MicroRNA与动物病毒性疾病研究进展
microrna研究思路
microrna研究思路引言：随着生物技术的发展，人们对于微小RNA（microRNA）的研究越来越深入。
微小RNA是一类非编码RNA分子，具有调控基因表达的重要功能。
本文将介绍微小RNA研究的思路和方法，以期更好地理解其在生物学中的作用。
一、鉴定与筛选微小RNA：鉴定和筛选微小RNA是研究的第一步。
目前，常用的方法有基于高通量测序的全基因组鉴定以及生物信息学分析。
首先，通过提取RNA样本，利用高通量测序技术获得大量的RNA序列信息。
然后，利用生物信息学分析工具对测序数据进行处理和比对，筛选出具有典型微小RNA特征的序列。
二、微小RNA的功能研究：微小RNA的功能研究是微小RNA研究的重点之一。
通过实验室内外的功能研究，可以揭示微小RNA在基因调控中的具体作用机制。
常用的研究方法有：靶标预测、基因敲除、转染和转基因动物模型等。
首先，通过生物信息学方法预测出微小RNA的靶标基因。
然后，利用基因敲除技术或转染技术使微小RNA的表达发生变化，观察靶标基因的表达水平变化。
最后，利用转基因动物模型验证微小RNA对于生物体内的调控作用。
三、微小RNA与疾病的关联研究：微小RNA在多种疾病中发挥重要的调控作用，因此，研究微小RNA与疾病的关联关系对于疾病的诊断和治疗具有重要意义。
常用的研究方法有：疾病相关基因的筛选、微小RNA表达谱的分析以及功能研究等。
首先，通过大量的临床样本和生物信息学分析，筛选出与疾病相关的基因。
然后，通过微小RNA表达谱的分析，寻找与疾病相关的微小RNA。
最后，通过功能研究，揭示微小RNA 在疾病发生发展中的作用机制。
四、微小RNA的应用前景：微小RNA的研究不仅可以增进对基因调控的理解，还具有广泛的应用前景。
微小RNA可以作为潜在的生物标志物用于疾病的早期诊断和预后评估。
此外，微小RNA还可以作为潜在的治疗靶点，通过调控微小RNA的表达来治疗相关疾病。
目前，已经有一些微小RNA药物进入了临床试验阶段。
microRNA及其应用研究进展
１９ ９ ３年 ， ｅ Ｌ ｅ等 首 先 在 秀 丽 新 小 杆 线 虫 （ ａ ｎｒａｄｔ ｌ ａ ｓ 中发 现 了第一 个可 时序 调 Ｃ ｅ ｏ ｂ ｉｓｅｅ ｎ ） ｈ ｉ ｇ 控 胚胎 后期 发育 的基 因 ｌ 一 ｌ７年 之 后 ， ｅｎ ａｔ ｉ ４ｉ ｎ ｌ ， Ｒ ｉｈ ｒ 等 又 在 同类 线 虫 中发 现 了第 二 个 异 时 性 开 关 基 因
【 键 词 ］ ｍ ｃｏ Ｎ 基 因表 达 ； 关 ｉｒＲ Ａ； 干细 胞 ； 疫 ； 病 免 疾
［ 中图分类号 ］ Ｑ ４ ７
［ 文献标识码 ］ Ａ
［ 文章编号］ １０ — ０ ２２ １）１０ ９ — ６ ０ ９ ０ ０ （０ １ — ０ ８ ０ ０
ｍ ｉｒ ＲＮＡ ｎｄ Ｒｅ ｅ Ａｄｖ ｎｃ ｓ ｉ Ａｐ ｉａ ｉ ｎｓ ｃｏ ａ ｃ ｎｔ ａ ｅ ｎ ｐｌｃ ｔｏ
ｐ ｏ ｅ ｓ ｉ ｈ ｅ ｅ ｒ ｈ ｏ ｈ ｕ ｃｉｎ ｏ ｃ ｏ ＮＡ ｒ ｕ ｒｇ ｓ ｎ ｔ ｅ ｒ ｓ ａ ｃ ｎ ｔ ｅ ｆ ｎ ｔ ｆ ｍｉ ｒ Ｒ ｒ ｏ ｗｅ ｅ ｓ ｍｍａ ｚ ｄ ｉ ｒｅ ．
［ ｙ ｗｏ ｄ ］ ｍｉ ｏ Ｎ ｇ ｎ ｘ ｒｓｉ ； ｔｍ ｃｌ ｍ ｕ ｉ ； ｉ ａｅ Ｋｅ ｒ ｓ ｃ Ｒ Ａ； ｅ ｅ ｅ ｐｅｓ ｎ ｓ ｅ ；ｉ ｍ ｎ ｙ ｄｓ ｓ ｒ ｏ ｅ ｌ ｔ ｅ
［ ｓ ａｔ ｍｉ ｏ Ｎ ｍ Ｒ Ａ ｒ ｎ ｏｅｏ ｓｎｎ ｐｏ ｉ－ｏ ｉｇ Ｒ Ａ ｏ ｐ ｒｘ ａｅ ２ ｎ ｃ ｏ ｄｓ ｈｕ Ａｂｔ ｃ】 ｒ ｃ Ｒ Ａ（ｉＮ １ａｅ ｅ ｄｇｎｕ ｏ － ｒ ｅ ｃｄｎ Ｎ ｆａｐｏｉ ｔｌ ２ ｕｌ ｔ ｅ．Ｔ ｏ— ｒ ｔｎ ｍ ｙ ｅｉ
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生
siRNA和microRNA用于抗病毒的研究进展
DOI: 10.3969/j.issn.1673-713X.2021.01.009·综述·siRNA和microRNA用于抗病毒的研究进展孙博，林嘉杰，王树松，孙绍光1999 年，Hamilton 和Baulcombe[1]首次提出了小干扰RNA（small interfering RNA，siRNA）的概念，发现植物中自然发生的siRNA 能引起转录后的基因沉默现象。
2001 年，Elbashir 等[2]发现合成的siRNA 能够引起不同哺乳动物细胞系的基因沉默现象。
这一发现表明，通过合成siRNA 能够引发可控的基因沉默现象，甚至有可能作为基因特异性治疗剂。
近年来，通过siRNA 来沉默病毒复制关键基因的表达，已成为抗病毒感染研究的热点。
1993 年，Lee 等[3]在秀丽隐杆线虫中首次发现了微RNA（microRNA，miRNA）。
该线虫中lin-4 基因的两种小转录物（分别为22 和61 nt）能与lin-14 mRNA 的3'-UTR 发生碱基互补配对，从而抑制lin-14 mRNA 的翻译。
2000 年，Pasquinelli 等[4]发现了第二种miRNA——let-7，同时发现let-7 在不同物种中高度保守。
这促使大量研究人员投入到miRNA 的研究中。
随着研究的不断深入，发现miRNA 水平的紊乱与多种疾病的发生有关[5-6]。
需要特别指出的是，miRNA 在病毒感染过程中发挥重要作用。
有研究表明，miRNA 既能抑制病毒在宿主细胞内的复制，也能促进病毒在宿主细胞内的复制[7-8]。
这说明miRNA 模拟物和miRNA 拮抗剂有望成为抗病毒药物的研发热点。
因此，探究参与病毒感染过程中的siRNA 和miRNA，对病毒感染的治疗具有重大意义。
1 siRNA 和 miRNA 的生成siRNA 是一种长度为21 ~ 23 bp 的小片段双链RNA （double stranded RNA，dsRNA），主要引起RNAi 现象。
MicroRNA研究概况以及MicroRNA芯片技术简述MicroRNA的研究
MicroRNA 研究概况以及MicroRNA 芯片技术简述一、MicroRNA 的研究概况1.MicroRNAMicroRNA（miRNA , miR）是由约21-25个核苷酸组成的分子，microRNA 通过抑制mRNA 的翻译或者促进其降解而起到负性调控的作用。
最初miRNA 的功能在植物学、癌症、病毒性感染和发育生物学中得到了验证。
但最近的研究发现，患有心脏疾病的小鼠对照正常状态miRNAs 失调，并且在肥大的心脏中也检测到了数种miRNA 的上调或者下调，同时体外实验也证实了它们对心肌细胞形态的影响。
2.MicroRNA 的研究进展miRNA现象的最早报道是在佃80年的Genetics和Cell上。
佃93年在线虫中发现的lin-4 是第一个被确定的miRNA [31]，它的基因产物是21 个核苷酸的RNA 分子并且部分序列互补于lin-14 mRNA的3' UTR区域。
这些互补序列使lin-4间断地与lin-14 mRNA结合。
奇怪的是，lin-4没有明显地改变lin-14 mRNA的量，但是Lin-14蛋白表达却明显降低。
2000年又在线虫中发现了与lin-4相似的miRNA ―― let-7，它们参与线虫发育的时空调节。
miRNA基因首先被RNA聚合酶H转录为较长的初始转录本，该转录本含有数千个核苷酸，称其为pri-miRNA。
在pri-miRNA内，miRNA位于由大约70个核苷酸构成的环柄结构内。
在动物体内，该环柄结构在细胞核内被RNA酶川Drosha和其辅助蛋白Pasha/DGCR8 识别和切割，形成pre-miRNA 。
之后，pre-miRNA 迅速被核质/细胞质转运蛋白Exportin5转运至细胞质，被位于细胞质内的RNA酶川Dicer 进一步切割。
产生一个类似于siRNA 的miRNA ：miRNA* 复合体，随后，该双链体解旋为成熟的miRNA和miRNA*，成熟的miRNA在一种ATP-依赖的沉默复合体（RISC ）中，形成非对称的RISC 复合物。
蜜蜂microRNA的研究进展
现其中 81 个 miＲNA 在其他昆虫中有同系物， 表明 它们是真实存在的 miＲNA， 并与同系物具有相似的 功能。这一研究结果为研究蜜蜂发育、 级型分化等 方 面 的 miＲNA 调 控 网 络 提 供 了 基 础。 Shi 等 （ 2012 ） 分别对中华蜜蜂 Apis cerana cerana 与意大利 蜜蜂 Apis mellifera ligustica 蜂王浆中 miＲNA 表达谱 进行检测， 发现两者存在着差异， 由此推测 miＲNA 在蜜蜂级型分化发挥着调控作用 。Guo 等（ 2013 ） 则 运用高通量测序技术 Solexa 检测了意蜂工蜂浆和蜂 王浆中的小 ＲNA 表达谱， 发现工蜂浆中的 miＲNA 表达量是蜂王浆中的 7 ～ 215 倍， 而且在幼虫发育的 4 － 6 ， 第 天 工蜂幼虫食物和蜂王浆中 miＲNA 表达 在给蜂王幼虫饲喂添 量有明显的动态变化。 另外， 结果不仅导致其 加了特异性 miＲNA 的蜂王浆之后， 体内 mＲNA 的表达出现明显的变化， 而且发育而成 的新蜂王的形态特征也有明显的变化， 特别是添加 184 的 蜂 王 浆， 了 miＲ变 化 尤 为 明 显。 Guo 等 （ 2013 ） 的 研 究 进 一 步 证 明 了 哺 育 蜂 分 泌 物 中 的 miＲNA 是蜜蜂级型分化调控机制的重要组成部分 。
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昆虫学报 Acta Entomologica 人们运用各种生物技术在哺 乳动物、 昆虫、 病毒体等生物中发现已鉴定注册的 miＲNAs 共有 24 521 个， 其中在蜜蜂中发现 218 个 （ http： / / www． mirbase． org / ） 。 蜜蜂是重要的社会性经济昆虫， 一直是国际上 特别在社会性结构相关的诸多领 热门的研究对象， 域是研究热点。 充分认识 miＲNA 对蜜蜂各方面的 调控机制， 对于养蜂生产具有重要的指导意义。 例 如， 了解 miＲNA 对蜜蜂免疫系统方面的调控机制， 就能针对性地有效地采取相关措施防治蜂群病虫害 及细菌病毒感染； 了解 miＲNA 对蜜蜂劳动分工行为 的调节机制， 便能更好地掌握蜂群发展的规律 ， 根据 从而达 需要控制蜂群中各种不同分工蜜蜂的数量 ， 而且也可以为人类认 到增加蜂产品的产量的目的， 识动物行为的可塑性提供重要的线索 。随着蜜蜂基 因组 测 序 的 完 成 （ Honey Bee Genome Sequencing Consortium， 2006 ） ， Weaver 等 （ 2007 ） 运用 3 种独立 的计算方法在蜜蜂基因组中确认了 65 个非冗余候 选的 miＲNA， 通过对蜜蜂 miＲNA 转录差异分析发 更有可能是蜜 现 miＲNA 可能参与调节蜜蜂的发育， 蜂级 型 分 化 的 关 键 性 调 控 因 子。 自 此 蜜 蜂 领 域 miＲNA 的研究随之展开。 近年的研究发现 miＲNA 对蜜蜂级型分化、 劳动分工行为、 免疫系统等方面都 可能发挥着重要的调控作用， 本文就其最新的研究 进展进行了综述。
miRNA的研究方法
科研(kē yán)中的miRNA研究(yánjiū)方法总结microRNA(miRNA) 是一类(yī lèi)长度在22nt左右(zuǒyòu)的内源非编码小RNA，广泛存在于动物、植物(zhíwù)、病毒等多种有机体中。
1993年，Lee等人在秀丽新小杆线虫(C.elegans)中发现了控制着线虫时序性发育的lin-4。
2000年，Reinhart等发现了另一个具有转录后调节功能的小分子RNA：let-7。
随后的几年时间里，许多研究人员相继发现了这类RNA，并将这些具有时空表达特异性的非编码小分子RNA命名为microRNA(miRNA)。
从长的初级miRNA(pri-miRNA)到形成成熟的单链miRNA到与靶标RNA结合，至少需要四步：首先是由核糖核酸酶ⅢDrosha和DGCR8组成的复合物将初始miRNA 转录本（pri-miRNA）加工成miRNA前体（pre-miRNA）；接着由转运蛋白Exportin-5和Ran GTP酶将miRNA从细胞核转运到细胞质中；第三步是由另一种核糖核酸酶ⅢDrosha将miRNA前体剪切成成熟的miRNA双链，miRNA双链打开，其中一条进入到RNA诱导的沉默RISC复合体（RISC）中，该复合体还包含TarRNA结合蛋白（TRBP）；最终RISC复合体根据miRNA与靶标RNA的互补配对，对靶基因进行剪切，或者翻译抑制。
图 1 miRNA生物学调控过程（摘自文献8）miRNA通过作用于相应靶mRNA，参与细胞增殖、凋亡、分化、代谢、发育、肿瘤转移等多种生物学过程。
预测超过1/3的人类基因都是保守的miRNA靶基因。
近些年，随着科学研究的进展，大量的miRNA已经被鉴定出来，截至目前发现的人的成熟的miRNA有2578条，小鼠的有1908条。
虽然miRNA的数量很多，但大多miRNA的功能并不为人所知。
miRNA的作用机制及功能研究进展
miRNA的作用机制及功能研究进展王娟〔德州学院生物系，山东德州253023〕摘要microRNA (miRNA)是内源性的大小在20-25nt的一类非编码RNAs，具有调节基因表达活性的功能，广泛存在于真核生物体内，并在进化中保守。
miRNA的广泛存在与进化上的保守性，暗示它在生命活动中具有必不可少的调节作用，他们参与动植物生长发育、细胞分化、细胞增殖与调亡、激素分泌、肿瘤形成等各种过程。
本文总结了近几年来在miRNA 的特征、生物发生、作用机制及功能意义上的研究进展。
miRNA无论在数量上还是功能上，可能都远远超过目前的发现，对其进展深入的研究，将有助于我们对生物体的各种生理病理机制的理解，并最终为疾病的诊断和治疗提供新的思路和理论根底。
关键词siRNA；microRNA；piRNA; 微处理器;核糖核酸内切酶Ⅲ; 基因调控; 生长发育；肿瘤治疗前言2006年，Andrew Fire 和Craig Mello 由于在RNAi〔RNA interference，RNAi〕及基因沉默现象研究领域的出色奉献而获得诺贝尔医学奖，这再次将人们的注意力拉到siRNA这样一种小分子RNA上。
小分子RNA包括一个大家族，并在真核生物中具有广泛的调节功能。
目前已经有至少两种小分子RNA被描述：来源于发夹状前体的miRNAs (microRNAs)和由长的dsRNAs加工而来的siRNAs (small interfering RNAs)。
研究发现，miRNA与siRNA有很多相似之处，但也有很大的不同，二者的区别将在以下文中进展论述。
最近又有文章报道了一种新的小分子RNA的发现[25]——piRNAs (piwi-interacting RNAs),他们特异地在小鼠的生精细胞中大量表达。
这些RNAs比以前发现的大多数小RNAs较大，约26–31nt(nucleotides)，并与Argonaute蛋白家族的Piwi亚枝(Piwi-subclade)成员相联系。
MicroRNA在昆虫－病毒互作中的作用研究进展
MicroRNA在昆虫－病毒互作中的作用研究进展吴萍【摘要】MicroRNA（miRNA）是一类小的非编码RNA，广泛参与生长发育、细胞凋亡、肿瘤、抗病毒等一系列重要的生命过程。
近年来的研究发现，miRNA在宿主与病毒的互作机制中发挥重要作用。
文中结合近几年在昆虫miRNA抗病毒免疫作用方面的研究成果，简要综述了miRNA的产生机制，与靶基因的结合特点，昆虫宿主编码的miRNA及病毒编码的miRNA在昆虫宿主－病毒互作中的作用。
%MicroRNA(miRNA)as small non-coding RNA widely participates in a series of important biological processes including development,cell apoptosis,tumor and anti-viral responses.Recently,studies suggest that micorRNAs play key roles in host-virus interaction.This article reviewed the mechanism of microRNAs biogene-sis,interaction between miRNAs and target genes,the roles of miRNA in host-virus interaction based on the re-cent achievements in insects.【期刊名称】《江苏科技大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2016(030)002【总页数】6页(P183-188)【关键词】昆虫;病毒;microRNA;互作【作者】吴萍【作者单位】江苏科技大学蚕业研究所，江苏镇江212018【正文语种】中文【中图分类】S881.2MicroRNA(miRNA)是一类由18～25个核苷酸组成的小的非编码RNA．miRNA 广泛存在于动物、植物和病毒等生物中,在物种进化中高度保守,并具有时空表达特异性,参与包括生长发育、细胞凋亡、肿瘤、抗病毒等一系列重要的生命过程[1-2]．RNA干扰 (RNA interference) 作为一种先天的抵抗病毒感染的防御机制最早是在植物中发现的[3], 随后研究发现,RNA干扰在昆虫自身免疫体系中也扮演着重要角色．研究表明：宿主编码的miRNA在受到病毒感染后,其表达水平会发生显著变化[4]．差异表达的miRNAs可能是由宿主免疫应答反应引起或由病毒感染诱导的调控因子导致．另一方面,病毒编码的miRNA也可调控自身与病毒复制相关基因或宿主免疫相关基因,从而进一步增加了宿主—病毒互作的复杂性．文中结合近几年昆虫miRNA在抗病毒免疫机制中的作用研究成果,就miRNA的产生,与靶基因的调控及在昆虫—病毒互作中的作用研究进展作一简要综述．1.1 标准途径通常,由宿主细胞和DNA病毒编码的miRNA由标准途径生成．即首先由RNA 聚合酶Ⅱ将细胞核内编码 miRNA 的基因转录成初级转录物 (primary miRNA, pri-miRNA),初级转录物除具备典型的mRNA特征外(含5’端帽子和3’端poly A 结构),还具有1个或多个茎环结构．初级转录物在位于细胞核中的Drosha酶和DGCR8/Pasha 蛋白的共同作用下被加工成约 70 nt 的不完全配对茎—环结构的miRNA前体(precursor miRNA, pre-miRNA)．而后 pre-miRNA 在核输出蛋白-5(Exprotin-5)的帮助下,从细胞核转运到细胞质,被细胞质中的Dicer 酶及其辅助因子TRBP切割成3’端有两个碱基突出的 18～25 个核苷酸长度的双链 miRNA:miRNA*分子．成熟的miRNA与Ago1或Ago2等复合物形成RNA诱导沉默复合体(RNA induced silencing complex, RISC),通过与靶mRNA的特定序列互补或不完全互补结合,诱导靶mRNA剪切或者阻止其翻译而对靶基因表达进行调控[5-9]．1.2 非标准途径近年来,研究发现, miRNA前体可不依赖于由Drosha酶和DGCR8蛋白组成的miRNA加工子(Microprocessor)而从其他非标准途径生成(图1)．例如,有些miRNA前体的生成无需Drosha酶,可由剪接体剪切短的含有发卡结构的内含子(称为mirtrons)而来[10];有些miRNA前体可由tRNase Z 酶剪切tRNA而来,如miR-1983[11];还有些miRNAs可来源于小核仁RNA(snoRNA),这类RNA主要位于核仁上,参与特定位点的甲基化和其他RNA的假尿苷化[12]．以上来源的miRNA虽然其前体的生成可不依赖Drosha酶,但成熟的miRNAs仍需Dicer酶在细胞质中的剪切．1.3 RNA病毒基因组来源的miRNARNA病毒曾被认为是不可能编码miRNA的,理由如下:1) 大多数RNA病毒的复制都在细胞质中进行,而细胞质中缺乏Drosha酶,因而初级转录物没法形成miRNA 前体．2) 病毒编码的miRNA会诱导RNA干扰应答从而降解RNA病毒自身的基因组．事实上,miRNA生成的非标准途径无需Drosha酶的剪切,这为RNA病毒编码miRNA提供了可能性．研究表明：当DNA病毒编码的miRNA前体插入RNA 病毒基因组中,可被成功地加工为成熟的miRNA．如来源于EB病毒(Epstein barr virus)的pre-miR-BART2R插入到TBEV (Flavivirus tick-borne encephclitis virus)基因组中,被加工成miR-BART2,而不影响TBEV病毒的复制[14]．来源于宿主的miR-124可从重组的正链RNA病毒、辛德毕斯病毒(Sindbis virus)中产生[15]．近年来,在反转录病毒,如人类免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus, HIV)、牛白血病病毒(Bovine leukemia virus, BLV)、猴泡沫病毒(Simian foamy viruse,SFV)中发现了大量的miRNAs[16-18]．在RNA病毒中,如西尼罗病毒(West Nile virus, WNV)、登革热病毒(Dengue virus, DENV)以及甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus, HAV)也被证实可编码miRNA[19-21]．一般认为,人类以及大多数动物的miRNA 通过与靶基因 mRNA 的3’非翻译区(3’UTR区)完全或不完全互补配对,诱导靶mRNA的降解或抑制靶基因蛋白的合成,从而参与基因的表达调控．种子序列(成熟miRNA 5’端的第2～8个核苷酸)与靶基因3’UTR区的结合通常要求完全互补．越来越多的研究表明,种子序列的完全配对并不是必需的,可以允许有至多1个碱基凸起或错配[22]．种子序列也不仅仅局限于miRNA 5’区,miRNA 3’端或中间序列与靶基因的配对也能发挥对靶基因的调控作用[22-23]．起初人们认为,在动物中,miRNA与靶基因的结合配对仅局限于靶基因mRNA的3’UTR区．现在很多证据表明这类特异性结合也可发生在靶基因mRNA的5’非翻译区或开放阅读框区域．例如,由巨细胞病毒(cytomegalovirus)编码的miR-US25-1可以和细胞周期调控相关基因(BRCC3, EID1, CD147等)的5’UTR配对结合并抑制其表达[24]．Argonaute (AGO) HITS-CLIP以及 PAR-CLIP数据分析表明，将近一半的AGO 与miRNA的结合位点位于开放阅读框内[25-26]．研究表明：miRNA对靶基因不仅具有负调控作用,即降解靶RNA或翻译抑制,miRNA对靶基因还有正调控作用,这可能是因为增加了靶基因mRNA的稳定性或与靶基因启动子序列的结合引发了翻译激活．例如,miR-128可以诱导与脑发育相关基因的表达[27]．文献[28]肝脏中特异表达的miR-122 与丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV) mRNA 5’UTR区给合从而引起病毒增殖,同时还增加了HCV基因组RNA的稳定性．有些miRNAs 可以和靶基因启动子的TATA框结合使得靶基因的表达水平上调[29]．一个miRNA可作用于多个靶基因,一个靶基因又可同时受多个miRNA调控,这使得miRNA与靶基因之间的调控更为复杂．3.1 昆虫编码的miRNA病毒与宿主相互作用是病毒感染致病以及免疫的生物学基础,病毒感染宿主后通过多种信号传导途径引起应答基因,包括miRNAs表达水平的变化．近些年,很多研究学者利用日趋先进的高通量测序技术对宿主受病原菌入侵后,宿主miRNA的表达谱进行了广泛研究．宿主感染病毒后miRNA表达谱的变化至少归为两类:一是为病毒的增殖提供更适宜的细胞内环境;二是诱导宿主免疫应答反应从而抑制病毒增殖[30-31]．例如,文献[4]采用Solexa高通量测序技术对家蚕质型多角体病毒 (Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus, BmCPV)感染中肠及对照中肠组织进行了小RNA测序分析,58个microRNAs在家蚕感染中肠组织和对照中肠组织中的表达有显著差异．差异表达的miRNAs的靶基因预测分析表明大多数靶基因的功能与应激和免疫相关．文献[32]预测在果蝇中,有超过70个miRNAs 参与果蝇免疫系统相关的Toll信号通路、Imd信号通路以及JNK和JAK/STAT信号通路的调控,推测由miRNA介导的RNA干扰途径可能是果蝇先天的广谱型免疫机制．冈比亚按蚊编码(Anopheles gambiae)的两个miRNA, aga-miR-2304以及aga-miR-2390经预测可能靶向作用于抑制素和酚氧化酶原基因[33]．文献[34]的研究发现,烟草天蛾(Manduca sexta)在受到病原菌侵染后,其miRNA表达谱变化涉及到编码病原物模式识别、酚氧化酶原激活、抗菌肽合成以及保守免疫信号转导等多个免疫应答相关通路的基因的表达．MiR-8是经实验室验证的，和昆虫免疫应答相关的miRNA．它可负调控果蝇中编码Drosmycin 以及Diptericin等抗菌肽(AMP)基因的表达[35],使得AMP在非感染情况下维持较低水平，从而确保免疫反应维持内稳态．果蝇中若缺失miR-8,则其体内的AMP将显著升高．miR-8对AMP的负调控也在小菜蛾(Plutella xyloshella)的幼虫实验中得到了证实．该研究还发现,miR-8可正向调控Serpin-27的表达,Serpin-27可抑制Toll通路的激活．当感染病原菌时,由于miR-8表达下调从而抑制Serpin-27表达,进而激活Toll通路[36]．家蚕编码的miR-278-3p 可通过调控IBP2基因的表达进而调控BmCPV的增殖[37]．研究表明：宿主基因组编码的microRNA既可调控宿主的基因也可作用于病毒的基因,从而可调控病毒的增殖．文献[38]的研究发现谷实夜蛾(Helicoverpa zea)Hz-miR24在感染囊泡病毒(ascovirus)晚期可下调ascovirus 病毒基因组编码的DNA依赖的RNA聚合酶及其beta亚基的转录水平．家蚕编码的bmo-miR-8可靶作用于多个家蚕核型多角体病毒(BmNPV)基因,抑制bmo-miR-8的表达可导致家蚕脂肪体中BmNPV病毒滴度减少为原来的1/8[39]．蚊子细胞C6/36感染登革热病毒后,miR-252表达水平上调3倍,抑制了miR-252的表达,登革热病毒基因组RNA水平上调1.5倍[40]．文献[41]的研究发现Wolbachia(一种节肢动物生殖组织内的共生细菌)感染蚊子后,可诱导在蚊子中特异表达的aae-miR-2940的表达,aae-miR-2940又可通过诱导宿主金属蛋白酶(metalloprotease)基因的表达，显著提高宿主细胞中Wolbachia的感染浓度．研究发现,aae-miR-2940也可通过诱导金属蛋白酶基因而正向调控WNV的复制[42]．此外,病毒还可通过破坏宿主miRNA来抑制宿主的先天免疫,实现帮助其自身繁殖的目的[43]．3.2 昆虫病毒编码的miRNA病毒编码的miRNA可靶作用于病毒基因，从而可调控病毒基因组复制或抑制宿主抗病毒应答反应．第一个经鉴定的昆虫病毒编码的miRNA是来源于棉铃虫囊泡病毒编码的HvAV-miR-1．它可下调病毒编码的DNA聚合酶进而影响病毒基因组的复制[44]．家蚕核型多角体病毒(BmNPV)编码的bmnpv-miR-3在BmNPV感染早期,可靶作用于病毒DNA结合蛋白p6.9基因以及其他晚期表达基因[45],这对BmNPV的复制非常有利．首先,可自主调控BmNPV增殖,避免过度复制;其次可抑制晚期表达基因在感染早期的表达;最后可调控宿主免疫应答反应[46]．苜蓿银纹夜蛾杆状病毒AcMNPV编码的AcMNPV-miR-1可靶作用于ODV-E25[47]．该基因是一个晚期表达基因,编码约25 kDa的包涵体类病毒(ODV)的结构蛋白,同时也可编码出芽病毒(BV)的膜[48-49]．研究发现,AcMNPV-miR-1过表达可促进ODV的形成,虽对BV病毒的复制无影响但可削弱其传染性[50]．抑制AcMNPV-miR-1的表达会显著降低包涵体的数量．棉铃虫杆状病毒(Helicoverpa zea nudivirus-1,HzNV-1)在潜伏期仅表达一个非蛋白编码基因,即持续感染相关基因(persistency-associated gene 1, pag1)[51]．pag1编码的2个miRNAs可降解病毒早期基因hhi1的转录本,对病毒维持潜伏期发挥重要作用．若pag1基因缺失,HzNV-1病毒将不能进入潜伏期．另一方面,研究表明,昆虫病毒的miRNA也可通过调控宿主基因的表达从而建立病毒的感染并在宿主体内成功复制．这可能是通过调节对某一特定通路起决定性作用的靶基因而导致的[52]．例如,家蚕核型多角体病毒(BmNPV)编码的BmNPV-miR-1可下调核输出蛋白Exportin-5的协同因子Ran的表达,从而阻断miRNA 前体运送至细胞质,进而影响感染BmNPV细胞中成熟miRNA的表达丰度[39]．再如,由WNV病毒编码的 KUN-miR-1可以正向调控蚊子细胞中编码GATA结合蛋白4基因(GATA- 4)的表达．沉默GATA- 4基因的表达可降低WNV病毒RNA的复制水平,这表明KUN-miR-1诱导表达的GATA- 4在WNV 病毒复制中发挥着重要作用[19]．miRNA在昆虫—病毒互作中扮演着重要角色,其调控机制是网络化的、多层次化的．宿主编码的miRNA通过调控自身相关基因及病毒基因,从而激活免疫应答反应,抵制病毒的侵染．反之,病毒编码的miRNA靶向作用于自身基因及宿主基因,一方面提高与病毒复制相关基因的表达,另一方面抑制宿主免疫相关基因的表达,从而达到在宿主体内顺利建立感染及繁殖的目的．迄今为止,miRNA在昆虫—病毒互作机制中的研究尚属冰山一角,广泛深入地研究这一互作机制,可为揭示昆虫免疫机制提供新的研究思路,对昆虫病毒病的鉴定与防治研究具有重要的科学理论意义和实际应用价值．【相关文献】[ 1 ]SHOMRON N, GOLAN D, HORNSTEIN E. 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Small RNAs derived from snoRNAs[J]. RNA, 2009, 15(7): 1233-1240.[13]ASGARI S. Role of microRNAs in arbovirus/vector interactions[J]. Viruses, 2014, 6(9):3514-3534.[14]ROUHA H, THURNER C, MANDL C W. Functional microRNA generated from a cytoplasmic RNA virus[J]. Nucleic Acids Research, 2010, 38(22): 8328-8337.[15]SHAPIRO J S, VARBLE A, PHAM A M, et al. Noncanonical cytoplasmic processing of viral m icroRNAs[J]. RNA, 2010, 16(11): 2068-2074.[16] BENNASSER Y, LE S Y,Man L Y, et al. HIV-1 encoded candidate micro-RNAs and their cellular targets[J]. Retrovirology, 2004, 1(1):1-5.[17]ROSEWICK N, MOMONT M, DURKIN K, et al. Deep sequencing reveals abundant noncano nical retroviral microRNAs in B-cell leukemia/lymphoma[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2013, 110(6): 2306-2311.[18]KINCAID RP, CHEN Y, COX J E, et al. 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Journal of Insect Physiology,2014, 70:151-158。
MicroRNA在非洲猪瘟研究中的应用
动物医学进展,02 ,42(4)=120-123Progress in Veterinary MedicineMicroRNA 在非洲猪瘟研究中的应用张兆博1，张思诗2,汉可欣1，李晓易3,文雪霞1，汉丽梅1宀(.沈阳农业大学畜牧兽医学院，辽宁沈阳1 10866； 2.中国农业科学院上海兽医研究所，上海20024 1 ； 3.长春师范大学，吉林长春130031; 4.东北畜禽疫病研究教育部重点实验室，辽宁沈阳1 10866)摘 要:microRNA 是非编码RNA 中一种重要的不具有编码能力的调节RNA ,它广泛存在于真核生物体内并对机体的发育、细胞凋亡、基因表达及蛋白质表达等一系列生物学过程起调控作用。
非洲猪瘟(Af-rican swine fever , ASF)是一种传染性强、危害大的急性传染病,已严重危害我国养猪业的正常发展。
对 ASF 发病过程中microRNA 的研究已成为近年来ASF 的研究热点之一。
论文对近年来ASF 发病过程中的microRNA 的作用及其机制进行综述，为未来microRNA 在ASF 防控中发挥作用提供参考。
关键词：非洲猪瘟；microRNA ；非洲猪瘟病毒中图分类号:S852.651非洲猪瘟(African swine fever, ASF )是由非洲 猪瘟病毒(African swine fever virus , ASFV )感染引起的急性、热性传染病，家猪和野猪都为该病的易感 对象。
ASFV 是一种20面体、有囊膜的双链DNA病毒，不同来源的分离株病毒基因组长度在170 kb~193 kb 之间［1］。
ASFV 约有151个〜167个开放阅读框(open reading frame, ORF )编码5个多基因家族，但目前部分ORF 编码蛋白的功能尚未明 确⑵。
ASFV 的传播方式多样，其既可以通过易感 动物之间的直接接触传播，也可以通过污染的猪肉、毒蛇、车辆、人及扁虱等途径间接传播［］。
MicroRNA相关文献
联系： 1.均为Dicer的产物：长度均 为22nt左右，5‘端是磷酸 基，3’端是羟基。 2.沉默机制有重叠，均需 Argonaute家族蛋白的存在， 同为RISC的组分。 3.二者进化关系上可能的两 种推论：siRNA 是miRNA的 补充；miRNA在进化过程中 替代了siRNA。
FIG 5 LOGO
To investigate whether miR-145 is involved in embryonic hepatic outgrowth
FIG 6 LOGO
To determine whether GrnA is a direct target of miR-145 in mediating hepatic outgrowth.
1
2
3
4
5
6
7
miR-145 and GrnA expression patterns are inversely correlated during liver developent
miR-145 is required for hepatic outgrowth during liver development
FIG 7 LOGO
We determine whether endogenous GrnA expression is affected by miR-145.
FIG 8 LOGO
To determine whether miR-145 affects embryonic hepatic outgrowth through targeting GrnA.
However, we cannot exclude the possibilities of miR-145 involvement in hepatic specification and/or differentiation. Our results suggest that the relevant mechanisms of miR-145-mediated growth regulation may xist in both embryonic hepatic growth and liver tumor growth.
MicroRNA的基础与临床研究进展
MicroRNA的基础与临床研究进展【摘要】MicroRNA 是新近发现的一类调控性小分子RNA，通过降解靶基因mRNA或转录后抑制靶基因表达而发挥作用。
近期的研究发现人血清中稳定存在一定水平的miRNA，并且血清miRNA 表达谱的变化与多种肿瘤的发生、发展具有明确的相关性, 说明血清miRNA 可以作为肿瘤临床诊断和预后评估的分子标志物。
【Abstract】MicroRNAs are small noncoding RNAs that function to regulate gene expression by post-transcription regulation or degradation mRNA of target gene. Recently，it has been shown that serum contains large amounts of stable miRNAs and that the serum miRNA expression profile can be used as a novel serum-based biomarker potentially offering more sensitive and specific tests than those currently available for early diagnosis of cancer and other diseases.【Key words】MicroRNA; Gene expression regulation；Disease; Biomarker2002年, MicroRNAs(miRNAs)的发现被《Science》杂志评为十大科技突破第一名, 近年来, 已然成为生命科学研究的重要热点之一。
在动、植物及病毒等生物中发现了一系列小分子非编码RNA(small noncoding RNA), 包括miRNA, siRNA, piRNA，esiRNA等, 它们组成了RNA 调控网络, 调控包括细胞增殖、分化和凋亡等一系列生理进程,并与多种人类疾病密切相关［1］。
动物中microRNA及其生物发生相关蛋白的研究
动物中microRNA及其生物发生相关蛋白的研究周学;郑丹;夏文静【摘要】MicroRNAs (miRNAs) are endogenous noncoding RNAs with about 21~25 nucleotides in length. The study found that miRNAs widely participate in a series of important process of the life and play an important role in the cell differentiation, the process of growth and development of the biology and tumorigenesis. There were many proteins participated in the generation and function of miRNAs. In this study, we researched the miRNAs and its biological related proteins in animals.%microRNA(简称miRNA)是一类长度为21~25nt内源性的非编码小RNA.研究发现,miRNA广泛参与生命过程中一系列重要的进程,在控制细胞分化、生长发育以及肿瘤发生等过程中都起着重要的作用.miRNA的产生及功能行使的过程中,需要多种蛋白或者蛋白复合体的参与.本文对动物中miRNA及其生物发生相关蛋白研究进展进行了综述.【期刊名称】《价值工程》【年(卷),期】2016(035)003【总页数】3页(P183-185)【关键词】microRNA;生物相关蛋白;功能;展望【作者】周学;郑丹;夏文静【作者单位】南京师范大学泰州学院化学与生物工程学院,泰州225300;南京师范大学泰州学院化学与生物工程学院,泰州225300;南京师范大学泰州学院化学与生物工程学院,泰州225300【正文语种】中文【中图分类】Q946.1真核生物的基因表达调控是一个十分复杂的过程，只有确保基因表达调控准确，才能有益于生物体的生长和发育，否则很可能导致疾病的出现。
microRNA的作用机制及其在疾病治疗中的应用
microRNA的作用机制及其在疾病治疗中的应用微RNA（miRNA）是一类含有约20-25核苷酸的非编码RNA，通过与靶基因mRNA结合从而抑制或降解mRNA，从而参与了多种细胞活动，包括基因表达、细胞生长和凋亡等，同时也参与了多种疾病的发展。
有研究表明，微RNA在多种疾病的发病机制中起着重要作用，并且其在疾病治疗中的应用前景十分广阔。
首先，微RNA在基因表达中的作用机制是通过结合mRNA降解酶和核酸酶，抑制靶基因mRNA的翻译和降解，从而影响基因的表达，调控基因的表达水平和细胞的功能。
例如，miR-126通过抑制VEGFA和SPRED1，反正则调控了血管生成和癌症进展。
其次，微RNA在疾病过程中起着重要作用。
研究发现，微RNA在多种疾病中均有参与，且不同疾病中的miRNA表达模式包含不同的miRNA基因。
例如，miR-21在癌症中表现出高度表达，并参与了肿瘤的细胞生长、凋亡、侵袭和转移等过程。
miR-184在恶性黑色素瘤中表现出抑制功能，导致瘤细胞的凋亡。
miR-122在肝硬化和肝癌病患中表现出明显的下降，是对于肝脏细胞生长和代谢的调控者，在肝炎病毒成活期甚至可以决定肝炎病毒的生存和繁殖。
显然，微RNA调控机制是多种疾病进展的重要影响因素之一。
最后，微RNA在疾病治疗中的应用前景十分广阔。
微RNA包括成熟微RNA 和微RNA前体等，在微RNA的抑制和激活中，可能都对细胞内信号传导通路和代谢途径的调控中发挥着重要作用。
利用微RNA的调控机制，可以制定出特定的微RNA干预策略，为多种疾病的治疗提供有效的方法。
目前的研究方向包括 but not limited to 以下几个方面：一、微RNA的治疗性靶向策略。
此策略是指通过靶向miRNA抑制或促进细胞和组织中某一特定功能的miRNA 而发挥治疗效果。
这种策略需要依靠有关miRNA及其下游信号通路的基础理论，从而设计出特定的手段和方案来实现治疗效果。
microRNA组学综述
基因组学结课综述microRNA组学研究及进展000000000000000000000000000000microRNA组学研究及进展摘要：microRNA是由属十小分子RNA，由基因序列上的内含子片断转录并剪切加工而来，其长度约为19-24个核若酸。
它的功能体现于基因翻译后与表达之间的时段，其功能的体现方式在于它能和mRNA进行不同程度的靶向绑定，以碱基的互补结合力形成双链结构，从而影响基因组信息的传递。
初始的研究表明，microRNA的靶向识别仅仅在于microRNA的5'端起的前8个左右的碱基，也就是其种子区域。
但后续研究表明；非种子序列的靶向作用也不容忽视；与此同时，microRNA成熟体的靶向区域并不局限在3'UTR，它还能有效的靶向5'UTR，甚至编码区域。
关键词:microRNA,靶基因分类，特征提取方法，神经网络一、 miRNA的发现由于miRNA很小，在很长时间里没有被人发现。
直到1993年，第一个miRNA lin-4才被Ambors等人发现。
Ambors等研究秀丽隐杆线虫(C.elegans)时，发现与发育相关的lin-4基因的编码产物是一个长度为22个碱基的RNA小分子，它与另一个发育相关基因lin-14的3'UTR区域的7个保守位点部分互补，可以调节lin-14的蛋白产物，从}fn调控线虫发育过程。
这一发现揭开了一种新的基因调控机制，但在此后的7年中人们一直没有发现新的miRNA。
直到2000年第二个miRNA分子let-7才在线虫被鉴定出来，它与lin-4有相似的调控机制。
在此之后不到一年时间，二个实验室从果蝇、蠕虫、人类细胞中找到了近百个这类小RNA，并将其命名为microRNA。
从此之后，miRNA的研究得到了广泛的关注，大量的miRNA 被发现。
目前关十miRNA的权威数据库miRBase中，收录了来自动物、植物和病毒等数十个物种的数千个miRNA基因的信息，并且其数量还在不断的快速增长[1]。
MicroRNA及其在医学中的应用
MicroRNA及其在医学中的应用温旺荣李莉陈文景[摘要]MicroRNAs（miRNAs）是近年来发现的一种非编码的小RNA，长度仅22个核苷酸左右，普遍介导基因转录后的调节，参与调控机体各种生理进程。
miRNA与疾病如肿瘤的发生发展密切相关。
研究发现血液循环中也存在miRNA，循环miRNA或可作为肿瘤无创诊断的新靶标。
本文就miRNA的来源、功能、与疾病的关系、检测方法及其在肿瘤诊断和治疗中的应用等方面的研究进展作一综述。
[关键词]MicroRNA；检测；肿瘤；诊断；治疗MicroRNA and its applications in medicineWEN Wangrong，LI Li，CHEN Wenjing（Center for Clinical Laboratory Medicine，the First Affiliated Hospital，Jinan University，Guangdong，Guangzhou510630，China）[ABSTRACT]MicroRNAs(miRNAs)are non-encoded small RNAs which discovered in recent years，about22nucleotides in length.They mediate the post-transcriptional genes modulation generally and regulate various physiological processes in the body.MiRNAs are closely related to the occurrence and development of human diseases such as tumour.Studies found that there are miRNAs in the blood circulation,and circulated miRNAs can act as a new non-invasive tumour diagnosis target.This article summarize the source,the function, the relation to diseases,the detection methods and the application in cancer diagnosis and treatment of miRNAs.[KEY WORDS]MicroRNA;Detection;Tumour;Diagnosis;TherapyMicroRNA（miRNA）是一组由动物、植物和病毒基因组所编码的单链小RNA（～22nt），它们不具有开放阅读框（ORF），不编码蛋白质，但却参与机体的各种重要的生理和病理过程，它们能够与靶mRNA的3′-UTR(untranslated region)区的碱基互补配对而起作用，使其降解或抑制其表达，从而导致特定基因的沉默，对机体生长、发育及各种疾病尤其是肿瘤的发生和发展具有重要的调节功能[1]。
浅析microRNA在疾病中作用的认识历程
Ｋｅ ｙ Ｗｏ ｒ ｄ ｓ ： ｍｉ ｃ ｒ ｏ ＲＮＡ ，ｉ ｎ ｆ ｌ ａ ｍｍａ ｔ ｉ ｏ ｎ，ｃ ａ ｎ ｃ ｅ ｒ
微 小 ＲＮ Ａ（ ｍｉ ｃ ｒ ｏ ＲＮ Ａ， ｍｉ ＲＮＡ） 是近 ２ Ｏ年来 分 子 生 物学 和肿 瘤学 领域 的研究 热点 ， 它位 于 非编 码 的基 因 片段 ， 曾经普 遍 被认 为 它 在 基 因 表达 中不 起 任 何 作 用 ，
１ ０ ０ ０９１。 Ｃｈｉ ｎａ
Ａｂ ｓ ｔ ｒ ａ ｃ ｔ ： Ｍｉ ｃ ｒ ｏ ＲＮＡ （ ｍｉ ＲＮＡ ） ｉ ｓ ａ ｒ ｅ ｃ ｅ ｎ ｔ ｌ ｙ ｄ ｉ ｓ ｃ ｏ ｖ ｅ ｒ ｅ ｄ ｃ ｌ ａ ｓ ｓ ｏ ｆ ｓ ｍａ ｌ ｌ ｎ ｏ ｎ ｃ ｏ ｄ ｉ ｎ ｇ ＲＮＡｓ ｔ ｈ ａ ｔ ａ ｒ ｅ ｉ ｍｐ ｌ ｉ ｃ ａ ｔ ｅ ｄ ｉ ｎ ｍａ ｎ ｙ ｐ ｈ ｙ ｓ ｉ ｏ ｌ ｏ ｇ ｉ ｃ ａ ｌ ａ ｎ ｄ ｐ ａ ｔ ｈ ｏ ｌ ｏ ｇ ｉ ｃ ａ ｌ ｐ ｒ ｏ ｃ ｅ ｓ ｓ ｅ ｓ ａ ｓ ｐ ｏ ｓ ｔ — ｔ ｒ ａ ｎ ｓ ｃ ｒ ｉ ｐ ｔ ｉ ｏ ｎ ａ ｌ ｒ ｅ ｐ ｒ ｅ ｓ ｓ ｏ ｒ ｓ ｏ ｆ ｇ ｅ ｎ ｅ ｅ ｘ ｐ ｒ ｅ ｓ ｓ ｉ ｏ ｎ ． Ｍａ ｔ ｕ ｒ ｅ ｍｉ ＲＮＡ ｃ ａ ｎ ｓ ｐ ｅ ｃ ｉ ｆ ｉ ｃ ａ ｌ ｌ ｙ ｂ ｉ ｎ ｄ ｔ Ｏ ３ － ＵＴＲｓ ｏ ｆ ｔ ａ ｒ ｇ ｅ ｔ ｃ ｅ ｌ ｌ ｕ ｌ ａ ｒ ｍＲＮＡ ｉ ｎ ｔ ｕ ｒ ｎ ｔ ｒ ｉ ｇ ｇ ｅ ｒ ｉ ｎ ｇ ｍＲＮＡ ｄ ｅ ｇ ｒ ａ ｄ ａ ｔ ｉ ｏ ｎ ｏ ｒ ｉ ｎ ｈ ｉ ｂ ｉ ｔ ｉ ｏ ｎ ｏ ｆ ｔ ｒ ａ ｎ ｓ ｌ ａ ｔ ｉ ｏ ｎ ．Ｔｈ ｅ ｍｉ ＲＮＡ ｐ ｌ ａ ｙ ｓ ａ ｎ ｉ ｍｐ ｏ ｒ ｔ ａ ｎ ｔ ｒ ｏ ｌ ｅ ｉ ｎ ｉ ｎ ｆ ｌ ａ ｍｍａ ｔ ｉ ｏ ｎ，ｃ ａ ｎ ｃ ｅ ｒ ，ａ ｎ ｄ ｏ ｔ ｈ ｅ ｒ ｄ ｉ ｓ ｅ ａ ｓ ｅ ｓ ，ｄ ｉ ｆ ｆ ｅ ｒ ｅ ｎ ｔ ｍｉ ＲＮＡ ａ ｎ ｄ ｔ ｈ ｅ ｉ ｒ ｒ ｏ ｌ ｅ ｓ ａ ｒ ｅ ｎ ｏ ｔ ｔ ｈ ｅ ｓ ａ ｍｅ ，ｗｈ ｉ ｃ ｈ ｒ ｅ ｆ ｌ ｅ ｃ ｔ ｅ ｄ ｔ ｈ ａ ｔ ｔ ｈ ｅ ｒ ｅ ｉ Ｓ ｕ ｎ ｉ ｖ ｅ ｒ ｓ ａ ｌ ｃ ｏ ｎ ｎ ｅ ｃ ｔ ｉ ｏ ｎ ｉ ｎ ｔ ｈ ｅ ｄ ｅ ｖ ｅ ｌ ｏ ｐ ｍｅ ｎ ｔ ｏ ｆ ｔ ｈ ｉ ｎ ｇ ｓ． Ｉ ｎ ｔ ｈ ｉ ｓ ａ ｒ ｔ ｉ ｃ ｌ ｅ 。ｗｅ ｄ ｉ ｓ ｃ ｕ ｓ ｓ ｅ ｄ ｔ ｈ ｅ ｍｉ ＲＮＡ ｓ ｄ ｉ ｓ ｃ ｏ ｖ ｅ ｒ ｙ ，ｐ ｒ ｏ ｄ ｕ ｃ ｔ ｉ ｏ ｎ，ｍｅ ｃ ｈ ａ ｎ ｉ ｓ ｍｓ ａ ｎ ｄ ｉ ｔ ｓ ｒ ｏ ｌ ｅ ｉ ｎ ｄ ｉ ｓ ｅ ａ ｓ ｅ ｓ ｂ ｙ ｔ ｈ ｅ ｐ ｏ ｉ ｎ ｔ ｏ ｆ ｖ ｉ ｅ ｗ ｔ ｈ ｅ ｗｈ ｏ ｌ ｅ ｗｏ ｒ ｌ ｄ ａ ｓ ｃ ｏ ｍｍｏ ｎ ｌ ｙ
猪繁殖与呼吸综合征病毒相关猪microRNA的初步筛选
猪繁殖与呼吸综合征病毒相关猪microRNA的初步筛选郜原;薄联锋;武小椿;孙柏;温俊歌;孙岩;徐志坤;张德礼【摘要】本试验旨在初步筛选出与猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染相关的猪microRNA(miRNA).采用生物信息学方法预测可能与PRRSV 3'非编码区(3'utr)产生相互作用的猪miRNA,构建PRRSV 3'utr的双荧光素酶报告基因载体psiCHECK-utr,同时合成预测到的miRNA(ssc-miR-323、ssc-miR-105-1)及其相应的抑制物,共转染猪脐静脉血管内皮细胞系(SUVEC),检测双荧光素酶活性.结果发现,ssc-miR-323与psiCH ECK-utr共转染后,荧光比率略有升高,ssc-miR-105-1与psiCHECK-utr共转染后,荧光比率降低.初步判定ssc-miR-323对PRRSV 3'utr 没有抑制作用,而ssc-miR-105-1对PRRSV3'utr有一定的抑制作用.【期刊名称】《中国兽医杂志》【年(卷),期】2012(048)003【总页数】4页(P21-24)【关键词】猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV);microRNA(miRNA);初步筛选【作者】郜原;薄联锋;武小椿;孙柏;温俊歌;孙岩;徐志坤;张德礼【作者单位】西北农林科技大学动物医学院兽医微生物学与病毒学课程组病毒免疫与生物信息研究室,陕西杨凌712100;西北农林科技大学动物医学院兽医微生物学与病毒学课程组病毒免疫与生物信息研究室,陕西杨凌712100;西北农林科技大学动物医学院兽医微生物学与病毒学课程组病毒免疫与生物信息研究室,陕西杨凌712100;西北农林科技大学动物医学院兽医微生物学与病毒学课程组病毒免疫与生物信息研究室,陕西杨凌712100;西北农林科技大学动物医学院兽医微生物学与病毒学课程组病毒免疫与生物信息研究室,陕西杨凌712100;西北农林科技大学动物医学院兽医微生物学与病毒学课程组病毒免疫与生物信息研究室,陕西杨凌712100;西北农林科技大学动物医学院兽医微生物学与病毒学课程组病毒免疫与生物信息研究室,陕西杨凌712100;西北农林科技大学动物医学院兽医微生物学与病毒学课程组病毒免疫与生物信息研究室,陕西杨凌712100【正文语种】中文【中图分类】S852.65+9.6猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）是一种严重危害着我国乃至全世界养猪业发展的猪免疫抑制性疾病，尤其是高致病性猪蓝耳病的暴发，对我国养猪业造成了极大损失。
牛脂肪组织中miRNA的研究进展
牛脂肪组织中miRNA的研究进展纪会;柴志欣;王会;钟金城【摘要】微小RNA(miRNA)是一种内源性非编码小RNA,主要通过与mRNA上2～8位核苷酸碱基互补结合使目标mRNA失去稳定性来发挥作用.大量研究表明,miRNA在牛的脂肪沉积与代谢,脂肪细胞的生成、增殖与分化过程中起着至关重要的作用.为此,文章从miRNA的合成、miR-378调控脂质代谢、miR-27b等其他转录因子对脂质代谢的调控、miRNA调控脂质代谢通路和在牛其他组织中的调控作用等5方面综述了牛脂肪组织中miRNA的研究进展,并对其在牛的生长发育、肉品质改良、脂肪代谢调节和牛营养水平均衡等方面的研究应用进行了展望,以期为miRNA在牛脂肪组织中的深入研究提供一定参考.【期刊名称】《中国草食动物科学》【年(卷),期】2018(038)004【总页数】5页(P53-57)【关键词】牛;脂肪组织;miRNA【作者】纪会;柴志欣;王会;钟金城【作者单位】西南民族大学青藏高原研究院,四川成都 610041;西南民族大学青藏高原研究院,四川成都 610041;西南民族大学青藏高原研究院,四川成都 610041;西南民族大学青藏高原研究院,四川成都 610041【正文语种】中文【中图分类】S823miRNA是一类长20～25个核苷酸的非编码小RNA，一般以互补配对的方式与靶基因结合，引导RNA诱导沉默复合物（RNA-induced silencing complex，RISC）清除mRNA或抑制mRNA的翻译，从而影响编码蛋白基因的表达。
miRNA最先是在秀丽线虫中被发现，现已发现miRNA广泛存在于哺乳动物、果蝇和植物等生物中。
miRNA基因尽管不编码蛋白，但其编码的RNA在生物整个生命活动中发挥着重要作用。
近年来，科学家们在有关牛miRNA的研究方面也做了大量研究，发现miRNA在牛的脂肪沉积与代谢，脂肪细胞生成、增殖与分化过程中起关键作用。
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（ 云南 省 大理 州 畜 牧 兽 医站 ， 云南 大 理 ６ ｌ Ｏ ） ７ Ｏ Ｏ
摘
要 ： ｃｏ ｍｉ ＲＮＡ （ ＲＮＡ） 小 分 子 Ｒ ｒ ｍｉ 是 ＮＡ 家 族 中 的 一 员 ， 源 性 非 编 码 基 因 构 成 的 ２ ｐ ２ ｐ 内 １ｂ ￣ ３ ｂ
（ｉ ＮＡ） ｍｉｒＲ ｓ Ｒ 和 ｃｏ ＮＡ（ ＲＮＡ） 子 ， 们 的 发 现 影响 基因 的表达 ， ｍｉ 分 它 尽管 许 多问题 还 尚待研 究 ， 对这 但
引起 了生 物学 家 的广 泛 关 注 。ｍｉ ＲＮＡ 是 新 近 发 现
的一 类 小 分 子 ， 早 发 现 的 ｍｉ 最 ＲＮＡ 基 因 是 线 虫
（ ｒｓｐ ｉ ｌｎ ｇ ｓ ｒ 、 、 、 Ｄ ｏｏ ｈ ｌ ｍｅ ｏ ａｔ ） 鱼 蛙 哺乳 动 物 中 都 ａ ａ ｅ
发现 了类 似的微小 ＲＮＡ， 现在 对数 种 模式 生 物 （ 、 人 小 鼠、 蝇 、 虫 、 果 线 拟南 芥 ） ｍｉ 的 ＲＮＡ 所做 的研 究 已
经非 常深 入 。科学 家 将 这些 约 ２ ｐ ３ｂ 、 现 １ｂ ～２ ｐ 呈
（ ｏ ｏ ｉｇＲＮＡ， ｃ ＮＡ） 分 子 ， 小 干 扰 Ｒ ｎ ｃｄｎ ｎＲ 小 即 ＮＡ
时空 特 异 性 表 达 模 式 的 Ｒ ＮＡ 分 子 ， 括 ｆ 包 ｆ ４和
７ 名 为 ｍｉｒＲＮＡ （ ＲＮＡ） 像 Ｒ 命 ｃｏ ｍｉ ， ＮＡ 干 扰 ，
它们 也能通 过类 似 的甚 至 可 能 是相 同的 Ｒ Ｓ ＩＣ分 子
中 圈分 类 号 ： ５ ２ Ｑ ２ 文献 标 识 码 ： Ａ
文章 编 号 ：０ ７５３ （０ ８ ０—０００ １ ０—０ ８ ２０ ） ３０ ９—４
近些 年 来 ， 类 发 现 了许 多 不 同 种类 的 ＲＮＡ 人 分 子 ， 中真核生物 中存 在 的两种 主 要非 编码 Ｒ 其 ＮＡ
ＱＵ ａ ｇ ｌ ＧＡＯ ｎ Ｚ Ａ０ ａ — ｏ ｇ， Ｃｈ ｎ —ｉ ｎ， Ｈｏ ｇ， Ｈ Ｂ ｏ ｈ ｎ ＣＨ Ｅ Ｃｈ ｏ Ｎ ａ
（ ｏｌｇ ｆ Ａｎｍａ ｃｅ ｃ ｎ ｅ ｈ ｏｏ ｙ，Ｙ ｎ ａ ｒｃ ｌｕ ａ ｎ ｖ ｒｉ Ｃ ｌ ｅ ｉ ｌＳ ｉ ｅａ ｄ Ｔ ｃ ｎ ｌ ｇ ｅ ｏ ｎ ｕ ｎ ｎ Ａｇ ｉｕ ｔ ｒ ｌＵ ｉｅ ｓ ｙ，Ｋｕ ｍｉｇ ， ｕ ｎ ｎ， ５ ２ １ Ｃ ｉａ ｔ ｎ ｎ Ｙ ｎ ａ ６ ０ ０ ， ｈｎ ）
Ａｂ ｔａ ｔ Ｔｈ ｎ ｅ ｔ ｎ ｃ ｕ ｅ ｙ ｂ ｃ ｅ ｉｌ ｔ ｉ ｆｌ ｈ ｓ ｂ ｃ ｍｉ ｇ ｏ ｅ ｏ ｈ ｏ ｔｃ ｍ ｍｏ Ｏ Ｏ ｏ ａ ｓｒ ｃ ： ｅ ｉ ｆ ｃ ｉ ａ ｓ ｄ ｂ ａ ｔ ｒａ ｈ ｂ ｏ ｉ ｏ ｗｉ ｍ ａ ｅ ｏ ｎ ｎ ｆｔ ｅ ｍ ｓ ｏ ｎ ｎ Ｓ Ｃ ｍｉ１ ｉ ｆ ｃｉ ｎ ａ ｄ ｇ ｉ ｅ ｕ ｈ ａ ｔ ｎ ｉ ｎ ｒ ｃ ｎ ｌ ｗｉｈ ｔ ｅ ｃ ａ ａ ｔ ｒｓ ｉｓ ｏ ｅ ｉｔ ｎ Ｏ ａ ｔｂ ｏ ｉｓ ａ ｄ ｄ ｆｉ ｕ ｔ ｎ ｅ ｔ ｎ ａ ｎ ｄ ｍ ｃ ｔ ｅ ｔｏ ｅ ｅ ｔｙ， ｔ ｈ ｈ ｒ ｃ ｅ ｉｔ ｆｒ ｓｓ ａ ｔ ｎ ｉ ｉ ｔｃ ｎ ｉ ｃ Ｉ ｏ ｃ ｔ ｆ
些 ｍｉ ＮＡ 的基 因序 列 、 Ｒ 加工 机 制 、 功能 等方 面的研 究表 明 ， 它们 具 有重要 的 调控功 能 ， 与生 物体 的抗 病 毒作用 、 某些 疾 病的发 生 和生长 发育 密切相关 ［ 。 ３ ］
１ ｍｉ ＲＮ Ａ
（ ａ ｎ ｒ ａ ｄｔ ｌｇ ｎ ）中控 制 发 育 时 序 的 ｌ ４ Ｃ ｅｏｈ ｂ ｉ ｓｅｅ ａ ｓ ｉ ｉ ｎ 基 因 ， 编码 一段 ２ ｐ长 的 ＲＮ 片断 ， 控 其靶 它 ２ｂ Ａ 调 基 因 ｌ ４和 ／ ８的表 达 ， 线 虫 的 发 育起 着重 ｉ １ ｎ ／２ ｎ 对
收 稿 日期 ：０ ７１—６ ２０ —２０ 作 者 简 介 ： 志敏 （９ ９ ） 男（ 族 ） 云 南 大理 人 ， 士研 究生 ， 要 从 事 人 兽 共 患病 学研 究 。 李 １７一 ， 彝 ， 硕 主
带 鬻 ＊
Ｐｒ ｇ ｅ ｓ ｏ ｃ ｅ ｉ ｌＢｉ ｆ ｌ ａ ｈｅ Ｍ ｅ ｈａ ｓ ｏ ｏ ｒ ｓ ｎ Ｂａ ｔ ｒａ ｏ ｉｍ ｎｄ ｔ ｃ ｎｉｍ ｆ Ａｎｔｂｉ ｔｃ Ｒｅ ｉ ｔ ｎ ｅ ｉ ｏ ｉ ｓｓ ａ ｃ
１ １ ｍｉ ． ＲＮＡ 的 特 征
要 作用 ；０ ０年 ， ２０ 又发现 了 ７基 因 ， 调控 其靶 基 因
／ １和 ｈｌ 的 表 达［ ］ 随 后 在 秀 虫 、 蝇 ／ ４ ｎ ｂ编码 的单链 小 Ｒ ＮＡ 分 子 ， 具 有 以下几个 显著 的特 点 ： 广泛 存 在 于真核 生物 中 ， ① 本身 不具有 开 放 阅 读框 （ ＲＦ ， Ｏ ） 是一 组 不 编码 蛋 白 质 的序列 ； 通 常长度 为 ２ ｐ ３ｂ ， 在 ３端 有 ② １ｂ ￣２ ｐ 但 ｔ １个 ～２个 碱 基 的 长度 变 化 （ Ｒ ｍｉ ＮＡ 具 体 长度 尚无 统一 标 准 ） ③ 成 熟 的ｍｉ ； ＲＮＡ５ 端 有 一 磷 酸 基 团 ，
单链 小 ＲＮＡ分 子 ， 生物进 化过 程 中保持 了 高度 的保 守性 ， 常 由 Ｄ ｃｒ酶从 具 有 发 夹二级 结 构 的 Ｒ 在 通 ｉ ｅ ＮＡ
前 体加工 而来 。ｍｉ ＲＮＡ 虽然微 小 ， 它在真核 生物发 育和基 因表 达 中通 过 与靶 ｍＲ 但 ＮＡ 形成 完全 或 不完全 互补 配对从 而扮 演着 重要 角色 。它们 参与动物 体发 育 、 细胞 增殖 与死 亡 、 细胞分化 、 素分 泌 、 瘤形成等各 激 肿 种 过程 。文章综述 了病毒 编码 的 ｍｉ ＮＡ 以及 ｍｉ Ａ 在 最新研 究 中的预 测 、 达和 功 能。 Ｒ ＲＮ 表 关键词 ： ＲＮＡ； ｍｉ 细胞毒性 Ｔ细胞 ；ｉ ＮＡ； 毒 学 ｓ Ｒ 病
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动 物医学进展 。Ｏ ８ ２ （ ） ９ 一３ ２ Ｏ ，９ ３ ：Ｏ９
Ｐｒ ｇ ｅ ｓ ｉ ｔ ｒｎａ ｙ Ｍ ｅ ｉ ｉ ｏ ｒ ｓ ｎ Ｖｅ ｅ ｉ ｒ ｄ ｃｎｅ
Ｍｉｒ ＲＮＡ 与 动 物 病 毒 性 疾 病 研 究 进 展 ｃｏ