三种DNA提取方法对检测草莓镶脉病毒稳定性的研究-论文
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St a b i l i t y As s a y o f Th r e e DNA Ex t r a c t i o n Me t ho ds f o r De t e c t i o n o f St r a wb e r r y Ve i n Ba n di n g Vi r u s
华 北 农 学 报 ・2 0 1 5, 3 0( 3): 2 0 0 — 2 0 4
三种 D N A提 取方 法对检 测草 莓镶脉 病毒 稳定 性 的研 究
冉 策 , 陈 柳 , 陆 家 兰 , 刘 正坪 , 魏艳 敏 , 赵 晓 燕 , 尚巧 霞
( 1 . 农业应用新技术北京市重点实验室, 北京农学 院 植物科学技术学院 , 北京 1 0 2 2 0 6; 2 . 北京农学院 教务处 , 北京 1 0 2 2 0 6 )
Abs t r a c t : Di f f e r e n t DNA i s o l a t i o n me t h o d s we r e us e d i n r e s e a r c h e s d u e t o t h e d i v e r s i t y o f s e c o n da r y me t a b o — l i t e s i n d i f f e r e n t p l a n t t i s s u e s . Th e e x i s t i n g o f l a r g e a mo u n t s o f p o l y s a c c h a r i d e s, p r o t e i n s, p o l y p h e n o l s a n d p i g me n t s i n s t r a wb e r r y p l a nt s i n lu f e n c e d t he e x t r a c t i o n o f h i g h q u a l i t y DNA f r o m s t r a wb e r r y l e a v e s a n d a te f r wa r d s P CR r e a e . t i o n. I n o r d e r t o i d e nt i f y t h e DNA e x t r a c t i o n me t h o d wh i c h wa s a p p l i e d t o t h e PCR d e t e c t i o n f o r St r a wb e r r y v e i n b a n —
摘要 : 草 莓 成熟 叶 片 中 含 有 大 量 的 多 糖 、 蛋白质 、 多酚和色素等物质 , 影响高质量 D N A 的提 取 和 下 游 P C R反 应 的 进 行 。为 确 定 适 用 于 P C R技 术 检 测 草 莓 镶 脉 病 毒 ( S t r a w b e r r y v e i n b a n d i n g v i r l z ¥ , S V B V) 的D N A提 取 方 法 , 从 草 莓 叶 片
( 1 . B e i j i n g Ke y L a b o r a t o r y o f Ne w T e c h n o l o g y i n Ag r i c u l t u r a l A p p l i c a t i o n, Co l l e g e o f P l a n t S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y , B e i j i n g Un i v e r s i t y o f Ag r i c u l t u r e , B e i j i n g 1 0 2 2 0 6, C h i n a ; 2 . O f i c e o f Ac a d e mi c Af f a i r s , B e i j i n g Un i v e r s i t y o f Ag r i c u l t u r e , B e i j i n g 1 0 2 2 0 6, C h i n a )
关键词 : 植物 D N A提 取 ; C T A B试 剂 盒 ; 高盐低 p H法 ; S D S法
中 图分 类号 : ¥ 4 3 2 . 4 1 文献 标 识 码 : A 文章编号 : 1 0 0 0—7 0 9 1 ( 2 0 1 5 ) 0 3—0 2 0 0—0 5
d oI : 1 0 . 7 6 6 8 / h b n x b . 2 0 1 5 . 0 3 . 0 3 4
S VBV b y PC R we r e t e s t e d a n d c o mp a r e d i n t h i s s t u d y .S t r a wb e r y r l e a v e s i n f e c t e d b y S VBV we r e u s e d a s t h e ma t e r i .
a l s r f o m wh i c h C T AB k i t me t h o d, h i g h s a l t a n d l o w p H me t h o d( HS L P M)a n d mo d i f i e d S DS me t h o d w e r e u s e d t o
e x t r a c t DNA i n t h i s p a pe r . Th e q u a l i t y a n d q u a n t i t y o f DNA e x t r a c t e d b y t h e s e t hr e e di f f e r e nt me t h o d s we r e a n a l y z e d b y g e l e l e c t r o p h o r e s i s a n d UV s p e c t r 0 p h 0 t 0 me t e r s . S VBV wa s d e t e c t e d b y PCR f r o m e x t r a c t e d DNA t o d e t e r mi ne t h e e f f e c t o f di f f e r e n t DNA e x t r a c t i o n me t h o ds o n t h e s t a b i l i t y o f PCR d e t e c t i o n .Th e r e s u l t s s h o we d t h a t a l l t h e t h r e e me t h o d s c o u l d i s o l a t e c o mp l e t e DNA f r a g me n t s . S e q ue n c i n g a n d s e q u e n c e a n a l y s i s o f t he P CR p r o d uc t s f r o m s t r a w— b e r r y l e a v e s i n f e c t e d b y S VBV p r o v e d t h e r e l i a b i l i t y o f t h e me t ho d s . DNA e x t r a c t e d b y t h r e e me t h o ds ro f m s t r a wb e r — y r l e a v e s c o u l d b e d e t e c t e d t h e i n f e c t i o n o f S VBV s h o we d t h e q ua l i t y o f DNA e x t r a c t e d b y a l l t h e t h r e e me t h o d s
d i n g v i r u s( S V BV), t o t a l DNAs e x t r a c t e d f r o m s t r a w b e r r y l e a v e s b y t h r e e d i f f e r e n t e x t r a c t i o n me t h o d s t o d e t e c t
t r a c t i o n me t h o d s, r e s u l t s s h o we d t h e q u a l i t y o f DNA e x t r a c t e d b y CT AB k i t wa s t he b e s t i n t h e s e t h r e e d i f f e r e n t DNA e x t r a c t i o n me t h o d s i n t h i s p a pe r .
RAN Ce , CHEN L i u , LU J i a — l a n , LI U Z h e n g — p i n g , W EI Ya n- mi n ,
Z H A O X i a o — y a n . S H A N G Q i a o — x i a
中提取 D N A后 , 对样 品 中 的 S V B V进行特异性的 P C R检 测 , 比较 确 定 不 同 D N A提取方法对 P C R检 测 S V B V 稳 定 性
的 影 响 。 以感 染 S V B V 的草 莓 叶片 为 材 料 , 分别采用 C T A B试 剂 盒 法 、 高盐低 p H法 、 改良 S D S法 提 取 草 莓 叶 片 的 总 D N A, 将 不 同方 法 提 取 的 D N A通 过 紫外 分光 光 度 法 和 琼 脂 糖 凝 胶 电泳 法 进 行 测 定 , 对D N A产 量 和 质 量 进 行 分 析 。 结 果表 明, 3种 方 法 均 能 获 得 较 为完 整 的 D N A片 段 , 用 C T A B试 剂 盒 提 取 的 D N A质 量 最 高 , 改良S D S法 提 取 的 D N A 质 量 较 低 。将 不 同方 法 提 取 的 D N A经过 P C R反 应 特 异性 检 测 S V B V后 , 将 与 目的 片 段 大小 一 致 的 P C R扩 增 产 物 经 序 列测定及分析 , 证明与 S V B V 的序 列 相 吻 合 , 证明了方法的可靠性 , 其质量能够满足 P C R 特 异性 检 测需 要 。
c o ul d me e t t h e s p e c i f i c d e ma n d s o f PCR de t e c tBaidu Nhomakorabeai o n o f S V BV i n s t r a wb e r y r l e a v e s .Co mp a r e d wi t h t h e o t h e r t wo e x .