Whonet的应用操作现用图解
whonet 使用手册 (中文版)说明书
WHONET使用手册全球抗微生物药物耐药性监测系统John Stelling布莱根妇女医院世卫组织抗微生物药物耐药性监测合作中心马萨诸塞州波士顿2016年11月缩略语AMR 抗微生物药物耐药性CLSI 临床和实验室标准协会EUCAST 欧洲药敏试验委员会GLASS 全球抗微生物药物耐药性监测系统ID 识别码MIC 最小抑菌浓度WHO 世界卫生组织目录1.序言 (1)2.安装WHONET (2)3.实验室配置 (3)3.1创建新的实验室配置 (3)3.2复制现有实验室配置 (6)3.3修改实验室配置 (7)4. 用于全球耐药监测系统的WHONET数据输入 (8)4.1 通用 (8)4.2 全球耐药监测系统最低配置下各数据域填写说明 (9)4.3查看数据库 (13)5. 国家层面的数据收集 (13)6. 将WHONET 文件导出为全球耐药监测系统交换格式 (14)6.1 合并WHONET文件 (14)6.2汇总WHONET文件 (15)6.3WHONET在全球耐药监测系统交换格式中排除“重复分离株”的规则 (18)7. 全球耐药监测系统数据检查和反馈报告 (19)8. 将全球耐药监测系统格式的数据文件上传到全球耐药监测系统信息技术平台 (21)附件1 – 修改实验室配置 (22)1.一般实验室信息 (22)2.抗生素 (23)3.抗生素断点 (24)4.地点 (27)5.修改数据域配置 (27)附件2 – BacLink简介 (28)1.序言本手册主要为各国全球抗微生物药物耐药性监测系统（GLASS，以下简称“全球耐药监测系统”）数据管理员撰写，也可供为参加该系统的监测点服务的实验室数据管理员使用。
手册描述在为全球耐药监测系统处理数据时如何使用WHONET软件。
WHONET支持将数据输出为全球耐药监测系统交换格式，以便上传到该系统的信息技术平台。
本手册并非描述WHONET全部功能和特征的完整使用手册。
WHONET使用
WHONET系统的应用－散点图
WHONET系统的应用－散点图
WHONET系统的应用－散点图
耐药分析组合
耐药分析组合反映了某一特殊克隆菌 群的一组固有的及获得性染色体与质 粒介导的耐药基因
耐药分析组合可用于定义细菌亚群
感染控制人员可利用耐药分析组合对 某一细菌的耐药机制特征进行进一步 的研究
定义新的实验室
实验室设置－抗生素
抗生素判定标准更新
出现的警示
抗生素判定标准更新
抗生素判定标准更新
抗生素顺序调整
抗生素组合设置
抗生素分析组合设定
方法学选择
病区设置
病区设置
数据段设置
数据段设置
数 据 输 入
数据输入－创建新的数据文件
WHONET数据文件
以dBASE格式保存，其内容由实验室设置所决定
阳性/革兰阴性菌、厌氧菌、分枝杆
菌、真菌、寄生虫等）。
5. 特定菌株组的设定：
可根据要求将种属相近或耐药
机制相同的几种菌种合并为一组
（作为一种菌株）进行分析，使统 计分析更能够突出主题、反映问题。
6．数据库的建立：
可同时建立多个数据库（如全国 的、地分别或联合统计分析，
主要内容
WHONET系统的安装
WHONET系统主要功能介绍 WHONET系统的应用
WHONET系统的安装
从中国抗感染化疗杂志网站下载 阳光检验网论坛： /bbs CD－Rom光盘安装 按标准程序进行安装 软盘安装 第一张软盘安装结束后，插入下一张软盘。
对泰能耐药对舒普深敏感的革兰阴性杆菌
代码 pma pae fme aba pme axy pce fin
WHONET的基本使用
• WHONET的使用是方便、简单的。但是 如何更有效的使用WHONET、能从中更 好的获取你所需要的信息，还完全依赖 于你自己微生物以及抗生素的知识。
由患者分离的每种抗生素最耐药 （敏感）的结果
• 考虑所有的菌株，对每一患者的每一抗 生素进行单独分析，计算耐药率时，只 应用最耐药（敏感）的结果
由患者－选每一抗生素解释的 结果
对每一抗生素、每一患者分离的菌的解释 （RIS）计数一次，若患者分离出的对某一
抗生素耐药（敏感）的菌株，即对患者 计数耐药（敏感）一次。这样能导致（R ＋I＋S）％ >100％，若超过100％则表 明耐药结果混杂或不一致的患者百分比。
输入数据
操
样
作
本
按
信
钮
息
样
本
结
果
提示信息
数据输入注意点
• 1、所有信息均具有可选择性（不需必须输入） • 2、日期格式：dd/mm/yy dd-mm-yy 等 • 3、质控菌株的输入：
Ⅰ、在病例号中输入菌株名如:ATCC 22922 系统会自动将标本种类改为“qc”。
II、若系统无法认识上标准菌株，可将标本种类改为 “qc”
• 对OPGV耐药组合的金葡菌的分析（OX、 GEN、PEN、VAN）
耐药分析组合
从敏感到多重耐药排列
有字母＝耐药或中敏 空格＝敏感 －＝未做实验
BacTrack分析
• BacTrack分析的作用是创建有统计学意 义的不常见的细菌表型、不常见的抗生 素、不常见的耐药组合的bactrack文件， 来监视你下次输入这些不常见的结果时， 有所提示。从而可以发现此次实验是否 存在误差，或提示如新的耐药机制的出 现。
Whonet的应用操作图解.pdf
Whonet的应用操作图解Whonet是微生物实验室经常使用的统计分析软件，且此软件中含有相应耐药规则分析系统，并进行某种或某类细菌在一段时间耐药趋势分析。
具体操作步骤如下：鼠标选择Whonet软件，双击打开软件；打开Whonet软件后，点击“select language”选择中文界面（若己为中文界面，此步骤则省去）。
选择“Chinese Simplified”再点击“OK”即可。
实验室的设置：如初次安装使用Whonet软件，首先应新建实验室，如实验室己设置，此步骤可省去。
鼠标选择“新建实验室”双击，并在填入“国家”“实验室名称”“实验室代码”。
然后点“打存”。
医院设置好后，可选择所需医院，点击“修改实验室”进行具体参数设定。
如选择“抗生素”的设定，则双击“抗生素”，若设置“科室”则双击“科室设置”。
根据本实验室实际，先选择药敏实验方法（如：纸片法、MIC法、Etest法，实验方法每次设定只可选择其一种，选择一种实验方法后，可选择多个抗生素），再选择需要的抗生素，点击“→”全部选择完成后，点击“确定”，然后根据提示保存修改。
若实验室开展了多种方法药敏实验，可根据重新设定其它实验方法所用的药物名称，设定步骤相同。
科室的设置：双击“科室设置”后，出现以下界面，根据医院实际进行设置。
数据库的设定（若己设定，此步可省去）：打开Whonet软件，选择医院，点击打开实验室。
点击“数据输入”，选择“新数据文件”双击。
根据所需对数据文件名进行命名，可按月、季度或年来命名，如以月命名，每月开始都要重新设定，一般情况下，按季度设定，这样按季度存储数据，抗生素耐药趋势分析是按季度分析，如每月都要进行抗生素耐药趋势分析，如按月设定。
然后点“确定”。
具体信息输入：首先打开Whonet软件，选择医院，打开实验室。
然后点击数据件，再选择“打开数据文件”点击。
打开后，在“文件类型”一栏，选择“所有文件”，然后再从显示的文件夹中，选择本院准备存储文件夹，点击“打开”。
Whonet5统计分析篇
1.数据加密：首先打开Whonet5.5软件，为保护患者隐私，我们对患者资料进行加密，在“数据输入”下选择“将病人的情况加密”，出现下图：点击“浏览”选择需要加密的数据，输入密语，点击“转换”至出现下图：数据加密成功，我们可以打开该数据文件，浏览数据库看看，下图为经过加密后的数据。
病历号、标标编号、实验编号和患者姓名都加密了。
2.科室分布统计：首先打开Whonet5.5软件，点击“数据分析”下的“数据分析”，出现下图：点击“分析类型”出现下图：在上图中行选择“科室”，列选择“检验结果”后点击“确定”，然后在细菌中选择“细菌组”，双击“所有细菌”并“确定”。
然后选择“数据文件”，如下图，若未找到想要的数据文件，可在文件类型下，选择：“所有文件”，选择所要分析的数据文件至右边，也可以多个文件一同分析。
当所有设置选择完后，点击下图“开始分析”出现下图，此为第一阶段的分析表（即详细表格），若有必要可点击左上角的“复制表格”至电子表格中粘贴即可。
然后点击“继续”分析出第二阶段统计表，如下图：若要统计表按病人数量或百分比等从大到小排列，只需要相应列处点击一下即可，如下图为按“病人数量”多少排列。
下图为ICU病房菌株分布柱状图：点击左上角的“复制表格”至电子表格中粘贴即可对此表进行统计分析处理，见下图：3.标本类型统计：依然按上面所述，打开WHONET5软件，打开自己的实验室，点击“数据分析”→分析类型，然后按下图所示选择，当然也可按自己的思路去做的。
选择完毕后点击确定，然后按下图所示选择：点击开始分析，即出现下图：这为详细列表，可以复制和打印，完后点继续即继续分析出第二阶段统计表，见下图：在上图的“文件”选项下有很多选项，你可以在这儿选择复制、打印及调整图形选项美化图形等操作：下面为图形选项调整截图：下图为调整后效果图：下图为保存表格选项：下面为保存后的柱状图：还可能根据需要进行分类：最后设置完毕，可点击“复制表格”等操作将表格复制到电子表格中编辑。
Whonet的应用操作图解
Whonet的应用操作图解Whonet就是微生物实验室经常使用的统计分析软件,且此软件中含有相应耐药规则分析系统,并进行某种或某类细菌在一段时间耐药趋势分析。
具体操作步骤如下:鼠标选择Whonet软件,双击打开软件;打开Whonet软件后,点击“select language”选择中文界面(若己为中文界面,此步骤则省去)。
选择“Chinese Simplified”再点击“OK”即可。
实验室的设置:如初次安装使用Whonet软件,首先应新建实验室,如实验室己设置,此步骤可省去。
鼠标选择“新建实验室”双击,并在填入“国家”“实验室名称”“实验室代码”。
然后点“打存”。
医院设置好后,可选择所需医院,点击“修改实验室”进行具体参数设定。
如选择“抗生素”的设定,则双击“抗生素”,若设置“科室”则双击“科室设置”。
根据本实验室实际,先选择药敏实验方法(如:纸片法、MIC法、Etest法,实验方法每次设定只可选择其一种,选择一种实验方法后,可选择多个抗生素),再选择需要的抗生素,点击“→”全部选择完成后,点击“确定”,然后根据提示保存修改。
若实验室开展了多种方法药敏实验,可根据重新设定其它实验方法所用的药物名称,设定步骤相同。
科室的设置:双击“科室设置”后,出现以下界面,根据医院实际进行设置。
数据库的设定(若己设定,此步可省去):打开Whonet软件,选择医院,点击打开实验室。
点击“数据输入”,选择“新数据文件”双击。
根据所需对数据文件名进行命名,可按月、季度或年来命名,如以月命名,每月开始都要重新设定,一般情况下,按季度设定,这样按季度存储数据,抗生素耐药趋势分析就是按季度分析,如每月都要进行抗生素耐药趋势分析,如按月设定。
然后点“确定”。
具体信息输入:首先打开Whonet软件,选择医院,打开实验室。
然后点击数据件,再选择“打开数据文件”点击。
打开后,在“文件类型”一栏,选择“所有文件”,然后再从显示的文件夹中,选择本院准备存储文件夹,点击“打开”。
WHONET简介及用法
细菌耐药性监测数据处理软件WHONET 5.3简介随着计算机技术的进步，药物敏感试验结果的收集，保存和处理也越来越多地依赖于计算机软件。
WHONET软件就是这样一种软件，它能将各个实验室的数据文件采用通用的编码和文件格式，有利于各临床实验室分析、监控和处理当地的耐药性监测资料并把这些信息整合到全国或者全球的耐药性监测数据文件中，促进资源的共享，这是目前世界卫生组织推荐用于细菌耐药性监测的软件，能够满足美国临床实验室标准化委员会制定有关软件的要求。
目前软件的最新版本是WHONET 5.3版本，注册用户可以从世界卫生组织细菌耐药性监测中心能够免费下载WHONET 5.3版本的软件，下载地址是：ftp：/ftp.who.int/cds/csreph。
国家细菌耐药性监测中心在自己的网站上也提供免费下载，地址是：，为了方便细菌检验工作者以及其他专业人员的应用，同时本中心还可以为监测网点单位提供邮寄光盘服务。
由于WHONET 5.1所占用的空间是9.2Mb, WHONET 5.3的大小是9.38Mb，软件太大下载耗时较长，并且现在网络上病毒泛滥，网络通信端口存在限制，有时下载并不方便。
由于采用的是NCCLS 的标准，受到知识产权保护的影响，所以判定标准更新肯定会迟于最新标准的发行时间，用户应当在实际应用之前加以适当的修正；现在该软件虽然可以免费下载，但是仍然不能做到在线升级；同时由于软件没有引入细菌药敏试验的专家系统，结果的判定和报告的发出还要依赖于临床微生物室工作人员对结果进行人工处理；这些都是需要软件工程师以后解决的问题。
软件的设计应当便于用户的应用，所以软件经历了从DOS版到WINDOWNS版的改进，从单一英文界面到现在可以使用多种语言界面，包括中文，出现WINDOWNS 版本的不断升级，每一次改进都给用户带来了很大的方便。
由于这两个版本在实际工作中应用较多，本文对两个版本的主要差别进行总结，并对新版本的优势加以详细介绍以便于操作者应用。
whonet 分析汇总
WHONET 数据分析教程汇总1.数据分析：简介2.数据分析：分析类型及选项3.数据分析：每个病人1份结果4.数据分析：细菌5.数据分析：菌株6.数据分析：数据库文件7.数据分析：输出数据分析：简介本教程用于WHONET5.6的数据分析：简介1. WHONET分析目前，可应用WHONET进行的分析分为如下7组：菌株列表和总结表耐药、中敏、敏感率和检测结果多文件敏感率和频率分布散点图耐药谱BacTrack –菌株提示语组提示语上述每一组分析将在下面相应章节中详细描述。
2. 数据分析界面打开WHONET主界面，依次单击数据分析菜单及数据分析子菜单，则打开数据分析界面，如图：该界面可分为5部分：分析类型（详见《数据分析：分析类型及选项》）选项（详见《数据分析：分析类型及选项》）每个病人（详见《数据分析：每个病人1份结果》）细菌（详见《数据分析：细菌》）菌株（详见《数据分析：菌株》）数据文件（详见《数据分析：数据库文件》）输出到（目的地）（详见《数据分析：输出》）3. 分析步骤一旦决定要输出分析结果时，则必须指明对上述各部分析要求。
某些部分的默认设置可能会满足要求。
但是，仍建议检查所有设置。
这将在下面各章节中，对分析步骤加以描述。
单击“开始分析”按钮开始分析过程。
若已选择输出到屏幕显示，则可能要打印或保存屏幕显示结果。
若要进行更多的输出或返回数据分析界面，则单击继续按钮。
单击“停止分析”按钮，可中断分析。
完成全部所需分析后，单击“退出”按钮，返回WHONET主界面。
4. 应用其它软件分析WHONET数据文件WHONET数据保存于dBASE格式文件。
与其它数据库结构相比，尽管dBASE有许多缺点。
但其优点为：与目前应用的分析工具兼容性更强。
因此，即使要求用WHONET以外的软件分析WHONET数据，也可有广泛的选择。
1. 分析选项界面打开数据分析界面，单击“分析类型”按钮，打开分析选择界面，如图：该界面分为3部分：分析类型报告格式抗生素选择的分析类型不同，报告格式及抗生素部分的选项也将随之发生变化。
Whonet的应用操作图解
Whonet的应用操作图解Whonet是微生物实验室经常使用的统计分析软件;且此软件中含有相应耐药规则分析系统;并进行某种或某类细菌在一段时间耐药趋势分析..具体操作步骤如下：鼠标选择Whonet软件;双击打开软件；打开Whonet软件后;点击“select language”选择中文界面若己为中文界面;此步骤则省去..选择“Chinese Simplified”再点击“OK”即可..实验室的设置：如初次安装使用Whonet软件;首先应新建实验室;如实验室己设置;此步骤可省去..鼠标选择“新建实验室”双击;并在填入“国家”“实验室名称”“实验室代码”..然后点“打存”..医院设置好后;可选择所需医院;点击“修改实验室”进行具体参数设定..如选择“抗生素”的设定;则双击“抗生素”;若设置“科室”则双击“科室设置”..根据本实验室实际;先选择药敏实验方法如：纸片法、MIC法、Etest法;实验方法每次设定只可选择其一种;选择一种实验方法后;可选择多个抗生素;再选择需要的抗生素;点击“→”全部选择完成后;点击“确定”;然后根据提示保存修改..若实验室开展了多种方法药敏实验;可根据重新设定其它实验方法所用的药物名称;设定步骤相同..科室的设置：双击“科室设置”后;出现以下界面;根据医院实际进行设置..数据库的设定若己设定;此步可省去：打开Whonet软件;选择医院;点击打开实验室.. 点击“数据输入”;选择“新数据文件”双击..根据所需对数据文件名进行命名;可按月、季度或年来命名;如以月命名;每月开始都要重新设定;一般情况下;按季度设定;这样按季度存储数据;抗生素耐药趋势分析是按季度分析;如每月都要进行抗生素耐药趋势分析;如按月设定..然后点“确定”..具体信息输入：首先打开Whonet软件;选择医院;打开实验室..然后点击数据件;再选择“打开数据文件”点击..打开后;在“文件类型”一栏;选择“所有文件”;然后再从显示的文件夹中;选择本院准备存储文件夹;点击“打开”..根据患者报告的实际情况;将患者信息;检测出的细菌及药敏输入;然后点击“菌株保存菌株”;并根据Whonet软件提示;确定是否保存..耐药分析：打开软件;选择医院;打开实验室..选择“数据分析”点击;再点击下面一栏的“数据分析”再点击下图中的“分析类型”选择分析类型;点确定.. 再点击“细菌”..选择细菌组或具体某一种细菌;点击“→”若选择的为细菌组;需点击右下角的“作为一种细菌分析”;然后“确定”..选择需要分析的文件夹;点击“→”;再点击“每个文件分别分析”;然后“确定”..点击“开始分析”..直接从下图中读取某种类细菌的耐药情况..选择“文件”;点击“停止分析”退出..。
whonet5.6使用说明
• 数据文件的命名
– 标准样式为：年+W+月+国家代码+实验室代码
• 如14W05CHN.gsy为甘肃省人民医院14年5月的数据
– 13W01CHN.GSY – 12W02CHN. GSY
13W05CHN. GSY
合适的文件格式
12W06CHN. GSY
13W09CHN. GSY 12W10CHN. GSY
提示语设置
13
14
药敏组合的作用：输入药敏结果时，快速定位
15
无细菌时的界面 包含所有抗菌药物
输入细菌时的界面 只显示“药敏组合”选择的抗菌药物
16
专家系统的应用
数据输入注意点
• 所有信息均具有可选择性（不需必须输入）
• 日期格式：一定要按日期格式输入，否则将影响统计
– 日/月/年 日-月-年
– W0398CHN. GSY W0798CHN. GSY – W0498CHN. GSY 不W合0适89的8C文HN件.格G式SY
W1198CHN. GSY W1298CHN. GSY
• 数据文件可以用EXCEL软件打开、编辑并保存！
合并数据库
可将多个数据文件合并为单个大的数据文件
14W01chn.gsy 14W02chn.gsy 14W03chn.gsy 14W04chn.gsy 14W05chn.gsy 14W06chn.gsy
– 自定义代码 – 汉化细菌名称、标本种类等 – 导入其它数据文件，可避免重复输入 – 无缝连接Microsoft Office软件
6
WHONET系统的安装
• 程序获取（最广泛的用途） –世界卫生组织网站. • http://www.who.int/drugresistance/whonetsof tware/en/ –WHONET中文官方网 • /index.html –微生物之家论坛 –中国感染与化疗杂志网站 •
whonet5.6使用说明
• 字段最低校验通过率：代表一个字段中所填写全部值的最低 正确率。比如：某字段的最低校验通过率要求达到90%，当 此字段填写了100个值，那么这100个值中至少要填对90个， 这个字段才可以通过校验，否则该字段就无法通过校验，直 接导致整个数据文件无法上报成功。
• 高质量记录：就是一条记录中，所有字段填写的值均是正确 的值，没有产生任何警告信息或者错误信息。
– 微软 IE7 浏览器
– 微软 IE8 浏览器
• 不支持使用低版本IE内核览器
• 360极速浏览器（最新版）
• 微软IE11浏
– 猎豹安全浏览器 – 世界之窗浏览器 – 搜狗浏览器 – QQ 浏览器
注意：资料备份！
全国耐药监测网新版系统的使用说明
• 新版系统的简介 • 如何上传高质量的数据
软件版本划分
重点
60
系统形式
• 使用主流最新版浏览器直接登录无须完装 任何软件
61
系统软硬件要求
• 计算机必须连接互联网（Internet） • 网速至少达到2M（推荐4M）
• 使用兼容性较好的最新版浏览器
系统浏览器要求
• 火狐浏览器【Firefox】（ 最新版）
• 谷歌浏览器【Chrome】（ 最新版）
• 不支持低内核版本的IE浏 览器：
– 微软 IE6 浏览器，即 Windows XP 操作系统自带 的浏览器
• 苹果浏览器【Safari】（最 新版）
• Opera浏览器（最新版） • 遨游浏览器（最新版）
提示语设置
13
14
药敏组合的作用：输入药敏结果时，快速定位
15
无细菌时的界面 包含所有抗菌药物
输入细菌时的界面 只显示“药敏组合”选择的抗菌药物
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Whonet的应用操作图解
Whonet是微生物实验室经常使用的统计分析软件，且此软件中含有相应耐药规则分析系统，并进行某种或某类细菌在一段时间耐药趋势分析。
具体操作步骤如下：
鼠标选择Whonet软件，双击打开软件；
打开Whonet软件后，点击“select language”选择中文界面（若己为中文界面，此步骤则省去）。
选择“Chinese Simplified”再点击“OK”即可。
实验室的设置：
如初次安装使用Whonet软件，首先应新建实验室，如实验室己设置，此步骤可省去。
鼠标选择“新建实验室”双击，并在填入“国家”“实验室名称”“实验室代码”。
然后点“打存”。
医院设置好后，可选择所需医院，点击“修改实验室”进行具体参数设定。
如选择“抗生素”的设定，则双击“抗生素”，若设置“科室”则双击“科室设置”。
根据本实验室实际，先选择药敏实验方法（如：纸片法、MIC法、Etest法，实验方法每次设定只可选择其一种，选择一种实验方法后，可选择多个抗生素），再选择需要的抗生素，点击“→”全部选择完成后，点击“确定”，然后根据提示保存修改。
若实验室开展了多种方法药敏实验，可根据重新设定其它实验方法所用的药物名称，设定步骤相同。
科室的设置：双击“科室设置”后，出现以下界面，根据医院实际进行设置。
数据库的设定（若己设定，此步可省去）：打开Whonet软件，选择医院，点击打开实验室。
点击“数据输入”，选择“新数据文件”双击。
根据所需对数据文件名进行命名，可按月、季度或年来命名，如以月命名，每月开始都要重新设定，一般情况下，按季度设定，这样按季度存储数据，抗生素耐药趋势分析是按季度分析，如每月都要进行抗生素耐药趋势分析，如按月设定。
然后点“确定”。
具体信息输入：首先打开Whonet软件，选择医院，打开实验室。
然后点击数据件，再选择“打开数据文件”点击。
打开后，在“文件类型”一栏，选择“所有文件”，然后再从显示的文件夹中，选择本院准备存储文件夹，点击“打开”。
根据患者报告的实际情况，将患者信息，检测出的细菌及药敏输入，然后点击“菌株保存菌株”，并根据Whonet软件提示，确定是否保存。
耐药分析：打开软件，选择医院，打开实验室。
选择“数据分析”点击，再点击下面一栏的“数据分析”
再点击下图中的“分析类型”
选择分析类型，点确定。
再点击“细菌”。
选择细菌组或具体某一种细菌，点击“→”若选择的为细菌组，需点击右下角的“作为一种细菌分析”，然后“确定”。
选择需要分析的文件夹，点击“→”，再点击“每个文件分别分析”，然后“确定”。
点击“开始分析”。
直接从下图中读取某种（类）细菌的耐药情况。
选择“文件”，点击“停止分析”退出。