度时,或许已经不纯粹作用于演示,极大可能运用于阅读领域;无论是传播观点、知识分享还是汇报工作,内容的详尽固然重要,但请一定注意信息框架的清晰,这样才能使内容层次分明,页面简洁易读。如果您的内容确实非常重要又难以精简,也请使用分段处理,对内容进行简单的梳理和提炼,这样会使逻辑框架相对清晰。
人类基因组绝大部分被转录成RNA 非编码RNA的数量是编码RNA的数百倍 生物体复杂性被隐藏在它们所输出的非编码RNA内,而非编码序列内。
2006年的诺贝尔生理学奖获得者:
Andrew Z. Fire Craig C. Mello
微小RNA(microRNA, miRNA)的发现
第一个被发现的miRNA (lin-4)由哈佛大学的Victor Ambros 发现的(1993) 第二个被发现的miRNA(let-7)由哈佛大学的博士后Frank Slack (Ruvkun 实验室)发现的(2000)
增加mir-17–19b的表达,加速了c-myc诱导的淋巴瘤形成

microRNA研究课件

microRNA研究课件

Microrna与mRNA的相互作用分析
总结词
互补配对分析,结合位点预测,转录本水平调节,翻 译水平调节。
详细描述
通过互补配对分析,研究Microrna与mRNA的碱基配 对规则以及作用力大小。利用结合位点预测方法,推 测Microrna与mRNA的结合位点及其附近的序列和结 构特征。转录本水平调节是指Microrna通过与靶基因 mRNA的3'UTR结合,抑制或下调靶基因转录物的生 成
Microrna与肿瘤
Microrna参与肿瘤细胞增殖和凋亡过程
通过调节细胞周期、抑制凋亡等途径参与肿瘤的发生发展。
Microrna与信号转导通路
调节肿瘤细胞信号转导通路,如PI3K/Akt、MAPK等,促进或抑制肿瘤细胞的生长和迁移。
Microrna与肿瘤细胞转移
参与肿瘤细胞的侵袭和转移过程,如调节细胞黏附、细胞外基质降解等。
Microrna与自身免疫性疾病
Microrna与自身免疫性 疾病的发病
通过调节免疫细胞功能、影响炎症反应等途 径参与自身免疫性疾病的发病过程。
Microrna与自身免疫性 疾病的诊疗
为自身免疫性疾病的诊断提供新的生物标志 物,并为治疗提供潜在靶点,有助于改善诊
疗效果。
04
Microrna的提取、检测方法
06
研究Microrna的实验设计及伦理问 题
实验设计原则及注意事项
要点一
基于科学问题的实验 设计
针对具体的科学问题,设计实验方案 ,确保研究的科学性和可靠性。
要点二
对照原则
设立对照组,以排除非实验因素对实 验结果的影响,提高研究的可信度。
要点三
随机原则
采用随机抽样方法,减少系统误差和 偏倚,提高研究的普遍性和可推广性 。

microRNA 过表达载体具体步骤及说明

microRNA 过表达载体具体步骤及说明

microRNA 过表达载体具体使用说明及步骤MicroRNA(miRNA)是一类真核生物内源性的小分子单链RNA,通常长为18~25nt,能够通过与靶mRNA 特异性的碱基配对结合,引起靶序列降解或抑制其翻译,从而对基因进行转录后的表达调控(如右图所示)。

GenePharma MicroRNA 载体利用CMV 启动子可以在众多哺乳动物细胞中快速、高效、持续表达pre-miRNA,经过Drosha(RNase Ⅲ)作用形成small hairpin pre-miRNAs。

在使用载体法针对某一MicroRNA 进行过表达研究过程中,通常会遇到如下几个问题:实验对照组的确立、细胞转染条件的确定、基因表达效率的检测。

1、实验对照组的确立在一个完善的MicroRNA 表达实验设计中,必须考虑设立正确合理的实验对照组。

通常,这些对照组包括载体阴性对照组、转染试剂对照组。

载体阴性对照可以有两种,一种是采用通用的阴性对照组,在本试剂盒中包括了该对照所需的载体(microRNA),可以表达与目的基因序列无同源性的microRNA 片段;另一种是将目的microRNA 的序列打乱后重新组合所得的阴性对照(scrambled)。

对照组的设立对于MicroRNA 表达研究是很有必要的,您可以利用载体对照来确认microRNA 实验中转染、RNA提取和基因表达检测方法的可靠性。

2、细胞转染条件的确定使用MicroRNA 载体转染细胞时,为了选择合适的转染方法和确定转染效率,通常采用报告基因来检测DNA 的导入情况。

最常用的报告基因是绿色荧光蛋白。

3、MicroRNA 表达的检测通常用两大类方法来检测MicroRNA 表达效率,一类方法是直接检测MicroRNA 的变化水平,常用的方法如northern 杂交、芯片(microarrays)以及核糖核酸酶保护分析,但这些传统的方法都需要用到标记探针与纯化的RNA 进行杂交,由于成熟的miRNAs 及其前体共享一段共同的靶序列,而且目前的这些方法有无法通过大小将其分开,因此很难专一识别成熟的MicroRNA,导致较高的背景信号。

生物芯片与第二代测序技术是两种重要的高通量基因组学研究方法

生物芯片与第二代测序技术是两种重要的高通量基因组学研究方法

生物芯片与第二代测序技术是两种重要的高通量基因组学研究方法,在生命科学研究领域有着极其广泛的应用前景。

经过近20年的发展,生物芯片技术逐渐成熟,正在向着“高密度,灵活定制,微量样品” 的方向发展,从一个实验室技术发展成一个基因组学研究所依赖的,快速产生海量数据的常规手段,正在逐步走向产业化。

第二代测序技术是最近几年建立的高通量技术,其特点是一次测序反应可以产生千万到亿条序列,而测序的成本大大降低,到2010年已经进入数千美元测定一个人全基因组的时代。

上海伯豪生物技术有限公司(简称SBC,上海生物芯片有限公司下属CRO子公司)先后建立了Roche 454技术平台, Illumina Solexa技术平台和ABI SOLiD技术平台,已拥有ABI SOLiD4 System(4台)、Roche Genome Sequencer FLX System(1台)和Illumina Genome Analyzer IIx(2台),已成为华东地区最大的第二代测序中心。

能提供的测序服务有:全基因组重测序、全转录组测序、染色质免疫沉淀-测序(ChIP-Seq)、DNA甲基化测序(MBD-Seq)、人全外显子组序列捕获及第二代测序、目标序列捕获及第二代测序。

目前用血液样品做microRNA芯片有两种情况。

1、全血:一般是分离白细胞,用试剂盒抽提白细胞中的RNA,随后做芯片实验。

一般1-2ml全血即可。

2、血清血浆:直接用试剂盒抽提RNA,因为目前发现血清血浆中也有microRNA的存在。

一般来讲,血浆的效果要好于血清。

一般400ul的血清血浆就可以了。

您所问的属于第二种情况。

但是做microRNA芯片的总RNA与做表达谱芯片的总RNA不一样,它必须包含microRNA,所以必须用能纯化到microRNA的试剂盒。

我们公司抽提含microRNA的总RNA用Qiagen miRNeasy Kit试剂盒或Ambion mirVana miRNA isolution Kit试剂盒。

miRNA的常用检测方法研究

miRNA的常用检测方法研究

miRNA的常用检测方法研究miRNA(microRNA)是一类长度约为22个核苷酸的非编码小RNA分子,它们在调控基因表达、细胞生物学以及疾病发生发展等方面发挥重要作用。

对miRNA的检测方法进行研究和开发具有重要的科学意义和应用价值。

目前,miRNA的常用检测方法主要包括定量PCR、芯片技术、深度测序、原位杂交等。

定量PCR是一种常用且经典的miRNA检测方法。

其中最常用的是RT-qPCR方法。

该方法通过首先对miRNA进行逆转录生成cDNA,再进行定量PCR扩增,最终通过产品的增长曲线和阈值周期数来确定miRNA的数量。

RT-qPCR方法具有高灵敏度、高特异性和快速的优势。

还可以通过SYBR Green染料或探针的方法来检测miRNA。

芯片技术也是一种常见的miRNA检测方法。

利用芯片上固定的探针序列,可以同时检测大量miRNA。

芯片技术具有高通量、高灵敏度和高特异性等优势,可以同时分析上千种miRNA。

不过,芯片技术还存在一些局限性,如需要对样品进行标记、探针设计较为困难等。

深度测序是一种新兴的miRNA检测方法。

通过高通量测序技术,可以直接测序miRNA 分子,从而获得其精确序列和表达量信息。

与传统方法相比,深度测序具有高分辨率和高灵敏度的优势。

深度测序技术还可以用于发现新的miRNA或miRNA亚型,以及miRNA与其他RNA分子的相互作用等。

原位杂交是一种用于检测miRNA表达模式的技术。

通过将标记有荧光物质的探针与待测miRNA进行杂交,可以在显微镜下观察到光信号的强弱,并进一步定量miRNA的表达水平。

原位杂交技术具有直观、可视化的优势,可以对miRNA在组织和细胞中的分布和定位进行研究。

还有一些其他的miRNA检测方法,如Northern blot、RPA(RNA protection assay)、Luciferase报告基因技术等,都具有一定的优缺点和适用范围。

随着研究的深入,miRNA检测方法也得到了不断的改进和发展。

microRNA研究课件

microRNA研究课件

疫苗开发
microrna也可以应用于疫苗开发。通过向 细胞中导入特定microrna,可以调节免疫 反应,增强机体对病原体的抵抗力,从而 达到预防和治疗疾病的目的。例如,某些 microrna可以作为疫苗佐剂使用,增强机 体的免疫应答和疫苗效果。
05
研究microrna的方法学
基于生物化学的方法
调节细胞增殖和凋亡
microrna可以调节细胞增殖和凋亡 过程,影响肿瘤的发生和发展。
调节免疫应答
microrna可以调节免疫应答反应, 影响炎症和自身免疫性疾病的发生 和发展。
02
microrna的生物合成及调节机制
microrna的生物合成
细胞核内microrna的生物合成
microrna基因首先在细胞核内被转录成初级转录物(pri-miRNA),然后被核酸酶Drosha和其辅助因子 Pasha加工成约70个核苷酸长的pre-miRNA,最后在核酸酶Dicer的作用下剪切并修饰形成成熟的microrna。
分子克隆技术:用于microrna的 cDNA克隆和序列分析。
Northern印迹杂交:检测microrna在 mRNA水平上的表达。
细胞和组织中microrna的表达:通 过原位杂交和组织芯片技术观察。
基于分子生物学的方法
01
基因组学技术
02
报告基因法
分析microrna基因组的位置和结构。
研究microrna对靶基因的调控作用。
定义
microrna是一类非编码RNA分子,由21-25个核苷酸组成, 通过与靶mRNA结合调节基因表达。
特点
microrna在生物体内具有高度保守性和稳定性,参与多种生 物学过程,包括发育、细胞增殖、凋亡和免疫应答等。

miRNA研究方法

miRNA研究方法

miRNA研究方法miRNA(microRNA)是一类短链非编码RNA分子,长度约为18-25个核苷酸,参与调控基因表达和蛋白质合成。

miRNA具有高度保守性和多样性,在生物体内广泛存在,对生物体发育、细胞增殖、分化以及肿瘤发生等过程起着重要的调控作用。

为了研究miRNA的功能和表达模式,科学家们开发了多种实验方法。

本文将介绍miRNA研究的主要方法及其特点。

1. miRNA microarray分析miRNA microarray是一种高通量技术,可以同时检测几百至几千种miRNA的表达水平。

该方法通过在芯片上固定检测miRNA的探针,利用荧光标记技术或强化技术检测miRNA与探针的结合情况。

该方法具有高度灵敏性和特异性,适用于发现miRNA的变化模式以及筛选与特定生理和病理过程相关的miRNA。

2.实时定量PCR(qRT-PCR)分析qRT-PCR是一种常用的miRNA定量分析方法。

首先,使用逆转录酶将miRNA逆转录成cDNA,并使用特异性引物与miRNA结合。

然后,通过PCR 扩增获得足够的DNA产物。

该方法具有高度特异性和灵敏性,并且可以通过比较不同样本中miRNA的表达水平进行定量分析。

然而,qRT-PCR的局限性在于需要使用已知miRNA作为参考,并且只能检测已知的miRNA。

3.原位杂交分析原位杂交是一种检测miRNA在细胞和组织中空间和时间表达模式的方法。

该方法通过在miRNA与所用探针相互补的位置上标记放射性同位素或荧光染料,使其与miRNA结合,然后通过显微镜观察探针的绑定情况。

该方法不需要特殊的前期处理,可以直接观察miRNA的表达模式,但是对嵌入固定组织的适用性较弱。

4. NGS(Next-Generation Sequencing)分析NGS是一种高通量测序技术,可以快速、准确地对miRNA进行全序列分析。

通过将miRNA逆转录成cDNA,加入特定的适配体,并通过PCR扩增得到测序所需的文库。

如何使用生物大数据技术分析miRNA表达谱

如何使用生物大数据技术分析miRNA表达谱

如何使用生物大数据技术分析miRNA表达谱miRNA(microRNA)是一类短小非编码RNA分子,起调控基因表达的重要作用。

miRNA的表达谱分析在生物学研究中具有重要意义,可以帮助我们理解miRNA的功能,发现miRNA与疾病之间的关联,并为疾病的诊断和治疗提供新思路。

生物大数据技术为miRNA表达谱的分析提供了巨大的支持和便利。

本文将介绍如何使用生物大数据技术分析miRNA表达谱。

首先,获取miRNA表达谱数据。

miRNA表达谱数据可以通过多种方法获得,包括实验室测序技术、公共数据库下载等。

实验室测序技术包括高通量测序技术(如RNA-seq)和芯片技术(如miRNA芯片)。

公共数据库,如The Cancer Genome Atlas(TCGA)、Gene Expression Omnibus(GEO)等,收集了大量的miRNA表达谱数据。

根据具体研究需求,选择合适的数据来源并下载相应的数据。

接下来,对miRNA表达谱数据进行预处理。

预处理的目标是去除噪声和干扰,保证数据的质量。

首先,进行数据清洗,去除低质量的读数和低表达miRNA。

其次,进行归一化操作,使不同样本之间的数据可比。

常用的归一化方法包括总读数归一化、RPKM归一化等。

最后,进行差异分析,找出在不同样本之间表达差异显著的miRNA。

差异分析方法包括t检验、方差分析、Wald检验等,根据实际情况选择合适的方法。

然后,进行miRNA的功能注释分析。

miRNA的功能注释可以帮助我们了解miRNA在调控基因表达和信号通路中的具体作用。

常用的功能注释方法包括GO (Gene Ontology)富集分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。

GO富集分析可以通过对miRNA靶基因的功能分类,揭示miRNA在生物学过程、分子功能和细胞组成等方面的参与情况。

KEGG富集分析可以帮助我们了解miRNA调控的代谢途径、信号通路以及相关的疾病。

检mrna表达量得实验

检mrna表达量得实验

检mrna表达量得实验一、概观mirnamicrornas(mirnas)是一类非编码的小rna分子,通过与靶rna的3´utr互补或部分互补结合,使其降解或介导其翻译抑制,参与细胞增殖、凋亡、分化、代谢、发育、肿瘤转移等多种生物学过程。

mirnas及其衍生物在疾病诊断和治疗有很大的前景。

mirnas基因通常位于基因间或编码蛋白基因的内含子中,在核内由rna聚合酶ii或iii转录产生具有特征性茎环结构的pri-mirna,然后在drosha-dgcr8复合体的作用下,剪接成70nt的pre-mirna,它由exportin5由核内运到胞浆。

在胞浆内,pre-mirna在dicer酶作用下剪切成22bp 的成熟双链mirna,其中的一条链与risc结合而参与基因转录后水平的调控。

mirbase数据库第21版里列有来自223物种的28645茎环结构和35828成熟mirnas。

可能近90%的人类基因受到mirnas 调控,然而,当过表达或抑制某一个mirna时,在发生调变的众多基因当中寻找并鉴定其中起关键作用的靶基因仍然具有相当大的挑战。

目前鉴定mirna靶基因的常用策略是利用生物信息学软件预测,结合基因芯片分析以及生物学实验方法来研究mirna的功能及寻找其中起重要作用的靶基因。

此外,利用蛋白质质谱来寻找mirna靶基因也成为一种新的途径。

二、mirna的检测和定量为了验证mirna在组织细胞内的表达,目前常用来检测mirna 的技术主要有以下几种:northern杂交,原位杂交, stem-loop实时定量rt-pcr。

这三种技术各有利弊,可以相互结合应用,来反映细胞内mirna的真实表达水平。

northern杂交microrna是一类很小的分子,部分microrna表达水平可能很低,因而需要极为灵敏而定量的分析工具。

由于其分子很小,用rt-pcr的方法来定量研究有一定困难,特别是重复性较差,步骤繁琐等。

microrna生物学特征

microrna生物学特征

microrna生物学特征
MicroRNA(miRNA)是一组短小的、不编码蛋白质的RNA家族,广泛存在于真核生物中。

其生物学特征主要包括以下几个方面:
1. 长度短:一般含20\~24个碱基,在3'端有1\~2个碱基的差异。

2. 特异性:成熟的microRNA在5'端和3'端具有特殊结构,便于区分。

3. 同源性:均来自前体的一条臂。

4. 广泛性:在自然界广泛存在,从低等生物到人类都有其存在的痕迹。

5. 保守性:高度保守性,时序表达特异性和组织表达特异性,以及miRNA 独有的特征。

6. 功能特性:可以跟RISC结合,促进靶基因mRNA降解,或抑制其蛋白翻译,从而发挥其生物学作用。

更多信息可查阅关于miRNA的学术文献获取。

miRNA的研究方法

miRNA的研究方法

科研中的miRNA研究方法总结microRNA(miRNA)是一类长度在22nt左右的内源非编码小RNA,广泛存在于动物、植物、病毒等多种有机体中。

1993年,Lee等人在秀丽新小杆线虫中发现了控制着线虫时序性发育的lin-4。

2000年,Reinhart等发现了另一个具有转录后调节功能的小分子RNA:let-7。

随后的几年时间里,许多研究人员相继发现了这类RNA,并将这些具有时空表达特异性的非编码小分子RNA命名为microRNA(miRNA)。

从长的初级miRNA(pri-miRNA)到形成成熟的单链miRNA到与靶标RNA 结合,至少需要四步:首先是由核糖核酸酶ⅢDrosha和DGCR8组成的复合物将初始miRNA转录本(pri-miRNA)加工成miRNA前体(pre-miRNA);接着由转运蛋白Exportin-5和RanGTP酶将miRNA从细胞核转运到细胞质中;第三步是由另一种核糖核酸酶ⅢDrosha将miRNA前体剪切成成熟的miRNA双链,miRNA双链打开,其中一条进入到RNA诱导的沉默RISC复合体(RISC)中,该复合体还包含TarRNA结合蛋白(TRBP);最终RISC复合体根据miRNA与靶标RNA的互补配对,对靶基因进行剪切,或者翻译抑制。

图1miRNA生物学调控过程(摘自文献8)miRNA通过作用于相应靶mRNA,参与细胞增殖、凋亡、分化、代谢、发育、肿瘤转移等多种生物学过程。

预测超过1/3的人类基因都是保守的miRNA靶基因。

近些年,随着科学研究的进展,大量的miRNA已经被鉴定出来,截至目前发现的人的成熟的miRNA有2578条,小鼠的有1908条。

虽然miRNA的数量很多,但大多miRNA的功能并不为人所知。

因此,准确快速地预测并鉴定miRNA的靶基因,对研究miRNA的功能具有十分重要的意义。

下面本篇文章将着重介绍一下在医学科研领域中如何快速高效的鉴定与人类疾病相关的miRNA及其功能研究方法。

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miRNA 通过调节基因表达 参与调控细胞的众多生物学功能 如生 通过调节基因表达, 参与调控细胞的众多生物学功能, 物发育,脂肪代谢, 及细胞的分化,增殖和凋亡等.它们通过与靶mRNA 物发育,脂肪代谢 及细胞的分化,增殖和凋亡等.它们通过与靶 非翻译区( 互补, 剪切或是抑制其翻译. 的3' 非翻译区 3' - UTR) 互补 将mRNA 剪切或是抑制其翻译. 人类基因组中已发现300 多种 多种miRNA, 而且预测实际数目会更多 它们可能 而且预测实际数目会更多, 人类基因组中已发现 会对人类基因组中近30%的基因发挥调控作用.但关于 的基因发挥调控作用. 的表达模式, 会对人类基因组中近 的基因发挥调控作用 但关于miRNA 的表达模式,生 物学功能,作用机制等, 目前的认识还不很清楚.在此, 物学功能,作用机制等 目前的认识还不很清楚.在此 我们设计并制备了 miRNA 表达谱的寡核苷酸芯片 利用其快速,平行,高通量的检测特点 分析 表达谱的寡核苷酸芯片, 利用其快速,平行,高通量的检测特点, 种不同细胞系中206 个miRNA 的表达水平特点 为miRNA 的进一步研究奠 的表达水平特点, 了6 种不同细胞系中 定了基础. 定了基础.
1.4 芯片图像的采集与数据处理
采用ScanArrayTM Express1.0 ( Perkin Elmer) 扫描 采用 仪进行扫描, 扫描强度为100%, 光电倍增管增益为 光电倍增管增益为80%, 仪进行扫描 扫描强度为 扫描精度为10m.扫描所得图 扫描精度为 .扫描所得图ScanArray3.0( Perkin Elmer) 软件进行处理 得到杂交信号和与之相应背景的 软件进行处理, 平均强度值, 平均强度值 从杂交信号值中减去背景值得到校正信号强 度值. 种细胞检测所得数据经阳性对照均衡后比较. 度值.6 种细胞检测所得数据经阳性对照均衡后比较. 判断表达存在差异的标准是: 相互比较的miRNA 信号 判断表达存在差异的标准是 ①相互比较的 荧光强度值相差至少大于1 荧光强度值相差至少大于 000; ②若其中有信号强度值 小于100, 则同一种 则同一种miRNA 在不同细胞的荧光值差异需 小于 大于500.数据经总体归一化和对数转化后 大于 .数据经总体归一化和对数转化后, Cluster3.0( Stanford University) 进行聚类分析. 进行聚类分析.
的准备, 1.3 miRNA 的准备,标记与杂交
依mirVanaTM miRNA Isolation Kit(Ambion) 说明书提取肿瘤 细胞的富集miRNA.用Universal Microplate 细胞的富集 . Spectrophotometer(Bio- tek) 紫外分析仪测定 紫外分析仪测定miRNA 浓度和纯度 浓度和纯度, 8 mol /L 尿素变性的 尿素变性的15%聚丙烯酰胺凝胶检测质量.依 聚丙烯酰胺凝胶检测质量. 聚丙烯酰胺凝胶检测质量 mirVanaTMmiRNALabeling Kit(Ambion) 说明书对富集 说明书对富集miRNA 进 行荧光标记, 方法简单描述如下: 先在miRNA 末端添加 末端添加20- 50 个经 行荧光标记 方法简单描述如下 先在 过氨基修饰的核苷酸尾, 然后与带有N过氨基修饰的核苷酸尾 然后与带有 羟基琥珀酰亚胺酯类 (Nhydroxysuccinimidylester, NHS- ester) 的荧光染料 的荧光染料Cy3 (Amersham Biosciences)反应.标记后的样本与 ×miRNA 反应. 反应 标记后的样本与3× Hybridization Buffer(Ambion) 混合并将其均匀铺于 混合并将其均匀铺于miRNA 寡核 苷酸芯片表面, 小心加盖玻片封片, 置于密封湿润的杂交仓中, ℃ 苷酸芯片表面 小心加盖玻片封片 置于密封湿润的杂交仓中 42℃ 杂交16 .最后进行杂交后清洗. 杂交 h.最后进行杂交后清洗.
2 结果
2.1 miRNA 的抽提和纯化
6 种细胞系富集 种细胞系富集miRNA 的D260nm/D280nm 值均为 ~2.1, 值均为1.8~ 符合miRNA 芯片的检测要求. 芯片的检测要求. 符合
2.2 芯片杂交结果
标记,纯化后的 与芯片杂交, 用扫描仪在543 nm 通道处 标记,纯化后的miRNA 与芯片杂交 用扫描仪在 对芯片进行扫描, 得到图像, 软件分析miRNA在6 种 对芯片进行扫描 得到图像 用Scanarray3.0 软件分析 在 细胞中的表达水平.经比较发现, 细胞中的表达水平.经比较发现 91 个miRNA 在6 种细胞间没有明显 差异, 存在差异. 种细胞中校正信号强度/ 差异 115 个miRNA 存在差异.miR- 21 在6 种细胞中校正信号强度 背景强度均大于2 表达水平均较高;miR- 17- 5p 和miR- 20a 在6 背景强度均大于 倍, 表达水平均较高 种细胞中的表达情况相似, 细胞中校正信号强度/背景强度大于 种细胞中的表达情况相似 在ES- 2细胞中校正信号强度 背景强度大于 细胞中校正信号强度 10 倍, 表达较高 miR- 126与miR- 128a 和miR- 151, miR- 145 与 表达较高; 与 miR- 297- 1 在HeLa 和MCF- 7 细胞中的表达水平类似.见表 . 细胞中的表达扫描得到的杂交后图像用ScanArray3.0 软件进行 将扫描得到的杂交后图像用 处理, 所得数据经归一化和对数转换后, 处理 所得数据经归一化和对数转换后 用Cluster3.0 进行聚类分析.结果, 细胞miRNA 进行聚类分析.结果 MCF- 7 和HeLa 细胞 的表达谱聚为一类. 的表达谱聚为一类.
RT2.4 RT- PCR 检测
用特异性引物对miR- 17- 5p,miR- 21 前体进行扩增 前体进行扩增, 用特异性引物对 , 同时以U6 作为内参.各细胞中 作为内参.各细胞中miRNA 前体的表达水 同时以 平经内参校正后, 发现miR- 17- 5p 前体在K562 细胞 平经内参校正后 发现 前体在 中的表达水平最高, 细胞中的表达量次之; 中的表达水平最高 在ES- 2 细胞中的表达量次之 miR- 21 在6 种肿瘤细胞中的表达水 平均较高, 与芯片检测结果基本一致( 平均较高 与芯片检测结果基本一致 图1) .
实验中用荧光标记的miRNA 直接与 直接与miRNA 检测芯片杂交 检测发现 检测芯片杂交, 实验中用荧光标记的 6种细胞系有各自不同的 种细胞系有各自不同的miRNA 表达谱.实验检测到 表达谱.实验检测到miR- 21 在6 种肿瘤 种细胞系有各自不同的 细胞中的表达水平均较高,这与文献报道的 这与文献报道的miR- 21 在70%的肺癌和 的肺癌和70% 细胞中的表达水平均较高 这与文献报道的 的肺癌和 的结直肠癌患者中表达上调一致[6]. 也发现, 的结直肠癌患者中表达上调一致 .Iorio 等[7]也发现 miR- 21 在乳腺 也发现 癌中表达明显上调, 而且在一定程度上可以显示肿瘤的恶性程度. 癌中表达明显上调 而且在一定程度上可以显示肿瘤的恶性程度.miRNA 集簇存在是其一个显著特征, 我们检测到miR-17- 5p 与miR- 20a的表达 集簇存在是其一个显著特征 我们检测到 的表达 水平类似, 而也有文献报道miR- 17- 5p 与miR- 20a 及其他 种miRNA 成 及其他4 水平类似 而也有文献报道 集簇存在于人类第13 号染色体上[8].O'Donnell等[9]通过染色质免疫沉 集簇存在于人类第13 号染色体上[8].O'Donnell等[9]通过染色质免疫沉 淀实验, 发现c-Myc 可直接与 可直接与miR- 17- 5p集簇位点结合 激活其表达 提 集簇位点结合, 淀实验 发现 集簇位点结合 激活其表达, 示这一miRNA 的表达可能和肿瘤的发生存在某种关联.MCF- 7 和HeLa 的表达可能和肿瘤的发生存在某种关联. 示这一 分别来源于人类乳腺和宫颈, 它们发育起源类似, 共同起源于胚胎内胚层. 分别来源于人类乳腺和宫颈 它们发育起源类似 共同起源于胚胎内胚层. 我们检测到MCF- 7 和HeLa 细胞 细胞miRNA 的表达谱聚为一类.提示在哺乳 的表达谱聚为一类. 我们检测到 动物体内特殊的miRNA 有可能参与维持胚胎早期发生过程中的多潜能细 动物体内特殊的 胞状态[10], 在器官和组织的发育,形成中发挥重要调控作用. 在器官和组织的发育,形成中发挥重要调控作用. 胞状态
生物芯片检测细胞中microRNA 的表达
MicroRNA Expression in Cells Detected by Oligonucleotide Microarray
07生技 生技1 生技
microRNA(miRNA) 是一类在线虫,植物,昆虫和哺乳动物中存在的 是一类在线虫,植物, 分子, 长度为18- 26 个核苷酸 nt) 的小非编码 个核苷酸( 的小非编码RNA,类似于 小RNA 分子 长度为 ,类似于siRNA 的分子 .
1 材料和方法
1.1 材料
实验所用6 种人类肿瘤细胞系均为本实验室保存, 分别HeLa( 人 实验所用 种人类肿瘤细胞系均为本实验室保存 分别 宫颈癌上皮细胞) 人慢性髓细胞性白血病细胞) 宫颈癌上皮细胞 ,K562( 人慢性髓细胞性白血病细胞 ,ES- 2( 人 卵巢透明细胞癌) 人乳腺癌细胞) 卵巢透明细胞癌 ,MCF- 7( 人乳腺癌细胞 ,HT- 29( 人结肠腺癌 细胞) 细胞( 人肺腺癌细胞) 所有细胞系均在5% CO2 条 细胞 和A549 细胞 人肺腺癌细胞 .所有细胞系均在 件下, 用含有10%胎牛血清的适合培养基培养. 件下 用含有 胎牛血清的适合培养基培养. 胎牛血清的适合培养基培养
图 一
3 讨论
microRNA 是一类在线虫,植物,昆虫和哺乳动物中存在的小 是一类在线虫,植物, RNA 分子 它们通过与靶 分子, 它们通过与靶mRNA 的3' 非翻译区 3' - UTR) 互补 将 非翻译区( 互补, mRNA 剪切或是抑制其翻译.已很明确 miRNA 在调控基因表达过程 剪切或是抑制其翻译.已很明确, 中发挥非常重要的作用, 而理解miRNA 在生物体内如何发挥作用的关 中发挥非常重要的作用 而理解 键是要知道miRNA 的表达模式.但是因为 的表达模式.但是因为miRNA 的长度非常短 只 的长度非常短( 键是要知道 检测miRNA 的方法受到很大的限制. 有18- 26 nt) , 检测miRNA 的方法受到很大的限制.我们利用生物芯 片的高通量,高敏感性的特点, 为在组织和细胞中检测多种miRNA 提 片的高通量,高敏感性的特点 为在组织和细胞中检测多种 供了理想的手段. 供了理想的手段.
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