人外周血白细胞DNA提取标准操作规程(SOP)
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人外周血白细胞DNA提取标准操作规程(SOP) (血液/组织/细胞基因组提取试剂盒(DP304))
1实验原理
本法采用血液/组织/细胞基因组提取试剂盒(DP304),从全血中分离白膜层,去除其中的红细胞及蛋白质,裂解白细胞释放DNA,再通过去除DNA中的杂质使其纯化,得到高纯度的DNA原液,最后使用微量紫外可见分光光度计对DNA 的浓度及纯度进行定量检测。
2实验仪器
EP管
微量移液器,10μL、50μL、200μL、1000μL
涡旋振荡器
数显恒温搅拌循环水箱
吸附柱CB3
收集管
离心机
涡旋振荡器
微量紫外可见分光光度计(Thermo NanoDrop1000)
3实验试剂
正常人混合血液,应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。
红细胞裂解液(裂解红细胞)
缓冲液GA(轻微裂解作用,为蛋白激酶K提供反应环境),若溶液产生沉淀,使用前应在37℃水浴中预热10min,以溶解沉淀。
蛋白激酶K(裂解蛋白质)
缓冲液GB(裂解白细胞,释放DNA),若溶液产生沉淀,使用前应在37℃水浴中预热10min,以溶解沉淀。
无水乙醇(沉淀DNA,去除杂质)
缓冲液GD(去除蛋白质),使用前应按照试剂瓶标签的说明加入无水乙醇。缓冲液PW(去除盐),使用前应按照试剂瓶标签的说明加入无水乙醇。
洗脱缓冲液TE(保存DNA)
4实验步骤
样品的采集与保存:用装有EDTA的塑料管采集2mL静脉血,2000rpm离心
5min,可见分层,分别为血浆层、白膜层、红细胞,将血浆吸出弃去,再通过点吸的方式将白膜层全部吸出,置于干净的EP管备用。如无法及时提取DNA,则应置于-80℃进行保存。
样品预处理:
裂解红细胞:通过低速涡旋15s混匀样品,取150μL样品置于干净的EP管,加入750μL红细胞裂解液,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀5min,然后10000rpm离心2min,吸去上清,留下白细胞沉淀。
重悬白细胞:加入200μL缓冲液GA,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀
3~5min,使白细胞沉淀重悬。
裂解蛋白质:加入20μL蛋白激酶K,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀1min。裂解白细胞,释放DNA:加入200μL缓冲液GB,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀10min,70℃水浴10min。
沉淀DNA,去除杂质:加入200μL无水乙醇,通过手摇振荡的方式进行颠倒混匀15s,简短离心使样品进一步混匀并去除管盖内壁的水珠。将管内所有溶液都加入吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
去除蛋白质:向吸附柱CB3中加入500μL缓冲液GD,12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
去除盐类:向吸附柱CB3中加入600μL缓冲液PW,12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
去除盐类:重复步骤(7)。向吸附柱CB3中加入600μL缓冲液PW,12000rpm 离心1min,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
去除残存漂洗液:将吸附柱CB3放回收集管中,12000rpm离心2min,倒掉废液。将吸附柱CB3打开盖子置于室温放置10min。
洗脱DNA:将吸附柱CB3转入一个干净的EP中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50μL洗脱缓冲液TE,室温放置5min,12000rpm离心2min,将溶液收集到EP 管中,如无法及时测定,应置于-80℃进行保存。
测定DNA浓度及纯度:使用微量紫外可见分光光度计进行测定,测定前通过手弹EP管底部3~5次的方式来使DNA溶液混匀。
5实验结果分析
A230nm:碳水化合物和盐类最高吸收峰吸收波长。
A280nm:蛋白质及酚类物质最高吸收峰吸收波长。
A260nm:DNA/RNA最高吸收峰吸收波长。
260/280:比值应在~之间,低于表示有蛋白质及酚类物质污染,高于表示有RNA污染。
260/230:比值应大于1,低于1表示有碳水化合物和盐类污染。
ng/μL:样品浓度单位,是通过样品在260nm处的吸光值以及选择的分析常数来计算的。采用本法提取的DNA溶液浓度应大于100ng/μL。