运用定点突变提高重组木聚糖酶在毕赤氏酵母中的表达
猪胃蛋白酶原 A 基因密码子优化及在毕赤
猪胃蛋白酶原 A 基因密码子优化及在毕赤酵母中表达的研究摘要天冬氨酸蛋白酶一般被称为酸性蛋白酶,在酸性条件下可催化水解蛋白质,是目前重要的工业用酶之一。
胃蛋白酶属于天冬氨酸家族,是研究蛋白质结构与功能关系的重要模型。
胃蛋白酶广泛存在于脊椎动物胃液中。
胃蛋白酶经济价值高,用途广泛,胃蛋白酶在制革、方便食品、奶、口香糖加工制造等行业也有一定的用处。
目前,商业、医药途径获得的胃蛋白酶主要从动物胃组织中提取,受动物脏器资源的限制,胃蛋白酶价格较高;容易残留一些动物自身的蛋白酶类,如一些组织蛋白酶等。
而微生物反应器具有效率高效,操作简单,能够降低成本等优点,所以,通过筛选微生物反应器,然后规模化生产胃蛋白酶颇有发展前途.本文利用基因工程开展胃蛋白酶的表达研究,为解决这些问题提供了新的研究方向。
第一,根据Genebank上公布的猪胃蛋白酶原 A 基因序列,进行引物设计,通过RT-PCR克隆获得了湖北白猪胃蛋白酶原 A 基因cDNA全长,包括一个1158bp的读码框,编码385个氨基酸,其中N区包含15个氨基酸组成的信号肽,成熟的胃蛋白酶原A由370个氨基酸残基组成。
与J04601比较,结果表明核苷酸和氨基酸相似性分别为99.3%和98.7%。
序列已提交Genebank,登录号为EF108301。
第二,在猪胃蛋白酶原 A 克隆和序列分析的基础上,构建了毕赤酵母胞内表达载体pPIC3.5K-pA,电转化 GS115,通过纤维蛋白-醋酸洋红消化试验和干酪素琼脂平板法筛选出两株高表达菌株。
还研究了不同 pH、不同诱导时间、不同启始浓度和甲醇诱导浓度等因素对表达量的影响。
结果表明:在 pH7、诱导 72h、启始诱导浓度为 OD600 为 2、甲醇诱导浓度为 1%时,重组胃蛋白酶原表达量为56mg/L,比优化前提高了 1.7 倍。
WB 检测显示,重组蛋白具有正常的生物活性。
第三,根据毕赤酵母密码子的偏嗜性,利用定点突变,成功地对分布在基因的 C 区和 N 区两端的可能影响表达量的稀有密码子进行了优化, 希望能够进一步提高重组酵母表达量。
SOE-PCR在定点突变中的应用_百替生物
SOE-PCR在定点突变中的应用福建师范大学闽南科技学院生物工程专业122582005037魏慧娘指导教师:张彦定【摘要】重叠延伸剪接技术(Gene splicing by overlap extension,SOE)是一种通过DNA链的交错延伸而实现基因的拼接的分子生物学实验方法,可简单的将两个不同来源的DNA片段连在一起,广泛应用于产生突变基因、杂合基因、构建突变体库、融合基因,基因敲除等。
本文综述了SOE-PCR在基因的基因定点突变中的应用情况、该方法的利弊并展望了其应用前景。
【关键词】SOE-PCR;定点突变SOE-PCR技术是1989年由Horton等[1]提出的,即利用掺有预期改变的人工合成引物,通过多次扩增反应来完成,得到重组基因或嵌合基因;如果片段来源相同就可以得到基因长片段DNA,片段来源不同就可以形成融合基因[2]。
该技术的关键是使用了具有末端互补的引物对,特殊设计的PCR5’端寡聚核苷酸引物含有使重构基因所需的遗传物质改变的碱基渗入,如置换、插入、或缺失,就可通过重叠链延伸技术迅速地将突变基因引入内部造成基因突变,可获得依靠内切酶消化的方法难以得到的产物[3]。
与常用的定点突变的方法如寡聚核苷酸引文介导的定点突变、PCR介导的定点突变及盒式突变相比,重叠延伸技术作为PCR介导的定点突变技术之一可以再DNA区段的任何位点进行突变[4]。
本文主要对SOE-PCR在定点突变中的应用进行综述。
1、SOE-PCR的原理SOE-PCR的主要原理是采用特殊设计的寡聚核苷酸引物,在特定位置引入突变。
首先,设计一对含有突变位点的引物,如图1中的c、b这两条引物含有互补末端,两个重叠片段可以再随后的延伸反应中融合在一起,在设计如图1中的a、d两条外侧引物通过PCR将人融合产物扩增。
原则上,引物可沿着靶基因移动到任何地方引入突变。
因此含有引入突变基因片段可通过单体反应得到加长。
这种通过重叠延伸两个DNA片段融合为一得能力可进一步用于两个或是来两个以上异源基因DNA片段的剪接。
木聚糖酶XynGl-1在毕赤酵母中的表达及发酵条件优化
木聚糖酶XynGl-1在毕赤酵母中的表达及发酵条件优化王停停;郑宏臣;徐健勇;彭梦;刘逸寒;路福平;宋诙【期刊名称】《食品与发酵工业》【年(卷),期】2017(043)001【摘要】将来源于Paenibacillus campinasensis GI-1的木聚糖酶编码基因成功整合到毕赤酵母GS115基因组上,构建了高产木聚糖酶XynG1-1的毕赤酵母工程菌.采用响应面法对该工程菌的发酵条件进行优化.首先使用Design-Expert软件进行Plackett Burman实验设计筛选出影响产酶量的3个主要因素,即甲醇含量、生物素含量和培养时间.在此基础上使用Design-Expert软件进行Box-Behnken实验设计,通过响应面分析得出优化的发酵培养条件为:甲醇含量2.28%,培养时间37.29 h,生物素4 mg/L,酵母粉20 g/L,蛋白胨20 g/L,YNB 30 g/L,装液量100 mL/L,转速250 r/min、温度28℃、磷酸缓冲液pH6.0.经实验验证,优化后的培养条件下胞外重组酶活达到707.2 IU/mL,与响应面预测结果一致,较优化前木聚糖酶酶活提高了7.9倍,较原始菌株产酶量提高了19.8倍.经10 L发酵罐扩大培养之后,重组木聚糖酶的酶活达到2 703 IU/mL.因此,该研究有效提高了木聚糖酶XynG1-1的发酵产量,并且,该重组酶保持了良好的酶学性质,可为工业化生产及应用奠定基础.【总页数】7页(P37-43)【作者】王停停;郑宏臣;徐健勇;彭梦;刘逸寒;路福平;宋诙【作者单位】天津科技大学生物工程学院,天津,300457;中国科学院天津工业生物技术研究所,工业酶国家工程实验室,天津,300308;中国科学院天津工业生物技术研究所,工业酶国家工程实验室,天津,300308;中国科学院天津工业生物技术研究所,天津工业生物系统与过程重点实验室,天津,300308;中国科学院天津工业生物技术研究所,工业酶国家工程实验室,天津,300308;中国科学院天津工业生物技术研究所,天津工业生物系统与过程重点实验室,天津,300308;天津科技大学生物工程学院,天津,300457;中国科学院天津工业生物技术研究所,工业酶国家工程实验室,天津,300308;天津科技大学生物工程学院,天津,300457;天津科技大学生物工程学院,天津,300457;中国科学院天津工业生物技术研究所,工业酶国家工程实验室,天津,300308;中国科学院天津工业生物技术研究所,天津工业生物系统与过程重点实验室,天津,300308【正文语种】中文【相关文献】1.蚓激酶基因在毕赤酵母中的表达及其发酵条件优化 [J], 江鹏;汤斌2.葡萄糖醛酸木聚糖酶在枯草芽孢杆菌中的表达及发酵条件优化 [J], 郭亚兰;周雨朦;吴斌;何冰芳3.木聚糖酶xynZF-318在枯草芽孢杆菌WB600中的表达及发酵条件优化 [J], 田艳杰;宋兆祥;马振武;王朝阳;徐佳;周晨妍4.耐碱性短小芽孢杆菌木聚糖酶在枯草杆菌中的表达及发酵条件优化 [J], 周煌凯;龚月生;杨明明;张云雁;宋秀平5.蜡样芽孢杆菌M22超氧化物歧化酶(SOD)基因在毕赤酵母中的表达及其发酵条件优化 [J], 王爽;齐俊生;付学池;王琦;梅汝鸿因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
毕赤酵母表达系统原理
毕赤酵母表达系统原理《毕赤酵母表达系统那点事儿》嘿,朋友们!今天咱来唠唠毕赤酵母表达系统。
这玩意儿可有意思啦!你看啊,毕赤酵母就像是一个神奇的小工厂。
它呀,能把我们想要的东西给生产出来。
想象一下,它就像一个勤劳的小工匠,在自己的小天地里忙忙碌碌。
这个小工厂有自己的一套工作流程呢。
首先,我们得把我们需要表达的基因送进去,就好像给小工匠下达一个任务订单。
毕赤酵母接收到这个基因后,就开始开动啦。
它会利用自己身体里的各种零部件和原材料,一点一点地把这个基因表达出来,变成我们想要的蛋白质。
它可厉害了,能生产出各种各样的蛋白质。
就像一个万能的大厨,不管你要做什么菜,它都能给你做出来。
而且啊,它做出来的东西质量还挺高。
毕赤酵母还有个优点,就是它比较好养活。
不需要特别复杂的条件,给它点吃的喝的,它就能茁壮成长。
这就像咱家里养的小宠物,只要你稍微照顾一下它,它就能给你带来很多欢乐。
不过呢,毕赤酵母也不是完美的啦。
有时候它也会出点小差错,就像人一样,偶尔也会犯点小迷糊。
但这并不影响它的可爱和实用呀。
在实际应用中,毕赤酵母表达系统可是帮了大忙呢。
比如说在生物医药领域,很多药物的生产都离不开它。
它就像一个幕后英雄,默默地为我们的健康贡献着力量。
我记得有一次,我在实验室里研究一个项目,就是用毕赤酵母表达系统来生产一种蛋白质。
那时候真是费了不少心思,不断地调整各种条件,就盼着能得到高质量的产物。
经过一番努力,终于看到了成果,那一刻的心情真是无法用言语来形容。
总之呢,毕赤酵母表达系统是个很有趣也很有用的东西。
它虽然小小的,但却有着大大的能量。
它就像一颗闪亮的星星,在科学的天空中绽放着自己的光芒。
我们要好好利用它,让它为我们创造更多的价值呀!。
定点突变巴曲酶在毕赤酵母中的克隆与表达
J unl f NAKE ( c ne8 NA ueaeKE el ) o ra o S S i c L e tr r yt hat o h
21 0 1年 第 2 卷 第 2期 3
Vo. 3No 2 2 1 12 . ,0 1
定 点 突变 巴 曲酶 在 毕 赤 酵 母 中的 克 隆 与 表 达
Ab ta t Ob e tv I r e oa od s c ee a r x bn e p e s di . ih aX一 3 b ig sr c : j cie n o d rt v i e r td b to o i x rs e p p c i 3 en a e st . M e h d Th u a tg n f b t o o i s co e t x to s e m t n e e o a r x b n wa l n d i o e — n
hy o yss by Ke r e s t ne o a r xo n, hr m b n lke e z me ofba hr ps a — dr l i x2 p ot a e, he ge f b t o bi a t o i -i n y t o t
En y e,n Pi hi a t rs b v r a t nso n m e, i I a p s o i y Ov l p Ex e i n PCR z i ’ C cI e
W ANG n —ig XU iL Ho gyn , Me, AN i ig YANG Yu Z Ha yn , — , HANG Ho gj , n - e i
p e son v c o PI r s i e t r p CZa a r ns e e n o Pihi a t r s X一 3 A nd t a f r d i t c a p s o i 3 .The r c m b n nt mut nt eo ia a ba r ob n wa e a a e n urfe r m e me a i n lq i s owi g i tox i s s p r t d a d p ii d f o f r nt to i u d, h n mm u l ia n no og c la d e z me a tv t s e n bl t i g a a yss a d fbrno e — l t i s a e pe tve y n y c i iy by we t r — o tn n l i n i i g n c o tng a s y r s c i l .The mol c a i ht i a ou 3 . kD S - e ul rwe g s b t 2 0 by DS PAGE a a y i. n l s s Re u t Th o c i f s ls e pr du ton o
猫血清白蛋白重组蛋白及其在毕赤酵母中的表达方法
猫血清白蛋白重组蛋白及其在毕赤酵母中的表达方法
猫血清白蛋白重组蛋白是一种重要的生物活性蛋白,具有多种生物学功能,如维持血浆渗透压、运输物质、免疫防御等。
在毕赤酵母中表达猫血清白蛋白重组蛋白,有助于研究该蛋白的结构和功能,并为生物制药、生物材料等领域提供重要资源。
猫血清白蛋白重组蛋白在毕赤酵母中的表达方法如下:
1. 基因克隆:首先从猫基因组数据库中获取猫血清白蛋白基因序列,通过 PCR 扩增得到目的基因。
然后,将目的基因与毕赤酵母的穿梭载体(如 pPICZα)进行重组,构建表达载体。
2. 转化毕赤酵母:将构建好的表达载体转化到毕赤酵母细胞中,通过筛选抗性平板得到转化子。
3. 诱导表达:在含有一定浓度诱导剂(如甲醇)的培养基中,培养转化子,诱导目的蛋白的表达。
甲醇诱导剂可以激活重组蛋白的表达,且在一定范围内,甲醇浓度越高,表达量也越高。
但过高的甲醇浓度会影响酵母的生长。
4. 蛋白纯化:诱导表达后的酵母细胞经过破碎、离心等步骤,获取含目的蛋白的的上清液。
然后,利用离子交换层析、凝胶过滤等方法对目的蛋白进行纯化。
5. 活性鉴定:对纯化的猫血清白蛋白重组蛋白进行活性鉴定,检测其在生理功能方面的表现,如抗氧化、抗炎等。
6. 应用:猫血清白蛋白重组蛋白在生物制药、生物材料等领域具有广泛应用前景。
例如,它可以作为生物制药的原料,用于治疗疾
病;也可以作为生物材料,用于组织工程和再生医学等。
总之,通过以上方法,可以在毕赤酵母中表达猫血清白蛋白重组蛋白,并进行纯化和活性鉴定。
这为研究猫血清白蛋白的结构和功能,以及将其应用于生物制药、生物材料等领域奠定了基础。
毕赤酵母中外源蛋白表达量的提升策略
毕赤酵母中外源蛋白表达量的提升策略
茹扎·也里扎提;杨宇
【期刊名称】《生物技术通报》
【年(卷),期】2024(40)3
【摘要】利用异源重组表达系统表达外源蛋白是基因工程研究的重点。
巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)是一种甲基营养型酵母,由于其易于遗传操作、高水平分泌外源蛋白、翻译后修饰等特点,已成为工业应用中蛋白质生产的重要菌株,常被用于酶制剂的生产。
然而,部分外源蛋白在毕赤酵母系统中的表达水平较低,仍有待提升的空间。
因此,进一步探索提升毕赤酵母中外源蛋白表达量的原理和方法,将对降低毕赤酵母表达系统工业化生产成本,提高经济效益,具有重要的意义。
本文主要从基因水平、转录水平、翻译水平、折叠分泌水平、抗逆水平、发酵工艺六个方面归纳总结了近年来毕赤酵母提高外源蛋白表达的优化策略的研究进展,旨在为提高外源蛋白在毕赤酵母表达系统中的表达水平提供有益参考。
【总页数】17页(P118-134)
【作者】茹扎·也里扎提;杨宇
【作者单位】北京理工大学生命学院
【正文语种】中文
【中图分类】TS2
【相关文献】
1.外源蛋白在毕赤酵母中的高效表达策略
2.巴斯德毕赤酵母高效表达外源蛋白的策略
3.巴斯德毕赤酵母表达外源蛋白的优化策略
4.基于提高蛋白在内质网中折叠效率的策略促进外源蛋白在毕赤酵母中表达水平的研究进展
5.毕赤酵母高效表达外源蛋白的分子水平策略
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定点突变和饱和突变
定点突变和饱和突变是两种常用的蛋白质工程技术,它们都可以改变目标基因的序列,从而影响蛋白质的结构和功能。
但是,这两种技术也有很大的不同,主要体现在以下几个方面:突变的范围定点突变是指在目标基因的特定位点上,引入预先设计好的碱基替换、插入或缺失,从而产生特定的氨基酸替换、添加或删除的突变体。
定点突变的目的是根据已有的关于蛋白质结构、功能、催化机理等信息,有目的地改变蛋白质性能或特异性。
饱和突变是指在目标基因的某一位点或某几个位点上,将原来的碱基替换成所有可能的其他碱基,从而产生所有可能的氨基酸替换的突变体。
饱和突变的目的是探索蛋白质功能和结构之间的关系,以及寻找具有改善或新颖性能的蛋白质突变体。
因此,定点突变是一种有选择性的突变技术,它只改变目标基因中感兴趣的部分;而饱和突变是一种无选择性的突变技术,它改变目标基因中所有可能的部分。
突变的方法定点突变通常采用PCR方法来实现,即利用合成的含有突变碱基的引物来扩增目标基因片段,并将其克隆到载体中。
这种方法虽然能够在特定位点引入特定碱基突变,但一次只能引入一种突变碱基,若进行饱和突变需要合成多条突变引物。
这样做既费时又费力,而且容易出错。
饱和突变则采用其他更高效和简便的方法来实现,比如使用简并密码子、随机引物、DNA重组等技术。
简并密码子是指可以编码多种氨基酸的密码子,比如NNK或NNS(N表示任意碱基,K表示G或T,S表示G或C),它们可以编码20种氨基酸中的19种(除了色氨酸)。
随机引物是指含有随机碱基序列的引物,它们可以产生各种不同组合的密码子。
DNA重组是指利用限制性内切酶、连接酶等酶来切割和连接不同来源或不同位置的DNA片段,从而产生新型DNA序列。
这些方法都可以在目标基因上产生大量不同类型和位置的突变,并且操作简单快速。
突变的效果定点突变和饱和突变对蛋白质性能和稳定性的影响也不尽相同。
定点突变通常是根据已知信息进行设计和预测的,因此它们往往能够达到预期的效果,比如增强或减弱蛋白质活性、改善或降低蛋白质亲和力、增加或减少蛋白质稳定性等。
普鲁兰酶基因在毕赤酵母中组成型表达及定点突变研究
普 鲁 兰 酶 基 因在 毕 赤酵 母 中组 成 型 表 达 及 定 点 突 变 研 究
吴丽双 ,田 健, 郑 甲 , 郭 宁 ,王玉光 ,周洪波
( 中南 大 学 资 源加 工与 生物 工程 学院 ,长 沙 4 1 0 0 8 3 )
摘 要: 合成 B a c i l l u s a c i d o p u l l u l y t i c u s的全长普鲁 兰酶基 因并在 毕赤酵母 x. 3 3中进行组 成型外分 泌表达 , 重组酶 的
d e c r e a s e o f t h e s p e c i i f c a c t i v i t y o f t h i s p u l l u l a n a s e w a s s e e n u p o n t h e r e p l a c e me n t o f A l a L e u( 6 2 5— 6 2 6 )b y L e u T y r .H o w e v e r , t h e
了一 定 的 理 论 和 实验 基 础 。
关键词 : 普 鲁 兰酶 ; B a c i l l u s a c i d o p u l l u l y t i c u s ; 毕 赤酵母 ; 定点突变
中 图分 类 号 : Q 7 S 文献标识码 : A 文章编 号 : 2 0 9 5—1 7 3 6 ( 2 0 1 3 ) 0 5—0 0 1 0— 0 4
Th e c o n s t i t u t i v e e x p r e s s i o n o f g e n e e n c o d i n g p uU u l a na s e i n Pi c hi a pa s t o r i s a n d s i t e - d i r e c t e d m ut a g e n e s i s
碱性木聚糖酶在毕赤酵母的表达及酶学性质研究
碱性木聚糖酶在毕赤酵母的表达及酶学性质研究熊科;杨玉焕;闫子祥;王晓玲;李秀婷【期刊名称】《食品与发酵工业》【年(卷),期】2015(041)003【摘要】将教酒链霉菌L1105第10家族碱性木聚糖酶基因去除纤维素结合域(CBD)后将功能结构域基因xyn-AeSC克隆到毕赤酵母表达载体.经筛选得到重组工程菌GS1153-20,用甲醇诱导后产酶活力达到最高683±9U/mL.结果表明,重组木聚糖酶的最适pH为7.2,且在pH 6.2 ~8.6有较高的相对酶活;其最适温度为70℃,40~60℃时相对酶活力都在70%以上;重组酶XynAeSC以燕麦木聚糖为底物时,酶活力最高,相对酶活力为桦木的259.7%±10.7%;对甘蔗渣木聚糖的酶活力最低,只有对桦木木聚糖酶活的16.0%±1.5%.研究表明,碱性木聚糖酶基因成功地在毕赤酵母中表达,且去除CBD域后,其酶学性质并未改变.【总页数】6页(P33-38)【作者】熊科;杨玉焕;闫子祥;王晓玲;李秀婷【作者单位】北京市质量与安全重点实验室,北京,100048;北京市食品添加剂工程技术研究中心,北京,100048;北京市质量与安全重点实验室,北京,100048;北京市风味化学重点实验室,北京,100048;北京市质量与安全重点实验室,北京,100048;北京市风味化学重点实验室,北京,100048;北京市质量与安全重点实验室,北京,100048;北京市风味化学重点实验室,北京,100048;北京市质量与安全重点实验室,北京,100048;北京市风味化学重点实验室,北京,100048【正文语种】中文【相关文献】1.突变木聚糖酶基因xynIIC~*在毕赤酵母中的表达及酶学性质研究 [J], 周晨妍;王武;邬敏辰2.短小芽孢杆菌木聚糖酶基因在毕赤酵母中的分泌表达及酶学性质研究 [J], 江正兵;宋慧婷;马立新3.嗜热绿色糖单孢菌木聚糖酶XyN10A基因在毕赤酵母中的分泌表达及其酶学性质研究 [J], 玉王宁;金一;谢响明;刘伟娜;郑菲;厚凌宇;王晓宇;梁迪;王伟轩;张朔;柳静言4.碱性木聚糖酶产生菌的筛选、XynG1-3基因克隆表达及酶学性质研究 [J], 郑宏臣;刘逸寒;刘晓光;韩杨;王建玲;路福平5.短小芽孢杆菌碱性β-葡萄糖苷酶在毕赤酵母中的表达及酶学性质研究 [J], 阚劲松; 张敏; 徐涛因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
运用定点突变提高重组木聚糖酶在毕赤氏酵母中的表达
运用定点突变提高重组木聚糖酶在毕赤氏酵母中的表达
陆健;曹钰;陈坚
【期刊名称】《微生物学报》
【年(卷),期】2002(042)004
【摘要】运用PCR介导的定点突变对米曲霉(Aspergillus oryzae)来源的木聚糖酶在毕赤酵母中的重组表达进行了研究,获得一表达量远远高于亲本的突变株
I156A,对其进行了提纯并研究其酶学特性,除热稳定性外其余与亲本基本一致.突变株I156A所产木聚糖酶XynFl的分子量为35kD,在pH 4~9范围内稳定,最适pH 为7.0,最适温度为45℃,在50℃以下稳定性略高于亲本.
【总页数】6页(P425-430)
【作者】陆健;曹钰;陈坚
【作者单位】江南大学生物工程学院工业生物技术教育部重点实验室,无锡,214036;江南大学生物工程学院工业生物技术教育部重点实验室,无锡,214036;江南大学生物工程学院工业生物技术教育部重点实验室,无锡,214036
【正文语种】中文
【中图分类】Q933
【相关文献】
1.4Aβ15基因在毕赤氏酵母中的分泌表达及初步纯化 [J], 谭琳;谭昕;周鹏;姚志彬
2.深黄被孢霉Δ6-脂肪酸脱氢酶基因在毕赤氏酵母SMD1168中表达的研究 [J], 王长远;全越;沈冰蕾;姚笛;于长青
3.一种提高大肠杆菌植酸酶异源表达的巴斯德毕赤氏酵母发酵策略 [J], ChenCC;龚家玮;朱春宝
4.突变型hGM-CSF在毕赤甲醇酵母中的分泌表达 [J], 杨红;欧阳克清;郭芝刚;李新平;陈云高;蔡绍皙
5.表达于甲醇营养型巴斯德毕赤氏酵母中的重组雪花莲凝集素(GNA)的大规模生产和纯化 [J], BaumgartnerP;袁宁;朱春宝
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桔青霉木聚糖酶基因克隆及其在毕赤酵母中的表达及活性分析
桔青霉木聚糖酶基因克隆及其在毕赤酵母中的表达及活性分析田谷;顿宝庆;王智;李维维;许修宏;李桂英【摘要】通过同源序列PCR克隆的方法,获得桔青霉(Penicillium citrinum)CR-2菌株的木聚糖酶编码基因xyl,该基因全长984 bp,编码327个氨基酸,无内舍子序列,具有完整开放阅读框.其编码的氨基酸序列N端具有一段包含19个氨基酸的信号肽序列,并具有糖基水解酶第10家族(GH10)的保守催化域特征,推测该酶属于第10家族成员.将该基因与毕赤酵母表达载体pPIC9相连接构建重组载体pPIC9-XYL,电击转化至毕赤酵母GS115菌株中.挑选阳性重组子经测序、酶活性以及SDS 电泳分析表明,xyl基因成功在毕赤酵母中分泌表达,重组酶活性可达214.15 IU/mL.该重组酶最适温度与最适pH分别为50℃和4.5,且具有良好的pH和热稳定性.【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2012(000)006【总页数】7页(P87-93)【关键词】桔青霉;木聚糖酶;毕赤酵母;酶学性质;表达【作者】田谷;顿宝庆;王智;李维维;许修宏;李桂英【作者单位】中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程中国农业科学院生物质能源研究中心,北京100081;东北农业大学生命科学学院,哈尔滨150030;中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程中国农业科学院生物质能源研究中心,北京100081;中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程中国农业科学院生物质能源研究中心,北京100081;中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程中国农业科学院生物质能源研究中心,北京100081;东北农业大学生命科学学院,哈尔滨150030;东北农业大学生命科学学院,哈尔滨150030;中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程中国农业科学院生物质能源研究中心,北京100081【正文语种】中文半纤维素是自然界纤维素类生物质资源中含量第二的多糖,仅次于纤维素的含量[1]。
突变型猪表皮生长因子在毕赤酵母中的表达的开题报告
突变型猪表皮生长因子在毕赤酵母中的表达的开题报告摘要:突变型猪表皮生长因子(EGF)在人类医学领域中具有广泛的应用,因此研究其表达在不同宿主中的效果具有重要意义。
本研究旨在探究突变型猪EGF在毕赤酵母中的表达效果,为未来研究其功能和应用提供基础。
采用基因工程技术将突变型猪EGF 合成进入毕赤酵母基因组,利用荧光显微镜观察重组毕赤酵母中EGF的表达情况,并进行蛋白质分析。
实验结果表明,在毕赤酵母中成功表达突变型猪EGF蛋白,且其分子量与理论值相符。
实验成果为后续研究突变型猪EGF在毕赤酵母中的生物学活性及其应用提供了基础。
关键词:突变型猪表皮生长因子;毕赤酵母;基因工程;表达;蛋白质引言:突变型猪表皮生长因子(EGF)是一种高度保守的多肽激素,对动物和人体皮肤细胞的增殖、分化和成熟具有协同作用。
在医学领域中,EGF在移植、创伤、癌症和组织修复等方面具有广泛的应用价值。
随着基因工程技术的不断发展,研究突变型猪EGF在不同宿主中的表达效果及其生物学活性已成为一个热门研究课题。
毕赤酵母是一种广泛应用于基因工程领域的模式微生物,其具有生长快、操作简单、基因编辑方便等优点,因此被广泛应用于外源蛋白质表达领域。
本研究旨在探究突变型猪EGF在毕赤酵母中的表达效果和蛋白质特性,为进一步研究其功能及应用奠定基础。
材料与方法:材料:突变型猪EGF基因、毕赤酵母YPH499菌株。
方法:将突变型猪EGF基因合成入毕赤酵母基因组,并通过选择性培养筛选出重组菌株。
将重组毕赤酵母接种进LB液体培养基中,利用荧光显微镜观察EGF在毕赤酵母中的表达情况。
利用SDS-PAGE蛋白质电泳技术对EGF蛋白质进行分析,并通过Western blot检测其表达量和特异性。
结果与讨论:利用基因工程技术成功将突变型猪EGF基因合成入毕赤酵母基因组。
通过选择性培养筛选出两个能够表达EGF蛋白的重组菌株。
经过显微镜观察,发现重组毕赤酵母中EGF融合蛋白表达量较高,荧光信号强烈。
一种利用树干毕赤酵母固态发酵生产木聚糖酶的方法
一种利用树干毕赤酵母固态发酵生产木聚糖酶的方法植物纤维素富含木聚糖,这是一种可溶于水的多糖,可以提供糖分和能量给生物体。
而木聚糖酶则可以将木聚糖分解为各种单糖,因此在生物制造、化学和环境领域有着广泛的应用。
本文讨论了一种利用树干毕赤酵母固态发酵生产木聚糖酶的方法。
首先,我们需要了解什么是毕赤酵母。
毕赤酵母,也称“木质素分解真菌”,是一种在自然环境中广泛存在的真菌。
它主要生长在植物表面、土壤和水中,可以分解植物纤维素和木质素。
毕赤酵母通过培养和生长,可以大量生产木聚糖酶。
毕赤酵母固态发酵的方法是种植毕赤酵母菌株在物理或化学反应器内,以自然或添加的固态基质为生长基质进行发酵。
该方法比传统的液体发酵方法更加高效,环保和经济。
目前,毕赤酵母固态发酵已经被证明是一种可行的生产木聚糖酶的方法。
接下来,我们将详细介绍毕赤酵母固态发酵生产木聚糖酶的步骤。
1. 筛选毕赤酵母菌株用一定方法筛选出适合固态酵素生产的毕赤酵母菌株。
在此过程中,考虑到毕赤酵母的生长条件需要有更好的适应性,因此将根据原始环境,筛选生长适应性更强的毕赤酵母菌株。
2. 选取适合的基质调配好相应的培养基,选择适合的固态基质,为毕赤酵母生长和繁殖提供营养,促进木聚糖酶的产生。
同时要确保基质的来源和化学成分、水分、酸碱度都能达到适宜的水平,以保证所生产出的木聚糖酶的纯度和活性。
3. 倒放法在倒放法中,先将经过有效灭菌处理的基质填充到反应器中,然后加入所筛选出的毕赤酵母菌株。
接着,进行表面打平,以保持反应器顶部平整。
4. 发酵条件使反应器维持一定的温度和湿度,具体的温度范围和湿度数值取决于毕赤酵母菌株和所选取的基质类型。
同时,要保证反应器内部通风良好,这可以帮助加速生长和减少气泡的产生以及发酵筛选条件的优化。
5. 收取、组织提取与测定当反应到达一个指定的时间段后,可以进行对所生产出的木聚糖酶的收获。
在此过程中,采取先将基质采获,然后进行适当的干燥以控制其湿度量,并用适量的缓冲液提取酵素,接着才作为酵素来为后续项目的进行提供所需的需要。
枯草芽孢杆菌木聚糖酶Xyn B在毕赤酵母中的表达
枯草芽孢杆菌木聚糖酶Xyn B在毕赤酵母中的表达莫毅;梁方方;赖志强;卢玉发;廖玉英;何仁春;黄丽霞;杨琳【摘要】编码枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis strain GD3b)木聚糖酶(XylanseB,XynB)基因从重组载体pUC-Xyn B中切割,并克隆到pPICZa A载体中,经酶切和测序鉴定,成功构建了分泌型毕赤酵母表达载体pPICZa-Xyn B.载体经线性化后转入毕赤酵母X-33,并筛选获得可通过甲醇诱导分泌表达XynB重组蛋白的毕赤酵母工程菌X-33/Xyn B.【期刊名称】《中国饲料》【年(卷),期】2012(000)009【总页数】3页(P19-21)【关键词】木聚糖酶;毕赤酵母;表达;重组蛋白【作者】莫毅;梁方方;赖志强;卢玉发;廖玉英;何仁春;黄丽霞;杨琳【作者单位】广西人口和计划生育研究中心;广西畜牧研究所;广西畜牧研究所;广西畜牧研究所;广西畜牧研究所;广西畜牧研究所;广西畜牧研究所;华南农业大学动物科学学院【正文语种】中文【中图分类】S816.7木聚糖酶能够降解饲料中的木聚糖,提高饲料利用率,降低畜禽肠道内饲料的黏度,从而提高饲料的有效能值和改善动物消化道的内环境,促进动物生长(张晓晖等,2007)。
但由于从自然环境中筛选所获得的木聚糖酶产生菌存在产量低,木聚糖酶不易分离纯化、稳定性差、不同来源的酶适应性不同等不足,在一定程度上限制了木聚糖酶的动物饲料添加剂中的实际应用(阮同琦等,2008;陈丛瑾等,2007)。
毕赤酵母(Pichia pastoris)是一种高效的真核表达系统,该系统不仅克服了原核表达系统产物不易分离纯化和不能保持重组蛋白活性等缺点,且可对翻译后的蛋白进行适度糖基化修饰、折叠、加工,使生产的蛋白具有天然的高级结构及生物学活性(Anjali等,2009;Su 等,2007)。
此外,毕赤酵母具有遗传稳定性强,外源蛋白的表达基因操作简单、外源蛋白能正确加工与修饰、表达量高、易大量发酵培养、内源性蛋白分泌少和易纯化等优点,使得毕赤酵母成为目前应用较广的分泌型真核表达系统(Cereghino和 Cregg,2000)。
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重组质粒 !"#$%&’()*+, 经 !"# !切割, 采用表达系统推荐的原生质体法转化巴斯德 毕赤氏酵母 -.,,/, 在不含组氨酸的再生平板 012 上随机挑选 344 个克隆子。经同步培 养后, 鉴定转化子的 -5,6 抗性, 从中挑选具有较高抗性的转化子, 并在含有 022’木聚糖 (0789:;< 2=><<>9*? 2<@7 0’1’()<9*, 的平板上培养鉴定。在研究过程中发现突变 .>A89 公司) 株 #,/BC 的 -5,6 抗性浓度为 4D/8A E 8F, 远低于亲本的 -5,6 抗性浓度 ,DG/8A E 8F。由于 因而也反映了重组质粒的整 -5,6 抗性水平大致依赖于所整合的细菌卡那霉素基因数目, 合拷贝数。由此可知, 突变株的整合拷贝数低于亲本。 !"# 培养和纯化 (突变株) 和未突变的 $%&’ , 基因的转化子 (亲本 将含有突变的 $%&’ , 基因的转化子 或出发菌株) 在 2HHI 培养基上摇瓶培养, 并每天补加 /8F E F 的甲醇诱导表达。 测定摇瓶培养上清液中的木聚糖酶含量, 发现突变株的产酶单位远远高于出发菌株 的产酶单位。在以考马斯蓝染色的突变株上清液蛋白凝胶电泳中能非常清晰地看到一条 约 J/K1 的谱带, 而亲本则很难辨认 (图 J) , 这表明突变株木聚糖酶的分泌表达量远高于 亲本; 但同时发现突变株的粗酶液很快地丧失活力, 考虑到高密度发酵胞外蛋白浓度很高 时, 毕赤氏酵母分泌的蛋白酶浓度也相应提高, 分泌的外源蛋白会遭到一定程度的降解, 因而有必要提纯木聚糖酶。
胞购于日本 MHNHOH JPQR=B 公司, 毕赤酵母表达 IQE 购于 4STQEO=&AS 公司, 并依据其推荐的方 案采用原生质体法进行转化。 !’% 质粒 +,-./01234! 的构建 米曲霉在麦麸培养基上培养 8U, 用 GQ))=S &ASA 公司的 4D=&AS 制备米曲霉 @42’$1 的 并用 <@GL 快速制备 IQE ( "PHO<HVQH 公司) 纯化, 然后用 JGL@M "6@ V#GL 合成 IQE <@GL, (6>=SEAVP 公司) 合成米曲霉的 V#GL, 并利用反转录 "6@ 法扩增编码米曲霉 !"#$ ’ 基因。 [+] 根据 IQEH<=E= 等人 对 !"#$ ’ 基因的报道设计的两条寡核苷酸引物如下, 分别与 WCS5> 的 $+ X 8$ 氨基酸和 8$K X 8$$ 氨基酸同源。 JASDA."’: -Y.6//LLMM6/6L/66/66L/6LM. (含 %&’ @ ! 酶切位点) , 6LLM/LM/.8Y LSEQDASDA."$: -Y.ML///6//66/6MML6L/L/6LM6/L (含 (’) !酶切位点) , 扩增后的片段克隆至质粒 )"46ZI。 M/LM.8Y ! ’ & 定点突变
[1 5 <] 基础研究, 克隆了其中一些并在原核和真核中进行了同源或异源重组表达 。
目前毕赤酵母表达系统是倍受关注的真核表达系统, 它不仅具有可诱导的强启动子 ()Q=’) , 而且外源基因整合于染色体上, 可防止重组工程菌的退化, 并且具有高密度发酵 等特点, 因而正在成为外源基因表达的常用表达系统。 研究发现, 米曲霉 ( !"#$.&’(()" *%+,-$ ) 来源的木聚糖酶基因 /+01 1 在毕赤酵母中重组 表达时, 重组酶的催化活性非常低。本文对重组表达于毕赤氏酵母的木聚糖酶 =>?@’ 运 用 89: 介导的定点突变, 提高重组酶的酶活水平, 并研究了酶学性质。
3期
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健等: 运用定点突变提高重组木聚糖酶在毕赤氏酵母中的表达
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凝胶电泳
使用 ./0 聚丙烯酰胺凝胶 (日本第一化学公司) , !"!#$%&’ 按照 ()*++,- 方法进行, 银染色或考马斯亮蓝染色。琼脂糖凝胶浓度为 .0 , 紫外摄影。 .// 伏电泳, !"$ 温度和 12 的影响及稳定性 按木聚糖酶活测定方法在 123 4 5, 657 8 557 以及 125 8 9, 3/7 分别测定重组木聚糖 酶的酶活, 以考察酶的最适作用温度和 12。 将酶液在它们的最适温度 (最适 12 条件) 下分别在不同 12 (不同温度) 下保持 .:, 考 察酶的 12 稳定性和耐热稳定性。 ! " !% 米氏常数 ! + 的测定 在 3/7 123 4 5 的醋酸缓冲液中, 底物浓度从 ;+<=+( 增大至 .;>5+<=+( 测定酶反应 的初速度。
[K] 进行定点突变操作。用于突变的寡核苷酸由 /ASA LDDA<[>AO 根据 *Q&BVPQ 的方法 ("PHO<HVQH 公司) 合成, 根据与 WCS5> 同属于一家族木聚糖酶的氨基酸序列比较, 设计的突
变引 物 如 下 所 示( 带 有 下 划 线 部 分 为 替 换 的 核 苷 酸 ) ,4’-+L:-Y./L6/MM/M. 6LL6/L//66MM6/LM/L//L6//6.8Y。 !"5 木聚糖酶酶活的测定 木聚糖酶酶活的测定方法如下: %9$<( 适当稀释的酶液加入到已在 0%\ 保温过的 ( ]O=< =HE D)A>ED, 和 %98<( >%%<<=> ^ ( )*09- 醋酸盐缓冲液, %9-<( 的 $F 木聚糖 JQ&<H 公司) 释放出的糖按照 J=<=&CQ.GA>D=S 法在 -%%S< 处测定。酶活单位定义: 在 0%\ 反应 8%<QS, (木糖) 为 ’ 活性单位 (_) 。 )*0 , -, 0%\ 每分钟产生 ’ <=> 产物 " !’6 重组木聚糖酶的纯化 将含有突变重组质粒的毕赤氏酵母在完全培养基 !"# 上 8%\ 预培养 $% P, 再接种于 离心收集上清液。浓缩后的上清液经过 MJI /$%%%J‘ 233! 培养基 8%\ 摇瓶培养 1%P, ($’9-<< : +%%<<, 日 本) 凝 胶 色 谱 柱, 用 0%<<=>?( )*+ , - 磷 酸 缓 冲 液 (含 M=D=P 公 司, 的 ) 洗脱, 收集有活力的组分, 浓缩后进样至阴离子交换柱 ( %9$<=>?( GH6> "=O=D *a?3, 日本) , 用 0%<<=>?( )*-9% 醋酸缓冲液 (含 ’9%<=>?( 的 09+<< : ’%<<, "AOJA)EQTA 2Q=DCDEA<D, 进行梯度洗脱, 收集活力峰。 GH6>)
随着经济和科技的发展, 环境和资源问题越来越引起人们的关注, 半纤维素中的木聚糖 约占纤维物质的 1<I 5 7#I 。木聚糖的完全降解需要木聚糖酶和木糖苷酶的协同作用, 其 中木聚糖酶 (1, 以内切方式水解木聚糖分子中的 ! !6 6B6J>’K? J>’K?&L>MN&’K,O, P9 7( "( 1( $) 6 ! 是一类重要的半纤维素酶。人们对各种微生物来源的木聚糖酶展开了各方面的 !糖苷键, 1,
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材料和方法
菌株
大肠杆菌 DR1#1、 巴斯德毕赤氏酵母 ( 2’34’-#-".*%’" ) ( LT,!) 及表达质粒 C8;92U 购 S/’’< 于美国 ;.%;0:QSP. 公司, 米曲霉 ( !"#$%&’(()" *%+,-$ ) :;R’"$ 日本国税厅酿造研究所保藏, 分别在 7EG 、 酵母和米曲霉。 7#G 、 7#G 培养大肠杆菌、 !"# 培养基 胰蛋白胨 (B;@9Q) 酵母浸膏 ( B;@9Q) 用蒸馏水定容至 !$#$! VR 培养基: 1#+, <+, .K9’ 1#+, 添加氨苄青霉素 #F1W+XWV 用于质粒筛选。 1V, CDE ( #,