第十五章 蛋白质的生物合成-翻译
第十五章蛋白质的生物合成
第一位
(5ˊ)
U
U
C
A
G
遗传密码字典 第二位
C
A
G
第三位
(3ˊ)
U C A G
U C A G
U C A G
U C A G
6 4 组 密 码 子 中 , AUG 既 是 甲 硫氨酸的密码,又是起始密码; 有三组密码不编码任何氨基酸, 而是多肽链合成的终止密码子: UAG、UAA、UGA。
• 在原核生物和真核生物中,均存在另一 种携带蛋氨酸的tRNA,识别非起动部位 的蛋氨酸密码,AUG。
第十五章蛋白质的生物合成
核糖体的研究历史
1.早在本世纪30年代后期就发现细胞质和细胞核中都有 核酸存在,不过用1924年福尔根发明的染色法只能使细胞核 中的核酸染色。但两种核酸在260nm的吸收非常相似。
第十五章 蛋白质合成及转运
蛋白质的生物合成
中心法则指出,遗传信息的表达最终是合成出 具有特定氨基酸顺序的蛋白质,这种以mRNA上所 携带的遗传信息,到多肽链上所携带的遗传信息的传 递,就好象以一种语言翻译成另一种语言时的情形 相似,所以称以mRNA为模板的蛋白质合成过程为 翻译(translation)。
2.Crick, F.比较了核酸和氨基酸的大小和形状后,认为不可 能在空间上互补,因此预测:(1) 存在一类分子转换器,使信 息从核酸序列转换成氨基酸序列;(2) 这种分子很可能是核酸; (3) 它不论以何种方式进入蛋白质翻译系统的模板,都必须与 模板形成氢键(即配对);(4) 有20种分子转换器,每种氨基 酸一个;(5) 每种氨基酸必定还有一个对应的酶,催化与特定 的分子转换器结合。
2.1941年,细胞学家J.Brachet和T.Caspersor注意到细 胞质中的核酸与蛋白质的合成有密切的关系。
第十五章 蛋白质的生物合成-翻译
二、tRNA
tRNA是氨基酸的搬运工具。 tRNA是多肽链和mRNA之间的 重要转换器。 每一种氨基酸可以有一种以上 tRNA作为运载工具。 能够携带相同氨基酸而反密码子 不同的一组tRNA分子称为氨基 酸的同工受体tRNA (isoaccepting tRNA) 。
tRNA须具备的功能 • 与氨基酸结合(3’末端) • 识别特异的氨酰-tRNA合成酶(D环) • 识别mRNA链上密码子 • 与核糖体结合,使延长中的肽链附着于核糖体上(TψC环)
蛋白质生物合成过程包括: 1. 氨基酸的活化; 2. 合成起始; 3. 肽链延伸:进入、转肽、移位; 4. 终止合成。
一、氨基酸的活化
二、合成的起始阶段
核糖体大小亚基分离; mRNA在小亚基定位结合; 起始氨酰tRNA的结合; 核糖体大亚基结合。
1. 核糖体大、小亚基分离 IF1和IF3与30S小亚基结合,促进核糖体大、小
翻译过程实际上就是由tRNA携带着氨基酸,逐一识别 mRNA上的密码子,并将氨基酸依密码子的排序相互 连接的过程。核糖体是翻译的场所。
一、mRNA模板和遗传密码
• mRNA是翻译的直接模板。 (一)遗传密码的破译
mRNA上四种核苷酸→组成蛋白质的20种aa
核苷酸与氨基酸对应关系?
3个相邻的核苷酸→1个aa, 有43种排列→64种密码子
• 核糖体可以看作是一个大分子的机构,它具有许多精密的 配合部分,来挑选并管理参与蛋白质合成的各个组分。它 参与多肽链的启动、延伸和终止的各种因子的识别。
原核生物核糖体
5S rRNA, 23S rRNA 50S
34种蛋白质 70S
16S rRNA 30S
21种蛋白质
真核生物核糖体
5SrRNA,5.8SrRNA,28SrRNA 60S
生化中英对照单词
Chapter 14 Protein Biosynthesis
第十四章 蛋白质的生物合成
Antibiotics 抗生素 Cap-site binding protein 帽子结合蛋白 Chloromycetin 氯霉素 Diphtheria toxin 白喉毒素 Eukaryote 真核生物 Genetic code 遗传密码 Insulin 胰岛素 Interferon 干扰素 Molecular chaperone 分子伴侣 Parathyroid hormone 甲状旁腺激素 Streptomycin 链霉素 Translational initiation complex 翻译起始复合物 Transpeptidase 转肽酶
丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶
Chapter 12 DNA Biosynthesis 第十二章 DNA生物合成
Bidirectional replication 双向复制 Endonuclease 内切核酸酶 Exonuclease 外切核酸酶 Gene expression 基因表达 Polymerases 聚合酶类 Primase 引发酶 Primosome 引发体 Proliferating cell nuclear antigen 增殖细胞核抗原 Recombination repairing 重组修复 Replicon 复制子 Reverse transcriptase 逆转录酶 Semiconservative replication 半保留复制 Single stranded DNA binding protein 单链DNA结合蛋白 Telomerase 端粒酶 Telomere 端粒 DNA topoisomerase DNA拓扑异构酶
Chapter 1 Nucleic Acid 第一章 核酸
5蛋白质的翻译
proteins,r-proteins)组成,rRNA 组成总分子量的 60%~65%。核糖体的相对大小常常用 沉降系数单位来表示。大肠杆菌的核糖体称为 70S 核糖体,其中的小亚基称为 30S 核糖体, 大亚基称为 50S 核糖体(图 5-8) 。小亚基包含 21 种不同的蛋白质(被称为 S1 一 S21)和 16SrRNA。大亚基由 33 种蛋白质(被命名为 L1~L33)和 23S 及 5SrRNAs 组成(图 5-9)。真核 核糖体称为 80S 核糖体,其中 40S 小亚基包含 33 种蛋白质和 18SrRNA,而 60S 大亚基包含 50 种蛋白质(图 5-9)和 3 种 rRNA (28S, 5.8S 和 5S) 。 真核 5.8SrRNA 与细菌 23SrRNA 的 5SrRNAs 部分同源(表 5.1) 。古细菌核糖体类似于细菌核糖体,但有些包含与真核相同的特别亚基。
组织上,原核生物与真核生物有重要的差别(图 5.1、图 5.2 和图 5.3) 。原核生物的 mRNA 的第一个密码子 AUG 上游的一个重要特征就是 Shine-Dalgarno 序列,而真核生物 mRNA 除
第一个密码子 AUG 的上游是核糖体小亚基扫描 AUG 的信号序列(CCACC)外, 5’端非翻译区 上游为帽子结构, 3’端非翻译区内有多聚腺苷化的信号 AAUAAA 以及其下游的多聚 A 尾巴。 mRNA 是由 DNA 的模板链转录而来, 其序列与编码链相同与模板链互补。 mRNA 的 5’ →3 ’ 三联体密码子序列与蛋白质 N 端到 C 端的氨基酸序列线形相关。原核生物 mRNA 的转录和翻 译发生在时间与空间上具有相对的同一性,其 mRNA 通常不稳定,在合成后的几分钟内翻译 成蛋白质。 真核 mRNA 的合成与成熟都在核内, 成熟的 mRNA 被运往胞质, 作为模板翻译蛋白 质 , 其 稳 定 性 相 对 较 高 , 达 几 小 时 。
分子生物学第十五章 蛋白质的生物合成
1.遗传密码种类:
• mRNA 分子有4种碱基:A、G、C、U,可组合成64个密 码子,其中61个分别代表20种不同氨基酸
• 遗传密码共有43=64种, 64: UAA、UAG、UGA 终止密码 61: AUG 起始密码 代表Met 60: 代表19种氨基酸
9
遗传密码表 第一碱基
(5/-端)
第二碱基
43
一、起始阶段
(一)原核生物翻译起始复合物的形成
参与的物质: 核糖体50S和30S大小两类亚基 mRNA 起始作用的fMet-tRNAfMet GTP供能 起始因子(IF1、IF2、IF3)
44
起始过程:
• 核糖体大小亚基解离 • 小亚基与mRNA结合:
16sRNA识别mRNA的SD序列
• fMet-tRNAfMet与mRNA起始密码子AUG结合 • 核糖体大小亚基形成起始复合物
tRNAphe Phe-tRNAphe
• 肽链起始和延长的甲硫氨酰-tRNA:
真核生物:起始: Met-tRNAiMet 延长: Met-tRNAMet
原核生物: 起始:fMet-tRNAfMet 延长:Met-tRNAMet
39
40
第三节 肽链的合成过程
41
整个翻译过程可分为 :
• 翻译的起始 • 翻译的延长 • 翻译的终止
tRNA反密码子 第1位碱基
mRNA密码子 第3位碱基
I
U
G AC
U, C, A A, G U, C U G
17
摆 动 配 对
32 1
U
123
18
• ⑤遗传密码的通用性
从原核生物到人类都共用同一套遗传密码,被称为遗传密码的通用性。 密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。
中国海洋大学资料生物化学课件第十五章 蛋白质合成(新)
(一)遗传密码的破译
* 美国科学家 Nirenberg 等, 1968 年获诺贝尔生 理学奖。 * 1961 年, Nirenberg 等人,在大肠杆菌的无细 胞体系中外加 poly(U) 模板、 20 种标记的氨基 酸,经保温后得到了多聚 phe-phe-phe ,于是 推测UUU编码phe。利用同样的方法得到 CCC 编码pro,GGG编码gly,AAA编码lys。 * 如果利用 poly ( UC ),则得到多聚 Ser-LeuSer-Leu,推测UCU编码Ser,CUC编码Leu。 * 到1965年就全部破译了64组密码子。
蛋白质合成时,mRNA结合于核糖体小亚基 上,大亚基结合带氨基酸的tRNA,tRNA的 反密码子与mRNA密码子配对,ATP供能, 合成蛋白质。
三、遗传密码
遗传密码:mRNA中的核苷酸序列与蛋白质 中氨基酸序列之间的对应关系称为遗传密码 三个碱基编码一个氨基酸称为三联体密码或 密码子(Coden)。 密码子的发现。
(1)在进入A位点之前,新氨酰tRNA首先必须与延伸因子EF— TU—GTP结合。 (2)延伸因子 EF—Tu是一个GTP结合蛋白,参与氨酰 tRNA的 就位。 (3)氨酰tRNA入位后,EF—TU—GTP水解,EF—TU—GDP从 核糖体上释放下来,在第二个延伸因子 EF—Ts 帮助下 EF— Tu—GDP 释 放 掉 GDP 并 重 新 结 合 一 分 子 GTP 再 生 成 EF— Tu—GTP。
简并性的生物学意义
A、减少有害突变:假如每种氨基酸只有一个密 码子,那么剩下的44个密码子都成了终止子, 如果一旦哪个氨基酸的密码子发生了单碱基的 点突变,那么极有可能造成肽链合成的过早终 止。如GUN 编码 Ala ,由于简并性的存在,不 论第三位的U变成什么,都仍然编码Ala; B、可以使DNA上的碱基组成有较大的变化余地, 而仍然保持多肽上氨基酸序列不变(意思基本 同上)。
分子生物学 蛋白质的生物合成
▪ SD序列后到AUG起始密码间的序列
mRNA序列上紧接S-D序列后的小核苷酸 序 列 ( 可 被 核 蛋 白 体 小 亚 基 蛋 白 rpS-1 识 别并结合。
3.起始氨基酰tRNA(fMet-tRNAfMet )结合到小亚基
IF-2 GTP
5'
AUG
3'
IF-1
IF-3
4.核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成
过程。 由核酸四种碱基组成的语言翻译成蛋白质
由20种氨基酸组成的语言
反应过程 (1)氨基酸的活化 (2)肽链的生物合成 (3)肽链形成后的加工和靶向输送
生物学意义
(1)维持多种生命活动 (2)适应环境的变化 (3)参与组织的更新和修复
第一节 蛋白质生物合成体系
Protein Biosynthesis System
IF-2 GGDTPPPi
5'
AUG
3'
IF-1
IF-3
起始复合物形成过程
IF-2G-GGDTTPPPi
5'
AUG
3'
IF-3
IF-1
▪ AUG:起始密码:有SD序列 延伸密码:无SD序列
(二)延长
▪ 指在mRNA模板的指导下,氨基酸依次 进入核蛋白体并聚合成多肽链的过程。
➢ 肽链延长在核蛋白体上连续循环式进行,又 称为核蛋白体循环(ribosomal cycle),包 括以下三步:
遗 传 密 码 表
遗传密码的特点
1. 方向性(directional) 翻译时遗传密码的阅读方向是5’→3’,
即读码从mRNA的起始密码子AUG开始,按5’→3’ 的方向逐一阅读,直至终止密码子。
蛋白质的生物合成(翻译)
(1)热休克蛋白(HSP): HSP70、HSP40和GreE族
(2)伴侣素(chaperonins): GroEL和GroES家族
2. 蛋白二硫键异构酶 (PDI)
3. 肽-脯氨酰顺反异构酶 (PPI)
(二) 抗生素对蛋白质合成的影响
1.抗生素类是微生 物产生的能够杀灭 或抑制细菌的一类 药物。
抑制蛋白质生物合成的原理
抗生素 四环素族(金霉素 新霉素、土霉素) 链霉素、卡那霉素、 新霉素 氯霉素、林可霉素 红霉素 梭链孢酸 放线菌酮 嘌呤霉素 作用点 原核核蛋白 体小亚基 原核核蛋白 体小亚基 原核核蛋白 体大亚基 原核核蛋白 体大亚基 原核核蛋白 体大亚基 真核核蛋白 体大亚基 真核、原核 核蛋白体 作用原理 应用 抑制氨基酰-tRNA与小亚基 抗菌药 结合 改变构象引起读码错误、抑 抗菌药 制起始 抑制转肽酶、阻断延长 抗菌药 抑制转肽酶、妨碍转位 与EFG-GTP结合,抑制肽 链延长 抑制转肽酶、阻断延长 氨基酰-tRNA类似物,进位 后引起未成熟肽链脱落 抗菌药 抗菌药 医学研究 抗肿瘤药
5'
UAG
3'
二、真核生物翻译过程
(一)起始
1. 核糖体大小亚基分离; 2. 起始氨基酰-tRNA结合; 3. mRNA在核糖体小亚基就位; 4. 核糖体大亚基结合。
原核先 就位,后 结合;真核 先结合, 后就位
(二) 延长
与原核生物相比,真核生物肽链延长过程有 不同的反应体系和延长因子。真核细胞核糖体没 有E位,转位时卸载的tRNA直接从P位脱落。
2
4 2 3
Thr
蛋白质的生物合成
16
(二)氨基酰-tRNA合成酶 (aminoacyl-tRNA synthetase)
氨基酰-tRNA合成酶
氨基酸 + tRNA
氨基酰- tRNA
ATP
AMP+PPi
17
1. 氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA 都有高度特异性:每种氨基酸都只有1种氨基酰tRNA合成酶,生成特定的氨基酰-tRNA(aa-tRNA)
参与蛋白质生物合成的主要物质 蛋白质生物合成过程 翻译后的加工与靶向输送 蛋白质生物合成的抑制剂
3
第一节 参与蛋白质生物合成的 主要物质
蛋白质合成体系:20种氨基酸,mRNA、 tRNA、核蛋白体、酶和蛋白因子、无机离 子、ATP 、GTP 等。
4
一、mRNA:合成蛋白质பைடு நூலகம்模板
(一) mRNA是遗传信息的携带者 遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为
14
密码子与反密码子除通过碱基互补结合外, 还具有摆动性,即密码子的第3位碱基与反 密码子的第1位碱基配对不严格,称为摆动 配对。
15
密码子、反密码子配对的摆动现象
tRNA反密码子 第1位碱基
I
U G AC
mRNA密码子 第3位碱基
U, C, A A, G U, C U G
密码子的第3位碱基发生突变时,并不影响tRNA带入 正确的氨基酸。
2.氨基酰-tRNA的表示方法:
Ser-tRNASer
Met-tRNAMet
真核生物起始因子辨认的Met-tRNAiMet 延长因子辨认Met-tRNAeMet
右上角字母可略
18
三、核糖体:合成蛋白质的场所
蛋白质翻译
蛋白质的生物合成⎯⎯翻译一切生命现象不能离开蛋白质,由于代谢更新,即使成人亦需不断合成蛋白质(约400g/日)。
蛋白质具有高度特异性。
不同生物,它们的蛋白质互不相同。
所以食物蛋白质不能为人体直接利用,需经消化、分解成氨基酸,吸收后方可用来合成人体蛋白质。
mRNA含有来自DNA的遗传信息,是合成蛋白质的“模板”,各种蛋白质就是以其相应的mRNA为“模板”,用各种氨基酸为原料合成的。
mRNA不同,所合成的蛋白质也就各异。
所以蛋白质生物合成的过程,贯穿了从DNA分子到蛋白质分子之间遗传信息的传递和体现的过程。
mRNA生成后,遗传信息由mRNA传递给新合成的蛋白质,即由核苷酸序列转换为蛋白质的氨基酸序列。
这一过程称为翻译(translation)。
翻译的基本原理见图14-1。
由图14-1可见,mRNA穿过核膜进入胞质后,多个核糖体(亦称核蛋白体,图中为四个)附着其上,形成多核糖体。
作为原料的各种氨基酸在其特异的搬运工具(tRNA)携带下,在多核糖体上以肽键互相结合,生成具有一定氨基酸序列的特定多肽链。
合成后从核糖体释下的多肽链,不一定具有生物学活性。
有的需经一定处理,有的需与其他成分(别的多肽链或糖、脂等)结合才能形成活性蛋白质。
第一节参与蛋白质生物合成的物质参与蛋白质合成的物质,除氨基酸外,还有mRNA(“模板”)、tRNA(“特异的搬运工具”)、核糖体(“装配机”)、有关的酶(氨基酰tRNA合成酶与某些蛋白质因子),以及ATP、GTP等供能物质与必要的无机离子等。
一、mRNA与遗传密码天然蛋白质有1010~1011种,组成蛋白质的氨基酸却只有20种。
这20种氨基1酸排列组合的不同,形成了形形色色的蛋白质。
蛋白质中氨基酸的序列如何决定?(一)三联体密码与密码的简并研究表明,密码子(codon)共有64个,每个密码子是由三个核苷酸(称为三联体,triplet)组成的。
有的氨基酸有多个密码子,这种现象称为简并(degenerate),如UUU和UUC都是苯丙氨酸的密码子,UCU、UCC、UCA、UCG、AGU和AGC都是丝氨酸的密码子,同一氨基酸的不同密码子称为同义词(synonyms)。
蛋白质的生物合成-翻译
tRNA的功能
1)识别mRNA链上的密码子 2)携带活化的氨基酸到生长肽链的正确位臵, 起转移氨基酸作用。
氨基酸在合成蛋白质之前必须通过AA-tRNA合成 酶活化,在消耗ATP的情况下结合到tRNA上, 生成有蛋白质合成活性的AA-tRNA。
该实验说明什么问题
将 [14C]-Cys-tRNACys,经Ni催化生成[14C]Ala-tRNACys,再把[14C]-Ala-tRNACys加进含血 红蛋白mRNA的兔网织细胞核糖体的蛋白质合成 系统中,结果发现[14C]-Ala-tRNACys插入了血 红蛋白分子通常由半胱氨酸占据的位臵上
核糖体的功能
小亚基:结合mRNA及tRNA反密码区段 功能 大亚基:结合tRNA其它区段 A位——氨酰tRNA 进入部位
核糖体的活性中心
P位——与正在延伸的肽酰 tRNA结合部位
蛋白质合成的过程
核糖体有三个tRNA结合位点 即将到来的氨酰-tRNA结合在A位
肽酰-tRNA结合在P位
2.序列富含嘌呤(如AGGA /GAGG)的一段序列。 3.能和原核生物16s rRNA相应的富含嘧啶序列 互补。
起始密码
SD序列
Initiation codon
30S亚基具有专一性的识别和选择mRNA起始位点的性质 ,而IF3能协助该亚基完成这种选择。研究发现,30S亚基通 过其16S rRNA的3’末端与mRNA5’端起始密码子上游碱基配对结 合。Shine及Dalgarno等证明几乎所有原核生物mRNA上都有一 个5’-AGGAGGU-3’序列,这个富含嘌呤区与30S亚基上16S rRNA 3’末端的富含嘧啶区序列5’-GAUCACCUCCUUA-3’相互补。
1.核糖体的组成
12翻译
延伸过程所需蛋白因子称为延长因子(elongation factor, EF) 原核生物:EF-T (EF-Tu, EF-Ts) EF-G 真核生物:EF-1 、EF-2
(一)进位
又称注册(registration)
指根据mRNA下 一组遗传密码的指导,
使相应氨基酰-tRNA
进入核蛋白体A位
延长因子EF-T催化进位 (原核生物)
)
B.EFT就是转肽酶
D.延长因子是蛋白质,其作用过程不需能量
E.协助注册过程需要形成氨基酰- tRNA-延长因子-GTP复合物
下列关于翻译延长过程的描述哪一项是正确的?
A.每延长一个氨基酸都要按照注册-转位-成肽的次序
B.氨基酰-tRNA进入受位 C.转位是肽链和mRNA一起从P位转到A位
D.成肽是在延长因子催化下进行的
氨基酸 + tRNA
氨基酰-tRNA合成酶
ATP
氨基酰- tRNA AMP+PPi
tRNA与酶 结合的模型
tRNA
AMP
氨基酰-tRNA合成酶
第一步反应
氨基酸 +ATP-E —→ 氨基酰-AMP-E + PPi
第二步反应
氨基酰-AMP-E + tRNA
↓
氨基酰-tRNA + AMP + E
为三联体密码 (triplet coden)
起始密码 (initiation coden): AUG 终止密码 (termination coden):
UAA,UAG,UGA
遗 传 密 码 表
一个N端氨基酸为丙氨酸的20肽,其开放阅读框 架至少应由多少个核苷酸残基组成( ) A.20 B.60 C.63 D.66
蛋白质生物合成—翻译及翻译后过程
9
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真核生物mRNA的特点
真核生物没有S-D序列, 靠帽子结构识别核糖体 真核生物的起始密码位 于Kozak序列 (CCACCAUGG)中, 增加翻译起始的效率
10
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二、生物合成的场所 — 核蛋白体 (Ribosomes)
11
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核蛋白体蛋白及rRNA的组成特点
31
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进 位
成肽
转 位
32
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三、肽链合成终止 (Termination)
1. 终止密码的辨认及肽链从 肽酰-tRNA水解出。
2. mRNA从核蛋白体中分 离及大小亚基的拆开
3. 终止过程需释放因子 (RF)。
33
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释放因子(release factor, RF):与肽链合成 终止相关的蛋白因子
等是由小泡介导的 49
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6
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7
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阅读框架(reading frames)
开放阅读框(open reading frame, ORF): 从起始密码AUG 到终止密码处的正确可阅读序列
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原核生物mRNA的特点
S-D序列:原核生物mRNA起始密码AUG上游8~13核苷酸 处,存在一段5′-UAAGGAGG-3′的保守序列,称为S-D 序列。是mRNA与核蛋白体识别、结合的位点
原核生物释放因子:RF-1,RF-2,RF-3 真核生物释放因子:eRF
1. 识别终止密码,如RF-1特异识别UAA、UAG;而RF-2可识 别UAA、UGA
2. 诱导转肽酶改变为酯酶活性,催化肽酰基转移到-OH上,使 肽链从核蛋白体上释放。
动物医学《基础生物化学-蛋白质的生物合成-翻译》课件
SD 序列
A purine-rich Shine-Dalgarno sequence and a AUG codon marks the start site of polypeptide synthesis on bacterial mRNA molecules.
AMP + E
氨基酰-tRNA表示方法:Ser-tRNASer
tRNA与酶结合的模型
tRNA
ATP 氨基酰-tRNA合成酶
氨基酰-tRNA合成酶的特点
氨基酰-tRNA合成酶具有高度特异性, 能够专一识别底物氨基酸和tRNA,保 证了翻译的准确无误。
催化氨基酰-tRNA脱酰基,具有校正活 化过程中可能发生的错误 。
第三步:核糖体大亚基结 合,起始复合物形成
30S复合物释放IF3后,与大亚基结合; IF2结合的GTP被水解,IF1、IF2均脱离。 50S大亚基与30S小亚基、模板mRNA以及
起始fMet-tRNAfMet构成起始复合体。
E
IF-1 IF-1
E
真核细胞的合成起始
起始氨基酸是Met,由特殊的tRNA携带 为Met-tRNAi
P位
A位
二肽酰-tRNA
(fMet成为N末端)
A位
A位成肽后,P位留下空载tRNA
③ 移位
无负荷的tRNA由E位点释放; 肽酰tRNA从A位移到P位; EF-G有转位酶活性,可结合并水解 1
分子GTP,促进核糖体向mRNA的3' 侧移动。
进 位
转肽 移 位
4. 肽链合成的终止
氨基酸进位,肽链形成和延伸,核糖体沿着mRNA的 5’——3’ 方向移位,循环往复,新合成的肽链由N端向 着C端不断延长,直至mRNA上出现终止密码,就没有 氨基酰-tRNA再进入A位点,肽链的合成终止。
大二生物化学与分子生物学系蛋白质翻译
IF-2 促进fMet-tRNAfMet与小亚基结合
IF-3 促进大、小亚基分离;提高P位对结合fMettRNAfMet的敏感性
EF-Tu 促进氨基酰-tRNA进入A位,结合并分解GTP
EF-Ts EF-Tu的调节亚基
EF-G
RF-1 RF-2 RF-3
有转位酶活性,促进mRNA-肽酰-tRNA由A位移至 P位;促进tRNA卸载与释放
64 起始密码:
AUG 终止密码: UAA、UAG、 UGA
传密码的特点:
➢ 方向性(directional) ➢ 连续性( non-punctuated) ➢ 简并性( degeneracy) ➢ 摆动性( wobble) ➢ 通用性( universal)
遗传密码的特点
• 方向性
●连续性(commaless) 各个三联体密码连续阅读,密码子间既
从核糖体释放出的新生多肽链不具备蛋白质生物活性, 必需经过不同的翻译后复杂加工过程才转变为天然构象的 功能蛋白。
主要包括
• 多肽链折叠为天然的三维结构 • 肽链一级结构的修饰 • 高级结构修饰
一、新生肽链折叠需要分子伴侣
细胞中大多数天然蛋白质折叠并不是自发完成的,其折叠过 程需要其他酶或蛋白质的辅助,这些辅助性蛋白质可以指导新 生肽链按特定方式正确折叠,它们被称为分子伴侣 (molecular chaperone)。
释放因子的功能 一是识别终止密码 二是诱导转肽酶改变为酯酶活性
• 多聚核糖体(polyribosome或polysome):多个核糖体结合 在1条mRNA链上所形成的聚合物。多聚核糖体的形成可以使 肽链合成高速度、高效率进行。
多聚核糖体
第四节
蛋白质合成后的加工和靶向输送
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(3)氨基酸侧链的修饰 氨基酸侧链的修饰包括羟化、羧化、甲 基化及二硫键的形成等。
(4)糖基化修饰 糖蛋白是细胞蛋白质组成的重要成分。它是在 翻译后的肽链上以共价键与单糖或寡聚糖连接而成。糖基化是在酶 催化下进行的。
15.1.3.5 多核糖体
多个核糖体同时与一个mRNA结合,每个核糖体独立的 进行翻译,各自合成完整的肽链。
15.2
蛋白质的生物合成过程
15.2.1、氨基酸的活化
所有参与合成多肽链的氨基酸都要激活,并由数十种高度专一的
氨基酰-tRNA合成酶催化。该酶由两个识别位点,它们能识别特定的 氨基酸和选择其所对应的tRNA,使两者连接起来(利用ATP)。
15.2.3 肽键的形成和肽链的延伸 (注意延长因子的参与)
(注意新的AA-tRNA如何定位,第一个肽键如何形成,核糖体如何移动…)
进位
氨基酰tRNA进入A位
进位因子
新的氨基酸-tRNA的进位依赖EF-Tu和Ts因子的协助
转肽
肽键的形成
肽键的形成由肽酰基转移酶催化
(此酶具有核酶的活性)
移位
密码子与反密码子的配对方式
变偶性——反密码子5’端的碱基与密码子的第三位配对不严格
15.1.3 rRNA与核糖体(ribosome)
15.3.1.1 核糖体的组成与结构
核糖体是rRNA 与几十种蛋白质的复合体,有大、小两个亚基构
成。含有合成蛋白质多肽链所必需的酶、起始因子(IF)、延伸因
子(EF)、释放因子(RF)等。 原核的核糖体(70S)= 30S小亚基 + 50S大亚基
首先IF3、IF1帮助30S小亚基 与mRNA结合,IF2和GTP帮助 甲酰甲硫氨酸-tRNA与AUG配 对,接着IF3脱离,形成30S 起始复合物。50S大亚基进入,
IF1和IF2脱离,形成50S起始
复合物,需要GTP。甲酰甲硫 氨酸-tRNA处于P位。
一个嘌呤丰富区
起始密码
起始密码AUG上游的S.D序列与16S rRNA3’端互补 结合有利于30S起始复合物的形成
原料氨基酸,20种 mRNA是合成蛋白质的“蓝图(或模板)” tRNA是原料氨基酸的“搬运工” rRNA与多种蛋白质结合成核糖体作为合成多肽链的装配 机(操作台)
蛋白质翻译系统示意图
15.1.1 mRNA,信使RNA
mRNA是遗传信息的载体(载有遗传密码,genetic code), 是合成蛋白质的蓝图(模板),它以一系列三联体密码子 (codon)的形式从DNA转录了遗传信息。每个密码子编码一个氨 基酸。
第15章 蛋白质翻译
Protein Biosynthesis (Translation)
本章主要内容:
翻译系统 蛋白质生物合成的过程 多肽链翻译后的修饰
蛋白质的到位
(RNA前体)
细胞核
(成熟RNA分子)
胞液
原核细胞
新合成蛋白质分子
真核细胞
基因在原核和真核细胞中最终得到表达
15.1 蛋白质的翻译系统
mRNA占细胞总RNA的5-10%,不稳定,寿命短。
原核的mRNA 是多顺反子;真核的mRNA 是单顺反子。
15.1.1.1 遗传密码
遗传密码是指DNA或由其转录的mRNA中核苷酸顺序与其
编码的蛋白质多肽链中氨基酸顺序之间的对应关系。
遗传密码为三联体(每三个核苷酸编码一个 氨基酸),由5’ 3’阅读,无间断。即使在少
15.3 真核生物蛋白质合成的特点
• 蛋白质的合成与mRNA的转录不偶联
• 起始tRNAMet所携带的是甲硫氨酸 • 起始因子多,起始复合物形成机制复杂
Байду номын сангаас
• 延长因子有eEF-1、eEF-2和eEF-3三种
• 释放因子只有eRF 一种
15.4 多肽链的修饰和加工
• 在核糖体上翻译得到的蛋白质多数是没有生物活 性的蛋白质前体,需要经过加工后才能转变为有 活性的蛋白质。
15.1.3.4 核糖体有4个基本功能
1. 容纳mRNA,并能沿着mRNA由5’——3’ 移动,由tRNA解读其密码; 2. 肽酰基位点(P位点),可结合肽酰基-
tRNA(肽-tRNA);
3. 氨基酰位点(A位点),可结合氨基酰tRNA(AA-tRNA); 4.脱氨酰基tRNA释放的位点(E位点); 5. 肽酰基转移酶中心,是形成肽键的位点 等。
图为原核生物的两种 16S rRNA和5S rRNA 的结 构
小亚基
tRNA
大亚基
核糖体
15.1.3.2 核糖体蛋白
原核细胞:小亚基含有21种蛋白质 大亚基含有34种蛋白质 真核细胞:小亚基含有30种蛋白质 大亚基含有50种蛋白质
15.3.1.3 rRNA rRNA的功能:
• 维持核糖体的三维结构 • 参与m RNA与核糖体小亚基的结合及亚基间的联合 • 在蛋白质合成过程中起决定作用
糖体上释放。
核糖体大、小亚基解聚,并进入下一轮合成。
蛋白质合成的终止
多个核糖体结合在同一条mRNA上,由 5’——3’进行翻译,形成多核糖体 (polyribosome),翻译速率得以提高
15.2.5 原核生物蛋白质合成的抑制
• 嘌呤霉素:阻断肽链的延长 • 链霉素:引起起始复合物的解离 • 氯霉素:抑制肽酰转移酶的活性 • 红霉素:抑制核糖体的移位
• 蛋白质的加工包括蛋白质折叠和蛋白质修饰
15.4.1 蛋白质的折叠
• 蛋白质折叠:蛋白质一级结构形成特定空间构象 的过程
• 折叠酶:蛋白质二硫键异构酶 肽酰脯氨酰顺反异构酶
• 分子伴侣:保证肽链的正确折叠
15.4.2 蛋白质的修饰
(1)N—端修饰 原核生物修饰时是由肽甲酰基酶除去甲酰基,多 数情况甲硫氨酸也被氨肽酶除去,真核生物中甲硫氨酸则全部被切 除。
原核生物肽链的延长
核糖体沿着mRNA 5’——3’方向移位 EF-G因子和GTP参与 空载的tRNA从E位点离开
15.2.4 肽链合成的终止 (注意释放因子的参与)
氨基酸进位,肽链形成和延伸,核糖体沿着mRNA
的5’——3’ 方向移位,循环往复,新合成的肽链由 氨基端向着羧基端不断延长,直至mRNA上出现终止密 码,相应的肽链释放因子RF1(对应UAA、UAG),RF2 (对应UAA、UGA)占据A位。肽链的合成终止,并从核
反应如下:
AA tRNA ATP AA-tRNA AMP PPi
氨基酸的羧基与tRNA 的3’端CCA-OH 以酯键相连,因此其氨基是 自由的。
氨酰基-tRNA合成酶
tRNAfmet fMet-tRNA合成酶
Met 酯键 甲酰FH4
翻译起始时, 第一个氨基酸 一般是蛋氨酸, 其氨基要甲酰 化,予以保护。
• 词义的改变:某些密码子在个别生物细胞内或染色体内的词义发生改变。
• 密码子的阅读方向:5’
3’
• 移码现象:mRNA中插入或删掉一个核苷酸引起该位点以后密码子发生
错读的现象。
遗 传 密 码 表
15.1.2 tRNA的结构与功能
原核tRNA有30-40种,真核有50-60种,含70-90个核苷酸, 并有多种稀有碱基。
15.5 蛋白质的到位
15.5.1 共翻译转位:蛋白质翻译与转位同时进行
信号肽(signal peptide):未成熟蛋白中,可被细胞识别系统识别 的特征性氨基酸序列。
15.5.2 翻译后转位
先由游离的核糖体翻译合成完整的蛋白质前 体,然后再将蛋白质从细胞质转移到线粒体或叶 绿体等细胞器中。
本章结束
tRNA是最小的RNA, 占细胞总RNA 的15%左右,其功能是携带氨 基酸和解读密码子。
tRNA 具有“四环一臂”和“三叶草” 形的典型结构。
注意:3’端CCA氨基酸受位和反密码子环
tRNA的结构—“四环一臂”
倒L形的三级结构
tRNA的功能是解读mRNA上的密码子和搬运氨基酸
tRNA上至少有4 个位点与多肽链合成有关:即3’CCA氨基酸接受位 点、氨基酰-tRNA合成酶识别位点、核糖体识别位点和反密码子位点。 每一个氨基酸有其特定的tRNA。氨基酸的羧基与tRNA的 3’ CCA-OH 以酯键结合生成氨基酰tRNA。 氨基酸与mRNA相应的密码子正确“对号”须依赖于tRNA的反密码子。 氨基酸
甲酰基
氨基酸与tRNA的 连接方式
fMet-tRNA
15.2.1.2 tRNA对mRNA密码子的辨认
• 反密码子通过碱基配对识别密码子 • 反密码子对密码子的识别表现有摇摆性(变偶性)
变偶性——反密码子5’端的碱基与密码子的第三位配对不严格
15.2.2 起始复合物的形成 (注意起始因子的参与)
动物生物化学练习(3)
1.无论是在DNA复制、还是RNA的转录或者是蛋白质翻译的过程, 我们都能看到碱基互补配对的原则贯穿在遗传信息从DNA传递到蛋 白质的各个环节。请做简要地介绍并评价其生物学意义。
2.DNA的复制包括哪些主要阶段?为什么复制具有半保留性?为什 么说子链的合成是半不连续的? 3.转录的终止出现在DNA分子中特定的碱基顺序上。原核DNA转录 的终止顺序有明显的结构特点,请予描述。除此以外,还有什么其 它的终止转录的方式? 4.关于多肽链的生物合成,请你说明: 氨基酰-tRNA合成酶的特点; 图示原核70S 起始复合物;解释延伸因子Tu的作用;并指出肽酰 基转移酶何时起作用。 5.为了克隆某个真核细胞的蛋白质的基因,研究人员更愿意先从组 织中分离它的mRNA,这样得到这个基因就不难了。为什么?
其中 30S小亚基含16S rRNA 和21种蛋白质
50S大亚基含23S,5SrRNA和34种蛋白质